检索结果-内蒙古大学图书馆

基于生物信息学分析筛选肝细胞癌中的核心基因:细胞周期蛋白B2可作为肝癌潜在的诊疗和预后生物标志物

中华肝脏病杂志 2020年第9期28卷 773-783页

作者：杨双燕任红李传飞汤慧重庆医科大学附属第二医院感染科/重庆医科大学病毒性肝炎研究所/感染性疾病分子生物学教育部重点实验室 400010 重庆医科大学附属第二医院消化内科 400010

目的通过生物信息学方法筛选出参与肝细胞癌(HCC)进展的核心基因(Hub gene),探讨细胞周期蛋白B2(CCNB2)在HCC发生发展及预后中的潜在作用。方法从GEO数据库中筛选并下载四个HCC相关数据集,用GEO2R分析数据并鉴定差异表达基因(DEGs)。利... 详细信息

目的通过生物信息学方法筛选出参与肝细胞癌(HCC)进展的核心基因(Hub gene),探讨细胞周期蛋白B2(CCNB2)在HCC发生发展及预后中的潜在作用。方法从GEO数据库中筛选并下载四个HCC相关数据集,用GEO2R分析数据并鉴定差异表达基因(DEGs)。利用DAVID数据库对DEGs进行GO分析,Cytoscape的ClueGO插件完成KEGG信号通路富集分析,并将DEGs导入STRING数据库建立蛋白相互作用(PPI)网络图,用Cytoscape对PPI网络进行可视化,构建关键模块(cluster)和筛选核心基因。分别使用UCSC数据库和UALCAN数据库完成核心基因在TCGA肝癌中的差异表达分析和生存分析。使用Firebrowse,Oncomine和UALCAN数据库分析核心基因在包括HCC在内的多个肿瘤中的表达。用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测候选基因在HCC组织和肝癌细胞系中的表达水平。结果从四个数据集中共鉴定了73个DEGs,包括15个上调基因和58个下调基因。KEGG信号通路富集分析显示DEGs主要富集于肿瘤相关通路。基于DEGs的PPI网络图,筛选了一个关键模块和10个核心基因。CCNB2与NCAPG在多个数据库的肝癌组织中均高表达。CCNB2与NCAPG呈正相关,被认为是与预后相关的关键基因(P<0.01)。RT-qPCR结果表明CCNB2在人肝癌组织和细胞系中高表达(P<0.01)。结论成功筛选出HCC相关的DEGs和核心基因,其中CCNB2在HCC中高表达且与患者生存预后相关,有望成为HCC诊疗和预后的生物标志物。

关键词：肝细胞癌生物信息学分析细胞周期蛋白B2 生物标志物

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人感染H7N9禽流感病毒血凝素和神经氨酸酶的B细胞表位预测

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细胞与分子免疫学杂志 2013年第12期29卷 1319-1321,1326页

作者：李虎胡鹏重庆医科大学附属第二医院感染科感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆医科大学病毒性肝炎研究所重庆400010

目的利用计算机软件预测人感染H7N9禽流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的B细胞表位。方法以HA、NA的氨基酸序列为基础,用Protean、PORTER、MEGA等生物信息学软件综合预测HA、NA蛋白可能的B细胞表位,再结合吴玉章的平均抗原指数方案... 详细信息

目的利用计算机软件预测人感染H7N9禽流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的B细胞表位。方法以HA、NA的氨基酸序列为基础,用Protean、PORTER、MEGA等生物信息学软件综合预测HA、NA蛋白可能的B细胞表位,再结合吴玉章的平均抗原指数方案进一步筛选。结果 HA蛋白最有可能的B细胞表位位于其N端的第53～57、179～183区段,HA蛋白的其它区段:62～66、98～101、164～166、315～320、424～426、443～445、493～496等也有可能存在B细胞表位。NA蛋白最有可能的B细胞表位位于N端的第321～329、379～386区段,NA蛋白的其他区段:46～48、52～54、74～78、136～141、145～150、160～164、194～197、246～248、333～343、426～431等也有可能存在B细胞表位。结论综合多种方案预测了H7N9病毒HA、NA蛋白的B细胞表位,为人感染H7N9禽流感病毒表位疫苗研究提供了实验基础。

关键词： H7N9 HA NA B细胞表位

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富马酸替诺福韦二吡呋酯对血脂影响的研究进展

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中华肝脏病杂志 2023年第10期31卷 1103-1107页

