检索结果-内蒙古大学图书馆

生物工程学报 2023年第4期39卷 1374-1389页

作者：隋馨莹徐平段昌柱李衍常重庆医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室分子医学与肿瘤研究中心重庆400016 军事科学院军事医学研究院生命组学研究所国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206 安徽医科大学基础医学院安徽合肥230032 中国医学科学院蛋白组学与新药研发创新单元北京102206

螯合体1(SQSTM1/p62)是一种选择性自噬接头蛋白,在清除待降解蛋白、维持细胞内蛋白质稳态中发挥重要的调控作用。p62蛋白具有多个功能结构域,介导与多种蛋白质发生相互作用进而精确调节特定的信号通路,从而将p62蛋白与氧化防御系统、炎... 详细信息

螯合体1(SQSTM1/p62)是一种选择性自噬接头蛋白,在清除待降解蛋白、维持细胞内蛋白质稳态中发挥重要的调控作用。p62蛋白具有多个功能结构域,介导与多种蛋白质发生相互作用进而精确调节特定的信号通路,从而将p62蛋白与氧化防御系统、炎症反应和营养感知等重要生命过程联系起来。研究表明p62的突变或者表达异常与多种疾病的发生发展过程密切相关,包括神经退行性疾病、肿瘤、感染性疾病、遗传性疾病以及慢性疾病等。本文综述了p62蛋白的结构特征、分子功能,并系统介绍其在蛋白质稳态和信号通路调控中的多种功能,总结了p62在疾病发生发展中的复杂性与多面性,以期为p62蛋白的功能与相关疾病研究提供参考。

关键词： SQSTM1/p62 蛋白酶体自噬疾病肿瘤

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于TXNDC11基因对泛癌的预后评估价值及其免疫调节作用的生物信息学分析

引用

吉林大学学报（医学版） 2022年第1期48卷 142-153页

作者：赵莹赵丹玉刘超锦州医科大学基础医学院遗传学教研室辽宁锦州121001 辽宁中医药大学中西医结合学院生物化学与分子生物学教研室辽宁沈阳110847

目的:通过生物信息学方法探讨硫氧还蛋白结构域11(TXNDC11)在泛癌预后分析中的作用及与肿瘤免疫细胞浸润的关系,阐明其对肿瘤的预后评估价值。方法:采用ONCOMINE和TIMER数据库综合分析TXNDC11 mRNA和蛋白在肿瘤组织及相对应癌旁正常组... 详细信息

