检索结果-内蒙古大学图书馆

湖北农业科学 2023年第5期62卷 66-72页

作者：张威祁进康李晋芳胡世俊闫晓慧西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650233 西南林业大学林学院/西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室昆明650233

为探究入侵植物薇甘菊(Mikania micrantha H.B.K)化学成分的抑菌作用,采用硅胶柱层析、Sephadex LH-20凝胶柱层析色谱法,从薇甘菊地上部分乙酸乙酯萃取物中分离得到5个化合物,根据1H NMR、13C NMR、MS波谱数据,分别鉴定为豆甾醇(1)、薇... 详细信息

为探究入侵植物薇甘菊(Mikania micrantha H.B.K)化学成分的抑菌作用,采用硅胶柱层析、Sephadex LH-20凝胶柱层析色谱法,从薇甘菊地上部分乙酸乙酯萃取物中分离得到5个化合物,根据1H NMR、13C NMR、MS波谱数据,分别鉴定为豆甾醇(1)、薇甘菊内酯(2)、去氧薇甘菊内酯(3)、异泽兰素(4)和泽兰黄酮(5)。采用平皿法测定了薇甘菊甲醇提取物、不同溶剂萃取物及分离得到的化合物对6种核桃病原真菌菌丝生长的抑制活性。结果表明,薇甘菊乙酸乙酯萃取物对炭疽菌、正丁醇萃取物对叶点霉的菌丝生长有较强的抑制作用,EC50分别为1.25000 mg/mL和1.66000 mg/mL;化合物2和化合物3对拟茎点霉和壳梭孢菌丝生长抑制率均显著高于其他化合物,化合物2和化合物3对拟茎点霉的EC50分别为60.62μg/mL和89.13μg/mL,对壳梭孢的EC50分别为43.65μg/mL和61.66μg/mL。

关键词：入侵植物薇甘菊(Mikania micrantha H.B.K) 化学成分核桃抑菌活性

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真菌中G蛋白信号调控因子蛋白类型与其理化性质的关系

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微生物学报 2021年第1期61卷 195-205页

作者：祝友朋韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 西南林业大学研究生院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

【目的】G蛋白信号调控因子(RGS)作为G蛋白信号转导途径的负调控因子,在植物病原菌的致病性和有性生殖调控方面发挥着重要作用。研究真菌中RGS蛋白类型与其理化性质及特征的关系,为今后深入开展不同真菌中具有不同类别RGS的功能解析打... 详细信息

【目的】G蛋白信号调控因子(RGS)作为G蛋白信号转导途径的负调控因子,在植物病原菌的致病性和有性生殖调控方面发挥着重要作用。研究真菌中RGS蛋白类型与其理化性质及特征的关系,为今后深入开展不同真菌中具有不同类别RGS的功能解析打下坚实的理论基础。【方法】前期对模式生物、病原菌、非致病菌等49个真菌中229个RGS蛋白序列进行找寻,并根据其保守结构域和同源性确定RGS类型有DEP-RGS、RGS-TM、PXA-RGS-PX、RGS、RGS-PAS-PAC、TM-RGS等6类。利用蛋白质数据库、ProtComp v9.0、PHD以及MEME等网站对上述RGS蛋白进行理化性质、亚细胞定位以及二级结构、基序等特征分析。【结果】上述不同类别的RGS蛋白具有明显的类别特征性,同时,也具有以下共同特征:理论等电点集中在6.01–7.00;不稳定性系数集中在40.01–60.00;95%以上的RGS蛋白属于亲水性蛋白;亲水性最强氨基酸残基存在较多的是R、D、E、Q、N;疏水性最强氨基酸残基存在较多的L、A、V、F、I;二级结构组成特征为b折叠较少;转运肽情况尚未明确;亚细胞定位多集中在细胞核。【结论】真菌中6类RGS蛋白的理化性质具有一定的共同特征,但不同类别的RGS蛋白也具有明显的类别特征,主要表现在保守结构域、二级结构、等电点、转运肽和亚细胞定位情况。

