检索结果-内蒙古大学图书馆

农业生物技术学报 2019年第10期27卷 1729-1741页

作者：刘蔚姚敏康郁王美解盼何昕刘忠松官春云钱伟华玮钱论文湖南农业大学南方粮油作物协同创新中心西南大学农学与生物科技学院中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学与遗传育种重点开放实验室

降低菜籽油中硫苷(glucosinolate, GSL)的含量对菜籽油品质改良具有重要意义。本研究以203份中国半冬性油菜(Brassica napus)自交系为材料,利用芸薹属60K SNP芯片对油菜种子硫苷含量进行全基因组关联分析(genome-wide association study... 详细信息

降低菜籽油中硫苷(glucosinolate, GSL)的含量对菜籽油品质改良具有重要意义。本研究以203份中国半冬性油菜(Brassica napus)自交系为材料,利用芸薹属60K SNP芯片对油菜种子硫苷含量进行全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS),共检测到20个与硫苷含量显著关联的SNP位点,分别位于A02、A03、A09、C03、C08、C09染色体上。对这些显著关联的SNP位点侧翼序列进行连锁不平衡分析,检测到C03染色体上的单体型区域(57830409～58283210 bp; r2=0.96)与硫苷含量显著关联。在这个单体型区域检测到了一个拟南芥(Arabidopsis thaliana)的直系同源基因支链氨基转移酶4 (branched-chain aminotransferase 4, BCAT4),涉及硫苷的合成。同时,利用50个重测序材料对这个单体型区域进行了进一步的区域关联分析,揭示BnBCAT4-C03 (BnaC03g68450D)基因区域单体型结构变异影响了硫苷的积累。结合基因共表达网络分析结果,表明BnBCAT4-C03与其他硫苷合成的重要基因形成了分子网络,调节硫苷的合成与积累。本研究结果有助于开发单体型功能标记,为极端低硫代品种选育提供理论指导。

关键词：甘蓝型油菜全基因组关联分析(GWAS) 硫苷含量单体型共表达

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施氮量对中双11号油菜农艺性状、产量品质及氮肥利用率的影响

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四川农业大学学报 2014年第3期32卷 260-264,282页

作者：吴永成马霓黄晓明彭海浪李壮牛应泽张春雷四川农业大学农学院/农业部西南作物生理生态与耕作重点实验室四川温江611130 中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学重点开放实验室/农业部作物生理生态与栽培重点开放实验室武汉430062 大邑县农村发展局四川大邑611330

【目的】探讨高含油量、耐密抗倒、适于机播机收的油菜新品种中双11号在成都平原的生物学性状表现及配套高产高效栽培技术。【方法】2010-2012年连续两年先后在成都平原的邛崃市和大邑县开展了不同直播密度条件下施氮量对中双11号农艺... 详细信息

【目的】探讨高含油量、耐密抗倒、适于机播机收的油菜新品种中双11号在成都平原的生物学性状表现及配套高产高效栽培技术。【方法】2010-2012年连续两年先后在成都平原的邛崃市和大邑县开展了不同直播密度条件下施氮量对中双11号农艺性状、产量品质及氮肥利用率影响的大田试验。【结果】两年不同直播密度下,株高、分枝部位和单株角果数总体上表现为随施氮量增加而升高。籽粒产量则随施氮量加大呈先增加而后下降的趋势,且在180-360kgN/hm2范围内产量差异不显著。高密度直播条件下,各施氮处理间的主花序长度和一次分枝数并无显著差异。籽粒含油量（%）随施氮量加大而下降,但在90-180kgN/hm2范围内可以维持较高的值。随施氮量增加,氮肥农学利用率（AEN）、氮肥偏生产力（PFPN）、氮肥表观利用率（REN）和氮肥生理利用率（PEN）均总体上呈下降趋势,但N180处理的氮肥利用率各指标值都相对较高;在180-450kgN/hm2范围内各施氮处理间的氮肥贡献率（NCR）均无显著差异,但它们均显著大于N90处理。【结论】在成都平原中等土壤肥力条件下,为适应机播机收,中双11号在高产（≥3 000kg/hm2）栽培措施上应适期早播（9月下旬）、高密度（36×104株/hm2）直播（条播）、合理施氮（180kg/hm2）。

