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β2微球蛋白-接头蛋白2-人类白细胞抗原A24(β2m-linker 2-HLA A24)蛋白的生物信息学分析、真核表达与鉴定

细胞与分子免疫学杂志 2020年第5期36卷 398-403页

作者：高雯琬陈思吟徐敏陶崑重庆医科大学基础医学院免疫教研室重庆400016

目的应用生物信息学方法对β2微球蛋白-接头蛋白2-人类白细胞抗原A24(β2m-linker 2-HLA A24)蛋白进行结构、功能预测分析,并对该蛋白进行真核表达与纯化。方法运用在线蛋白质分析软件ProtParam预测β2m-linker 2-HLA A24蛋白理化性质;... 详细信息

目的应用生物信息学方法对β2微球蛋白-接头蛋白2-人类白细胞抗原A24(β2m-linker 2-HLA A24)蛋白进行结构、功能预测分析,并对该蛋白进行真核表达与纯化。方法运用在线蛋白质分析软件ProtParam预测β2m-linker 2-HLA A24蛋白理化性质;磷酸化位点预测软件NetPhos和蛋白质二级结构预测软件SOPMA分析其磷酸化位点和二级结构;并利用蛋白质结构模型预测工具SWISS-MODEL建立三级结构模型。构建含组氨酸标签(His tag)的重组质粒pcDNA3.4/β2m-linker 2-HLA A24-His tag,在Expi293F细胞表达,经镍柱亲和层析获得β2m-linker 2-HLA A24蛋白;采用SDS-PAGE、Western blot、间接ELISA验证蛋白的纯度和性质。结果β2m-linker 2-HLA A24蛋白含有44个磷酸化位点,属于亲水性蛋白,二级结构以无规卷曲为主,并成功构建三级结构模型;成功构建pcDNA3.4/β2m-linker 2-HLA A24-His tag重组质粒,并在Expi293F细胞表达系统中获得可溶性表达。结论成功构建β2m-linker 2-HLA A24蛋白,生物信息学结果显示该蛋白具备与抗原肽结合并激活T细胞的功能。为后续联合使用该蛋白与抗原肽激活抗原特异性CD8^+T细胞实验奠定了基础。

关键词： β2微球蛋白-接头蛋白2-人类白细胞抗原A24(β2m-linker 2-HLA A24) 生物信息学真核表达

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应变控制对形状记忆聚氨酯表面微纳结构的影响

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西南医科大学学报 2023年第1期46卷 31-36页

作者：张雪莲潘显超乔雅茹韩榕林王锦峰邢娟西南医科大学基础医学院病理生理教研室泸州646000 西南医科大学药学院药物化学教研室泸州646000 重庆大学生物工程学院重庆400045

目的探讨应变控制对形状记忆聚氨酯表面微纳结构的影响。方法将拉伸率为200%的聚氨酯薄膜,以夹具将两端固定的应变控制方式在32°C的空气中静置24 h;随后去除固定装置,让薄膜在41℃的空气环境中进行形状回复。计算薄膜形状回复率,... 详细信息

目的探讨应变控制对形状记忆聚氨酯表面微纳结构的影响。方法将拉伸率为200%的聚氨酯薄膜,以夹具将两端固定的应变控制方式在32°C的空气中静置24 h;随后去除固定装置,让薄膜在41℃的空气环境中进行形状回复。计算薄膜形状回复率,采用原子力显微镜和扫描电镜观测和分析不同形态下(原始形状、应变控制后形状、回复后形状)聚氨酯薄膜表面微纳结构的变化与差异。结果应变控制降低了薄膜的形状回复率。原子力显微镜和扫描电镜观测结果显示:原始形状中聚氨酯分子链段中的硬段与软段发生相分离,硬段聚集形成无序的微区结构,并进一步组装成纳米纤维。拉伸引起微区结构沿拉伸方向有序排列,其结果是纳米纤维在拉伸薄膜表面沿拉伸方向延伸。应变控制对拉伸薄膜表面微纳结构无显著影响;经应变控制处理后薄膜表面微纳结构的排列仍处于有序状态,形状回复仅改变纳米纤维排列方向。结论应变控制可调节聚氨酯形状回复性能及表面微纳结构,研究结果对该材料在生物医学领域的应用具有重要参考价值。

