检索结果-内蒙古大学图书馆

安徽医科大学学报 2025年第2期60卷 255-265页

作者：丁瑞培刘承忠史灿灿张慧玉代宜萍穆如雪李子龙何茂章李卓君安徽医科大学第一临床医学院合肥230032 安徽医科大学基础医学院微生物学教研室合肥230032 南昌大学抚州医学院基础医学部抚州344000

目的分析由健康人粪便中新分离出的一株动物双歧杆菌B4株的全基因组信息,并探究其益生特性。方法采用体外实验方法对动物双歧杆菌B4的耐药性、溶血性、耐胃酸特性以及生化特性进行评估,并利用二代+三代测序技术对该菌进行全基因组测序... 详细信息

目的分析由健康人粪便中新分离出的一株动物双歧杆菌B4株的全基因组信息,并探究其益生特性。方法采用体外实验方法对动物双歧杆菌B4的耐药性、溶血性、耐胃酸特性以及生化特性进行评估,并利用二代+三代测序技术对该菌进行全基因组测序以及基因功能注释。结果经全基因组测序后显示该动物双歧杆菌B4株基因组大小为1944146 bp,GC含量为60.49%,不含质粒,总基因数为1642个。体外实验分析结果显示,该动物双歧杆菌B4株具有良好的益生特性,包括非溶血性和耐胃酸的特性。同时基因组结果显示,该动物双歧杆菌B4株不具有毒素、致病相关基因,耐药基因少且传播能力不高,具有很高的安全性。通过KEGG、COG、GO等基因注释显示其含有很多生物活性酶,如β-半乳糖苷酶、L-乳酸脱氢酶等益生基因。结论该动物双歧杆菌B4株具有良好的益生特性,在基因层面上展示了优良的安全性,具有益生特性的基因序列。

关键词：动物双歧杆菌分离培养全基因组测序基因组分析益生菌益生基因

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一株人源性高效尿酸降解菌M2a的分离鉴定、全基因组测序及功能分析

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微生物学通报 2025年第3期52卷 1309-1322页

作者：迪力努尔·艾克帕贺怡田婷婷梁美婷陈邬锦陈晓瑜朱语秋杜满茜孙玉萍新疆医科大学基础医学院新疆乌鲁木齐830000 新疆第二医学院基础医学部新疆克拉玛依834000 新疆医科大学第五附属医院检验科新疆乌鲁木齐830000 新疆医科大学基础医学院医学微生物学教研室新疆乌鲁木齐830000 新疆医科大学新疆地方病分子生物学重点实验室新疆乌鲁木齐830000

【背景】高尿酸血症是一种尿酸生成与排泄失衡所导致的嘌呤代谢紊乱疾病,而肠道微生物在嘌呤代谢中发挥重要作用,其中1/3的尿酸通过肠道菌群分解,所以肠道益生菌能够有效降低体内尿酸水平,缓解高尿酸血症。【目的】获得人源性尿酸降解菌... 详细信息

【背景】高尿酸血症是一种尿酸生成与排泄失衡所导致的嘌呤代谢紊乱疾病,而肠道微生物在嘌呤代谢中发挥重要作用,其中1/3的尿酸通过肠道菌群分解,所以肠道益生菌能够有效降低体内尿酸水平,缓解高尿酸血症。【目的】获得人源性尿酸降解菌,并了解其与尿酸降解有关的基因及功能。【方法】通过体外尿酸强化培养和驯化,从正常低尿酸健康人群肠道粪便中获得具备尿酸降解能力的菌株,对其进行一般形态学观察、生化试验、16S rRNA基因序列测定,以及生物信息学分析和鉴定,并进行全基因组测序和功能基因挖掘。【结果】分离出一株具有较高尿酸降解功能的革兰氏阳性杆菌M2a,尿酸降解率达到82.73%,经鉴定为类干酪乳酪杆菌(Lacticaseibacillus paracasei),全基因组测序发现菌株M2a具有9个与尿酸降解相关的基因。【结论】菌株M2a具有高效降解尿酸的能力,为开发和利用微生物制剂进行尿酸治疗提供了科学依据和菌种资源。

关键词：类干酪乳酪杆菌菌株鉴定全基因组测序尿酸降解功能分析

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人正常宫颈上皮细胞感染沙眼衣原体的基因表达谱分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2023年第2期43卷 93-101页