目的:通过生物信息学方法探讨硫氧还蛋白结构域11(TXNDC11)在泛癌预后分析中的作用及与肿瘤免疫细胞浸润的关系,阐明其对肿瘤的预后评估价值。方法:采用ONCOMINE和TIMER数据库综合分析TXNDC11 mRNA和蛋白在肿瘤组织及相对应癌旁正常组织中的表达;采用临床蛋白质组肿瘤分析协作组(CPTAC)数据库分析TXNDC11蛋白在肿瘤组织和正常组织间表达的差异;采用基因表达谱交互分析网站(GEPIA)分析TXNDC11表达与泛癌分期之间的关系;采用Kaplan-Meier Plotter在线网站分析TXNDC11表达与泛癌患者生存预后的关系;采用TIMER数据库分析各种肿瘤组织中TXNDC11蛋白表达与肿瘤免疫浸润细胞之间的相关性;采用SangerBox数据库分析TXNDC11蛋白与免疫检查点的关系。结果:ONCOMINE数据库分析,与癌旁正常组织比较,结肠癌(COAD)、胃腺癌(STAD)和肉瘤(SARC)组织中TXNDC11 mRNA表达水平明显降低(P<0.05),而乳腺癌(BRCA)、食管癌(ESCA)、肾嫌色细胞癌(KICH)和胰腺癌(PAAD)组织中TXNDC11 mRNA表达水平明显升高(P<0.01)。TIMER数据库分析,BRCA、胆管癌(CHOL)、ESCA、胶质母细胞瘤(GBM)、头颈鳞状细胞癌(HNSC)和前列腺癌(PRAD)组织中TXNDC11蛋白表达水平升高,COAD、肾乳头状细胞癌(KIRP)、肺腺癌(LUAD)、肺鳞状细胞癌(LUSC)、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤(PCPG)、直肠腺癌(READ)和甲状腺癌(THCA)组织中TXNDC11呈明显低表达。CPTAC数据库分析,肾透明细胞癌(KIRC)和子宫内膜癌(UCEC)组织中TXNDC11蛋白表达水平明显高于癌旁正常组织(P<0.01),而BRCA、卵巢癌(OV)和COAD组织中TXNDC11蛋白表达水平明显低于癌旁正常组织(P<0.05或P<0.01)。GEPIA数据库分析,TXNDC11表达水平与LUAD、卵巢浆液性囊腺癌、THCA和UCEC患者的临床病理分期有密切关联(P<0.05)。Kaplan-Meier Plotter数据库分析,膀胱尿路上皮癌(BLCA)(HR=0.71,P=0.024)、BRCA(HR=0.68,P=0.021)、ESCA(HR=0.39,P=0.0051)、HNSC(HR=0.72,P=0.026)、KIRC(HR=0.41,P=0.0026)、LUAD(HR=0.53,P<0.01)、READ(HR=0.34,P=0.014)、SARC(HR=0.61,P=0.016)、胸腺癌(THYM)(HR=0.14,P=0.0042)、THCA(HR=0.35,P=0.043)和UCEC(HR=0.36,P<0.01)组织中TXNDC11的高表达与肿瘤患者的良好预后有关联。TIMER数据库分析,TXNDC11表达与22种肿瘤组织中B细胞浸润水平有相关性(P<0.05),TXNDC11表达与16种肿瘤组织中CD4+T淋巴细胞浸润水平、25种肿瘤组织中CD8+T淋巴细胞浸润水平、22种肿瘤组织中中性粒细胞浸润水平、22种肿瘤组织中巨噬细胞浸润水平和23种肿瘤组织中树突状细胞浸润水平有明显相关性(P<0.05);TXNDC11表达与COAD、LUSC、HNSC、SARC和皮肤黑色素瘤(SKCM)的免疫细胞具有明显相关性(P<0.01)。SangerBox数据库分析,TXNDC11在多种肿瘤组织中与多个免疫检查点基因表达水平有明显相关性(P<0.05)。结论:泛癌分析中,TXNDC11在多种肿瘤组织中普遍低表达,且TXNDC11与多种肿瘤患者的预后生存有密切关联。TXNDC11可作为一个重要的肿瘤预后预测因子,并在一定程度上调节多种肿瘤的免疫反应。

关键词：硫氧还蛋白结构域11 泛癌预后免疫浸润免疫检查点生物信息学

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

CRISPR/Cas13技术作为病毒核酸检测工具的研究进展

引用

热带医学杂志 2025年第2期25卷 282-288页

作者：冯文杰王芳应旗康古天乐董宇航张俊梅李冬静贺晓龙吴兴安延安大学生命科学学院陕西延安716000 空军军医大学基础医学院微生物与病原生物学教研室陕西西安710068 重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室重庆400016

病毒感染性疾病一直是人类生命健康所面临的威胁之一,建立一个快速、精准的病毒核酸检测平台对于控制病毒的传播以及应对重大公共卫生安全事件具有重要意义。基于成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)以及CRISPR相关蛋白Cas13组成的CRISP... 详细信息

病毒感染性疾病一直是人类生命健康所面临的威胁之一,建立一个快速、精准的病毒核酸检测平台对于控制病毒的传播以及应对重大公共卫生安全事件具有重要意义。基于成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)以及CRISPR相关蛋白Cas13组成的CRISPR/Cas13系统开发出的核酸检测技术可以特异性识别特定的病毒核酸序列,激活Cas13蛋白活性,顺式切割靶标RNA的同时反式切割RNA检测探针实现检测结果的可视化,达到检测的目的。本文综述了基于CRISPR/Cas13开发出多种高特异性和高灵敏度的核酸检测技术,并且总结了这些检测技术在人类、动物以及植物感染性病毒中的应用;同时介绍了基于这些检测技术开发出的简便样品处理方法和高效的结果判读方法,实现在较短的时间内获得准确的结果。CRISPR/Cas13检测技术的不断改进和完善有助于在病毒大流行期间提供可行方案遏制病毒传播。

关键词：基于成簇规律间隔短回文重复序列 Cas13 切割活性病毒核酸检测

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

瞬时受体电位信号通路在肝细胞癌中的表达及生物学功能

引用

实用医学杂志 2024年第6期40卷 743-747页

作者：吴智鹏张钰琴王明刚张荣臻毛德文广西中医药大学研究生院南宁530200 广西医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室南宁530021 广西中医药大学第一附属医院肝病科南宁530023

