检索结果-内蒙古大学图书馆

微生物学报 2021年第1期61卷 195-205页

作者：祝友朋韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 西南林业大学研究生院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

【目的】G蛋白信号调控因子(RGS)作为G蛋白信号转导途径的负调控因子,在植物病原菌的致病性和有性生殖调控方面发挥着重要作用。研究真菌中RGS蛋白类型与其理化性质及特征的关系,为今后深入开展不同真菌中具有不同类别RGS的功能解析打... 详细信息

【目的】G蛋白信号调控因子(RGS)作为G蛋白信号转导途径的负调控因子,在植物病原菌的致病性和有性生殖调控方面发挥着重要作用。研究真菌中RGS蛋白类型与其理化性质及特征的关系,为今后深入开展不同真菌中具有不同类别RGS的功能解析打下坚实的理论基础。【方法】前期对模式生物、病原菌、非致病菌等49个真菌中229个RGS蛋白序列进行找寻,并根据其保守结构域和同源性确定RGS类型有DEP-RGS、RGS-TM、PXA-RGS-PX、RGS、RGS-PAS-PAC、TM-RGS等6类。利用蛋白质数据库、ProtComp v9.0、PHD以及MEME等网站对上述RGS蛋白进行理化性质、亚细胞定位以及二级结构、基序等特征分析。【结果】上述不同类别的RGS蛋白具有明显的类别特征性,同时,也具有以下共同特征:理论等电点集中在6.01–7.00;不稳定性系数集中在40.01–60.00;95%以上的RGS蛋白属于亲水性蛋白;亲水性最强氨基酸残基存在较多的是R、D、E、Q、N;疏水性最强氨基酸残基存在较多的L、A、V、F、I;二级结构组成特征为b折叠较少;转运肽情况尚未明确;亚细胞定位多集中在细胞核。【结论】真菌中6类RGS蛋白的理化性质具有一定的共同特征,但不同类别的RGS蛋白也具有明显的类别特征,主要表现在保守结构域、二级结构、等电点、转运肽和亚细胞定位情况。

关键词：真菌 G蛋白信号调控因子理化性质关系解析生物信息学

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植物病原丝状真菌RGS的研究进展

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北京林业大学学报 2021年第4期43卷 150-157页

作者：韩长志祝友朋西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224 西南林业大学研究生院云南昆明650224

G蛋白信号调控因子(RGS)作为G蛋白信号途径中发挥重要的负调控作用的蛋白,其功能主要表现影响真菌菌丝生长、产孢等发育阶段,以及次生代谢产物、色素合成等致病性方面。近些年,随着学术界对于植物病原丝状真菌RGS蛋白研究的不断深入,产... 详细信息

G蛋白信号调控因子(RGS)作为G蛋白信号途径中发挥重要的负调控作用的蛋白,其功能主要表现影响真菌菌丝生长、产孢等发育阶段,以及次生代谢产物、色素合成等致病性方面。近些年,随着学术界对于植物病原丝状真菌RGS蛋白研究的不断深入,产生了大量的学术报道,然而,尚缺乏对模式真菌与植物病原丝状真菌中RGS蛋白系统性对比分析的研究报道。该文对模式真菌与植物病原丝状真菌RGS蛋白的结构、分类进行综述,并通过SMART保守结构域、二级结构组成情况以及遗传关系分析,明确了植物病原丝状真菌与模式真菌中的RGS蛋白均具有保守的RGS结构域以及相似的二级结构组成情况,以及根据RGS蛋白的序列同源性,明确真菌中RGS蛋白可分为6大类,具有不同结构域的RGS蛋白分别聚类。同时,对不同真菌中RGS蛋白功能进行综述,明确植物病原丝状真菌中RGS的数量和类型均多于模式真菌,RGS蛋白功能具有保守性和独特性特征。为今后学术界进一步开展植物病原丝状真菌中RGS蛋白的作用机制解析,以及植物病原丝状真菌与其他模式真菌中RGS蛋白之间的关系解析提供理论基础。

