检索结果-内蒙古大学图书馆

基于酵母双杂交技术对与纳尔逊海湾正呼肠孤病毒σNS相互作用宿主蛋白的筛选

吉林大学学报（医学版） 2024年第5期50卷 1313-1321页

作者：孙绿茵马竹萍李润林李永刚陶晓莉锦州医科大学基础医学院病原生物学教研室辽宁锦州121000

目的:探讨小鼠成纤维L929细胞中与纳尔逊海湾正呼肠孤病毒(NBV)σNS蛋白相互作用(互作)的宿主蛋白,阐明宿主蛋白对病毒复制的影响。方法:构建表达σNS蛋白的诱饵质粒pGBKT7-S3,采用测序技术验证诱饵质粒在Y2H酵母细胞中的准确表达。将pG... 详细信息

目的:探讨小鼠成纤维L929细胞中与纳尔逊海湾正呼肠孤病毒(NBV)σNS蛋白相互作用(互作)的宿主蛋白,阐明宿主蛋白对病毒复制的影响。方法:构建表达σNS蛋白的诱饵质粒pGBKT7-S3,采用测序技术验证诱饵质粒在Y2H酵母细胞中的准确表达。将pGBKT7-S3和pGADT7质粒分别和共同转化至Y2HGold酵母细胞中,涂布于固体培养基进行培养,观察菌落生长情况,确认σNS蛋白对酵母细胞无毒性,不能自行激活报告基因。诱饵质粒pGBKT7-S3与小鼠成纤维L929细胞的cDNA文库进行杂交,对编码互作蛋白的阳性克隆进行质粒抽提,阳性测序结果通过Uniprot数据库检索筛选得到与NBVσNS互作的蛋白。对互作蛋白进行基因本体论(GO)功能富集分析、京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析和STRING生物信息学分析。结果:成功筛选出61个阳性克隆。DNA测序分析和BLAST比对分析去除23个未匹配到数据库和测序基本相同的阳性克隆。阳性测序结果通过Uniprot数据库检索筛选得到38个与NBVσNS互作的蛋白,31个蛋白参与细胞生物过程,36个蛋白是细胞解剖成分,31个蛋白具有结合功能,5个蛋白是线粒体呼吸链组成部分,7个蛋白是核糖体蛋白和核糖体大小亚基的组成部分,2个蛋白参与铁代谢稳态。GO功能富集分析,互作蛋白参与的生物过程(BP)富集在细胞过程、代谢过程、生物学调节、定位和对刺激的反应等;细胞组分主要是细胞解剖成分和含蛋白复合物;分子功能集中在结合、催化活性、结构分子活性和转运活性等方面。KEGG信号通路富集分析,蛋白在遗传信息处理途径的翻译、折叠、分类和降解信号通路中高度富集,在机体系统中主要与消化系统有关联;与多种病毒性传染病和癌症有关联。STRING分析,互作蛋白涉及核糖体蛋白类、蛋白修饰类、代谢类和免疫蛋白类等功能蛋白。结结论论:成功筛选出与NBVσNS蛋白互作的蛋白,宿主蛋白在病毒复制中具有重要作用。

关键词：纳尔逊海湾正呼肠孤病毒酵母双杂交实验 σNS蛋白蛋白互相作用生物信息学

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异烟肼对脓肿分枝杆菌L型的诱导作用

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南方医科大学学报 2013年第7期33卷 1036-1040页

作者：范贵荣杨致邦黄进重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室//基础医学实验教学中心//病原生物学与免疫实验室重庆400016

目的探讨异烟肼对脓肿分枝杆菌L型的诱导作用。方法将脓肿分枝杆菌分别接种于含128μg/ml异烟肼和无异烟肼的结核分枝杆菌快速液体培养基中培养。含异烟肼的培养物经0.45μm孔径滤膜过滤,滤液接种于无异烟肼的结核分枝杆菌快速液体培养... 详细信息

