检索结果-内蒙古大学图书馆

蚕业科学 2011年第2期37卷 266-271页

作者：李京生杨瑞生贾萍石生林刘彦群潘敏慧秦利沈阳农业大学生物科学技术学院沈阳110866 西南大学农业部蚕桑功能基因组与生物技术重点开放实验室重庆400716

基因组中的基因和基因密码子组成不同使柞蚕核型多角体病毒(ApNPV)与家蚕核型多角体病毒(BmNPV)间不能交叉感染。通过计算有效密码子数(ENc)、相对同义密码子使用度(RSCU)、GC含量、GC3s含量、密码子适应指数(CAI),比较分析ApNPV和BmNP... 详细信息

基因组中的基因和基因密码子组成不同使柞蚕核型多角体病毒(ApNPV)与家蚕核型多角体病毒(BmNPV)间不能交叉感染。通过计算有效密码子数(ENc)、相对同义密码子使用度(RSCU)、GC含量、GC3s含量、密码子适应指数(CAI),比较分析ApNPV和BmNPV同义密码子使用模式差异。ApNPV和BmNPV的密码子偏好性均较弱,但二者的ENc值和GC含量差异显著;除碱基组成外,还存在其它因素影响密码子使用模式,但各影响因素的贡献率均较低,在基于密码子使用频率的对应分析中BmNPV的第1、第2向量轴贡献率均低于ApNPV;ApNPV的基因表达水平与GC含量、GC3s含量以及ENc值极显著相关(r分别为0.418、0.735、-0.628,P=0.000),而BmNPV的基因表达水平只与GC3s含量呈弱相关(r=0.214,P=0.010)。分析结果显示,ApNPV和BmNPV的密码子偏好性虽均较弱,但同义密码使用模式及其影响因素存在差异。

关键词：柞蚕核型多角体病毒家蚕核型多角体病毒同义密码子密码子偏好性

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柞蚕核型多角体病毒p11基因克隆及序列分析

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华北农学报 2009年第2期24卷 42-46页

作者：石生林刘彦群潘敏慧鲁成沈阳农业大学生物科学技术学院辽宁沈阳110161 西南大学农业部蚕桑学重点开放实验室重庆400716

为丰富柞蚕核型多角体病毒分子生物学基础，通过PCR扩增克隆了ApNPV p11基因并进行了序列的生物信息学分析。ApNPV p11基因编码102个氨基酸，预测分子量11．2kDa；氨基酸序列N端1～33位是信号肽序列，中部50～72位是跨膜区。PSI—BLAST... 详细信息

为丰富柞蚕核型多角体病毒分子生物学基础，通过PCR扩增克隆了ApNPV p11基因并进行了序列的生物信息学分析。ApNPV p11基因编码102个氨基酸，预测分子量11．2kDa；氨基酸序列N端1～33位是信号肽序列，中部50～72位是跨膜区。PSI—BLAST搜索表明有20种核型多角体病毒编码蛋白与ApNPVP11蛋白有显著性匹配；比对分析发现P11蛋白氨基酸序列中部相对保守，两端变异较大。进化分析表明ApNPV属于NPV类群I且与EppoNPV、AgMNPV、CfDefNPV亲缘关系较近。

关键词：杆状病毒 p11基因序列分析

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柞蚕蛹全长cDNA文库的构建和随机EST测序

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蚕业科学 2009年第3期35卷 528-532页

作者：夏润玺李玉萍王欢李喜升刘彦群秦利姜德富鲁成沈阳农业大学生物科学技术学院沈阳110161 辽宁省蚕业科学研究所辽宁凤城118100 西南大学农业部蚕桑学重点开放实验室重庆400716

采用RNA转录5′末端转换（SMART）技术构建了柞蚕（Antheraea pernyi）蛹的全长cDNA文库。所构建cDNA文库的容量为5×10^5个独立克隆,插入片段长800-2500 bp,且90%的插入片段大于1 kb。随机挑取288个克隆进行表达序列标签（EST）测... 详细信息

