检索结果-内蒙古大学图书馆

华中农业大学学报 2020年第6期39卷 23-29页

作者：祝友朋韩长志西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

以49个全基因组序列已经公布的真菌为研究对象,通过OrthoVenn2同源基因簇比对、BLASTp比对和关键词搜索3种方法对G蛋白信号调控因子(regulators of G-protein signaling,RGS)同源基因进行比对分析,并结合SMART进行保守结构域分析,结果发... 详细信息

以49个全基因组序列已经公布的真菌为研究对象,通过OrthoVenn2同源基因簇比对、BLASTp比对和关键词搜索3种方法对G蛋白信号调控因子(regulators of G-protein signaling,RGS)同源基因进行比对分析,并结合SMART进行保守结构域分析,结果发现,49个真菌中共有229个RGS蛋白,每种真菌中所含有RGS蛋白的数量范围为3~9个,且死体营养型病原菌和半活体营养型病原菌的RGS蛋白数量高于活体营养型病原菌;根据RGS蛋白中保守结构域进行分类,可以划分为DEP-RGS、RGS-TM、PXA-RGS-PX、RGS、RGS-PAS-PAC、TM-RGS等6种,其中,具有RGS-PAS-PAC和TM-RGS这2种特殊保守结构域的RGS蛋白主要集中在半活体营养型病原菌和死体营养型病原菌;进一步对229个RGS蛋白进行遗传关系分析,发现具有同种保守结构域的RGS蛋白亲缘关系较近。上述研究结果表明植物病原丝状真菌的寄生性与RGS蛋白数量和种类之间存在着一定的关联性。

关键词：植物病原菌丝状真菌调控蛋白 G蛋白信号调控因子(RGS) 同源比对比较基因组学

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黄单胞菌分泌蛋白的理化性质及特征分析

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华中农业大学学报 2020年第6期39卷 30-36页

作者：覃悦祝友朋韩长志西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

基于全基因组序列已经公布的黄单胞菌Xanthomonas campestris B100、Xanthomonas campestris *** 8004、Xanthomonas campestris CN14中分泌蛋白序列为基础数据,采用Protscale、SMART、TargetP 2.0 Server等生物信息学分析软件对上述分泌蛋白展开理化性质、保守结构域以及转运肽等分析,结果显示:黄单胞菌中分泌蛋白理论等电点与氨基酸长度之间无相关关系,44.73%的蛋白为不稳定蛋白,83.21%的蛋白亲水性小于0,属于亲水性蛋白。同时,在每种黄单胞菌的分泌蛋白中,具有明显保守结构域的蛋白数量平均为12个,并且所有分泌蛋白均具有信号肽,转运肽预测可能性分布也较为平均。

关键词：黄单胞菌分泌蛋白理化性质生物信息学分析植物病原菌亚细胞定位转运肽

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不同营养类型植物病原真菌次生代谢产物合成基因簇的差异性研究

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华中农业大学学报 2020年第6期39卷 37-43页

作者：祝友朋韩长志西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

选择全基因组序列已经公布的22种真菌为研究对象,利用antiSMASH数据库对不同营养类型真菌的次生代谢产物合成基因簇进行注释,以期发现不同营养类型植物病原真菌在侵染植物过程中次生代谢产物所发挥的作用及合成基因簇的差异性。结果表明... 详细信息

选择全基因组序列已经公布的22种真菌为研究对象,利用antiSMASH数据库对不同营养类型真菌的次生代谢产物合成基因簇进行注释,以期发现不同营养类型植物病原真菌在侵染植物过程中次生代谢产物所发挥的作用及合成基因簇的差异性。结果表明:半活体营养型真菌和死体营养型真菌中次生代谢产物合成基因簇的种类和数量都高于活体营养型真菌;进一步对非核糖体肽合成酶(NRPS)、聚酮合酶(PKS)、萜烯(terpene)三大类次生代谢产物合成基因簇进行分析,发现半活体营养型和死体营养型病原菌中NRPS基因簇、PKS基因簇和萜烯基因簇的数量也都高于活体营养型病原菌。

关键词：植物病原真菌营养类型次生代谢产物合成基因簇免疫防卫反应

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四川王朗自然保护区及邻近地区蚁科昆虫区系分析

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应用昆虫学报 2019年第6期56卷 1402-1409页

作者：罗成龙徐正会张新民祁彪冉茂君袁定宇西南林业大学生物多样性保护与利用学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

