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分子植物育种 2023年

作者：马福仙董洪进原晓龙耿云芬王毅丁淑金张汉尧黄冈师范学院生物与农业资源学院云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室西南林业大学林学院西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室

西南桦(Betula alnoides)是重要的用材树种，且具有潜在的药用价值。本研究采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和基于MGISEQ2000测序平台的基因组调查方法测定西南桦基因组大小。结果显示，流式细胞术测定的西南桦基因组大... 详细信息

西南桦(Betula alnoides)是重要的用材树种，且具有潜在的药用价值。本研究采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和基于MGISEQ2000测序平台的基因组调查方法测定西南桦基因组大小。结果显示，流式细胞术测定的西南桦基因组大小约为1.00 Gb；高通量测序获得原始数据32.82 Gb，处理后得到约30.38 Gb的过滤数据(Clean data)，测序质量良好；数据约简法(K-monomeric unit， K-mer)分析预估西南桦是复杂基因组，为四倍体植物，基因组大小为924.00 Mb，杂合度为3.3%，GC含量约为36.14%。分析西南桦基因组的基本信息，为其后续研究物种进化、倍性水平和全基因组测序等提供科学依据。

关键词：西南桦流式细胞术数据约简法(K-mer)分析基因组大小

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巢蕨组培快繁技术研究

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种子 2021年第5期40卷 84-90页

作者：段杰秋孙大宽向建英唐军荣西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业和草原局重点实验室云南昆明650224 西南林业大学云南生物多样性研究院云南昆明650224

为建立巢蕨试管内成苗和试管外成苗的组培快繁体系,以巢蕨的成熟孢子为试验材料,对影响巢蕨离体繁殖的因素及成苗途径进行研究。结果表明,孢子最优萌发培养基为1/4 MS,萌发率达91.75%;配子体在1/2 MS+6-BA 0.3 mg·L^(-1)+NAA 0.2 m... 详细信息

为建立巢蕨试管内成苗和试管外成苗的组培快繁体系,以巢蕨的成熟孢子为试验材料,对影响巢蕨离体繁殖的因素及成苗途径进行研究。结果表明,孢子最优萌发培养基为1/4 MS,萌发率达91.75%;配子体在1/2 MS+6-BA 0.3 mg·L^(-1)+NAA 0.2 mg·L^(-1)的培养基中增殖效果最好,平均增殖系数为5.1。试管内成苗试验中,在培养基上添加无菌水或液体1/2 MS,有助于配子体形成小苗;之后,小苗在MS+6-BA 0.5 mg·L^(-1)+NAA 0.2 mg·L^(-1)的培养基中GGB诱导率最高,达94.33%,实现了小苗以GGB途径快速增殖;由GGB诱导产生的小苗在1/2 MS+IBA 1 mg·L^(-1)的培养基中生根最好,其生根率达100%;试管外成苗试验中,喷洒1 g·L^(-1)的KH 2PO 4溶液能促进配子体成苗,且成苗率达82%。

关键词：巢蕨组织培养配子体 GGB

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滇紫草基因组大小测定

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分子植物育种 2023年

作者：马福仙余姣君原晓龙王毅张汉尧黄冈师范学院生物与农业资源学院云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室西南林业大学林学院西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室

滇紫草(Onosma paniculatum)通常作为紫草(Arnebiae radix)的替代品使用，是云南传统的中药材。本研究首次采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和高通量测序技术的Survey分析测定滇紫草基因组大小。结果显示，流式细胞术测定... 详细信息

滇紫草(Onosma paniculatum)通常作为紫草(Arnebiae radix)的替代品使用，是云南传统的中药材。本研究首次采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和高通量测序技术的Survey分析测定滇紫草基因组大小。结果显示，流式细胞术测定的滇紫草基因组大小约为880.20 Mbp；高通量测序获得原始数据64.09 Gb，处理后得到约59.72 Gb的过滤数据(Clean data)，测序质量良好；数据约简法(K-monomeric unit， K-mer)分析预估滇紫草为复杂基因组，大小为848.08 Mbp，杂合度为0.3%，GC含量约为37.17%。分析滇紫草基因组的基本信息，为其后续研究物种进化、基因资源利用和药用成分合成途径等提供科学依据。

