检索结果-内蒙古大学图书馆

江苏农业科学 2022年第14期50卷 144-154页

作者：程欢张东华张俊忠刘丽西南林业大学保护生物学学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

应用高通量测序技术分析苹果砧木T337根部、枝部、叶部的内生菌群落并利用PICRUSt进行功能预测。从苹果砧木T337不同部位的内生细菌中共获得的有效序列聚类为11386个操作分类单元(OTUs)。从内生真菌中获得的有效序列聚类为2718个OTUs。... 详细信息

应用高通量测序技术分析苹果砧木T337根部、枝部、叶部的内生菌群落并利用PICRUSt进行功能预测。从苹果砧木T337不同部位的内生细菌中共获得的有效序列聚类为11386个操作分类单元(OTUs)。从内生真菌中获得的有效序列聚类为2718个OTUs。α-多样性分析结果表明,各指数均为根部显著高于枝部、叶部,枝部、叶部间的差异则不显著;从内生真菌多样性上看,除辛普森(Simpson)指数表现为根部、叶部显著高于枝部外,其他指数均表现为根>叶>枝。物种丰度分析结果表明,在门水平上,T337根部的最优细菌门为放线菌门(Actinobacteria),枝部、叶部的最优细菌门为变形菌门(Proteobacteria);在属水平上,T337根部、枝部、叶部最具优势的内生细菌分别为变形菌门的鞘氨醇单胞属(Sphingomonas)、不动杆菌属(Acinetobacter)、甲基杆菌属(Methylobacterium);根部的特有菌属最多,有187个,枝部有5个,叶部有6个。T337根部、枝部、叶部都存在大量未归类的内生细菌(占比分别为35.885%、50.185%、59.884%)。根、枝、叶3个部位最优势真菌门均为子囊菌门(Ascomycota),内生真菌优势属分别为子囊菌门的亚隔孢属(Didymella)、Knufia(尚无统一的中文名)和壳针孢属(Septoria)。根部内生真菌的特有属有121个,枝部样品的特有属有7个,叶部样品的特有属有35个。根、枝、叶中也存在大量未归类的内生真菌(占比分别为41.031%、82.036%、39.467%)。功能预测结果显示,苹果砧木T337内生细菌群落功能与植物组织部位发挥的功能一致,可为进一步挖掘与植物营养生长相关微生物提供参考。

关键词：苹果砧木T337 高通量测序内生微生物功能预测 α-多样性分析

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青藏高原东北坡蚂蚁物种的分布格局

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林业科学研究 2022年第3期35卷 131-140页

作者：陈超熊忠平徐正会刘霞钱昱含祁彪钱怡顺郭宁妍西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

[目的]揭示青藏高原蚂蚁群落结构和分布规律。[方法]采用样地调查法研究了青藏高原东北坡蚂蚁物种分布格局。[结果]在该地区记录蚂蚁2亚科13属30种。气温、海拔、植被类型对蚂蚁物种的分布和丰富度起主要作用,低海拔地带气温较高,食物... 详细信息

[目的]揭示青藏高原蚂蚁群落结构和分布规律。[方法]采用样地调查法研究了青藏高原东北坡蚂蚁物种分布格局。[结果]在该地区记录蚂蚁2亚科13属30种。气温、海拔、植被类型对蚂蚁物种的分布和丰富度起主要作用,低海拔地带气温较高,食物资源丰富,栖息着更多的蚂蚁物种。草丛栖息的蚂蚁物种最丰富,在土壤内筑巢和地表觅食的物种最多。光亮黑蚁(Formica candida Smith)是青藏高原东北坡分布最广泛、适应性最强的物种,可作为该地区生态环境变化的指示物种。[结论]大部分蚂蚁物种因受环境制约而分布范围较窄,生态适应能力弱,很容易因人为干扰而变得脆弱。虽然物种多样性偏低,但是在该地区栖息的蚂蚁物种和其他地方相比有明显差异,脆弱的生态系统中栖息着耐寒、耐干旱的物种,对高海拔缺氧环境表现出良好适应性,对高原生态系统土壤改良和植物种子扩散等具有重要作用。

