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Smoothened沉默胚胎成纤维细胞NIH/3T3的mRNA表达谱分析

医学研究杂志 2020年第9期49卷 46-50,10页

作者：刘董剑梁亚冰崔宏伟张岩杨凌内蒙古医科大学呼和浩特010110 内蒙古医科大学附属医院临床医学研究中心、内蒙古自治区医学细胞生物学重点实验室呼和浩特010050 内蒙古医科大学基础医学院遗传学教研室呼和浩特010110

目的探讨通过沉默Smoothened(Smo)基因抑制Hedgehog通路后,小鼠胚胎成纤维细胞NIH/3T3中mRNA表达谱的变化。方法提取Smo沉默和对照NIH/3T3细胞的总RNA,并进行测序。与对照组比较,分析差异表达的mRNA,通过BLAST2GO和京都基因与基因组百... 详细信息

目的探讨通过沉默Smoothened(Smo)基因抑制Hedgehog通路后,小鼠胚胎成纤维细胞NIH/3T3中mRNA表达谱的变化。方法提取Smo沉默和对照NIH/3T3细胞的总RNA,并进行测序。与对照组比较,分析差异表达的mRNA,通过BLAST2GO和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析和预测这些差异表达mRNA的相关功能。选取差异表达mRNA进行实时定量PCR验证。结果通过测序在Smo沉默的NIH/3T3细胞中发现有2289个mRNA差异表达,其中1646个mRNA在Smo沉默后表达下调,而643个mRNA表达上调。荧光实时定量PCR结果与测序结果一致。生物信息学分析显示,差异表达mRNA参与细胞过程、单有机体过程、生物学调节。差异表达mRNA富集在轴突导向(ko04360)、癌症通路(ko05200)、癌症中的microRNA(ko05206)等通路。利用GEPIA数据库分析CXCL12、IL-33、TGF-β2和FGF10及其受体在食管癌和正常食管组织中的表达情况,和预后的预测分析。结论在NIH/3T3细胞中沉默Smo抑制Hedgehog通路可能会通过细胞因子CXCL12、IL-33、TGF-β2和FGF10影响肿瘤细胞的增殖。

关键词：小鼠胚胎成纤维细胞 Hedgehog通路 Smoothened mRNA表达谱分析

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高浓度棕榈酸对正常肝细胞株糖皮质激素受体α-亚型表达的影响

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贵阳医学院学报 2009年第2期34卷 181-185页

作者：吴青龙洋王蕴红田浩明贵阳市消防支队卫生队贵州贵阳550002 四川大学华西医院内分泌代谢病研究室四川成都610041 重庆医科大学基础医学院遗传与细胞生物学教研室重庆400016

目的:研究高浓度棕榈酸对肝细胞糖皮质激素受体α亚型(GRα)表达的影响。方法:用含有10%小牛血清的低糖DMEM培养基培养正常肝细胞株L02。1.0×105细胞接种到6孔板中,并用含有200 mmol/L棕榈酸的低糖DMEM培养基培养72 h,24 h换液1次... 详细信息

目的:研究高浓度棕榈酸对肝细胞糖皮质激素受体α亚型(GRα)表达的影响。方法:用含有10%小牛血清的低糖DMEM培养基培养正常肝细胞株L02。1.0×105细胞接种到6孔板中,并用含有200 mmol/L棕榈酸的低糖DMEM培养基培养72 h,24 h换液1次,用实时荧光定量PCR进行定量分析GRαmRNA。结果:高浓度棕榈酸培养72 h后,肝细胞内GRαmRNA水平是对照组(用含10%、不含脂肪酸牛血清白蛋白的低糖DMEM培养基培养72 h)的1.67倍。结论:高浓度棕榈酸可以刺激肝细胞GRα上调表达。

关键词：受体,糖皮质激素代谢综合征X 肝细胞棕榈酸类

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双氢青蒿素影响人胶质瘤细胞生物学特性的研究

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中国药物与临床 2021年第20期21卷 3361-3364,I0002页

作者：刘秀中董金垚张燕燕师如意山西省武乡县人民医院普通外科 046300 山西医科大学附属山西省肿瘤医院外科特需病区山西医科大学第一医院普通外科山西医科大学基础医学院医学细胞生物学与遗传学教研室

