检索结果-内蒙古大学图书馆

作物学报 2022年第1期48卷 86-98页

作者：荐红举尚丽娜金中辉丁艺李燕王季春胡柏耿 Vadim Khassanov 吕典秋西南大学农学与生物科技学院重庆400715 南方山地农业教育部工程研究中心重庆400715 薯类生物学与遗传育种重庆市重点实验室重庆400715 国家马铃薯工程技术研究中心山东德州253600 S.Seifullin Kazakh Agrotechnical University Zhenis Avenue 010011AstanaRepublic of Kazakhstan

植物光敏色素作用因子(phytochrome interacting factors,PIFs)属于碱性-螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子家族,通过将光和温度等外部环境信号与植物体内源信号途径相整合,进而形成复杂的信号转导网络来精密调控植物... 详细信息

植物光敏色素作用因子(phytochrome interacting factors,PIFs)属于碱性-螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子家族,通过将光和温度等外部环境信号与植物体内源信号途径相整合,进而形成复杂的信号转导网络来精密调控植物的生长发育进程。目前,关于马铃薯PIF家族基因的研究较少,鉴定和分析StPIF家族成员有助于进一步提高马铃薯的产量和品质。本研究运用生物信息学方法,以拟南芥PIF家族成员蛋白序列作为源序列,通过在马铃薯基因组数据库中进行BlastP分析鉴定出7个StPIFs家族成员,并对其进行系统进化、染色体分布、复制事件、蛋白理化性质、基因结构、Motif预测、启动子顺式作用元件、基因表达模式以及对高温胁迫的响应分析。结果显示,StPIF家族所有成员均含有Motif 1(bHLH结构域)、Motif 2(APB结构域)基序;在StPIF基因的启动子区域预测到多个参与光响应、激素、干旱、低温、昼夜节律以及防御和应激反应调控元件;基因表达模式和现蕾期高温胁迫响应分析表明,家族成员具有明显的组织表达特异性,基因存在功能分化,且大部分StPIF成员对生物胁迫和高温等非生物胁迫具有明显响应。以上研究结果极大丰富了我们对StPIF家族的认识,为进一步探究StPIF基因在马铃薯生长期应对生物胁迫以及在结薯期应对高温等非生物胁迫中发挥的功能奠定了理论基础。

关键词：马铃薯(Solanum tuberosum L.) PIF家族生物信息学高温表达模式分析

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一株耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌噬菌体的分离鉴定和临床应用

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微生物学通报 2023年第7期50卷 3035-3048页

作者：刘自强潘勇军谭新杨永清熊敏周宁侯洁薇丁训梅马迎飞余加林重庆医科大学附属儿童医院新生儿科国家儿童健康与疾病临床医学研究中心儿童发育疾病研究教育部重点实验室儿童感染免疫重庆市重点实验室重庆404100 中国科学院深圳先进技术研究院深圳合成生物学创新研究院中国科学院定量工程生物学重点实验室广东深圳518055 南方科技大学医院广东深圳518055

【背景】耐药菌感染是人类生命健康的重要威胁,寻找抗生素替代或辅助疗法迫在眉睫,噬菌体是细菌的天敌,有很大的开发潜力。【目的】分离针对耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii, CRAB)的烈性噬菌体... 详细信息

【背景】耐药菌感染是人类生命健康的重要威胁,寻找抗生素替代或辅助疗法迫在眉睫,噬菌体是细菌的天敌,有很大的开发潜力。【目的】分离针对耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii, CRAB)的烈性噬菌体,治疗患者CRAB肺部感染,为噬菌体疗法的推广积累经验。【方法】用CRAB临床菌株NAB11B做宿主菌,从医院污水中分离新噬菌体,进行生物学特征和基因组特点的表征、分析后制备成高纯度的噬菌体制剂,通过雾化吸入的方式治疗肺部CRAB感染,评估噬菌体疗法的有效性和安全性。【结果】分离到一株新噬菌体,命名为AB_SZL4,其潜伏期短、增殖速度快、抑菌能力强、生物学稳定性高且不携带有害基因。在临床应用中,噬菌体鸡尾酒联合抗生素疗法能快速清除肺部病原菌,且未见明显噬菌体相关不良反应。【结论】AB_SZL4是一株有极大临床应用潜力的烈性噬菌体。

关键词：耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌噬菌体生物学特性基因组学分析噬菌体疗法

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三峡库区中段水体微生物群落结构与环境因子相关性研究

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长江流域资源与环境 2021年第5期30卷 1184-1193页

作者：秦宇郑望张曦蒋成勇重庆交通大学水利水运工程教育部重点实验室重庆400074

为研究三峡库区中段水体微生物多样性的变化以及群落结构与环境理化性质的相关性,以三峡库区涪陵、忠县、万州为研究区域,分别于2018年高水位期(1、3月)和低水位期(5、7、9月)进行采样分析,结合水质分析及16S rRNA高通量测序分析,对中... 详细信息