关键词：滇紫草流式细胞术 K-mer分析基因组大小

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遮荫对白枪杆苗期生长性状和光合色素的影响

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林业与环境科学 2022年第1期38卷 126-131页

作者：叶澜段华超李燕燕李世民井卉竹董琼西南林业大学/西南地区生物多样性保育国家林业和草原局重点实验室云南昆明650233

研究遮荫对白枪杆Fraxinus malacophylla 幼苗生长、生物量及其分配等指标的影响,为今后白枪杆苗木培育和石漠化植被恢复提供优质种苗。试验以1年生白枪杆实生苗为材料,采用单因素随机试验方法,设置不遮荫(F_(1))、25%±5%遮荫(F_(... 详细信息

研究遮荫对白枪杆Fraxinus malacophylla 幼苗生长、生物量及其分配等指标的影响,为今后白枪杆苗木培育和石漠化植被恢复提供优质种苗。试验以1年生白枪杆实生苗为材料,采用单因素随机试验方法,设置不遮荫(F_(1))、25%±5%遮荫(F_(2))、50%±5%遮荫(F_(3))、75%±5%遮荫(F_(4))4个处理,试验开始后每隔30 d测定白枪杆幼苗的地径、苗高、株幅等生长指标,生长期结束后称量白枪杆幼苗的生物量,并对生长指标进行比较分析。结果表明:不同遮荫处理会对白枪杆幼苗的生长、生物量及分配产生显著影响,随着遮荫程度增加,白枪杆幼苗的苗高生长量、地径生长量、冠幅生长量、总生物量和各器官生物量均先增加后降低,且均在中度遮荫处理下达到最大值;根生物量分配比和根冠比总体随着遮荫程度增加而下降,茎生物量比随着遮荫程度增加而增加,叶生物量分配比变化不显著;随遮荫程度的增加,白枪杆幼苗光合色素含量增大,而叶绿素a与叶绿素b的比值(Chla/Chlb)下降。研究表明,中度遮荫下一年生白枪杆幼苗生长最好,具有较高的耐荫性;因此,白枪杆幼苗在育苗和石漠化生态恢复过程中的利用应充分考虑其耐荫蔽能力。

关键词：白枪杆遮荫生长量生物量分配光合色素

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基于森林资源二类调查数据的香格里拉市森林生物量二阶抽样优化

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西南林业大学学报 2021年第6期41卷 160-167页

作者：杨沁雨王瑞胥辉西南林业大学林学院/西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室云南昆明 650233

以香格里拉市针叶林为研究对象,确定95％可靠性指标和85％抽样精度,选取1 km×1 km、2 km×2 km、3 km×3 km、4 km×4 km、5 km×5 km、6 km×6 km、7 km×7 km、8 km×8 km、9 km×9 km、10 km&#... 详细信息

以香格里拉市针叶林为研究对象,确定95％可靠性指标和85％抽样精度,选取1 km×1 km、2 km×2 km、3 km×3 km、4 km×4 km、5 km×5 km、6 km×6 km、7 km×7 km、8 km×8 km、9 km×9 km、10 km×10 km共计10种一阶抽样单元规格,基于二阶抽样的一阶单元间方差差异,对二阶抽样进行优化设计,进而对比分析优化前后二阶抽样方法的抽样误差和抽样精度.结果表明:在10种未优化二阶抽样单元中6 km×6 km的抽样单元具有最小的抽样误差和最高的抽样精度,其抽样误差值为9.12％,抽样精度为90.88％;经二阶抽样优化后,10种抽样单元的抽样精度均明显提升,抽样误差明显降低,其中6 km×6 km的抽样单元抽样误差最小为6.39％,抽样精度最高为93.61％.本研究中优化后的二阶抽样方法具有较好的抽样精度和实用性,可为今后的森林生物量调查提供精度保障.

