检索结果-内蒙古大学图书馆

基因组学与应用生物学 2024年第9期43卷 1632-1645页

作者：王芳陈丽丹王赟胡祖权曾柱陈晋贵州医科大学基础医学院贵州省高等学校感染免疫与抗体工程重点实验室贵阳550025 贵州医科大学生物与工程学院(健康医药现代产业学院) 贵州省高等学校免疫细胞与抗体工程研究中心贵阳550025

羟基磷灰石(hydroxyapatite,HA)在骨修复和材料界面修饰中具有重要价值,但其在植入体内后可能会引起慢性炎症,而树突状细胞(dendritic cells,DCs)是调控慢性炎症反应的关键细胞,其表型和功能受材料表面结构影响。因此,本研究在构建HA表... 详细信息

羟基磷灰石(hydroxyapatite,HA)在骨修复和材料界面修饰中具有重要价值,但其在植入体内后可能会引起慢性炎症,而树突状细胞(dendritic cells,DCs)是调控慢性炎症反应的关键细胞,其表型和功能受材料表面结构影响。因此,本研究在构建HA表面台阶结构的基础上,分析其对未成熟树突状细胞(immature dendritic cells,imDCs)的细胞骨架结构、黏附形态以及mRNA表达谱的影响,以期为优化HA材料的表面结构设计提供一定的理论依据。利用取向连接生长原理制备出具有台阶结构的HA片材,并以此构建细胞培养模型。利用免疫荧光染色分析imDCs细胞骨架和黏附形态的变化,并采用转录组测序技术分析imDCs的mRNA表达谱的变化。结果显示,HA表面台阶结构的暴露会增加imDCs的铺展面积,并影响细胞黏附形态。转录组测序分析显示mRNA表达谱发生了变化,差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)主要富集到黏着斑信号通路、趋化因子信号通路、白介素-17信号通路等关键信号通路。因此,HA台阶结构可能通过黏着斑信号通路、趋化因子信号通路、白介素-17信号通路调控imDCs的形态特征和免疫学功能,进而影响免疫应答过程。

关键词：羟基磷灰石树突状细胞台阶结构转录组测序信号通路

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基于RNA-seq技术分析活性氧对未成熟树突状细胞迁移能力的促进作用

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基因组学与应用生物学 2024年第11期43卷 1859-1871页

作者：董美玲罗赵雅靖吴仪陈晋岳萍胡祖权曾柱王赟贵州医科大学基础医学院贵州省细胞免疫治疗工程研究中心贵阳550000 贵州医科大学生物与工程学院(健康医药现代产业学院) 贵州省普通高等学校免疫细胞与抗体工程研究中心贵阳550000

本研究在检测未成熟树突状细胞(immature dendritic cells,imDCs)响应胞外活性氧(reactive oxygen species,ROS)后的细胞周期和迁移能力基础上,通过RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术分析差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),探索ROS促进imDCs迁移的潜在机制。利用H_(2)O_(2)模拟ROS构建imDCs氧化应激模型,利用CCK8法检测细胞活力,采用流式细胞术检测细胞凋亡和细胞周期变化,利用细胞实时成像实验分析imDCs的自由迁移情况。提取总RNA并进行RNA-seq,对DEGs进行GO和KEGG富集分析,按照DEGs表达变化|log_(2)FC|且FDR≤0.01筛选代谢及骨架调节相关转录基因。结果表明,H_(2)O_(2)处理浓度小于100μmol/L时,imDCs的细胞活力和凋亡均无显著变化;imDCs在ROS环境中的细胞周期停滞在G0/G1期,且细胞的自由迁移能力增强。RNA-seq结果显示,H_(2)O_(2)处理组与对照组相比,共有282个DEGs,其中225个基因表达下调,57个基因表达上调。GO和KEGG分析发现这些基因参与了代谢、细胞周期和细胞骨架等相关通路,其中与异源物质代谢相关的Gsta1、Gsta3、Cstdc5和Prdx1等基因表达上调,Shmt2基因表达下调;参与骨架调节的S100a8、Ppbp和Tm4sf19等基因表达上调,而Nusap1、Stmn1、Kif20a和Prc1等基因表达下调。本研究表明,在imDCs响应胞外ROS过程中抗氧化系统激活、细胞骨架重塑与细胞周期停滞可能参与调控其迁移能力。