关键词：真菌 G蛋白信号调控因子理化性质关系解析生物信息学

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植物病原丝状真菌RGS的研究进展

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北京林业大学学报 2021年第4期43卷 150-157页

作者：韩长志祝友朋西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224 西南林业大学研究生院云南昆明650224

G蛋白信号调控因子(RGS)作为G蛋白信号途径中发挥重要的负调控作用的蛋白,其功能主要表现影响真菌菌丝生长、产孢等发育阶段,以及次生代谢产物、色素合成等致病性方面。近些年,随着学术界对于植物病原丝状真菌RGS蛋白研究的不断深入,产... 详细信息

G蛋白信号调控因子(RGS)作为G蛋白信号途径中发挥重要的负调控作用的蛋白,其功能主要表现影响真菌菌丝生长、产孢等发育阶段,以及次生代谢产物、色素合成等致病性方面。近些年,随着学术界对于植物病原丝状真菌RGS蛋白研究的不断深入,产生了大量的学术报道,然而,尚缺乏对模式真菌与植物病原丝状真菌中RGS蛋白系统性对比分析的研究报道。该文对模式真菌与植物病原丝状真菌RGS蛋白的结构、分类进行综述,并通过SMART保守结构域、二级结构组成情况以及遗传关系分析,明确了植物病原丝状真菌与模式真菌中的RGS蛋白均具有保守的RGS结构域以及相似的二级结构组成情况,以及根据RGS蛋白的序列同源性,明确真菌中RGS蛋白可分为6大类,具有不同结构域的RGS蛋白分别聚类。同时,对不同真菌中RGS蛋白功能进行综述,明确植物病原丝状真菌中RGS的数量和类型均多于模式真菌,RGS蛋白功能具有保守性和独特性特征。为今后学术界进一步开展植物病原丝状真菌中RGS蛋白的作用机制解析,以及植物病原丝状真菌与其他模式真菌中RGS蛋白之间的关系解析提供理论基础。

关键词：丝状真菌 RGS 结构域功能综述

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禾谷炭疽菌中内吞相关蛋白找寻及特征解析

禾谷炭疽菌中内吞相关蛋白找寻及特征解析

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中国植物病理学会2023年学术年会

作者：张凯强韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

受体介导的内吞作用(receptor-mediated endocytosis)为诸多生物体内大多数细胞与环境相互作用的重要途径,通过内吞相关蛋白作用,实现对于特定生物大分子的摄取。此前研究人员对于模式真菌(酿酒酵母、构巢曲霉等)中的内吞作用相关蛋白... 详细信息

受体介导的内吞作用(receptor-mediated endocytosis)为诸多生物体内大多数细胞与环境相互作用的重要途径,通过内吞相关蛋白作用,实现对于特定生物大分子的摄取。此前研究人员对于模式真菌(酿酒酵母、构巢曲霉等)中的内吞作用相关蛋白展开了诸多研究工作,明确含有NPFxD基序以及DPFxD基序的蛋白,且上述基序蛋白通常参与内吞靶向信号过程。植物病原丝状真菌内吞过程与菌丝细胞的生长、分化以及发育等关系密切。禾谷炭疽菌[Colletotrichum graminicola(Cesati) Wilson]是一种半活体营养型植物病原丝状真菌,可以侵染玉米、小麦、高粱等禾本科植物而引起炭疽病,给世界各国农业生产造成巨大的经济损失。该病菌作为研究炭疽菌属真菌的重要模式生物,在开展其他植物病原炭疽菌研究方面具有重要的指导意义。目前学术界对于植物病原丝状真菌中致病基因的研究报道较多,对于生长发育过程中DPFxD基序蛋白的报道较为少见,且国内外学者对禾谷炭疽菌中存在具有DPFxD基序的蛋白情况尚未见学术报道,影响着以生长发育过程作为靶标蛋白的新型农药的开发利用工作。本研究基于构巢曲霉DPFxD蛋白序列,通过Blastp比对分析和关键词搜索,一是明确***中存在48个DPFxD蛋白序列;二是通过在线分析软件SMART、ProtComp v9.0等,明确其保守结构域、信号肽、蛋白质二级结构、疏水性、遗传关系等情况;三是测定出有多条与DPFxD基序蛋白预测功能相同的蛋白质序列;四是通过遗传关系分析,明确禾谷炭疽菌DPFxD基序蛋白与炭疽菌属中的***、***、***等病菌有较高的同源性和较近的亲缘关系等。以上这些成果为深入研究其他炭疽菌属真菌DPFxD基序蛋白提供有益的参考价值。为进一步探究DPFxD蛋白功能奠定理论基础,也为其他炭疽菌内吞作用蛋白研究提供重要的理论指导。