【目的】揭示王朗自然保护区及邻近地区蚂蚁区系特征。【方法】采用样地调查法。【结果】采集到蚁科昆虫5亚科,37属,77种蚂蚁,分析了属和种的分布类型和区系成分。【结论】王朗自然保护区及邻近地区蚂蚁区系具有东洋界向古北界过渡特征... 详细信息

【目的】揭示王朗自然保护区及邻近地区蚂蚁区系特征。【方法】采用样地调查法。【结果】采集到蚁科昆虫5亚科,37属,77种蚂蚁,分析了属和种的分布类型和区系成分。【结论】王朗自然保护区及邻近地区蚂蚁区系具有东洋界向古北界过渡特征,同时具有西南区、华中区、华北区、青藏区成分高度汇聚特点。在属级水平上以东洋界、古北界分布属最丰富,东洋界分布属稍占优势,与新热带界关系最远。在种级水平上以东洋界分布种占优势,与古北界关系最密切,与新热带界关系最远。在中国动物地理区划中具有典型西南区特征,与华南区关系密切,与东北区关系最远。

关键词：蚁科区系自然保护区四川

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真菌中G蛋白信号调控因子蛋白类型与其理化性质的关系

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微生物学报 2021年第1期61卷 195-205页

作者：祝友朋韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 西南林业大学研究生院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

【目的】G蛋白信号调控因子(RGS)作为G蛋白信号转导途径的负调控因子,在植物病原菌的致病性和有性生殖调控方面发挥着重要作用。研究真菌中RGS蛋白类型与其理化性质及特征的关系,为今后深入开展不同真菌中具有不同类别RGS的功能解析打... 详细信息

【目的】G蛋白信号调控因子(RGS)作为G蛋白信号转导途径的负调控因子,在植物病原菌的致病性和有性生殖调控方面发挥着重要作用。研究真菌中RGS蛋白类型与其理化性质及特征的关系,为今后深入开展不同真菌中具有不同类别RGS的功能解析打下坚实的理论基础。【方法】前期对模式生物、病原菌、非致病菌等49个真菌中229个RGS蛋白序列进行找寻,并根据其保守结构域和同源性确定RGS类型有DEP-RGS、RGS-TM、PXA-RGS-PX、RGS、RGS-PAS-PAC、TM-RGS等6类。利用蛋白质数据库、ProtComp v9.0、PHD以及MEME等网站对上述RGS蛋白进行理化性质、亚细胞定位以及二级结构、基序等特征分析。【结果】上述不同类别的RGS蛋白具有明显的类别特征性,同时,也具有以下共同特征:理论等电点集中在6.01–7.00;不稳定性系数集中在40.01–60.00;95%以上的RGS蛋白属于亲水性蛋白;亲水性最强氨基酸残基存在较多的是R、D、E、Q、N;疏水性最强氨基酸残基存在较多的L、A、V、F、I;二级结构组成特征为b折叠较少;转运肽情况尚未明确;亚细胞定位多集中在细胞核。【结论】真菌中6类RGS蛋白的理化性质具有一定的共同特征,但不同类别的RGS蛋白也具有明显的类别特征,主要表现在保守结构域、二级结构、等电点、转运肽和亚细胞定位情况。

关键词：真菌 G蛋白信号调控因子理化性质关系解析生物信息学

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云南干热河谷地区木棉科植物丛枝菌根真菌的调查研究

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西北农林科技大学学报（自然科学版） 2014年第1期42卷 205-210页

作者：伍建榕汪洋赵春燕陆青华高柱王芳马焕成国家林业局西南地区生物多样性保育重点实验室云南昆明650224 西南林业大学林学院云南省高校森林灾害预警控制重点实验室云南昆明650224

【目的】调查云南干热河谷地区木棉科植物根及根际周围的丛枝菌根真菌(AMF)分布状况,为筛选对干热河谷木棉生长有明显促进作用的AMF提供理论依据。【方法】采用湿筛沉淀法,从云南干热河谷的元阳、元江、东川、元谋、宾川和怒江6个地区... 详细信息

