检索结果-内蒙古大学图书馆

中国人兽共患病学报 2021年第3期37卷 203-211页

作者：曹纹侨李锴喻云谭青青陆合张静重庆医科大学分子医学与肿瘤研究中心重庆400016 重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室重庆400016

目的本研究旨在了解弓形虫感染小鼠肺组织转录组的变化。方法取感染和未感染弓形虫的小鼠肺组织提取总RNA并制备cDNA文库,采用BGISEQ-500测序平台对文库进行高通量转录组测序。从测序结果中筛选差异表达基因(differentially expressed g... 详细信息

目的本研究旨在了解弓形虫感染小鼠肺组织转录组的变化。方法取感染和未感染弓形虫的小鼠肺组织提取总RNA并制备cDNA文库,采用BGISEQ-500测序平台对文库进行高通量转录组测序。从测序结果中筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并随机筛选10个差异表达基因利用实时荧光定量PCR(quantitative real time PCR,q-PCR)对其表达量进行验证。对总的差异表达基因进行Gene Ontology(GO)富集分析、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析和关键驱动基因(Key driver gene analysis,KDA)分析。结果总共筛选到286个差异表达基因,其中上调基因234个,下调基因52个。随机筛选的10个差异表达基因的q-PCR结果与测序结果的变化趋势一致,说明转录组测序结果可靠。GO分析结果显示差异表达基因主要与免疫和细胞因子相关。KEGG富集分析结果显示与细胞因子相关的通路:细胞因子与细胞因子受体互作和趋化因子信号通路被显著富集,分别为Top1和Top4。对两条通路中显著富集的24个差异表达基因进行KDA分析,共筛选到10个关键驱动基因:Tnf、Cxcl10、Il10、Ccl2、Ifng、Cxcl9、Cxcr2、Ccr5、Ccl4和Ccl7。结论在弓形虫感染小鼠的肺组织中,Tnf、Cxcl10、Il10、Ccl2、Ifng、Cxcl9、Cxcr2、Ccr5、Ccl4、Ccl7可能发挥了重要作用。

关键词：刚地弓形虫肺关键驱动基因 RNA-seq q-PCR

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细粒棘球绦虫水通道蛋白9的多肽特征及免疫定位研究

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中国人兽共患病学报 2021年第1期37卷 45-52,59页

作者：谭青青李锴张静高剑吴宏烨范俊杰陆合叶彬重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室重庆400016 重庆医科大学分子医学与肿瘤研究中心重庆400016 新疆医科大学寄生虫学教研室乌鲁木齐830011

目的研制细粒棘球绦虫水通道蛋白9(EgAQP9)的特异性多肽抗体,并用于检测其在棘球蚴囊壁、生发细胞及原头蚴中的组织分布情况。方法根据EgAQP9特异氨基酸序列设计合成B细胞抗原多肽,再用合成的多肽偶联KLH作为免疫原注射免疫新西兰兔以... 详细信息

目的研制细粒棘球绦虫水通道蛋白9(EgAQP9)的特异性多肽抗体,并用于检测其在棘球蚴囊壁、生发细胞及原头蚴中的组织分布情况。方法根据EgAQP9特异氨基酸序列设计合成B细胞抗原多肽,再用合成的多肽偶联KLH作为免疫原注射免疫新西兰兔以制备多克隆抗体。酶联免疫吸附试验(ELISA)方法检测多肽抗体滴度,蛋白免疫印迹法(Western blot)测定多肽抗体免疫活性,免疫荧光实验分析EgAQP9的亚细胞定位,免疫组化实验分析EgAQP9组织定位。结果免疫新西兰兔成功制备出多肽抗体;间接ELISA检测其多肽抗体效价高达1∶256000;Western blot结果显示多肽抗体能够特异识别细粒棘球绦虫中36 kDa处的条带,与EgAQP9预测的相对分子量大小相符;免疫荧光实验结果显示EgAQP9分布于棘球蚴生发细胞的胞质、胞膜中;免疫组化实验显示该蛋白主要分布在原头蚴表面及棘球蚴囊泡生发层。结论本研究以制备的EgAQP9兔源多克隆抗体定位了AQP9在棘球蚴生发细胞、原头蚴及棘球蚴囊壁中的分布状况。

关键词：细粒棘球绦虫水通道蛋白多肽抗体亚细胞定位组织定位

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基于生物信息学分析的肝癌核心基因的筛选及验证

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基因组学与应用生物学 2021年第2期40卷 867-877页

作者：李怡敏汪洋袁琳 Nur Fazleen Binti Idris 黄国旺涂增重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室分子医学与肿瘤研究中心重庆400016 西安市第一医院西安710000