关键词：二阶抽样森林生物量抽样精度森林资源二类调查香格里拉

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不同生物菌肥处理对猕猴桃果园土壤和植株生态化学计量特征的影响

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经济林研究 2025年第02期 277-286页

作者：高永青陈德志孙风霞赵红珍杨妮王怡匀毛一帆王连春西南林业大学林学院西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业和草原局重点实验室云南源盘果业有限公司

【目的】不同生物菌肥处理条件下，猕猴桃果园土壤和植株各器官中碳（C）、氮（N）、磷（P）含量及其化学计量比的影响，为猕猴桃果园科学施肥和土壤肥力调控提供理论依据。【方法】本研究采用三因素四水平的正交试验，对7年生‘东红’... 详细信息

【目的】不同生物菌肥处理条件下，猕猴桃果园土壤和植株各器官中碳（C）、氮（N）、磷（P）含量及其化学计量比的影响，为猕猴桃果园科学施肥和土壤肥力调控提供理论依据。【方法】本研究采用三因素四水平的正交试验，对7年生‘东红’猕猴桃进行试验，以不施生物菌肥为对照（T16），将地衣芽孢杆菌（bacillus licheniformis,BL）、解淀粉芽孢杆菌（bacillus amyloliquefaciens,BA）、胶冻样芽孢杆菌（bacillus jelliformis,BM）3种生物菌肥作为因子，设置了4种施肥水平（0、20、40、60 g/株），共16个处理组（T1T16），在果实成熟期采集0～20 cm土壤样品及猕猴桃根、叶、茎、果实样品，采用重铬酸钾油浴法测定土壤有机碳含量，奈氏比色法测定土壤、植株的全氮含量，钼锑抗比色法测定土壤、植株的全磷含量，运用单因素方差分析和Pearson相关分析法分析猕猴桃果园土壤与植株生态化学计量比的相关性。【结果】生物菌肥显著改善了猕猴桃果园土壤的化学计量特征，T9（BL 40 g、BA 20 g、BM 60 g）在提升土壤养分方面效果最佳，使土壤C、N、P含量较CK分别提升了75.96%、16.18%、77.05%；猕猴桃各器官中叶片N含量最高、根部P含量最高，茎部氮含量均低于CK。生物菌肥显著改善了猕猴桃植株各器官的化学计量特征；果园中土壤N、P比低于中国土壤的平均水平（9.3），表明果园中的限制因子是磷；土壤C、N、P比值对猕猴桃植株各器官的比值具有一定影响，但对叶片影响相对较弱；T5（BL 20 g、BA 20 g）处理下，根、叶、果实N含量较CK分别提高18.98%、18.92%、61.28%；根、叶、茎、果实中磷含量提升最显著的处理组分别是T13（BL 60 g、BA 20 g、BM 40 g）、T8（BL 40 g、BM 40 g）、T9（BL 40 g、BA 20 g、BM 60 g）、T4（BL 20 g、BM 20 g）；相关性分析显示，在0.05水平下，土壤N含量仅与茎部N∶P，土壤P含量仅与根部N含量，根部P含量与土壤C、C∶P呈现显著负相关关系；根部N含量与土壤P、C∶P，果实N∶P与土壤C、C∶N∶P，叶片N∶P比值与土壤C∶N呈显著正相关关系；在0.01水平下，根部N∶P与土壤C、C∶N、C∶P呈极显著正相关关系；茎部N∶P和N含量与土壤C、C∶N∶P、C∶N、C∶P呈极显著负相关关系。【结论】不同生物菌肥处理对猕猴桃果园土壤化学计量特征及植株各器官营养分配具有影响，能有效提升果园土壤肥力，增强果树对养分的吸收效率。生物菌肥处理下，T9处理组对土壤中有机碳、全氮、全磷含量提升最有效。T5处理能显著提升猕猴桃各器官全氮含量，而各器官的全磷含量要依据其生长生理特性来选择生物菌肥处理组合。

关键词：生物菌肥猕猴桃生态化学计量碳氮磷比

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楚雄华山松种子园无性系幼苗叶枯病病原菌鉴定

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西北林学院学报 2022年第4期37卷 181-187页

作者：吕则佳陈健鑫冯峻朱艳董云祥罗正平马焕成伍建榕云南省高校森林灾害预警控制重点实验室西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 西南地区生物多样性保育国家林业和草原局重点实验室西南林业大学林学院云南昆明650224 云南省林木种苗工作总站云南昆明650215 楚雄市林业和草原局国有林场云南楚雄675000