关键词：丝状真菌 RGS 结构域功能综述

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基于全基因组序列的黄单胞菌分泌蛋白质预测及其特征分析

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江苏农业学报 2021年第1期37卷 53-59页

作者：覃悦祝友朋韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

黄单胞菌(Xanthomonas campestris)作为诸多革兰氏阴性细菌之一,主要危害十字花科农作物和核桃、杧果等经济林植物。前人对植物病原细菌、真菌等的分泌蛋白和相关蛋白质开展了预测及分析研究,明确其分泌蛋白在致病过程中具有非常重要的... 详细信息

黄单胞菌(Xanthomonas campestris)作为诸多革兰氏阴性细菌之一,主要危害十字花科农作物和核桃、杧果等经济林植物。前人对植物病原细菌、真菌等的分泌蛋白和相关蛋白质开展了预测及分析研究,明确其分泌蛋白在致病过程中具有非常重要的作用。本研究以已经公布全基因组序列的黄单胞菌*** B100、*** *** str.8004、*** CN14中的蛋白质序列为基础,结合细菌中分泌蛋白的基本特征,采用在线分析程序(包括SignalP v5.0、ProtComp v9.0等)对上述3个黄单胞菌的分泌蛋白序列进行预测和分析,明确上述细菌中分别含有135个、128个、135个分泌蛋白,并对分泌蛋白所具有的基本特征开展分析,为深入研究黄单胞菌分泌蛋白的功能打下理论基础。

关键词：黄单胞菌全基因组信号肽生物信息学

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喜马拉雅山错那段不同海拔梯度蚂蚁多样性

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环境昆虫学报 2021年第3期43卷 584-593页

作者：刘霞许国莲徐正会张翔李晓艳刘兰兰钱昱含西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

为了揭示喜马拉雅山不同海拔梯度蚂蚁的多样性规律,采用样地调查法研究了喜马拉雅山错那段北坡、南坡和山间谷地的蚂蚁群落。共采集蚂蚁标本7516头,隶属于2亚科、5属、7种。利用EstimateS 9.1.0程序对该地区蚂蚁物种丰富度进行估计并绘... 详细信息

为了揭示喜马拉雅山不同海拔梯度蚂蚁的多样性规律,采用样地调查法研究了喜马拉雅山错那段北坡、南坡和山间谷地的蚂蚁群落。共采集蚂蚁标本7516头,隶属于2亚科、5属、7种。利用EstimateS 9.1.0程序对该地区蚂蚁物种丰富度进行估计并绘制物种累计曲线,结果表明错那段的蚂蚁物种实际观察值等于或接近该地区蚂蚁丰富度的估计值。多样性分析显示,错那段3个垂直带蚂蚁物种数目、Shannon-Wiener多样性指数和Fisherα指数顺序为北坡>山间谷地>南坡,优势度指数顺序为北坡<山间谷地<南坡,个体密度顺序为北坡>南坡>山间谷地;在各垂直带上蚂蚁群落物种数目、个体密度、多样性指数总体随海拔升高呈现垂直带中下部较高,垂直带上部较低;群落各项指标更多的表现出“多域效应”现象,降水和海拔对蚂蚁物种丰富度和多样性起决定作用,凋落物的质量和坡度有重要影响。相关性分析发现错那段蚂蚁物种多样性指数与草本盖度极相关,优势度指数与灌木盖度相关性显著;群落相似性分析表明植被类型和海拔高差对蚂蚁群落间相似性有重要作用。

关键词：蚁科多样性垂直带喜马拉雅山

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AtIDD5基因过表达植株构建及其表型分析

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分子植物育种 2022年

作者：徐晓东李林倩于德嘉董萍萍陈健鑫郑洪健张国斌杨红玉昆明学院农学与生命科学学院云南农业大学植物保护学院西南林业大学生物多样性保护学院云南省高校森林灾害预警控制重点实验室

植物的生长与发育与糖的信号或合成有密切关系，拟南芥IDD5 （Indeterminate Domain 5）基因编码一个C2H2型锌指类的转录因子。本研究构建了由35S驱动的AtIDD5超表达植株AtIDD5-OE，并发现超表达T3代稳定植株中AtIDD5表达水平显著升高... 详细信息