关键词：应变控制形状记忆聚氨酯微纳结构

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生理学“四位一体”创新实验课程体系改革

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基础医学教育 2022年第12期24卷 961-965页

作者：黄春霞王岩陈显军耿艳清王美姣李英博重庆医科大学基础医学院生理学教研室重庆400016 重庆医科大学实验教学中心机能实验室

教研室结合国家级一流本科课程,建设了“四位一体”创新实验课程体系。文章旨在探讨该课程体系和多维度的过程性评价建立方法和成效。“四位一体”创新实验课程体系能更有效地调动学生的学习积极性,使学生科研思维能力、科研设计能力、... 详细信息

教研室结合国家级一流本科课程,建设了“四位一体”创新实验课程体系。文章旨在探讨该课程体系和多维度的过程性评价建立方法和成效。“四位一体”创新实验课程体系能更有效地调动学生的学习积极性,使学生科研思维能力、科研设计能力、团队协作能力和解决问题的能力等均得到提升,有利于新型创新人才的培养和实验教学质量的提高。

关键词：生理学实验教学教学改革

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蛋白的酪氨酸磷酸化信号通路与阿尔茨海默病的关系

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中国比较医学杂志 2021年第7期31卷 147-152页

作者：李雅娟孙姣姣刘广益于洋重庆医科大学附属永川医院重庆永川402160 西南医科大学基础医学院组织胚胎学教研室四川泸州646000

蛋白酪氨酸磷酸化信号通路是广泛存在于细胞中的重要信号转导通路,其功能与细胞增值、分化、转化及凋亡密切相关。阿尔茨海默病是一种神经系统退行性疾病,与年龄相关,具有隐匿发病、进行发展的特点。其主要病理特征为β-淀粉样蛋白(amyl... 详细信息

蛋白酪氨酸磷酸化信号通路是广泛存在于细胞中的重要信号转导通路,其功能与细胞增值、分化、转化及凋亡密切相关。阿尔茨海默病是一种神经系统退行性疾病,与年龄相关,具有隐匿发病、进行发展的特点。其主要病理特征为β-淀粉样蛋白(amyloid proteinβ,Aβ)聚集,Tau蛋白异常磷酸化后形成神经纤维缠结(neurofibrillary tangle,NFT)。酪氨酸激酶抑制剂治疗阿尔茨海默病已成为现代医学研究的一大热门,故对蛋白酪氨酸磷酸化信号通路与阿尔茨海默病关系的基础研究进展作以下简要综述。

关键词：酪氨酸磷酸化阿尔茨海默病信号通路

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基于生物信息学分析的肝癌核心基因的筛选及验证

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基因组学与应用生物学 2021年第2期40卷 867-877页

作者：李怡敏汪洋袁琳 Nur Fazleen Binti Idris 黄国旺涂增重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室分子医学与肿瘤研究中心重庆400016 西安市第一医院西安710000

本研究基于GEO数据库,选取由慢性乙型肝炎诱导的肝细胞癌芯片数据GSE121248为研究对象,利用GEO_(2)R软件分析数据,筛选出差异表达基因,利用DAVID数据库进行GO分析和KEGG pathway富集分析。利用STRING数据库构建PPI网络,分析筛选核心基... 详细信息