关键词：中双11号油菜直播施氮量农艺性状产量品质

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悬铃木LFY同源基因启动子的功能分析

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中国科技论文在线精品论文 2014年第19期7卷 1913-1920页

作者：陆顺教易双双李志能刘蕾张佳琪包满珠刘国锋华中农业大学园艺林学学院园艺植物生物学教育部重点实验室武汉430070 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室海南儋州 571737 华中农业大学园艺林学学院园艺植物生物学教育部重点实验室武汉430070 西南大学园艺园林学院重庆400715 华中农业大学园艺林学学院园艺植物生物学教育部重点实验室武汉430070 西安铁路北客站地区管理委员会西安710021 华中农业大学园艺林学学院园艺植物生物学教育部重点实验室武汉430070

LEAFY (LFY)基因是植物花分生组织决定基因,对植物花芽分化及花发育具有重要调控作用.为探讨悬铃木LFY同源基因启动子(pPlacLFY)用于创造不育转基因植株的可行性,通过构建pPlacLFY∷GUS和pPlacLFY∷BARNASE载体转化烟草,对其表达特性和... 详细信息

LEAFY (LFY)基因是植物花分生组织决定基因,对植物花芽分化及花发育具有重要调控作用.为探讨悬铃木LFY同源基因启动子(pPlacLFY)用于创造不育转基因植株的可行性,通过构建pPlacLFY∷GUS和pPlacLFY∷BARNASE载体转化烟草,对其表达特性和功能进行研究.对转pPlacLFY∷GUS烟草T1代植株不同部位的组织化学染色及GUS蛋白定量分析结果显示:在花萼、花瓣、雄蕊、雌蕊、果实等生殖器官中均有很强的GUS活性,其中果实的表达量最高;在幼叶、茎和顶芽等营养器官中也检测到较高的GUS活性,而在老叶和根中GUS表达不明显.对pPlacLFY∷BARNASE转基因烟草的表型观测结果发现:多数转化植株的生长发育受到影响,主要表现为生长缓慢、叶片扭曲皱缩、出现黄斑和顶芽萎缩等,最后逐渐死亡.由此可见,悬铃木的LFY同源基因具有较广泛的表达特性,不适合直接用于基因工程创造不育植株,同时也说明PlacLFY基因在参与生殖发育调控的同时,还可能参与营养器官的发育.

关键词：园林植物学悬铃木 LEAFY 启动子 BARNASE 不育

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柞蚕核型多角体病毒和家蚕核型多角体病毒的同义密码子使用模式分析

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蚕业科学 2011年第2期37卷 266-271页

作者：李京生杨瑞生贾萍石生林刘彦群潘敏慧秦利沈阳农业大学生物科学技术学院沈阳110866 西南大学农业部蚕桑功能基因组与生物技术重点开放实验室重庆400716

基因组中的基因和基因密码子组成不同使柞蚕核型多角体病毒(ApNPV)与家蚕核型多角体病毒(BmNPV)间不能交叉感染。通过计算有效密码子数(ENc)、相对同义密码子使用度(RSCU)、GC含量、GC3s含量、密码子适应指数(CAI),比较分析ApNPV和BmNP... 详细信息

基因组中的基因和基因密码子组成不同使柞蚕核型多角体病毒(ApNPV)与家蚕核型多角体病毒(BmNPV)间不能交叉感染。通过计算有效密码子数(ENc)、相对同义密码子使用度(RSCU)、GC含量、GC3s含量、密码子适应指数(CAI),比较分析ApNPV和BmNPV同义密码子使用模式差异。ApNPV和BmNPV的密码子偏好性均较弱,但二者的ENc值和GC含量差异显著;除碱基组成外,还存在其它因素影响密码子使用模式,但各影响因素的贡献率均较低,在基于密码子使用频率的对应分析中BmNPV的第1、第2向量轴贡献率均低于ApNPV;ApNPV的基因表达水平与GC含量、GC3s含量以及ENc值极显著相关(r分别为0.418、0.735、-0.628,P=0.000),而BmNPV的基因表达水平只与GC3s含量呈弱相关(r=0.214,P=0.010)。分析结果显示,ApNPV和BmNPV的密码子偏好性虽均较弱,但同义密码使用模式及其影响因素存在差异。

