检索结果-内蒙古大学图书馆

基于TCGA数据库及转录组数据分析HDAC 1基因在胃癌中的表达和临床意义

贵州医科大学学报 2020年第2期45卷 132-137,150页

作者：李抄陈定宇张晓怡赵艳王琴容周建奖鲍丽雅谢渊贵州医科大学地方病与少数民族性疾病教育部重点实验室贵州省医学分子生物学重点实验室贵州医科大学分子生物学重点实验室贵州贵阳550004 贵州医科大学附院感染科肝炎实验室贵州贵阳550004

目的:利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库及转录组数据分析组蛋白去乙酰化酶1(HDAC1)在胃癌(GC)中的表达情况、探讨HDAC 1与临床参数的关系,并预测其在肿瘤发生发展中的可能机制。方法:从TCGA数据库中下载GC组织(GC组,371例)和正常胃组织(... 详细信息

目的:利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库及转录组数据分析组蛋白去乙酰化酶1(HDAC1)在胃癌(GC)中的表达情况、探讨HDAC 1与临床参数的关系,并预测其在肿瘤发生发展中的可能机制。方法:从TCGA数据库中下载GC组织(GC组,371例)和正常胃组织(正常组,36例)的RNASeq数据和临床信息,比较正常组与GC组HDAC 1 mRNA的表达差异;将GC组分为HDAC 1 mRNA高表达组(高于均值)271例和HDAC 1 mRNA低表达组(低于均值)100例,分析GC患者HDAC 1表达量与临床病理参数的相关性及其预后;利用LinkedOmics数据库分析与HDAC 1表达相关的基因,Omicsbean-Canner预测HDAC 1基因相关信号通路及功能富集。结果:GC组标本HDAC 1基因平均表达量明显高于正常组(t=6.88,P<0.01);GC患者HDAC 1基因表达与患者的年龄、T分期、AJCC分期及幽门螺杆菌(***)感染等病理参数呈正相关性(P<0.05),但与性别、N分期及M分期等病理参数无相关性(P>0.05);Kaplan-Meier分析结果表明,HDAC 1基因表达与生存无相关性(P>0.05);GC组患者HADC 1基因表达与AK 2(adenylate kinase 2)、EIF 3 I(eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I,)及MARCKSL 1(MARCKS like 1)等9118个基因表达量呈正相关,与GNAL(G protein subunit alpha L)、ARMCX 2(armadillo repeat containing X-linked 2)及CCDC 46(centrosomal protein 112)等10907个基因表达量呈负相关;HDAC 1基因功能显著富集到细胞周期、notch信号通路及Transcriptional misregulation in cancer等。结论:HDAC 1基因在GC样本中呈高表达,且HDAC 1基因的表达与患者的年龄、T分期、AJCC分期及***感染等病理参数相关。

关键词：胃肿瘤 TCGA数据库组蛋白去乙酰化酶1 转录组

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基于OBE教育理念的分子生物学理论课程与实验课程的教学改革

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现代职业教育 2021年第33期 12-13页

作者：王碧张婷李渺柏松地方病与少数民族疾病教育部重点实验室贵州省医学分子生物学重点实验室贵州医科大学贵州理工学院

分子生物学理论课程与实验课程是生物技术或生物工程专业的基础课程,针对分子生物学理论课程与实验课程教学过程中出现的问题,将OBE教育理念引入该门课程的教学过程中,打破传统的教学模式,以充分激发学生的创新能力为教学改革目标,完善... 详细信息

分子生物学理论课程与实验课程是生物技术或生物工程专业的基础课程,针对分子生物学理论课程与实验课程教学过程中出现的问题,将OBE教育理念引入该门课程的教学过程中,打破传统的教学模式,以充分激发学生的创新能力为教学改革目标,完善基于OBE教育理念的教学内容、教学方式和教学评价体系的改革,提高教学质量。

关键词： OBE 分子生物学教学改革

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黄连素对人耐紫杉醇去势性前列腺癌细胞凋亡和IL-6/STAT3表达的影响

