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热带作物学报 2024年第2期45卷 247-258页

作者：陈健鑫吴峰婧琳魏玉倩杨娅琳马焕成杨红玉伍建榕西南林业大学生物多样性保护学院/云南省高校森林灾害预警控制重点实验室云南昆明650224 西南林业大学林学院/西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室云南昆明650224 昆明学院农学与生命科学学院云南昆明650214

油茶(Camellia oleifera)是山茶科(Theaceae)的一种特有的油料植物,具有重要的观赏价值和经济价值,随着油茶的集约化种植,病虫害大量发生,加之良种选育滞后,严重制约着油茶产业的发展。INDETERMINATE DOMAIN(IDD)家族是高等植物中一类... 详细信息

油茶(Camellia oleifera)是山茶科(Theaceae)的一种特有的油料植物,具有重要的观赏价值和经济价值,随着油茶的集约化种植,病虫害大量发生,加之良种选育滞后,严重制约着油茶产业的发展。INDETERMINATE DOMAIN(IDD)家族是高等植物中一类保守的转录因子,通过介导植物内源激素进而调控植物的基础免疫反应。为鉴定油茶中IDD基因家族成员,本研究以油茶全基因组信息为参考,通过IDD基因家族保守结构域鉴定了29个油茶CoIDD基因家族成员,进一步明确了各基因的结构、理化性质、系统进化关系、亚细胞定位。通过RT-PCR克隆到1个与AtIDD4/5/6同源的CoIDD4基因,明确了其理化性质、表达模式及核定位信号,同时分析了其启动区顺式作用元件的类型。研究结果表明,29个CoIDD基因家族成员分为4个亚组,平均亲水系数均小于0,属于亲水性蛋白,且亚细胞定位均位于细胞核内;克隆到CoIDD4基因的全长ORF框包含1620bp碱基,编码539个氨基酸,主要在叶片和花器官中表达;该基因启动子区顺式作用元件主要是参与光响应和植物激素响应元件两大种类。综上所述,本研究在油茶中鉴定了29个IDD基因家族成员,其中CoIDD4基因与AtIDD4/5/6亲缘关系较近,推测其可能参与油茶激素信号转导和基础免疫反应调节等进程,为油茶IDD转录因子功能解析提供理论基础,也为油茶的抗性优良品种选育及分子育种提供参考依据。

关键词：油茶 IDD基因家族生物信息学分析植物激素抗性调控

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云南元阳梯田森林生态系统蚂蚁群落和分布格局研究

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四川农业大学学报 2022年第4期40卷 591-600,I0001-I0005页

作者：杨蕊和秋菊徐正会武必念都红张新民云南省森林灾害预警与控制重点实验室/西南林业大学生物多样性保护学院昆明650224

【目的】揭示梯田森林生态系统蚂蚁物种多样性与环境因素之间的相互关系。【方法】采用样地调查法研究云南元阳梯田森林生态系统蚂蚁群落和分布格局。【结果】合计记录蚁科昆虫10亚科47属101种,发现3个中国新记录种:母卫无刺蚁Kartidris... 详细信息

【目的】揭示梯田森林生态系统蚂蚁物种多样性与环境因素之间的相互关系。【方法】采用样地调查法研究云南元阳梯田森林生态系统蚂蚁群落和分布格局。【结果】合计记录蚁科昆虫10亚科47属101种,发现3个中国新记录种:母卫无刺蚁Kartidris matertera Bolton、平额大头蚁Pheidole planifrons Santschi和扎姆拟毛蚁Pseudolasius zamrood Akbar et al.。白足狡臭蚁Technomyrmex albipes(Smith)、黑头酸臭蚁Tapinoma melanocephalum(Fabricius)和近缘重头蚁Carebara affinis(Jerdon)是蚂蚁群落的优势种。蚂蚁群落主要指标随海拔升高出现多个峰值,主要受气温和人为干扰影响。不同海拔蚂蚁群落物种组成差异明显,大多数蚂蚁物种垂直分布范围狭窄,栖息生境、觅食场所和筑巢场所有限,在环境中表现出脆弱性。【结论】元阳梯田森林生态系统对维持蚂蚁物种多样性具有重要作用,不同海拔高度上蚂蚁群落具有差异性的生态功能和保护价值。受人为干扰影响,一些海拔高度上的蚂蚁群落稳定性降低,多数蚂蚁物种栖息生境有限并表现出脆弱性,需加强森林植被的保护以更好维持森林-梯田生态系统及其生物多样性活力。