关键词：柞蚕核型多角体病毒家蚕核型多角体病毒同义密码子密码子偏好性

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桑种质资源ITS序列与系统进化分析

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中国农业科学 2010年第9期43卷 1771-1781页

作者：陈仁芳余茂德刘秀群陈龙清华中农业大学园艺林学学院/园艺植物生物学教育部重点实验室西南大学生物技术学院/农业部蚕桑学重点开放实验室

目的分析桑ITS序列,为桑系统位置、进化关系、DNA指纹鉴别、育种亲本选择提供分子生物学依据。方法利用收集的73份桑资源,总DNA提取,PCR扩增,测序,并从GenBank下载桑科Moraceae,桑属MorusITS序列,软件分析ITS长度、变异位点、G+C含量、... 详细信息

目的分析桑ITS序列,为桑系统位置、进化关系、DNA指纹鉴别、育种亲本选择提供分子生物学依据。方法利用收集的73份桑资源,总DNA提取,PCR扩增,测序,并从GenBank下载桑科Moraceae,桑属MorusITS序列,软件分析ITS长度、变异位点、G+C含量、遗传分歧、同源性百分比差异、系统位置与进化关系。结果获得ITS完整序列,基本序列全长576bp,G+C含量59.55%。(ITS1:174bp,G+C含量61.49%,ITS2:302bp,G+C含量62.25%,5.8S:100bp,G+C含量48.00%)。序列比对表明,共166个变异位点,(ITS1:100,ITS2:66,5.8S:0),一些变异位点有明显的种性特征,可作为特异DNA指纹鉴别位点。最大遗传分歧4.0,山桑(***)与其它栽培种遗传分歧0.9—1.4。基于ITS桑系统位置,在非洲硬木树(Milicia excelsa,MEU93585)与新西兰鹊肾树(Streblus glaber,DQ499105)之间,与非洲硬木树(MEU93585)亲缘关系最近。Mrbayes分析,新疆黑桑(***),北美默里桑(***,FJ605515)最原始,进化顺序为新疆黑桑,北美默里桑→白桑(***)→华桑(***)→长穗桑(***)。结论ITS长度、G+C含量、变异位点均可作桑种质资源DNA特异指纹鉴别的依据,特别是碱基变异位点。桑属劳亚古陆(Laurasia)高纬度起源,由北向南迁移。桑属可由地理分布间接反映系统进化关系。

关键词：桑 ITS 指纹鉴别进化关系

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柞蚕核型多角体病毒p11基因克隆及序列分析

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华北农学报 2009年第2期24卷 42-46页

作者：石生林刘彦群潘敏慧鲁成沈阳农业大学生物科学技术学院辽宁沈阳110161 西南大学农业部蚕桑学重点开放实验室重庆400716

为丰富柞蚕核型多角体病毒分子生物学基础，通过PCR扩增克隆了ApNPV p11基因并进行了序列的生物信息学分析。ApNPV p11基因编码102个氨基酸，预测分子量11．2kDa；氨基酸序列N端1～33位是信号肽序列，中部50～72位是跨膜区。PSI—BLAST... 详细信息

为丰富柞蚕核型多角体病毒分子生物学基础，通过PCR扩增克隆了ApNPV p11基因并进行了序列的生物信息学分析。ApNPV p11基因编码102个氨基酸，预测分子量11．2kDa；氨基酸序列N端1～33位是信号肽序列，中部50～72位是跨膜区。PSI—BLAST搜索表明有20种核型多角体病毒编码蛋白与ApNPVP11蛋白有显著性匹配；比对分析发现P11蛋白氨基酸序列中部相对保守，两端变异较大。进化分析表明ApNPV属于NPV类群I且与EppoNPV、AgMNPV、CfDefNPV亲缘关系较近。