本研究基于GEO数据库,选取由慢性乙型肝炎诱导的肝细胞癌芯片数据GSE121248为研究对象,利用GEO_(2)R软件分析数据,筛选出差异表达基因,利用DAVID数据库进行GO分析和KEGG pathway富集分析。利用STRING数据库构建PPI网络,分析筛选核心基... 详细信息

本研究基于GEO数据库,选取由慢性乙型肝炎诱导的肝细胞癌芯片数据GSE121248为研究对象,利用GEO_(2)R软件分析数据,筛选出差异表达基因,利用DAVID数据库进行GO分析和KEGG pathway富集分析。利用STRING数据库构建PPI网络,分析筛选核心基因。利用GEPIA对核心基因的表达进行验证,Kaplan Meier Plotter在线分析工具对核心基因与患者生存情况的相关性进行验证。通过上述方法筛选出309个DEGs,其中上调基因94个,下调基因215个。差异基因功能分析显示上调的DEGs主要参与细胞周期和卵母细胞减数分裂通路等途径,下调的DEGs则在补体和凝血级联、代谢途径以及咖啡因代谢途径富集。筛选出15个具有高度关联性的核心基因(BUB1,BUB1B,BIRC5,CCNB1,CCNB2,CDC20,CDK1,KIF-20A,MAD2L1,NCAPG,ZWINT,PBK,BTL,TTK和NUSAP1),它们与肝癌患者的总体生存率具有明显相关性,并为其构建了miRNA调控网络。本研究通过生物信息学方法有效分析了肝细胞癌发生、发展相关的差异表达基因,筛选出15个核心基因,分析其生物学相关功能,以期探索肝细胞癌发病机制,并为临床诊断标志物的改进以及筛选提供一定的理论基础。

关键词：肝癌差异表达基因生物信息学

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医学蠕虫水通道蛋白研究进展

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中国血吸虫病防治杂志 2020年第5期32卷 542-547页

作者：王芬叶彬重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室重庆400016 重庆医科大学分子医学与肿瘤研究中心

水通道蛋白是广泛存在于医学蠕虫中的一类可特异性介导水和其他溶质分子跨膜转运的膜内在蛋白,其在促进水跨膜转运、渗透调节、营养物质吸收、有毒代谢产物排出以及抗寄生虫药物转运过程中发挥重要作用,有望成为抗寄生虫疫苗候选分子和... 详细信息

水通道蛋白是广泛存在于医学蠕虫中的一类可特异性介导水和其他溶质分子跨膜转运的膜内在蛋白,其在促进水跨膜转运、渗透调节、营养物质吸收、有毒代谢产物排出以及抗寄生虫药物转运过程中发挥重要作用,有望成为抗寄生虫疫苗候选分子和药物靶点。本文综述了医学蠕虫水通道蛋白的结构特征并探讨其作为抗蠕虫疫苗候选分子和药物靶点的可行性,为新型抗寄生虫疫苗或药物研发提供参考。

关键词：医学蠕虫水通道蛋白疫苗候选分子药物靶点

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细粒棘球绦虫蛋白激酶A的生物信息学特征及免疫反应性

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中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2020年第6期38卷 682-687页

作者：范俊杰韩秀敏 Nur Fazleen Binti Idris 李锴谭青青曹纹侨李想廖鹏叶彬重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室重庆400016 重庆医科大学分子医学与肿瘤研究中心重庆400016 青海省人民医院西宁810007

目的研究细粒棘球绦虫cAMP依赖性蛋白激酶A(EgPKA)基因的生物信息学特征,分析其重组蛋白的免疫反应性。方法利用细粒棘球绦虫全基因组测序数据设计特异性引物扩增EgPKA基因的编码区序列,并通过生物信息学方法综合分析EgPKA蛋白的理化性... 详细信息

