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生物工程学报 2021年第7期37卷 2232-2239页

作者：刘子齐左涛徐锋徐平军事科学院军事医学研究院生命组学研究所中国医学科学院蛋白质组学与药物研发新技术创新单元国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

多数癌症的发生发展都具有细胞周期高度活化的特性。细胞周期蛋白依赖性激酶4/6 (CDK4/6)不仅在细胞有丝分裂中发挥了巨大作用,而且参与了衰老、凋亡和组蛋白调节等诸多生物学过程,并在多种癌症的发生发展中被异常激活。FDA批准了Palboc... 详细信息

多数癌症的发生发展都具有细胞周期高度活化的特性。细胞周期蛋白依赖性激酶4/6 (CDK4/6)不仅在细胞有丝分裂中发挥了巨大作用,而且参与了衰老、凋亡和组蛋白调节等诸多生物学过程,并在多种癌症的发生发展中被异常激活。FDA批准了Palbociclib、Ribociclib和Abemaciclib等3种靶向CDK4/6的抑制剂,在临床上也取得了显著的疗效,有效地延长了内分泌治疗耐药的乳腺癌患者以及其他多种类型癌症患者的生存期。但这些抑制剂的临床应用也面临着获得性耐药等问题。文中综述了CDK4/6参与的生物调控过程,及其抑制剂在癌症治疗中的应用和面临的耐药性挑战。

关键词：肿瘤 CDK4/6 CDK4/6抑制剂耐药

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基于SH2超亲体的微量样品酪氨酸磷酸化蛋白质组学技术研究进展及应用

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生物工程学报 2021年第7期37卷 2334-2341页

作者：门丽影徐锋徐平安徽医科大学基础医学院安徽合肥230032 军事科学院军事医学研究院生命组学研究所中国医学科学院蛋白质组学与药物研发新技术创新单元国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

酪氨酸磷酸化是生物体内一种重要的蛋白质磷酸化修饰类型,参与细胞信号转导、细胞迁移、凋亡等众多的生命活动过程。在磷酸化蛋白质组学研究中,由于酪氨酸磷酸化蛋白丰度低且有时起始样品量有限,传统的磷酸化蛋白质组富集方法用于酪氨... 详细信息

酪氨酸磷酸化是生物体内一种重要的蛋白质磷酸化修饰类型,参与细胞信号转导、细胞迁移、凋亡等众多的生命活动过程。在磷酸化蛋白质组学研究中,由于酪氨酸磷酸化蛋白丰度低且有时起始样品量有限,传统的磷酸化蛋白质组富集方法用于酪氨酸磷酸化肽富集效率较低。微量样品的制备技术以及SH2超亲体的引入正在改变酪氨酸磷酸化蛋白质组研究的现状,现对此进行综述。

关键词：酪氨酸磷酸化 SH2超亲体微量样品膜蛋白富集技术

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酪氨酸磷酸化蛋白质组学技术研究进展及其在生物医学研究中的应用

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生物工程学报 2021年第1期37卷 100-111页

作者：李凯旋徐锋徐平河北大学生命科学学院河北保定071002 军事科学院军事医学研究院生命组学研究所国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室中国医学科学院蛋白组学与新药研发新技术创新单元北京102206

在酪氨酸磷酸化蛋白质组学的研究过程中,酪氨酸磷酸化位点的富集是最重要的一步。目前常用的富集方法是抗体亲和富集或SH2 superbinder富集。此外,通过质谱与生物信息学等技术,可实现大规模酪氨酸磷酸化位点的鉴定。对酪氨酸磷酸化蛋白... 详细信息

在酪氨酸磷酸化蛋白质组学的研究过程中,酪氨酸磷酸化位点的富集是最重要的一步。目前常用的富集方法是抗体亲和富集或SH2 superbinder富集。此外,通过质谱与生物信息学等技术,可实现大规模酪氨酸磷酸化位点的鉴定。对酪氨酸磷酸化蛋白质组学进行深度覆盖研究,揭示癌症发生发展过程中失调的激酶,将有助于深入理解癌症的发生发展过程;且由于75%的致癌基因是酪氨酸激酶基因,酪氨酸激酶抑制剂作为抗癌药物受到了越来越多的关注。应用酪氨酸磷酸化蛋白质组学技术,可以鉴定与癌症等重大疾病相关的酪氨酸激酶,从而帮助找到酪氨酸激酶抑制剂。总之,酪氨酸磷酸化蛋白质组学技术可以在酪氨酸激酶鉴定、酪氨酸激酶抑制剂研究及酪氨酸磷酸化信号通路研究等生物医学领域中得到很好的应用。