关键词：杆状病毒 p11基因序列分析

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柞蚕蛹全长cDNA文库的构建和随机EST测序

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蚕业科学 2009年第3期35卷 528-532页

作者：夏润玺李玉萍王欢李喜升刘彦群秦利姜德富鲁成沈阳农业大学生物科学技术学院沈阳110161 辽宁省蚕业科学研究所辽宁凤城118100 西南大学农业部蚕桑学重点开放实验室重庆400716

采用RNA转录5′末端转换（SMART）技术构建了柞蚕（Antheraea pernyi）蛹的全长cDNA文库。所构建cDNA文库的容量为5×10^5个独立克隆,插入片段长800-2500 bp,且90%的插入片段大于1 kb。随机挑取288个克隆进行表达序列标签（EST）测... 详细信息

采用RNA转录5′末端转换（SMART）技术构建了柞蚕（Antheraea pernyi）蛹的全长cDNA文库。所构建cDNA文库的容量为5×10^5个独立克隆,插入片段长800-2500 bp,且90%的插入片段大于1 kb。随机挑取288个克隆进行表达序列标签（EST）测序,有效序列为250条,根据EST测序结果计算文库重组率达95%。经序列拼接得到175个unigenes,通过序列比对发现其中97个unigenes与GenBank中的已知基因高度同源,且有88条全长序列,基因的完整性比率达90%。在随机EST测序中获得了具有5′端和3′端非编码区的延伸因子-1α基因（Gen-Bank登录号：FJ788508）,该基因cDNA全长1743 bp,有一个1392 bp的开放阅读框,编码含463个氨基酸残基的蛋白,蛋白的理论分子质量为50.4 kD,等电点8.96。EST测序分析表明,柞蚕蛹cDNA文库符合构建基因文库的质量要求,该文库的构建将有助于柞蚕功能基因的克隆和研究。

关键词：柞蚕 cDNA文库 RNA转录5′末端转换表达序列标签延伸因子-1α(EF-1α)

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柞蚕全长cDNA文库中筛选到一个与蛹滞育解除相关的KK-42结合蛋白基因(英文)

柞蚕全长cDNA文库中筛选到一个与蛹滞育解除相关的KK-42结合蛋白...

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中国蚕学会第六届青年学术研讨会

作者：李玉萍夏润玺王欢李喜升刘彦群魏兆军姜德富鲁成向仲怀沈阳农业大学生物科学技术学院辽宁省蚕业科学研究所农业部蚕桑学重点开放实验室西南大学合肥工业大学食品与生物工程学院

我们成功构建了柞蚕Antheraea pernyi蛹的全长cDNA文库。总RNA提取自处于滞育后期的单个新鲜雌蛹。所构建文库的滴度是5×105cfu/ml,重组率达到95%。表达序列标签（EST）测序得到了250个有效序列,它们可以聚成175个单基因簇,其中包... 详细信息

我们成功构建了柞蚕Antheraea pernyi蛹的全长cDNA文库。总RNA提取自处于滞育后期的单个新鲜雌蛹。所构建文库的滴度是5×105cfu/ml,重组率达到95%。表达序列标签（EST）测序得到了250个有效序列,它们可以聚成175个单基因簇,其中包括24个重叠群和151的单拷贝。生物信息学分析结果表明,这175个单基因簇中有97个（55.4%）在数据库中有同源序列（其中只有5个是柞蚕已知基因）,37个（21.2%）在数据库中有EST同源序列但缺乏功能注释,41个（23.4%）为新的EST。通过EST测序,我们从该文库中鉴定了柞蚕KK-42结合蛋白基因（ApKK42-BP;GenBank登录号FJ744151）,该基因与天蚕Antheraea yamamai的KK-42结合蛋白基因在氨基酸序列上的一致性高达95%,而KK-42结合蛋白基因与天蚕的幼虫滞育解除有关。蛋白质序列分析表明,ApKK42-BP是一个胞外蛋白而不是膜蛋白,其信号肽位于第1-18。ApKK42-BP包括2个推测的保守功能域abhydroipase和abhydrolase,这一结果表明该蛋白可能是一种脂肪酶。基于EST数量的表达发现,ApKK42-BP在滞育的后期是一个高表达基因,表明该基因与柞蚕的蛹滞育解除也有关系。