目的研究细粒棘球绦虫cAMP依赖性蛋白激酶A(EgPKA)基因的生物信息学特征,分析其重组蛋白的免疫反应性。方法利用细粒棘球绦虫全基因组测序数据设计特异性引物扩增EgPKA基因的编码区序列,并通过生物信息学方法综合分析EgPKA蛋白的理化性质、亚细胞定位、三维结构。构建GS115/EgPKA-pPIC9K重组酵母工程菌并用甲醇诱导表达,抗His标签镍柱亲和层析柱纯化EgPKA重组蛋白,用细粒棘球蚴病患者血清、细粒棘球蚴感染的BALB/c小鼠血清作为一抗,蛋白质免疫印迹(Western blotting)分析纯化的EgPKA重组蛋白的免疫反应性。结果EgPKA基因编码区全长1053 bp,编码350个氨基酸残基,发生了48 bp的缺失突变(417~464 bp),突变后EgPKA编码区碱基A415、G416和T465重新结合形成新的氨基酸Ser154。生物信息学分析结果显示,EgPKA理论等电点为8.63,不稳定性系数为29.04,脂肪系数为82.49,总平均亲水性为-0.374,不含信号肽,无跨膜区。Cell-Ploc 2.0软件分析结果显示,EgPKA蛋白可能定位于细胞膜、细胞质、线粒体和细胞核。Western blotting分析结果显示,1%甲醇诱导表达72 h时EgPKA重组蛋白的产量最高,纯化的EgPKA重组蛋白能与细粒棘球蚴病患者血清,细粒棘球蚴感染后4、8、12和16个月的小鼠血清发生特异性反应,出现两条分别为Mr 40000和35000蛋白条带,而与健康小鼠及健康人血清无特异性反应,无条带出现。结论EgPKA编码区序列存在基因缺失突变,EgPKA重组蛋白具有较好的免疫反应性,有望作为细粒棘球蚴病的早期诊断抗原。

关键词：细粒棘球绦虫蛋白激酶A 生物信息学分析真核表达

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细粒棘球绦虫囊化原头蚴AQP基因转录动态及异源表达实验研究

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第三军医大学学报 2020年第21期42卷 2081-2092页

作者：谭青青吴宏烨高剑李锴范俊杰李想廖鹏曹纹侨叶彬重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室重庆400016 新疆医科大学寄生虫学教研室乌鲁木齐830011 重庆医科大学基础医学院分子医学与肿瘤研究中心重庆400016

目的探索细粒棘球蚴水通道蛋白(Echinococcus granulosus aquaporins,EgAQPs)在棘球蚴液形成过程中的作用。方法收集体外培养不同时期的棘球蚴标本和BALB/c小鼠体内接种的继发棘球蚴标本,RT-qPCR方法检测12个EgAQPs基因在体内、体外培... 详细信息

目的探索细粒棘球蚴水通道蛋白(Echinococcus granulosus aquaporins,EgAQPs)在棘球蚴液形成过程中的作用。方法收集体外培养不同时期的棘球蚴标本和BALB/c小鼠体内接种的继发棘球蚴标本,RT-qPCR方法检测12个EgAQPs基因在体内、体外培养不同发育时期的转录表达。以细粒棘球蚴cDNA为模板,扩增EgAQP、EgAQP1、EgAQP3、EgAQP4-1、EgAQP4-4和EgAQP9-16个基因编码区片段,同时,通过化学合成方法扩增另外6个EgAQPs(EgAQPAn.G、EgAQPFA-CHIP、EgAQP4-2、EgAQP4-3、EgAQP4-5、EgAQP9-2)基因编码区片段,并在非洲爪蟾卵母细胞中检测这12个EgAQPs基因的透水功能,Western blot检测EgAQPs在卵母细胞膜上的表达。结果体外培养的原头蚴及感染小鼠的继发棘球蚴体积均随培养时间的延长而逐渐增大,棘球蚴囊内透明液体增多。RT-qPCR结果显示12个EgAQPs基因在体内、体外培养不同发育时间的转录表达水平均较低。注射EgAQPs基因的非洲爪蟾卵母细胞的体积变化率和透水系数与阴性对照组差异无统计学意义,这12个EgAQPs基因在卵母细胞中未表现出水通道功能。Western blot检测12个EgAQPs基因在卵母细胞总蛋白、胞质蛋白与胞膜蛋白上的表达,结果均未观察到蛋白在预期的水通道蛋白理论分子量处表达。结论12个EgAQPs基因在原头蚴囊化形成棘球蚴过程中转录表达水平均较低,这些基因在爪蟾卵母细胞的异源表达均未表现出通透水的功能。

关键词：细粒棘球绦虫水通道蛋白原头蚴棘球蚴转录谱异源表达

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携带Lipocalin 2基因重组减毒沙门菌的构建及其对分枝杆菌生长影响的研究

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重庆医科大学学报 2020年第2期45卷 239-244页

作者：唐弘王瑜伟何永林卢楠徐蕾庄稀尧李智颖杨婕陈俊伊熊雨涵杨春重庆医科大学基础医学院分子医学与肿瘤研究中心病原生物学教研室重庆400016 重庆市中医院检验科重庆400021