近年来,在全球范围内肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)的发病率和病死率不断攀升,针对HCC的治疗策略仍然不足,凸显了探讨HCC发病和进展机制的重要性。瞬时受体电位(transient receptor potential, TRP)通路是重要的非选择性阳... 详细信息

近年来,在全球范围内肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)的发病率和病死率不断攀升,针对HCC的治疗策略仍然不足,凸显了探讨HCC发病和进展机制的重要性。瞬时受体电位(transient receptor potential, TRP)通路是重要的非选择性阳离子通路,与炎性反应、感觉传导等方面密切相关。目前,多项研究表明,TRP通路也参与了HCC的发生和发展,诱导HCC的侵袭和迁移。然而,TRP通路在HCC中的整体潜在机制和可能的信号转导通路仍不清楚。因此,本文讨论了TRP通路在HCC中的异常表达,并就TRP通路参与肝脏慢性炎症-纤维化进展、HCC细胞增殖、迁移、凋亡以及HCC干细胞生成等HCC形成与进展的关键生物事件进行综述,展望其在HCC治疗中的应用前景。旨在更好地理解TRP通路在HCC中的意义,有助于发现新的治疗靶点和有效的药物,并为未来临床治疗开拓新局面。

关键词：瞬时受体电位信号通路肝细胞癌表达特征生物学功能

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

肠道病毒D68型感染前后转录组分析及差异表达基因的验证

引用

第三军医大学学报 2021年第4期43卷 275-282页

作者：唐霞司俊卓卢楠何永林徐蕾包嘉佳唐佳玲杨春重庆医科大学基础医学院病原微生物学教研室重庆400016

目的探讨肠道病毒D68型(enterovirus D68, EV-D68)感染前后宿主细胞转录组的表达变化,寻找与EV-D68感染的相关基因及信号通路,为初步探索EV-D68的感染机制奠定基础。方法将病毒以感染复数(multiplicity of infection,MOI)0.01接种于人... 详细信息

目的探讨肠道病毒D68型(enterovirus D68, EV-D68)感染前后宿主细胞转录组的表达变化,寻找与EV-D68感染的相关基因及信号通路,为初步探索EV-D68的感染机制奠定基础。方法将病毒以感染复数(multiplicity of infection,MOI)0.01接种于人横纹肌瘤(rhabdomyosarcoma, RD)细胞,24 h后提取感染组和对照组细胞总RNA进行转录组测序,筛选差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),对其进行GO和KEGG富集分析,并用RT-qPCR验证8个主要差异表达的基因(EGR1、c-fos、ZNF625、ARRDC3、c-jun、ASNS、CHAC1、ADM2)。结果从测序结果中共筛选出差异表达两倍以上的基因140个,其中上调基因71个,下调基因69个。GO功能富集分析结果主要涉及离子的调控与应答;KEGG富集分析结果主要与甲状旁腺激素的合成分泌和作用、GnRH信号通路、Toll样受体信号通路、IL-17信号通路和MAPK信号通路等有关。RT-qPCR验证结果表明选取的8个基因上调或下调的差异表达倍数趋势与测序结果基本一致,c-fos和c-jun的表达量随病毒MOI及感染时长的增加而增加。结论通过对差异表达基因的功能和信号通路富集分析及验证,EV-D68加重哮喘的机制可能与c-fos上调有关;而MAPK信号通路可能在EV-D68感染期间发挥促炎作用和抗病毒作用。

关键词： EV-D68 转录组测序差异表达基因

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于数据库分析HRH3在肝癌中的功能作用及临床意义

引用

中国比较医学杂志 2021年第6期31卷 35-40页

作者：胡艳芬张文桃朱剑军吴昊刘铭山西医科大学基础医学院医学细胞生物与遗传学教研室太原030001

目的通过公共数据库,分析组胺受体H3(histamine receptor H3,HRH3)在HCC中的表达水平,及其在HCC发展中的作用和临床预后的意义。方法基于ULACAN数据库,分析HRH3在肝细胞癌组织和正常肝组织中的表达水平;基于STRING数据库分析HRH3蛋白互... 详细信息

