检索结果-内蒙古大学图书馆

微生物学报 2023年第1期63卷 156-169页

作者：陈健鑫唐婕魏玉倩马焕成伍建榕西南林业大学生物多样性保护学院、云南省高校森林灾害预警控制重点实验室云南昆明650224 西南林业大学林学院、西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室云南昆明650224

春兰(Cymbidium goeringii)是一种具有较高经济和观赏价值的地生兰。由于栖息地的严重破坏,大多数地生兰处于濒危状态,根系与微生物的共生关系伴随着兰科植物从种子萌发到开花结果,因此根系内生微生物在地生兰生活史中具有重要作用。【... 详细信息

春兰(Cymbidium goeringii)是一种具有较高经济和观赏价值的地生兰。由于栖息地的严重破坏,大多数地生兰处于濒危状态,根系与微生物的共生关系伴随着兰科植物从种子萌发到开花结果,因此根系内生微生物在地生兰生活史中具有重要作用。【目的】分析野生春兰根系内生菌群落组成与潜在功能,为春兰的人工保育提供理论依据。【方法】采集云南省昆明市、保山市和大理州的野生春兰的根系,利用宏基因组测序,并进行物种注释及功能注释。【结果】保山的春兰根内微生物丰度及多样性大于大理及昆明的春兰样品,春兰根系内生真菌的优势门为担子菌门(Basidiomycota)、子囊菌门(Ascomycota)和球囊霉门(Glomeromycota),优势科为球囊霉科(Glomeraceae)、多孔菌科(Polyporaceae)和角担菌科(Ceratobasidiaceae),其中角担菌科是春兰主要的兰科菌根真菌(orchid mycorrhizal fungi,OMF);内生细菌的优势门为厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes),优势科为韦荣球菌科(Erysipelotrichaceae)、Cyclobacteriaceae和醋酸杆菌科(Acetobacteraceae);内生古菌的优势门为广古菌门(Euryarchaeota)和奇古菌门(Thaumarchaeota),优势科为钠白菌科(Natrialbaceae);病毒以花椰菜花叶病毒科(Caulimoviridae)为主。春兰根系内生菌的功能在KEGG数据库主要被注释到新陈代谢(metabolism)和遗传信息加工(genetic information processing)两大通路,PHI数据库注释提示,镰孢属(Fusarium/Gibberella)、巨座壳属(Magnaporthe)和曲霉属(Aspergillus)可能成为野生春兰潜在病原菌。【结论】本研究明确了云南省三地区野生春兰根系内生菌的主要类群,首次发现了春兰根系中有球囊霉科真菌定殖,并对内生菌群进行功能注释分析,为野生春兰保育、人工幼苗菌根化及病害防治提供理论依据。

关键词：春兰根系内生微生物宏基因组 KEGG数据库 PHI数据库

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云南油茶炭疽病菌的鉴定及生防菌筛选

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华南农业大学学报 2022年第5期43卷 43-53页

作者：陈健鑫魏玉倩刘丽张东华马焕成伍建榕云南省高校森林灾害预警控制重点实验室/西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室/西南林业大学林学院云南昆明650224

【目的】明确云南省德宏州、文山州和保山市油茶炭疽病菌的种类,筛选具有良好拮抗效果的生防菌。【方法】本研究于2019和2020年7—9月进行了病害调查,收集病叶标本,采用组织分离法分离病原菌,通过柯赫氏法则验证其致病性,联合形态学与... 详细信息

【目的】明确云南省德宏州、文山州和保山市油茶炭疽病菌的种类,筛选具有良好拮抗效果的生防菌。【方法】本研究于2019和2020年7—9月进行了病害调查,收集病叶标本,采用组织分离法分离病原菌,通过柯赫氏法则验证其致病性,联合形态学与多位点序列分析鉴定病原菌种类。同时从健康油茶叶片内分离筛选内生拮抗菌,并通过平板对峙法验证抑菌作用。【结果】云南省德宏州地区油茶炭疽病发生较严重,平均发病率为56.18%,病情指数为53.11,云南省油茶炭疽病菌种类主要有5种,分别是胶孢炭疽菌Colletotrichum gloeosporioides、卡哈瓦炭疽菌***、喀斯特炭疽菌***、松针刺盘孢***和暹罗刺盘孢***。其中,胶孢炭疽菌是优势病原菌,菌株CA17(暹罗刺盘孢)在活体油茶叶片上的致病性最强。平板对峙培养结果表明,采自德宏州健康油茶叶片的内生菌Streptomyces fulvissimus和Bacillus mojavensis对菌株CA17具有较好的拮抗作用,抑菌率分别达到37%和42%。【结论】本研究可为油茶炭疽病的诊断与绿色防控提供理论依据。

