检索结果-内蒙古大学图书馆

解放军理工大学学报（自然科学版） 2013年第4期14卷 390-397页

作者：黄海平盛勇华徐佳王汝传南京邮电大学计算机学院江苏南京210003 苏州大学江苏省计算机信息处理技术重点实验室江苏苏州215006 东南大学计算机网络和信息集成教育部重点实验室江苏南京211189 计算机软件新技术国家重点实验室(南京大学) 江苏南京210093

由于无法维护稳定的端到端路径,现有的数据传输多采用即遇即传的路由算法,普遍存在信息投递率低、网络冗余大、节点易受攻击等问题;同时,延迟容忍网络路由技术越来越多地应用于存在着节点自私性的社会网络中。为了解决以上问题,提出了... 详细信息

由于无法维护稳定的端到端路径,现有的数据传输多采用即遇即传的路由算法,普遍存在信息投递率低、网络冗余大、节点易受攻击等问题;同时,延迟容忍网络路由技术越来越多地应用于存在着节点自私性的社会网络中。为了解决以上问题,提出了一种考虑用户社交关系同时提高信息传输效率为目的数据传输方法。主要分3个步骤:初始化,节点根据社会关系权值建立各自的通讯录;路由选择,利用节点的历史投递时延作为其传输成功率的依据,并以此进行高效的路由选择;副本管理和队列调度,采用节点最大副本数来减少信息冗余以及最大化社会关系权值进行队列调度。THE ONE仿真工具的实验结果表明,提出的SRDD算法,与EPIDEMIC和PROPHET算法相比,具有更高的数据传输成功率以及更低的传输时延,同时保证了节点更好的安全性。

关键词：延迟容忍网络社交关系路由选择数据传输

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带方向特征的Contourlet HMT模型

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中国科学：信息科学 2013年第5期43卷 626-643页

作者：王相海陈明莹宋传鸣徐孟春方玲玲辽宁师范大学计算机与信息技术学院大连116029 南京大学计算机软件新技术国家重点实验室南京210093 苏州大学江苏省计算机信息处理技术重点实验室苏州215006

根据Shannon信息理论将纹理的方向特征定义为:图像中信号取值为随机分布的奇异值时方向变量的取值特征.根据这一定义,并结合Tamura方向特征的求取方法,文中对Contourlet变换系数的方向概率分布进行了研究,获得方向特征在Contourlet变换... 详细信息

根据Shannon信息理论将纹理的方向特征定义为:图像中信号取值为随机分布的奇异值时方向变量的取值特征.根据这一定义,并结合Tamura方向特征的求取方法,文中对Contourlet变换系数的方向概率分布进行了研究,获得方向特征在Contourlet变换的父子子带间形成传递这一结论,在此基础上结合Contourlet隐Markov树(HMT)模型,建立了以隐状态变量分布为条件的方向隐变量的概率分布模型,即带方向特征的Contourlet HMT模型,给出了该模型的结构和训练方法.此外,通过基于所提出模型的无监督结合上下文信息的图像分割算法对合成图像和遥感图像的目标分割实验验证了所提出模型的有效性.

关键词：方向特征 Contourlet HMT 无监督纹理分割隐状态变量分布

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一种蛋白质与肽段全柔性计算对接方法

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计算机与应用化学 2013年第7期30卷 776-780页

作者：李海鸥吕强吴宏杰苏州大学计算机科学与技术学院江苏苏州215006 江苏省计算机信息处理技术重点实验室江苏苏州215006 苏州科技学院电子与信息工程学院江苏苏州215009

蛋白质-肽段对接时受体的骨架柔性问题一直以来都是计算生物学中的一个挑战。目前,绝大多数的对接都是一种半柔性对接(只考虑配体的柔性)。然而在真实的对接过程中,受体也会产生构象变化,包括侧链运动、骨架运动或其它突变。本文提出了... 详细信息

蛋白质-肽段对接时受体的骨架柔性问题一直以来都是计算生物学中的一个挑战。目前,绝大多数的对接都是一种半柔性对接(只考虑配体的柔性)。然而在真实的对接过程中,受体也会产生构象变化,包括侧链运动、骨架运动或其它突变。本文提出了一种包含受体骨架柔性的蛋白质-肽段柔性对接方法。在8个较难的Unbound蛋白质-肽段复合物和2个受体有明显柔性区域的对接案例上进行了测试。分析表明本文提出的这种柔性对接方法在受体有明显柔性区域的案例上都取得了很大的改进。

关键词：蛋白质-肽段对接骨架柔性 Unbound

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一种基于折叠模式识别的蛋白质结构片段库构建方法

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小型微型计算机系统 2013年第2期34卷 356-359页

作者：陈沙沙吴宏杰吕强苏州大学计算机科学与技术学院江苏苏州215006 江苏省计算机信息处理技术重点实验室江苏苏州215006 苏州科技学院电子与信息工程学院江苏苏州215009