作者：贾如斯辰力李明洋杨佳吴芯蕾朱珊丽温州医科大学第一临床医学院(信息与工程学院) 温州325035 武汉大学医学部基础医学院武汉430062 温州医科大学基础医学院微生物学和免疫学教研室温州325035 温州医科大学第二临床医学院温州325035

目的分析人正常宫颈上皮细胞(HcerEpic)感染沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis,Ct)前后基因表达谱差异。方法HcerEpic细胞经DEAE-D预处理后加入E型Ct标准株,培养44 h后收集HcerEpic细胞(感染组),并以未感染Ct的HcerEpic细胞作为对照组,... 详细信息

目的分析人正常宫颈上皮细胞(HcerEpic)感染沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis,Ct)前后基因表达谱差异。方法HcerEpic细胞经DEAE-D预处理后加入E型Ct标准株,培养44 h后收集HcerEpic细胞(感染组),并以未感染Ct的HcerEpic细胞作为对照组,提取两组总RNA后反转录并构建cDNA文库。通过高通量测序分析两组基因表达谱差异,并选择代表性基因通过实时荧光定量PCR(qPCR)验证。结果共检测23997个基因,差异基因125个,其中上调基因119个,下调基因6个;GO分析显示差异基因富集于对病毒防御反应、Ⅰ型干扰素(interferon,IFN)信号通路、对Ⅰ型IFN的细胞反应等条目;KEGG富集通路为甲型流感、单纯疱疹病毒感染、EB病毒感染、HPV感染、NOD样受体通路等相关通路。结论人正常宫颈上皮细胞感染Ct前后转录组存在差异,差异基因主要富集于IFN通路,与细胞抗病毒过程密切相关。qPCR验证了ISG15、IFIT2、OASL、UBE2L6等差异显著且与IFN通路密切相关的基因。

关键词：沙眼衣原体宫颈上皮细胞转录组差异表达基因

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病原感染与免疫教学AI视频动画的制作与思考

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基础医学教育 2024年第3期26卷 249-254页

作者：夏丹丹郭萍刘伯玉张俊玲张林杰王林定王明丽安徽医科大学临床医学院基础医学部病原生物学与免疫学教研室合肥230031 安徽医科大学临床医学院临床医学系安徽医科大学基础医学院微生物学教研室

病原感染与免疫主要教授病原微生物等感染引发疾病后的诊断与防治的发生机制与方法,传统教学法学生接受程度较低。文章中本科生为教学AI视频动画的创作主体,以此探索不同课程独立知识点间的链接,能够更好地理解和掌握各课程的内在联系... 详细信息

病原感染与免疫主要教授病原微生物等感染引发疾病后的诊断与防治的发生机制与方法,传统教学法学生接受程度较低。文章中本科生为教学AI视频动画的创作主体,以此探索不同课程独立知识点间的链接,能够更好地理解和掌握各课程的内在联系。实施方案根据病原感染与免疫三门临床医学生必修课程为主线梳理出40个重难点,制作出30个具有综合内容的教学脚本,依据脚本完成AI化视频动画的制作与表现。在安徽医科大学临床医学院小范围使用后盲评教学效果,99%的学生都认为该教学动画能够加深对相应知识点的理解和记忆。71.71%学生认为画面非常有趣。全体参加该教学动画制作的学生的专业技能与理论联系实际能力显著提升。教师在教学过程使用该视频动画可以提高教学效率。

关键词：基础医学病原感染与免疫教学AI视频动画线上教育教学方法

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7例HIV阴性马尔尼菲篮状菌感染患者基因变异分析及临床特征

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热带医学杂志 2024年第4期24卷 503-508页

作者：连冬丽郭利萍顾雨琛毛艳艳袁静深圳市第三人民医院感染科广东深圳518112 广西医科大学基础医学院微生物学教研室广西南宁530021 深圳大学医学部广东深圳518061

目的分析人类免疫缺陷病毒(HIV)阴性马尔尼菲篮状菌感染患者基因组中非同义单核苷酸变异的情况及其临床特征,为临床诊断提供新思路。方法收集2018年1月-2021年7月深圳市第三人民医院感染科收治的HIV阴性马尔尼菲篮状菌感染患者的血样和... 详细信息