关键词：内吞作用禾谷炭疽菌 DPFxD 炭疽菌属生物信息学

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基于BioMod2组合模型下草地贪夜蛾在云南省的适宜生境分布变化研究

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南方农业学报 2023年第12期54卷 3571-3580页

作者：袁煜林吕建平潘嫦艳廖周洋侯墨林邓忠坚张媛西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224 云南省植保植检站云南昆明650034 陆良县植保植检站云南曲靖655600

【目的】研究气候变化背景下草地贪夜蛾在云南省的生境分布变化,旨在为农业部门开展草地贪夜蛾的防控和监测提供科学参考。【方法】通过系统收集草地贪夜蛾在云南省的分布点,并结合野外调查数据,利用BioMod2组合模型和ArcGIS 10.7,模拟... 详细信息

【目的】研究气候变化背景下草地贪夜蛾在云南省的生境分布变化,旨在为农业部门开展草地贪夜蛾的防控和监测提供科学参考。【方法】通过系统收集草地贪夜蛾在云南省的分布点,并结合野外调查数据,利用BioMod2组合模型和ArcGIS 10.7,模拟草地贪夜蛾在当前和未来气候条件下的潜在生境分布变化。【结果】将9种物种分布模型进行组合,得到组合模型AUC、TSS和Kappa均值分别为0.994、0.980和0.943,其中,广义线性模型(GBM)、广义增强模型(GLM)、随机森林(RF)和人工神经元网络(ANN)是预测草地贪夜蛾生境分布的最优模型,表现最差的模型是表面分布区分室模型(SRE),未能通过模型精度检验。影响草地贪夜蛾分布的4个重要环境变量因子为坡度、海拔、年均气温和最高气温。当前时期草地贪夜蛾在云南省的适生生境面积为32.94万km2,占云南省总面积的83.61%。在未来气候模拟条件下,适生区面积扩张,尤其是低适生区和高适生区面积明显扩张,扩张均值分别为27.84%和12.80%;非适生区和中适生区面积减少,下降均值分别为19.69%和32.92%。【结论】基于气候变化大背景下的预测结果显示,草地贪夜蛾在云南省的适生区面积明显扩张,非适生区面积收缩,适生区有向高海拔和高纬度地区扩散的趋势,气候变化导致虫害的风险增大,应密切监控虫灾严重区域及新发地的虫情发展。

关键词：草地贪夜蛾 BioMod2组合模型生境分布变化风险防控

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希金斯疽菌中糖苷水解酶互作蛋白找寻及分析

希金斯疽菌中糖苷水解酶互作蛋白找寻及分析

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中国植物病理学会2023年学术年会

作者：尹青晓韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum)又称希金斯刺盘孢,属子囊菌门刺盘孢属真菌。该病菌主要危害小油菜、萝卜、大白菜、菜心、花椰菜、羽衣甘蓝等十字花科蔬菜,严重影响了农作物的生产,造成严重的经济损失。糖苷水解酶(GH)是病... 详细信息

