检索结果-内蒙古大学图书馆

福建农林大学学报（自然科学版） 2024年第4期53卷 443-450页

作者：薄淑文韩长志西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

【目的】糖苷水解酶(GH)作为破坏植物细胞壁的重要酶类,在植物病原菌致病过程中发挥着重要作用。为了解GH蛋白之间的互作机制,对禾谷炭疽菌GH互作蛋白及其遗传关系进行研究。【方法】基于前期所获得的禾谷炭疽菌GH蛋白,通过STRING网络... 详细信息

【目的】糖苷水解酶(GH)作为破坏植物细胞壁的重要酶类,在植物病原菌致病过程中发挥着重要作用。为了解GH蛋白之间的互作机制,对禾谷炭疽菌GH互作蛋白及其遗传关系进行研究。【方法】基于前期所获得的禾谷炭疽菌GH蛋白,通过STRING网络在线分析不同GH蛋白之间的互作关系,通过ProtComp v9.0在线分析GH蛋白的亚细胞定位,利用Clustal X和MEGA 11软件对GH蛋白进行多重比对和构建系统进化树,并选取互作关系多的蛋白通过GRAMM在线软件进行分子对接。【结果】禾谷炭疽菌中89个GH蛋白之间的互作表现为3大类的聚集关系,其中,Ⅰ类聚集了34个GH蛋白,Ⅱ类聚集了33个GH蛋白,Ⅲ类聚集了22个GH蛋白;85个GH蛋白定位于细胞外(分泌),仅4个GH蛋白定位于细胞核、内质网、细胞质膜。系统发育树分为4大类,有一些GH亚家族蛋白只存在于一类中,也有一些GH亚家族蛋白同时存在于两类及两类以上中;分子对接发现,互作蛋白之间均存在多个相互作用的氨基酸残基位点。【结论】禾谷炭疽菌GH蛋白之间有3种互作情况,即不同亚家族GH蛋白之间的互作、同一亚家族中不同GH蛋白之间的互作以及不存在互作关系;大部分GH蛋白定位于细胞外;大多数GH亚家族中不同蛋白亲缘关系较近,蛋白之间可通过氢键相互作用。

关键词：禾谷炭疽菌糖苷水解酶蛋白互作协同作用

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云南南滚河自然保护区蚂蚁群落研究

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西部林业科学 2014年第5期43卷 93-100页

作者：宋扬徐正会李春良郝永强李海斌西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

为了揭示滇西南地区蚂蚁多样性，采用样方调查法和搜索调查法研究了南滚河自然保护区蚂蚁群落。在16块样地中采获蚁科昆虫11亚科57属188种，不同样地蚂蚁群落的物种数5-72种，个体密度12.5-1234.0头/m2，优势度指数0.0887-0.7024，多样... 详细信息

为了揭示滇西南地区蚂蚁多样性，采用样方调查法和搜索调查法研究了南滚河自然保护区蚂蚁群落。在16块样地中采获蚁科昆虫11亚科57属188种，不同样地蚂蚁群落的物种数5-72种，个体密度12.5-1234.0头/m2，优势度指数0.0887-0.7024，多样性指数0.7978-2.9355，均匀度指数0.2514-0.7170。沟谷雨林蚂蚁物种最丰富，苔藓常绿阔叶林物种最贫乏；橡胶林蚂蚁个体密度最高，苔藓常绿阔叶林个体密度最低；山地雨林蚂蚁群落多样性指数、均匀度指数最高，优势度指数最低；柚木林蚂蚁群落优势度指数最高，多样性指数、均匀度指数最低。季风常绿阔叶林和沟谷雨林拥有最丰富的稀有种，最有保护价值；山地雨林、落叶季雨林、苔藓常绿阔叶林、针阔混交林也有一定数目的稀有种，保护价值较大。相似性系数表明，不同植被类型蚂蚁群落间差异显著。

关键词：膜翅目蚁科蚂蚁群落多样性南滚河自然保护区

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希金斯炭疽菌磷酸二酯酶生物信息学分析

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科学技术与工程 2014年第27期22卷 163-167页

作者：韩长志西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

磷酸二酯酶(Pde)在植物病原菌G蛋白信号传导途径上发挥着重要作用。Pde已在粟酒裂殖酵母菌、稻瘟病菌等中有相关报道,然而,对于侵染十字花科植物的希金斯炭疽菌中Pde研究尚不深入。基于酿酒酵母中已经报道的典型Pde序列,利用Blastp以及... 详细信息

磷酸二酯酶(Pde)在植物病原菌G蛋白信号传导途径上发挥着重要作用。Pde已在粟酒裂殖酵母菌、稻瘟病菌等中有相关报道,然而,对于侵染十字花科植物的希金斯炭疽菌中Pde研究尚不深入。基于酿酒酵母中已经报道的典型Pde序列,利用Blastp以及关键词对炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,并通过SMART保守结构域分析。同时,通过对该菌中典型Pde氨基酸序列进行理化性质、疏水性、细胞信号肽、跨膜区结构、亚细胞定位以及二级结构等生物信息学分析,此外,通过对希金斯炭疽菌中的典型Pde与其他物种中的同源序列进行遗传关系比较分析。通过上述生物信息学分析,以期为深入开展Pde定位、功能研究等方面研究,同时,为进一步实现以控制病原菌G蛋白信号途径功能新的药物靶标的开发提供有力的理论支撑。