目的探讨异烟肼对脓肿分枝杆菌L型的诱导作用。方法将脓肿分枝杆菌分别接种于含128μg/ml异烟肼和无异烟肼的结核分枝杆菌快速液体培养基中培养。含异烟肼的培养物经0.45μm孔径滤膜过滤,滤液接种于无异烟肼的结核分枝杆菌快速液体培养基内返祖培养。将含异烟肼和无异烟肼的培养物及返祖菌进行细胞壁染色和透射电镜观察其细胞壁完整性,扫描电镜观察其表面微观结构。含异烟肼的培养物转种L型菌琼脂平板培养,无异烟肼的培养物和返祖菌转种营养琼脂平板培养,观察其菌落形态。对返祖菌及诱导前接种菌的16S rDNA进行鉴定。结果在含128μg/ml异烟肼浓度的结核分枝杆菌快速液体培养基中培养的脓肿分枝杆菌细胞壁缺失,形态为球形,L型细菌琼脂平板上菌落呈典型油煎蛋样,而无异烟肼的结核分枝杆菌快速液体培养基中培养的脓肿分枝杆菌细胞壁完整,形态为杆状,营养琼脂平板上呈圆形菌落。128μg/ml异烟肼浓度的结核分枝杆菌快速液体培养基中培养的脓肿分枝杆菌经返祖后,返祖菌细胞壁完整,形态为杆状,营养琼脂平板上菌落也呈圆形。16S rDNA鉴定返祖菌与诱导前接种菌的同源性达100%,为同一种细菌,即脓肿分枝杆菌。结论异烟肼成功诱导脓肿分枝杆菌L型,可用于脓肿分枝杆菌耐药机制和防治研究。

关键词：脓肿分枝杆菌 L型细菌异烟肼细胞壁

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细粒棘球绦虫囊化原头蚴AQP基因转录动态及异源表达实验研究

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第三军医大学学报 2020年第21期42卷 2081-2092页

作者：谭青青吴宏烨高剑李锴范俊杰李想廖鹏曹纹侨叶彬重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室重庆400016 新疆医科大学寄生虫学教研室乌鲁木齐830011 重庆医科大学基础医学院分子医学与肿瘤研究中心重庆400016

目的探索细粒棘球蚴水通道蛋白(Echinococcus granulosus aquaporins,EgAQPs)在棘球蚴液形成过程中的作用。方法收集体外培养不同时期的棘球蚴标本和BALB/c小鼠体内接种的继发棘球蚴标本,RT-qPCR方法检测12个EgAQPs基因在体内、体外培... 详细信息

目的探索细粒棘球蚴水通道蛋白(Echinococcus granulosus aquaporins,EgAQPs)在棘球蚴液形成过程中的作用。方法收集体外培养不同时期的棘球蚴标本和BALB/c小鼠体内接种的继发棘球蚴标本,RT-qPCR方法检测12个EgAQPs基因在体内、体外培养不同发育时期的转录表达。以细粒棘球蚴cDNA为模板,扩增EgAQP、EgAQP1、EgAQP3、EgAQP4-1、EgAQP4-4和EgAQP9-16个基因编码区片段,同时,通过化学合成方法扩增另外6个EgAQPs(EgAQPAn.G、EgAQPFA-CHIP、EgAQP4-2、EgAQP4-3、EgAQP4-5、EgAQP9-2)基因编码区片段,并在非洲爪蟾卵母细胞中检测这12个EgAQPs基因的透水功能,Western blot检测EgAQPs在卵母细胞膜上的表达。结果体外培养的原头蚴及感染小鼠的继发棘球蚴体积均随培养时间的延长而逐渐增大,棘球蚴囊内透明液体增多。RT-qPCR结果显示12个EgAQPs基因在体内、体外培养不同发育时间的转录表达水平均较低。注射EgAQPs基因的非洲爪蟾卵母细胞的体积变化率和透水系数与阴性对照组差异无统计学意义,这12个EgAQPs基因在卵母细胞中未表现出水通道功能。Western blot检测12个EgAQPs基因在卵母细胞总蛋白、胞质蛋白与胞膜蛋白上的表达,结果均未观察到蛋白在预期的水通道蛋白理论分子量处表达。结论12个EgAQPs基因在原头蚴囊化形成棘球蚴过程中转录表达水平均较低,这些基因在爪蟾卵母细胞的异源表达均未表现出通透水的功能。

关键词：细粒棘球绦虫水通道蛋白原头蚴棘球蚴转录谱异源表达

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利福平对脓肿分枝杆菌L型的诱导作用

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第三军医大学学报 2013年第16期35卷 1717-1720页