关键词：油茶炭疽病内生拮抗菌多位点序列分析生物防治

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不同种苏铁珊瑚状根内生微生物多样性及适应性研究

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微生物学报 2022年第7期62卷 2835-2849页

作者：魏玉倩陈健鑫郑艳玲竺永金周嫒婷马焕成伍建榕西南林业大学林学院西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室云南昆明650224 西南林业大学生物多样性保护学院云南省高校森林灾害预警控制重点实验室云南昆明650224

【目的】苏铁(Cycassp.)是珍稀濒危树种,能在干热河谷中长期稳定生存的原因可能与珊瑚状根内生微生物有密切关系。不同种苏铁在同一生境下其珊瑚状根内生微生物种类和群落组成存在怎样的差异性是本研究的科学问题。【方法】采用宏基因... 详细信息

【目的】苏铁(Cycassp.)是珍稀濒危树种,能在干热河谷中长期稳定生存的原因可能与珊瑚状根内生微生物有密切关系。不同种苏铁在同一生境下其珊瑚状根内生微生物种类和群落组成存在怎样的差异性是本研究的科学问题。【方法】采用宏基因测序技术对四川省攀枝花公园内5种同属不同种苏铁珊瑚状根进行了分子鉴定,分析了苏铁间微生物类型、功能基因和代谢通路过程的差异性。【结果】公园内不同苏铁的珊瑚状根内生微生物的优势类群在门水平上基本相同,但相对丰度有差异性。在真菌界水平上的优势类群为担子菌门(Basidiomycota)、子囊菌门(Ascomycota)、球囊菌门(Glomeromycota)和隐真菌门(Cryptomycota),在细菌界水平上的优势类群为蓝细菌门(Cyanobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、螺旋体门(Spirochaetes)和放线菌门(Actinobacteria)。不同种的苏铁在真菌界和细菌界的微生物群落相对丰度存在一定差异。蓝细菌门在篦齿苏铁、攀枝花苏铁、华南苏铁和贵州苏铁中的相对丰度远高于宽叶苏铁,而放线菌门和球囊菌门在宽叶苏铁的相对丰度远高于篦齿苏铁、攀枝花苏铁、华南苏铁和贵州苏铁。通过KEGG数据库比对分析发现不同种苏铁间微生物的差异表达基因功能主要与环境适应和能量代谢通路相关。结果表明碳水化合物代谢(carbohydrate metabolism)、氨基酸代谢(aminoacid metabolism)、基因结构的折叠、排列和降解(folding、sorting、degradation)及信号转导(signal transduction)的功能基因较为丰富。【结论】种植于同一地点的不同苏铁的珊瑚状根内生微生物的优势类群在门水平上基本相同,但相对丰度有差异性。珊瑚状根内的蓝细菌和放线菌参与的氮素和碳水化合物合成和代谢过程可能是苏铁适应干热河谷贫瘠环境的重要因素之一。

关键词：苏铁珊瑚状根内微生物宏基因组群落多样性聚类分析

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四川王朗自然保护区及邻近地区蚁科昆虫区系分析

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应用昆虫学报 2019年第6期56卷 1402-1409页

作者：罗成龙徐正会张新民祁彪冉茂君袁定宇西南林业大学生物多样性保护与利用学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

【目的】揭示王朗自然保护区及邻近地区蚂蚁区系特征。【方法】采用样地调查法。【结果】采集到蚁科昆虫5亚科,37属,77种蚂蚁,分析了属和种的分布类型和区系成分。【结论】王朗自然保护区及邻近地区蚂蚁区系具有东洋界向古北界过渡特征... 详细信息