关键词：希金斯炭疽菌磷酸二酯酶理化性质亚细胞定位二级结构

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禾谷炭疽菌腺苷酸环化酶的生物信息学分析

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贵州农业科学 2014年第10期42卷 64-68页

作者：韩长志西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

为了给禾谷炭疽菌新靶标药物的研究开发提供参考,以酿酒酵母的典型腺苷酸环化酶（AC）序列为基础,利用炭疽菌属蛋白数据库在线对其进行Blastp比对及关键词搜索,通过SMART对该菌典型AC蛋白的保守结构域、理化性质、细胞信号肽、跨膜区结... 详细信息

为了给禾谷炭疽菌新靶标药物的研究开发提供参考,以酿酒酵母的典型腺苷酸环化酶（AC）序列为基础,利用炭疽菌属蛋白数据库在线对其进行Blastp比对及关键词搜索,通过SMART对该菌典型AC蛋白的保守结构域、理化性质、细胞信号肽、跨膜区结构以及二级结构等生物信息学进行分析,同时比较禾谷炭疽菌中典型AC氨基酸序列与其他物种同源序列的遗传关系。结果表明：禾谷炭疽菌中存在一个与酿酒酵母Srv2同源的序列,命名为CgCap1腺苷酸环化酶蛋白,该酶蛋白包含有530个氨基酸,基因序列长1 906bp具有保守CARP结构域,等电点蛋白在5~6范围,属亲水性、不稳定蛋白,不含信号肽序列,定位于质膜上,二级结构中的β折叠所占比例较低,与同属于炭疽菌属真菌胶孢炭疽菌、西瓜炭疽菌的亲缘关系较近。

关键词：禾谷炭疽菌腺苷酸环化酶理化性质亚细胞定位二级结构

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全基因组预测枯草芽孢杆菌XF-1的分泌蛋白

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福建农业学报 2016年第4期31卷 384-388页

作者：韩长志西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

枯草芽孢杆菌XF-1对诸多植物病原菌具有抑制作用,是农业生产上重要的生防菌之一。利用SignalP、ProtComp、TMHMM、Phobius、LipoP、TatP等预测程序对枯草芽孢杆菌中3 853条蛋白质序列进行分泌蛋白的预测研究,并对所获得的分泌蛋白开展... 详细信息

枯草芽孢杆菌XF-1对诸多植物病原菌具有抑制作用,是农业生产上重要的生防菌之一。利用SignalP、ProtComp、TMHMM、Phobius、LipoP、TatP等预测程序对枯草芽孢杆菌中3 853条蛋白质序列进行分泌蛋白的预测研究,并对所获得的分泌蛋白开展氨基酸分布、信号肽长度、切割位点等性质进行分析。结果表明,该菌含有分泌蛋白为104个,其氨基酸长度、信号肽长度与植物病原菌不同;信号肽切割位点属于A-X-A类型,与其他已经报道的植物病原真菌、细菌以及卵菌中分泌蛋白信号肽切割位点一致。通过上述生物信息学分析方法有效地实现了枯草芽孢杆菌分泌蛋白的预测,分泌蛋白的信号肽切割位点具有物种保守型特点。

关键词：枯草芽孢杆菌分泌蛋白信号肽预测程序

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云南大理栽培春兰中ORSV和CymMV的分子检测及序列分析

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园艺学报 2022年第3期49卷 655-662页

作者：陈健鑫魏玉倩唐婕竺永金马焕成伍建榕西南林业大学生物多样性保护学院云南省高校森林灾害预警控制重点实验室昆明650224 西南林业大学林学院西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室昆明650224

2018—2019年,在云南大理部分地区开展了春兰(Cymbidium goeringii)病毒病害的调查和典型植株收集,通过逆转录—聚合酶链式反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)检测春兰中的病毒。70株春兰中均检测到齿兰环... 详细信息

2018—2019年,在云南大理部分地区开展了春兰(Cymbidium goeringii)病毒病害的调查和典型植株收集,通过逆转录—聚合酶链式反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)检测春兰中的病毒。70株春兰中均检测到齿兰环斑病毒(odontoglossum ringspot virus,ORSV),未检出建兰花叶病毒(cymbidium mosaic virus,Cym MV),说明该地区潜在的病毒病害主要为ORSV。基于外壳蛋白(CoatProtein)的系统发育树分析表明,所有ORSV分离物位于一个分支。ORSV外壳蛋白属于烟草花叶病毒外壳蛋白家族,理论等电点为5.01,属于亲水性稳定蛋白质。本研究证实了ORSV已经开始感染大理地区栽培的春兰,建议尽快开展兰花病毒病的早期诊断、药剂筛选及防治工作。