目的观察中药制剂双氢青蒿素(DHA)对胶质瘤SHG44细胞生物学特性的影响。方法利用细胞增殖实验(MTT)法、trans-well法、流式细胞术、聚合酶链反应(PCR)等方法分别检测DHA对SHG44细胞在增殖、迁移、细胞周期及Claudin-1基因表达等方面的... 详细信息

目的观察中药制剂双氢青蒿素(DHA)对胶质瘤SHG44细胞生物学特性的影响。方法利用细胞增殖实验(MTT)法、trans-well法、流式细胞术、聚合酶链反应(PCR)等方法分别检测DHA对SHG44细胞在增殖、迁移、细胞周期及Claudin-1基因表达等方面的影响。结果SHG44细胞的增殖、迁移能力可受到DHA显著抑制;DHA可以显著影响细胞之间的紧密连接蛋白Claudin-1的表达水平,使其上调表达。结论DHA可以通过影响SHG44细胞生物学特性起到抗癌作用,是潜在的治疗胶质瘤的新药。

关键词：双氢青蒿素胶质瘤细胞生物学

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富丝氨酸/精氨酸剪接因子7的表达在肝细胞癌中的意义

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广西医科大学学报 2024年第5期41卷 697-707页

作者：唐文张飞云韦彩妮赵玉玲刘耀鸿黎东心黄秒胡启平广西医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室南宁530021 广西高校生物分子医学研究重点实验室南宁530021 广西医科大学第一临床医学院南宁530021 广西医科大学附属肿瘤医院影像诊断中心南宁530021 广西医科大学长寿与老年相关疾病教育部重点实验室南宁530021

目的:探讨富丝氨酸/精氨酸剪接因子7(SRSF7)表达肝细胞癌(HCC)中的临床意义及生物学功能。方法:首先通过TCGA数据库中HCC转录组数据和临床数据分析SRSF7的表达水平、临床病理特征、功能和通路富集情况。再利用临床HCC样本、Huh7、Hep3B... 详细信息

目的:探讨富丝氨酸/精氨酸剪接因子7(SRSF7)表达肝细胞癌(HCC)中的临床意义及生物学功能。方法:首先通过TCGA数据库中HCC转录组数据和临床数据分析SRSF7的表达水平、临床病理特征、功能和通路富集情况。再利用临床HCC样本、Huh7、Hep3B细胞株进行验证;将细胞分为对照组(control组)、过表达组(SRSF7OE组)和敲低组(SRSF7KD组)。细胞计数试剂盒(CCK-8)实验、TUNEL实验检测其增殖和凋亡能力;伤口愈合实验、Transwell迁移实验和Transwell侵袭实验检测其迁移和侵袭能力;蛋白质免疫印迹法(western blotting)实验检测上皮—间质转化(EMT)相关标志物的蛋白水平;实时荧光定量PCR(RT-qPCR)实验检测SRSF7下游调控基因的mRNA水平。结果:生信分析结果显示,SRSF7在HCC肿瘤组织中呈高表达并且与肿瘤分级、分期和患者预后不良有关(P<0.05)。Western blotting和免疫组化结果显示,SRSF7在肿瘤组织中呈高表达(P<0.05)。与对照组相比,过表达SRSF7能促进HCC细胞增殖、迁移侵袭以及EMT进程;敲低SRSF7能抑制HCC细胞增殖、促进细胞凋亡,抑制HCC细胞迁移侵袭和EMT进程(P<0.05)。结论:SRSF7在HCC中呈高表达,其高表达可能通过调控PAK5、RTL1等下游靶基因的表达来促进HCC细胞增殖,抑制细胞凋亡,并通过促进EMT进程来促进细胞迁移和侵袭,进而促进HCC的进展。

关键词：肝细胞癌富丝氨酸/精氨酸剪接因子7 增殖迁移侵袭上皮—间质转化

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利用靶向二代测序技术对一个Alport综合征家系进行基因突变分析

利用靶向二代测序技术对一个Alport综合征家系进行基因突变分析

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第十四次全国医学遗传学学术会议

作者：陈晨卢超霞王琼曹丽华罗阳张学中国医科大学医学基因组学教研室教育部医学细胞生物学重点实验室中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础医学院医学遗传学系