本研究基于GEO数据库,选取由慢性乙型肝炎诱导的肝细胞癌芯片数据GSE121248为研究对象,利用GEO_(2)R软件分析数据,筛选出差异表达基因,利用DAVID数据库进行GO分析和KEGG pathway富集分析。利用STRING数据库构建PPI网络,分析筛选核心基因。利用GEPIA对核心基因的表达进行验证,Kaplan Meier Plotter在线分析工具对核心基因与患者生存情况的相关性进行验证。通过上述方法筛选出309个DEGs,其中上调基因94个,下调基因215个。差异基因功能分析显示上调的DEGs主要参与细胞周期和卵母细胞减数分裂通路等途径,下调的DEGs则在补体和凝血级联、代谢途径以及咖啡因代谢途径富集。筛选出15个具有高度关联性的核心基因(BUB1,BUB1B,BIRC5,CCNB1,CCNB2,CDC20,CDK1,KIF-20A,MAD2L1,NCAPG,ZWINT,PBK,BTL,TTK和NUSAP1),它们与肝癌患者的总体生存率具有明显相关性,并为其构建了miRNA调控网络。本研究通过生物信息学方法有效分析了肝细胞癌发生、发展相关的差异表达基因,筛选出15个核心基因,分析其生物学相关功能,以期探索肝细胞癌发病机制,并为临床诊断标志物的改进以及筛选提供一定的理论基础。

关键词：肝癌差异表达基因生物信息学

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营养状态和认知功能对PD患者日常生活能力的作用机制探索——基于中介效应和调节效应

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现代预防医学 2021年第21期48卷 4001-4005+4011页

作者：韩敏秦瑶葛晓燕韩红娟崔靖余红梅山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室锦州医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室山西医科大学基础医学院数学教研室重大疾病风险评估山西省重点实验室

目的探讨营养状态和认知功能对PD患者日常生活能力的影响机制。方法收集某院365例PD患者资料;采用简易营养评估量表(Mini Nutritional Assessment, MNA)、简易精神状态量表(Mini-Mental State Examination, MMSE)和统一帕金森病评分量表... 详细信息

目的探讨营养状态和认知功能对PD患者日常生活能力的影响机制。方法收集某院365例PD患者资料;采用简易营养评估量表(Mini Nutritional Assessment, MNA)、简易精神状态量表(Mini-Mental State Examination, MMSE)和统一帕金森病评分量表(Unified Parkinson’s Disease Rating Scale, UPDRSⅡ)分别评估PD患者的营养状态、认知功能和日常生活能力。采用Bootstrap法进行中介效应检验;采用协方差分析和简单效应分析检验调节效应。采用近似误差均方根(root-mean-square error of approximation, RMSEA)、赤池信息量准则(Akaike information criterion, AIC)、一致性赤池信息量准则(consistent Akaike information criterion, CAIC)和期望交叉验证指数(expected cross-validation index, ECVI)指标评估中介效应和调节效应模型的性能。结果中介效应结果:路径MNA→MMSE→UPDRSⅡ的中介效应无统计学意义Z=-1.83(P=0.067),β=-0.079, 95%CI(-0.164～0.006);路径MMSE→MNA→UPDRSⅡ的中介效应有统计学意义Z=-2.33(P<0.001),β=-0.106, 95%CI(-0.195～-0.017),中介效应占比为16.48%。调节效应结果:MMSE和MNA交互效应系数为β=-12.792(P=0.013),95%CI(-22.845～-2.740),t=-2.500。简单效应结果:潜在营养不良时,认知障碍组比认知正常组UPDRSⅡ评分平均高2.553分,95%CI为1.008～4.099;营养不良时,认知障碍组比认知正常组UPDRSⅡ评分平均高7.780分,95%CI为6.838～8.723。出现营养不良时,认知障碍与认知正常组的差值有统计学意义F=36.557(P<0.001),潜在营养不良时候,认知障碍与认知正常组的差值无统计学意义F=2.829(P>0.05)。结论 MMSE→MNA→UPDRSⅡ的中介路径成立,但是中介效应较弱;PD发展机制中,营养状态介导并调节了认知功能对PD患者日常生活能力的影响。

关键词：帕金森病营养状态认知功能日常生活能力调节效应中介效应

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缺氧条件下胶质瘤分泌的外泌体通过JAK/STAT3信号通路促进胶质瘤干细胞迁移

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第三军医大学学报 2020年第4期42卷 392-400页

