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棉花能够为纺织业提供天然纤维,在世界范围内被广泛种植。为定位与纤维品质及产量相关的QT L,以两个陆地棉材料为亲本,构建重组自交系及陆地棉整合遗传图谱。该遗传图谱共有8 295个标记(简化基因组测序开发标记5 521个,芯片开发标记2 316个,SSR标记458个),总遗传距离为5 197.17 cM。结合17个环境的表型数据,共定位到与棉花纤维品质以及产量相关的QTL共983个。其中,198个为稳定的QTL,主要分布在4号,6号,7号,13号,21号以及25号染色体上。整合上述数据,共定位到了37个QTL成簇分布区,这些QTL成簇分布区共包含59个成对性状。其中,92.59%的呈现高度或中度正相关的性状形成的性状对代表的QTL加性效应方向相同,所有呈现高度或中度负相关性状形成的性状对代表的QTL加性效应方向相反。在这些QTL成簇分布区域的置信区间中,共有1 297个基因,其中414个同时在两套转录组数据中表达,结合基因注释信息,表达模式以及前人的研究成果,最终确定了23个潜在候选基因。有6个QTL成簇分布区域,同时包含有纤维品质性状以及产量性状的QTL,且他们具有相反的加性效应。其中,qClu-chr13-2能够提高纤维品质,但降低产量,该结果在自然群体中已被验证。该研究为解释棉花纤维品质及产量的遗传基础以及实现纤维品质和产量的同步改良,提供了有用的信息。

关键词：陆地棉整合遗传图谱纤维品质产量遗传相关性

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小麦7DL染色体臂物理图谱的构建与Survey测序

小麦7DL染色体臂物理图谱的构建与Survey测序

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第三届全国小麦基因组学及分子育种大会

作者：聂小军 Mingcheng Luo 宋卫宁王乐李变丽杜向红 Simkova Hana Safar Jan Dolezel Jaroslav David Edwards Rudi Appels 旱区逆境生物学国家重点实验室农学院国家小麦改良中心杨凌分中心西北农林科技大学陕西杨凌712100 Department of Plant Sciences University of California DavisCalifornia 95616 USA Centre of the Region Hana for Biotechnological and Agricultural Research Institute of Experimental B School of Agriculture and Food Sciences and Australian Centre for Plant Functional Genomics Univers Centre for Comparative Genomics Murdoch UniversityPerth Western Australia Australia

作为国际小麦基因组测序计划的组成部分,构建了小麦7DL染色体臂的物理图谱.首先分离富集7DL染色体的基因组DNA并构建了BAC文库,共50,304个克隆,平均插入片段为115kb,大约覆盖了整条臂的15倍.对这些克隆进行了指纹印迹分析后,获得了45,45... 详细信息

作为国际小麦基因组测序计划的组成部分,构建了小麦7DL染色体臂的物理图谱.首先分离富集7DL染色体的基因组DNA并构建了BAC文库,共50,304个克隆,平均插入片段为115kb,大约覆盖了整条臂的15倍.对这些克隆进行了指纹印迹分析后,获得了45,452个高质量的指纹印迹结果,用于下游重叠群(Contig)的拼接.对获得的印迹结果,采用FPB软件去除载体的污染,然后利用FPC软件进行组装,共获得了1,614个重叠群和6893个单体.从这些contigs中挑选出最短路径克隆(Minimal Tilling Path,MTP)4,472个,总长约为373,819kb,大约覆盖了整个染色体的92％.进一步对MTP克隆的BAC末段测序,开发了多个SSR和ISBP标记,重叠群与遗传图的整合正在进行中.同时,利用Illumina Hi-Seq高通量测序平台对分离出的7DL染色体全基因组DNA进行了survey测序,3个run共获得了23.58Gb的数据,大约覆盖7DL67倍.从中组装了238Mb的序列,覆盖了7DL的基因编码区和低拷贝区域,鉴定出1,659个功能基因,其中62％与其他禾本科植物具有共线性关系.序列分析鉴定出了23,272个SSR位点,并对其中的40个用小麦遗传材料进行验证.对其它的序列元件如TE,miRNA前体和成熟miRNA也进行了分析.已获得的7DL物理图谱和survey序列在提供了研究小麦基因组结构与进化的有力工具外,也正在成为在这条染色体臂上精细定位及克隆关键基因的平台.

