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中国植物病理学会2019年学术年会

作者：官鑫向阳祝友朋韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

核桃根际土壤微生物群落多样性对于发挥土壤作用具有重要作用,然而,尚不明确核桃根际土壤微生物群落功能情况。因此,为了明确不同土层深度核桃根际土壤微生物群落多样性特征及其变化趋势,本研究采用Biolog-ECO板技术及高通量测序技术,... 详细信息

核桃根际土壤微生物群落多样性对于发挥土壤作用具有重要作用,然而,尚不明确核桃根际土壤微生物群落功能情况。因此,为了明确不同土层深度核桃根际土壤微生物群落多样性特征及其变化趋势,本研究采用Biolog-ECO板技术及高通量测序技术,对不同土层深度核桃根际土壤微生物群落多样性差异进行了比较。结果表明,不同土层土壤微生物群落功能多样性差异显著,土壤平均颜色变化率（AWCD）随培养时间延长而逐渐增加,不同土层土壤AWCD大小顺序为20～40 cm＞40～60 cm＞0～20 cm;同时,土壤微生物群落Shannon指数的总体趋势为20～40 cm＞0～20 cm＞40～60 cm。不同土层深度核桃根际土壤微生物群落均匀度指数和优势度指数之间差异不显著。不同土层深度核桃根际土壤微生物对不同碳源的利用能力存在差异,其中40～60 cm土层利用率最高,0～20 cm利用率最低,糖类、氨基酸类、羧酸类和多聚物类为各深层土壤微生物的主要碳源。此外,通过主成分分析,结果表明,主成分1和主成分2分别能解释变量方差的45.21%和33.47%,在主成分分离中起主要贡献作用的是糖类、氨基酸类和羧酸类。该研究为进一步解析核桃根际土壤微生物与生防菌之间的关系提供重要的理论支撑。

关键词： Biolog-ECO 高通量技术群落多样性核桃根际土壤微生物

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云南省双柏鄂嘉镇大型真菌的资源调查

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贵州农业科学 2020年第4期48卷 75-79页

作者：刘朝茂李萍杨斌西南林业大学生物多样性保护与利用学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

为云南双柏县鄂嘉镇大型真菌的合理开发利用及进一步研究提供参考,通过实地踏查结合查阅相关文献对双柏鄂嘉镇大型真菌进行鉴定,并研究其多样性。结果表明:该地区共有大型真菌39种,隶属于2门4纲9目21科25属,其中,子囊菌仅1科1属1种,担子... 详细信息

为云南双柏县鄂嘉镇大型真菌的合理开发利用及进一步研究提供参考,通过实地踏查结合查阅相关文献对双柏鄂嘉镇大型真菌进行鉴定,并研究其多样性。结果表明:该地区共有大型真菌39种,隶属于2门4纲9目21科25属,其中,子囊菌仅1科1属1种,担子菌18科24属38种;≥4种的优势科有3个,占总科数的14.29%;≥3种的优势属4个,占总属数的16.00%;按生态类型可为木生真菌、土生真菌和外生菌根真菌3类,木生真菌11种,占总数28.21%,土生真菌4种,占总数10.26%,外生菌根真菌24种,占总数61.54%;按利用价值分为食用、药用及毒菌3类,食用菌18种,药用菌12种,毒菌7种,其中食药兼用菌7种,未知种9种。该区域具有丰富的大型真菌资源,具有重要的开发应用前景。

关键词：大型真菌种质资源优势科属物种多样性鄂嘉镇云南

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楚雄西舍路大型真菌多样性研究

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安徽农业科学 2019年第7期47卷 83-86页

作者：李萍杨雪晴肖海燕刘朝茂西南林业大学生物多样性保护与利用学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

[目的]研究楚雄西舍路大型真菌的多样性。[方法]通过对楚雄西舍路大型真菌进行采集、鉴定,并对其优势科、属进行分析。[结果]该地区大型真菌有2纲8目19科27属49种,其中牛肝菌科有11种,占总数的22.45%;红菇科有8种,占总数的16.33%;多孔菌... 详细信息