关键词：活性氧树突状细胞氧化应激细胞骨架细胞迁移

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失巢凋亡相关基因对子宫内膜癌患者预后状况的预测价值

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基因组学与应用生物学 2024年第4期43卷 697-707页

作者：刘凯凤韦现鹏欧阳燕胡祖权岳萍曾柱贵州医科大学基础医学院贵州省感染免疫与抗体工程特色重点实验室贵州省细胞免疫治疗工程研究中心贵阳550025 贵州医科大学生物与工程学院(健康医药现代产业学院) 贵州医科大学生物与医学工程重点实验室贵州省高等学校免疫细胞与抗体工程研究中心贵阳550025

子宫内膜癌(uterine corpus endometrial carcinoma,UCEC)是最常见的女性生殖系统肿瘤,肿瘤发生远端转移的患者预后极差。失巢凋亡(anoikis)是一种特殊的程序性细胞死亡形式,在肿瘤的侵袭和转移中起着关键作用,分析失巢凋亡相关基因与U... 详细信息

子宫内膜癌(uterine corpus endometrial carcinoma,UCEC)是最常见的女性生殖系统肿瘤,肿瘤发生远端转移的患者预后极差。失巢凋亡(anoikis)是一种特殊的程序性细胞死亡形式,在肿瘤的侵袭和转移中起着关键作用,分析失巢凋亡相关基因与UCEC患者预后之间的关系将为临床治疗提供指导。本研究采用非监督一致性聚类算法对数据集进行分组,分析患者的肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)与临床特征的差异。同时,筛选预后相关的失巢凋亡基因,构建风险评分模型,评估UCEC患者的风险评分与临床特征、TME和药物治疗反应之间的关系。在分析失巢凋亡相关基因表达差异的基础上确定两个明确的聚类(A簇和B簇),与A簇UCEC患者相比,B簇UCEC患者的总生存期较短、免疫浸润水平较低。构建的风险评分模型可量化失巢凋亡相关基因的调控模式,高风险评分组表现为预后不良且免疫细胞浸润水平低,而低风险评分组则相反。药物敏感性分析结果表明,高风险评分的人群可能从靶向有丝分裂和DNA修复通路的药物中获得更佳疗效。本研究揭示了失巢凋亡相关基因与临床特征、TME和药物治疗反应之间的潜在关系,并阐明了其在UCEC治疗中的价值。

关键词：子宫内膜癌肿瘤微环境失巢凋亡风险评分模型预后价值

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DC-CIK免疫治疗联合化疗治疗血液恶性肿瘤的安全性和有效性分析

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基因组学与应用生物学 2024年第3期43卷 504-521页

作者：熊华毅余鹏刘鲜梅宋咏刚胡祖权曾柱贵州医科大学生物与工程学院(健康医药现代产业学院) 贵州省高等学校免疫细胞与抗体工程研究中心/生物与医学工程重点实验室贵阳550025 贵州医科大学基础医学院贵州省高等学校感染免疫与抗体工程重点实验室贵阳550025

本研究旨在研究树突状细胞-细胞因子诱导的杀伤细胞(dendritic cell and cytokine-induced killer cell,DC-CIK)免疫治疗联合化疗治疗血液恶性肿瘤的临床疗效。本研究从PubMed、Web of Science、The Cochrane Library、Embase、CNKI、WanFang Data、SinoMed和VIP等数据库中,收集2000年1月至2023年2月发表的符合要求的随机对照研究,应用RevMan 5.4.1软件进行Meta分析。共纳入15篇文献,894例患者,包括686例骨髓瘤患者和208例白血病患者,其中DC-CIK免疫治疗联合化疗治疗组共451例,设置为联合治疗组,而单纯化疗组共443例,设置为化疗(对照)组。分析结果显示,联合治疗组在临床疗效、预后情况、生活质量及各项免疫指标(T淋巴细胞亚群分布和细胞因子分泌水平)等方面均优于化疗组,且不会给患者带来特异性的副作用。研究结果表明,DC-CIK免疫治疗联合化疗能够改善恶性血液肿瘤患者的免疫功能,增强机体的抗肿瘤能力,从而显著提高临床治疗的效果。

关键词：树突状细胞-细胞因子诱导的杀伤细胞联合治疗血液恶性肿瘤 Meta分析

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基于R语言PMCMRplus包实现完全随机设计资料Nemenyi秩和检验