植物的生长与发育与糖的信号或合成有密切关系，拟南芥IDD5 （Indeterminate Domain 5）基因编码一个C2H2型锌指类的转录因子。本研究构建了由35S驱动的AtIDD5超表达植株AtIDD5-OE，并发现超表达T3代稳定植株中AtIDD5表达水平显著升高；表型分析显示超表达植株的幼苗根生长明显减慢，整个植株生长发育迟缓。与对淀粉粒的发育进行正调控相反，暗示AtIDD5对植物的生长过程产生反馈调节作用，本研究为后期研究AtIDD5基因在植物生长发育中的功能提供线索。

关键词： AtIDD5 超表达植物构建拟南芥

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四川大凉山东部蚂蚁物种多样性研究

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四川农业大学学报 2021年第6期39卷 742-754页

作者：韩秀徐正会张新民李彪翟奖李婷西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

【目的】研究四川大凉山东部的蚂蚁多样性规律。【方法】采用样地调查法对该区域的蚂蚁物种多样性进行调查;利用Estimate S9.1.0程序对数据进行处理,分析抽样的充分性;利用多样性分析方法分析蚂蚁群落的组成、物种多样性及群落相似性;用... 详细信息

【目的】研究四川大凉山东部的蚂蚁多样性规律。【方法】采用样地调查法对该区域的蚂蚁物种多样性进行调查;利用Estimate S9.1.0程序对数据进行处理,分析抽样的充分性;利用多样性分析方法分析蚂蚁群落的组成、物种多样性及群落相似性;用Pearson相关分析方法分析蚂蚁物种多样性与植被的关系。【结果】在大凉山东部8个垂直带上共采获蚂蚁35 630头,经鉴定隶属6亚科43属136种。各样地蚂蚁群落个体密度2.0~399.8头/m^(2)(平均值96.9头/m^(2)),在各垂直带的北坡底域效应显著,而在南坡多域效应表现明显;优势度指数在各样地间变化较大,总体呈多域效应现象;多样性指数受坡向影响较大,北坡多表现为中域效应现象,南坡多表现为多域效应现象;相似性系数0.158 5~0.583 3(平均0.259 8),处于中等不相似水平。【结论】纬度、坡向和海拔影响蚂蚁物种多样性。海拔是蚂蚁群落主要指标的决定因素,物种数目、个体密度和多样性指数总体随海拔升高而降低,但同时受坡向、气候和人为因素的共同影响。尽管各垂直带均已受到不同程度的人为干扰,但相似性系数仍然较低,表明不同垂直带蚂蚁群落间差异明显,具有较好的生态功能和保护价值。

关键词：蚁科生物多样性群落垂直带四川

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短毛切梢小蠹肠道细菌群落结构与多样性

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中国森林病虫 2023年第2期42卷 1-8页

作者：崔雅洁赵宁李宗波杨斌西南林业大学生物多样性保护学院云南省高校森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224 西南林业大学生命科学学院云南昆明650224

为明确短毛切梢小蠹Tomicus brevipilosus肠道细菌群落结构及其多样性,采用宏基因组测序技术对短毛切梢小蠹肠道和残体的细菌DNA测序,分析细菌群落的组成、丰度及多样性。结果发现:共鉴定出23门53纲119目188科221属458种;变形菌门Proteo... 详细信息

为明确短毛切梢小蠹Tomicus brevipilosus肠道细菌群落结构及其多样性,采用宏基因组测序技术对短毛切梢小蠹肠道和残体的细菌DNA测序,分析细菌群落的组成、丰度及多样性。结果发现:共鉴定出23门53纲119目188科221属458种;变形菌门Proteobacteria、放线菌门Actinobacteria、拟杆菌门Bacteroidetes为肠道和残体菌群的优势门,平均相对丰度分别为64.14%和61.21%、26.58%和24.78%、8.79%和12.08%;分枝菌酸杆菌属Mycolicibacterium、中慢生根瘤菌属Mesorhizobium、叶杆菌属Phyllobacterium、慢生根瘤菌属Bradyrhizobium为肠道和残体菌群优势属,平均相对丰度分别为17.60%和16.67%、 13.89%和10.01%、 10.27%和5.82%、10.90%和18.89%;肠道和残体的细菌群落组成和多样性有明显不同。这些结果将为深入探究短毛切梢小蠹的肠道菌群功能及其灾变机制提供新的视野和理论依据。