【目的】揭示王朗自然保护区及邻近地区蚂蚁区系特征。【方法】采用样地调查法。【结果】采集到蚁科昆虫5亚科,37属,77种蚂蚁,分析了属和种的分布类型和区系成分。【结论】王朗自然保护区及邻近地区蚂蚁区系具有东洋界向古北界过渡特征,同时具有西南区、华中区、华北区、青藏区成分高度汇聚特点。在属级水平上以东洋界、古北界分布属最丰富,东洋界分布属稍占优势,与新热带界关系最远。在种级水平上以东洋界分布种占优势,与古北界关系最密切,与新热带界关系最远。在中国动物地理区划中具有典型西南区特征,与华南区关系密切,与东北区关系最远。

关键词：蚁科区系自然保护区四川

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黄单胞菌分泌蛋白的理化性质及特征分析

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华中农业大学学报 2020年第6期39卷 30-36页

作者：覃悦祝友朋韩长志西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

基于全基因组序列已经公布的黄单胞菌Xanthomonas campestris B100、Xanthomonas campestris *** 8004、Xanthomonas campestris CN14中分泌蛋白序列为基础数据,采用Protscale、SMART、TargetP 2.0 Server等生物信息学分析软件对上述分泌蛋白展开理化性质、保守结构域以及转运肽等分析,结果显示:黄单胞菌中分泌蛋白理论等电点与氨基酸长度之间无相关关系,44.73%的蛋白为不稳定蛋白,83.21%的蛋白亲水性小于0,属于亲水性蛋白。同时,在每种黄单胞菌的分泌蛋白中,具有明显保守结构域的蛋白数量平均为12个,并且所有分泌蛋白均具有信号肽,转运肽预测可能性分布也较为平均。

关键词：黄单胞菌分泌蛋白理化性质生物信息学分析植物病原菌亚细胞定位转运肽

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基于全基因组序列的核桃细菌性黑斑病菌分泌蛋白的预测及特征分析

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南京林业大学学报（自然科学版） 2019年第3期43卷 17-22页

作者：祝友朋刘宏莉韩长志西南林业大学生物多样性保护与利用学院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

【目的】充分了解核桃黑斑病菌的侵染机制。【方法】以全基因组序列已经公布的7个核桃细菌性黑斑病菌菌株CFBP2528、CFBP7179、CFBP8253、DW3F3、J303、NCPPB1447、Xaj417等所具有的蛋白序列为预测数据,基于分泌蛋白所具有的主要特征,利... 详细信息

【目的】充分了解核桃黑斑病菌的侵染机制。【方法】以全基因组序列已经公布的7个核桃细菌性黑斑病菌菌株CFBP2528、CFBP7179、CFBP8253、DW3F3、J303、NCPPB1447、Xaj417等所具有的蛋白序列为预测数据,基于分泌蛋白所具有的主要特征,利用SignalP v4.1、ProtCompB v9.0、TMHMM v2.0、big-PI Fungal predictor、TargetP v1.1、LipoP v1.0等在线分析程序对分泌蛋白进行预测,同时分析其氨基酸组成及分布、信号肽长度、信号肽切割位点等特征。【结果】核桃细菌性黑斑病菌的分泌蛋白平均为74个,其氨基酸长度多集中于101～400氨基酸,所占比例为63.65%。信号肽氨基酸残基中以A最多,所占比例为22.04%;其次是L,所占比例为19.27%。信号肽长度以19～29个氨基酸的最多,所占比例为79.62%,信号肽切割位点属于A-X-A类型。【结论】核桃细菌性黑斑病菌中分泌蛋白的有效预测,可为深入解析核桃细菌性黑斑病菌中分泌蛋白在侵染过程中所发挥的功能提供理论依据。

关键词：核桃细菌性黑斑病菌全基因组分泌蛋白生物信息学分析

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植物病原丝状真菌寄生性与RGS蛋白的关系研究

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华中农业大学学报 2020年第6期39卷 23-29页

作者：祝友朋韩长志西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

以49个全基因组序列已经公布的真菌为研究对象,通过OrthoVenn2同源基因簇比对、BLASTp比对和关键词搜索3种方法对G蛋白信号调控因子(regulators of G-protein signaling,RGS)同源基因进行比对分析,并结合SMART进行保守结构域分析,结果发... 详细信息