作者：段袁琴胡鹏重庆医科大学附属第二医院感染科教育部感染性疾病分子生物学重点实验室重庆医科大学病毒性肝炎研究所重庆400010

富马酸替诺福韦二吡呋酯(TDF)是一种新型核苷酸类逆转录酶抑制剂,主要用于治疗人类免疫缺陷病毒和乙型肝炎病毒感染。近年来越来越多的研究发现,TDF治疗可以降低艾滋病和慢性乙型肝炎患者的血脂,而血脂又和疾病进展以及心血管事件的发... 详细信息

富马酸替诺福韦二吡呋酯(TDF)是一种新型核苷酸类逆转录酶抑制剂,主要用于治疗人类免疫缺陷病毒和乙型肝炎病毒感染。近年来越来越多的研究发现,TDF治疗可以降低艾滋病和慢性乙型肝炎患者的血脂,而血脂又和疾病进展以及心血管事件的发生息息相关。现就TDF对血脂影响的研究进展作一综述,旨在为TDF的合理用药提供依据。

关键词：乙型肝炎病毒血脂人类免疫缺陷病毒富马酸替诺福韦二吡呋酯

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血浆置换联合双重血浆吸附治疗早、中、晚期肝衰竭的经济学评价

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中华肝脏病杂志 2020年第5期28卷 434-440页

作者：孔令希邱峰王红梅单雪峰胡鹏钟珊王娜重庆医科大学附属第一医院药学部 400042 重庆医科大学附属第二医院感染科重庆医科大学病毒性肝炎研究所感染性疾病分子生物学教育部重点实验室400010

目的比较血浆置换、半量血浆置换联合双重血浆吸附(DPMAS)、先等量血浆置换再联合DPMAS、先DPMAS再联合等量血浆置换4种人工肝模式治疗肝衰竭的经济学特点。方法用Treeage pro 2011软件构建决策树模型,针对肝衰竭患者早、中、晚期分别... 详细信息

目的比较血浆置换、半量血浆置换联合双重血浆吸附(DPMAS)、先等量血浆置换再联合DPMAS、先DPMAS再联合等量血浆置换4种人工肝模式治疗肝衰竭的经济学特点。方法用Treeage pro 2011软件构建决策树模型,针对肝衰竭患者早、中、晚期分别计算并比较4种不同治疗模式的成本效果比值及增量成本效果值,且对该模型进行敏感性分析;数据来自课题组前期研究结果。结果肝衰竭早期患者的人工肝治疗,半量血浆置换联合DPAMS方案成本效果比值为89547.79,增量成本效果值为34665.34,低于人均国内生产总值,增加的成本具有成本效果优势;肝衰竭中、晚期,先DPMAS再联合等量血浆置换的方案,成本效果比值分别为122865.5、284334.97,增量成本效果比值分别为70744.55、75299.48,小于3倍人均国内生产总值,增加的成本可以接受,有经济学优势。敏感性分析结果显示基础分析结果可靠。结论对于早期肝衰竭,半量血浆置换联合DPAMS方案最具成本效果优势;而对于肝衰竭中、晚期,采用先DPMAS再联合等量血浆置换是最为经济的人工肝治疗方案。

关键词：肝衰竭肝,人工血浆置换经济学

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直接抗病毒药物在丙型肝炎肝硬化患者中的应用进展

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临床肝胆病杂志 2024年第8期40卷 1682-1687页

作者：冉锡萍蔡大川重庆医科大学附属第二医院感染病科重庆401336 感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆医科大学病毒性肝炎研究所重庆400010

慢性丙型肝炎病毒感染可导致肝硬化的发生,肝硬化后出现肝细胞癌等并发症是慢性肝病患者的主要死亡原因。抗病毒治疗可以实现持续病毒学应答,改善肝炎、肝纤维化,进而延缓病程进展。直接抗病毒药物(DAA)在丙型肝炎肝硬化患者中的安全性... 详细信息

慢性丙型肝炎病毒感染可导致肝硬化的发生,肝硬化后出现肝细胞癌等并发症是慢性肝病患者的主要死亡原因。抗病毒治疗可以实现持续病毒学应答,改善肝炎、肝纤维化,进而延缓病程进展。直接抗病毒药物(DAA)在丙型肝炎肝硬化患者中的安全性和有效性已被证实,其是否能改善肝硬化患者疾病并发症和预后逐渐成为讨论和研究的热点。相关数据主要由国外学者报告,我国DAA上市较晚,尚缺乏中远期数据。本文回顾了最新的相关研究,对DAA在丙型肝炎肝硬化患者中的应用现状及其对临床预后的影响进行综述。