目的:Alport综合征(Alport syndrome,AS)是一种遗传性肾病,以血尿,进行性肾功能衰竭,感音神经性耳聋和眼部异常为主要特征,其致病基因是分别编码Ⅳ型胶原α3,α4和α5链的COL4A3,COL4A4和COL4A5基因。Ⅳ型胶原是肾小球基底膜的主要成分... 详细信息

目的:Alport综合征(Alport syndrome,AS)是一种遗传性肾病,以血尿,进行性肾功能衰竭,感音神经性耳聋和眼部异常为主要特征,其致病基因是分别编码Ⅳ型胶原α3,α4和α5链的COL4A3,COL4A4和COL4A5基因。Ⅳ型胶原是肾小球基底膜的主要成分,因此上述基因的突变,均可影响Ⅳ型胶原的折叠、分泌及基质形成等分子生物学功能,从而引起AS。方法:我们利用Ion AmpliseqTM Inherited Disease Panel,通过靶向二代测序技术进行包括COL4A3,COL4A4和COL4A5基因在内的328个基因的突变筛查,针对可疑突变进行Sanger测序验证及进一步的RNA水平分析。结果:靶向二代测序区域未直接检测到致病突变,但我们在分析原始数据中发现COL4A5基因外显子4,10,17,20,21,37和45未被Disease Panel的探针完全覆盖,Sanger测序验证以上区域,发现先证者COL4A5基因内含子9存在剪接突变c.547-3C>A,其母亲该位点为杂合突变。经RNA提取及cDNA测序分析显示先证者发生COL4A5基因外显子1 0跳跃,整码缺失21个氨基酸。结论:本研究首次发现COL4A5基因的一个新剪接突变,导致外显子10缺失,据此分析在蛋白水平Ⅳ型胶原α5链将丢失7个典型的Gly—X-Y结构,很可能影响胶原分子的构象、弹性及组装。综上,我们利用二代测序技术检测到X连锁Alport综合征家系的致病突变,并在RNA水平验证了该突变导致的外显子跳跃,帮助确定临床诊断,并为后续的遗传咨询和产前诊断提供可靠依据。

关键词：先证者靶向二代测序 Alport 综合征基因突变分析

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金属硫蛋白-1和CT23在肝细胞癌中的表达及意义

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广东医学 2019年第2期40卷 214-219页

作者：卢丽斯黄秒孙克俭覃世兴王莉雯冯祥匡琪琪葛盈盈王弘姚家丽付骏吴圣明胡启平广西医科大学临床医学系基础医学院广西南宁530021 广西医科大学附属肿瘤医院影像学诊断中心广西南宁530021 广西医科大学细胞生物学与遗传学教研室广西南宁530021 广西医科大学组织学与胚胎学教研室广西南宁530021 广西医科大学附属肿瘤医院病理科广西南宁530021

目的探讨金属硫蛋白-1(MT-1)、癌-睾丸抗原CT23在肝癌细胞、原发性肝细胞癌(HCC)中的表达及其与临床资料的关系和意义,了解MT-1和CT23在HCC发生、发展中的联系,为进一步研究HCC的发生、发展机制和相应治疗措施提供实验依据。方法运用RN... 详细信息

目的探讨金属硫蛋白-1(MT-1)、癌-睾丸抗原CT23在肝癌细胞、原发性肝细胞癌(HCC)中的表达及其与临床资料的关系和意义,了解MT-1和CT23在HCC发生、发展中的联系,为进一步研究HCC的发生、发展机制和相应治疗措施提供实验依据。方法运用RNA干扰、表达谱芯片、荧光定量PCR、免疫组化SP法检测CT23与MT-1在肝癌细胞、HCC组织及其癌旁组织中的表达;通过t检验分析癌组织及癌旁组织中MT-1、CT23的表达与患者性别、年龄、甲胎蛋白(AFP)、乙肝表面抗原(HBsAg)、肿瘤大小、肿瘤数目、有无转移、Edmondson分级、肝硬化的关系。结果 (1)MT-1和CT23的阳性信号主要定位于细胞质,镜下呈棕黄色或棕褐色团块或颗粒状。(2)MT-1、CT23在HCC组织中的表达均较癌旁组织低(P<0.05)。(3)在HCC组织中,肿瘤Edmondson分级低、单发者MT-1表达高于肿瘤Edmondson分级高、多发者(P<0.05),MT-1表达与年龄、性别、HBsAg、肿瘤大小、AFP、肝硬化、肝脂肪变性、有无转移无明显关系(P>0.05);MT-1在癌旁组织中的表达与临床资料无明显关系(P>0.05)。(4)CT23的表达在HCC组织及癌旁组织中与临床资料无明显关系(P>0.05)。(5)肝癌细胞中CT23下调引起MT-1 mRNA上调,HCC组织及癌旁组织中,MT-1与CT23之间的蛋白表达无明显关系(P>0.05)。结论 MT-1在HCC组织中表达较癌旁组织中降低,且在Edmondson分级较高、肿瘤多发者中MT-1表达较低,可见MT-1与HCC的发生、发展密切相关,其机制可能与肝组织中MT-1下调后金属解毒能力下降、自由基堆积导致细胞进一步恶化相关。CT23下调后细胞中MT-1表达上升,提示CT23下调后肝癌细胞恶性行为的下调可能通过MT-1表达上调来实现,但相关性和具体机制尚不明确,有待进一步研究。