为研究三峡库区中段水体微生物多样性的变化以及群落结构与环境理化性质的相关性,以三峡库区涪陵、忠县、万州为研究区域,分别于2018年高水位期(1、3月)和低水位期(5、7、9月)进行采样分析,结合水质分析及16S rRNA高通量测序分析,对中段水体3个点位的微生物多样性进行研究,并对不同时期的微生物群落结构与环境因子进行相关分析。结果发现:三峡库区中段水体微生物多样性表现为库区中段上游涪陵高于中下游忠县和万州。经群落组成分析得出,库区中段水体微生物的优势菌门无差异,主要优势菌群为Proteobacteria(80.50%~21.51%)、 Actinobacteria (32.60%~9.98%)、 Bacteroidetes (6.89%~3.50%)、 Cyanobacteria(9.65%~0.08%)等。微生物群落结构组成存在显著的时间变化性,Actinobacteria、 Firmicutes、Planctomycetes与Cyanobacteria等菌门的相对丰度在库区高水位期高于低水位期,而最优势菌门Proteobacteria的相对丰度在高水位期低于低水位期。冗余分析表明总氮、溶解氧、水位是影响三峡水库中段水体微生物群落结构的主要环境因子。

关键词：微生物多样性环境因子冗余分析三峡库区群落结构

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基于微流控芯片技术的微生物加固可视化研究

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岩土工程学报 2020年第6期42卷 1005-1012页

作者：何想马国梁汪杨赵常刘汉龙楚剑肖杨重庆大学土木工程学院重庆400045 重庆大学山地城镇建设与新技术教育部重点实验室重庆400045 库区环境地质灾害防治国家地方联合工程研究中心(重庆) 重庆400045 南洋理工大学土木与环境工程学院新加坡639789

微生物诱导碳酸钙沉积(MICP)能够加固散粒土体,是岩土工程中新兴绿色加固技术之一。然而,关于微生物加固机理以及矿化形成过程的研究尚不多见。基于微流控芯片技术开发了微生物加固可视化系统,利用该系统开展了微生物诱导碳酸钙矿化机... 详细信息

微生物诱导碳酸钙沉积(MICP)能够加固散粒土体,是岩土工程中新兴绿色加固技术之一。然而,关于微生物加固机理以及矿化形成过程的研究尚不多见。基于微流控芯片技术开发了微生物加固可视化系统,利用该系统开展了微生物诱导碳酸钙矿化机理的原位微细观研究,通过对微生物加固过程中碳酸钙晶体的沉积进行了观测,并对其时空分布、沉积模式、生长速率进行了量化。结果表明溶质分子的对流和扩散作用对碳酸钙晶体分布影响较大,碳酸钙的分布存在时间不均匀和空间不均匀现象,时间不均匀随反应进行呈现弱化现象而空间不均匀在整个反应过程(0~2200 min)中一直存在。研究发现微尺寸管道中碳酸钙存在孔隙中和颗粒间两种沉积模式,孔隙中的碳酸钙均匀长大,而颗粒间碳酸钙存在不同速率的生长轴。研究结果将加深对微生物加固机理的认识,为微生物加固技术的优化和推广应用提供参考。

关键词：微生物矿化微流控芯片可视化结晶 MICP

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固碳产甲烷微生物阴极能质传输特性数值模拟

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化工学报 2020年第5期71卷 2273-2282页

作者：宋珣付乾李俊张亮廖强朱恂重庆大学工程热物理研究所重庆400030 重庆大学低品位能源利用技术及系统教育部重点实验室重庆400030

固碳产甲烷微生物电合成系统以附着其电极表面的生物膜为催化剂,可以在处理废水的同时将CO2转化为甲烷,极具应用前景。微生物阴极是该系统的核心部件之一,其表面生物膜内的能质传输特性极大地影响系统性能。针对微生物阴极能质传输特性... 详细信息

固碳产甲烷微生物电合成系统以附着其电极表面的生物膜为催化剂,可以在处理废水的同时将CO2转化为甲烷,极具应用前景。微生物阴极是该系统的核心部件之一,其表面生物膜内的能质传输特性极大地影响系统性能。针对微生物阴极能质传输特性尚不明确的问题,推导了微生物阴极电极反应动力学方程(Nernst-Monod方程),构建了耦合生化/电化学反应的物质传输理论模型,研究了不同阴极电势、生物膜电导率以及孔隙率对阴极生物膜内电荷及物质传输的影响规律。研究结果表明当阴极电势高于-0.5 V (vs SHE)时,随阴极电势的降低生物膜内电流密度增大,底物浓度降低;但当阴极电势降低至-0.5 V(vs SHE)后,生物膜消耗电子还原底物的能力几乎达到饱和;低电导率(<10-3S/m)会导致生物膜内形成明显的电势差,使得底物利用速率降低,严重影响微生物阴极的性能;生物膜孔隙率控制在0.4时,微生物阴极可达到最佳电流密度。

