检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2019年第13期17卷 4229-4234页

作者：王鹏良吴双成梁文兰邓洁梅谢沁汝苏洁霞谢雅榆陈乃明朱鹏杨利平张照远广西壮族自治区林业科学研究院广西优良用材林资源培育重点实验室南宁530002 北部湾大学广西北部湾海洋生物养护重点实验室钦州535011 钦州市林业科学研究所钦州市植物生物技术重点实验室钦州535099

邓恩桉是成功引种至中国的耐寒桉,为了深入挖掘邓恩桉耐寒基因资源,本研究利用同源克隆技术从邓恩桉叶片低温诱导的c DNA中分离出一个长度为1 392 bp的DNA序列,包含一个长度为972 bp的开放阅读框,编码323个氨基酸的蛋白质。该蛋白质具... 详细信息

邓恩桉是成功引种至中国的耐寒桉,为了深入挖掘邓恩桉耐寒基因资源,本研究利用同源克隆技术从邓恩桉叶片低温诱导的c DNA中分离出一个长度为1 392 bp的DNA序列,包含一个长度为972 bp的开放阅读框,编码323个氨基酸的蛋白质。该蛋白质具有一个AP2结构域,分子量为34.765 76 kD。聚类分析表明,该基因与冈尼桉的DREB2类基因和蓝桉的DREB2基因聚成一支,与蓝桉DREB2基因遗传关系最近,因此命名为EdDREB2。qRT-PCR分析表明,EdDREB2基因受低温诱导1 h时的表达量为1.08倍,至12 h时表达最高,说明该基因可能参与低温胁迫的调控。EdDREB2基因的克隆、生物信息学分析和表达分析为其功能的深入研究提供帮助。

关键词：邓恩桉(Eucalyptus dunnii) EdDREB2 基因克隆表达分析

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巨桉叶绿体基因组密码子偏好性分析

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广西植物 2019年第12期39卷 1583-1592页

作者：王鹏良吴双成杨利平王华宇陈乃明张照远广西优良用材林资源培育重点实验室广西壮族自治区林业科学研究院南宁530002 广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室北部湾大学广西钦州535011 钦州市植物生物技术重点实验室广西钦州市林业科学研究所广西钦州535099

该文针对巨桉叶绿体基因组序列,选取其中长于300 nt且以AUG为起始密码子的43个非重复基因作为研究对象,采用CodonW1.4.2软件分析巨桉叶绿体基因组的密码子使用偏好性。结果表明:第3位密码子的平均GC含量为27.97%;ENC的变化范围为39.49~6... 详细信息

该文针对巨桉叶绿体基因组序列,选取其中长于300 nt且以AUG为起始密码子的43个非重复基因作为研究对象,采用CodonW1.4.2软件分析巨桉叶绿体基因组的密码子使用偏好性。结果表明:第3位密码子的平均GC含量为27.97%;ENC的变化范围为39.49~61.00,平均为47.04;RSCU>1的密码子有31个,其中29个以A/U结尾;中性分析显示,GC12与GC3无显著相关;回归分析未达到显著性水平;ENC-plot分析发现,大部分基因落在曲线上或附近;对应分析表明第1轴的贡献率为17.68%,第2轴的贡献率为11.49%,第3轴、第4轴的贡献率分别为8.00%和5.76%,前4轴累计贡献率达42.93%,第1轴与GC、ENC、CAI达到极显著相关。上述分析结果表明,巨桉叶绿体基因组的密码子偏好较弱,密码子第3位偏好以A或U结尾,选择和突变在巨桉叶绿体基因组密码子偏好中起相对均衡的作用,最终确定UUG、CUU、GUU、UCC、UCA、ACA、UAU、UAA、CAU、AAU、AGA和GGA 12个高频高表达密码子为最优密码子。这为转化叶绿体基因密码子优化,提高表达效率和改良巨桉目标性状奠定了坚实基础。

关键词：巨桉叶绿体基因组密码子偏好性

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普通油茶叶绿体基因组密码子偏好性分析

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广西植物 2018年第2期38卷 135-144页

作者：王鹏良杨利平吴红英农有良吴双成肖玉菲覃子海王华宇刘海龙广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室钦州学院广西钦州535011 广西特色经济林培育与利用重点实验室广西壮族自治区林业科学研究院南宁530002 钦州市植物生物技术重点实验室广西钦州市林业科学研究所广西钦州535099

为了利用叶绿体基因工程技术改良普通油茶的重要经济性状,该研究以普通油茶叶绿体全基因组序列为材料,从中筛选出51条长度大于300 bp且以ATG起始的非重复CDS(Coding DNA Sequence)为对象,利用CodonW软件分析其密码子偏好性。结果表明:... 详细信息

