宾夕法尼亚大学(University of Pennsylvania,简称宾大)由本杰明.富兰克林创建于1740年,是美国著名的私立研究型大学,常春藤盟校之一。学校在艺术、人文、社会科学、建筑与工程教育上处于领先地位,其沃顿商学院位列全美三甲,护理学院为...
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宾夕法尼亚大学(University of Pennsylvania,简称宾大)由本杰明.富兰克林创建于1740年,是美国著名的私立研究型大学,常春藤盟校之一。学校在艺术、人文、社会科学、建筑与工程教育上处于领先地位,其沃顿商学院位列全美三甲,护理学院为全美两强之一。宾大2011年毕业演讲人艾米.古特曼(Amy Gutmann,1949-),美国著名政治理论家、政治学和哲学教授。1971年毕业于哈佛拉德克利夫学院,1972年获伦敦经济学院政治学硕士学位,1976年获哈佛大学政治学博士学位。1986～2004年,在普林斯顿大学先后担任系主任、学术顾问、教务长。2004年,就任宾夕法尼亚大学校长。2005年被评为美国哲学学会院士,2009年获得卡内基公司学术领导奖等多项荣誉。2009年11月,古特曼教授被奥巴马总统任命为美国总统委员会生物伦理问题主席。她公开出版著作15部,发表论文100多篇。文章根据宾夕法尼亚大学网站公布的英文演讲稿翻译而成,标题系译者所加。
基因调控网络是基于微阵列基因表达数据,对基因之间表达关系依赖程度的一种仿真或重建。从基因表达数据挖掘基因之间存在的一定程度因果关系,对重构基因调控网络具有十分重要的意义。提出一种基于频繁原子序列关联熵的基因关联分析算法,通过基因关联熵有效识别基因之间的因果关系,并采用启发式搜索策略构建基因关联贝叶斯调控网络(gene association based Bayesian regulatory,GABR)。与基因贝叶斯网络描述基因表达水平值之间依赖关系不同,GABR是一种基因序列贝叶斯网络,基因关联分析对象是生物组织样本的基因表达值排序并置换为基因列下标所形成的序列。算法的优势在于基因变量取值原子序列,该基因为原子序列的结果,基因关联熵以及条件概率分布的计算更符合基因表达数据分析的生物本质特征。ALARM网络模拟数据的实验结果表明,基因关联分析算法性能明显优于同类算法。在酵母菌微阵列基因数据GDS2267和小鼠胚胎基因GSE76118等GEO数据集进行实验,测试结果表明GABR方法重构的基因调控网络具有较高的有效性和鲁棒性。
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