关键词：肝炎病毒属肝硬化直接抗病毒药物治疗结果

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B和C基因型乙型肝炎病毒对阿德福韦酯治疗的病毒学应答比较

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中华肝脏病杂志 2008年第6期16卷 412-415页

作者：曾爱中邓惠彭凤英辛小娟杨春李青岭郭进军张祯祯赫美君袁喆黄文祥黄爱龙重庆医科大学病毒性肝炎研究所教育部感染性疾病分子生物学重点实验室重庆400010 重庆医科大学附属第一医院感染科重庆医科大学附属第二医院淌化科

目的阐明不同基因型HBV对阿德福韦酯治疗反应是否存在差异。方法首先利用型特异引物PCR法结合型特异核苷酸分析法检测HBV基因型，然后根据基因型对阿德福韦酯Ⅲ期临床资料进行分析及统计学处理（计量资料用t检验，计数资料用卡方检验）... 详细信息

目的阐明不同基因型HBV对阿德福韦酯治疗反应是否存在差异。方法首先利用型特异引物PCR法结合型特异核苷酸分析法检测HBV基因型，然后根据基因型对阿德福韦酯Ⅲ期临床资料进行分析及统计学处理（计量资料用t检验，计数资料用卡方检验）。结果177例临床标本检出B基因型HBV感染者102例，C基因型感染者65例，B＋C混合型感染者6例，B＋D混合型感染者4例。治疗第12、24周时，B基因型组和C基因型组血清HBVDNA下降均值分别为2.2log10拷贝／ml、2.1log10拷贝／ml和2.7log10拷贝／ml、2．4log10拷贝／ml，两组差异均无统计学意义（P〉0．05），第48周时两组HBVDNA分别下降3.6log10拷贝／ml和3．1log10拷贝／ml，差异有统计学意义（P〈0．05）。治疗结束时（48周）B基因型组和C基因型组分别有43例（42．2％）和22例（33．8％）出现血清HBVDNA转阴，差异有统计学意义（P〈0．05）；两组患者HBeAg阴转率和抗-HBe血清转换率分别为30．4％、29．2％和21．6％、20．0％，差异无统计学意义（P〉0．05）。两组患者血清ALT复常率在治疗第12、24、36周和48周时分别为35．3％、33．9％，51．0％、53．9％，63．4％、61．5％和83．3％、81．5％，各时间段两组ALT复常率差异均无统计学意义（P〉0．05）。结论阿德福韦酯治疗慢性乙型肝炎48周时，部分病毒学指标（如血清HBVDNA下降均值和HBVDNA阴转率）B基因型优于C基因型HBV感染者。但由于阿德福韦酯起效较慢，抑制病毒作用相对较弱，有必要延长治疗时间进一步证实这一现象。

关键词：肝炎乙型慢性肝炎病毒基因型阿德福韦酯

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丙氨酸转氨酶低于2倍正常值上限的慢性乙型肝炎患者的肝脏病理学特征及其影响因素

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中华肝脏病杂志 2023年第5期31卷 483-488页

作者：王晓昊刘小庆蔡大川胡鹏李虎重庆医科大学附属第二医院感染病科、重庆医科大学病毒性肝炎研究所、感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆400010

目的分析丙氨酸转氨酶(ALT)低于2倍正常值上限(ULN)的慢性乙型肝炎(CHB)患者的肝脏病理学特征及其影响因素,探讨启动抗病毒治疗ALT阈值的优化策略。方法回顾性收集2010年1月—2019年12月行肝穿刺活体组织学检查的CHB初治患者及其临床资... 详细信息

