检索结果-内蒙古大学图书馆

华中农业大学学报 2017年第5期36卷 39-44页

作者：韩长志许僖西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

利用CAT(CAZymes analysis toolkit)在线分析程序对Trichoderma virens Gv29-8中碳水化合物活性酶类蛋白(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)不同亚家族的分布情况进行分析,结果表明:粘绿木霉Gv29-8中含有185个CAZymes蛋白,分为主要类别和复合类别两种类型;其中,主要类别含有71个GH蛋白、54个CBM蛋白及12个AA蛋白、25个CE蛋白、3个PL蛋白、3个GT蛋白;复合类型含有17个蛋白。遗传关系分析表明,CAZymes分类应进一步细化到更小的类别。

关键词：碳水化合物活性酶类蛋白粘绿木霉遗传关系预测程序

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缺须墨头鱼不同地理居群的形态分化

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广西师范大学学报（自然科学版） 2013年第4期31卷 128-133页

作者：何茜李旭周伟李奇生西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

分布于长江、红河和澜沧江水系的缺须墨头鱼在形态上存在一定的差异,为确认不同地理居群之间是否发生形态分化,将采自以上3个水系32个采集点的248尾标本按照所属水系,分为金沙江、澜沧江、元江和李仙江4个组,对其外部形态特征以及可数... 详细信息

分布于长江、红河和澜沧江水系的缺须墨头鱼在形态上存在一定的差异,为确认不同地理居群之间是否发生形态分化,将采自以上3个水系32个采集点的248尾标本按照所属水系,分为金沙江、澜沧江、元江和李仙江4个组,对其外部形态特征以及可数性状进行比较,并运用多变量形态学方法对其18个常规性状和17个框架结构性状进行分析。形态比较结果显示,金沙江水系个体在头部和吸盘性状上与其他组间的存在一定差异;可数性状比较结果表明,不同分组间缺须墨头鱼没有明显分化;主成分分析分散值点图显示,没有任一组被独立分出。所以,形态比较与形态度量学研究结果都不能证明其有明显的分化。

关键词：缺须墨头鱼主成分分析形态度量学形态分化

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基于Maxent模型的楚雄腮扁叶蜂潜在分布区预测

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西部林业科学 2013年第2期42卷 49-55页

作者：冯璐刘建宏李永和徐荣李勤文陈敏西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

基于2011～2012年随机调查和收集楚雄腮扁叶蜂在中国西南地区的22个自然分布点数据,并结合分布点的环境变量,采用Maxent最大熵值模型,对楚雄腮扁叶蜂在中国的适生范围进行预测研究。结果表明,楚雄腮扁叶蜂主要分布于云南大部分地区和四... 详细信息

基于2011～2012年随机调查和收集楚雄腮扁叶蜂在中国西南地区的22个自然分布点数据,并结合分布点的环境变量,采用Maxent最大熵值模型,对楚雄腮扁叶蜂在中国的适生范围进行预测研究。结果表明,楚雄腮扁叶蜂主要分布于云南大部分地区和四川、贵州、广西的部分地区,潜在分布于广东雷州半岛及海南的西部、南部沿海地区。用Maxent模型预测楚雄腮扁叶蜂潜在分布的训练数据和测试数据的AUC值均为0.997,精度极高。用刀切法对各环境变量重要性的检测表明,温度因素对楚雄腮扁叶蜂的潜在分布影响最大。

关键词：楚雄腮扁叶蜂 Maxent模型发生潜在分布区预测

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基于全基因组序列的核桃细菌性黑斑病菌分泌蛋白的预测及特征分析

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南京林业大学学报(自然科学版) 2019年第3期43卷 17-22页

作者：祝友朋刘宏莉韩长志西南林业大学生物多样性保护与利用学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

【目的】充分了解核桃黑斑病菌的侵染机制。【方法】以全基因组序列已经公布的7个核桃细菌性黑斑病菌菌株CFBP2528、CFBP7179、CFBP8253、DW3F3、J303、NCPPB1447、Xaj417等所具有的蛋白序列为预测数据,基于分泌蛋白所具有的主要特征,利... 详细信息

【目的】充分了解核桃黑斑病菌的侵染机制。【方法】以全基因组序列已经公布的7个核桃细菌性黑斑病菌菌株CFBP2528、CFBP7179、CFBP8253、DW3F3、J303、NCPPB1447、Xaj417等所具有的蛋白序列为预测数据,基于分泌蛋白所具有的主要特征,利用SignalP v4.1、ProtCompB v9.0、TMHMM v2.0、big-PI Fungal predictor、TargetP v1.1、LipoP v1.0等在线分析程序对分泌蛋白进行预测,同时分析其氨基酸组成及分布、信号肽长度、信号肽切割位点等特征。【结果】核桃细菌性黑斑病菌的分泌蛋白平均为74个,其氨基酸长度多集中于101～400氨基酸,所占比例为63.65%。信号肽氨基酸残基中以A最多,所占比例为22.04%;其次是L,所占比例为19.27%。信号肽长度以19～29个氨基酸的最多,所占比例为79.62%,信号肽切割位点属于A-X-A类型。【结论】核桃细菌性黑斑病菌中分泌蛋白的有效预测,可为深入解析核桃细菌性黑斑病菌中分泌蛋白在侵染过程中所发挥的功能提供理论依据。