作者：范贵荣杨致邦黄进重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室基础医学实验教学中心病原生物学与免疫实验室重庆400016

目的探讨利福平对脓肿分枝杆菌L型的诱导作用。方法将脓肿分枝杆菌分别接种于含256μg/mL利福平和无利福平的结核分枝杆菌快速液体培养基中培养。含利福平的培养物经0.45μm孔径滤膜过滤,滤液接种于无利福平的结核分枝杆菌快速液体培养... 详细信息

目的探讨利福平对脓肿分枝杆菌L型的诱导作用。方法将脓肿分枝杆菌分别接种于含256μg/mL利福平和无利福平的结核分枝杆菌快速液体培养基中培养。含利福平的培养物经0.45μm孔径滤膜过滤,滤液接种于无利福平的结核分枝杆菌快速液体培养基内返祖培养。将含利福平和无利福平的培养物及返祖菌进行细胞壁染色和透射电镜观察其细胞壁完整性,扫描电镜观察其表面微观结构。含利福平的培养物转种L型菌琼脂平板培养,无利福平的培养物和返祖菌转种营养琼脂平板培养,观察其菌落形态。对诱导前接种菌和返祖菌的16S rDNA进行鉴定。结果在含256μg/mL利福平浓度的结核分枝杆菌快速液体培养基中培养的脓肿分枝杆菌的细胞壁缺失,形态为球形,L型细菌琼脂平板上菌落呈典型油煎蛋样,而无利福平的结核分枝杆菌快速液体培养基中培养的脓肿分枝杆菌细胞壁完整,形态为杆状,营养琼脂平板上呈圆形菌落。256μg/mL利福平浓度的结核分枝杆菌快速液体培养基中培养的脓肿分枝杆菌经返祖后,返祖菌细胞壁完整,形态为杆状,营养琼脂平板上菌落也呈圆形。16S rDNA鉴定返祖菌与诱导前接种菌的同源性达100%,为同一种细菌,即脓肿分枝杆菌。结论利福平成功诱导脓肿分枝杆菌L型。

关键词：脓肿分枝杆菌 L型细菌利福平细胞壁

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四种靶向因子与柯萨奇病毒B3 VP1融合基因疫苗免疫效果的比较

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细胞与分子免疫学杂志 2010年第2期26卷 103-106页

作者：刘贵霞蓝佳明揣侠高志云金玉怀张永红谢立新殷长甫王永祥河北医科大学基础医学院病原生物学教研室河北石家庄050017

目的:比较巨噬细胞源趋化因子(MDC)、补体片段C3d3、志贺毒素B亚单位(STxB)和小鼠β-防御素2(mBD2)分别与柯萨奇病毒B3(CVB3)VP1构建的融合基因疫苗及VP1基因疫苗对小鼠的免疫效果。方法:将雄性BALB/c小鼠随机分为6组,每组22只,分别于... 详细信息

目的:比较巨噬细胞源趋化因子(MDC)、补体片段C3d3、志贺毒素B亚单位(STxB)和小鼠β-防御素2(mBD2)分别与柯萨奇病毒B3(CVB3)VP1构建的融合基因疫苗及VP1基因疫苗对小鼠的免疫效果。方法:将雄性BALB/c小鼠随机分为6组,每组22只,分别于股四头肌注射pcDNA3、pcDNA3/VP1、pcDNA3/MDC-VP1、pcDNA3/VP1-C3d3、pcD-NA3/STxB-VP1和pcDNA3/mBD2-VP1,接种剂量为每次100μg/只,3周免疫1次,共3次。每次免疫后第14天内眦静脉取血,用微量中和试验滴定血清中和抗体滴度。第3次免疫后第21天,每组随机取3只小鼠,制备脾淋巴细胞,用CCK-8细胞计数法检测特异性CTL的杀伤活性;每组取3只小鼠以3LDLD50CVB3病毒攻击,第7天取血处死,检测血清病毒滴度;其余小鼠以5LDLD50的CVB3攻击,观察各组的生存情况。结果:除了pcDNA3对照组,其他各组的中和抗体滴度均随免疫次数的增加而提高(P<0.01),第3次免疫后,pcD-NA3/MDC-VP1、pcDNA3/VP1-C3d3和pcDNA3/mBD2-VP1组的抗体滴度明显高于pcDNA3/VP1组(P<0.01);pcDNA3/STxB-VP1和pcDNA3/mBD2-VP1组CTL杀伤活性显著高于其他各组(P<0.01)。致死量病毒攻击后,pcDNA3/MDC-VP1、pcDNA3/VP1-C3d3和pcDNA3/mBD2-VP1组小鼠血中病毒滴度显著低于其他组(P<0.01);pcDNA3/MDC-VP1和pcD-NA3/VP1-C3d3组小鼠生存率显著高于其他各组(P<0.05)。结论:pcDNA3/MDC-VP1和pcDNA3/VP1-C3d3能诱导出较强的体液免疫和细胞免疫,能有效降低血中病毒滴度,获得较高的小鼠生存率;整体效果优于其他组。

