大理茶(Camellia taliensis)是茶的重要野生近缘种,是茶资源的重要组成部分,研究大理茶群体的遗传多样性和亲缘关系,对科学保护和合理利用大理茶种质资源至关重要。本研究应用SSR标记技术对澜沧江流域5个州市共45份大理茶种和5份普洱茶(C. sinensis var. assamica)种的种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果显示,15对有效引物共检测到55个多态性位点,每对引物平均扩增3.67个位点;大理茶资源的平均期望杂合度(epected heterozygosity, He)为0.346;多态信息含量(polymorphism information content, PIC)变化范围是0.024~0.661,平均值为0.381;香农指数变化范围是0.067~1.321,平均值为0.669;多态性引物比例为60.0%,多态性引物占有效引物的比例为75.0%。聚类分析结果显示,澜沧江流域大理茶树种质分类与地理区域具有相关性,地理位置较远的大理茶树居群间的遗传距离较远,但居群内遗传距离较近。以上结果表明,澜沧江流域大理茶资源具有中等遗传多样性和中等丰富度。本研究为大理茶种质资源的保护开发及遗传图谱构建提供参考。
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