关键词：酪氨酸激酶酪氨酸磷酸化酪氨酸磷酸化肽段富集精准医学

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C1QA水平与R-CHOP方案治疗弥漫大B细胞淋巴瘤患者疗效和预后的关系

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中华肿瘤杂志 2021年第12期43卷 1310-1315页

作者：王艳荣杨建良秦燕周生余刘鹏何小慧姜时雨赵凤仪钟巧凤周钰李阳许萌于晓波韩晓红石远凯国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院内科抗肿瘤分子靶向药物临床研究北京市重点实验室100021 军事科学院军事医学研究院生命组学研究所国家蛋白质科学中心北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室102206 国家癌症中心中国医学科学院北京协和医学院临床药理研究中心100032

目的探讨R-CHOP方案(利妥昔单抗+环磷酰胺+阿霉素+长春新碱+泼尼松)或类R-CHOP方案治疗的弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者治疗前血浆补体水平与临床病理特征和预后的关系。方法收集2010—2016年于中国医学科学院肿瘤医院就诊的105例DLBCL... 详细信息

目的探讨R-CHOP方案(利妥昔单抗+环磷酰胺+阿霉素+长春新碱+泼尼松)或类R-CHOP方案治疗的弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者治疗前血浆补体水平与临床病理特征和预后的关系。方法收集2010—2016年于中国医学科学院肿瘤医院就诊的105例DLBCL患者的临床病理资料。采用抗体芯片检测R-CHOP或类R-CHOP治疗的105例DLBCL患者治疗前和80例健康对照者血浆中34种补体的水平,分析DLBCL患者治疗前血浆补体水平与临床病理特征和预后的关系。结果国际预后指数(IPI)评分为3~5分患者血浆中补体C1QA的信号值为1261.43±138.96,与IPI评分为0~2分患者(950.79±80.19)比较,差异有统计学意义(P=0.037)。IPI评分为3~5分患者的CR1L信号值为2214.69±98.58,与IPI评分0~2分患者(1984.67±121.79)比较,差异有统计学意义(P=0.017)。非完全缓解(non-CR)组患者的C1QA信号值为1165.43±98.56,与完全缓解(CR)组(914.70±100.77)比较,差异有统计学意义(P=0.045);non-CR组患者的CR1L信号值为2263.13±145.63,与CR组(1821.34±84.68)比较,差异有统计学意义(P=0.008)。Cox回归分析显示,血浆中C1QA信号值升高与DLBCL患者的无进展生存时间(HR=2.063,95%CI为1.220~3.489,P=0.007)和总生存时间(HR=2.23,95%CI为1.036~4.798,P=0.040)有关。采用多因素Cox回归进行IPI评分校正后,血浆C1QA信号值升高仍与无进展生存时间有关(HR=1.765,95%CI为1.034~3.013,P=0.037)。结论采用R-CHOP或类R-CHOP方案治疗的DLBCL患者基线血浆中C1QA和CR1L水平与患者的IPI评分和疗效有关,C1QA血浆基线水平对DLBCL患者的预后具有一定的预测价值。

关键词：弥漫大B细胞淋巴瘤补体 C1Q C1QA 利妥昔单抗

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外泌体蛋白质组学在肝癌发生发展和治疗研究中的应用进展

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生物工程学报 2020年第10期36卷 1992-2000页

作者：赵丽萍徐锋张亚莉徐平贵州大学医学院贵州贵阳550025 军事科学院军事医学研究院生命组学研究所国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206 中国医学科学院蛋白组学与新药研发新技术创新单元北京102206

肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是最常见的五大恶性肿瘤之一。据世界卫生组织(World health organization,WHO)最新统计,肝癌发病率位居全球第八,死亡率位居全球第三,严重影响人们的生命健康。外泌体(Exosomes)是磷脂双分子层... 详细信息

肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是最常见的五大恶性肿瘤之一。据世界卫生组织(World health organization,WHO)最新统计,肝癌发病率位居全球第八,死亡率位居全球第三,严重影响人们的生命健康。外泌体(Exosomes)是磷脂双分子层包被的细胞外囊泡,携带来自母细胞的蛋白质、核酸等活性物质,可实现细胞间的物质交换和信息交流,参与协调体内的生理病理过程。近年来外泌体与肝癌相关性的研究引起了广泛关注,大量研究表明外泌体蛋白在肝癌的发生发展、诊断治疗和预后方面发挥至关重要的作用。现就外泌体的组成与功能、外泌体蛋白在肝癌的作用进行简要综述。

关键词：肝癌外泌体蛋白蛋白质组学分子标志物诊断治疗

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K27泛素化修饰研究进展

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生物工程学报 2020年第8期36卷 1484-1492页

作者：孙圳卢慧肖伟弟李衍常徐平军事科学院军事医学研究院生命组学研究所蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心北京102206 东北大学生命科学与健康学院微生物药物研究所辽宁沈阳110819 中国医学科学院蛋白组学与新药研发创新单元北京102206

泛素化修饰作为最普遍存在的翻译后修饰形式之一,介导了生物体内蛋白质稳态调控等功能。泛素分子的7个赖氨酸和N端甲硫氨酸可以继续被泛素分子修饰,进而形成8种类型的泛素链。其中,K48和K63泛素链由于丰度高且功能研究相对清楚被称为经... 详细信息

泛素化修饰作为最普遍存在的翻译后修饰形式之一,介导了生物体内蛋白质稳态调控等功能。泛素分子的7个赖氨酸和N端甲硫氨酸可以继续被泛素分子修饰,进而形成8种类型的泛素链。其中,K48和K63泛素链由于丰度高且功能研究相对清楚被称为经典泛素链,而其他6种泛素链被称为非经典泛素链。在非经典泛素链中,K27泛素链是在泛素分子的Lys27(K27)位点上继续发生泛素化形成的,具有紧密的空间结构。近些年,K27泛素链在固有免疫、蛋白稳态和DNA损伤修复等方面的功能逐渐被报道,但K27泛素链的合成、修剪过程及其下游招募特定蛋白质的分子调控机制还所知甚少。文中结合实验室研究,综述了K27泛素链结构特征、结合方式和生物学功能,为未来K27泛素链结构和生物学功能的深入研究提供参考。

关键词：泛素 K27泛素链免疫 DNA损伤

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鞭毛蛋白衍生多肽CBLB502免疫反应对其抗辐射作用的影响

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军事医学 2021年第12期45卷 891-895页

作者：段君昭王磊詹轶群葛常辉军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所北京放射生物学重点实验室北京100850 军事科学院军事医学研究院生命组学研究所国家蛋白质科学中心北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

目的 Toll样受体5(TLR5)配体鞭毛蛋白衍生多肽CBLB502,具有良好的辐射防护作用,但其本身具有一定的免疫激活作用。该文拟研究CBLB502的免疫原性对其抗辐射药效的影响。方法应用ELISA方法检测正常人群中CBLB502的免疫原性反应,通过CBLB50... 详细信息

目的 Toll样受体5(TLR5)配体鞭毛蛋白衍生多肽CBLB502,具有良好的辐射防护作用,但其本身具有一定的免疫激活作用。该文拟研究CBLB502的免疫原性对其抗辐射药效的影响。方法应用ELISA方法检测正常人群中CBLB502的免疫原性反应,通过CBLB502对小鼠的迟发型超敏反应和溶血空斑实验,观察多次免疫小鼠对CBLB502的免疫反应以及对其抗辐射活性的影响。结果约4.5%正常人对CBLB502具有较高反应性,CBLB502较高剂量时(10 mg/kg)小鼠迟发型超敏反应增强,体液免疫受到抑制;但在较低剂量(<3 mg/kg)时无免疫毒性。连续给药可显著激活小鼠的免疫反应,但对CBLB502的抗辐射活性抑制达80%~90%,显著降低小鼠存活率。此外,高剂量(0.5 mg/kg)给药组的存活率显著低于免疫照射对照组。结论 CBLB502连续给药可显著降低其抗辐射活性并具有一定副作用。

关键词：鞭毛蛋白衍生多肽 CBLB502 Toll样受体5 免疫原性抗辐射酶联免疫吸附测定

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人类蛋白质组计划研究现状与趋势

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中国基础科学 2020年第4期22卷 1-6,50页

作者：姜颖张普民贺福初蛋白质组学国家重点实验室军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心北京102206

