检索结果-内蒙古大学图书馆

中国医学物理学杂志 2022年第12期39卷 1485-1489页

作者：王霄朱恩照艾自胜同济大学医学院医学统计学教研室上海200092

利用卷积神经网络快速高效地对医学影像数据进行分析和处理可以实现医学影像数据快速分类、定位等操作,提高医学诊疗的效率。本研究从卷积神经网络的背景和原理入手,介绍各种类型的卷积神经网络的应用场景和一些常用的卷积神经网络模型... 详细信息

利用卷积神经网络快速高效地对医学影像数据进行分析和处理可以实现医学影像数据快速分类、定位等操作,提高医学诊疗的效率。本研究从卷积神经网络的背景和原理入手,介绍各种类型的卷积神经网络的应用场景和一些常用的卷积神经网络模型,包括残差卷积神经网络、U-net、循环卷积神经网络等及其在医学影像诊断中的应用,最后针对卷积神经网络和人工智能技术讨论了其未来的展望和挑战。

关键词：人工智能卷积神经网络医学影像医学诊断综述

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能谱CT深度学习图像重建与迭代重建算法图像质量对比的体模和动物模型研究

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中华放射学杂志 2023年第12期57卷 1361-1367页

作者：姜江陈勇石骁萌陆伟王柏松石博文王雯芳朱兰潘自来张欢上海交通大学医学院附属瑞金医院放射科上海200025 GE医疗(中国)CT影像研究中心上海201203 上海交通大学医学院生物统计学教研室上海200025

目的探讨基于体模和动物模型的深度学习重建算法(TF-GSI)和自适应统计迭代重建算法(ASiR-V)对于能谱CT图像质量的影响。方法使用GE Revolution Apex能谱CT对ACR 464体模和胃癌淋巴结转移小鼠模型(n=16)进行扫描。分别在体模和小鼠的70 ... 详细信息

目的探讨基于体模和动物模型的深度学习重建算法(TF-GSI)和自适应统计迭代重建算法(ASiR-V)对于能谱CT图像质量的影响。方法使用GE Revolution Apex能谱CT对ACR 464体模和胃癌淋巴结转移小鼠模型(n=16)进行扫描。分别在体模和小鼠的70 keV虚拟单能图像上重建TF-GSI和ASiR-V的中、高两档等级图像(TF-GSI-M、TF-GSI-H、ASiR-V50%和ASiR-V100%)。评价体模各组图像骨和丙烯酸的任务传递函数(TTF)、图像噪声功率谱(NPS)以及可检测能力指数(d′)。使用单因素方差分析对比小鼠图像噪声、脑组织和肝脏的信噪比(SNR)和对比噪声比(CNR)。2名医师(A和B)评价TF-GSI-H和ASiR-V100%2种重建算法图像对微小病灶检出的一致性采用Kappa检验。结果体模方面,TF-GSI-H组图像在TTF、NPS和d′的表现均最佳:相较ASiR-V100%,TF-GSI-H组图像骨和丙烯酸的TTF50%分别升高了2.4%和8.9%,TF-GSI-H组图像的NPS peak下降了54.1%,TF-GSI-H相对ASiR-V100%对骨和丙烯酸的检出能力分别提升了52.7%和59.5%。TF-GSI组相较ASiR-V组图像噪声降低,2种组织的SNR和CNR均升高,但各组图像间差异不具有统计学意义(P>0.05)。2名医师对2种重建算法图像评价的一致性良好(A,Kappa=0.875,P<0.001;B,Kappa=0.625,P=0.012)。2种重建算法图像对小鼠微小转移灶的检出方面,TF-GSI组高于ASiR-V组(准确度分别为83.5%、71.9%;灵敏度分别为77.8%、61.2%;特异度分别为85.7%、85.7%)。结论TF-GSI相对ASiR-V可以提高能谱CT虚拟单能图像的空间分辨率,改善图像噪声并具有提高微小病灶检出的潜在价值。

关键词：体层摄影术 X线计算机深度学习迭代重建图像质量

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双胎妊娠子痫前期的预测进展

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中华围产医学杂志 2023年第7期26卷 601-606页

作者：谢金亮王筱金王炳顺上海交通大学公共卫生学院上海200025 上海交通大学医学院临床研究中心生物统计教研室上海200025

近年来,双胎妊娠孕妇显著增加。相较单胎,双胎妊娠子痫前期(preeclampsia,PE)发病风险更高、进展更快,病情更严重,因此预测和预防双胎PE更加重要。PE的预测与筛查的发展经历了从指南推荐的危险因素筛查到仅含母体因素的简单模型,再发展... 详细信息