关键词：蚁科生物多样性群落分布格局梯田森林生态系统

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禾谷炭疽菌中候选G蛋白偶联受体蛋白的找寻

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科学技术与工程 2022年第1期22卷 103-109页

作者：喻红稠韩长志西南林业大学生物多样性保护学院昆明650224 西南林业大学生物多样性保护学院昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR)是生物中一类具有典型七跨膜结构域的重要细胞表面受体,对细胞信号转导过程具有重要作用.禾谷炭疽菌严重危害着玉米、高粱等禾本科植物的产业发展,然而,对于该菌中GPCR蛋白数量及功能尚... 详细信息

G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR)是生物中一类具有典型七跨膜结构域的重要细胞表面受体,对细胞信号转导过程具有重要作用.禾谷炭疽菌严重危害着玉米、高粱等禾本科植物的产业发展,然而,对于该菌中GPCR蛋白数量及功能尚未有系统性报道.基于典型GPCR蛋白序列所具有的七跨膜保守结构域特征,通过TMHMM、Philius和TOPCONS 3种常用软件进行在线分析,明确全部蛋白的预测功能与蛋白数量、跨膜结构域数量与蛋白数量、氨基酸序列长度与蛋白数量之间的关系.结果表明,禾谷炭疽菌中含有243个具有七跨膜结构域蛋白(涉及含有7个跨膜结构域但不含有信号肽序列蛋白或者含有信号肽序列的具有8个跨膜结构域的蛋白),进一步通过SMART保守结构域分析,可知该菌中存在220个候选GPCR蛋白.该研究为进一步开展禾谷炭疽菌候选GPCR蛋白的理化性质解析提供了重要的数据支撑,也为进一步明确GPCR蛋白及其功能的研究奠定重要的理论基础.

关键词：禾谷炭疽菌七跨膜结构域候选GPCR 生物信息学

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四川鞍子河国家级自然保护区及邻近地区蚁科昆虫区系分析

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四川动物 2022年第1期41卷 99-106页

作者：陈超和秋菊徐正会郭宁妍钱怡顺张新民西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

为揭示四川鞍子河国家级自然保护区及邻近地区蚂蚁区系特征,2016年6—7月采用样地调查法研究了该区域的蚂蚁区系。结果显示:共采集蚂蚁6亚科32属62种;在世界动物地理界中,分布于东洋界的共32属,东洋界分布种最多(62种),新热带界种最少(3... 详细信息

为揭示四川鞍子河国家级自然保护区及邻近地区蚂蚁区系特征,2016年6—7月采用样地调查法研究了该区域的蚂蚁区系。结果显示:共采集蚂蚁6亚科32属62种;在世界动物地理界中,分布于东洋界的共32属,东洋界分布种最多(62种),新热带界种最少(3种);在中国动物地理区中,西南区种最多(62种),蒙新区种最少(4种);在种的分布型中,东洋-古北界共有种最丰富(36种,58.1%),东洋-古北-新北界共有种等3个分布型物种贫乏(1种,1.6%)。保护区及邻近地区蚂蚁区系具有东洋界向古北界过渡的特征,同时具有西南区、华南区、华中区、华北区成分汇聚特点,具有典型西南区特征。

关键词：鞍子河国家级自然保护区蚁科昆虫区系四川

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小麦不同营养型病原真菌的候选GPCR蛋白预测及对比研究

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西南农业学报 2023年第5期36卷 952-957页

作者：夏雄飞张凯强任文来韩长志西南林业大学生物多样性保护学院昆明650224 文安县农业农村局河北文安065800 云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