目的:探讨携带脂质运载蛋白2(lipocalin 2,Lcn2)的减毒沙门菌对分枝杆菌生长的影响。方法:以巨噬细胞RAW264.7提取RNA逆转录为c DNA为模版,采用PCR法扩增Lcn2基因,定向克隆到质粒pBudCE4.1-orim的多克隆位点中,构建重组质粒pBudCE4.1-or... 详细信息

目的:探讨携带脂质运载蛋白2(lipocalin 2,Lcn2)的减毒沙门菌对分枝杆菌生长的影响。方法:以巨噬细胞RAW264.7提取RNA逆转录为c DNA为模版,采用PCR法扩增Lcn2基因,定向克隆到质粒pBudCE4.1-orim的多克隆位点中,构建重组质粒pBudCE4.1-orim-Lcn2;将重组质粒转染RAW264.7细胞,用RT-qPCR法检测Lcn2的mRNA相对表达量,并以空白载体为对照组;将重组质粒转入减毒沙门菌SL7207得到重组菌株SL7207-pBudCE4.1-orim-Lcn2;重组菌感染RAW264.7细胞,Western blot检测Lcn2的蛋白表达,RT-qPCR法检测Lcn2的mRNA的相对表达量,并以空载菌组为对照;7H10平板上通过菌落计数观察重组菌对感染RAW264.7细胞的卡介苗(Bacille calmette-guerin,BCG)生存的影响,以空载菌组为对照。用重组菌灌胃小鼠,检测脾组织Lcn2和血清IFN-γ水平,以空载菌和生理盐水为对照组。结果:PCR扩增出Lcn2基因;重组质粒经双酶切及基因测序鉴定正确。重组菌感染RAW264.7细胞Lcn2的蛋白表达量较对照组增加(P=0.000)。RT-qPCR法检测重组菌、重组质粒Lcn2 mRNA表达较对照组明显升高(P=0.000,F=5.281;P=0.000,F=22570)。7H10平板上重组菌组BCG数量与空载菌组相比明显减少(P=0.000,F=11.41)。重组菌组与空载对照菌组相比小鼠脾组织Lcn2表达升高(P=0.000,F=4.449),重组菌组与生理盐水组血清IFN-γ升高(P=0.004,F=15.27)。结论:成功构建了携带Lcn2基因的重组减毒沙门菌。重组菌感染RAW264.7细胞后Lcn2的表达增加,对感染RAW264.7的BCG存活起到一定的抑制作用。重组菌灌胃后小鼠脾组织Lcn2表达增加,血清IFN-γ含量增加,小鼠免疫状态有利于结核病转归。该研究为进一步研究脂质运载蛋白和结核分枝杆菌感染的关系及分子机制打下基础。

关键词：减毒沙门菌 Lcn2基因分枝杆菌 RAW264.7细胞

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原头蚴体外形成棘球蚴的优化培养体系研究

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第三军医大学学报 2019年第5期41卷 415-423页

作者：吴宏烨李锴王芬刘许诺范俊杰叶彬重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室分子医学与肿瘤研究中心重庆400016

目的建立适合细粒棘球绦虫原头蚴在体外形成棘球蚴的培养体系。方法以RPMI1640或DMEM培养基为基质,胎牛血清或绵羊血清为营养成分,人肝细胞株L02为饲养细胞设计配伍2大类、6个组培养体系;培养细粒棘球绦虫原头蚴45 d,根据各组原头蚴的... 详细信息

目的建立适合细粒棘球绦虫原头蚴在体外形成棘球蚴的培养体系。方法以RPMI1640或DMEM培养基为基质,胎牛血清或绵羊血清为营养成分,人肝细胞株L02为饲养细胞设计配伍2大类、6个组培养体系;培养细粒棘球绦虫原头蚴45 d,根据各组原头蚴的头节外翻率、成囊率和囊泡大小情况,寻找适合原头蚴形成棘球蚴的体外培养体系最佳配伍;在最佳配伍的培养体系继续培养棘球蚴囊泡至180 d。结果在起初的45 d期间,DMEM体系的E组(DMEM+胎牛血清+人肝细胞株L02)培养的棘球蚴生长最快,20 d起原头蚴成囊率高于其他各组(P<0.05),25 d起棘球蚴囊泡大于其他各组(P<0.05),45 d时原头蚴成囊率达到100%;在其后的46～180 d内,棘球蚴囊泡持续增大,至80 d时肉眼可见透明囊泡,至180 d时最大囊泡直径达2.2 mm。结论添加胎牛血清及人肝细胞株L02的DMEM培养基有利于体外培养的原头蚴发育为棘球蚴囊泡。