采用RNA转录5′末端转换（SMART）技术构建了柞蚕（Antheraea pernyi）蛹的全长cDNA文库。所构建cDNA文库的容量为5×10^5个独立克隆,插入片段长800-2500 bp,且90%的插入片段大于1 kb。随机挑取288个克隆进行表达序列标签（EST）测序,有效序列为250条,根据EST测序结果计算文库重组率达95%。经序列拼接得到175个unigenes,通过序列比对发现其中97个unigenes与GenBank中的已知基因高度同源,且有88条全长序列,基因的完整性比率达90%。在随机EST测序中获得了具有5′端和3′端非编码区的延伸因子-1α基因（Gen-Bank登录号：FJ788508）,该基因cDNA全长1743 bp,有一个1392 bp的开放阅读框,编码含463个氨基酸残基的蛋白,蛋白的理论分子质量为50.4 kD,等电点8.96。EST测序分析表明,柞蚕蛹cDNA文库符合构建基因文库的质量要求,该文库的构建将有助于柞蚕功能基因的克隆和研究。

关键词：柞蚕 cDNA文库 RNA转录5′末端转换表达序列标签延伸因子-1α(EF-1α)

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柞蚕核多角体病毒lef-12基因序列及转录分析(英文)

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蚕业科学 2008年第4期34卷 772-776页

作者：石生林潘敏慧王强鲁成西南大学农业部蚕桑学重点开放实验室重庆400716 沈阳农业大学生物科学技术学院沈阳110161

为加强柞蚕核多角体病毒(Anthraea pernyinucleopolyhedrovirus,ApNPV)的分子基础研究,对ApNPVlef-12基因进行序列及转录分析。ApNPVlef-12基因长516个核苷酸,编码171个氨基酸,预测分子质量19.0 kD。Ap-NPVlef-12基因5′端非编码区含有杆状病毒晚期基因启动子模序(ATAAG),但终止密码子(TAG)下游没有典型的多聚腺苷酸信号(AATAAA)。PSI-BLAST表明18种鳞翅目NPV编码ApNPV LEF-12同源蛋白;ApNPV LEF-12蛋白与类群ⅠNPVLEF-12的氨基酸一致性高于其与类群ⅡNPVLEF-12的氨基酸一致性。ApNPVLEF-12蛋白及与其关系较近的同源蛋白的有效密码子数较低。转录分析表明,ApNPVlef-12基因属晚期表达基因。

关键词：柞蚕 lef-12基因核多角体病毒转录分析

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九种绢丝昆虫线粒体12S rRNA基因的序列特征和系统发育分析

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昆虫学报 2008年第3期51卷 307-314页

作者：刘彦群靳向东秦利鲁成向仲怀沈阳农业大学生物科学与技术学院沈阳110161 吉林省蚕业科学研究所吉林永吉132200 西南大学农业部蚕桑学重点开放实验室重庆400716

为探讨鳞翅目中绢丝昆虫之间的系统发育关系和分子进化特征,本研究测定了中国柞蚕Antheraea pernyi野生型和放养型的线粒体12SrRNA基因的部分序列,结合来自GenBank数据库的17条序列,对总共9种绢丝昆虫(2科3属)的12SrRNA基因序列进行了... 详细信息

为探讨鳞翅目中绢丝昆虫之间的系统发育关系和分子进化特征,本研究测定了中国柞蚕Antheraea pernyi野生型和放养型的线粒体12SrRNA基因的部分序列,结合来自GenBank数据库的17条序列,对总共9种绢丝昆虫(2科3属)的12SrRNA基因序列进行了分析。利用软件MEGA3.1进行碱基组成、变异位点的统计和分子进化分析,分别用类平均聚类法((UPGMA)、邻接法(NJ)、最小进化法(ME)、最大简约法(MP)重建系统发生树。测定的中国柞蚕野生型的12SrRNA基因序列(427bp)与放养型"豫早1号"的序列完全一致。序列对齐后共鉴定80个变异位点,50个简约信息位点。碱基组成分析显示在科属间具有明显差异,AT含量蚕蛾科高于大蚕蛾科;在A和T碱基的使用上,大蚕蛾科偏好使用T,而蚕蛾科则偏好使用A。与动物中常见的以转换为主的碱基替换模式不同,所分析的9种昆虫中除桑蚕属内部为转换与颠换基本一致外,其余物种间均是颠换多于转换。进化分析支持柞蚕属、樗蚕属和桑蚕属的单系。基于UPGMA法的进化树支持琥珀蚕是柞蚕属的较原始类型,而NJ、ME和MP法则支持印度柞蚕是较原始的类型,因此,柞蚕属种间的进化关系尚需进一步研究。