【目的】调查云南干热河谷地区木棉科植物根及根际周围的丛枝菌根真菌(AMF)分布状况,为筛选对干热河谷木棉生长有明显促进作用的AMF提供理论依据。【方法】采用湿筛沉淀法,从云南干热河谷的元阳、元江、东川、元谋、宾川和怒江6个地区的木棉须根及其所带土壤中分离AMF孢子,在体视镜下观察记录孢子的颜色、大小、连孢菌丝的特征、孢子果形态等;在此基础上,用微吸管挑取孢子置于载玻片上,加浮载剂(蒸馏水、乳酸、乳酸甘油、Melzer’s试剂)在Nikon显微镜下观察,对孢子颜色、大小,孢壁颜色、类型、厚度等指标进行鉴定。【结果】从云南干热河谷6个地区的野生及人工栽培的木棉中,共分离鉴定出AMF 3属6种,分别为幼套球囊霉Claroideoglomus etunicatum、摩西球囊霉Funneliformis mosseae、何氏球囊霉Glomus hoi、缩球囊霉Funneliformis constrictum、苏格兰球囊霉Glomus caledonium和细凹无梗囊霉Acaulospora scrobiculata。AMF在不同区域、不同季节和不同栽培环境下的分布规律不同,旱季较少,雨季较多;野生环境中多,人工栽培环境少。【结论】在云南干热河谷地区,幼套球囊霉和摩西球囊霉较其他AMF出现频率更高,孢子数量较多,初步认为这2种是该区域木棉科植物丛枝菌根真菌的优势种。

关键词：木棉科丛枝菌根真菌干热河谷

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灭字脊虎天牛触角转录组中气味结合蛋白基因的鉴定及表达谱分析

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四川农业大学学报 2018年第2期36卷 193-202页

作者：吉帅帅庄翔麟刘乃勇西南林业大学生物多样性保护与利用学院昆明650224 西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

【目的】发掘灭字脊虎天牛(Xylotrechus quadripes Chevrolat)成虫触角中的OBP基因,明确OBP基因在成虫不同组织的表达情况。【方法】采用Illumina HiSeq^(TM) 2000测序平台对灭字脊虎天牛的触角进行转录组测序,利用BLAST同源搜索的方法... 详细信息

【目的】发掘灭字脊虎天牛(Xylotrechus quadripes Chevrolat)成虫触角中的OBP基因,明确OBP基因在成虫不同组织的表达情况。【方法】采用Illumina HiSeq^(TM) 2000测序平台对灭字脊虎天牛的触角进行转录组测序,利用BLAST同源搜索的方法鉴定OBP基因,采用RT-PCR技术研究OBP基因的表达谱。【结果】从灭字脊虎天牛的触角转录组中共鉴定到24个OBP基因,所有OBP基因均具有全长开放阅读框(123~180个氨基酸)和信号肽序列(16~23个氨基酸)。多序列比对结果表明,不同OBP间一致性较低,其平均值为19.4%。序列比对和进化树分析结果表明,9个OBP具有6个保守的半胱氨酸,属于Classic OBPs家族;15个OBP具有4个保守的半胱氨酸,属于Minus-C OBPs家族。RT-PCR结果表明,Xqua OBP4、OBP8、OBP18和OBP21在触角特异表达;Xqua OBP2、OBP3、OBP7和OBP20在触角高表达,另外在其他组织中也有表达;其他OBPs基因在检测的两个或多个组织中均有不同程度的表达。【结论】从灭字脊虎天牛触角转录组中共鉴定得到24个OBP基因,其中部分基因在触角特异或高表达,很可能参与嗅觉功能;部分基因在非嗅觉组织中有表达,很可能具有非嗅觉功能。

关键词：灭字脊虎天牛触角转录组气味结合蛋白表达谱

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基于Sentinel-2数据的火烧迹地提取研究

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自然灾害学报 2023年第6期32卷 123-130页

作者：韩丽高启王秋华高仲亮王锲西南林业大学土木工程学院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

昆明为云南省的政治经济文化中心,森林火灾多发给人民生产生活带来了极大的威胁。准确提取火烧迹地有利于掌握林火规律,加强森林火险区划,通过合理配备资源提高森林防火效率。以昆明地区2016—2020年Sentinel-2数据、高温火点数据和土... 详细信息

昆明为云南省的政治经济文化中心,森林火灾多发给人民生产生活带来了极大的威胁。准确提取火烧迹地有利于掌握林火规律,加强森林火险区划,通过合理配备资源提高森林防火效率。以昆明地区2016—2020年Sentinel-2数据、高温火点数据和土地利用分类数据为基础,基于差分归一化火烧比率(dNBR)提取该地区火烧迹地面积,并对其空间分布特征进行分析。结果表明:土地利用数据有利于提高火烧迹地提取效率,但高温火点数据错漏较多,对火烧迹地提取贡献不大。Sentinel-2数据与dNBR指数的结合在单火场可以达到平均89%以上的提取精度,有较高适用性。昆明地区火灾高发区为安宁市、晋宁区等地,过火区域集中在高程1700~2300 m、坡度6°~25°的林地耕地混杂地区,阴坡过火面积略大于阳坡。