关键词：原发性肝细胞癌 MT-1 CT23 免疫组化 RNA干扰

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CT23通过调节H6PD表达影响磷酸戊糖途径调控肝细胞癌细胞凋亡

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广西医科大学学报 2024年第4期41卷 516-523页

作者：杨哲廖晓璐张若皓卢玉飞党德静宁敬予陈俊霏肖贝贝黄秒胡启平广西医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室南宁530021 广西高校生物分子医学研究重点实验室南宁530021 广西医科大学第一临床医学院南宁530021 广西医科大学第二临床医学院南宁530021 广西医科大学附属肿瘤医院影像诊断中心南宁530021 广西医科大学长寿与老年相关疾病教育部重点实验室南宁530021

目的:探讨癌-睾丸抗原23(CT23)参与磷酸戊糖途径(PPP)调控,促进肝细胞癌(HCC)细胞凋亡的分子机制。方法:通过全转录组测序、葡萄糖消耗检测、乳酸生成分析、还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)生成检测、活性氧(ROS)生成分析和线粒... 详细信息

目的:探讨癌-睾丸抗原23(CT23)参与磷酸戊糖途径(PPP)调控,促进肝细胞癌(HCC)细胞凋亡的分子机制。方法:通过全转录组测序、葡萄糖消耗检测、乳酸生成分析、还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)生成检测、活性氧(ROS)生成分析和线粒体示踪等方法探讨CT23与PPP的关系;蛋白质印记法(western blotting)及实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测敲低CT23的HCC细胞中已糖-6-磷酸脱氢酶(H6PD)表达量变化,TUNEL法分析细胞凋亡。结果:CT23与PPP有关;与control组相比,shCT23组HCC细胞葡萄糖消耗减少,乳酸生成水平降低,NADPH生成水平降低,ROS水平升高,细胞凋亡增加,H6PD mRNA水平降低,H6PD蛋白水平降低(均P<0.05);电镜下细胞形态发生变化并伴随线粒体损伤;与shCT23组相比,shCT23+H6PDOE组HCC细胞H6PD蛋白水平升高,葡萄糖消耗增多,乳酸生成水平升高,NADPH生成水平升高,细胞凋亡减少(均P<0.05)。结论:CT23通过H6PD增强PPP促进HCC细胞凋亡。

关键词：肝细胞癌癌—睾丸抗原23 磷酸戊糖途径己糖-6-磷酸脱氢酶

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宁夏地区汉族MTHFR基因C677T多态性与男性无精和严重少弱精的相关性分析

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宁夏医科大学学报 2011年第7期33卷 625-628页

作者：邱晓峰胡小平李元杰党洁彭亮徐仙李永丽焦海燕宁夏医科大学总医院泌尿外科银川750001 生育力保持省部共建教育部重点实验室宁夏回族自治区生殖与遗传重点实验室银川750004 宁夏医科大学基础医学院医学遗传学与细胞生物学教研室银川750004 宁夏医科大学总医院生殖中心银川750001

目的研究宁夏地区汉族人群5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶基因(MTHFR)C677T多态性与男性不育患者无精和严重少弱精的相关性。方法采用病例-对照研究方法,应用限制性片段长度多态性扩增技术(PCR-RFLP)分析宁夏地区汉族271例男性不育患者(其... 详细信息