[目的]研究楚雄西舍路大型真菌的多样性。[方法]通过对楚雄西舍路大型真菌进行采集、鉴定,并对其优势科、属进行分析。[结果]该地区大型真菌有2纲8目19科27属49种,其中牛肝菌科有11种,占总数的22.45%;红菇科有8种,占总数的16.33%;多孔菌科4种,占总数的8.16%;鹅膏菌科、乳牛肝菌科、珊瑚菌科和硬皮马勃科均有3种,均占总数的6.12%;口蘑科和鸡油菌科均有2种,均占总数的4.08%;轴腹菌科、条孢牛肝菌科、锁瑚菌科等10科均只有1种,均占总数的2.04%。从其经济价值看,食用菌有20种,占总数的40.82%;药用菌有3种,占总数的6.12%;药食兼用菌8种,占总数的16.33%;毒菌有4种,占总数的8.16%;用途不明菌有14种,占总数的28.57%。[结论]该地区野生食用、药用菌资源丰富,具有较大的开发和利用潜力。

关键词：大型真菌优势科优势属物种多样性楚雄西舍路

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胶孢炭疽菌黑色素合成途径中漆酶蛋白生物信息学分析

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江苏农业科学 2019年第6期47卷 48-51页

作者：祝友朋陈摇韩长志西南林业大学生物多样性保护与利用学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

胶孢炭疽菌可以侵染桃、核桃等诸多重要农林植物,它可引起生产上诸多经济树种的炭疽病,严重威胁着各国农林业的健康生产。植物病原丝状真菌中黑色素合成途径中关键环节漆酶已经在稻瘟病菌、玉米大斑病菌等进行了较为深入的研究,然而尚... 详细信息

胶孢炭疽菌可以侵染桃、核桃等诸多重要农林植物,它可引起生产上诸多经济树种的炭疽病,严重威胁着各国农林业的健康生产。植物病原丝状真菌中黑色素合成途径中关键环节漆酶已经在稻瘟病菌、玉米大斑病菌等进行了较为深入的研究,然而尚未见有关胶孢炭疽菌黑色素合成途径中关键环节漆酶的生物信息学分析报道。本研究以胶孢炭疽菌中漆酶Cg14LAC氨基酸序列为基础,通过TargetP、SignalP、ProtComp、Phyre、big-PI Fungal Predictor、SMART、TMHMM等生物信息学分析工具对上述序列开展蛋白质亚细胞定位、细胞信号肽、二级结构、锚定位点、保守结构域、跨膜结构域等进行分析,同时对上述序列开展与炭疽菌属不同真菌遗传进化关系分析。研究结果为进一步深入开展该蛋白在致病过程中所具有的功能研究打下坚实的理论基础。

关键词：农林植物胶孢炭疽菌黑色素漆酶生物信息学遗传进化

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林业院校“生物信息学”研究生课程教学改革初探

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西南林业大学学报（社会科学） 2018年第4期2卷 104-106页

作者：韩长志祝友朋西南林业大学生物多样性保护与利用学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

林业院校"生物信息学"研究生课程涉及遗传学、水生生物学、生物化学与分子生物学等多个专业,是较为重要的研究生基础课程。通过将理论讲授法、案例启发教学法、讨论法交叉应用于整个"生物信息学"教学过程,并通过撰... 详细信息

林业院校"生物信息学"研究生课程涉及遗传学、水生生物学、生物化学与分子生物学等多个专业,是较为重要的研究生基础课程。通过将理论讲授法、案例启发教学法、讨论法交叉应用于整个"生物信息学"教学过程,并通过撰写发表科技论文的方式进行实践应用考核,以期将"生物信息学"课程建设成适合林业院校生物学一级学科专业、具有鲜明林业特色且具有重要影响力的精品课程。

关键词： “生物信息学” 研究生课程林业院校教学改革

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植物提取物对4株水稻病原菌的抑菌活性筛选

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浙江农业科学 2023年第10期64卷 2468-2473页

作者：赵鹏杨态娇张东华张学良黄朝政伍建榕刘丽闫晓慧云南省高校森林灾害预警控制重点实验室西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 国家林业和草原局西南地区生物多样性保育重点实验室西南林业大学林学院云南昆明650224

为开发新型植物源农药,探究水稻恶苗病、稻瘟病、褐变穗病和稻曲病的生物防治方法,以木贼镰孢(Fusarium equiseti)、稻梨孢(Pyricularia oryzae)、极细链格孢(Alternaria tenuissima)、稻绿核菌(Ustilaginoidea oryzae)为供试病原菌,采... 详细信息

