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基于16S rRNA基因测序技术分析猪链球菌2型感染BALB/c小鼠粪便样本中微生物的变化

微生物学报 2020年第5期60卷 963-971页

作者：王小敏徐鹏饶传王微微杨秋丽熊久先遵义医科大学微生物学教研室贵州遵义563000

【目的】通过研究粪便样本的微生物特点间接探讨猪链球菌2型感染BALB/c小鼠后肠道微生物的变化。【方法】本研究采用IlluminaMiSeq测序技术,测定了健康小鼠和猪链球菌2型感染小鼠粪便中微生物16S rRNA V3-V4区序列,并对群落结构和多样... 详细信息

【目的】通过研究粪便样本的微生物特点间接探讨猪链球菌2型感染BALB/c小鼠后肠道微生物的变化。【方法】本研究采用IlluminaMiSeq测序技术,测定了健康小鼠和猪链球菌2型感染小鼠粪便中微生物16S rRNA V3-V4区序列,并对群落结构和多样性进行了比较分析。【结果】多样性分析表明,感染组和对照组小鼠的粪便中微生物多样性和群落组成均不相同,存在较大的差异,感染组展示了较高的物种丰度和种群差异性。在门水平上,相对于对照组,感染组增加厚壁菌门和拟杆菌门等有益微生物比例,以提高机体免疫力,但也同时增加了变形杆菌等条件致病菌的比例,增加了疾病发生的可能性。在科水平上,感染组和对照组优势菌均含有瘤胃菌科,但其所占细菌总序列的比例存在较大的差异,分别占感染组和对照组细菌总序列的36.58%和11.02%。在属水平上,感染组和对照组的优势菌属类别及占总微生物比例存在显著的差异。感染组主要以瘤胃菌科UCG-002和乳酸杆菌属为优势菌属,对照组以螺旋体科GWE2-31-10和密螺旋体属2为优势菌属。综上,BALB/c小鼠感染猪链球菌2型后存在肠道微生态失调。【结论】通过本研究,不仅对猪链球菌2型感染后小鼠的粪便微生物多样性和组成种类有了一定的认识,而且为今后筛选有益微生物、通过调整微生物治疗猪链球菌2型感染提供了依据。

关键词：猪链球菌2型粪便微生物 16S rRNA基因测序技术

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胶原水凝胶在HepG2.2.15细胞三维培养中的应用研究

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中国病原生物学杂志 2021年第5期16卷 531-535,539页

作者：敖弟书徐运娥孙欣宋鸿遵义医科大学微生物学教研室贵州遵义563099

目的了解用胶原水凝胶为支架构建HBV转染细胞HepG2.2.15的三维(three-dimensiona,3D)培养模型的应用情况。方法采用扫描电镜(SEM)和原子力显微镜(AFM)观察水凝胶内胶原纤维的结构特征,以胶原水凝胶为支架建立HepG2.2.15细胞3D培养模型... 详细信息

目的了解用胶原水凝胶为支架构建HBV转染细胞HepG2.2.15的三维(three-dimensiona,3D)培养模型的应用情况。方法采用扫描电镜(SEM)和原子力显微镜(AFM)观察水凝胶内胶原纤维的结构特征,以胶原水凝胶为支架建立HepG2.2.15细胞3D培养模型。采用倒置显微镜观察细胞形态特征;采用MTS法和钙黄绿素-AM(Ca-AM)染色法检测细胞的增殖活性;采用ELISA法检测细胞HBsAg、HBeAg的分泌;采用荧光探针PCR法检测HBV DNA的表达。结果HepG2.2.15细胞在96孔板胶原水凝胶中能培养45d,在24孔板内培养则长达160d,且生长良好,并能维持转染细胞特性,持续分泌HBsAg、HBeAg和HBV DNA。结论建立的胶原水凝胶HepG2.2.15细胞3D培养模型能长时间维持细胞增殖。

关键词：胶原水凝胶三维培养 HBV HepG2.2.15细胞

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C57BL/6小鼠外周淋巴组织和肝脏中CD11c^(+)B220^(+)NK细胞分析