近年来,双胎妊娠孕妇显著增加。相较单胎,双胎妊娠子痫前期(preeclampsia,PE)发病风险更高、进展更快,病情更严重,因此预测和预防双胎PE更加重要。PE的预测与筛查的发展经历了从指南推荐的危险因素筛查到仅含母体因素的简单模型,再发展至联合更广泛指标的复杂模型的过程;同时模型算法也从logistic回归扩展至竞争风险模型等复杂算法,预测模型不断改进。本文全面阐述相关模型在双胎妊娠PE预测中的适用性及研究展望,建议结合本土化指标,通过优化建模策略改进适用于双胎PE的预测模型。

关键词：先兆子痫妊娠,双胎预测生物标记

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头颈部木村病的影像学特征研究

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上海交通大学学报（医学版） 2024年第9期44卷 1182-1189页

作者：罗瑞杨功鑫石慧敏韩永顺何一宁田臻吴颖为上海交通大学医学院附属第九人民医院放射科上海200011 上海交通大学医学院附属第九人民医院统计教研室上海200011 上海交通大学医学院附属第九人民医院病理科上海200011

目的·探究头颈部木村病患者计算机断层扫描(computed tomography,CT)和磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)的影像学特征。方法·回顾性收集2009—2023年上海交通大学医学院附属第九人民医院经病理学确诊的头颈部木村... 详细信息

目的·探究头颈部木村病患者计算机断层扫描(computed tomography,CT)和磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)的影像学特征。方法·回顾性收集2009—2023年上海交通大学医学院附属第九人民医院经病理学确诊的头颈部木村病患者64例,所有患者均在术前完成CT和/或MRI增强成像。收集、记录及分析患者临床及影像学特征,其中包括年龄,性别,外周血嗜酸性粒细胞比例,血清IgE水平,病变位置、形态、大小、CT密度及强化程度、MRI信号及强化程度、表观扩散系数(apparent diffusion coefficient,ADC)、时间-信号强度曲线(time-signal intensity curve,TIC)类型、灌注速率及达峰时间(time to peak,TTP)。结果·64例木村病患者平均年龄(40±19)岁,男性占92.2%;73.5%患者嗜酸性粒细胞比例升高,所有检测血清IgE的患者(10例)IgE水平均升高。CT和MRI共发现结外病变(皮下和腺体病变)82个、淋巴结病变144个;结外病变中,80.5%表现为皮下或腺体内边界不清的斑片状病变,其他为边界清晰的结节状病变。所有病变在CT上均呈等密度影,在MRI上均表现为T1加权成像(T1-weighted imaging,T1WI)等信号,T2加权成像(T2-weighted imaging,T2WI)高信号。结外病变增强后多呈不均匀强化,而淋巴结病变增强后多呈均匀强化。结外病变和淋巴结病变的ADC中位数分别为1.04×10^(-3) mm^(2)/s和0.67×10^(-3) mm^(2)/s,差异具有统计学意义(P=0.000)。动态增强磁共振成像结果显示,结外病变的TIC类型主要为Ⅰ型和Ⅱ型,分别占57.5%和42.5%;而淋巴结病变TIC类型主要为Ⅱ型(96.6%)。结外病变和淋巴结病变的TTP和灌注速率,差异均具有统计学意义(均P=0.000)。结论·木村病结外病变及淋巴结病变在CT上呈等密度影,在MRI上表现为T1WI等信号、T2WI高信号。结外病变ADC较高,TIC类型为Ⅰ或Ⅱ型,增强后多呈不均匀强化;淋巴结病变ADC较低,TIC类型多为Ⅱ型,增强后多呈均匀强化。

关键词：木村病计算机断层扫描磁共振成像扩散加权成像动态增强磁共振成像

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基于贝叶斯网络的随机森林优化填补算法

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海军军医大学学报 2025年第2期46卷 253-257页

作者：董鑫宇陈琪杨志宇贺佳同济大学医学院上海200092 海军军医大学(第二军医大学)卫生勤务学系军队卫生统计学教研室上海200433

目的评估并改进缺失数据处理方法,提升二分类结局预测模型性能。方法模拟数据缺失场景,通过预测模型的ROC AUC及均方根误差(RMSE)共同评估直接剔除、均值填补、随机森林填补、多重填补对预测模型性能的影响,并将贝叶斯网络引入随机森林... 详细信息