【目的】通过对小麦3种不同营养型病原真菌的候选GPCR蛋白进行找寻及性质对比分析,为进一步找寻新型农药作用靶标奠定理论基础。【方法】选择已经公布全基因组序列的3种小麦营养型病原真菌,基于GPCR蛋白所具有的7重跨膜结构典型特征,利... 详细信息

【目的】通过对小麦3种不同营养型病原真菌的候选GPCR蛋白进行找寻及性质对比分析,为进一步找寻新型农药作用靶标奠定理论基础。【方法】选择已经公布全基因组序列的3种小麦营养型病原真菌,基于GPCR蛋白所具有的7重跨膜结构典型特征,利用3种蛋白跨膜在线预测程序(TOPCONS、TMHMM、Philius)对上述病原真菌的候选GPCR蛋白开展找寻,以及候选GPCR蛋白序列长度、理论等电点、不稳定系数、最强亲(疏)水性残基等特征和遗传关系进行对比分析。【结果】小麦白粉病菌、叶枯病菌、叶斑病菌中分别含有候选GPCR蛋白11、32、69个,蛋白序列平均长度为396 aa。蛋白的理论等电点平均值在8.78左右,不稳定系数在40左右,亲水性在-2.70左右,疏水性在3.20左右,而最强亲(疏)水性氨基酸残基分布不一致。上述112个候选GPCR蛋白按遗传关系聚为三大类,分别具有71、36、5个蛋白。【结论】小麦不同营养型病原真菌的候选GPCR蛋白数量以活体型真菌数量最少,死体型真菌数量最多,半活体型真菌介于两者之间。不同候选GPCR蛋白在理论等电点、不稳定系数等理化性质及遗传关系等方面具有一定同质性特征,然而最强亲(疏)水性氨基酸残基具有较大差异。

关键词：小麦白粉病菌叶枯病菌叶斑病菌 GPCR蛋白

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四川大凉山中部蚁科昆虫分布格局研究

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扬州大学学报（农业与生命科学版） 2022年第2期43卷 111-120页

作者：钱怡顺陈超祁彪郭宁妍徐正会张新民西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

为揭示四川大凉山地区蚁科昆虫的分布规律,采用样地调查法研究大凉山中部蚁科昆虫的分布格局,共发现蚂蚁6个亚科44个属115个种(包括11个待定种)。结果表明:大多数蚂蚁对生境的选择范围较窄,仅在1~2类生境中栖息,其物种丰富度由高到低依... 详细信息

为揭示四川大凉山地区蚁科昆虫的分布规律,采用样地调查法研究大凉山中部蚁科昆虫的分布格局,共发现蚂蚁6个亚科44个属115个种(包括11个待定种)。结果表明:大多数蚂蚁对生境的选择范围较窄,仅在1~2类生境中栖息,其物种丰富度由高到低依次为针阔混交林、云南松林、针叶林、阔叶林、竹林或稀树灌丛,说明生境的复杂性与蚁科昆虫丰富度呈正相关关系;凯氏盘腹蚁(Aphaenogaster caeciliae Viehmeyer)和尖毛拟立毛蚁[Paraparatrechina aseta(Forel)]是该地区垂直分布范围最广、生态适应幅度最宽的物种,其余大多数物种的垂直分布范围较窄,有些种类甚至仅栖息于某一海拔高度上;筑巢场所稳定性、食物资源丰富度及热量获取是影响蚂蚁选择觅食和筑巢场所的主要因素,地表和土壤内是蚂蚁觅食的主要场所,土壤内和石下是蚂蚁筑巢的主要场所。这一研究认为,蚁科昆虫分布格局主要与物种适应能力有关,同时受海拔、气候和植被类型的影响,复杂的植被类型拥有更丰富的蚁科昆虫。

关键词：蚁科分布格局觅食场所筑巢场所大凉山

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拟南芥对暹罗炭疽菌侵染的抗性响应机制

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植物病理学报 2023年第5期53卷 890-904页

作者：陈健鑫魏玉倩于德嘉李林倩徐晓东马焕成杨红玉伍建榕云南省高校森林灾害预警控制重点实验室西南林业大学生物多样性保护学院昆明650224 西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室西南林业大学林学院昆明650224 昆明学院农学与生命科学学院昆明650214