希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum)又称希金斯刺盘孢,属子囊菌门刺盘孢属真菌。该病菌主要危害小油菜、萝卜、大白菜、菜心、花椰菜、羽衣甘蓝等十字花科蔬菜,严重影响了农作物的生产,造成严重的经济损失。糖苷水解酶(GH)是病原菌侵染植物打破细胞壁屏障的一种重要酶类,对希金斯炭疽菌各类GH亚家族之间的蛋白互作进行分析,有利于加强对希金斯炭疽菌侵染植物过程中GH协同作用机制更深一步的了解,可为希金斯炭疽菌的防治提供理论依据。然而,尚未见有关希金斯炭疽菌中糖苷水解酶蛋白互作分析的相关研究报道。为了更好地解析希金斯炭疽菌中GH蛋白协同作用关系,本研究基于前期筛选的该菌中75个GH蛋白,通过STRING、ProtComp v9.0等在线分析程序对上述蛋白的互作关系及亚细胞定位进行分析,并采用MEGA7.0软件进行序列比对,构建系统进化树。结果显示,希金斯炭疽菌75个GH蛋白之间的互作主要表现为同一GH亚家族蛋白之间的互作,不同GH亚家族蛋白之间的互作,以及单独的蛋白不参与互作等三类互作情况。其中,GH3与GH7蛋白之间的互作关系较为密切,但其亲缘关系较远;GH28家族中的蛋白主要为同一家族内的蛋白互作关系,且蛋白的亲缘关系相近。H1VKY1与H1VPT7蛋白属于不同GH亚家族,但其亚细胞定位于质膜,且都是单独的蛋白并不参与蛋白之间的互作,H1W0U5蛋白则定位于细胞核,H1W3J7与H1V4B7蛋白定位于内质网,均不参与蛋白互作,其他蛋白均分泌于胞外。该研究为深入解析希金斯炭疽菌GH蛋白之间的互作机制提供重要的参考,也对该菌的防治作用靶标找寻具有重要的意义。

关键词：希金斯炭疽菌蛋白互作亚细胞定位遗传关系

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基于COⅠ基因标记的云南人工养殖金环胡蜂遗传多样性分析

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西南农业学报 2022年第6期35卷 1470-1476页

作者：刘鑫阳宋忠云杨晨和秋菊易传辉朱恩骄西南林业大学生物多样性保护学院昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224 西南林业大学云南生物多样性研究院昆明650224 云南林业职业技术学院昆明650224

【目的】了解云南人工养殖金环胡蜂Vespa mandarinia的遗传多样性状况,为科学人工养殖和危害防控提供依据。【方法】基于mtDNACOⅠ基因标记,对云南省金环胡蜂8个主要人工养殖区237个人工养殖个体的mtDNACOⅠ基因进行了测定,分析了群体... 详细信息

【目的】了解云南人工养殖金环胡蜂Vespa mandarinia的遗传多样性状况,为科学人工养殖和危害防控提供依据。【方法】基于mtDNACOⅠ基因标记,对云南省金环胡蜂8个主要人工养殖区237个人工养殖个体的mtDNACOⅠ基因进行了测定,分析了群体的遗传多样性、遗传结构和遗传分化情况。【结果】共获得金环胡蜂mtDNACOⅠ基因600 bp编码区序列,其中A+T的含量为68.05%,存在明显的AT碱基偏向性;有保守位点563个,变异位点37个,占分析位点总数的6.16%;变异位点中,有30个转换位点,7个颠换位点,无插入或缺失;共获得12个单倍型,其中6个单倍型为群体间共享,其余6个为不同群体独有单倍型;整体单倍型多样性(Hd)为0.82958,核苷酸平均差异数(K)为15.18387,核苷酸多样性(Pi)为0.02526;各养殖种群内部遗传距离在0.00~0.0283,种群间遗传距离在0.0001~0.0544;遗传变异50.48%来源种群间,49.52%来源于种群内,表明遗传变异主要来源于种群外部;F_(st)=0.50482,差异较显著(P<0.001),表明种群间遗传分化较大;COⅠ基因单倍型主要有2个聚类簇,多数单倍型之间只有1个位点突变。【结论】云南各地区养殖金环胡蜂种群单倍型多样性较高,核苷酸多样性较低;原始种群来源于少数个体,养殖过程中与当地野生自然种群或外地引入种群进行了基因交流,各种群遗传多样性存在差异。建议养殖种群尽量使用当地土著种源;严防外地引入种源养殖个体逃逸后与野生种群杂交,造成当地成野生种群遗传多样性提高,从而增加种群的适应能力,导致种群的快速扩张,避免对当地生物多样性特别是授粉昆虫造成的影响。