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细胞与分子免疫学杂志 2022年第2期38卷 116-121页

作者：王玉袁欣秦欢徐运娥孙欣遵义医科大学微生物学教研室贵州遵义563000

目的研究CD11c^(+)B220^(+)自然杀伤(NK)细胞在外周淋巴组织和肝脏中的分布及其表面浆细胞样树突状细胞抗原1(PDCA-1)分子的表达情况。方法采集C57BL/6小鼠脾脏、淋巴结和肝脏组织,制备单个核细胞悬液,通过多色流式细胞术检测3个组织器... 详细信息

目的研究CD11c^(+)B220^(+)自然杀伤(NK)细胞在外周淋巴组织和肝脏中的分布及其表面浆细胞样树突状细胞抗原1(PDCA-1)分子的表达情况。方法采集C57BL/6小鼠脾脏、淋巴结和肝脏组织,制备单个核细胞悬液,通过多色流式细胞术检测3个组织器官中CD11c^(+)B220^(+)NK细胞的比例及其表面PDCA-1分子的表达情况。结果脾脏、淋巴结和肝脏均存在CD11c^(+)B220^(+)NK细胞,在脾脏中比例最高,达到(2.82±0.45)%。3个组织中均有部分CD11c^(+)B220^(+)NK细胞表达PDCA-1,脾脏最明显。结论CD11c^(+)B220^(+)NK细胞是小鼠外周淋巴组织和肝脏中NK细胞的重要亚群,因组织不同其表面PDCA-1表达存在差异。

关键词：脾脏淋巴结肝脏 CD11c^(+)B220^(+)NK细胞浆细胞样树突状细胞抗原1(PDCA-1)

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天然化合物抑制单核细胞增生李斯特菌生物被膜的研究进展

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医学研究与战创伤救治 2024年第8期37卷 891-896页

作者：李雅笛郭荣芳(综述) 王玉(审校) 遵义医科大学微生物学教研室遵义563000

单核细胞增生李斯特菌(Lm)生物被膜抵抗抗菌药物和消毒剂的清除作用,导致食品的持续性污染和感染的发生。天然化合物来源广泛,种类繁多,是理想的单核细胞增生李斯特生物被膜清除剂。文章主要就单核细胞增生李斯特菌生物被膜形成过程中... 详细信息

单核细胞增生李斯特菌(Lm)生物被膜抵抗抗菌药物和消毒剂的清除作用,导致食品的持续性污染和感染的发生。天然化合物来源广泛,种类繁多,是理想的单核细胞增生李斯特生物被膜清除剂。文章主要就单核细胞增生李斯特菌生物被膜形成过程中的调控机制;天然化合物抑制单核细胞增李斯特菌生物被膜的作用机理及研究现状进行综述,旨在为单核细胞增李斯特菌生物被膜的防控提供参考。

关键词：单核细胞增生李斯特菌生物被膜调控机制天然化合物

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BCG感染树突状细胞的转录组测序和分析

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中国人兽共患病学报 2022年第12期38卷 1072-1079页

作者：孙巧玲袁欣王玉遵义医科大学基础医学院微生物学教研室遵义563003

目的通过转录组学筛选DC2.4细胞内BCG感染相关的差异表达基因和信号通路,为探索DC细胞抗分枝杆菌的胞内免疫机制提供科学依据。方法以小鼠DC2.4细胞作为细胞模型,设置感染组和未感染组,感染组经BCG(MOI=2)感染,培养24 h后收集细胞,采用... 详细信息