作者：程玥叶秀峰重庆医科大学基础医学院病理学教研室

目的探讨胶质瘤细胞在缺氧条件下分泌的外泌体对胶质瘤干细胞迁移的作用。方法超高速离心法提取缺氧和常氧条件下胶质瘤细胞分泌的外泌体,采用透射电子显微镜(TEM)和动态光散射(DLS)、Western blot检测等方法对外泌体进行鉴定;用DIO染... 详细信息

目的探讨胶质瘤细胞在缺氧条件下分泌的外泌体对胶质瘤干细胞迁移的作用。方法超高速离心法提取缺氧和常氧条件下胶质瘤细胞分泌的外泌体,采用透射电子显微镜(TEM)和动态光散射(DLS)、Western blot检测等方法对外泌体进行鉴定;用DIO染料标记外泌体,荧光显微镜观察胶质瘤干细胞能否摄取外泌体。将PBS(空白组)、常氧(20%O2,常氧组)和缺氧(1%O2,缺氧组)条件下提取的外泌体与胶质瘤干细胞共培养,CCK-8法测定胶质瘤干细胞增殖情况,Transwell实验检测胶质瘤干细胞迁移能力变化,Western blot检测JAK/STAT3通路蛋白磷酸化水平的改变。结果在胶质瘤干细胞的胞质中检测到外泌体携带的荧光染料DIO。CCK-8结果显示:提取的外泌体以不同浓度(浓度梯度依次为1、5、10、20、40μg/mL)处理不同时间(12、24、48、72 h)后,常氧组和缺氧组胶质瘤干细胞的细胞活力差异无统计学意义。与空白组和常氧组比较,缺氧组提取外泌体共培养组的胶质瘤干细胞迁移能力显著提高(P<0.05),JAK/STAT3通路蛋白磷酸化水平也显著增加(P<0.05)。结论胶质瘤细胞在缺氧条件下分泌的外泌体部分通过提高JAK/STAT3通路磷酸化水平促进胶质瘤干细胞迁移。

关键词：外泌体胶质瘤干细胞缺氧细胞迁移 JAK/STAT3

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医学蠕虫水通道蛋白研究进展

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中国血吸虫病防治杂志 2020年第5期32卷 542-547页

作者：王芬叶彬重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室重庆400016 重庆医科大学分子医学与肿瘤研究中心

水通道蛋白是广泛存在于医学蠕虫中的一类可特异性介导水和其他溶质分子跨膜转运的膜内在蛋白,其在促进水跨膜转运、渗透调节、营养物质吸收、有毒代谢产物排出以及抗寄生虫药物转运过程中发挥重要作用,有望成为抗寄生虫疫苗候选分子和... 详细信息

水通道蛋白是广泛存在于医学蠕虫中的一类可特异性介导水和其他溶质分子跨膜转运的膜内在蛋白,其在促进水跨膜转运、渗透调节、营养物质吸收、有毒代谢产物排出以及抗寄生虫药物转运过程中发挥重要作用,有望成为抗寄生虫疫苗候选分子和药物靶点。本文综述了医学蠕虫水通道蛋白的结构特征并探讨其作为抗蠕虫疫苗候选分子和药物靶点的可行性,为新型抗寄生虫疫苗或药物研发提供参考。

关键词：医学蠕虫水通道蛋白疫苗候选分子药物靶点

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柚皮素通过Nrf2/HO-1通路减轻链脲佐菌素诱导的SH-SY5Y细胞损伤

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神经解剖学杂志 2020年第5期36卷 553-559页

作者：向辉秦晶晶茶喆李玉林余华荣重庆医科大学基础医学院生理学教研室重庆400016

目的:研究柚皮素(Nar)能否通过核因子E2相关因子2(Nrf2)/血红素加氧酶-1(HO-1)信号通路减轻链脲佐菌素(STZ)诱导的人神经母细胞瘤细胞系SH-SY5Y细胞损伤。方法:将SH-SY5Y细胞分为3组:对照组(control)、STZ处理组(STZ)和STZ与Nar联合处理... 详细信息