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中国卫生统计 2023年第6期40卷 954-955页

作者：靳帅叶远浓贵州医科大学生物与工程学院(健康医药现代产业学院) 550025 贵州省普通高等学校免疫细胞与机体工程研究中心

目的利用R语言PMCMRplus包实现数值变量或等级资料多个独立样本两两比较的Nemenyi检验,为广大研究人员实现Nemenyi法检验提供参考。方法利用医学统计学教材和文献中的相关数据,演示用PMCMRplus包实现Krukal-Wallis检验和Nemenyi检验的... 详细信息

目的利用R语言PMCMRplus包实现数值变量或等级资料多个独立样本两两比较的Nemenyi检验,为广大研究人员实现Nemenyi法检验提供参考。方法利用医学统计学教材和文献中的相关数据,演示用PMCMRplus包实现Krukal-Wallis检验和Nemenyi检验的过程和代码。结果R语言PMCMRplus包方便地实现了数值变量多个独立样本两两比较的Nemenyi检验,且能输出精确的χ2值和P值。结论R语言PMCMRplus包进行Nemenyi检验过程与代码易于解读、具有可操作性,为研究人员提供了实用的操作参考。

关键词： R语言 PMCMRplus包 Nemenyi检验 Krukal-Wallis检验

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DC-CIK免疫治疗联合化疗治疗血液恶性肿瘤的Meta分析

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基因组学与应用生物学 2023年

作者：熊华毅余鹏刘鲜梅宋咏刚胡祖权曾柱贵州医科大学生物与工程学院(健康医药现代产业学院)贵州省高等学校免疫细胞与抗体工程研究中心/生物与医学工程重点实验室贵州医科大学基础医学院贵州省高等学校感染免疫与抗体工程重点实验室

本研究旨在研究树突状细胞-细胞因子诱导的杀伤细胞（dendritic cell and cytokine-induced killer cell，DC-CIK）免疫治疗联合化疗治疗血液恶性肿瘤的临床疗效。本研究从PubMed、Web of Science、The Cochrane Library、Embase、CNKI、WanFang Data、SinoMed和VIP等数据库中，收集2000年1月至2023年2月发表的符合要求的随机对照研究，应用RevMan 5.4.1软件进行Meta分析。共纳入15篇文献，894例患者，包括686例骨髓瘤患者和208例白血病患者，其中DC-CIK免疫治疗联合化疗治疗组共451例，设置为联合治疗组，而单纯化疗组共443例，设置为对照组。分析结果显示，联合治疗组在临床疗效、预后情况、生活质量及各项免疫指标（T淋巴细胞亚群分布和细胞因子分泌水平）等方面均优于单纯化疗治疗组，且不会给患者带来特异性的副作用。研究结果表明，DC-CIK免疫治疗联合化疗能够改善恶性血液肿瘤患者的免疫功能，增强机体的抗肿瘤能力，从而显著提高临床治疗的效率。

关键词：树突状细胞-细胞因子诱导的杀伤细胞联合治疗血液恶性肿瘤 Meta分析

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基于抗体融合荧光蛋白的镰刀菌免疫检测技术

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基因组学与应用生物学 2024年第11期43卷 1850-1858页

作者：闫瑜雪尚国富陈绍美喻艳琴胡祖权艾民彭晓燕贵州医科大学公共卫生与健康学院环境污染与疾病监控教育部重点实验室贵阳550000 贵州医科大学基础医学院贵州省感染免疫与抗体工程特色重点实验室贵阳550000 贵州医科大学生物与工程学院(健康医药现代产业学院) 贵州省高等学校免疫细胞与抗体工程研究中心贵阳550000

镰刀菌(Fusarium)是一类重要的植物病原菌和临床上常见的致病真菌,为实现镰刀菌的快速灵敏检测,本研究通过基因工程操作技术将编码抗镰刀菌单链抗体(single-chain variable fragment,scFv)FvSG7的基因与mNenoGreen(mNG)绿色荧光蛋白和Na... 详细信息