关键词：金环胡蜂 COⅠ基因遗传多样性遗传分化养殖种群

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炭疽属真菌GH12蛋白找寻及生物信息学分析

炭疽属真菌GH12蛋白找寻及生物信息学分析

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中国植物病理学会2023年学术年会

作者：薄淑文韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

炭疽属(Colletotrichum)真菌是一类主要危害农林植物的病原真菌,广泛分布于热带、亚热带和温带地区,其寄主种类繁多,可以侵染各种农作物、花卉、林木等。碳水化合物活性酶(Carbohydrate-Active enzymes,CAZymes)参与降解寄主植物细胞壁... 详细信息

炭疽属(Colletotrichum)真菌是一类主要危害农林植物的病原真菌,广泛分布于热带、亚热带和温带地区,其寄主种类繁多,可以侵染各种农作物、花卉、林木等。碳水化合物活性酶(Carbohydrate-Active enzymes,CAZymes)参与降解寄主植物细胞壁,促进病原菌在寄主植物细胞中附着、侵入、定殖等过程。糖苷水解酶(Glycoside hydrolases,GH)作为碳水化合物活性酶(CAZymes)中的一类蛋白,在实现植物病原真菌侵染植物过程中发挥着非常重要的作用。糖苷水解酶(GH)家族具有诸多亚家族,糖苷水解酶12 (GH12)家族具有内切纤维素酶、木葡聚糖酶、β-1,3-1,4-葡聚糖酶活性,为典型的多功能糖苷水解酶家族。本研究通过NCBI数据库共获得146条炭疽属真菌GH12蛋白序列,采用SienalP v6.0、PrtComp v9.0、TMHMM v2.0、Protscale、PHD等在线分析程序对氨基酸序列的信号肽、亚细胞定位、跨膜结构域、疏水性、等电点等性质进行预测分析。结果显示,在146条GH12蛋白序列中,有93条在N端含有典型的信号肽序列;有38条分泌至胞外,剩余108条分别定位细胞膜外,细胞质膜、高尔基体、溶酶体、细胞核、线粒体中;有123条不含有跨膜结构域,剩余23条含有1个及以上的跨膜结构域;有26条预测为亲水性,120条预测为疏水性;146条均含有无规则卷曲、α螺旋、β折叠,部分含有TM helix (跨膜螺旋);且大部分属于酸性蛋白;大多数GH12蛋白序列的脂肪族氨基酸指数在60～85范围内,有140条不稳定系数小于40,预测为稳定性蛋白,剩余6条预测为非稳定性蛋白;分析发现,有些GH12蛋白序列并不符合分泌蛋白的特征。对炭疽属GH12蛋白进行预测分析,以期为深入研究炭疽菌属真菌不同的寄主范围、致病机制以及GH12的互作机制打下坚实的理论基础。

关键词：炭疽属 GH12 生物信息学糖苷水解酶

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草地贪夜蛾CRAL_TRIO结构域基因家族的基因组鉴定及其表达特征分析

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植物保护学报 2021年第6期48卷 1262-1272页