为开发新型植物源农药,探究水稻恶苗病、稻瘟病、褐变穗病和稻曲病的生物防治方法,以木贼镰孢(Fusarium equiseti)、稻梨孢(Pyricularia oryzae)、极细链格孢(Alternaria tenuissima)、稻绿核菌(Ustilaginoidea oryzae)为供试病原菌,采用生长速率法及孢子萌发实验法对17种植物的23种提取物进行了室内抑菌活性测定。生长速率法结果显示:在浓度为2 mg·mL^(-1)时,茵陈蒿、牛尾蒿和鱼眼草提取物对木贼镰孢菌丝生长有一定的抑制活性,抑菌率分别为71.66%、63.33%、50.00%;茵陈蒿、香丝草提取物对稻梨孢的菌丝生长抑制率分别为33.33%、30.83%。孢子萌发实验结果表明,鱼眼草、墨西哥鼠尾草、茵陈蒿提取物对稻绿核菌孢子萌发的抑制率分别为49.68%、45.38%、43.23%;茵陈蒿、牛尾蒿、香丝草提取物对极细链格孢子萌发有一定的抑制作用,抑制率分别为73.69%、50.60%、45.02%。本研究发现,茵陈蒿、牛尾蒿的提取物具有较好的抑菌活性,为今后开发植物源抑菌剂提供了一定的理论依据。

关键词：植物提取物生长速率法孢子萌发实验法水稻病原菌抑菌活性

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希金斯疽菌中糖苷水解酶互作蛋白找寻及分析

希金斯疽菌中糖苷水解酶互作蛋白找寻及分析

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中国植物病理学会2023年学术年会

作者：尹青晓韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum)又称希金斯刺盘孢,属子囊菌门刺盘孢属真菌。该病菌主要危害小油菜、萝卜、大白菜、菜心、花椰菜、羽衣甘蓝等十字花科蔬菜,严重影响了农作物的生产,造成严重的经济损失。糖苷水解酶(GH)是病... 详细信息

希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum)又称希金斯刺盘孢,属子囊菌门刺盘孢属真菌。该病菌主要危害小油菜、萝卜、大白菜、菜心、花椰菜、羽衣甘蓝等十字花科蔬菜,严重影响了农作物的生产,造成严重的经济损失。糖苷水解酶(GH)是病原菌侵染植物打破细胞壁屏障的一种重要酶类,对希金斯炭疽菌各类GH亚家族之间的蛋白互作进行分析,有利于加强对希金斯炭疽菌侵染植物过程中GH协同作用机制更深一步的了解,可为希金斯炭疽菌的防治提供理论依据。然而,尚未见有关希金斯炭疽菌中糖苷水解酶蛋白互作分析的相关研究报道。为了更好地解析希金斯炭疽菌中GH蛋白协同作用关系,本研究基于前期筛选的该菌中75个GH蛋白,通过STRING、ProtComp v9.0等在线分析程序对上述蛋白的互作关系及亚细胞定位进行分析,并采用MEGA7.0软件进行序列比对,构建系统进化树。结果显示,希金斯炭疽菌75个GH蛋白之间的互作主要表现为同一GH亚家族蛋白之间的互作,不同GH亚家族蛋白之间的互作,以及单独的蛋白不参与互作等三类互作情况。其中,GH3与GH7蛋白之间的互作关系较为密切,但其亲缘关系较远;GH28家族中的蛋白主要为同一家族内的蛋白互作关系,且蛋白的亲缘关系相近。H1VKY1与H1VPT7蛋白属于不同GH亚家族,但其亚细胞定位于质膜,且都是单独的蛋白并不参与蛋白之间的互作,H1W0U5蛋白则定位于细胞核,H1W3J7与H1V4B7蛋白定位于内质网,均不参与蛋白互作,其他蛋白均分泌于胞外。该研究为深入解析希金斯炭疽菌GH蛋白之间的互作机制提供重要的参考,也对该菌的防治作用靶标找寻具有重要的意义。

关键词：希金斯炭疽菌蛋白互作亚细胞定位遗传关系

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炭疽属真菌GH12蛋白找寻及生物信息学分析

炭疽属真菌GH12蛋白找寻及生物信息学分析

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中国植物病理学会2023年学术年会

作者：薄淑文韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

炭疽属(Colletotrichum)真菌是一类主要危害农林植物的病原真菌,广泛分布于热带、亚热带和温带地区,其寄主种类繁多,可以侵染各种农作物、花卉、林木等。碳水化合物活性酶(Carbohydrate-Active enzymes,CAZymes)参与降解寄主植物细胞壁... 详细信息