关键词：柞蚕 cDNA文库表达序列标签(EST) KK-42结合蛋白滞育解除

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柞蚕核多角体病毒lef-12基因序列及转录分析(英文)

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蚕业科学 2008年第4期34卷 772-776页

作者：石生林潘敏慧王强鲁成西南大学农业部蚕桑学重点开放实验室重庆400716 沈阳农业大学生物科学技术学院沈阳110161

为加强柞蚕核多角体病毒(Anthraea pernyinucleopolyhedrovirus,ApNPV)的分子基础研究,对ApNPVlef-12基因进行序列及转录分析。ApNPVlef-12基因长516个核苷酸,编码171个氨基酸,预测分子质量19.0 kD。Ap-NPVlef-12基因5′端非编码区含有杆状病毒晚期基因启动子模序(ATAAG),但终止密码子(TAG)下游没有典型的多聚腺苷酸信号(AATAAA)。PSI-BLAST表明18种鳞翅目NPV编码ApNPV LEF-12同源蛋白;ApNPV LEF-12蛋白与类群ⅠNPVLEF-12的氨基酸一致性高于其与类群ⅡNPVLEF-12的氨基酸一致性。ApNPVLEF-12蛋白及与其关系较近的同源蛋白的有效密码子数较低。转录分析表明,ApNPVlef-12基因属晚期表达基因。

关键词：柞蚕 lef-12基因核多角体病毒转录分析

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九种绢丝昆虫线粒体12S rRNA基因的序列特征和系统发育分析

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昆虫学报 2008年第3期51卷 307-314页

作者：刘彦群靳向东秦利鲁成向仲怀沈阳农业大学生物科学与技术学院沈阳110161 吉林省蚕业科学研究所吉林永吉132200 西南大学农业部蚕桑学重点开放实验室重庆400716

为探讨鳞翅目中绢丝昆虫之间的系统发育关系和分子进化特征,本研究测定了中国柞蚕Antheraea pernyi野生型和放养型的线粒体12SrRNA基因的部分序列,结合来自GenBank数据库的17条序列,对总共9种绢丝昆虫(2科3属)的12SrRNA基因序列进行了... 详细信息

为探讨鳞翅目中绢丝昆虫之间的系统发育关系和分子进化特征,本研究测定了中国柞蚕Antheraea pernyi野生型和放养型的线粒体12SrRNA基因的部分序列,结合来自GenBank数据库的17条序列,对总共9种绢丝昆虫(2科3属)的12SrRNA基因序列进行了分析。利用软件MEGA3.1进行碱基组成、变异位点的统计和分子进化分析,分别用类平均聚类法((UPGMA)、邻接法(NJ)、最小进化法(ME)、最大简约法(MP)重建系统发生树。测定的中国柞蚕野生型的12SrRNA基因序列(427bp)与放养型"豫早1号"的序列完全一致。序列对齐后共鉴定80个变异位点,50个简约信息位点。碱基组成分析显示在科属间具有明显差异,AT含量蚕蛾科高于大蚕蛾科;在A和T碱基的使用上,大蚕蛾科偏好使用T,而蚕蛾科则偏好使用A。与动物中常见的以转换为主的碱基替换模式不同,所分析的9种昆虫中除桑蚕属内部为转换与颠换基本一致外,其余物种间均是颠换多于转换。进化分析支持柞蚕属、樗蚕属和桑蚕属的单系。基于UPGMA法的进化树支持琥珀蚕是柞蚕属的较原始类型,而NJ、ME和MP法则支持印度柞蚕是较原始的类型,因此,柞蚕属种间的进化关系尚需进一步研究。

关键词：绢丝昆虫蚕蛾科大蚕蛾科 12S rRNA基因碱基组成替换模式系统发生关系

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