关键词：春兰建兰花叶病毒齿兰环斑病毒分子检测外壳蛋白基因生物信息

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球花石楠黑斑病菌生物学特性

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中国森林病虫 2015年第2期34卷 6-8,30页

作者：韩长志李瑞强西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

对球花石楠黑斑病菌Alternaria sp.生物学特性进行了研究。结果显示,该病原菌生长最适条件为PDA,28℃,p H 8,碳源为麦芽糖,氮源为蛋白胨,明确该病菌可以较好地适应不同的光照条件以及不同碳源、氮源等营养环境条件。

关键词：球花石楠黑斑病链格孢生物学特性

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藏东南德姆拉山西坡及波密河谷蚂蚁分布格局

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西北林学院学报 2012年第4期27卷 77-82页

作者：刘霞徐正会张成林于娜娜许国莲北京林业大学林学院北京100083 西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

为了揭示藏东南地区蚂蚁物种的分布规律,采用搜索调查法和样地调查法调查了德姆拉山西坡及波密河谷蚂蚁物种的分布格局。结果表明:发现蚁科(Formicidae)昆虫3亚科,10属,27种。其群落随生态环境条件的变化呈现带状分布;大多数物种对环境... 详细信息

为了揭示藏东南地区蚂蚁物种的分布规律,采用搜索调查法和样地调查法调查了德姆拉山西坡及波密河谷蚂蚁物种的分布格局。结果表明:发现蚁科(Formicidae)昆虫3亚科,10属,27种。其群落随生态环境条件的变化呈现带状分布;大多数物种对环境的适应性较弱,仅分布在低海拔区域,垂直分布高差小于500m;同一亚科不同属或同属不同种对环境的选择分化明显。在9类生境中,高山栎(Quercus semicarpifolia)林的物种最丰富;在9类觅食场所中,在地表觅食的物种最丰富;在6类筑巢场所中,在石下筑巢的蚂蚁物种最丰富。亮腹黑褐蚁(Formica gagatoides)是该地区分布最广泛、占据生境类型最多的物种。

关键词：蚁科垂直分布生境分化西藏

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全基因组预测褐环乳牛肝菌的分泌蛋白

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江苏农业科学 2017年第23期45卷 45-48页

作者：韩长志刘艳任雪敏西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

褐环乳牛肝菌作为针叶树种上重要的外生真菌,为宿主植物提供营养元素和水分,在此过程中,对于该菌分泌蛋白发挥的作用机制尚不清楚。利用Signal P、Prot Comp等预测程序对褐环乳牛肝菌中18 303条蛋白质序列进行分泌蛋白找寻,明确其含有32... 详细信息

褐环乳牛肝菌作为针叶树种上重要的外生真菌,为宿主植物提供营养元素和水分,在此过程中,对于该菌分泌蛋白发挥的作用机制尚不清楚。利用Signal P、Prot Comp等预测程序对褐环乳牛肝菌中18 303条蛋白质序列进行分泌蛋白找寻,明确其含有327个分泌蛋白,同时,对上述分泌蛋白的氨基酸大小分布、信号肽长度、信号肽切割位点等进行分析,明确该菌分泌蛋白的氨基酸长度集中于51~450 aa,信号肽长度以17~21 aa的序列最为集中,其信号肽切割位点均属于A-X-A类型。通过上述生物信息学分析方法有效地实现了褐环乳牛肝菌分泌蛋白的预测,分泌蛋白的信号肽切割位点类型与其他已经报道的致病疫霉、粗糙脉孢霉、禾谷炭疽菌等分泌蛋白信号肽切割位点一致。研究结果为进一步解析分泌蛋白在该菌为宿主植物提供营养过程中发挥的作用机制提供重要的理论支持。

关键词：褐环乳牛肝菌全基因组分泌蛋白信号肽预测程序

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管氏肿腿蜂感染Wolbachia的分子检测

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西南林业大学学报（自然科学） 2016年第3期36卷 169-173页

作者：黄镜梅刘乃勇许小露李丽芳杨斌朱家颖西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

Wolbachia是一类在节肢动物中广泛感染的胞内共生菌,为了解Wolbachia在管氏肿腿蜂体内的感染情况,采用Wolbachia的通用引物、A大组特异性引物和B大组特异性引物对管氏肿腿蜂体内Wolbachia的wsp基因进行PCR扩增及序列测定,所获得的基因... 详细信息

Wolbachia是一类在节肢动物中广泛感染的胞内共生菌,为了解Wolbachia在管氏肿腿蜂体内的感染情况,采用Wolbachia的通用引物、A大组特异性引物和B大组特异性引物对管氏肿腿蜂体内Wolbachia的wsp基因进行PCR扩增及序列测定,所获得的基因片段分别命名为w Sgu、wSgu A和wSguB,长度分别为620、572 bp和463 bp。基因序列分析表明wSgu与wSguB序列间碱基差异较大,同源性仅为60%。系统发育分析表明该寄生蜂感染了A大组的Wolbachia,但对于该寄生蜂是否也感染了B大组的Wolbachia尚待确定。

关键词：管氏肿腿蜂 Wolbachia wsp基因 PCR 序列分析

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