目的:研究柚皮素(Nar)能否通过核因子E2相关因子2(Nrf2)/血红素加氧酶-1(HO-1)信号通路减轻链脲佐菌素(STZ)诱导的人神经母细胞瘤细胞系SH-SY5Y细胞损伤。方法:将SH-SY5Y细胞分为3组:对照组(control)、STZ处理组(STZ)和STZ与Nar联合处理组(STZ+Nar)。STZ组为用8 mmol/L STZ处理SH-SY5Y细胞,STZ+Nar组为用8 mmol/L STZ与200μmol/L Nar共同处理SH-SY5Y细胞。利用CCK-8试剂盒检测细胞活性;Annexin-V/PI染色检测细胞凋亡情况;活性氧(ROS)染色检测细胞ROS水平;Western Blot检测Nrf2与HO-1蛋白的表达情况;Real time RT-PCR检测Nrf2与HO-1的mRNA表达水平。结果:与control组相比,STZ组在8 mmol/L STZ处理4 h后达到半数致死量,ROS水平显著提升,细胞凋亡率达到约50%,Nrf2蛋白水平有所提高(P <0.05),Nrf2的mRNA水平未见显著性差异,HO-1蛋白水平未见显著性差异而mRNA水平明显升高(P <0.01)。当Nar与STZ共同处理细胞后,与STZ组相比,细胞活性显著提升(P <0.01),ROS水平明显下降,细胞凋亡率显著下降(P <0.01),Nrf2蛋白与mRNA水平显著升高(P <0.01),HO-1蛋白水平显著升高(P <0.01),HO-1 mRNA水平有所升高(P <0.05)。结论:Nar能通过增强Nrf2/HO-1信号通路的活性减轻STZ诱导的SH-SY5Y细胞损伤。

关键词：柚皮素链脲佐菌素氧化应激 Nrf2/HO-1 SH-SY5Y细胞

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丙泊酚抑制肥大细胞脱颗粒减轻大鼠脑出血神经功能损伤

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神经解剖学杂志 2022年第5期38卷 537-543页

作者：杨正宇黄娟陶飞廖玉慧陆蔚天陆军军医大学大坪医院麻醉科重庆400038 重庆医科大学神经科学研究中心重庆医科大学基础医学院人体解剖学教研室重庆400016 陆军军医大学新桥医院麻醉科重庆400037

目的:研究丙泊酚(propofol)减轻大鼠脑出血(ICH)后神经功能损伤与肥大细胞脱颗粒的关系。方法:右侧大脑基底核注射尾部自体血制备SD大鼠脑出血模型,脑出血后30 min经股静脉泵注丙泊酚。模型制备后采用改良的Garcia实验和corner turns实... 详细信息

目的:研究丙泊酚(propofol)减轻大鼠脑出血(ICH)后神经功能损伤与肥大细胞脱颗粒的关系。方法:右侧大脑基底核注射尾部自体血制备SD大鼠脑出血模型,脑出血后30 min经股静脉泵注丙泊酚。模型制备后采用改良的Garcia实验和corner turns实验检测大鼠神经功能,分光光度计检测伊文思蓝含量,干湿比检测脑含水量,Western Blot检测类胰蛋白酶、糜蛋白酶、IL-1β和TNF-α的表达,荧光染色实验和甲苯胺蓝染色实验检测肥大细胞数量。结果:与对照组相比,脑出血组大鼠神经功能评分减少(P<0.05),伊文思蓝含量以及脑含水量升高(P<0.05),类胰蛋白酶、糜蛋白酶、IL-β和TNF-α表达增多(P<0.05),肥大细胞数量增加;与脑出血组相比,丙泊酚组大鼠神经功能评分增高(P<0.05),伊文思蓝含量以及脑含水量降低(P<0.05),类胰蛋白酶、糜蛋白酶、IL-1β和TNF-α表达减少(P<0.05),肥大细胞数量减少。结论:丙泊酚抑制肥大细胞脱颗粒减轻大鼠脑出血后神经功能损伤。

关键词：丙泊酚脑出血肥大细胞脱颗粒炎症大鼠

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