目的分析人类免疫缺陷病毒(HIV)阴性马尔尼菲篮状菌感染患者基因组中非同义单核苷酸变异的情况及其临床特征,为临床诊断提供新思路。方法收集2018年1月-2021年7月深圳市第三人民医院感染科收治的HIV阴性马尔尼菲篮状菌感染患者的血样和临床资料,利用全外显子测序分析基因组中抗真菌相关基因突变的情况,并比较单核苷酸突变患者和无突变患者的临床特征。结果在入组的7例患者基因组中,有4例检测出不同基因位点突变,占57.14%。患者1的STAT1基因发生杂合子突变,c.G1053T,p.L351F;患者2的JAK2基因发生杂合突变,c.C1144T,p.H382Y;患者3的TYK2基因发生杂合突变,c.G2102C,p.R701T;患者5的ARIE基因发生杂合突变,c.C1634T,p.S545F。经遗传变异分析与数据库比对,上述的基因突变存在临床致病可能。对单核苷酸突变患者和无突变患者的临床特征和实验室检查结果进行对比发现,该两组在临床特点和实验室指标方面无明显差异。结论HIV阴性马尔尼菲篮状菌感染患者中存在可能的致病性基因突变,但根据临床特征很难鉴别患者是否具有原发性免疫缺陷,应加强对该类患者的基因突变检测,优化治疗方案,减缓疾病进展。

关键词：马尔尼菲篮状菌真菌感染基因突变

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诺维氏梭菌对小鼠移植性肝癌的抑制作用

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肿瘤预防与治疗 2021年第4期34卷 279-285页

作者：黄筱钧邓昭敏王红仁邝玉李婉宜李明远湖北民族大学医学部病原生物学教研室湖北恩施445000 西藏自治区人民政府驻成都办事处医院医学检验科成都610041 四川大学华西基础医学与法医学院微生物学教研室成都610041 四川大学华西第二医院医学检验科成都610041

目的:评估无毒诺维氏梭菌对小鼠移植性肝癌的抑瘤效应,及其在肿瘤和重要器官的定植情况,并确定瘤内注射的最佳剂量。方法:建立H22皮下移植瘤BALB/c小鼠模型后称小鼠重量,测量肿瘤大小,并按随机原则分为生理盐水组、无毒诺维氏梭菌低剂量... 详细信息

目的:评估无毒诺维氏梭菌对小鼠移植性肝癌的抑瘤效应,及其在肿瘤和重要器官的定植情况,并确定瘤内注射的最佳剂量。方法:建立H22皮下移植瘤BALB/c小鼠模型后称小鼠重量,测量肿瘤大小,并按随机原则分为生理盐水组、无毒诺维氏梭菌低剂量组(1.0×10^(7)/mL,0.5 mL)、中剂量组(1.0×10^(8)/mL,0.5 mL)和高剂量组(1.0×10^(9)/mL,0.5 mL)。每天观察小鼠的一般情况,每周3次定时测量小鼠重量,每周2次测肿瘤大小,评估细菌的抑瘤效应。采用革兰染色法、细菌培养法、PCR技术,了解肿瘤和重要器官中诺维氏梭菌的定植情况。利用HE染色、脾脏指数、胸腺指数,了解细菌干预后荷瘤鼠炎症反应、免疫功能及肿瘤转移的情况。结果:无毒诺维氏梭菌低、中、高剂量组抑瘤率分别为8.49%、44.59%、14.84%,高剂量组小鼠一般情况最差,中剂量组小鼠一般情况最好。培养结果显示,肿瘤组织中有诺维氏梭菌定植,主要脏器无该菌定植。高剂量组和中剂量组荷瘤鼠脾脏质量明显增大,两组脾脏质量和指数与生理盐水组比较差异有统计学意义(P<0.05)。高剂量组胸腺显著缩小,但胸腺指数各组间差异无统计学意义(P>0.05)。结论:无毒诺维氏梭菌能选择性地定植于肝癌区,中剂量(1.0×10^(8)/mL,0.5 mL)无毒诺维氏梭菌能有效抑制免疫正常小鼠H22皮下移植瘤,可能与抗肿瘤免疫和炎症反应有关。

关键词：诺维氏梭菌溶菌疗法肝细胞癌

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长期ART中HIV-1抗体的水平变化特点及其与HIV-1储存库相关关系的研究