关键词：蚁科物种分布格局垂直带青藏高原

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川西高原北部地区蚂蚁物种分布格局研究

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广西师范大学学报（自然科学版） 2023年第5期41卷 134-142页

作者：段加焕徐正会张新民李婷尹晓丹李朝义西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室(西南林业大学) 云南昆明650224

为了揭示川西高原地区蚂蚁物种分布规律,本文采用样地调查法研究川西高原北部蚂蚁物种分布格局。结果表明:川西高原北部地区共栖息着35种蚂蚁,隶属于4亚科17属;四川凹唇蚁Formica sentschuensis Ruzsky、丝光蚁***、科氏红蚁Myrmica koz... 详细信息

为了揭示川西高原地区蚂蚁物种分布规律,本文采用样地调查法研究川西高原北部蚂蚁物种分布格局。结果表明:川西高原北部地区共栖息着35种蚂蚁,隶属于4亚科17属;四川凹唇蚁Formica sentschuensis Ruzsky、丝光蚁***、科氏红蚁Myrmica kozlovi Ruzsky和吉市红蚁*** Forel是川西高原北部分布最广泛、适应性最强的物种;蚂蚁对栖息生境、觅食和筑巢场所等微生境均表现出明显的选择分化,其中阔叶林的物种最丰富;觅食场所中,以地表觅食最丰富;筑巢场所多以石下筑巢和土壤筑巢为主。蚂蚁物种的分布格局主要与物种的适应能力有关,同时还受海拔、植被和人为因素的干扰。研究结果对丰富和完善我国西南山地的蚂蚁多样性具有重要意义。

关键词：川西高原北部分布格局蚁科栖息生境

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炭疽属植物病原真菌分泌蛋白的预测及比较分析

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福建农林大学学报（自然科学版） 2023年第6期52卷 747-754页

作者：薄淑文喻红稠覃悦韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

植物病原真菌分泌蛋白在其致病过程中起着重要的作用。通过NCBI数据库下载前人已报道的24种炭疽属植物病原真菌全基因组序列,利用SignalP v5.0、ProtComp v9.0、TMHMM v2.0等在线分析程序对这些炭疽菌蛋白质的跨膜结构、信号肽、糖基磷... 详细信息

植物病原真菌分泌蛋白在其致病过程中起着重要的作用。通过NCBI数据库下载前人已报道的24种炭疽属植物病原真菌全基因组序列,利用SignalP v5.0、ProtComp v9.0、TMHMM v2.0等在线分析程序对这些炭疽菌蛋白质的跨膜结构、信号肽、糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定位点、亚细胞定位等进行预测分析,根据分泌蛋白的典型特征筛选获取24种炭疽菌的分泌蛋白。结果显示:在约34万条蛋白序列中,分泌蛋白所占比例为2.14%~3.76%,其氨基酸残基数量多集中于100~300个,并且氨基酸组成相似度较高,其中以丙氨酸残基在分泌蛋白中的含量最高,所占比例达9.72%~10.54%;同时,24种炭疽菌分泌蛋白的信号肽在-3和-1位切割位点处相对比较保守,属于A-X-A类型,其氨基酸残基数量多集中于17~22个。可见,炭疽属不同种之间分泌蛋白的比例、氨基酸组成、信号肽特征等存在差别,但差异并不大。

关键词：炭疽属分泌蛋白对比分析生物信息学

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高黎贡山南段大型真菌多样性研究

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西南林业大学学报（自然科学） 2023年第5期43卷 97-105,I0002-I0006页

作者：梁香娜高玉江张海洋张颖西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警控制重点实验室云南昆明650233

以随机路线踏查法为主,样地法为辅,对该区林下大型真菌进行较系统地调查,除随机踏查路线外,共选取8块标准样地,调查高黎贡山南段大型真菌资源情况。结果表明:该区内大型真菌种类223种,隶属46科、86属。其中食用菌77种,药用菌21种,毒菌25... 详细信息

