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河南师范大学学报（自然科学版） 2017年第3期45卷 48-52页

作者：韩长志许僖西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

禾谷炭疽菌侵染玉米、小麦等农作物引起的炭疽病,给各国农业生产造成了巨大的经济损失.基于前期研究结果,以267个碳水化合物酶类蛋白(CAZymes)序列为基础,对其进行理化性质分析,结果表明,近2/3的蛋白理论等电点小于6,属于酸性蛋白,同时... 详细信息

禾谷炭疽菌侵染玉米、小麦等农作物引起的炭疽病,给各国农业生产造成了巨大的经济损失.基于前期研究结果,以267个碳水化合物酶类蛋白(CAZymes)序列为基础,对其进行理化性质分析,结果表明,近2/3的蛋白理论等电点小于6,属于酸性蛋白,同时,通过随机数软件对上述蛋白进行10%抽样分析,明确了不同理论等电点类别的分泌蛋白所具有的分子质量、分子式、原子数量、半衰期、不稳定性系数、脂肪族氨基酸指数、总平均亲水性等性质.该研究为深入解析禾谷炭疽菌CAZymes蛋白的功能奠定了坚实的理论基础.

关键词：禾谷炭疽菌分泌蛋白理化性质预测程序

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植物病原丝状真菌分泌蛋白及CAZymes的研究进展

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南京林业大学学报(自然科学版) 2017年第5期41卷 152-160页

作者：韩长志许僖西南林业大学生物多样性保护与利用学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

为了明确对植物病原丝状真菌分泌蛋白及CAZymes进一步研究的方向,笔者对丝状真菌分泌蛋白及CAZymes基本特征、分类情况以及预测方法、功能等方面进行综述。基于前人对于植物病原丝状真菌分泌蛋白以及CAZymes的报道,通过文献计量分析方法... 详细信息

为了明确对植物病原丝状真菌分泌蛋白及CAZymes进一步研究的方向,笔者对丝状真菌分泌蛋白及CAZymes基本特征、分类情况以及预测方法、功能等方面进行综述。基于前人对于植物病原丝状真菌分泌蛋白以及CAZymes的报道,通过文献计量分析方法、SMART保守结构域和motif分析等方法,对丝状真菌分泌蛋白及CAZymes进行了综合分析,统计发现国内关于分泌蛋白的研究较多,对于CAZymes的研究报道较少,诸多分泌蛋白在病原菌侵染致病过程中发挥的功能如何尚未得到全面解析,有关CAZymes的研究也是如此,预测方法基本上是基于生物信息学分析,尚缺少有力的生物学试验验证证据。因此,今后研究需要进一步完善对于分泌蛋白及CAZymes预测的生物信息学分析工具或算法以及开展生物学试验验证;通过比较植物病原菌与生防菌之间CAZymes数量及功能差异,明确不同菌之间的共性与特性;此外,学术界应对丝状真菌中CAZymes的分类开展进一步细化研究,以及对比分析不同亚家族的分布情况,更好地解析CAZymes的功能。

关键词：丝状真菌碳水化合物活性酶(CAZymes) 分泌蛋白生物学功能

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古树名木资源科普旅游开发研究

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林业调查规划 2018年第1期43卷 156-159,190页

作者：古旭张瑞郭吉朋邓忠坚西南林业大学云南生物多样性研究院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224 西南林业大学林学院云南昆明650224 云南森林自然中心云南昆明650224

我国古树名木资源丰富,并且具有较高的景观、科研和历史价值,因而成为开发优质科普旅游的基础。文中对古树名木的科普价值和旅游资源潜力进行分析,并且以"树文化"为发展契机的贵州妥乐村、台湾科普旅游典范——溪头自然教育... 详细信息

我国古树名木资源丰富,并且具有较高的景观、科研和历史价值,因而成为开发优质科普旅游的基础。文中对古树名木的科普价值和旅游资源潜力进行分析,并且以"树文化"为发展契机的贵州妥乐村、台湾科普旅游典范——溪头自然教育园区以及面临开发与保护平衡的云南腾冲古银杏村为案例,分析了3个景区的成功要素和建设经验。在此基础上,对不同类型的古树名木资源分布区的科普旅游开发模式和景区建设进行了探讨。

关键词：古树名木科普旅游开发模式景区建设

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不同受害程度云南松树干挥发物成分分析及对云南切梢小蠹的影响

不同受害程度云南松树干挥发物成分分析及对云南切梢小蠹的影响

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中国昆虫学会2018年学术年会

作者：刘金林赵宁杨斌李宗波西南林业大学生物多样性保护与利用学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明 650224

云南切梢小蠹Tomicus yunnanensis 是以危害云南松为特征的一种毁灭性蛀干害虫，其初级引诱是寄主树木次生代谢物质诱发的嗅觉与行为敏感性协同调控的结果，但目前关于云南切梢小蠹寄主选择所利用的挥发性物质及其阶段性动态并不清楚。