关键词：火烧迹地差分归一化火烧比率 Sentinel-2 林火昆明地区

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植物病原丝状真菌RGS的研究进展

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北京林业大学学报 2021年第4期43卷 150-157页

作者：韩长志祝友朋西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224 西南林业大学研究生院云南昆明650224

G蛋白信号调控因子(RGS)作为G蛋白信号途径中发挥重要的负调控作用的蛋白,其功能主要表现影响真菌菌丝生长、产孢等发育阶段,以及次生代谢产物、色素合成等致病性方面。近些年,随着学术界对于植物病原丝状真菌RGS蛋白研究的不断深入,产... 详细信息

G蛋白信号调控因子(RGS)作为G蛋白信号途径中发挥重要的负调控作用的蛋白,其功能主要表现影响真菌菌丝生长、产孢等发育阶段,以及次生代谢产物、色素合成等致病性方面。近些年,随着学术界对于植物病原丝状真菌RGS蛋白研究的不断深入,产生了大量的学术报道,然而,尚缺乏对模式真菌与植物病原丝状真菌中RGS蛋白系统性对比分析的研究报道。该文对模式真菌与植物病原丝状真菌RGS蛋白的结构、分类进行综述,并通过SMART保守结构域、二级结构组成情况以及遗传关系分析,明确了植物病原丝状真菌与模式真菌中的RGS蛋白均具有保守的RGS结构域以及相似的二级结构组成情况,以及根据RGS蛋白的序列同源性,明确真菌中RGS蛋白可分为6大类,具有不同结构域的RGS蛋白分别聚类。同时,对不同真菌中RGS蛋白功能进行综述,明确植物病原丝状真菌中RGS的数量和类型均多于模式真菌,RGS蛋白功能具有保守性和独特性特征。为今后学术界进一步开展植物病原丝状真菌中RGS蛋白的作用机制解析,以及植物病原丝状真菌与其他模式真菌中RGS蛋白之间的关系解析提供理论基础。

关键词：丝状真菌 RGS 结构域功能综述

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基于MODIS的云南省2001-2020年林火发生时空特征分析

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南京林业大学学报（自然科学版） 2023年第5期47卷 73-79页

作者：张文文王劲王秋华张曦妍曹恒茂龙腾腾西南林业大学土木工程学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224 玉溪市新平县林业局云南玉溪653400

【目的】研究森林火灾发生的时空特征,掌握云南省林火发生的时空分异特征,定量分析林火发生规律,识别林火高发区和易发区,以进行森林火险分布科学区划。【方法】基于云南省2001—2020年中分辨率成像光谱仪(MODIS)火灾位置/热异常产品数... 详细信息

【目的】研究森林火灾发生的时空特征,掌握云南省林火发生的时空分异特征,定量分析林火发生规律,识别林火高发区和易发区,以进行森林火险分布科学区划。【方法】基于云南省2001—2020年中分辨率成像光谱仪(MODIS)火灾位置/热异常产品数据(MCD14DL),利用火位置信息中所具有的关联性与异质性等,采用统计分析、中心点分析、标准差椭圆法、Ripley’s K函数、核密度等方法,分析云南省林火发生的时空分布特征。【结果】①云南省2001—2020年间林火发生的年际波动较大,2010年出现火点高峰值;季节变化显著,林火主要集中在冬、春两季,春季火点最多且在3月出现高峰值。②林火发生具有显著的区域性特征,林火高发区主要分布在云南省西南部,其次是东南和西北部,东北部林火发生数最少。普洱市是林火发生的中位数中心,其西北部森林火点分布密度最高,核密度值约为0.43;其次是西双版纳州中西部区域,核密度值约为0.34;再者是大理州西北部和文山州东北部区域,这两处核密度值均约为0.26,这4个区域为云南省森林火点分布的热点区。③20年间,林火空间分布的方向性明显,云南省森林火点的总体重心位置正逐步由普洱一带向大理—楚雄—玉溪—红河州一带偏移。④云南省林火的整体空间分布类型为凝聚模式,但聚集程度不高且在逐渐分散。【结论】2001—2020年云南省林火发生不是完全随机分布的,而是呈现一定的时空分布规律。该特征规律有助于强化区域火情管理,增强重点防火区域的防火建设与宣传,科学安排防火工作,降低林火发生率,实现森林可持续发展。

关键词： MODIS火产品火点林火发生时空特征云南省

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