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传染病信息 2022年第1期35卷 46-50页

作者：张晴高林郭晓燕孜来古丽·米吉提郭云天 CHEN Wei-wei 焦艳梅王福生蚌埠医学院研究生院 233000 解放军总医院第五医学中心感染病医学部北京100039 北京大学基础医学院病原生物学系暨感染病研究中心 100191 首都医科大学附属北京地坛医院感染科 100015 新疆医科大学基础医学院微生物学教研室乌鲁木齐830017 南方医科大学临床医学院广州510515 Republic of Sierra Leone Armed Forces 34 Military HospitalTropic Infectious Diseases Provention and Control Center999127 Freetown

目的分析HIV-1感染者在长期抗反转录病毒治疗(antiretroviral therapy,ART)前后血浆中p24抗体和总HIV-1特异性抗体水平变化特点及其与HIV-1储存库关系。方法选取2009年11月—2013年7月于我中心接受ART满5年的27例HIV-1感染者作为研究对... 详细信息

目的分析HIV-1感染者在长期抗反转录病毒治疗(antiretroviral therapy,ART)前后血浆中p24抗体和总HIV-1特异性抗体水平变化特点及其与HIV-1储存库关系。方法选取2009年11月—2013年7月于我中心接受ART满5年的27例HIV-1感染者作为研究对象,采用荧光素酶免疫吸附试验和酶联免疫吸附试验,分别检测患者接受ART 0、1、3、5年时间点的p24抗体和总HIV-1特异性抗体的水平,同时对其与总HIV-1 DNA和细胞相关RNA(cell-associated RNA,CA-RNA)的水平进行相关性分析。结果在ART 0、1、3、5年时,p24抗体水平分别为2.450(1.910~5.460)、1.460(1.080~2.160)、1.280(1.120~1.800)、1.570(1.090~2.180)LU;总HIV-1特异性抗体水平分别为3.378(3.157~3.710)、3.489(3.237~3.622)、3.446(2.742~3.573)、3.336(2.860~3.566)。p24抗体与总HIV-1 DNA和CA-RNA的水平均呈正相关(r分别为0.407、0.305,P均<0.05);总HIV特异性抗体水平与总HIV-1 DNA和CA-RNA水平没有相关性(r分别为0.155、0.165,P均>0.05)。结论总HIV-1特异性抗体水平在ART期间没有明显变化,且与HIV-1储存库大小没有相关性,p24抗体水平随着ART时间增加呈逐渐降低的趋势,与HIV-1储存库的大小呈正相关,可为HIV-1特异性抗体和HIV-1储存库大小关系的研究提供依据。

关键词： HIV-1 HIV-1特异性抗体 p24抗体 HIV-1储存库总HIV-1 DNA 细胞相关RNA 抗反转录病毒治疗相关性

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HIV-1感染者肠道产丁酸菌***和***变化特点

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传染病信息 2021年第6期34卷 494-497页

作者：孜来古丽·米吉提马海梅藺志强张芳琴曹琳焦艳梅王福生新疆医科大学基础医学院微生物学教研室乌鲁木齐830017 新疆医科大学第八附属医院检验科乌鲁木齐830046 庆阳市宁县第二人民医院检验科 745201 解放军总医院第五医学中心老年医学科北京100039 解放军总医院第五医学中心感染病医学部北京100039

目的初步探讨2种肠道产丁酸菌***和***在HIV-1感染中的特点以及与疾病进展的关系。方法20例未治疗HIV-1感染者纳入研究对象(HIV-1感染组),以20例年龄、性别等相匹配的健康人作为对照。收集研究对象的血液及粪便标本。提取粪便细菌基因组... 详细信息

目的初步探讨2种肠道产丁酸菌***和***在HIV-1感染中的特点以及与疾病进展的关系。方法20例未治疗HIV-1感染者纳入研究对象(HIV-1感染组),以20例年龄、性别等相匹配的健康人作为对照。收集研究对象的血液及粪便标本。提取粪便细菌基因组DNA,应用实时荧光定量PCR方法对2种产丁酸菌进行定量分析,检测患者的临床指标,用SPSS 20.0软件进行统计学分析。结果对照组与HIV-1感染组中***拷贝数(log)分别为(7.47±7.48)copies/μl、(7.46±7.42)copies/μl,***拷贝数(log)分别为(6.74±6.75)copies/μl、(6.45±6.44)copies/μl,2组之间差异均无统计学意义(P均>0.05)。2组粪便中***水平均高于***。2种细菌的拷贝数呈正相关(对照组r=0.447,HIV-1感染组r=0.499)。HIV-1感染组***的拷贝数与CD4+/CD8+T细胞比值呈正相关(r=0.573)。结论HIV-1感染后产丁酸的优势菌株***与CD4+/CD8+T细胞比值呈正相关,该细菌可能与免疫状态相关。