关键词：绢丝昆虫蚕蛾科大蚕蛾科 12S rRNA基因碱基组成替换模式系统发生关系

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家蚕HSP20·8基因体外表达及荧光原位杂交研究(英文)

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蚕业科学 2007年第1期33卷 14-19页

作者：孙卫忠李斌王彦文柴春利刘彬斌鲁成西南大学农业部蚕桑学重点开放实验室重庆400716 山东农业大学林学院泰安271018

前期研究发现,相对于其它组织器官,有一种低分子量热激蛋白在家蚕肾型卵中高量表达,并命名为低分子量热激蛋白HSP20.8。为了进一步阐明家蚕低分子量热激蛋白HSP20.8的基因结构、表达特性及其在家蚕染色体上的分布,根据HSP20.8基因cDNA... 详细信息

前期研究发现,相对于其它组织器官,有一种低分子量热激蛋白在家蚕肾型卵中高量表达,并命名为低分子量热激蛋白HSP20.8。为了进一步阐明家蚕低分子量热激蛋白HSP20.8的基因结构、表达特性及其在家蚕染色体上的分布,根据HSP20.8基因cDNA序列设计特异引物,进行了克隆、表达及荧光原位杂交研究。结果表明,该基因含有1个561碱基对的开放阅读框(open reading frame,ORF),与cDNA序列比较分析发现该基因无内含子序列。重组蛋白的分子量在20 kD左右。热激蛋白基因HSP20.8在家蚕基因组中为单拷贝基因,其位点在染色体近中部区域。

关键词：家蚕低分子量热激蛋白重组杆状病毒荧光原位杂交

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家蚕中肠组织在变态发育不同时期的蛋白表达差异分析

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蚕业科学 2007年第2期33卷 207-215页

作者：黄志君邓小娟陈芳艳母培强杨婉莹钟仰进夏庆友曹阳华南农业大学动物科学学院蚕丝科学系广州510642 西南大学蚕学与生物技术学院农业部蚕桑学重点开放实验室重庆400716

分析了家蚕在变态期不同发育时段中肠组织蛋白表达差异的信息。SDS-PAGE电泳分析显示,从家蚕吐丝前1 d到化蛹72 h的中肠蛋白分离到相对明显的16条泳带,其中分子量约为30、45、70 kD的蛋白组分含量较大,且比较稳定,分子量约为50、60、62... 详细信息

分析了家蚕在变态期不同发育时段中肠组织蛋白表达差异的信息。SDS-PAGE电泳分析显示,从家蚕吐丝前1 d到化蛹72 h的中肠蛋白分离到相对明显的16条泳带,其中分子量约为30、45、70 kD的蛋白组分含量较大,且比较稳定,分子量约为50、60、62 kD的蛋白组分在不同时期存在着显著的表达差异。进而通过聚丙烯酰胺双向凝胶电泳分析,发现家蚕中肠组织蛋白的表达种类和差异蛋白数目的变化在化蛹1～3 d非常明显:蛋白表达种类的变化呈现2个高峰,分别为化蛹0 h和化蛹41 h;差异蛋白数目的变化呈现3个波峰,分别在吐丝98 h至化蛹0 h、化蛹30～41 h和化蛹41～58 h。在化蛹1～3 d,这种显著峰值变化的时期刚好与家蚕中肠组织发生旧肠壁细胞退化死亡和新生肠壁细胞分化增殖的盛期相吻合,从一个侧面反映了家蚕中肠组织在变态期活跃的发育进程。

关键词：家蚕变态期中肠组织蛋白表达差异

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基于水力学模型的三峡库区四大家鱼产卵场推求

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水利学报 2007年第11期38卷 1285-1289页