关键词：微生物电合成系统二氧化碳还原生物膜传质动力学模型

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基于CRISPR/LanCas9的水稻基因编辑系统的开发和优化

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生物技术通报 2024年第10期40卷 233-242页

作者：李欣格王美霞王晨阳马桂根周常勇王亚南周焕斌河北农业大学植物保护学院保定071001 中国农业科学院植物保护所植物病虫害综合治理全国重点实验室北京100193 西南大学柑橘研究所国家柑橘工程研究中心重庆400712 农业农村部基因编辑创新利用重点实验室(海南) 三亚572024 农业农村部桂林作物有害生物科学观测实验站桂林541399

【目的】在水稻中建立CRISPR/LanCas9和CRISPR/SLanCas9基因编辑系统,扩展CRISPR/Cas基因编辑工具箱。【方法】将来自动物乳酸杆菌KCTC 3501的LanCas9进行密码子优化,并且进一步通过蛋白融合重组LanCas9和SpCas9的活性结构域形成嵌合体S... 详细信息

【目的】在水稻中建立CRISPR/LanCas9和CRISPR/SLanCas9基因编辑系统,扩展CRISPR/Cas基因编辑工具箱。【方法】将来自动物乳酸杆菌KCTC 3501的LanCas9进行密码子优化,并且进一步通过蛋白融合重组LanCas9和SpCas9的活性结构域形成嵌合体SLanCas9,分别构建CRISPR/LanCas9和CRISPR/SLanCas9编辑工具;以OsWRKY45、OsCPK4、OsCPK6、OsCPK7、OsMPK8、OsGSK3、OsGSK4为靶基因,在NGG PAM或者NAG PAM设计20 nt或者24 nt的sgRNA,通过水稻遗传转化,检测分析其编辑效率。【结果】LanCas9在水稻中可以识别NGG PAM,结合20 nt的sgRNA编辑效率更高,对OsWRKY45基因的编辑效率为25.00%;融合的SLanCas9不仅能够识别NGG PAM,在NAG PAM位点也有一定的编辑效率,在不同PAM位点的编辑效率分别可达100%和39.58%。此外,SLanCas9还具有多重基因编辑能力,在NGG PAM位点的多重基因编辑效率高达74.07%。【结论】开发了具有自主知识产权的新型CRISPR/LanCas9和CRISPR/SLanCas9基因编辑技术。

关键词： CRISPR LanCas9 SLanCas9 基因编辑水稻

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长江中游鳤的遗传多样性及种群历史动态分析

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水生生物学报 2024年第10期48卷 1736-1744页

作者：翟东东王东何天琪蔡方陶段辛斌胡兴坤朱滨谢仲桂夏明刘红艳熊飞江汉大学生命科学学院湖北省汉江流域特色生物资源保护开发与利用工程技术研究中心武汉430056 江汉大学持久性有毒污染物环境与健康危害湖北重点实验室武汉430056 中国水产科学研究院长江水产研究所国家农业科学重庆观测实验站武汉430223 水利部中国科学院水工程生态研究所武汉430079 湖南省水产科学研究所长沙410153

为研究长江中游鳤群体的遗传多样性,利用两个线粒体基因和两个核基因序列作为分子标记,分析了汉江下游、南洞庭湖、藕池河和长江公安段4个鳤群体的遗传多样性、遗传分化和种群历史动态。研究结果显示,长江中游鳤单倍型多样性较高,核苷... 详细信息

为研究长江中游鳤群体的遗传多样性,利用两个线粒体基因和两个核基因序列作为分子标记,分析了汉江下游、南洞庭湖、藕池河和长江公安段4个鳤群体的遗传多样性、遗传分化和种群历史动态。研究结果显示,长江中游鳤单倍型多样性较高,核苷酸多样性较低,整体遗传多样性处于中等水平。分子方差变异分析(AMOVA)和遗传分化指数FST显示长江中游鳤群体间不存在遗传分化现象。种群历史动态分析表明长江中游鳤群体在历史上可能发生过种群扩张现象,扩张时间约在16.54万年前,处于庐山冰期和大理冰期间较为温暖的间冰期。STRUCTURE分析表明长江中游和西江中下游鳤群体间存在较明显的分化,推算其分化时间约在5.55万年前,建议在制定保护策略时将这两个水系的鳤群体视作两个保护单元。

关键词：长江中游遗传多样性分化时间种群历史动态鳤

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微球层叠微通道用于全血血浆分离

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分析化学 2019年第5期47卷 661-668页

作者：陈梦迪杨雁婷邓治杨徐洪燕邓吉楠杨忠胡宁杨军重庆大学生物工程学院生物流变科学与技术教育部重点实验室视觉损伤与再生修复重庆市重点实验室重庆市璧山中学校东华大学机械工程学院第三军医大学西南医院检验系