为明确楚雄市华山松种子园无性系幼苗叶枯病的病原,采用传统形态学和分子生物学相结合的方法对华山松叶枯病进行病原鉴定。结果表明,引起华山松叶枯病的病原菌为胡枝子拟盘多毛孢(Pestalotiopsis lespedezae)和互隔链格孢(Alternaria al... 详细信息

为明确楚雄市华山松种子园无性系幼苗叶枯病的病原,采用传统形态学和分子生物学相结合的方法对华山松叶枯病进行病原鉴定。结果表明,引起华山松叶枯病的病原菌为胡枝子拟盘多毛孢(Pestalotiopsis lespedezae)和互隔链格孢(Alternaria alternata)。

关键词：叶枯病病原鉴定华山松种子园无性系楚雄

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云南火焰兰高通量转录组测序分析

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分子植物育种 2021年第13期19卷 4293-4301页

作者：辛雅萱辛静瞿绍宏董章宏姚国琼杨琳懿冯发玉唐军荣西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业和草原局重点实验室昆明650224 西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室昆明650224

云南火焰兰(Renanthera imschootiana Rolfe)是濒临灭绝的附生植物,关于其分子水平的研究少有报道。为了获得云南火焰兰相关基因组基础信息,本研究通过Illumina HiSeqTM4000技术对云南火焰兰叶片进行转录组测序,并利用相关生物信息学数... 详细信息

云南火焰兰(Renanthera imschootiana Rolfe)是濒临灭绝的附生植物,关于其分子水平的研究少有报道。为了获得云南火焰兰相关基因组基础信息,本研究通过Illumina HiSeqTM4000技术对云南火焰兰叶片进行转录组测序,并利用相关生物信息学数据库对其进行序列比对和数据分析。分析结果表明:共获得77888条功能基因(Unigenes),其N50为1348 bp,平均长度为805 bp,Q20和Q30序列分别占98.04%和94.32%。经比对,在Nr、KEGG、KOG、Swiss-prot、GO等数据库中能得到注释的Unigene分别为31298、29356、14852、15697、17645条。在GO数据库中,共得到24473个GO功能,将其分为3个大类和47个亚类,以生物过程这一类别所注释的基因数最多;KOG功能注释信息有17743个,将其分为25个基因功能大类,其中基因数目较多的分别是一般功能基因和信号传导机制的相关基因;在KEGG中涉及的相关通路可将其归为19个亚类,其中以代谢通路较为突出。此外,对云南火焰兰转录组Unigene进行CDS比对和预测,共预测到2317条CDS,其大小主要集中在200-500 bp,占总CDS的79.41%。本研究可为云南火焰兰乃至火焰兰属植物功能基因的挖掘、利用以及遗传育种等方面的工作提供一定的科学依据。

关键词：云南火焰兰转录组 Unigene

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云南省文山市大型真菌多样性分析及资源评价

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西南农业学报 2022年第11期35卷 2497-2505页

作者：竺永金潘启强陈健鑫魏玉倩胡亚萍王乐张颖马焕成伍建榕西南林业大学生物多样性保护学院/云南省高校森林灾害预警控制重点实验室昆明650224 生态环境部南京环境科学研究所南京210042 西南林业大学林学院/西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室昆明650224

【目的】通过在文山市开展大型真菌资源调查,以期发掘该地区的重要经济价值菌类和了解当地新特有资源状况。【方法】采用随机调查法结合样地调查法对该区域8乡2镇大型真菌资源进行为期2年的调查,标本的鉴定主要采用传统形态学分类鉴定... 详细信息