目的通过公共数据库,分析组胺受体H3(histamine receptor H3,HRH3)在HCC中的表达水平,及其在HCC发展中的作用和临床预后的意义。方法基于ULACAN数据库,分析HRH3在肝细胞癌组织和正常肝组织中的表达水平;基于STRING数据库分析HRH3蛋白互作网络、基因功能注释和KEGG信号通路富集;基于Kaplan-Meier Plotter数据库,分析HRH3表达水平与HCC患者临床生存预后的关系。结果与正常肝组织相比,HRH3在HCC中表达水平显著升高(P<0.05)。HRH3表达水平与HCC患者性别、肿瘤分期、分化、淋巴结转移和TP53突变无关。HRH3与5-羟色胺受体家族成员和代谢型谷氨酸受体家族成员等有相互作用,其作为G蛋白偶联受体分子在细胞内传递信号。高表达HRH3与早期HCC患者良好预后相关,高表达HRH3与晚期HCC患者不良预后相关。结论在HCC组织中HRH3呈显著高表达,其作为G蛋白偶联受体在细胞内发挥生物学功能。HRH3在HCC早期发生阶段可能发挥抑癌作用,而在HCC晚期阶段发生促癌功能,具体作用机制有待进一步研究。

关键词：肝细胞癌组胺受体H3 公共数据库

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

细胞原纤毛与人类疾病

引用

生理学报 2021年第6期73卷 999-1016页

作者：刘杰许洁陈茜汪长东重庆医科大学生物化学与分子生物学教研室分子医学与肿瘤研究中心基础医学院

细胞原纤毛定位于绝大多数哺乳动物细胞表面,属于非常保守的细胞器,调节细胞增殖、分化、迁移、极性、信号级联等生命活动来调控细胞生命进程和维持细胞稳态。原纤毛结构蛋白或附属蛋白编码基因突变所导致的疾病统称为"纤毛类疾病&... 详细信息

细胞原纤毛定位于绝大多数哺乳动物细胞表面,属于非常保守的细胞器,调节细胞增殖、分化、迁移、极性、信号级联等生命活动来调控细胞生命进程和维持细胞稳态。原纤毛结构蛋白或附属蛋白编码基因突变所导致的疾病统称为"纤毛类疾病",发生在胚胎期、婴儿期甚至成人期。纤毛类疾病不仅累及单一器官,也涉及多器官多系统,表现出多变表型和重叠表型。本文主要综述原纤毛相关基因突变对骨骼、牙齿、皮肤、肝胆、肾脏、大脑、视网膜、心脏等器官的影响,揭示其致病机制,并对当前一些纤毛类疾病新型治疗方法进行探讨。

关键词：细胞原纤毛纤毛类疾病器官治疗

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

青蒿琥酯通过调控GADD45A、NACC1的表达抑制肝癌细胞的作用

引用

中国药理学通报 2024年第6期40卷 1089-1097页

作者：沈冠彤董金垚冯璟秦楠杜根来朱飞连科刘新宇李清靓张迅玮师如意山西医科大学基础医学院医学细胞生物学与遗传学教研室山西太原030001 山西省肿瘤医院肝胆胰胃外科山西太原030013 山西省人民医院消化科山西太原030012 山西中医药大学中药与食品工程学院山西晋中030619 山西白求恩医院(山西医学科学院同济山西医院) 山西医科大学第三医院山西太原030032

目的阐明青蒿琥酯(artesunate,ART)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)病理进程中对肿瘤细胞的作用及潜在的机制。方法用含不同浓度ART的培养基处理两种HCC细胞系MHCC-97H、HCC-LM3,以0 mg·L-1 ART处理的细胞作为对照组,对... 详细信息

目的阐明青蒿琥酯(artesunate,ART)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)病理进程中对肿瘤细胞的作用及潜在的机制。方法用含不同浓度ART的培养基处理两种HCC细胞系MHCC-97H、HCC-LM3,以0 mg·L-1 ART处理的细胞作为对照组,对比ART对HCC的作用。采用MTT和克隆形成实验测定ART对HCC细胞生长能力的影响;划痕实验和Transwell实验分别检测ART对HCC细胞迁移和侵袭能力的影响;流式细胞术验证ART对HCC细胞凋亡和细胞周期变化的影响;通过转录组测序分析以及qRT-PCR验证关键基因的表达情况探究ART在HCC细胞中的可能作用机制。结果与对照组相比,ART处理后的肿瘤细胞增殖、迁移、侵袭能力明显降低(P<0.01),而细胞凋亡率明显上升,且G_(2)/M期细胞比例明显增高,提示肿瘤细胞被阻滞于该期。使用RNA测序数据进行转录组学分析,确定生长停滞与DNA损伤诱导蛋白45A(growth arrest and DNA damage inducible alpha,GADD45A)是ART的潜在作用靶点,并且提示,ART可通过上调GADD45A的表达进而诱导细胞凋亡和细胞周期阻滞。此外,生信分析结果提示,GADD45A与其上游转录因子伏隔核相关蛋白1(nucleus accumbens associated 1,NACC1)有蛋白互作现象,并且经ART处理后,GADD45A与NACC1的mRNA水平和蛋白水平均发生明显变化。结论ART可能通过影响GADD45A及其潜在上游NACC1基因的表达抑制HCC的发生发展。通过探究ART作用于HCC的功能影响及发生机制,为临床治疗肝癌提供新药物、新方向和新思路。