目的通过转录组学筛选DC2.4细胞内BCG感染相关的差异表达基因和信号通路,为探索DC细胞抗分枝杆菌的胞内免疫机制提供科学依据。方法以小鼠DC2.4细胞作为细胞模型,设置感染组和未感染组,感染组经BCG(MOI=2)感染,培养24 h后收集细胞,采用转录组测序技术(RNA-Seq)检测感染组和未感染组mRNA表达谱并结合生物信息学分析方法,筛选树突状细胞内与BCG感染相关的差异表达基因并进行qRT-PCR验证。结果与未感染组相比,感染组差异表达基因共有27个(P<0.05),其中26个上调基因,1个下调基因。通过GO和KEGG富集分析发现差异基因参与炎症反应、免疫系统过程等;TNF信号通路、IL-17信号通路以及细胞因子与细胞因子受体信号通路等参与BCG胞内感染过程。qRT-PCR验证与BCG感染相关的差异表达基因与转录组数据趋势一致。结论BCG感染树突状细胞后,能够激发宿主细胞炎症反应和免疫应答,TNF、IL-17等信号通路参与BCG胞内感染过程。

关键词：卡介苗树突状细胞转录组测序 mRNA

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小GTP酶Rab9蛋白的功能及其在疾病中的研究进展

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医学研究与战创伤救治 2023年第9期36卷 974-977页

作者：李雅笛(综述) 王玉(审校) 遵义医科大学微生物学教研室遵义563000

小GTP酶Rab9定位于胞内反式高尔基体网络和晚期内吞体,在维持细胞稳态中发挥重要的调控作用。Rab9能够与其互作蛋白结合,调控细胞内膜转运、自噬和信号转导,从而将Rab9与细胞内受体和脂质转运、凋亡等重要生理功能相联系。研究表明调控R... 详细信息

小GTP酶Rab9定位于胞内反式高尔基体网络和晚期内吞体,在维持细胞稳态中发挥重要的调控作用。Rab9能够与其互作蛋白结合,调控细胞内膜转运、自噬和信号转导,从而将Rab9与细胞内受体和脂质转运、凋亡等重要生理功能相联系。研究表明调控Rab9表达能够影响其介导的生理功能,进而影响多种疾病的发生发展,包括感染性疾病、肿瘤、遗传性疾病等。文章主要就Rab9蛋白的结构特征、分子功能及其在疾病发生发展中的复杂作用进行综述。

关键词： Rab9 内膜转运自噬病原体感染肿瘤

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金黄色葡萄球菌生物被膜耐药机制研究进展

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中国感染控制杂志 2023年第2期22卷 244-248页

作者：曾建业陈丹丹王俣棋吕纯莉王小敏遵义医科大学基础医学院微生物学教研室贵州遵义563000

金黄色葡萄球菌是常见的引起医院感染和社区感染的致病菌之一。近年来,临床上金黄色葡萄球菌抗感染治疗失败的病例越来越多,生物被膜的形成被认为是导致抗菌药物治疗失败的主要原因。然而,金黄色葡萄球菌生物被膜的耐药机制并未完全阐... 详细信息

金黄色葡萄球菌是常见的引起医院感染和社区感染的致病菌之一。近年来,临床上金黄色葡萄球菌抗感染治疗失败的病例越来越多,生物被膜的形成被认为是导致抗菌药物治疗失败的主要原因。然而,金黄色葡萄球菌生物被膜的耐药机制并未完全阐明。证据表明,金黄色葡萄球菌生物被膜感染难以治愈且容易反复,感染后反复治疗将大大增加患者的痛苦和经济负担。本文对金黄色葡萄球菌生物被膜耐药机制的研究进展进行综述,以期为开发新的抗菌药物提供参考依据。

关键词：金黄色葡萄球菌生物被膜耐药机制生物被膜感染

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慢性炎性疼痛对小鼠肠道菌群的影响

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安徽医科大学学报 2022年第1期57卷 138-143页

作者：王小敏徐鹏王俣棋曾建业周思宸邢承志胡翔宇吴亚男张昳若范红结遵义医科大学基础医学院微生物学教研室遵义563000

目的探究慢性炎性疼痛对小鼠肠道菌群多样性和结构的影响。方法选取SPF级雌性C57BL/6J小鼠12只,随机分为CFA组和Mock组,每组6只;Mock组右后足底皮下注射50μl的0.9%氯化钠溶液,CFA组右后足底皮下注射50μl的CFA作为慢性炎性疼痛模型组。... 详细信息