以随机路线踏查法为主,样地法为辅,对该区林下大型真菌进行较系统地调查,除随机踏查路线外,共选取8块标准样地,调查高黎贡山南段大型真菌资源情况。结果表明:该区内大型真菌种类223种,隶属46科、86属。其中食用菌77种,药用菌21种,毒菌25种,食药兼用菌15种,不明80种;易危1种,近危1种,无危101种,中国特有种8种。优势科为红菇科(Russulaceae)、多孔菌科(Polyporaceae)、丝膜菌科(Cortinariaceae)、牛肝菌科(Boletaceae)、蘑菇科(Agaricalceae)、小菇科(Mycenaceae)。优势属为红菇属(Russula)、乳菇属(Lactarius)、丝膜菌属(Cortinarius)、鹅膏属(Amanita)、小菇属(Mycena)、小皮伞属(Marasmius)、多孔菌属(Polyporus)、粉褶菌属(Entoloma)、蜡蘑属(Laccaria)、栓菌属(Trametes)、马勃属(Lycoperdon)、湿伞属(Hygrocybe)、小孔菌属(Microporus),不同样地的优势属各有不同。区系地理成分具有明显的温带性质,与热带—亚热带大型真菌区系具有一定的关系,与云南大围山相似性较高。

关键词：高黎贡山大型真菌多样性生态分布

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四川大凉山东部地区蚂蚁物种分布特征

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广西师范大学学报（自然科学版） 2023年第1期41卷 174-191页

作者：李婷徐正会李彪翟奖韩秀张新民西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室(西南林业大学) 云南昆明650224

为揭示四川大凉山东部地区的蚂蚁物种分布规律,采用样地调查法研究该地区蚂蚁物种的分布格局,运用采获频数统计法对蚂蚁物种的垂直分布、栖息生境、觅食和筑巢场所进行统计分析。本次调查共采获蚂蚁标本35630头,隶属于6亚科43属135种(包... 详细信息

为揭示四川大凉山东部地区的蚂蚁物种分布规律,采用样地调查法研究该地区蚂蚁物种的分布格局,运用采获频数统计法对蚂蚁物种的垂直分布、栖息生境、觅食和筑巢场所进行统计分析。本次调查共采获蚂蚁标本35630头,隶属于6亚科43属135种(包括15个待定种)。其中,生活在低海拔区域的针叶林和针阔混交林内的蚂蚁种类较多,其他植被类型内的蚂蚁种类较少,并表现出较窄的生态适应幅度;在视野开阔和食物资源丰富地表觅食的蚂蚁种类较多,大多数蚂蚁在结构稳定的土壤和石块下筑巢。研究结果表明,蚂蚁物种的分布格局受海拔、植被类型、食物资源丰富度及筑巢场所稳定性的综合影响,同时还与蚂蚁物种的自身适应能力有关。

关键词：蚁科物种生物多样性垂直分布生态适应大凉山

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间作柿子树对苹果根际土壤微生物群落结构和功能的影响

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西南农业学报 2023年第12期36卷 2651-2661页

作者：郑娇刘娟娟张东华伍建榕刘丽西南林业大学生物多样性保护学院/云南省高校森林灾害预警控制重点实验室昆明650224

【目的】揭示柿子树与苹果树间作体系下,苹果根际土壤的微生物群落结构和理化性质。【方法】以间作(I)和非间作(NI)的苹果根际土壤为材料,采用高通量测序技术,对苹果根际土壤微生物群落结构进行分析。【结果】间作柿子树增加了苹果根际... 详细信息