在人类基因组草图完成之际,一批科学家迅速集结于国际人类蛋白质组组织(HUPO)旗下,启动"人类蛋白质组计划(HPP)"。近20年来,以鉴定和定量复杂体系中基因组编码全套蛋白质为核心的蛋白质组学技术获得了空前发展。在这篇文章中... 详细信息

在人类基因组草图完成之际,一批科学家迅速集结于国际人类蛋白质组组织(HUPO)旗下,启动"人类蛋白质组计划(HPP)"。近20年来,以鉴定和定量复杂体系中基因组编码全套蛋白质为核心的蛋白质组学技术获得了空前发展。在这篇文章中,我们将回顾HPP的发展历程和我国在蛋白质组学领域的最新进展,并简略讨论"蛋白质组学驱动的精准医学"的发展趋势和应用前景。

关键词：人类蛋白质组计划人类肝脏蛋白质组计划蛋白质组学驱动的精准医学

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组织蛋白酶S在肝细胞癌发生发展中的调控作用研究进展

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军事医学 2020年第8期44卷 634-638页

作者：陶萍徐平广州中医药大学附属第二临床医学院广州510120 军事科学院军事医学研究院生命组学研究所国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室中国医学科学院蛋白组学与新药研发新技术创新单元北京102206

肝细胞癌(HCC)是临床常见的恶性肿瘤之一,其发病率逐年升高,预后差。组织蛋白酶S(CTSS)是木瓜蛋白酶超家族的溶酶体半胱氨酸蛋白酶,其在肝癌组织中高表达。近年来研究发现,CTSS在肝癌的发生发展及转移调控过程中占有重要地位,但作用机... 详细信息

肝细胞癌(HCC)是临床常见的恶性肿瘤之一,其发病率逐年升高,预后差。组织蛋白酶S(CTSS)是木瓜蛋白酶超家族的溶酶体半胱氨酸蛋白酶,其在肝癌组织中高表达。近年来研究发现,CTSS在肝癌的发生发展及转移调控过程中占有重要地位,但作用机制尚不明确,且相关研究缺乏系统性的总结,该文对CTSS的结构与功能及其在肝癌发生发展中的调控作用作一综述。

关键词：组织蛋白酶S 肝细胞癌生物学功能

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人尿液蛋白质N-糖肽富集和质谱鉴定的新方法研究

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质谱学报 2018年第2期39卷 149-157页

作者：黄俊杰焦丰龙王和平朱丽华秦伟捷钱小红华北理工大学基础医学院河北唐山063200 军事医学科学院放射与辐射医学研究所国家蛋白质科学中心(北京)蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心北京102206 河北省慢性疾病重点实验室河北唐山063000

蛋白质的N-糖基化修饰参与了许多重要的生理过程,是研究多种重大疾病诊断标志物的热点。与其他体液活检样本相比,尿液可以无创、大量获取,并且不受稳态调节的影响,能够在一定程度上反映整个机体的生理和病理状态。因此,人尿液蛋白质N-... 详细信息

蛋白质的N-糖基化修饰参与了许多重要的生理过程,是研究多种重大疾病诊断标志物的热点。与其他体液活检样本相比,尿液可以无创、大量获取,并且不受稳态调节的影响,能够在一定程度上反映整个机体的生理和病理状态。因此,人尿液蛋白质N-糖基化的规模化研究对疾病诊断标记物的筛选和治疗靶点的发现均具有重大意义。由于人尿液中的N-糖蛋白含量有限,修饰比例较低,在质谱分析时N-糖肽易被高丰度的非糖肽所掩盖,难以鉴定。因此,发展高效、高选择性的富集材料是实现尿蛋白N-糖基化深度覆盖的必要前提。本研究利用巯基-烯点击化学反应,使用[3-(甲基丙烯酰氨基)丙基]二甲基(3-硫代丙基)氢氧化铵内盐(SPP)制备了两性离子修饰亲水硅胶材料(SPP-SiO2)。该材料成功地应用于标准糖蛋白和健康人尿蛋白N-糖肽的富集和质谱检测,共鉴定了包含1 065个位点的633个尿液糖蛋白,比文献报道的鉴定规模提高了12.2%,证明了该亲水材料在尿液糖蛋白质组研究中的应用潜力。

关键词：巯基-烯点击化学法尿蛋白 N-糖肽富集质谱鉴定

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