关键词：巨噬细胞源趋化因子补体片段C3d 志贺毒素B亚单位小鼠β-防御素2 柯萨奇病毒B3型基因疫苗

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锌离子依赖的金属蛋白酶-1体内抑制分枝杆菌的抗原处理

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重庆医科大学学报 2018年第9期43卷 1180-1186页

作者：吴宣艳李鹏卢楠方陈城杨春何永林重庆医科大学基础医学院分子医学与肿瘤研究中心病原生物学教研室重庆400016

目的:在小鼠体内观察卡介苗的锌离子依赖的金属蛋白酶-1(Zinc metalloprotease-1,Zmp1)对结核分枝杆菌抗原PPE68处理的影响。方法:6~8周龄BALB/c小鼠随机分为5组,分别为p Bud CE4.1空质粒对照组(n=7)、表达PPE68抗原肽的p BudCE4.1-PPE... 详细信息

目的:在小鼠体内观察卡介苗的锌离子依赖的金属蛋白酶-1(Zinc metalloprotease-1,Zmp1)对结核分枝杆菌抗原PPE68处理的影响。方法:6~8周龄BALB/c小鼠随机分为5组,分别为p Bud CE4.1空质粒对照组(n=7)、表达PPE68抗原肽的p BudCE4.1-PPE68p质粒组(n=9)、表达PPE68抗原的p Bud CE4.1-PPE68质粒组(n=9)、PPE68抗原和Zmp1共表达的p Bud CE4.1-PPE68-Zmp1质粒组(n=10)及PPE68抗原肽和Zmp1共表达的p Bud CE4.1-PPE68p-Zmp1质粒组(n=8)。各组质粒电转化减毒沙门菌株SL7207构建相应的重组沙门菌。以灌胃方式将各组沙门菌免疫小鼠3周。收集小鼠血液和肺肠灌洗液,采用ELISA法测定血清中IFN-γ、IL-12含量及肺与肠道s Ig A的含量;分离培养脾细胞,用CCK-8法检测脾淋巴细胞增殖情况。结果:与PPE68抗原组相比,PPE68和Zmp1共表达组的IFN-γ(117.29±16.86,P=0.034)、IL-12(40.46±7.11,P=0.0037)、淋巴细胞刺激指数SI(3.30±0.49,P=0.004)均降低;与PPE68抗原肽组相比,PPE68抗原肽和Zmp1共表达组相应因子含量下降不明显,IFN-γ(132.75±28.40,P=0.070)、IL-12(55.43±11.78,P=0.198)、SI(4.70±1.57,P=0.124)。结论:卡介苗的Zmp1影响结核分枝杆菌抗原PPE68的处理过程,这可能是影响BCG免疫效果的重要原因。

关键词：卡介苗 PPE68 锌离子依赖的金属蛋白酶-1 抗原处理

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轮状病毒NSP5克隆、鉴定、表达及其条件优化

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中国人兽共患病学报 2021年第8期37卷 703-708页

作者：林家锋陶晓莉陆恒章于美玲李婷婷李藤菲程美慧李永刚锦州医科大学基础医学院病原生物学教研室锦州121000

目的为制备NSP5多克隆抗体及进一步研究NSP5的功能和在轮状病毒复制中的作用奠定基础。方法利用分子克隆的技术构建出原核表达蛋白质粒NSP5-pGEX-6P-1和真核表达质粒NSP5-pFLAG-CMV-3,其中NSP5-pFLAG-CMV-3转染细胞后通过Western Blot... 详细信息