由暹罗炭疽菌(Colletotrichum siamense)引起的油茶炭疽病严重限制着云南省油茶产业的发展。为分析植物响应暹罗炭疽菌的侵染过程,本研究建立了暹罗炭疽菌--拟南芥的互作体系,并在接种3 d、5 d和7 d后进行转录组测序,筛选到差异表达基因... 详细信息

由暹罗炭疽菌(Colletotrichum siamense)引起的油茶炭疽病严重限制着云南省油茶产业的发展。为分析植物响应暹罗炭疽菌的侵染过程,本研究建立了暹罗炭疽菌--拟南芥的互作体系,并在接种3 d、5 d和7 d后进行转录组测序,筛选到差异表达基因是9 644个、11 583个和12 050个。差异表达基因分析及荧光定量PCR(qRT-PCR)结果显示,与茉莉酸/乙烯信号通路相关基因大部分呈上调表达,与水杨酸通路相关基因部分上调表达,与纤维素合成酶相关的基因则主要呈下调表达,与拟南芥激素信号转导途径及抗性反应相关的转录因子家族也被诱导表达。差异表达基因的KEGG功能注释结果表明,上调表达基因主要被注释到能量代谢、信号转导和环境适应3个主要通路中,下调表达的基因主要被注释到碳水化合物代谢、脂质代谢和翻译3个主要通路中。KEGG功能富集结果表明,上调表达的基因主要富集到植物--病原物互作、氧化磷酸化和MAPK信号通路中,下调表达的基因主要富集到角质、苏木和蜡的生物合成、DNA复制和戊糖和葡萄糖醛酸的相互转化的通路中。本研究通过转录组测序分析了拟南芥应对暹罗炭疽菌侵染的响应机制,结果表明拟南芥受到暹罗炭疽菌侵染后,主要通过调控茉莉酸/乙烯信号以及水杨酸信号转导通路,激活下游抗病基因以抵抗病原菌的侵染,为后续抗性育种及炭疽病的绿色防控提供了理论依据。

关键词：暹罗炭疽菌拟南芥转录组抗性响应

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油茶根腐病根际土壤和根系内细菌群落结构及多样性

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经济林研究 2023年第2期41卷 69-82页

作者：杨娅琳陈健鑫武自强刘丽张东华马焕成伍建榕西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224 西南林业大学林学院云南昆明650224 西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业和草原局重点实验室云南昆明650224

【目的】为鉴定根腐病潜在病原菌,改善土壤施肥制度,筛选油茶病害生防菌及研发防控药剂提供参考依据。【方法】采用16S rRNA基因Illumina Miseq高通量测序技术与PICRUSt功能预测相结合的方法,对5个病情等级下油茶根际土壤和根系内细菌... 详细信息

【目的】为鉴定根腐病潜在病原菌,改善土壤施肥制度,筛选油茶病害生防菌及研发防控药剂提供参考依据。【方法】采用16S rRNA基因Illumina Miseq高通量测序技术与PICRUSt功能预测相结合的方法,对5个病情等级下油茶根际土壤和根系内细菌群落结构和功能进行分析,并借助冗余分析等方法探讨土壤化学性质与细菌群落结构的关系。【结果】从油茶根际土壤和根系内共获得1707个OTU,分属于18门257属。患根腐病后,细菌的丰富度指数(Chao1)及均匀度指数(Ace)升高。相较于健康油茶,患病油茶土壤内酸杆菌门的丰度有不同程度的下降,变形菌门的丰度升高;根系内变形菌门的丰度随病情等级的上升,逐级升高。相较于健康油茶,患病油茶土壤内慢生根瘤菌属的丰度有不同程度的增加;根系内苯基杆菌属的丰度随着根腐病病情等级的上升逐级升高。油茶林土壤细菌群落结构的主要影响因子为土壤的pH值、有机质含量、速效磷含量、速效钾含量。发病情况较轻与发病情况较重的油茶根际土壤和根系内细菌群落结构差异较大。油茶根际土壤和根系内细菌以代谢功能为核心,患病导致油茶根系内碳水化合物代谢和氨基酸代谢功能丰度提高,根际土壤内碳水化合物代谢、能量代谢功能丰度下降。【结论】根际土壤和根系内细菌的群落丰富度、均匀度上升以及结构改变导致微生物群落功能失调,可能是造成油茶根腐病的原因之一。