目的探究慢性炎性疼痛对小鼠肠道菌群多样性和结构的影响。方法选取SPF级雌性C57BL/6J小鼠12只,随机分为CFA组和Mock组,每组6只;Mock组右后足底皮下注射50μl的0.9%氯化钠溶液,CFA组右后足底皮下注射50μl的CFA作为慢性炎性疼痛模型组。2周后,安乐死小鼠,解剖后取结肠内粪便,组内两只小鼠结肠内粪便进行混样,采用16S rRNA高通量基因测序技术检测分析肠道菌群多样性和结构。结果两组小鼠在肠道菌群构成上差异明显。与Mock组相比,CFA组肠道菌群丰富度及多样性降低;门水平上,厚壁菌门和TM7丰度升高;科、属水平上,气球菌属、乳酸杆菌属和脱硫弧菌属丰度显著升高,嗜冷杆菌属、普雷沃氏菌属、颤螺菌属和双歧杆菌属丰度明显降低;从门到属主要分类等级上,发现的生物标志物较多。结论慢性炎性疼痛的小鼠肠道菌群结构尤其是优势菌群结构发生了明显变化,这些数据可为慢性炎性疼痛导致的微生态失衡的治疗及通过“肠-脑轴”改善患者消极情绪提供依据。

关键词：高通量测序慢性炎性疼痛肠道菌群多样性

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流感病毒聚合酶碱性蛋白1相关宿主因子研究进展

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中华微生物学和免疫学杂志 2023年第11期43卷 860-867页

作者：刘浩如王盛羽孙欣宋鸿遵义医科大学基础医学院微生物学教研室遵义563000 遵义医科大学贵州省普通高等学校传染病与生物安全重点实验室遵义563000

流感病毒严重危害人类健康,对社会发展造成重大影响,成为世界公共卫生安全隐患。因此,了解流感病毒的生命周期能够为抗病毒感染提供策略。感染病毒的宿主细胞会通过启动固有免疫系统来抵御病毒的入侵,而病毒与宿主因子的关系是密不可分... 详细信息

流感病毒严重危害人类健康,对社会发展造成重大影响,成为世界公共卫生安全隐患。因此,了解流感病毒的生命周期能够为抗病毒感染提供策略。感染病毒的宿主细胞会通过启动固有免疫系统来抵御病毒的入侵,而病毒与宿主因子的关系是密不可分的,在流感病毒生命周期中的各个阶段都需要宿主因子的参与并对流感病毒的增殖产生不同的效应。聚合酶碱性蛋白1(polymerase basic protein 1,PB1)为RNA聚合酶亚基,是流感病毒复制和转录过程中的关键病毒蛋白。本综述总结了不同的宿主因子与PB1发生相互作用,进而调节流感病毒的复制、传播与致病性,为抗病毒药物的研发提供新思路。

关键词：流感病毒宿主因子聚合酶碱性蛋白1

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类器官在人类病毒研究中的应用进展

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医学研究与战创伤救治 2023年第6期36卷 644-648页

作者：徐运娥敖弟书(综述) 宋鸿(审校) 遵义医科大学基础医学院微生物学教研室遵义563099

病毒是危害人类健康的重要病原体,由于缺乏能再现病毒自然感染过程的体外研究模型,这为深入研究病毒致病机制、宿主-病毒之间相互作用等带来了巨大挑战,严重阻碍了病毒致病机制的研究、抗病毒药物的筛选和疫苗的开发。类器官技术能在体... 详细信息

病毒是危害人类健康的重要病原体,由于缺乏能再现病毒自然感染过程的体外研究模型,这为深入研究病毒致病机制、宿主-病毒之间相互作用等带来了巨大挑战,严重阻碍了病毒致病机制的研究、抗病毒药物的筛选和疫苗的开发。类器官技术能在体外构建模拟体内组织结构和生理功能的实验模型,被认为是目前最具潜力的病毒感染研究模型。文章就类器官在病毒体外培养、宿主-病毒相互作用、病毒致病机制及抗病毒药物筛选等研究中的应用进展作一综述。

关键词：类器官病毒研究感染模型

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