片段组装方法是从头预测蛋白质三维结构的一类重要方法.现有的基于序列相似的片段库质量限制了低同源目标的预测精度,所以寻找与天然结构更加拟合的已知蛋白质结构片段来构建高质量的片段库是片段组装方法的一项重要任务.本文利用SCOP... 详细信息

片段组装方法是从头预测蛋白质三维结构的一类重要方法.现有的基于序列相似的片段库质量限制了低同源目标的预测精度,所以寻找与天然结构更加拟合的已知蛋白质结构片段来构建高质量的片段库是片段组装方法的一项重要任务.本文利用SCOP数据库中的三维结构相似性,对SCOP的折叠模式进行预测,提取预测出的相同折叠模式的已知蛋白质结构的信息,生成保存残基信息的数据库(Vall库).然后将目标蛋白质序列分割成的残基片段与Vall库进行综合评价后生成一种新的片段库,该片段库可以用于一个骨架预测并行蚁群算法.将本文方法与蛋白质结构预测程序RosettaAbinitio的基于序列的片段库进行了比较,实验结果表明采用本文方法的片段库可以找到更接近天然构象的蛋白质结构.

关键词：蛋白质折叠模式片段库 SCOP

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非下采样Contourlet HMT模型

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中国科学：信息科学 2013年第11期43卷 1431-1444页

作者：王相海倪培根苏欣方玲玲宋传鸣辽宁师范大学计算机与信息技术学院大连116029 苏州大学江苏省计算机信息处理技术重点实验室苏州215006 辽宁师范大学数学学院大连116029

非下采样Contourlet变换(NSCT)不仅具有类似传统小波变换和Contourlet变换的多尺度和多方向特性,而且还具有良好的平移不变特性.文中对NSCT变换系数进行研究,获得NSCT变换的方向子带系数同样具有持续性和聚集性的结论;在此基础上结合隐M... 详细信息

非下采样Contourlet变换(NSCT)不仅具有类似传统小波变换和Contourlet变换的多尺度和多方向特性,而且还具有良好的平移不变特性.文中对NSCT变换系数进行研究,获得NSCT变换的方向子带系数同样具有持续性和聚集性的结论;在此基础上结合隐Markov树模型,建立了一种新的基于NSCT域的隐Markov树模型NSCT-HMT,并且给出了该模型的参数结构以及模型参数的训练方法;最后将所提出的模型应用于图像去噪中取得了很好的仿真效果.

关键词：非下采样Contourlet变换高斯混合模型隐Markov树模型 NSCT-HMT模型图像去噪

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基于租户的访问控制模型T-ARBAC

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计算机科学与应用 2013年第3期3卷 173-179页

作者：曹进李培峰朱巧明钱培德苏州大学计算机科学与技术学院苏州江苏省计算机信息处理技术重点实验室苏州

SaaS服务模式极大地降低了企业成本、提高了企业效率,同时也提高了企业的管理水平及加快了其创新步伐。但由于租户数据存储于服务提供商数据存储平台,如何保障租户的数据安全是一个无法回避的问题,并且平台用户数量巨大,如何有效地对用... 详细信息

SaaS服务模式极大地降低了企业成本、提高了企业效率,同时也提高了企业的管理水平及加快了其创新步伐。但由于租户数据存储于服务提供商数据存储平台,如何保障租户的数据安全是一个无法回避的问题,并且平台用户数量巨大,如何有效地对用户进行管理也是一个值得探索的问题。本文结合基于角色的访问控制模型,设计出一个支持多租户、方便租户权限控制与管理的SaaS平台访问控制模型T-ARBAC (Tenant-Admin- istrative Role Based Access Control),满足了租户访问控制策略多样性与安全、独立访问共存数据的要求。

关键词：多租户访问控制 T-ARBAC

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基于距离特征的蛋白质无序段建模方法及应用

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苏州科技学院学报（自然科学版） 2013年第2期30卷 37-40,56页

作者：刘宏伟吕强苏州大学计算机科学与技术学院江苏苏州215006 江苏省计算机信息处理技术重点实验室江苏苏州215006

蛋白质无序段在天然条件下无法折叠到特定的三维结构,具有高度的结构动态性。现有的对无序段从能量角度建模的方法缺少对无序段的空间约束。首先提取无序段的空间特征,并找到使预测过程趋于最低能量的最优特征值,最后将这些特征值作为... 详细信息

蛋白质无序段在天然条件下无法折叠到特定的三维结构,具有高度的结构动态性。现有的对无序段从能量角度建模的方法缺少对无序段的空间约束。首先提取无序段的空间特征,并找到使预测过程趋于最低能量的最优特征值,最后将这些特征值作为约束应用到并行蚁群蛋白质结构预测算法。实验结果表明:该方法可以有效地利用无序段对蛋白质结构的连接作用,有助于搜索到更接近天然结构的折叠区域结构。