关键词：油茶根腐病细菌多样性群落结构土壤化学性质 PICRUSt功能预测

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雅鲁藏布河谷上游及青藏高原西南坡蚂蚁物种多样性

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福建农林大学学报（自然科学版） 2022年第2期51卷 267-274页

作者：李彪熊忠平徐正会刘霞翟奖许国莲周雪英西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

为了揭示青藏高原腹地的蚂蚁物种多样性,采用样地调查法研究了雅鲁藏布河谷上游和青藏高原西南坡的蚂蚁群落.在雅鲁藏布河谷上游发现2亚科8属13种,蚂蚁群落的优势种为箭蚁待定种(Cataglyphis sp.)、光亮黑蚁(Formica candida Smith)和... 详细信息

为了揭示青藏高原腹地的蚂蚁物种多样性,采用样地调查法研究了雅鲁藏布河谷上游和青藏高原西南坡的蚂蚁群落.在雅鲁藏布河谷上游发现2亚科8属13种,蚂蚁群落的优势种为箭蚁待定种(Cataglyphis sp.)、光亮黑蚁(Formica candida Smith)和西藏盘腹蚁(Aphaenogaster tibetana Donisthorpe);在青藏高原西南坡发现2亚科8属15种,蚂蚁群落的优势种为光亮黑蚁、莱曼蚁(*** Bondroit)和科氏红蚁(Myrmica kozlovi Ruzsky).多样性分析表明,蚂蚁群落物种数目、个体密度、多样性指数随海拔升高出现2~3个峰值,呈现多域效应现象.相关性分析表明:多样性指数和均匀度指数均与乔木郁闭度、灌木盖度和地被物厚度呈极显著正相关关系;物种数目与乔木郁闭度和灌木盖度呈极显著正相关关系,与地被物厚度呈极显著负相关关系;优势度指数与海拔呈显著负相关关系,其余指标与海拔呈极显著负相关关系.相似性分析表明,雅鲁藏布河谷上游和青藏高原西南坡蚂蚁群落存在明显差异.可见,海拔和植被特征对蚂蚁物种多样性均有重要影响.

关键词：蚁科物种多样性群落垂直带青藏高原

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植物提取物对油茶炭疽菌的抑菌活性筛选

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中国生物防治学报 2022年第4期38卷 852-859页

作者：罗建梅张兴怡伍建榕刘丽洪英娣张东华闫晓慧云南省高校森林灾害预警控制重点实验室/西南林业大学生物多样性保护学院昆明650224 西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室/西南林业大学林学院昆明650224

为开发新型植物源农药,探究油茶炭疽病的生物防治方法,以油茶炭疽病菌(Colletotrichum fructicola)为供试病原菌,采用生长速率法测定了49种植物的70种提取物对油茶炭疽病菌的抑制作用,筛选出活性较好的提取物,并通过浓度梯度试验测定其... 详细信息

为开发新型植物源农药,探究油茶炭疽病的生物防治方法,以油茶炭疽病菌(Colletotrichum fructicola)为供试病原菌,采用生长速率法测定了49种植物的70种提取物对油茶炭疽病菌的抑制作用,筛选出活性较好的提取物,并通过浓度梯度试验测定其抑菌毒力。结果表明,在提取物浓度为1 mg/mL时,臭灵丹石油醚萃取物和益母草乙酸乙酯萃取物对油茶炭疽菌抑菌效果最好,抑制率分别为54.48%和50.75%,经毒力测定其有效中浓度(EC)分别为0.7013和0.6246 mg/mL。本研究为进一步利用臭灵丹、益母草开发植物源抑菌剂提供了一定的理论依据。

关键词：植物提取物生长速率法毒力油茶炭疽菌抑菌活性

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