镰刀菌(Fusarium)是一类重要的植物病原菌和临床上常见的致病真菌,为实现镰刀菌的快速灵敏检测,本研究通过基因工程操作技术将编码抗镰刀菌单链抗体(single-chain variable fragment,scFv)FvSG7的基因与mNenoGreen(mNG)绿色荧光蛋白和NanoLuc(NLuc)荧光素酶基因构建融合表达载体,优化原核表达条件后进行大量表达纯化;利用SDS-PAGE和Western blot检测融合蛋白FvSG7-mNG-NL的表达情况;利用免疫荧光分析融合蛋白与镰刀菌菌丝的结合特性;利用酶联免疫吸附测定实验(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)分析融合蛋白与镰刀菌抗原的结合能力。结果显示,融合荧光蛋白FvSG7-mNG-NL的原核表达载体构建成功,并实现可溶性高效表达。FvSG7-mNG-NL保留单链抗体、荧光素酶以及荧光蛋白的活性,可通过生物发光共振能量转移(bioluminescence resonance energy transfer,BRET)增强发光成像。本研究为发展镰刀菌的灵敏快速免疫检测技术奠定了实验基础。

关键词：镰刀菌单链抗体荧光素酶融合蛋白免疫学检测

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非靶向脂质组学分析伏马菌素B1对未成熟树突状细胞脂质代谢的影响

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基因组学与应用生物学 2023年第3期42卷 327-336页

作者：唐开义于欢喻艳琴欧沙王赟曾柱胡祖权贵州医科大学基础医学院贵州省高等学校感染免疫与抗体工程重点实验室贵阳550025 贵州医科大学生物与工程学院(健康医药现代产业学院) 贵州省高等学校免疫细胞与抗体工程研究中心/生物与医学工程重点实验室贵阳550025

伏马菌素B1(fumonisin B1,FB1)是一种具有免疫抑制作用的真菌毒素。本研究利用FB1处理未成熟树突状细胞(immature dendritic cells,imDCs),通过非靶向脂质组学分析FB1对imDCs脂质代谢的影响。运用超高效液相色谱串联四极杆静电场轨道阱... 详细信息

伏马菌素B1(fumonisin B1,FB1)是一种具有免疫抑制作用的真菌毒素。本研究利用FB1处理未成熟树突状细胞(immature dendritic cells,imDCs),通过非靶向脂质组学分析FB1对imDCs脂质代谢的影响。运用超高效液相色谱串联四极杆静电场轨道阱质谱(UPLC-Q-Exactive Orbitrap-MS)技术采集质谱数据,通过主成分分析(principal component analysis,PCA)、偏最小二乘法判别分析(partial least-squares discrimination analysis,PLS-DA)和正交偏最小二乘法判别分析(orthogonal partial least-squares discrimination analysis,OPLS-DA)进行多维统计分析,比较FB1处理组和对照组之间脂质代谢谱的差异,并以OPLS-DA模型的变量权重值(variable importance for the projection,VIP)>1和P<0.05为标准筛选差异脂质分子。脂质组学分析结果显示,从imDCs中共检测到36个脂质亚类,1845个脂质分子。从FB1处理的imDCs中筛选出30个显著性差异脂质分子,其中神经酰胺(ceramide,Cer)、磷酸神经酰胺(ceramide phosphate,CerP)、单半乳糖甘油二酯(monogalactosyldiacylglycerol,MGDG)、磷脂酰胆碱(phosphatidylcholine,PC)、鞘氨醇(sphingosine,So)、磷脂酰丝氨酸(phosphatidylserine,PS)和鞘磷脂(sphingomyelin,SM)等亚类的含量显著下降(VIP>1,P<0.05),而甘油二酯(diacylglycerol,DG)和磷脂酰肌醇(phosphatidylinositol,PI)的含量显著升高(VIP>1,P<0.05)。研究结果说明FB1可能通过干扰imDCs的正常脂质代谢来发挥其免疫抑制作用。

关键词：伏马菌素B1 树突状细胞脂质组学脂质代谢物鞘脂代谢

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微丝骨架结合蛋白在未成熟树突状细胞抗原吞噬过程中的差异表达分析

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医用生物力学 2024年第5期39卷 814-822页

作者：李道红罗代琴曾宪琳张帅徐朴吴翠芳王赟叶远浓胡祖权龙金华曾柱贵州医科大学基础医学院、贵州省细胞免疫治疗工程技术中心/贵州省感染免疫与抗体工程特色重点实验室贵阳550025 贵州医科大学生物与工程学院(健康医药现代产业学院、贵州省高等学校免疫细胞与抗体工程研究中心生物与医学工程重点实验室)贵阳550025 贵州医科大学附属医院介入科贵阳550004 贵州医科大学大健康学院医学信息学教研室生物信息学与生物医学大数据智能挖掘实验室贵阳550025 贵州医科大学附属肿瘤医院头颈肿瘤科贵阳550000