【目的】通过在文山市开展大型真菌资源调查,以期发掘该地区的重要经济价值菌类和了解当地新特有资源状况。【方法】采用随机调查法结合样地调查法对该区域8乡2镇大型真菌资源进行为期2年的调查,标本的鉴定主要采用传统形态学分类鉴定与分子生物学相结合,并通过传统的生物多样性统计方法对该地区内各样方的物种丰富度、多样性指数、均匀性指数进行了分析。【结果】该地区大型真菌共有116种,隶属于2门,4纲,11目,30科,71属。其中10种大型真菌为中国特有种。根据大型真菌资源利用价值分析结果表明,本次调查发现的大型真菌中有食用菌19种,药用菌20种,毒菌3种,木腐菌55种,部分种类具有良好的开发前景。物种累积曲线分析结果显示,本研究抽样充分。多样性分析结果显示,丰富度指数(R)变化趋势为P10>P9>P8>P1>P7>P4>P5>P2>P6>P2>P3;优势度指数(D)变化趋势为P9>P1>P7>P8>P3>P10>P2>P3>P4>P5;物种多样性指数(H′)变化趋势为P9>P7>P1>P8>P10>P6>P3>P4>P2>P5;均匀度指数(E)变化趋势为P9>P1>P8>P7>P6>P3>P2>P10>P4>P5。【结论】对文山市内的大型真菌进行了较为系统的调查,基本摸清了该地区大型真菌资源的本底状况信息。多样性分析结果显示该地区的大型真菌物种多样性丰度较高。本研究为该地区大型真菌资源的保护、开发利用及管理提供了科学依据,也丰富了云南省大型真菌已知物种的数据信息。

关键词：分类大型真菌资源评价多样性分析文山市

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ABT-1处理对树头菜扦插生根及生理生化特性的影响

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江西农业大学学报 2021年第1期43卷 116-125页

作者：李世民郑鑫华段华超董琼西南林业大学林学院/西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室云南昆明650224

【目的】插穗生根是一个复杂的生理过程,而生理生化指标在插穗生根过程中发挥着重要作用。树头菜应用广泛,研究ABT-1处理对树头菜扦插生根及生理生化特性的影响,探究树头菜扦插生根机制,为其建立高效的扦插繁殖体系提供理论依据。【方... 详细信息

【目的】插穗生根是一个复杂的生理过程,而生理生化指标在插穗生根过程中发挥着重要作用。树头菜应用广泛,研究ABT-1处理对树头菜扦插生根及生理生化特性的影响,探究树头菜扦插生根机制,为其建立高效的扦插繁殖体系提供理论依据。【方法】以树头菜1年生枝条为试验材料,选用ABT-1(0,50,100,150 mg/L)溶液分别浸泡插穗3 h,探究其对扦插生根以及生理生化指标的影响。【结果】树头菜扦插后30 d左右有愈伤组织产生,45 d左右开始有不定根形成,90 d生长稳定,生根类型既有愈伤组织生根型,又有皮部生根型,且多为愈伤组织生根型,ABT-1处理各水平在8个生根指标中基本均以150 mg/L浸泡3 h效果最佳,生根率、平均根数、平均根长、最长根长、平均根粗、最大根系直径、生根指数、根系效果指数分别为82.2%、12.11条/株、17.96 cm、40.55 cm、3.59 mm、7.97 mm、13.57和1.12,且均显著(P<0.05)高于清水处理(CK)。ABT-1处理组和CK可溶性糖含量呈现先下降后上升趋势,且整个过程中ABT-1处理组可溶性糖含量始终高于CK,而处理组和CK可溶性蛋白含量总体上呈现先上升后下降再上升的趋势,ABT-1处理组含量始终高于CK;ABT-1处理组和清水处理(CK)POD活性总体上变化趋势相同,在根原基诱导期和和愈伤组织形成期,以及不定根伸长期出现1个峰值,且整个过程中处理组POD活性始终高于CK;ABT-1处理组前期SOD、CAT活性变化趋势与CK相反,后期处理组和对照组SOD活性总体上变化趋势相同,此外,处理组SOD活性始终高于对照组;ABT-1处理组和对照组(CK)MDA含量总体上呈现先小幅上升后下降最后趋于平稳趋势,且整个过程中处理组MDA含量始终小于对照组(CK)。【结论】ABT-1处理有利于插穗生根和改善根系质量,提高插穗内营养物质含量、相关酶活性,以及通过调控插穗内抗氧化酶保护系统活性变化来抑制插穗体内毒害物质水平抑制MDA的产生,对插穗生根有促进作用。

关键词：树头菜扦插生根 ABT-1 生理生化

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