关键词：细粒棘球绦虫原头蚴成囊棘球蚴培养体系

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干扰素诱导肝癌细胞ADAR1的表达模式及HBV复制抑制

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第三军医大学学报 2019年第14期41卷 1336-1342页

作者：李怡敏袁琳杨生永胡源胡接力黄爱龙涂增重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆400016 重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室分子医学与肿瘤研究中心重庆400016

目的探讨Ⅰ型干扰素(IFN-α、IFN-β)和Ⅱ型干扰素(IFN-γ)在肝癌细胞中诱导ADAR1(P110和P150)的表达模式及对HBV复制的作用。方法不同浓度IFN-α(0、200、500、1 000、2 000 U/mL)、IFN-β(0、200、1 000 U/mL)和IFN-γ(0、200、1 000 U/mL)分别处理肝癌细胞(Huh7和HepG2),Western blot和RT-qPCR检测肝癌细胞中IFN作用后ADAR1的表达变化;Huh7细胞瞬时转染HBV复制型质粒,IFN-α作用后,Southern blot分析HBV DNA复制中间体水平。结果Ⅰ型IFN(IFN-α、IFN-β)作用Huh7和HepG2细胞后,ADAR1 P110蛋白水平增加(P<0.05),同时ADAR1 P150表达水平明显增高(P<0.01),且ADAR1 P150的表达呈现IFN浓度依赖性;Ⅱ型IFN(IFN-γ)作用Huh7和HepG2细胞后,ADAR1 P110和P150蛋白表达水平没有发生明显变化。IFN-α明显抑制Huh7细胞中HBV复制(P<0.05),与浓度梯度呈负相关。结论Ⅰ型IFN可诱导肝癌细胞中ADAR1 P150表达,IFN-α抑制Huh7细胞中HBV复制,其作用可能与ADAR1相关。

关键词：干扰素 ADAR1 肝癌细胞乙型肝炎病毒

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锌离子依赖的金属蛋白酶-1体内抑制分枝杆菌的抗原处理

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重庆医科大学学报 2018年第9期43卷 1180-1186页

作者：吴宣艳李鹏卢楠方陈城杨春何永林重庆医科大学基础医学院分子医学与肿瘤研究中心病原生物学教研室重庆400016

目的:在小鼠体内观察卡介苗的锌离子依赖的金属蛋白酶-1(Zinc metalloprotease-1,Zmp1)对结核分枝杆菌抗原PPE68处理的影响。方法:6~8周龄BALB/c小鼠随机分为5组,分别为p Bud CE4.1空质粒对照组(n=7)、表达PPE68抗原肽的p BudCE4.1-PPE... 详细信息

目的:在小鼠体内观察卡介苗的锌离子依赖的金属蛋白酶-1(Zinc metalloprotease-1,Zmp1)对结核分枝杆菌抗原PPE68处理的影响。方法:6~8周龄BALB/c小鼠随机分为5组,分别为p Bud CE4.1空质粒对照组(n=7)、表达PPE68抗原肽的p BudCE4.1-PPE68p质粒组(n=9)、表达PPE68抗原的p Bud CE4.1-PPE68质粒组(n=9)、PPE68抗原和Zmp1共表达的p Bud CE4.1-PPE68-Zmp1质粒组(n=10)及PPE68抗原肽和Zmp1共表达的p Bud CE4.1-PPE68p-Zmp1质粒组(n=8)。各组质粒电转化减毒沙门菌株SL7207构建相应的重组沙门菌。以灌胃方式将各组沙门菌免疫小鼠3周。收集小鼠血液和肺肠灌洗液,采用ELISA法测定血清中IFN-γ、IL-12含量及肺与肠道s Ig A的含量;分离培养脾细胞,用CCK-8法检测脾淋巴细胞增殖情况。结果:与PPE68抗原组相比,PPE68和Zmp1共表达组的IFN-γ(117.29±16.86,P=0.034)、IL-12(40.46±7.11,P=0.0037)、淋巴细胞刺激指数SI(3.30±0.49,P=0.004)均降低;与PPE68抗原肽组相比,PPE68抗原肽和Zmp1共表达组相应因子含量下降不明显,IFN-γ(132.75±28.40,P=0.070)、IL-12(55.43±11.78,P=0.198)、SI(4.70±1.57,P=0.124)。结论:卡介苗的Zmp1影响结核分枝杆菌抗原PPE68的处理过程,这可能是影响BCG免疫效果的重要原因。

关键词：卡介苗 PPE68 锌离子依赖的金属蛋白酶-1 抗原处理

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