关键词：云南切梢小蠹云南松树干挥发物指示性物质 GC-MS GC-EAD

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尖孢镰刀菌分泌蛋白的预测及其生物信息学分析

尖孢镰刀菌分泌蛋白的预测及其生物信息学分析

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第十三届全国青年植保科技创新学术研讨会暨全国植物保护博士后论坛

作者：祝友朋蔡旺芸韩长志西南林业大学生物多样性保护与利用学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

由尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)引起的豆科、葫芦科、茄科等100多种植物根腐病、茎腐病、茎基腐病等,严重影响着上述植物的健康生长,给生产生活造成了重大经济损失.***属于半知菌类真菌,是一种以土壤习居为主要特征的植物病原真菌,... 详细信息

由尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)引起的豆科、葫芦科、茄科等100多种植物根腐病、茎腐病、茎基腐病等,严重影响着上述植物的健康生长,给生产生活造成了重大经济损失.***属于半知菌类真菌,是一种以土壤习居为主要特征的植物病原真菌,广泛分布于世界各地.前人研究发现,***的主要致病机制在于侵染并破坏寄主植物的维管束组织,从而导致植物不能实现正常的营养和水分运输功能,引起植物根腐、茎腐、茎基腐等症状,严重时甚至造成植株萎蔫死亡,严重影响着植物的产量和品质.同时,前人研究表明,植物病原真菌、卵菌以及细菌中存在着大量的分泌蛋白,其在侵染植物的过程中发挥着重要的作用,不仅有助于实现其对植物的侵染、定殖和扩散,而且有助于形成对抗植物免疫防卫反应的效应分子、信号分子和诱饵蛋白.然而,对于尖孢镰刀菌的分泌蛋白尚未明确,因此本研究以全基因组序列中已经公布的尖孢镰刀菌菌株(*** ***4287)中的蛋白序列为基础数据,以真菌分泌蛋白所具有的特征(N-端含有信号肽、不含有跨膜结构域、没有GPI锚定位点、将蛋白分泌在胞外)为依据,利用SignalP v3.0、ProtCompB v9.0、TMHMM v2.0、big-PI Fungal predictor、TargetP v1.1等生物信息学分析程序筛选、获得分泌蛋白,同时,对其氨基酸组成及分布、信号肽长度大小、信号肽切割位点等特征进行分析,结果表明:尖孢镰刀菌中分泌蛋白数量为778个,其氨基酸长度多集中于101～400AA,所占比例为57.07％,氨基酸组成中以G(甘氨酸)最多,所占比例为9.20％;信号肽长度以16～21aa最多,所占比例为81.49％,信号肽氨基酸残基中以P(脯氨酸)最多,所占比例为9.12％;信号肽切割位点-3～3氨基酸组成中最多的分别是T(苏氨酸)、S(丝氨酸)、T、A(丙氨酸)、S、S,信号肽切割位点属于T-X-A类型,属于SPⅠ型信号肽识别位点,具有相对保守性特点.

关键词：植物病原菌尖孢镰刀菌分泌蛋白生物信息学

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全基因组预测希金斯炭疽菌中碳水化合物酶类蛋白

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江苏农业科学 2017年第2期45卷 24-28页

作者：韩长志西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

希金斯炭疽菌侵染菜心等十字花科植物引起的炭疽病,给各国农业生产造成了巨大的经济损失。基于前期研究结果,以658个分泌蛋白为基础序列,利用CAZymes Analysis Toolkit预测程序,分析上述蛋白中的碳水化合物酶类(CAZymes)蛋白,明确该菌... 详细信息

希金斯炭疽菌侵染菜心等十字花科植物引起的炭疽病,给各国农业生产造成了巨大的经济损失。基于前期研究结果,以658个分泌蛋白为基础序列,利用CAZymes Analysis Toolkit预测程序,分析上述蛋白中的碳水化合物酶类(CAZymes)蛋白,明确该菌中含有238个CAZymes,分为主要类别和复合类别2类,前者包括75个糖苷水解酶(GHs)、48个碳水化合物绑定结构(CBMs)、33个辅助酶类家族(AAs)、30个碳水化合物酯酶(CEs)、23个多糖裂解酶(PLs)、4个糖基转移酶(GTs),后者则包括17个GHs/CBMs、4个AAs/CBMs、4个CEs/CBMs等。研究结果可为深入开展该病菌侵染植物作用机制的研究提供一定的理论基础。

关键词：希金斯炭疽菌碳水化合物酶类蛋白预测程序全基因组预测

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全基因组预测褐环乳牛肝菌的分泌蛋白

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江苏农业科学 2017年第23期45卷 45-48页

作者：韩长志刘艳任雪敏西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

褐环乳牛肝菌作为针叶树种上重要的外生真菌,为宿主植物提供营养元素和水分,在此过程中,对于该菌分泌蛋白发挥的作用机制尚不清楚。利用Signal P、Prot Comp等预测程序对褐环乳牛肝菌中18 303条蛋白质序列进行分泌蛋白找寻,明确其含有32... 详细信息