目的评估并改进缺失数据处理方法,提升二分类结局预测模型性能。方法模拟数据缺失场景,通过预测模型的ROC AUC及均方根误差(RMSE)共同评估直接剔除、均值填补、随机森林填补、多重填补对预测模型性能的影响,并将贝叶斯网络引入随机森林填补算法,利用变量间相关性进行填补方法的优化。结果不同缺失占比下,通过AUC及RMSE均可得出贝叶斯网络优化随机森林填补算法效果最佳。此外,在缺失占比为10%~20%时,各种填补方法对预测模型的性能提升效果大体相同;当缺失占比为30%~40%时,相较于均值填补,除贝叶斯网络优化随机森林填补算法外,随机森林填补更好,其效果略优于多重填补;当缺失占比接近50%时,即使模型性能依旧较好,但填补数据逐渐偏离真实数据特征,模型的可用性下降。结论贝叶斯网络优化随机森林填补算法总体效果较好,当随机缺失占比30%~40%时可优先考虑。

关键词：预测模型缺失填补随机森林贝叶斯网络

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药物警戒中基于个例安全报告的药品安全性信号检测报告规范解读与启示

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中国药物警戒 2024年第11期21卷 1280-1283页

作者：梁际洲陈晨鑫白汪洋郭晓晶许金芳贺佳叶小飞海军军医大学军队卫生统计学教研室上海200433 同济大学医学院上海200092

目的对药物警戒中基于个例安全报告进行药品安全性信号检测报告规范(READUS-PV)进行分析并解读,为国内更好地基于个例安全报告进行药品安全性信号检测研究提供参考。方法整理分析并解读国际上信号检测领域专家共同发表药物警戒中基于个... 详细信息

目的对药物警戒中基于个例安全报告进行药品安全性信号检测报告规范(READUS-PV)进行分析并解读,为国内更好地基于个例安全报告进行药品安全性信号检测研究提供参考。方法整理分析并解读国际上信号检测领域专家共同发表药物警戒中基于个例安全报告进行药品安全性信号检测报告规范(READUS-PV)。结果READUS-PV从题目、引言、方法、结果、讨论、宣言、摘要等7个方面给出14个条目的建议。结论在实际药品安全性信号检测研究中,可参考READUS-PV,提升研究质量。

关键词：个例安全报告药物警戒信号检测解读启示

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SDAEC算法在单细胞测序数据批次校正中的应用

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中国卫生统计 2024年第4期41卷 501-506页

作者：王文杰李康谢宏宇哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081 浙江大学医学院附属妇产科医院临床研究中心

目的提出深度堆叠降噪自编码嵌套聚类(stacked denoising auto encoder embedded cluster, SDAEC)算法并用于单细胞mRNA测序(single cell mRNA sequence, scRNA-seq)数据的批次效应移除,对其移除批次效应性能进行评估。方法基于单细... 详细信息

目的提出深度堆叠降噪自编码嵌套聚类(stacked denoising auto encoder embedded cluster, SDAEC)算法并用于单细胞mRNA测序(single cell mRNA sequence, scRNA-seq)数据的批次效应移除,对其移除批次效应性能进行评估。方法基于单细胞数据具有高维度、高稀疏性及高度非线性误差特点,通过将单细胞Louvain聚类算法嵌入堆叠降噪自动编码器(stacked denoising auto encoder, SDAE)算法中,形成SDAEC算法,用于单细胞测序数据的批次效应移除。结合实际卵巢癌组织scRNA-seq数据,利用分布邻域嵌入(t-distributed stochastic neighbor embedding, tSNE)、 k最近邻批次效应检测(k-nearest-neighbor batch-effect test, kBET)、调整兰德系数(adjusted rand index, ARI)、标准化互信息(normalized mutual information, NMI)、平均轮廓宽度(average silhouette width, ASW)评价其移除批次效应性能。结果利用SDAEC方法对scRNA-seq数据批次效应移除性能高于Combat、相互最近邻(mutual nearest neighbors, MNN)、分布匹配残差网络(maximum mean discrepancy distribution-matching residual networks, MMD-ResNet)和基于零膨胀负二项的方差提取法(zero-inflated negative binomial-based wanted variation extraction, ZINB-WaVE)。结论 SDAEC算法能够移除scRNA-seq数据的批次效应,提高scRNA-seq数据下游分析的有效性,具有实际应用价值。

关键词：深度堆叠降噪自编码嵌套聚类单细胞测序批次效应卵巢癌

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基于体成分数据分析中老年超重/肥胖女性肠道菌群的特征

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陆军军医大学学报 2023年第15期45卷 1582-1588页