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贵州医科大学学报 2021年第6期46卷 627-631,638页

作者：张健彭煜晖李毅梁欣明付文莉张婷柏华禹文峰吴昌学张启芳贵州医科大学地方病与少数民族疾病教育部重点实验室&贵州省医学分子生物学重点实验室贵州贵阳550004 贵州医科大学第三附属医院医学中心实验室贵州都匀558000

目的研究黄连素(BBR)对人耐紫杉醇(PTX)去势性前列腺癌细胞凋亡和白细胞介素-6(IL-6)/信号转导与转录因子3(STAT3)表达的影响。方法选取对数生长期人耐PTX前列腺癌细胞株DU145 R,用DMSO、10及20μmol/L BBR处理72 h,采用流式细胞术检测D... 详细信息

目的研究黄连素(BBR)对人耐紫杉醇(PTX)去势性前列腺癌细胞凋亡和白细胞介素-6(IL-6)/信号转导与转录因子3(STAT3)表达的影响。方法选取对数生长期人耐PTX前列腺癌细胞株DU145 R,用DMSO、10及20μmol/L BBR处理72 h,采用流式细胞术检测DU145 R细胞凋亡;取0、10及20μmol/L BBR处理24 h的DU145 R细胞,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)与蛋白印迹(Western blot)分别检测DU145 R细胞中IL-6、STAT3 mRNA及蛋白表达。结果与DMSO组相比,10和20μmol/L BBR组DU145 R细胞凋亡数量增加(P<0.05);与0μmol/L组比较,10和20μmol/L BBR组DU145 R细胞中IL-6与STAT3 mRNA及蛋白表达降低(P<0.05)。结论BBR可能通过下调IL-6/STAT3表达诱导DU145 R细胞的凋亡。

关键词：白细胞介素6 前列腺肿瘤前列腺癌细胞紫杉醇耐药黄连素信号转导与转录因子3

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黄连素对人耐紫杉醇去势性前列腺癌细胞活力、增殖及HMGB1表达的影响

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贵州医科大学学报 2021年第6期46卷 632-638页

目的探讨黄连素(BBR)对去势抵抗性前列腺癌(CRPC)紫杉醇(PTX)耐药细胞活力、增殖及高迁移率族蛋白1(HMGB1)表达的影响。方法取对数生长期的PTX耐药前列腺癌细胞株DU145 R,用0、5、10、20、30及50μmol/LBBR处理,采用细胞计数试剂盒8(CC... 详细信息

目的探讨黄连素(BBR)对去势抵抗性前列腺癌(CRPC)紫杉醇(PTX)耐药细胞活力、增殖及高迁移率族蛋白1(HMGB1)表达的影响。方法取对数生长期的PTX耐药前列腺癌细胞株DU145 R,用0、5、10、20、30及50μmol/LBBR处理,采用细胞计数试剂盒8(CCK8)分别于48和72 h评估6组DU145 R细胞的细胞活力;分别用二甲基亚砜(DMSO)、10及20μmol/L BBR处理对数生长期的DU145 R细胞,采用细胞克隆形成实验检测3组DU145 R细胞的克隆形成数;利用Oncomine数据库与人类蛋白质图谱数据库(HPA)分别分析HMGB1 mRNA及蛋白在前列腺癌和正常组织中的表达,利用TIMER2.0数据库分析HMGB1表达与前列腺癌患者生存的相关性;取对数生长期细胞DU145及DU145 R(分为0、10及20μmol/L BBR处理组),采用蛋白印迹法检测2组细胞中HMGB1蛋白表达。结果与0μmol/L BBR组相比,各浓度组DU145 R细胞的细胞活力降低(P<0.05);与DMSO组相比,5和10μmol/L BBR组DU145 R细胞的克隆形成数量减少(P<0.05);与正常组织相比,前列腺癌组织中HMGB1 mRNA及蛋白表达增加(P<0.001),且HMGB1高表达与前列腺癌患者不良预后相关(P=0.0193);与DU145组相比,DU145 R各组细胞HMGB1的表达明显增高(P<0.001);与0μmol/L BBR组相比,10和20μmol/L BBR组DU145 R细胞HMGB1蛋白表达下调(P<0.05)。结论BBR可抑制CRPC PTX耐药细胞增殖、细胞活力及HMGB1的表达。