目的分析丙氨酸转氨酶(ALT)低于2倍正常值上限(ULN)的慢性乙型肝炎(CHB)患者的肝脏病理学特征及其影响因素,探讨启动抗病毒治疗ALT阈值的优化策略。方法回顾性收集2010年1月—2019年12月行肝穿刺活体组织学检查的CHB初治患者及其临床资料。利用多元回归模型探讨ALT水平和显著肝组织学改变(≥G2/S2)的风险。采用受试者操作特征曲线评价不同模型诊断肝组织炎症≥G2或纤维化≥S2的价值。结果共纳入447例符合要求的CHB患者,中位数年龄为38.0岁,72.9%为男性。ALT水平在正常范围时,分别有66.9%和53.0%的患者存在显著的肝脏炎症(≥G2)和纤维化(≥S2);ALT为1~2×ULN时,肝脏炎症≥G2和纤维化≥S2的比例上升为81.2%和60.0%。调整混杂因素后,发现较高的ALT水平(>29 U/L)与显著的肝脏炎症(OR:2.30,95%置信区间:1.11~4.77)以及纤维化(OR:1.84,95%置信区间:1.10~3.09)有关。引入γ-谷氨酰转移酶-血小板比值(GPR)后,不同ALT治疗阈值标准下的CHB患者出现≥G2/S2的比例显著降低,尤其是对肝纤维化≥S2的误判可以得到显著的改善(33.5%~57.5%)。结论无论ALT正常或在2×ULN以内,均有超过半数的CHB患者存在明显的炎症及纤维化。GPR可以显著改善不同ALT治疗阈值对CHB患者病情的准确判断。

关键词：慢性乙型肝炎乙型肝炎病毒炎症纤维化抗病毒治疗

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聚乙二醇干扰素α-2a治疗慢性乙型肝炎过程中外周血γδT细胞的变化及其临床意义

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中华肝脏病杂志 2018年第5期26卷 365-370页

作者：刘楷沈妍希凌宁雷宇胡鹏任红陈敏重庆医科大学附属第二医院感染科、重庆医科大学病毒性肝炎研究所、教育部感染性疾病分子生物学重点实验室 400010

目的观察慢性乙型肝炎（CHB）患者在聚乙二醇干扰素（Peg-IFN） α-2a治疗过程中外周血γδT细胞的变化,并分析其与临床指标及疗效的相关性. 方法收集HBeAg阳性的CHB患者在Peg-IFNα-2a治疗不同时间点的外周全血,包括0周17例、12周20... 详细信息

目的观察慢性乙型肝炎（CHB）患者在聚乙二醇干扰素（Peg-IFN） α-2a治疗过程中外周血γδT细胞的变化,并分析其与临床指标及疗效的相关性. 方法收集HBeAg阳性的CHB患者在Peg-IFNα-2a治疗不同时间点的外周全血,包括0周17例、12周20例、24周20例及48周16例,其中有11例患者在每个时间点均收集血样观察.流式细胞术检测外周血中γ δ T及其亚群细胞Vδ1T、Vδ2T、效应记忆γδT（γ δTem）、中央记忆γ δT （γ δTcm）、初始γδT （γδTnaive）与终末分化效应γ δT （γ δTeff）细胞的频率.同时检测肝功能、HBV血清病毒等标志物及HBV DNA水平.用SPSS 23.0统计软件分析比较各治疗时间点细胞比例的差异,以及细胞比例与丙氨酸氨基转移酶（ALT）、HBsAg、HBeAg或HBV DNA水平的相关性;并且分析持续随访的11例患者中,γδT及其亚群细胞比例与Peg-IFN α-2a治疗应答的相关性.结果在Peg-IFNα-2a治疗0～ 48周期间,CHB患者外周血γδT及Vδ 2T细胞比例逐渐下降,48周时的γδT细胞和Vδ 2T细胞比例分别为6.89％（5％,8.15％）、4.61％（2.16％,6.50％）,明显低于0周水平[12.5％（7.73％,19.00％）、6.59％（3.86％,13.62％）],差异均具有统计学意义（P值均＜0.05）;但V δ 1T、γ δ Tem、γ δTcm、γ δTnaive或γ δTeff亚群细胞的比例在各时间点的差异均无统计学意义（P值均＞ 0.05）.同时ALT、HBsAg、HBeAg或HBV DNA水平与γδT或Vδ2T细胞比例均呈显著性正相关（P值均＜0.05）.11例持续随访患者中,应答者的γ δ Tem细胞的比例在各时间点均显著低于无应答者,差异均有统计学意义（P值均＜ 0.05）,而其他γδT亚群细胞比例在两组间的差异均无统计学意义（P值均＞ 0.05）. 结论 Peg-IFN α-2a治疗CHB过程中γδT细胞比例随着HBV复制降低及肝脏炎症缓解而呈下降趋势,且具有较低效应记忆γδT细胞比例的CHB患者在Peg-IFNα-2a治疗中可能更易获得应答.