【目的】揭示柿子树与苹果树间作体系下,苹果根际土壤的微生物群落结构和理化性质。【方法】以间作(I)和非间作(NI)的苹果根际土壤为材料,采用高通量测序技术,对苹果根际土壤微生物群落结构进行分析。【结果】间作柿子树增加了苹果根际土壤有机质(OM)、水解性氮(AN)、全磷(TP)含量,降低了土壤中有效钾(AK)含量。Alpha多样性分析表明,间作对苹果根际土壤细菌丰富度指数和多样性指数无显著影响,但显著降低了根际土壤真菌的Ace指数(P=0.03)。β多样性分析表明,间作和非间作土壤细菌和真菌群落结构都存在显著差异。LEfSe分析发现,间作显著增加苹果根际土壤中17个细菌属丰度,分别为Sporacetigenium、Tepidisphaera、Agromyces、Alkanindiges、Phycisphaera、假黄色单胞菌属(Pseudoxanthomonas)、Terrimonas、Pseudohaliea、Paenisporosarcina 9个已知属,8个未知属;显著降低4个细菌属丰度,分别为Sporichthya、Methylocystis、Devosia、Altererythrobacter。间作显著增加1个真菌属丰度,为Arthrographis;降低3个真菌属丰度,分别为柱孢属(Cylindrocarpon)、Metacordyceps、外瓶霉属(Exophiala)。Spearman相关性分析表明,根际细菌属Pseudomonas与有效磷(AP)、全磷(TP)呈显著正相关,真菌属Naganishia与有效磷(AP)呈显著正相关;真菌属Polyscytalum、Minimedusa与有效磷(AP)呈显著负相关。PICRUSt2结果显示,间作显著降低了根际细菌碳水化合物运输和代谢以及胞外结构两大类功能丰度;FUNGuild功能分析显示,间作显著降低了病原-腐生过渡型真菌在苹果根际土壤的丰度。【结论】苹果与柿子树间作可提高苹果根际土壤OM、AN、TP含量,显著增加根际有益微生物的相对丰度,减少病原真菌微生物的相对丰度,为探讨间作抗病机理提供数据参考。

关键词：苹果间作柿子树根际微生物 Illumina Miseq测序群落结构功能预测

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植物病原丝状真菌G蛋白偶联受体的预测方法对比研究

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福建农林大学学报（自然科学版） 2023年第5期52卷 607-616页

作者：韩长志薄淑文西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

植物病原丝状真菌G蛋白偶联受体(GPCR)在实现外界信号感知和传递过程中发挥着重要作用。基于GPCR蛋白所具有的典型7个跨膜保守结构域及非典型保守结构域,通过总结前人已报道的候选GPCR的同源比对方法,对其跨膜结构域数量预测方法及跨膜... 详细信息

植物病原丝状真菌G蛋白偶联受体(GPCR)在实现外界信号感知和传递过程中发挥着重要作用。基于GPCR蛋白所具有的典型7个跨膜保守结构域及非典型保守结构域,通过总结前人已报道的候选GPCR的同源比对方法,对其跨膜结构域数量预测方法及跨膜结构蛋白数据库进行对比,明确TOPCONS是目前预测GPCR跨膜结构域的较好方法。然后,选择NCBI数据库中223个不同真菌的GPCR蛋白序列通过TOPCONS和TMHMM进行对比分析,结果显示,2种软件对GPCR跨膜结构域数量的预测结果不尽相同,TOPCONS预测结果的准确度较高;进一步对上述GPCR蛋白序列的氨基酸数目进行分析,明确具有7个跨膜结构域的GPCR蛋白氨基酸数目为200~1406个。该研究可为进一步开展植物病原丝状真菌GPCR蛋白的结构预测及其功能研究提供参考。

关键词：植物病原丝状真菌 G蛋白偶联受体预测方法 TOPCONS软件对比分析

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油茶根腐病根际土壤、根系内真菌群落结构和多样性分析

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中国农业科技导报 2024年第7期26卷 121-135页

作者：杨娅琳吴峰婧琳陈健鑫武自强刘丽张东华马焕成伍建榕西南林业大学生物多样性保护学院云南省高校森林灾害预警控制重点实验室昆明650224 西南林业大学林学院西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室昆明650224

为明确患根腐病的油茶在不同病情等级下根系和根际土壤内真菌群落组成、多样性、功能特征及与环境因子的关系,以德宏州梁河县的油茶为研究对象,利用高通量测序技术对5个病情等级的油茶根系及根际土壤内真菌的转录间隔区(internal transc... 详细信息