关键词：前列腺肿瘤前列腺癌细胞紫杉醇耐药 Oncomine数据库人类蛋白质图谱高迁移率族蛋白1 黄连素

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ACTB基因引物的设计及其在医学本科分子生物学实验教学中的应用

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高教学刊 2020年第14期6卷 97-100页

作者：宋辉张婷禹文峰地方病与少数民族疾病教育部重点实验室贵州贵阳550004 贵州省医学分子生物学重点实验室贵州贵阳550004 贵州医科大学贵州贵阳550004

目的针对ACTB基因设计引物,并在医学本科分子生物实验教学中通过聚合酶链式反应(PCR)让学生认识真核基因内含子和外显子结构的特点。方法通过在线软件Primer-BLAST设计针对ACTB基因的引物,通过改变退火温度,优化PCR体系,同时,结合实验... 详细信息

目的针对ACTB基因设计引物,并在医学本科分子生物实验教学中通过聚合酶链式反应(PCR)让学生认识真核基因内含子和外显子结构的特点。方法通过在线软件Primer-BLAST设计针对ACTB基因的引物,通过改变退火温度,优化PCR体系,同时,结合实验教学结果评价引物的特异性。结果针对ACTB基因外显子3和外显子4设计了两对引物,引物1和引物2。引物1在退火温度68℃时,表现出较高的特异性和PCR产量。以基因组DNA(gDNA)和cDNA为模板,PCR产物大小相差441bp。以此条件,引物1在实验教学中也表现出较好的效果,目的基因扩增成功率达到90%以上。结论引物1在退火温度68℃时,利用PCR技术结合琼脂糖凝胶电泳结果,学生们可以形象的理解真核生物基因的结构特点,值得在医学本科分子生物学实验教学中推广。

关键词： ACTB PCR 真核基因结构分子生物学实验教学

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医学院校研究生分子生物学技术实验教学创新体系的构建

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基础医学教育 2022年第2期24卷 103-105页

作者：齐晓岚张婷洪伟谢渊何燕沈祥春贵州医科大学地方病与少数民族疾病教育部重点实验室贵州省医学分子生物学重点实验室贵阳550004 贵州医科大学药学院

分子生物学技术是推动生命科学领域及其他多个相关领域学科发展的关键技术,是各个科学研究领域的必备工具。随着分子生物学的发展以及其重要性的逐渐提升,博士、硕士研究生及本科生对分子生物学技术教学的需求也日益明显且各有侧重。文... 详细信息

分子生物学技术是推动生命科学领域及其他多个相关领域学科发展的关键技术,是各个科学研究领域的必备工具。随着分子生物学的发展以及其重要性的逐渐提升,博士、硕士研究生及本科生对分子生物学技术教学的需求也日益明显且各有侧重。文章通过对研究生课程实践教学体系、教学模式、教学方法等进行教学体系构建的探索,提升实验技术课的教学效果,为培养高素质的医学院校研究生提供参考。

关键词：分子生物学技术实验教学教学改革

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幽门螺杆菌细胞毒素相关基因A蛋白不同片段对胃癌细胞γH2AX表达的影响

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贵州医科大学学报 2022年第2期47卷 133-140页

作者：贾岑岑王琴容周建奖程薇赵艳贵州医科大学地方病与少数民族疾病教育部重点实验室&贵州省医学分子生物学重点实验室贵州贵阳550004 贵州医科大学附属医院血液科贵州贵阳550004