炭疽属(Colletotrichum)真菌是一类主要危害农林植物的病原真菌,广泛分布于热带、亚热带和温带地区,其寄主种类繁多,可以侵染各种农作物、花卉、林木等。碳水化合物活性酶(Carbohydrate-Active enzymes,CAZymes)参与降解寄主植物细胞壁,促进病原菌在寄主植物细胞中附着、侵入、定殖等过程。糖苷水解酶(Glycoside hydrolases,GH)作为碳水化合物活性酶(CAZymes)中的一类蛋白,在实现植物病原真菌侵染植物过程中发挥着非常重要的作用。糖苷水解酶(GH)家族具有诸多亚家族,糖苷水解酶12 (GH12)家族具有内切纤维素酶、木葡聚糖酶、β-1,3-1,4-葡聚糖酶活性,为典型的多功能糖苷水解酶家族。本研究通过NCBI数据库共获得146条炭疽属真菌GH12蛋白序列,采用SienalP v6.0、PrtComp v9.0、TMHMM v2.0、Protscale、PHD等在线分析程序对氨基酸序列的信号肽、亚细胞定位、跨膜结构域、疏水性、等电点等性质进行预测分析。结果显示,在146条GH12蛋白序列中,有93条在N端含有典型的信号肽序列;有38条分泌至胞外,剩余108条分别定位细胞膜外,细胞质膜、高尔基体、溶酶体、细胞核、线粒体中;有123条不含有跨膜结构域,剩余23条含有1个及以上的跨膜结构域;有26条预测为亲水性,120条预测为疏水性;146条均含有无规则卷曲、α螺旋、β折叠,部分含有TM helix (跨膜螺旋);且大部分属于酸性蛋白;大多数GH12蛋白序列的脂肪族氨基酸指数在60～85范围内,有140条不稳定系数小于40,预测为稳定性蛋白,剩余6条预测为非稳定性蛋白;分析发现,有些GH12蛋白序列并不符合分泌蛋白的特征。对炭疽属GH12蛋白进行预测分析,以期为深入研究炭疽菌属真菌不同的寄主范围、致病机制以及GH12的互作机制打下坚实的理论基础。

关键词：炭疽属 GH12 生物信息学糖苷水解酶

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我国常见农林植物根腐病研究进展

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农业开发与装备 2019年第12期 31-31,39页

作者：帕若楠谢尹颖武自强西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650051 西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650051

近年来,我国农林业植物根腐病频繁发生,而根腐病作为一种土传病害,主要侵染植物根部,严重影响了农林业植物的正常生理过程,对农林业造成了不可磨灭的损失。为促进农林业的可持续发展,针对几种常见农林业植物根腐病病害,对各类根腐病的... 详细信息

近年来,我国农林业植物根腐病频繁发生,而根腐病作为一种土传病害,主要侵染植物根部,严重影响了农林业植物的正常生理过程,对农林业造成了不可磨灭的损失。为促进农林业的可持续发展,针对几种常见农林业植物根腐病病害,对各类根腐病的发病和危害程度、病害症状和病原鉴定、防治方法及防治效果进行概述,同时还对生物防治在根腐病方面的作用进行了讨论,为今后农林业植物根腐病的系统研究和防治提供参考。

关键词：根腐病病原防治方法

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林业院校植物保护专业普通植物病理学“金课”建设途径探析——以西南林业大学为例

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教育观察 2020年第37期9卷 134-136页

作者：韩长志覃悦西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室西南林业大学研究生院

西南林业大学和全国许多大学一样,在教学和管理中曾经出现过学生"混学分""水课""清考"等问题,在一定程度上影响了教学质量和人才培养质量。为加快高等教育改革步伐,西南林业大学林学院植物保护专业普通... 详细信息

西南林业大学和全国许多大学一样,在教学和管理中曾经出现过学生"混学分""水课""清考"等问题,在一定程度上影响了教学质量和人才培养质量。为加快高等教育改革步伐,西南林业大学林学院植物保护专业普通植物病理学积极开展"金课"建设,在教学平台、教学内容、教学方法以及考核方法方面探索了"金课"建设的途径。"金课"建设中也暴露出一些困难和问题:线上、线下教学中人为割裂教学方式导致诸多并不适宜开展网上授课的课程也纷纷线上教学,造成不必要的资源浪费;教学内容创新不够丰满,教学实践能力不足;教学考核方法多以期末闭卷考试为主,辅以平时小测成绩。本文以普通植物病理学课程为例,从教学理念、教学平台以及教学内容、教学方法、考核方法五大方面开展"12345"金课建设,以形成课程样板和实施的常态。

关键词：林业院校植物保护专业普通植物病理学金课

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