关键词：青蒿琥酯肝细胞癌抗癌作用机制 GADD45A NACC1 细胞凋亡 G_(2)/M

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

弓形虫急性感染小鼠肺组织的转录组分析

引用

中国人兽共患病学报 2021年第3期37卷 203-211页

作者：曹纹侨李锴喻云谭青青陆合张静重庆医科大学分子医学与肿瘤研究中心重庆400016 重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室重庆400016

目的本研究旨在了解弓形虫感染小鼠肺组织转录组的变化。方法取感染和未感染弓形虫的小鼠肺组织提取总RNA并制备cDNA文库,采用BGISEQ-500测序平台对文库进行高通量转录组测序。从测序结果中筛选差异表达基因(differentially expressed g... 详细信息

目的本研究旨在了解弓形虫感染小鼠肺组织转录组的变化。方法取感染和未感染弓形虫的小鼠肺组织提取总RNA并制备cDNA文库,采用BGISEQ-500测序平台对文库进行高通量转录组测序。从测序结果中筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并随机筛选10个差异表达基因利用实时荧光定量PCR(quantitative real time PCR,q-PCR)对其表达量进行验证。对总的差异表达基因进行Gene Ontology(GO)富集分析、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析和关键驱动基因(Key driver gene analysis,KDA)分析。结果总共筛选到286个差异表达基因,其中上调基因234个,下调基因52个。随机筛选的10个差异表达基因的q-PCR结果与测序结果的变化趋势一致,说明转录组测序结果可靠。GO分析结果显示差异表达基因主要与免疫和细胞因子相关。KEGG富集分析结果显示与细胞因子相关的通路:细胞因子与细胞因子受体互作和趋化因子信号通路被显著富集,分别为Top1和Top4。对两条通路中显著富集的24个差异表达基因进行KDA分析,共筛选到10个关键驱动基因:Tnf、Cxcl10、Il10、Ccl2、Ifng、Cxcl9、Cxcr2、Ccr5、Ccl4和Ccl7。结论在弓形虫感染小鼠的肺组织中,Tnf、Cxcl10、Il10、Ccl2、Ifng、Cxcl9、Cxcr2、Ccr5、Ccl4、Ccl7可能发挥了重要作用。

关键词：刚地弓形虫肺关键驱动基因 RNA-seq q-PCR

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

新型冠状病毒疫苗预防变异株重症发生的机制

引用

国际生物制品学杂志 2023年第4期46卷 228-234页

作者：马永平重庆医科大学基础医学院分子医学与肿瘤研究中心生物化学与分子生物学教研室重庆400016

疫苗是预防COVID-19疫情的主要手段之一,然而,随着新型冠状病毒变异株尤其是奥密克戎株的出现,疫苗的预防作用有所减弱,民众期盼疫苗更新能赶上病毒变异速度。此文从新型冠状病毒的感染特征和黏膜免疫的关系出发,论述了第1代COVID-19疫... 详细信息

疫苗是预防COVID-19疫情的主要手段之一,然而,随着新型冠状病毒变异株尤其是奥密克戎株的出现,疫苗的预防作用有所减弱,民众期盼疫苗更新能赶上病毒变异速度。此文从新型冠状病毒的感染特征和黏膜免疫的关系出发,论述了第1代COVID-19疫苗在预防变异株重症化方面的积极作用与不足,并对奥密克戎变异株的进化提出了新的干扰剧变假说,希望引起对病毒非自然加速进化的关注。虽然疫情已经结束,但是针对过去3年在新型冠状病毒变异株疫苗研发过程中的滞后现状,此文提出应急情况下针对变异株升级疫苗审批的疫苗升级绿色通道和紧急使用的瞻前性研究,探讨从法规和政策方面进行改革的可行性,以便将来再次遭遇类似COVID-19疫情的紧急情况时,通过及时升级疫苗应对快速变化的疫情。

关键词：新型冠状病毒变异株新型冠状病毒疫苗干扰剧变假说疫苗升级绿色通道

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：