目的探讨幽门螺杆菌(***)细胞毒素相关基因A(CagA)蛋白不同片段对胃癌细胞磷酸化组蛋白H2AX(γH2AX)表达的影响。方法取前期分离的***东亚株GZ7及其CagA敲除株*** GZ7ΔCagA感染的癌细胞株AGS,采用免疫荧光方法检测DNA双链断裂标志物γH... 详细信息

目的探讨幽门螺杆菌(***)细胞毒素相关基因A(CagA)蛋白不同片段对胃癌细胞磷酸化组蛋白H2AX(γH2AX)表达的影响。方法取前期分离的***东亚株GZ7及其CagA敲除株*** GZ7ΔCagA感染的癌细胞株AGS,采用免疫荧光方法检测DNA双链断裂标志物γH2AX的表达;构建不同序列的CagA表达载体(载体a、b、c、d、e),转化大肠杆菌,提取质粒后测序鉴定,将鉴定后的载体转染AGS,采用免疫荧光方法检测γH2AX的表达,并通过流式细胞术检测细胞周期。结果成功鉴定了含不同片段的CagA载体;*** GZ7感染的胃癌细胞AGS核内γH2AX的表达高于*** GZ7ΔCagA感染的细胞(P<0.05);与NC组比较,不同序列CagA载体转染后胃癌细胞AGS中γH2AX表达均有增加(P<0.05或P<0.01),且载体b、c及d表达增加较明显(P<0.01);载体a和c转染后的胃癌细胞AGS的G0/G1期细胞比例升高(P<0.05),载体b、c、d及e转染后胃癌细胞AGS的G2/M期比例明显升高(P<0.01)。结论CagA是***感染诱导胃癌细胞DNA双链断裂的重要因素,CagA中的EPYIA基序是这种DNA损伤的重要结构。

关键词：螺杆菌,幽门胃肿瘤细胞周期细胞毒素相关基因A蛋白 DNA损伤磷酸化组蛋白H2AX

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慢性氟中毒大鼠学习记忆能力与血清、海马及皮质脑组织中PGC-1α水平的相关性

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贵州医科大学学报 2018年第10期43卷 1154-1158,1168页

作者：刘仙红陈丹曾晓晓董阳婷邓婕齐晓岚吴昌学李毅宋辉官志忠贵州医科大学地方病与少数民族性疾病教育部重点实验室贵州贵阳550004 贵州医科大学贵州省医学分子生物学重点实验室贵州贵阳550004 贵州医科大学分子生物学重点实验室贵州贵阳550004 贵州医科大学附院病理科贵州贵阳550004

目的:研究慢性氟中毒大鼠脑组织中过氧化物酶体增殖激活受体γ辅激活因子(PGC-1α)水平,探讨PGC-1α与学习记忆能力的关系。方法:SD大鼠60只,随机分为对照组(饮水含氟量<0. 5 mg/L)、低氟组(饮水含氟量为5. 0 mg/L)、高氟组(饮水含... 详细信息

目的:研究慢性氟中毒大鼠脑组织中过氧化物酶体增殖激活受体γ辅激活因子(PGC-1α)水平,探讨PGC-1α与学习记忆能力的关系。方法:SD大鼠60只,随机分为对照组(饮水含氟量<0. 5 mg/L)、低氟组(饮水含氟量为5. 0 mg/L)、高氟组(饮水含氟量为50. 0 mg/L),染氟时间分别为3个月及6个月;分别于染氟3月及6月时,用Morris水迷宫测定大鼠学习记忆能力,采用氟离子选择电极法测定大鼠血清氟含量,用蛋白印记方法检测大鼠海马及皮质组织中PGC-1α蛋白表达水平,分析大鼠海马及皮质PGC-1α蛋白水平与血清氟含量及空间学习记忆能力的相关性。结果:染氟大鼠逃避潜伏期较对照组显著延长、穿越平台次数及逗留平台象限时间明显缩短,以染氟6月组大鼠更明显(P <0. 05);血清氟含量随着染氟浓度的增高及染氟时间的延长而升高,高氟组大鼠血氟含量显著高于对照组,以染氟6月组大鼠尤为明显(P <0. 05);染氟大鼠海马区和皮质区的PGC-1α蛋白表达水平随着染氟浓度的增加和染氟时间的延长而逐渐下降,染氟6月组大鼠海马及皮质PGC-1α蛋白与血氟含量呈负相关(r=-0. 574、-0. 516,P <0. 05)、与大鼠逗留平台象限时间呈正相关(r=0. 76、0. 60,P <0. 05)、与逃避潜伏期呈负相关(r=-0. 542、-0. 58,P <0. 05)。结论:慢性氟中毒大鼠大脑组织PGC-1α蛋白表达水平降低,可能是氟中毒大鼠空间学习记忆能力降低的机制之一。