设计并制作了一款由两种大小不同微球层叠堆积的微通道与毛细通道阵列组合而成的微流控芯片装置,可以在全血样本流经微通道过程中,通过微球堆积层过滤、吸附其中的细胞组分,快速分离出血浆。采用负压进样方式在微通道中紧密堆积微球,并... 详细信息

设计并制作了一款由两种大小不同微球层叠堆积的微通道与毛细通道阵列组合而成的微流控芯片装置,可以在全血样本流经微通道过程中,通过微球堆积层过滤、吸附其中的细胞组分,快速分离出血浆。采用负压进样方式在微通道中紧密堆积微球,并采用蛋白封闭液包被的方法增加微球表面亲水性,在毛细作用下,芯片烘干冷却后滴入的全血在微通道中前进,进而分离出血浆。测试了直径分别为10、15、20、23和40μm的不同微球对血浆分离速度的影响,当使用直径为10μm的微球堆积通道时,血浆分离速率最快。考察了堆积通道局部加宽设计等对血浆分离的影响,结果表明,相较于长直型通道,局部加宽通道的血浆分离速率大大增加,最快可达0.16μL/min,可在短时间内收集得到足量血浆,满足大多数临床血液检测等相关要求。利用本方法收集的血浆样本在芯片上进行血液凝集实验,可快速分析待测血液血型,具有良好的实际应用价值。

关键词：血浆微流控芯片全血毛细作用过滤

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赖氨酰氧化酶LOX在OA疾病发生发展中的调控作用及其干预机制研究

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医用生物力学 2021年第S01期36卷 21-21页

作者：吴嘉钦杨力许康王春莉重庆大学生物工程学院教育部生物流变科学与技术重点实验室国家创新吸引人才111基地重庆400030 湖北中医药大学药学院武汉430065

目的骨关节炎(osteoarthritis,OA)是一种常见的软组织退行性疾病,具有较高患病率和致残率。胞外基质(extracellular matrix,ECM)结构和功能的异常是OA发生的重要因素。赖氨酰氧化酶(lysyl oxidases,LOX)是调控ECM结构和功能重塑的关键... 详细信息

目的骨关节炎(osteoarthritis,OA)是一种常见的软组织退行性疾病,具有较高患病率和致残率。胞外基质(extracellular matrix,ECM)结构和功能的异常是OA发生的重要因素。赖氨酰氧化酶(lysyl oxidases,LOX)是调控ECM结构和功能重塑的关键蛋白。探讨LOX在OA疾病发生发展中的调控作用及其干预机制。方法采用qPCR和蛋白免疫印迹等实验方法检测LOX在正常软骨组织与OA软骨组织中的表达情况,分析LOX在OA疾病发生发展过程中的调控作用。

关键词：赖氨酰氧化酶骨关节炎软骨组织干预机制退行性疾病关键蛋白蛋白免疫印迹胞外基质

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基于水提醇沉原理的白芨胶规模化生产研究

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农产品加工 2022年第8期 19-23页

作者：许家倚蒲艳芬刘正波吴忠本粟小娓杨丽丽吴明开陈玉皎曹军贵州贵安精准医学研究院股份有限公司贵州贵安561113 贵州航天智慧农业有限公司贵州贵阳550081 贵州省农作物品种资源研究所贵州贵阳550006 重庆大学生物工程学院生物流变科学与技术教育部重点实验室重庆400044

以中药材白芨粉为原料,采用水提醇沉原理生产白芨胶。根据白芨水提取—水浓缩—乙醇提取—乙醇浓缩—白芨胶获得等工艺步骤,设计可满足不同需求的、规模化、智能化白芨胶生产系统,生产系统包括提取罐、真空上料机、离心机、浓缩器、醇... 详细信息

以中药材白芨粉为原料,采用水提醇沉原理生产白芨胶。根据白芨水提取—水浓缩—乙醇提取—乙醇浓缩—白芨胶获得等工艺步骤,设计可满足不同需求的、规模化、智能化白芨胶生产系统,生产系统包括提取罐、真空上料机、离心机、浓缩器、醇沉分离一体罐、离心液储罐和浓缩液储罐。以572 kg贵州白芨为原料,通过该生产系统获得白芨胶冻干粉207.11 kg,该白芨胶冻干粉总糖含量为84.13%。建立了白芨胶的生产工艺,通过该工艺生产出得率更高、总糖含量高的白芨胶冻干粉,同时根据生产实际设计了白芨胶提取分离一体化生产线,这为白芨胶的规模化生产建立了坚实的基础。

关键词：白芨白芨胶自动化规模化生产系统

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