目的研究宁夏地区汉族人群5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶基因(MTHFR)C677T多态性与男性不育患者无精和严重少弱精的相关性。方法采用病例-对照研究方法,应用限制性片段长度多态性扩增技术(PCR-RFLP)分析宁夏地区汉族271例男性不育患者(其中无精患者158例、严重少弱精患者113例)和180例正常男性的MTHFR C677T等位基因频率及基因型分布特点。结果①不育患者与正常对照组MTH-FR C677T的各基因型分别为CC 27.7%vs 35.0%、CT 41.3%vs 47.2%和TT 31.0%vs 17.8%,两组间基因型分布及等位基因频率差异有统计学意义(P<0.01)。②将不育患者分为无精患者组和严重少弱精患者组后,两组MTHFR C677T基因型分布均仍与正常对照组差异有统计学意义(P<0.05)。结论 MTHFR C677T多态性可能是宁夏汉族男性不育的易感性风险因素。

关键词：无精症严重少弱精症 5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性

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环境污染物暴露对儿童免疫系统发育的影响

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广西医科大学学报 2024年第11期41卷 1530-1537页

作者：霍霞谢博曾志俊徐锡金暨南大学环境与气候学院环境医学与发育毒理学实验室广州511443 暨南大学第一附属医院环境医学与发育毒理学实验室广州510630 重庆医科大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生学教研室重庆400016 汕头大学医学院环境医学与发育毒理学实验室汕头515041 汕头大学医学院细胞生物学与遗传学教研室汕头515041

环境污染物的暴露会导致炎症因子释放和免疫功能受损。本文基于粗放式电子垃圾拆解污染现场,通过检测重金属、有机污染物、大气污染物等环境污染物内、外暴露水平,儿童外周血炎症细胞、细胞因子和接种I类疫苗后血清特异性抗体浓度等免... 详细信息

环境污染物的暴露会导致炎症因子释放和免疫功能受损。本文基于粗放式电子垃圾拆解污染现场,通过检测重金属、有机污染物、大气污染物等环境污染物内、外暴露水平,儿童外周血炎症细胞、细胞因子和接种I类疫苗后血清特异性抗体浓度等免疫相关指标,探讨环境污染物暴露对儿童免疫系统发育的影响及其健康风险。结果发现,粗放式电子垃圾拆解区各类污染物处于较高水平,长期污染物暴露可造成儿童机体呈现慢性低度炎症状态,疫苗接种所产生的特异性抗体滴度较低且与污染物暴露水平负相关,儿童黏膜免疫系统受损,感冒、腹泻等呼吸、消化系统病症的发生频率增加,儿童免疫功能的变化与年龄、性别、营养状况和复合暴露有关。由于机体低度炎症是衰老和慢性疾病的重要因素,也是各类器官系统损伤和疾病发生的主要诱发因素,随着年龄的增长,罹患心血管疾病、糖尿病、神经退行性疾病和自身免疫性疾病等慢性疾病的发病风险不断加大。研究提示,环境污染物暴露可通过干扰儿童期免疫系统的正常发育,增加成年后罹患相关疾病的风险。这些研究可为制定针对性的疫苗接种政策和慢性疾病的早期防控提供科学依据。

关键词：污染物暴露免疫毒理慢性低度炎症儿童健康

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川金丝猴(Rhinopithecus roxellana)基因组微卫星的鉴定与多态性分子标记筛选的研究

川金丝猴(Rhinopithecus roxellana)基因组微卫星的鉴定与多态性...

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第十四届全国野生动物生态与资源保护学术研讨会暨第九届中国动物学会兽类学分会全国代表大会

作者：蔡延森余浩洋刘三许侯伟刘选珍李静四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室四川成都610041 成都动物园，四川成都，610081 西南医科大学基础医学院医学细胞生物学与遗传学教研室四川泸州646000 四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室四川成都610041 成都动物园四川成都610081

微卫星序列,又称为短串联重复序列(SSRs),一般重复单位为1～6bp,广泛存在于真核、原核和病毒基因组中。微卫星既是基因组的重要组成,也是种群遗传学中运用最广泛的遗传标记。

关键词：川金丝猴微卫星全基因组遗传管理谱系鉴定

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