目的为制备NSP5多克隆抗体及进一步研究NSP5的功能和在轮状病毒复制中的作用奠定基础。方法利用分子克隆的技术构建出原核表达蛋白质粒NSP5-pGEX-6P-1和真核表达质粒NSP5-pFLAG-CMV-3,其中NSP5-pFLAG-CMV-3转染细胞后通过Western Blot和间接免疫荧光法观测NSP5在293T细胞里的表达和定位;NSP5-pGEX-6P-1经转化*** BL21(DE3)后从IPTG浓度、温度及历经时间3个方面摸索出最优化的诱导蛋白表达条件,并经GST琼脂糖树脂纯化蛋白且用SDS-PAGE和Western Blot进行鉴定。结果构建了真核表达载体NSP5-pFLAG-CMV-3和原核表达载体NSP5-pGEX-6P-1。经NSP5-pFLAG-CMV-3转染后的293T细胞通过Western Blot验证NSP5蛋白在细胞中成功表达,间接免疫荧光观察到重组蛋白在细胞质中富集。37℃、8 h、0.4 mmol/L IPTG诱导是NSP5-pGEX-6P-1蛋白表达的最适条件,且以包涵体形式汇聚在沉淀中进行表达。SDS-PAGE和Western Blot表明重组蛋白纯化成功。结论成功构建NSP5重组表达系统,成功优化了NSP5蛋白诱导表达的条件并纯化蛋白。

关键词：轮状病毒 NSP5 基因重组蛋白表达蛋白纯化

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脓肿分枝杆菌耐利福平机制的研究

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中国人兽共患病学报 2013年第12期29卷 1172-1176页

作者：范贵荣杨致邦黄进高继业重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室基础医学实验教学中心病原生物学与免疫学实验室重庆400016

目的探讨脓肿分枝杆菌耐利福平的机制。方法采用棋盘微量稀释法,分别测定利福平在加入不同浓度的改变细胞壁通透性的试剂和主动外排泵抑制剂时对脓肿分枝杆菌的最低抑菌浓度。通过利福平对脓肿分枝杆菌的最低抑菌浓度的变化情况来分析... 详细信息

目的探讨脓肿分枝杆菌耐利福平的机制。方法采用棋盘微量稀释法,分别测定利福平在加入不同浓度的改变细胞壁通透性的试剂和主动外排泵抑制剂时对脓肿分枝杆菌的最低抑菌浓度。通过利福平对脓肿分枝杆菌的最低抑菌浓度的变化情况来分析细胞壁通透性和主动外排在脓肿分枝杆菌耐利福平机制中的作用。结果随着TWEEN-80、Trixon X-100、甲苯、乙醚、CCCP、利血平和泮托拉唑浓度的增加,利福平对脓肿分枝杆菌的最低抑菌浓度逐渐降低。对于TWEEN-80、Trixon X-100、CCCP和泮托拉唑,利福平对脓肿分枝杆菌的最低抑菌浓度由512μg/mL降至小于32μg/mL,0.1%的TWEEN-80、0.006 25%的Trixon X-100、0.1μg/mL的CCCP和32μg/mL的泮托拉唑为最适浓度;对于甲苯、乙醚和利血平,利福平对脓肿分枝杆菌的最低抑菌浓度由512μg/mL降至64μg/mL,0.25%的甲苯、0.25%的乙醚和8μg/mL的利血平为最适浓度。它们均能促进利福平对脓肿分枝杆菌的抑菌作用。结论细胞壁通透性和主动外排在脓肿分枝杆菌耐利福平的机制中有重要作用。

关键词：脓肿分枝杆菌利福平细胞壁通透性主动外排

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细粒棘球绦虫蛋白激酶A的生物信息学特征及免疫反应性

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中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2020年第6期38卷 682-687页

作者：范俊杰韩秀敏 Nur Fazleen Binti Idris 李锴谭青青曹纹侨李想廖鹏叶彬重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室重庆400016 重庆医科大学分子医学与肿瘤研究中心重庆400016 青海省人民医院西宁810007