关键词： F.prausnitzii R.intestinalis HIV-1 实时荧光定量PCR 产丁酸菌丁酸肠道菌群

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金黄色葡萄球菌酚溶调控蛋白α小肽敲除对自溶素AtlA蛋白表达的影响

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第三军医大学学报 2017年第21期39卷 2066-2071页

作者：谭利李思瑞姜北张骁鹏陈江胡晓梅黎庶第三军医大学基础医学部微生物学教研室重庆400038

目的利用同源重组技术构建金黄色葡萄球菌Newman psmα基因缺失突变株,探究psmα缺失对金黄色葡萄球菌蛋白表达的影响。方法分别扩增psmα基因的上下游同源臂,根据同源重组原理,构建p BT2基因打靶载体,利用同源重组技术,构建psmα缺失的... 详细信息

目的利用同源重组技术构建金黄色葡萄球菌Newman psmα基因缺失突变株,探究psmα缺失对金黄色葡萄球菌蛋白表达的影响。方法分别扩增psmα基因的上下游同源臂,根据同源重组原理,构建p BT2基因打靶载体,利用同源重组技术,构建psmα缺失的Newman突变株。并对野生株和突变株培养上清蛋白进行研究。结果突变株培养上清中一个相对分子质量约为135×103的蛋白表达水平较野生株明显减少甚至缺失;质谱分析提示该蛋白为金黄色葡萄球菌atl A基因编码的双功能自溶素前体蛋白(Atl A蛋白);实时荧光定量PCR结果显示psmα基因敲除株atl A基因的转录水平较野生株显著降低。结论 psmα缺失后能够降低atl A基因的转录表达水平。

关键词：金黄色葡萄球菌 PSMα小肽自溶素 Atl A蛋白

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宏基因组研究高脂饮食诱导小鼠的肥胖易感性与肠道菌群的关系

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第三军医大学学报 2017年第8期39卷 773-780页

作者：朱宏斌沈伟王竞卢曙光赵岩乐率申梦宇李刚杨雨卉龚雅利李明谭银玲胡福泉第三军医大学基础医学部微生物学教研室、重庆市微生物工程实验室重庆400038

目的考察高脂饮食喂养后小鼠肠道菌群在组成及功能上与肥胖易感的相关性。方法采用高脂饲料喂养C57BL/6J小鼠构建高脂饮食诱导肥胖组(high-fat-diet-induced-obesity,HFDIO)和高脂饮食诱导肥胖抵抗组(high-fat-diet-induced-obesity-res... 详细信息

目的考察高脂饮食喂养后小鼠肠道菌群在组成及功能上与肥胖易感的相关性。方法采用高脂饲料喂养C57BL/6J小鼠构建高脂饮食诱导肥胖组(high-fat-diet-induced-obesity,HFDIO)和高脂饮食诱导肥胖抵抗组(high-fat-diet-induced-obesity-resistant,HFDIOR)模型,正常饲料组为对照组,搜集并提取3组小鼠粪便样本细菌基因组,DNA质检后挑取高质量样本(每组6个),采用Illumina公司的Hiseq2000进行细菌宏基因组测序及相关生物信息学与统计学分析。结果较之对照组,肥胖组和肥胖抵抗组小鼠肠道厚壁菌门、变形菌门、脱铁杆菌门含量显著升高,拟杆菌门显著下降(P<0.05)。肥胖组和肥胖抵抗组小鼠肠道的特征菌种组成显著不同,且毛螺菌科中的Lachnospiraceae bacterium 10_1与Lachnospiraceae bacterium 28_4分别为肥胖及肥胖抵抗组小鼠的关键菌种;肥胖与肥胖抵抗小鼠肠道菌群的功能及代谢显著差异则主要集中在碳水化合物代谢、核酸代谢与锚定、膜转运活性及转移酶活性等方面。结论不同个体对于饮食诱导的肥胖的易感性差别可能与肠道菌群组成及功能变化相关,这有助于正确评价肠道菌群在肥胖发生中的作用。

关键词：肥胖肠道菌群饮食诱导肥胖抵抗高脂饮食宏基因组

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