关键词：肝炎乙型慢性聚乙二醇干扰素α γδT细胞

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慢性丙型肝炎病毒感染者外周血滤泡辅助T淋巴细胞的变化研究

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上海交通大学学报（医学版） 2016年第6期36卷 825-829页

作者：殷文伟童师雯教育部感染性疾病分子生物学重点实验室重庆医科大学病毒性肝炎研究所重庆医科大学附属第二医院感染科重庆400010 重庆医科大学附属第二医院临床营养科重庆400010

目的研究滤泡辅助T淋巴细胞(TFH细胞)在慢性丙型肝炎病毒(HCV)感染者外周血的变化特点及其与疾病特征的相关性。方法共纳入20名健康对照者和23例HCV感染者,其中4例接受聚乙二醇干扰素α联合利巴韦林治疗。流式细胞术检测外周血CD4^+CXCR... 详细信息

目的研究滤泡辅助T淋巴细胞(TFH细胞)在慢性丙型肝炎病毒(HCV)感染者外周血的变化特点及其与疾病特征的相关性。方法共纳入20名健康对照者和23例HCV感染者,其中4例接受聚乙二醇干扰素α联合利巴韦林治疗。流式细胞术检测外周血CD4^+CXCR5^+TFH细胞比例变化。结果慢性HCV感染者外周血CD4^+CXCR5^+TFH细胞占单个核细胞的比例为5.845%(2.680%~14.200%),健康对照组为3.765%(1.200%~8.520%)(u=124.5,P=0.010 6);占CD4^+T淋巴细胞的比例,感染组和对照组分别为14.800%(8.440%~36.600%)和9.550%(2.700%~21.800%)(u=132.0,P=0.017 6)。CD4^+CXCR5^+TFH细胞比例与HCV RNA载量呈负相关(r=-0.432 8,P=0.039 1),与GPT和GOT无相关性。抗病毒治疗后HCV感染者TFH细胞比例降低。结论 CD4^+CXCR5^+TFH细胞可能参与了慢性HCV感染机体抗病毒免疫应答。

关键词：丙型肝炎病毒滤泡辅助T细胞病毒载量谷丙转氨酶

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血浆置换联合双重血浆吸附治疗提高慢加急性肝衰竭预后

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中华肝脏病杂志 2018年第10期26卷 744-749页

作者：钟珊王娜赵静张莉罗玲曾维琼石小枫王志毅蔡大川张大志周智胡鹏重庆医科大学附属第二医院感染科重庆医科大学病毒性肝炎研究所感染性疾病分子生物学教育部重点实验室 400010

目的比较血浆置换（PE）联合双重血浆吸附与单纯PE治疗慢加急性肝衰竭的疗效和安全性。方法回顾性分析2015年1月以来收治的经人工肝治疗的慢加急性肝衰竭患者251例。比较不同模式治疗前后患者症状、体征、实验室检查以及并发症的变化情... 详细信息

目的比较血浆置换（PE）联合双重血浆吸附与单纯PE治疗慢加急性肝衰竭的疗效和安全性。方法回顾性分析2015年1月以来收治的经人工肝治疗的慢加急性肝衰竭患者251例。比较不同模式治疗前后患者症状、体征、实验室检查以及并发症的变化情况，并追踪近期疗效。据资料不同用t检验、Pearsonz。检验或者Fisher确切概率法进行统计学分析。结果早期肝衰竭，低置换PE联合双重血浆分子吸附系统（DPMAs）（83.7％）和等量PE联合DPMAS治疗有效率（84．0％和82．1％）明显优于单纯的足量PE（55．6％）垆〈0．05）。中晚期肝衰竭，各组治疗有效率差异无统计学意义（P〉0．05）。联合治疗组的胆红素下降率、胆汁酸下降率均明显优于PE组（P〈0．05）。低置换量PE联合DPMAS（LPE＋DPMAS）组，先PE后DPMAS组的凝血酶原活动度改善率，白蛋白改善率均明显低于PE组（P〈0．05）。先DPMAS后PE组凝血酶原活动度改善率和白蛋白改善率与PE组差异无统计学意义。各组不良反应发生差异无统计学意义。结论较单纯PE而言，PE联合DPMAS既能提高早期肝衰竭治疗有效率，还能减少血浆用量。先行DPMAs治疗后行PE治疗，能改善DPMAS对凝血功能和白蛋白水平的不良影响。

关键词：肝衰竭肝,人工血浆置换双重血浆吸附

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