为明确患根腐病的油茶在不同病情等级下根系和根际土壤内真菌群落组成、多样性、功能特征及与环境因子的关系,以德宏州梁河县的油茶为研究对象,利用高通量测序技术对5个病情等级的油茶根系及根际土壤内真菌的转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列进行测序。结果表明,染病油茶根系及根际土壤内的真菌群落多样性(Shannon指数)降低,根系中真菌总OTUs(operational taxonomic units)、特有OTUs和丰富度(Chao1指数)呈先增加后减少的趋势;根际土壤中染病油茶真菌群落的均匀度和丰富度上升。门水平上,子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)为根系及根际土壤中共同的优势菌门,球囊菌门(Glomeromycota)和被孢囊门(Mortierellomycota)在根系中丰度表现为逐级递减的趋势。属水平上,患病后油茶根系内树状孢属(Dendrosporium)、暗双胞属(Cordana)、Matsushimamyces、无柄盘菌属(Pezicula)、黑孢盘属(Melanconium)的丰度明显上升。油茶林下土壤真菌群落结构的主要影响因子为速效钾、有机质、pH、速效磷,真菌群落与环境因子联合分析结果表明,部分有益菌和磷含量呈正相关,部分病原菌和钾含量呈负相关。FUNGuild功能分析表明,油茶根系及根际土壤中真菌以腐生型为主,健康油茶中共生营养型真菌丰度最高,染病后逐渐降低;从Ⅱ级病害以后的油茶根系内植物病原功能群开始成为优势功能群。综上所述,油茶患病后真菌的多样性减少,根系内部分有益真菌丰度减少,植物病原菌和腐生菌增加,丛枝菌根真菌的定殖在调节油茶病健关系中发挥着重要的作用。针对德宏州梁河县的油茶基地,需要多施钾肥和磷肥,减少氮肥的施用,可提高部分有益菌的丰度,降低病原菌的丰度,从而减轻油茶根腐病的发生。

关键词：油茶根腐病真菌多样性群落结构土壤理化性质 FUNGuild功能

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文山国家级自然保护区蚂蚁多样性与分布格局

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森林与环境学报 2023年第1期43卷 103-112页

作者：崔文夏房华徐正会都红杨蕊王戌勃西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224 西南林业大学图书馆云南昆明650224

为揭示云南文山国家级自然保护区蚂蚁多样性规律,采用样地调查法研究了文山国家级自然保护区及邻近地区蚂蚁物种的多样性与分布格局。结果表明,在9块样地中共采集蚂蚁14885头,隶属9亚科51属109种。整体上,物种丰富度、个体密度和Shannon... 详细信息

为揭示云南文山国家级自然保护区蚂蚁多样性规律,采用样地调查法研究了文山国家级自然保护区及邻近地区蚂蚁物种的多样性与分布格局。结果表明,在9块样地中共采集蚂蚁14885头,隶属9亚科51属109种。整体上,物种丰富度、个体密度和Shannon-Wiener多样性指数与海拔显著(P<0.05)或极显著线性负相关(P<0.01),海拔的变化导致生境不同,中低海拔地区植被类型多样,食物资源丰富,栖息着更多的蚂蚁物种,人为干扰影响着局部的蚂蚁丰富度。在6类生境中,季风常绿阔叶林内的蚂蚁物种最丰富(62种),苔藓矮林内的蚂蚁物种最贫乏(2种)。黄足尼兰蚁(Nylanderia flavipes)的垂直分布范围最大,同时超83%的物种(91种)生态适应幅度狭窄。大多数的蚂蚁在地表觅食,在土壤中筑巢。不同样地蚂蚁群落间相似性处于极不相似至中等不相似水平,表明群落分化明显,生态功能多样,可在生物多样性保护中发挥重要作用。研究区域内,气温、植被类型和人为干扰对蚂蚁物种的丰富度和分布有重要影响。

关键词：云南文山国家级自然保护区蚁科群落 α多样性分布规律

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