褐环乳牛肝菌作为针叶树种上重要的外生真菌,为宿主植物提供营养元素和水分,在此过程中,对于该菌分泌蛋白发挥的作用机制尚不清楚。利用Signal P、Prot Comp等预测程序对褐环乳牛肝菌中18 303条蛋白质序列进行分泌蛋白找寻,明确其含有327个分泌蛋白,同时,对上述分泌蛋白的氨基酸大小分布、信号肽长度、信号肽切割位点等进行分析,明确该菌分泌蛋白的氨基酸长度集中于51~450 aa,信号肽长度以17~21 aa的序列最为集中,其信号肽切割位点均属于A-X-A类型。通过上述生物信息学分析方法有效地实现了褐环乳牛肝菌分泌蛋白的预测,分泌蛋白的信号肽切割位点类型与其他已经报道的致病疫霉、粗糙脉孢霉、禾谷炭疽菌等分泌蛋白信号肽切割位点一致。研究结果为进一步解析分泌蛋白在该菌为宿主植物提供营养过程中发挥的作用机制提供重要的理论支持。

关键词：褐环乳牛肝菌全基因组分泌蛋白信号肽预测程序

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云南无量山印支灰叶猴社会结构初步研究

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兽类学报 2017年第1期37卷 59-65页

作者：熊为国黄志旁尹龙云马驰罗旭崔亮伟范朋飞西南林业大学云南省森林灾害预警与防治重点实验室大理大学东喜马拉雅资源与环境研究所

乌叶猴属物种主要以一雄多雌的小群活动,其群体大小一般不超过20只。泰国东北部的印支灰叶猴生活在一雄多雌或多雄多雌群的小群中,而云南无量山的印支灰叶猴却生活在多雄多雌的大群中,有些群大小超过100只,但是对无量山印支灰叶猴的社... 详细信息

乌叶猴属物种主要以一雄多雌的小群活动,其群体大小一般不超过20只。泰国东北部的印支灰叶猴生活在一雄多雌或多雄多雌群的小群中,而云南无量山的印支灰叶猴却生活在多雄多雌的大群中,有些群大小超过100只,但是对无量山印支灰叶猴的社会结构缺乏研究。2012年9月至2015年7月,在云南无量山国家级自然保护区大寨子片区开展一群习惯化印支灰叶猴的社会结构研究。采用10 min间隔的焦点动物瞬时记录法,记录焦点成年雄性5 m范围内不同性别年龄个体的数量。观察期间共有594次准确识别焦点雄性5 m范围内其它个体年龄性别的有效数据(至少有1只其他个体)。其中,焦点雄性周围出现其它成年雄性的几率为44.2%,数量为(0.62±0.85)只;同时出现成年雄性和成年雌性的几率是32.5%。取食时焦点雄性周围出现其它雄性的比例(60.0%)和数量(平均0.93只)都大于休息和移动时,数量最多为5只成年雄性。结果表明该群灰叶猴的社会结构不是由多个OMU和AMU组成的重层社会,而是多雄多雌的社会结构。无量山印支灰叶猴群内成年雄性间相互容忍度较高,个体的空间分布在取食时尤其密集,说明无量山印支灰叶猴的食物丰富(至少在某些季节),这也部分解释了为什么无量山印支灰叶猴能够生活在大群中。本文为进一步研究亚洲疣猴社会结构的多样性和进化提供了重要的基础资料。

关键词：印支灰叶猴社会结构多雄多雌无量山

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昆明市山茶炭疽病菌生物学特性研究

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中国森林病虫 2017年第2期36卷 26-28页

作者：韩长志赵惠谊西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

对山茶炭疽病菌Gloeosporium theae-sinensis Miyaka生物学特性进行研究。该病菌最适生长条件为PDA、28℃、p H7;能在多种碳源和氮源条件下生长,碳源以可溶性淀粉最适,氮源以蛋白胨最适。

关键词：茶炭疽盘长孢菌山茶炭疽病生物学特性昆明市

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油用牡丹主要真菌病害的发生与防治综述

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江苏农业科学 2017年第18期45卷 98-99,104页

作者：韩长志左安建刘云霞西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

油用牡丹是原产于中国的一种特有的生物资源,具有重要的观赏价值和油用价值。其花、籽均有丰富的营养成分,具有重要的开发利用价值。近些年,全国油用牡丹种植面积逐年扩大,真菌病害发生日益严重,严重影响着以油用牡丹花、籽为原料的后... 详细信息

油用牡丹是原产于中国的一种特有的生物资源,具有重要的观赏价值和油用价值。其花、籽均有丰富的营养成分,具有重要的开发利用价值。近些年,全国油用牡丹种植面积逐年扩大,真菌病害发生日益严重,严重影响着以油用牡丹花、籽为原料的后续产品的开发与利用。基于前人研究报道,对油用牡丹主要真菌病害的病原、危害症状、发病规律以及防治措施进行分析,为今后开展油用牡丹病害研究指明方向。

关键词：油用牡丹真菌病害发生情况防治措施展望

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