作者：李翀廖文根陈大庆刘建虎中国水利水电科学研究院水环境研究所北京100038 中国水产科学研究院长江水产研究所农业部淡水鱼类种质资源与生物技术重点开放实验室湖北荆州434000 西南农业大学水产学院重庆400716

卵场位置是长江流域四大家鱼资源调查的重点。对于四大家鱼产卵场位置的定位以及影响家鱼产卵繁殖的水文、水流条件等非生物的因素，一般以河段邻近水文站观测数据来推算或近似。本文采用MIKE 11商业软件，基于三峡库区622个河道断面，... 详细信息

卵场位置是长江流域四大家鱼资源调查的重点。对于四大家鱼产卵场位置的定位以及影响家鱼产卵繁殖的水文、水流条件等非生物的因素，一般以河段邻近水文站观测数据来推算或近似。本文采用MIKE 11商业软件，基于三峡库区622个河道断面，模拟了2002～2003年三峡库区水动力变化，而后以重庆市云阳断面为起点，根据该断面2002-2003年四大家鱼捞获卵、苗的发育时间，推求出长江上游重庆至云阳4个产卵场的位置，最后对模型法推求产卵场位置的不确定性进行了分析。

关键词：四大家鱼产卵场位置水文特性三峡库区

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家蚕胚胎细胞系(BmE-SWU2)同工酶的研究

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蚕业科学 2006年第1期32卷 110-113页

作者：关国平潘敏慧陈敏鲁成西南农业大学蚕学与生物技术学院农业部蚕桑学重点开放实验室重庆400716

以新建的家蚕胚胎细胞系(BmE-SWU2)细胞为材料,应用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(Active-PAGE)不连续系统,进行α-酯酶(α-EST)、β-酯酶(β-EST)、乳酸脱氢酶(LDH)和苹果酸脱氢酶(MDH)的同工酶研究,观察了在建系过程中同工酶的表达情况,... 详细信息

以新建的家蚕胚胎细胞系(BmE-SWU2)细胞为材料,应用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(Active-PAGE)不连续系统,进行α-酯酶(α-EST)、β-酯酶(β-EST)、乳酸脱氢酶(LDH)和苹果酸脱氢酶(MDH)的同工酶研究,观察了在建系过程中同工酶的表达情况,比较了BmE-SWU2细胞系与其源胚胎的同工酶差异。结果显示,在第10代和第25代之间,尚未有明显的表达差异。该细胞系和源胚胎同工酶的比较发现,二者的同工酶表达谱具有很高的相似性。

关键词：家蚕胚胎细胞系同工酶酯酶乳酸脱氢酶苹果酸脱氢酶

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家蚕精子顶体酶活性分析及冷冻精液的人工授精

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蚕业科学 2006年第1期32卷 47-51页

作者：陈田飞吴大洋李春峰西南农业大学蚕学与生物技术学院农业部蚕桑学重点开放实验室重庆400716

采用改良Kennedy s法测定了家蚕精子顶体酶活性,得到了适合家蚕精子顶体酶活性测定的最佳条件,即:孵育温度为25℃,孵育时间为4 h;精液体外4℃存放随时间延长其顶体酶活性呈下降趋势,酶活性的测定应在15 h内进行。虽然冷冻精液随着冷冻... 详细信息

采用改良Kennedy s法测定了家蚕精子顶体酶活性,得到了适合家蚕精子顶体酶活性测定的最佳条件,即:孵育温度为25℃,孵育时间为4 h;精液体外4℃存放随时间延长其顶体酶活性呈下降趋势,酶活性的测定应在15 h内进行。虽然冷冻精液随着冷冻时间的延长其酶活性下降,但是不同冷冻方式之间酶活性变化趋势不同,-80℃保存时酶活性直线下降,120 d后酶活性下降了61%。液氮中保存的精液虽然在30 d后的酶活性为冷冻前的58%,但在其后的几个月中酶活性下降不明显。此外,顶体酶活性的高低与精液人工授精产卵数及受精卵率相关,酶活性越低其产卵数越少,受精卵率也越低,提示顶体酶活性的高低可以在一定程度上反映精液的品质。

关键词：家蚕精予顶体酶人工授精

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