关键词：核桃细菌性黑斑病菌全基因组分泌蛋白生物信息学分析

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生防木霉SS003菌株(Trichoderma atroviride)的固体发酵工艺研究

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江西农业大学学报 2012年第6期34卷 1256-1261页

作者：敖新宇程立君陈玉惠西南林业大学/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

为了探索酷绿木霉SS003菌株固体发酵产孢子的较优工艺条件。分别以酷绿木霉SS003菌株为供试菌和以玉米秸秆、麦麸发酵基质,分别进行了固体发酵培养基配方和固体发酵条件的优化筛选,试验设计均采用单因索试验。试验最终检测方法采用血球... 详细信息

为了探索酷绿木霉SS003菌株固体发酵产孢子的较优工艺条件。分别以酷绿木霉SS003菌株为供试菌和以玉米秸秆、麦麸发酵基质,分别进行了固体发酵培养基配方和固体发酵条件的优化筛选,试验设计均采用单因索试验。试验最终检测方法采用血球计数板倍量稀释法镜检孢子量(108个/g)。分别获得了酷绿木霉SS003菌株产孢固体发酵的较优培养基配方和较优固体发酵条件,即80目的玉米秸秆与麦麸配比1∶3,接种1×106个/mL的SS003孢子液,保持含水量55%和充分通气,培养11 d后,酷绿木霉SS003菌株固体发酵产孢量达到最大(76.14×108个/g)。初步探索到绿木霉SS003菌株固体发酵产孢的较优工艺条件,为该菌的深入研发提供了有益的试验数据。

关键词：酷绿木霉固体发酵工艺优化筛选

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普通核桃与深纹核桃中叶绿体基因组密码子使用特征对比

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江苏农业学报 2024年第8期40卷 1507-1520页

作者：朱艳韩长志西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

本研究旨在对比分析普通核桃与深纹核桃中叶绿体基因组密码子的使用偏好性,对普通核桃与深纹核桃中各53条蛋白质编码区序列开展预测分析,明确上述2种核桃叶绿体基因组中的最优密码子,为未来开展核桃物种的亲缘关系研究提供理论依据。利... 详细信息

本研究旨在对比分析普通核桃与深纹核桃中叶绿体基因组密码子的使用偏好性,对普通核桃与深纹核桃中各53条蛋白质编码区序列开展预测分析,明确上述2种核桃叶绿体基因组中的最优密码子,为未来开展核桃物种的亲缘关系研究提供理论依据。利用Codon W 1.4.2和在线软件CUSP等分析普通核桃与深纹核桃中的叶绿体基因组密码子,获得相对同义密码子使用度(RSCU)、有效密码子数(ENC)、G+C含量等参数,再进行中性绘图分析、有效密码子数分析及奇偶偏好性分析。普通核桃与深纹核桃中叶绿体基因组的密码子适应指数均为0.167,ENC均在45.00以上,表明密码子偏好性弱。普通核桃与深纹核桃中叶绿体基因组密码子的G+C含量整体表现为:基因中所有密码子第1位碱基G+C的含量(GC_(1))>基因中所有密码子第2位碱基G+C的含量(GC_(2))>基因中所有密码子第3位碱基G+C的含量(GC_(3))。进一步分析发现,第3位碱基的使用频率表现为T大于A,G大于C。从普通核桃中筛选出14个最优密码子,从深纹核桃中筛选出17个最优密码子,其中共有23个最优密码子在第3个位置偏好以A/U结尾。总之,普通核桃和深纹核桃中叶绿体基因组密码子偏好性主要受到自然选择的影响,本研究结果可以为进一步探索核桃抗性遗传基因的改良和表达提供理论基础和数据支撑。

关键词：普通核桃深纹核桃叶绿体基因组同义密码子偏好性

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云南切梢小蠹气味结合蛋白的同源模建

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应用昆虫学报 2015年第5期52卷 1223-1228页

作者：汪宇孙浩朱家颖赵宁杨斌西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224 西南林业大学理学院昆明650224

【目的】为了研究云南切梢小蠹Tomicus yunnanensis气味结合蛋白(Odorant binding proteins,OBPs)参与其嗅觉识别过程的机理奠定基础,本文对云南切梢小蠹OBP进行了同源模建及评价分析。【方法】采用同源模建方法构建了云南切梢小蠹OBP... 详细信息