关键词：无序段折叠区域并行蚁群结构预测

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蛋白质loop区域闭合数值方法分析与比较

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软件导刊 2013年第8期12卷 29-33页

作者：孙路吕强徐维维权丽君苏州大学计算机科学与技术学院江苏苏州215006 江苏省计算机信息处理技术重点实验室江苏苏州215006

针对蛋白质loop区域的闭合问题,比较分析了两种来源于机器人学的数值方法——循环坐标下降法(CCD)和雅可比矩阵方法,进行了实现并设计实验。在计算时间和闭合效率方面循环坐标下降法要明显优于雅可比矩阵方法,而雅可比矩阵方法则可以较... 详细信息

针对蛋白质loop区域的闭合问题,比较分析了两种来源于机器人学的数值方法——循环坐标下降法(CCD)和雅可比矩阵方法,进行了实现并设计实验。在计算时间和闭合效率方面循环坐标下降法要明显优于雅可比矩阵方法,而雅可比矩阵方法则可以较平均地改变每一个二面角值。

关键词：蛋白质 loop区域闭合数值方法,循环坐标下降法雅可比矩阵

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GPCR跨膜螺旋的结构拓扑建模及其预测方法

GPCR跨膜螺旋的结构拓扑建模及其预测方法

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2013中国计算机大会

作者：吴宏杰吕强权丽君陈荣陈沙沙李海鸥钱培德苏州大学计算机科学与技术学院江苏苏州 215006 苏州大学江苏省计算机信息处理技术重点实验室江苏苏州 215006 苏州科技学院电子与信息工程学院江苏苏州 215009 苏州大学计算机科学与技术学院江苏苏州 215006 苏州大学江苏省计算机信息处理技术重点实验室江苏苏州 215006 苏州大学计算机科学与技术学院江苏苏州 215006

7个a跨膜螺旋组成的螺旋束是G蛋白偶联受体的最主要拓扑特征,其三维结构的预测精度直接影响完整受体的三维结构预测、配体对接及功能分析的准确性.近期许多研究小组提出了各种方法,同时也遇到了一个共同的问题:采样时难以在7个跨膜螺旋... 详细信息

7个a跨膜螺旋组成的螺旋束是G蛋白偶联受体的最主要拓扑特征,其三维结构的预测精度直接影响完整受体的三维结构预测、配体对接及功能分析的准确性.近期许多研究小组提出了各种方法,同时也遇到了一个共同的问题:采样时难以在7个跨膜螺旋结构的保守性与局部多样性之间获得平衡,其实质是未将两者统一到一个系统模型中.文中针对跨膜螺旋的空间结构特点,建立了兼顾保守性与多样性的结构拓扑模型,并利用该模型形成了4阶段的结构优化方法,试图获得采样广度与深度的平衡.同时,引入基于结构拓扑的能量项与约束,起到了优化评判标准和剪裁采样空间的作用,有效地预测了跨膜螺旋的三维结构.使用文中方法展开了3组验证实验,用8个已解构的目标分别与GPCRDOCK2010的参赛结果、知名结构预测工具Swiss和MODELLER进行了比较.与Swiss的比较中,文中方法有5个目标获得了更优的三维螺旋结构;与单模板、多模板的MODELLER的比较中,文中方法分别在6个目标与7个目标上取得了优势.

关键词： G蛋白偶联受体跨膜螺旋结构拓扑模型计算机应用

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抗自适应泄漏的基于身份加密方案

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通信学报 2012年第7期33卷 90-95页

作者：汤佳惠朱艳琴罗喜召苏州大学计算机科学与技术学院江苏苏州215006 苏州大学江苏省计算机信息处理技术重点实验室江苏苏州215006

针对基于身份的加密(IBE)体制中缺乏有效抗自适应泄漏方案的问题,运用熵抗泄漏的基本思想,定义了自适应泄漏攻击下IBE的安全性;利用基于身份的散列证明系统(IB-HPS)和提取器,提出了抗自适应泄漏的IBE方案;并对其进行实例化,构建了基于q-... 详细信息

针对基于身份的加密(IBE)体制中缺乏有效抗自适应泄漏方案的问题,运用熵抗泄漏的基本思想,定义了自适应泄漏攻击下IBE的安全性;利用基于身份的散列证明系统(IB-HPS)和提取器,提出了抗自适应泄漏的IBE方案;并对其进行实例化,构建了基于q-TABDHE假设的抗自适应泄漏的IBE方案。安全性分析表明,设计的IBE方案是选择明文攻击安全的,它不仅能够有效地抵抗自适应泄漏,而且能够容忍较大的密钥泄漏量。

关键词：自适应泄漏基于身份的加密熵抗泄漏 q-TABDHE假设

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