关键词：小麦基因组 BAC指纹印记重叠群物理图谱 Survey测序

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烟草根黑腐病根际拮抗菌的筛选、鉴定及其促生防病效果

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中国烟草科学 2021年第3期42卷 57-64页

作者：罗云艳安航何佶弦杨洋江连强闫芳芳徐传涛安德荣李斌西北农林科技大学植物保护学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室陕西杨凌712100 四川省烟草公司广元市公司四川广元628000 四川省烟草公司宜宾市公司四川宜宾644000 四川省烟草公司凉山州公司四川凉山615000 四川省烟草公司攀枝花市公司四川攀枝花617000 四川省烟草公司泸州市公司四川泸州646000 中国烟草总公司四川省公司成都610000

为挖掘对烟草根黑腐病菌有较高拮抗效果的根际促生菌资源,从四川广元和陕西汉中等地采集30份烟草根际土壤,以烟草根黑腐病菌为靶标,采用温度筛选法和平板对峙法分离筛选出有高效拮抗活性的菌株,并对该菌株进行系统发育分析,采用抗生素... 详细信息

为挖掘对烟草根黑腐病菌有较高拮抗效果的根际促生菌资源,从四川广元和陕西汉中等地采集30份烟草根际土壤,以烟草根黑腐病菌为靶标,采用温度筛选法和平板对峙法分离筛选出有高效拮抗活性的菌株,并对该菌株进行系统发育分析,采用抗生素标记法和温室盆栽法测定菌株LY79的定殖规律、对烟草的促生效果以及对烟草根黑腐病的防治效果。结果表明:(1)从烟草根际土壤分离到一株烟草根黑腐病高效拮抗菌株LY79,经形态学、生理生化鉴定结合16S rRNA和持家基因ropB分析将菌株LY79鉴定为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)。(2)抗生素标记菌株LY79^(A)在烟草根际土定殖规律为先下降后上升再下降最终趋于稳定,且施药40 d后仍能在烟草根际土、根系、茎、叶分离到1.34×10^(6)、2.91×10^(4)、1.81×10^(4)、1.01×10^(4) CFU/g的菌株LY79^(A),说明其定殖能力较强。(3)菌株LY79对烟草促生效果较好,处理60 d后,烟草的株高、茎粗、整株干质量、根干质量分别增加了34.68%、37.85%、103.79%、72.55%。(4)1×10^(9) CFU/mL浓度的菌株LY79发酵液对烟草根黑腐病的盆栽防效达71.54%,仅略低于对照药剂70%甲基托布津500倍液。解淀粉芽孢杆菌LY79在烟草根黑腐病防治中具有较大的应用潜力。

关键词：烟草根黑腐病根际促生菌定殖促生防效

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中早熟葡萄新品种——秦秀

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中国果业信息 2019年第8期36卷 59-59页

作者：张剑侠王跃进西北农林科技大学园艺学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室农业部西北园艺植物种质资源利用重点开放实验室

“秦秀”葡萄是以“京秀”为母本,“郑果大无核”为父本杂交育成的中早熟新品种。2012年11月通过陕西省果树品种审定委员会登记认定。该品种果穗中等大,圆锥形,平均单穗重554g,最大686g。果粒椭圆形,果梗中等长,平均单粒重4.9g,最大9.4g... 详细信息

“秦秀”葡萄是以“京秀”为母本,“郑果大无核”为父本杂交育成的中早熟新品种。2012年11月通过陕西省果树品种审定委员会登记认定。该品种果穗中等大,圆锥形,平均单穗重554g,最大686g。果粒椭圆形,果梗中等长,平均单粒重4.9g,最大9.4g,软核或无核。果皮较薄,红色,果粉中等厚,外观美观;果肉绿白色,肉脆,汁中等多,味甜,品质中上。

关键词：品种审定委员会早熟葡萄杂交育成中早熟陕西省圆锥形单穗重椭圆形

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Exploring the biological significance of temperature-dependent Thermotoga maritima proteomes using constraint-based modeling-derived robustness analysis

Exploring the biological significance of temperature-depende...

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第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会

作者：童维王灼维王融刘斯奇旱区作物逆境生物学国家重点实验室农学院西北农林科技大学杨凌712100 北京基因组研究所中国科学院北京101300 遗传与基因组学院西奈山医学院纽约10029美国

Background: Mining the underlying value from high-throughput proteomic data is an emerging challenge in proteomics ***, we propose an integration of theoretical metabolic network and differential proteomes as a method... 详细信息

关键词： Thermotoga maritima robustness analysis proteome metabolic network

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我国苹果产业节本增效关键技术Ⅱ:现代宽行高干省力高效栽培模式创建技术