作者：肖开然桂富荣朱家颖西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224 云南农业大学云南省高原特色农业产业研究院昆明650201

为明确重大入侵性害虫草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda CRAL_TRIO结构域基因的功能,利用同源比对法鉴定该害虫基因组中的CRAL_TRIO结构域基因,利用系统进化树和基因染色体定位探究其进化关系,使用数字基因表达谱分析其在不同发育阶段... 详细信息

为明确重大入侵性害虫草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda CRAL_TRIO结构域基因的功能,利用同源比对法鉴定该害虫基因组中的CRAL_TRIO结构域基因,利用系统进化树和基因染色体定位探究其进化关系,使用数字基因表达谱分析其在不同发育阶段的表达情况,并采用反转录PCR技术分析19个CRAL_TRIO结构域基因在雌雄成虫不同组织中的表达特征。结果显示,从草地贪夜蛾基因组中鉴定到46个CRAL_TRIO结构域基因,所编码的氨基酸序列存在典型CRAL_TRIO结构域,且该结构域中有8个保守的氨基酸位点。系统进化树和基因染色体定位分析表明,多数草地贪夜蛾CRAL_TRIO结构域基因通过基因复制进化而来。基因表达谱分析发现,草地贪夜蛾CRAL_TRIO结构域基因在不同发育阶段的表达可聚为2组,其中一组在幼虫前期高表达,另一组在6龄幼虫期、蛹期和成虫期高表达。挑选验证的CRAL_TRIO结构域基因大部分在触角和脑中高表达,有2个基因在触角中特异性表达,部分在复眼中具有较高的表达量,表明这些CRAL_TRIO结构域基因在草地贪夜蛾嗅觉和视觉行为调控中起重要作用。

关键词：草地贪夜蛾 CRAL_TRIO结构域基因基因重复表达特征

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樟叶总木脂素提取工艺及其抑菌活性研究

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中国农业科技导报 2024年第5期26卷 138-147页

作者：张岚雄郑威陈源桉沈婧邹双全伍建榕倪林西南林业大学生物多样性保护学院云南省高校森林灾害预警控制重点实验室昆明650224 福建农林大学自然生物资源保育利用福建省高校工程研究中心福州350002 福建农林大学植物保护学院福州350002

为研究樟叶总木脂素的最佳回流提取工艺及抑菌活性,以樟叶为研究对象,测定其芝麻素和9-羟基芝麻素含量,通过单因素联合Box-Behnken响应面法对樟叶总木脂素回流提取工艺进行优化,并采用带毒平板法对总木脂素的抑菌活性进行评价。结果表明... 详细信息

为研究樟叶总木脂素的最佳回流提取工艺及抑菌活性,以樟叶为研究对象,测定其芝麻素和9-羟基芝麻素含量,通过单因素联合Box-Behnken响应面法对樟叶总木脂素回流提取工艺进行优化,并采用带毒平板法对总木脂素的抑菌活性进行评价。结果表明,回流提取最佳工艺条件为提取温度86℃、料液比1∶8.39(g·mL^(-1))、提取时间43 min、提取溶剂为无水乙醇,在此条件下木脂素提取率达0.3804%。各因素对提取率的影响表现为提取温度>提取时间>料液比。抑菌活性试验表明,木脂素含量为2 mg·mL^(-1)时对链孢粘帚霉菌(Gliocladium catenulatum)、苹果黑腐皮壳菌(Valsa mali Miyabe et Yamada)、西瓜尖孢镰孢菌(Fusarium oxysporumf)和瓜果腐霉菌(Pythium aphanidermatum)的抑菌效果最佳,抑菌率均达到50%以上;有效中质量浓度(EC50)分别为1.238、1.280、1.486和0.419 mg·mL^(-1)。以上研究结果为樟叶开发利用及植物源农药研究及开发提供了理论参考。

关键词：樟木脂素响应面法抑菌活性毒力

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