以49个全基因组序列已经公布的真菌为研究对象,通过OrthoVenn2同源基因簇比对、BLASTp比对和关键词搜索3种方法对G蛋白信号调控因子(regulators of G-protein signaling,RGS)同源基因进行比对分析,并结合SMART进行保守结构域分析,结果发现,49个真菌中共有229个RGS蛋白,每种真菌中所含有RGS蛋白的数量范围为3~9个,且死体营养型病原菌和半活体营养型病原菌的RGS蛋白数量高于活体营养型病原菌;根据RGS蛋白中保守结构域进行分类,可以划分为DEP-RGS、RGS-TM、PXA-RGS-PX、RGS、RGS-PAS-PAC、TM-RGS等6种,其中,具有RGS-PAS-PAC和TM-RGS这2种特殊保守结构域的RGS蛋白主要集中在半活体营养型病原菌和死体营养型病原菌;进一步对229个RGS蛋白进行遗传关系分析,发现具有同种保守结构域的RGS蛋白亲缘关系较近。上述研究结果表明植物病原丝状真菌的寄生性与RGS蛋白数量和种类之间存在着一定的关联性。

关键词：植物病原菌丝状真菌调控蛋白 G蛋白信号调控因子(RGS) 同源比对比较基因组学

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横断山脉亚高山带高山栎叶片生态化学计量及内稳性特征

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植物研究 2023年第6期43卷 923-931页

作者：李鸿博陈诗黄耀华康定旭伍建榕马焕成西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室昆明650224 云南省高校森林灾害预警控制重点实验室西南林业大学生物多样性保护学院昆明650224

为揭示横断山脉亚高山带高山栎(Quercus semicarpifolia)的生态适应性机制,选取该地区8个样地的高山栎叶片和生长基质土壤为研究对象,分别测定C、N、P含量及其比例特征,并对生长限制性元素进行判断,利用生态化学计量内稳性模型拟合判断... 详细信息

为揭示横断山脉亚高山带高山栎(Quercus semicarpifolia)的生态适应性机制,选取该地区8个样地的高山栎叶片和生长基质土壤为研究对象,分别测定C、N、P含量及其比例特征,并对生长限制性元素进行判断,利用生态化学计量内稳性模型拟合判断高山栎叶片所处状态。结果表明8个样地土壤C、N、P质量分数分别为38.86~70.19、3.54~9.46、0.61~2.05 g∙kg^(-1),土壤ω(C)∶ω(N)为5.65~16.07,ω(C):ω(P)为36.98~74.42,ω(N)∶ω(P)为4.41~12.90,均值分别为9.48、51.79和6.54。叶片C、N、P质量分数分别为428.31~473.86、21.22~31.68、2.21~3.68 g∙kg^(-1),叶片ω(C)∶ω(N)、ω(C)∶ω(P)和ω(N)∶ω(P)分别为14.16~22.46,121.41~215.86和6.99~12.84,均值分别为17.36、164.39和9.68。叶片N、P含量均高于全球平均水平。各样地中叶N与土壤P、叶N与土壤ω(C)∶ω(N)、叶ω(C)∶ω(P)与土壤ω(N)∶ω(P)、叶ω(C)∶ω(N)与土壤ω(N)∶ω(P),以及叶ω(C)∶ω(P)与叶ω(N)∶ω(P)极显著正相关(P<0.01)。此外,高山栎叶片化学计量内稳性指数以1/H进行探讨,1/H_(ω(N))为-0.181~0.141、1/H_(ω(P))为-1.255~1.206、1/H_([ω(N)∶ω(P)])为0.391~0.960,表明各高山栎1/Hω(N)处于稳态、1/H_(ω(P))和1/H_([ω(N)∶ω(P)])多处于弱稳态、弱敏感和敏感态。高山栎叶片ω(N)∶ω(P)小于或接近16,说明该地区对高山栎N、P两种元素供应充足。高山栎能够过量贮存N、P元素以适应变化的外界生境,但对于外界P元素的利用策略更为保守。该地区高山栎林在长期演替进程中与土壤形成了良好的养分供给与归还关系,已形成相对完整稳定的亚高山带森林生态系统。