作者：陈孟亭张晓虹杨晶秦立强陈伟苏州大学附属第一医院内分泌科江苏苏州215123 苏州大学公共卫生学院营养与食品卫生学教研室江苏苏州215123 苏州大学附属第一医院临床营养科江苏苏州215123 苏州大学第一临床医学院内分泌病学教研室江苏苏州215123 中国医学科学院北京协和医院临床营养科北京100730

目的探索中老年超重/肥胖女性人群中肠道菌群与人体脂肪、肌肉成分的相关性。方法 2019年9月至2020年10月在苏州市各个社区招募中老年超重/肥胖女性75名,收集基本信息,完成膳食调查,采用老年体力活动量表(physical activity scale for ... 详细信息

目的探索中老年超重/肥胖女性人群中肠道菌群与人体脂肪、肌肉成分的相关性。方法 2019年9月至2020年10月在苏州市各个社区招募中老年超重/肥胖女性75名,收集基本信息,完成膳食调查,采用老年体力活动量表(physical activity scale for the elderly,PASE)评估体力活动量,采用生物电阻抗法测量体成分数据,收集志愿者粪便样本并进行16S rRNA测序,筛选菌群,利用统计学软件建立多元线性回归分析模型,并引入年龄、身高、体力活动量、蛋白质摄入量、脂肪摄入量、碳水化合物摄入量进行校正,分析肠道菌群与体脂肪及肌肉相关指标的关系。结果多元线性回归分析筛选出24个操作分类单元建立模型。校正后结果提示,在脂肪方面,EtOH8科及部分菌属、费氏刺骨鱼菌属(Epulopiscium)与体脂质量(body fat,FAT)正相关,颤螺菌属(Oscillospira)、乳球菌属(Lactococcus)、斯卡多维亚氏菌属(Scardovia)及毛螺菌科(Lachnospiraceae)部分菌属与脂肪质量百分比(fat mass ratio,FMR)负相关。在肌肉方面,除Lachnobacterium属与肌肉质量(soft lean mass,SLM)负相关外,栖热菌科(Thermaceae)、亚栖热菌属(Meiothermus)及库克菌属(Kocuria)等14个菌群与SLM正相关。结论中老年超重/肥胖女性肠道菌群与体脂肪及肌肉相关指标显著相关,部分特定菌群可能对脂肪或肌肉具有积极的调节作用。

关键词：肥胖肠道菌群人体成分中老年体脂质量肌肉质量去脂体质量

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单细胞RNA测序数据批次效应校正方法

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中国卫生统计 2023年第1期40卷 153-156页

作者：王文杰李康谢宏宇哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150086 浙江大学医学院附属妇产科医院

传统的“bulk”RNA测序通过测量一个细胞群中基因的平均表达水平来描述一个组织的整体状态,掩盖了单个细胞的信号及组织内细胞异质性。单细胞RNA测序(single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)是近年来新兴的检测技术,通过单个细胞的转录... 详细信息

传统的“bulk”RNA测序通过测量一个细胞群中基因的平均表达水平来描述一个组织的整体状态,掩盖了单个细胞的信号及组织内细胞异质性。单细胞RNA测序(single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)是近年来新兴的检测技术,通过单个细胞的转录图谱分析其分子状态[1],在描绘细胞微环境,阐述相关生物学机制,识别新的治疗靶点等方面取得了前所未有的进展[2]。scRNA-seq数据通常由多批次实验数据整合而成,批次效应主要来源于实验数据的获取时间、操作人员、试剂批次、设备及检测技术平台等方面。批次效应可能是高度非线性的,它的存在使得下游分析复杂化,结果难以解释。因此,有效地移除scRNA-seq数据批次效应至关重要。

关键词：批次效应分子状态生物学机制细胞微环境数据整合细胞群校正方法整体状态

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基于虚拟教研室的放射卫生教学探索

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当代教育实践与教学研究（电子刊） 2024年第13期 1-4页

作者：陈丹丹苏州大学放射卫生学虚拟教研室/苏州大学苏州医学院放射医学与防护学院

放射卫生学是重要的医学专业课程,也是与核技术应用实践紧密结合的课程.随着大学教学改革的不断深化,原有的教学模式受时间和空间的约束,教学资源的更新、实验仪器的投入赶不上实际发展的需要.因此,"虚拟教研室"的教学新模式... 详细信息

放射卫生学是重要的医学专业课程,也是与核技术应用实践紧密结合的课程.随着大学教学改革的不断深化,原有的教学模式受时间和空间的约束,教学资源的更新、实验仪器的投入赶不上实际发展的需要.因此,"虚拟教研室"的教学新模式能促进理论与实验有机结合,提高课程教学效果.

关键词：放射卫生虚拟教研室放射医学教学方法

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