目的研究细粒棘球绦虫cAMP依赖性蛋白激酶A(EgPKA)基因的生物信息学特征,分析其重组蛋白的免疫反应性。方法利用细粒棘球绦虫全基因组测序数据设计特异性引物扩增EgPKA基因的编码区序列,并通过生物信息学方法综合分析EgPKA蛋白的理化性... 详细信息

目的研究细粒棘球绦虫cAMP依赖性蛋白激酶A(EgPKA)基因的生物信息学特征,分析其重组蛋白的免疫反应性。方法利用细粒棘球绦虫全基因组测序数据设计特异性引物扩增EgPKA基因的编码区序列,并通过生物信息学方法综合分析EgPKA蛋白的理化性质、亚细胞定位、三维结构。构建GS115/EgPKA-pPIC9K重组酵母工程菌并用甲醇诱导表达,抗His标签镍柱亲和层析柱纯化EgPKA重组蛋白,用细粒棘球蚴病患者血清、细粒棘球蚴感染的BALB/c小鼠血清作为一抗,蛋白质免疫印迹(Western blotting)分析纯化的EgPKA重组蛋白的免疫反应性。结果EgPKA基因编码区全长1053 bp,编码350个氨基酸残基,发生了48 bp的缺失突变(417~464 bp),突变后EgPKA编码区碱基A415、G416和T465重新结合形成新的氨基酸Ser154。生物信息学分析结果显示,EgPKA理论等电点为8.63,不稳定性系数为29.04,脂肪系数为82.49,总平均亲水性为-0.374,不含信号肽,无跨膜区。Cell-Ploc 2.0软件分析结果显示,EgPKA蛋白可能定位于细胞膜、细胞质、线粒体和细胞核。Western blotting分析结果显示,1%甲醇诱导表达72 h时EgPKA重组蛋白的产量最高,纯化的EgPKA重组蛋白能与细粒棘球蚴病患者血清,细粒棘球蚴感染后4、8、12和16个月的小鼠血清发生特异性反应,出现两条分别为Mr 40000和35000蛋白条带,而与健康小鼠及健康人血清无特异性反应,无条带出现。结论EgPKA编码区序列存在基因缺失突变,EgPKA重组蛋白具有较好的免疫反应性,有望作为细粒棘球蚴病的早期诊断抗原。

关键词：细粒棘球绦虫蛋白激酶A 生物信息学分析真核表达

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bFGF促进肝癌Bel-7402细胞增殖的信号转导机制

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中国肿瘤临床 2006年第5期33卷 256-259页

作者：刘萍孙黎光唐玉海李新鸣中国医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室中国医科大学基础医学院病原生物学教研室沈阳市110001

目的:分析肝癌细胞系Bel-7402中Ras-Raf-ERK1/2途径介导的bFGF对细胞周期素E(cyclinE)表达及细胞增殖的影响,以探讨肝癌细胞增殖的信号转导机制。方法:bFGF处理后用流式细胞术检测细胞增殖情况;Western印迹检测ERK1/2激酶的活化;RT-RCR... 详细信息

目的:分析肝癌细胞系Bel-7402中Ras-Raf-ERK1/2途径介导的bFGF对细胞周期素E(cyclinE)表达及细胞增殖的影响,以探讨肝癌细胞增殖的信号转导机制。方法:bFGF处理后用流式细胞术检测细胞增殖情况;Western印迹检测ERK1/2激酶的活化;RT-RCR方法检测cyclinE的基因表达。结果:FCM结果表明bFGF诱导细胞进入S期(27.49%±0.72%→42.45%±1.06%);bFGF时、量效依赖性地诱导Bel-7402细胞ERK1/2活性增高和cy-clinEmRNA表达。25ng/mlbFGF作用Bel-7402细胞10minERK1/2活性达高峰为对照组的3.84倍,作用8h后cyclinEmRNA表达达高峰为对照组的5.15倍;MEK1抑制剂PD98059可抑制bFGF的这些作用。结论:Ras-Raf-ERK1/2途径介导bFGF对cyclinEmRNA表达的诱导进而促进Bel-7402细胞的细胞周期进程,在肝癌增殖过程中bFGF信号转导发挥了重要的作用。

关键词：肝癌碱性成纤维细胞生长因子细胞外信号调节蛋白澈酶细胞周期素E 信号转导

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