目的 PDCD5(programmed cell death 5)作为凋亡促进因素在多种肿瘤中表达下降,本研究力求阐明PDCD5在乳腺癌亚型中的表达和预后的作用。方法利用Gene Expression-Based Outcome for Breast Cancer Online algorithm(GOBO)软件分析PDCD5...
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目的 PDCD5(programmed cell death 5)作为凋亡促进因素在多种肿瘤中表达下降,本研究力求阐明PDCD5在乳腺癌亚型中的表达和预后的作用。方法利用Gene Expression-Based Outcome for Breast Cancer Online algorithm(GOBO)软件分析PDCD5对乳腺癌亚型预后的影响。结果在各种乳腺癌亚型中,PDCD5基因在基底细胞样乳腺癌组织中高表达,ER阴性的乳腺癌组织中PDCD5表达比阳性组织表达高。PDCD5低表达能够增加ER+LN-患者,未经tamoxifen治疗患者和LN-患者的总存活时间。然而PDCD5高表达能够促进ER+luminal B患者和未经tamoxifen治疗ER+患者的总存活时间。结论 PDCD5可能参与基底细胞样乳腺癌发病机制。
目的:探讨Cox比例风险模型与加速失效时间模型(accelerated failure time model,AFT)在基因表达数据生存分析中的应用及比较。方法:针对基因表达数据高维小样本的特性,首先采用偏最小二乘法对基因数据集进行降维,然后以降维后的成分为...
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目的:探讨Cox比例风险模型与加速失效时间模型(accelerated failure time model,AFT)在基因表达数据生存分析中的应用及比较。方法:针对基因表达数据高维小样本的特性,首先采用偏最小二乘法对基因数据集进行降维,然后以降维后的成分为协变量对两类生存模型进行拟合并比较其性能。结果:两类模型中病人生存时间的对数秩检验表明,不同风险组生存时间的差异均有统计学意义(P<0.01),而AFT模型比Cox模型具有更大的检验统计量的值。结论:Cox模型和AFT模型都适用于基因表达数据的生存分析,在某些实际应用中AFT模型的拟合效果可能更优于Cox模型。
目的:PDCD5(programmed cell death 5)在多种肿瘤组织和细胞中表达降低,但是在胃癌组织未见系统研究,本文基于数据挖掘分析PDCD5表达对胃癌预后的影响。方法:利用Oncomine数据库挖掘PDCD5在胃癌组织中的表达情况。利用Kaplan-Meier Plot...
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目的:PDCD5(programmed cell death 5)在多种肿瘤组织和细胞中表达降低,但是在胃癌组织未见系统研究,本文基于数据挖掘分析PDCD5表达对胃癌预后的影响。方法:利用Oncomine数据库挖掘PDCD5在胃癌组织中的表达情况。利用Kaplan-Meier Plotter进行胃癌患者生存周期分析。结果:相比正常胃组织,PDCD5基因在弥漫型胃癌组织和混合型胃癌组织中呈低表达,而肠型胃癌组织未见明显变化。PDCD5高表达能够延长弥漫型胃癌、混合型胃癌和肠型胃癌患者的生存时间。结论:大样本数据挖掘能迅速准确地获取胃癌组织中PDCD5表达的相关信息,为深入研究奠定基础。
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