目的探讨未成熟树突状细胞(immature dendritic cells,imDCs)发挥抗原吞噬功能时关键微丝骨架结合蛋白(microfilament cytoskeleton-binding proteins,MCBPs)的差异表达情况。方法从健康人外周血中分离单核细胞(monocytes,MOs),经重组人粒-巨噬细胞集落刺激因子(recombinant human granulocyte-macrophage colony stimulating factor,rhGM-CSF)、重组人白介素-4(recombinant human interleukin-4,rhIL-4)诱导培养6天获得imDCs;将imDCs与低分子量(40 kDa)和高分子量(150 kDa)的右旋糖酐分别孵育1、3和6 h,流式细胞仪检测imDCs吞噬右旋糖酐的比率及免疫表型分子的表达;免疫荧光检测丝状肌动蛋白(filamentous actin,F-actin)及PFN1、WASP、α-actinin在细胞中的定位情况;qPCR和Western blotting分别检测MCBPs在mRNA和蛋白水平的表达差异;最后,基于系统生物学算法中的逐步回归和主成分分析方法筛选成分系数最大的MCBPs。结果在吞噬抗原的过程中,imDCs对低分子量抗原的吞噬速度更快,吞噬时长可维持约3 h,其细胞表型和细胞形态逐渐向mDCs分化,且F-actin发生明显的重塑,PFN1、CDM、WASP、CAPZB、Filamin A、α-actinin等MCBPs的表达下调,WAVE1、Arp2/3复合体、Fascin的表达上调;信号蛋白Rac1的mRNA表达上调,CDC42和RhoA的mRNA表达下调;免疫荧光结果显示,PFN1、WASP、α-actinin在imDCs吞噬抗原过程中发生转位;逐步回归和主成分分析结果显示PFN1的成分系数最大。结论PFN1可能是imDCs吞噬抗原过程中的关键MCBPs,这对于深入理解imDCs细胞骨架结构变化与免疫学功能之间的关系具有重要意义。

关键词：未成熟树突状细胞吞噬微丝骨架微丝骨架结合蛋白系统生物学

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乳酸对小鼠未成熟树突状细胞影响的基因芯片分析

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贵州师范大学学报（自然科学版） 2024年第4期42卷 108-116页

作者：赵茂黄瑾刘新宇邱炜贵州医科大学生物与工程学院(健康医药现代产业学院) 贵州贵阳550025

研究乳酸对小鼠未成熟树突状细胞(imDCs)基因组表达水平的影响,为深入研究病理酸性微环境对imDCs免疫功能影响的分子机制提供前期数据。从C57BL/6J小鼠骨髓中分离单核细胞,并诱导其分化为imDCs。20 mmol/L浓度乳酸处理imDCs 24 h,利用BG... 详细信息

研究乳酸对小鼠未成熟树突状细胞(imDCs)基因组表达水平的影响,为深入研究病理酸性微环境对imDCs免疫功能影响的分子机制提供前期数据。从C57BL/6J小鼠骨髓中分离单核细胞,并诱导其分化为imDCs。20 mmol/L浓度乳酸处理imDCs 24 h,利用BGISEQ平台进行基因芯片分析,筛选出差异表达基因。结果显示,20 mmol/L浓度乳酸处理使imDCs中表达发生变化的基因有915个。通过基因本体论(GO)分析发现差异表达基因参与细胞骨架、凋亡过程及免疫反应等;京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析发现差异表达基因涉及的信号通路包括MAPK信号通路、PI3K-AKT信号通路及TOLL样受体信号通路等。利用Cytoscape软件构建差异表达蛋白之间的互作网络图,并根据节点数筛选关键差异表达蛋白。筛选出分化抗原簇38(CD38)、3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGCR)等上调关键差异表达蛋白和信号转导和趋化因子受体7(CCR7)、转录激活因子1(STAT1)等下调关键差异表达蛋白。

关键词：乳酸未成熟树突状细胞基因芯片 GO分析 KEGG分析

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