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中国果树 2017年第2期 1-4,J0002页

作者：陈学森毛志泉姜远茂王楠张宗营王志刚于国合邹养军姜召涛王恩琪东明学徐月华马均李建明隋秀奇山东农业大学作物生物学国家重点实验室泰安271000 山东省果茶技术推广站西北农林科技大学洛川试验站烟台市果树站龙口市果树研究所沂源县农业局蓬莱市农业局云南省农业科学院园艺作物研究所静宁县果树果品研究所烟台现代果业科学研究院

针对我国苹果主产区生态系统的多样性及降水的时空不均衡性和不匹配性、一家一户分散经营的长久性及果农转型升级的迫切性、芽变选种与苹果短枝型芽变品种品质、栽培模式变革与其整形修剪方式以及良种与良法配套等苹果现代栽培模式创建... 详细信息

针对我国苹果主产区生态系统的多样性及降水的时空不均衡性和不匹配性、一家一户分散经营的长久性及果农转型升级的迫切性、芽变选种与苹果短枝型芽变品种品质、栽培模式变革与其整形修剪方式以及良种与良法配套等苹果现代栽培模式创建中的问题,提出按照因时因地制宜及多样化原则,创建适合我国国情的现代宽行高干省力高效栽培模式,包括灌溉区的矮化自根砧、干旱区的抗性砧优质短及冷凉区的抗性砧穗组合等3种模式。

关键词：苹果宽行高干省力高效

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2019-2021年黄河流域棉区棉花生产表观成本、产值和收益监测报告

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中国棉花 2023年第2期50卷 6-16页

作者：毛树春王树林马小艳董合忠郝曙光李冰尹会会张爱民徐志森楚宗艳杨苏龙贺道华王占彪中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室河南安阳455000 河北省农林科学院棉花研究所石家庄050051 山东省农业科学院经济作物研究所济南250100 石家庄市平山县农业农村局河北平山050400 邢台市任泽区农业农村局河北邢台055150 聊城市农业科学院山东聊城252000 滨州市农业科学院山东滨州256611 南阳市农业科学研究所河南南阳473000 开封市农林科学研究院河南开封475004 山西省农业科学院棉花研究所山西运城044000 西北农林科技大学陕西杨凌7121000 中国农业科学院西部农业研究中心新疆昌吉831100

科学核算黄河流域棉区棉花生产成本、产值和收益对全面、准确把握新时代黄河流域棉区棉花生产所处的状态和实际水平,对深入了解黄河流域棉区的农情、棉情具有重要意义和参考价值。结果表明,2019年、2020年和2021年黄河流域棉区棉花生产... 详细信息

科学核算黄河流域棉区棉花生产成本、产值和收益对全面、准确把握新时代黄河流域棉区棉花生产所处的状态和实际水平,对深入了解黄河流域棉区的农情、棉情具有重要意义和参考价值。结果表明,2019年、2020年和2021年黄河流域棉区棉花生产(不包括轧花加工)每666.67 m^(2)表观总成本分别为1 436.50元、1 418.79元和1 440.72元;每666.67 m^(2)表观主产品产值分别为1 927.76元、2 036.77元和2 430.99元;每666.67 m^(2)表观纯收益分别为491.26元、617.97元和990.28元,都呈现逐年上涨趋势,表明植棉可以获得较高的收益回报;受气候变化和市场价格影响,年际植棉生产波动大,稳定性差,相关补贴对稳定植棉收益具有重要功能。2019年、2020年和2021年每千克皮棉表观总成本分别为12.35元、12.37元和14.83元,比全国平均水平低15.47%、10.81%和12.71%,物化成本分别为4.71元、4.88元和6.27元,比全国平均水平低43.59%、38.62%和38.71%,表明黄河流域棉花生产具有较强的竞争力。进一步比较发现,黄河流域棉区棉花生产不同市场主体投入产出和收益差异大。3年平均每666.67 m^(2)表观总成本表现为家庭农场(1 956.88元)>合作社(1 818.60元)>基本农户(1 368.31元),按相同籽棉售价测算,家庭农场和合作社为了抵消流转费用的成本,每666.67 m^(2)需增产籽棉约50 kg才能获得与基本农户等额的收益。然而,3年平均每666.67 m^(2)籽棉产量则是基本农户(286.05 kg)>家庭农场(276.73 kg)>合作社(259.27 kg)。3年平均每666.67 m^(2)表观生产性收益为基本农户(806.34元)>家庭农场(153.19元)>合作社(144.40元)。按照提高单产、改善品质和降低成本对农业规模经营方式进行比较,在推进规模化植棉进程中,要保护基本农户,鼓励发展家庭农场,规范合作社,通过植棉大户和农业社会化服务组织带动基本农户。

关键词：棉花生产成本产值收益市场主体黄河流域棉区

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