关键词：横断山脉高山栎生态化学计量特征内稳性生态适应性机制

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千里光化学成分及抗烟草花叶病毒活性研究

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天然产物研究与开发 2023年第9期35卷 1554-1561页

作者：符滔李雅丽张威吴江梅刘洋罗新香闫晓慧胡世俊西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室西南林业大学林学院昆明650233

对千里光(Senecio scandens)化学成分及其抗烟草花叶病毒(TMV)活性进行研究,为开发新型植物病毒抑制剂提供理论依据。综合运用硅胶、凝胶、MCI等多种柱层析方法对千里光地上部分乙酸乙酯萃取物化学成分进行分离,利用NMR、MS鉴定其结构;... 详细信息

对千里光(Senecio scandens)化学成分及其抗烟草花叶病毒(TMV)活性进行研究,为开发新型植物病毒抑制剂提供理论依据。综合运用硅胶、凝胶、MCI等多种柱层析方法对千里光地上部分乙酸乙酯萃取物化学成分进行分离,利用NMR、MS鉴定其结构;采用活体半叶枯斑法测定化合物对TMV的抑制活性。从千里光乙酸乙酯萃取物中共分离得到13个化合物,根据其理化性质以及波谱数据分别鉴定为24-烯-环阿尔廷酮(1)、3β-羟基-7β-甲氧基-5-豆甾烯(2)、正三十二烷(3)、乌索酸(4)、豆甾醇(5)、(22 E)-ergosta-6,22-diene-3β,5β,8α-triol(6)、山柰酚(7)、3-吲哚甲醛(8)、泽兰黄酮(9)、槲皮素(10)、紫杉叶素(11)、jacaranone(12)、叶绿醇(13)。除化合物7和化合物10外,其余化合物均为首次从该植物中分离得到。活性测定结果表明,化合物8和化合物13具有较强的抗TMV活性。

关键词：千里光化学成分抗烟草花叶病毒活性半叶枯斑法

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滇西南地区蚂蚁物种分布格局研究

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云南农业大学学报（自然科学版） 2022年第1期37卷 10-23页

作者：郭宁妍钱昱含徐正会张力张宁李海斌蒋华郝永强西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

【目的】揭示滇西南地区蚂蚁分布规律。【方法】采用样地调查法研究滇西南地区蚂蚁物种的分布格局。【结果】共采集到蚁科昆虫10亚科65属188种,相较于南滚河国家级自然保护区,滇西南地区亚科数相近,物种数相等,属的丰富度更高。滇西南... 详细信息

【目的】揭示滇西南地区蚂蚁分布规律。【方法】采用样地调查法研究滇西南地区蚂蚁物种的分布格局。【结果】共采集到蚁科昆虫10亚科65属188种,相较于南滚河国家级自然保护区,滇西南地区亚科数相近,物种数相等,属的丰富度更高。滇西南地区分布的蚂蚁物种超过半数生态适应幅度狭窄,栖息生境、觅食和筑巢场所类别有限。黄足尼兰蚁[Nylanderia flavipes(Smith)]、邵氏姬猛蚁[Hypoponera sauteri Wheeler]和宽结摇蚁[Erromyrma latinodis(Mayr)]的垂直分布范围最大(海拔高差1750 m),栖息于季风常绿阔叶林的蚂蚁物种(112种)、地表觅食的蚂蚁物种(140种)和在土壤内筑巢的蚂蚁物种(87种)最为丰富。【结论】分析认为蚂蚁物种的分布格局主要受物种适应能力、海拔、气候、植被类型和丰富度影响。多数蚂蚁喜欢低海拔和食物资源丰富的环境,适宜的温度和湿度条件更有利于蚂蚁栖息。研究结果对滇西南生物多样性保护具有参考价值。

关键词：蚁科垂直分布栖息生境觅食筑巢

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