关键词：氟中毒过氧化物酶体增殖激活受体γ辅激活因子学习记忆能力脑组织大鼠 Sprague-Dawley

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CircRNA4736通过“海绵状”吸附miR-206调控Seipin介导的线粒体自噬在缺血性脑卒中再灌注损伤的分子机制

CircRNA4736通过“海绵状”吸附miR-206调控Seipin介导的线粒体自...

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2019全国老年痴呆与认知障碍相关疾病学术大会

作者：禹文峰贵州医科大学地方病与少数民族疾病教育部重点实验室贵州医科大学贵州省医学分子生物学重点实验室

目的缺血性脑卒中神经元损伤主要有2种形式:迟发性神经元坏死和凋亡。线粒体损伤和功能紊乱是脑缺血再灌注中导致神经元死亡的重要因素。因此,清除损伤的线粒体并避免对神经元造成更严重危害是缺血性脑卒中溶栓治疗后的再灌注损伤神经... 详细信息

目的缺血性脑卒中神经元损伤主要有2种形式:迟发性神经元坏死和凋亡。线粒体损伤和功能紊乱是脑缺血再灌注中导致神经元死亡的重要因素。因此,清除损伤的线粒体并避免对神经元造成更严重危害是缺血性脑卒中溶栓治疗后的再灌注损伤神经细胞保护的重要策略之一。内质网蛋白Seipin介导的线粒体自噬能够清除受损线粒体,但机制不清。本研究旨在探索circRNA4736是否竞争性吸附miR-206,解除miR-206对Seipin的抑制作用,从而上调Seipin蛋白的表达,促进Seipin介导的线粒体自噬,最终抑制神经元凋亡。方法通过RNA-seq检测PC12细胞正常组与OGD/R处理组中差异表达circRNA和miRNA的筛选及验证;构建circRNA4736和Seipin敲除、脑缺血再灌注的动物和细胞模型;检测目标circRNA4736、miR-206与靶基因Seipin内源性表达水平及其相关性;分析miR-206沉默对氧糖剥夺PC12细胞的影响;在PC12细胞中分析过表达circRNA4736通过充当"分子海绵"吸附miR-206,从而抑制miR-206对Seipin的阻碍作用;分析外源性circRNA4736对缺血再灌注损伤的神经细胞的保护作用。结果在Seipin-KO小鼠的MCAO模型发现,线粒体自噬水平较野生型小鼠MCAO模型显著降低;在Seipin敲低的PC12细胞经OGD/R处理后,线粒体自噬水平较野生型PC12细胞显著下降;PC12细胞Seipin缺失导致Akt-mTOR信号活性增加;通过全转录组测序分析获得了差异表达倍数最高的circRNA4736;同时我们发现,miR-206表达水平与circRNA4736呈负相关;双荧光素酶报告基因检测发现miR-206与circRNA4736和Seipin之间均具有相互结合位点,并且过表达circRNA4736或下调miR-206能够恢复Seipin表达及其介导的线粒体自噬;在PC12细胞的OGD/R模型中抑制miR-206水平,Seipin蛋白的表达得到回复,细胞纯化线粒体蛋白中P62和BNIP3的表达及Beclin-1和LC3Ⅱ/LC3Ⅰ均显著上调,即线粒体自噬增强;过表达circRNA4736能够有效促进OGD/R模型的PC12细胞Seipin的表达上调及显著抑制PC12细胞凋亡。结论Seipin及其介导的线粒体自噬可能作为缺血性脑卒中溶栓治疗后导致的缺血再灌注损伤的潜在研究靶点,外源性circRNA4736通过"海绵状"竞争性结合miR-206,解除miR206对Seipin的3'UTR区的抑制作用,从而重新激活Seipin蛋白生物学功能,进而促进Seipin介导的线粒体自噬,最终抑制神经元的凋亡。