【目的】为了研究云南切梢小蠹Tomicus yunnanensis气味结合蛋白(Odorant binding proteins,OBPs)参与其嗅觉识别过程的机理奠定基础,本文对云南切梢小蠹OBP进行了同源模建及评价分析。【方法】采用同源模建方法构建了云南切梢小蠹OBP的三维结构,并利用Procheck、Verify_3D和ERRAT等方法评估了构建模型的可靠性。【结果】对优化后的模建蛋白的结果分析发现,序列中有6个保守的半胱氨酸位点,具有气味结合蛋白的典型特征,并且Procheck、Verify_3D和ERRAT对模型的评价分数较高,结构具有很高的可能性。【结论】基于已知的同源蛋白结构信息和模建蛋白的一级序列信息,预测序列已知但结构未知的蛋白空间结构,为今后研究该云南切梢小蠹气味结合蛋白的功能结构域奠定基础。

关键词：气味结合蛋白同源模建三维结构云南切梢小蠹

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昆明地区15种常绿森林木本植物离体叶的失水特征

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林草资源研究 2019年第2期 142-146页

作者：李世友罗静张桥蓉蒋婷王昆伦王秋华胡燕娥西南林业大学消防学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

基于特定条件下昆明地区阔叶林与云南松林、华山松林、地盘松林同样易燃的现象,选择昆明地区15种常见常绿木本植物的离体叶为研究对象,测定了鲜叶质量和在80℃干燥箱中0.5h,1h,1.5h,2h,3h,4h,5h,17h共8个时刻的质量,计算各时段的平均失... 详细信息

基于特定条件下昆明地区阔叶林与云南松林、华山松林、地盘松林同样易燃的现象,选择昆明地区15种常见常绿木本植物的离体叶为研究对象,测定了鲜叶质量和在80℃干燥箱中0.5h,1h,1.5h,2h,3h,4h,5h,17h共8个时刻的质量,计算各时段的平均失水率、平均失水速率和各时刻平均含水率,分析了离体叶的失水特征。结果表明:15种离体叶失水速率均呈现出先快后慢的变化趋势,3种针叶保水能力强于12种阔叶。从失水角度看,3种针叶失水慢于12种阔叶,阻燃性强于后者。植物离体叶在热作用下的失水速率可以作为评价植物燃烧性的一个指标。

关键词：昆明地区木本植物离体叶失水速率失水特征

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中国盘腹蚁属19种蚂蚁的形态测量学研究

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林业科学研究 2023年第6期36卷 106-114页

作者：段加焕徐正会张新民西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

[目的]探究形态测量学方法在蚁科昆虫分类中的应用价值。[方法]采用因子分析、主成分分析和系统聚类的统计分析方法进行中国盘腹蚁属19种蚂蚁的形态测量学研究。[结果]4个主成分胸长(MSL)、头宽(HW)、腹柄长宽比(LPI)和腹柄长高比(DPI)... 详细信息

[目的]探究形态测量学方法在蚁科昆虫分类中的应用价值。[方法]采用因子分析、主成分分析和系统聚类的统计分析方法进行中国盘腹蚁属19种蚂蚁的形态测量学研究。[结果]4个主成分胸长(MSL)、头宽(HW)、腹柄长宽比(LPI)和腹柄长高比(DPI)有较高的载荷值,可综合反映其他14个变量,其主成分得分散点图能够明显区分该属19种蚂蚁;聚类分析可将19种盘腹蚁聚成4分支,第一支与第二亲缘关系最近,与第四支最远,其结果与主成分的分散点图的聚类情况以及形态特征分类结果基本一致。[结论]形态测量学方法对蚁科昆虫的分类学研究具有很好的应用价值,具有重要应用前景,可为物种分类鉴定提供新的方法。

关键词：盘腹蚁属形态测量主成分分析聚类分析

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陕西佛坪国家级自然保护区管理现状调查与评价

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林业经济问题 2010年第5期30卷 430-434页

作者：杨丽萍陈晶周伟云南省森林灾害预警与控制重点实验室西南林业大学昆明650224

通过对陕西佛坪国家级自然保护区管理进行现状调查,从管理体系设置、执法建设情况、生态监测以及科研和社区共管与生态旅游4个方面,对佛坪保护区大熊猫保护管理的基本现状进行分析与评价,结果表明:保护区管理体系基本完善,机构设置合理... 详细信息

通过对陕西佛坪国家级自然保护区管理进行现状调查,从管理体系设置、执法建设情况、生态监测以及科研和社区共管与生态旅游4个方面,对佛坪保护区大熊猫保护管理的基本现状进行分析与评价,结果表明:保护区管理体系基本完善,机构设置合理,经费较为宽松;执法体系完善;监测体系规范;作为科研平台,每年有科研项目在区内实施。参照《自然保护区有效管理评价技术规范》(2008),佛坪保护区有效管理现状达到优等。同时,对保护区仍然存在的一些问题,提出了针对性的建议。并针对存在的问题给出建议。

关键词：佛坪保护区现状调查大熊猫陕西

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