关键词：短毛切梢小蠹消化道细菌群落多样性宏基因组技术

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滇朴丛芽病植原体的分子鉴定

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植物保护 2021年第2期47卷 70-77页

作者：陈健鑫张宏雁魏玉倩洪英娣马焕成伍建榕云南省高校森林灾害预警控制重点实验室西南林业大学生物多样性保护学院昆明650224 西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室西南林业大学林学院昆明650224

滇朴Celtis kunmingensis Cheng et Hong是云南的乡土树种,适宜全国大部分地区种植,极具观赏价值,是近年来最热门的绿化首选树种―绿化行道树,云南部分地区滇朴近年常表现丛芽的症状。本研究采用形态学与分子生物学结合的方法,对染病的... 详细信息

滇朴Celtis kunmingensis Cheng et Hong是云南的乡土树种,适宜全国大部分地区种植,极具观赏价值,是近年来最热门的绿化首选树种―绿化行道树,云南部分地区滇朴近年常表现丛芽的症状。本研究采用形态学与分子生物学结合的方法,对染病的幼嫩枝条进行扫描电镜(SEM)观察;利用16S rDNA植原体通用引物P1/P7和R16F2/R16R2进行常规PCR和巢式PCR,分别获得1.8 kb和1.2 kb的特异性基因片段,将该特异性片段与其他已知分类地位的植原体16S rDNA片段进行同源性比对分析,同时利用邻接法(NJ)构建系统发育树。结果表明在染病的滇朴韧皮部组织中可见植原体存在,滇朴丛芽病植原体与芝麻叶状植原体同源性高达99.40%,通过系统发育树可进一步推测滇朴丛芽病植原体是属于16SrⅠ-B亚组成员,本研究结果为该病害的诊断与防治提供了理论依据。

关键词：滇朴丛芽病植原体扫描电镜(SEM) PCR 系统发育树

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楚雄华山松种子园无性系幼苗叶枯病病原菌鉴定

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西北林学院学报 2022年第4期37卷 181-187页

作者：吕则佳陈健鑫冯峻朱艳董云祥罗正平马焕成伍建榕云南省高校森林灾害预警控制重点实验室西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 西南地区生物多样性保育国家林业和草原局重点实验室西南林业大学林学院云南昆明650224 云南省林木种苗工作总站云南昆明650215 楚雄市林业和草原局国有林场云南楚雄675000

为明确楚雄市华山松种子园无性系幼苗叶枯病的病原,采用传统形态学和分子生物学相结合的方法对华山松叶枯病进行病原鉴定。结果表明,引起华山松叶枯病的病原菌为胡枝子拟盘多毛孢(Pestalotiopsis lespedezae)和互隔链格孢(Alternaria al... 详细信息

为明确楚雄市华山松种子园无性系幼苗叶枯病的病原,采用传统形态学和分子生物学相结合的方法对华山松叶枯病进行病原鉴定。结果表明,引起华山松叶枯病的病原菌为胡枝子拟盘多毛孢(Pestalotiopsis lespedezae)和互隔链格孢(Alternaria alternata)。

关键词：叶枯病病原鉴定华山松种子园无性系楚雄

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漾濞大泡核桃根际土壤微生物群落功能多样性

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北方园艺 2021年第22期 98-103页

作者：韩长志喻红稠李庆磊官鑫西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

以3种不同土层深度的核桃根际土壤为试材,采用Biolog-ECO板方法,研究了微生物群落多样性组成及差异,以期为进一步解析核桃根际土壤微生物与生防菌之间的关系提供参考依据.结果表明:漾濞大泡核桃根际土壤中3种不同深度土层微生物在利用... 详细信息

以3种不同土层深度的核桃根际土壤为试材,采用Biolog-ECO板方法,研究了微生物群落多样性组成及差异,以期为进一步解析核桃根际土壤微生物与生防菌之间的关系提供参考依据.结果表明:漾濞大泡核桃根际土壤中3种不同深度土层微生物在利用碳源方面的活性表现出不同特性,尤以深层根际土壤微生物利用单一碳源能力强,其次为中层及浅层;同时,核桃根际土壤微生物群落Shannon指数的总体变化趋势为中层强于浅层及深层.

关键词：生态板漾濞大泡核桃群落多样性根际土壤微生物

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