关键词：环状RNA4736 微小RNA206 Seipin蛋白线粒体自噬脑缺血再灌注

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Seipin变化对6-OHDA诱导的PC12帕金森细胞模型自噬及凋亡的影响

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贵州医科大学学报 2021年第4期46卷 392-397,409页

作者：胡玉梅郭冬芬任真奎刘颖吴昌学禹文峰贵州医科大学分子生物学重点实验室贵州贵阳550004 贵州医科大学地方病与少数民族疾病教育部重点实验室贵州贵阳550004 贵州医科大学基础医学院贵州贵阳550004

目的探究Seipin蛋白对6-OHDA诱导的PC12帕金森细胞模型凋亡及自噬的影响。方法PC12细胞分为正常组和加药组(加入6-OHDA构建帕金森模型细胞);将前期构建成功的Seipin敲低及其敲低对照细胞株、Seipin过表达及其过表达对照细胞株分为Seipi... 详细信息

目的探究Seipin蛋白对6-OHDA诱导的PC12帕金森细胞模型凋亡及自噬的影响。方法PC12细胞分为正常组和加药组(加入6-OHDA构建帕金森模型细胞);将前期构建成功的Seipin敲低及其敲低对照细胞株、Seipin过表达及其过表达对照细胞株分为Seipin敲低对照组(KD-control)、Seipin敲低组(KD)、Seipin敲低对照加药组(KD-control+6-OHDA)及Seipin敲低加药组(KD+6-OHDA),Seipin过表达对照组(OE-control)、Seipin过表达组(OE)、Seipin过表达对照加药组(OE-control+6-OHDA)、Seipin过表达加药组(OE+6-OHDA);采用Western blot检测Seipin、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)、磷酸化mTOR(p-mTOR)、自噬相关蛋白Beclin1、微管相关蛋白1A/1B-轻链3(LC3-1A/B)及凋亡相关蛋白BCL2-Associated X蛋白质(Bax)、B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)、裂解型半胱氨酸水解酶3(Cleved caspase-3)蛋白表达水平。结果6-OHDA处理的PC12细胞中,与正常组比较,6-OHDA处理后Seipin表达降低、p-mTOR/mTOR的比值降低、Beclin1、LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ、Bax/Bcl-2、Cleved caspase-3的表达升高(P<0.01);在Seipin敲低后,KD相较于KD-control,p-mTOR/mTOR的比值升高、自噬相关蛋白Beclin1及LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ的表达均降低,凋亡相关蛋白Bax/Bcl-2和Cleved caspase-3表达均升高(P<0.05),过表达Seipin与敲低Seipin结果相反;加药处理后KD+6-OHDA相对KD-control+6-OHDA,Seipin含量降低,p-mTOR/mTOR的比值升高、自噬相关蛋白Beclin1及LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ的表达均降低,凋亡相关蛋白Bax/Bcl-2和Cleved caspase-3表达均升高(P<0.05);在Seipin过表达组中,过表达Seipin与敲低Seipin结果相反。结论6-OHDA诱导的细胞损伤可能是通过减少Seipin蛋白的表达实现,上调Seipin蛋白的表达可对6-OHDA诱导的细胞损伤具有抑制作用。

关键词：帕金森 6-羟基多巴胺氢溴酸盐 Seipin 自噬凋亡

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