为了利用叶绿体基因工程技术改良普通油茶的重要经济性状,该研究以普通油茶叶绿体全基因组序列为材料,从中筛选出51条长度大于300 bp且以ATG起始的非重复CDS(Coding DNA Sequence)为对象,利用CodonW软件分析其密码子偏好性。结果表明:密码子第三位GC含量为27.55%,ENC范围在35.23~56.67之间,平均值为46.09;RSCU值大于1.00的密码子数目为30个,其中29个第三位碱基以U或A结尾;中性绘图表明GC12与GC3的相关系数为0.143,相关性不显著,回归系数为0.0573;频数分布显示,55%基因的ENC比值集中分布在0~0.1,25%基因的ENC比值分布在0.1~0.2之间;对应分析结果表明,第一向量轴占10.12%的差异,第二向量轴占9.36%的差异,其余两轴分别占7.97%和7.46%,前4轴累计差异为34.91%。中性绘图、ENC-plot和对应性分析均表明普通油茶叶绿体基因密码子偏好受突变作用,更多受选择的影响。最终取高表达优越密码子和高频密码子共有的CUU、AUU、GUU、GUA、UAA、CAA、AAA、GAC、GAA、CCU、ACU、GCU、GCA、UGU、CGU、AGU、UUG、GGU等18个密码子作为最优密码子。该研究结果为利用叶绿体基因工程技术改良普通油茶重要经济性状奠定了基础。

关键词：普通油茶叶绿体密码子偏好 ENC RSCU

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扁桃斑鸠菊扦插繁育影响因子研究

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安徽农业科学 2016年第14期44卷 197-199页

作者：杨利平陈乃明王华宇陈丽文何贵整时群王鹏良广西钦州市林业科学研究所钦州市植物生物技术重点实验室钦州市植物生物工程技术研究中心广西钦州535099 钦州学院广西钦州535099

[目的]了解影响扁桃斑鸠菊扦插育苗的相关因素,提高育苗成活率。[方法]开展不同基质类型、不同插穗类型以及不同植物生长调节剂对扁桃斑鸠菊扦插繁育效果的研究。[结果]2年生(半木质化带顶芽)的插穗最有利于扁桃斑鸠菊的扦插繁殖,成活率... 详细信息

[目的]了解影响扁桃斑鸠菊扦插育苗的相关因素,提高育苗成活率。[方法]开展不同基质类型、不同插穗类型以及不同植物生长调节剂对扁桃斑鸠菊扦插繁育效果的研究。[结果]2年生(半木质化带顶芽)的插穗最有利于扁桃斑鸠菊的扦插繁殖,成活率达86.05%;200 mg/L IBA处理可显著提高插穗扦插成活率、平均根长及生根数,成活率达93.33%;使用轻基质作为扁桃斑鸠菊的扦插基质,其插穗的成活率、生根数和平均根长等指标均显著高于其余3种。[结论]应首选2年生(半木质化带顶芽)的扁桃斑鸠菊插穗,经200 mg/L IBA处理,选用轻基质作为扦插基质更有利于苗木繁育。

关键词：扁桃斑鸠菊扦插基质植物生长调节剂插穗类型 Vernonia amygdalina Del.

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普通油茶岑软3号苗木分级研究

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安徽农业科学 2016年第32期44卷 155-157页

作者：唐维龙杨利平王华宇陈元松赵文东韦长江吴红英覃雯霞赵森黄达军许尤厚王鹏良广西国有三门江林场广西柳州545006 钦州市林业科学研究所钦州市植物生物技术重点实验室/工程中心广西钦州535099 钦州学院海洋学院广西北部湾海洋生物养护重点实验室广西钦州535011 广西壮族自治区林业科学研究院广西特色经济林开发和利用重点实验室广西南宁530002

[目的]对岑软3号苗木分级进行研究,进一步规范其出圃规格,提高苗木质量。[方法]以1年生的岑软3号嫁接苗为材料,测量其苗高、地径、叶片数等8个性状,利用主成分分析和逐步聚类分析法对苗木质量进行分级。[结果]28对性状组合中有22对存在(... 详细信息

[目的]对岑软3号苗木分级进行研究,进一步规范其出圃规格,提高苗木质量。[方法]以1年生的岑软3号嫁接苗为材料,测量其苗高、地径、叶片数等8个性状,利用主成分分析和逐步聚类分析法对苗木质量进行分级。[结果]28对性状组合中有22对存在(极)显著相关;主成分分析提取了前4个主成分,保留了82.8%的信息,地径、苗高、叶片数和上部鲜重为主要指标;逐步聚类将岑软3号苗木分成3类;确定其苗木分级:Ⅰ级苗的苗高H≥32.739 cm,地径D≥0.410 cm;Ⅱ级苗的苗高H≥20.666 cm,地径D≥0.323 cm。[结论]逐步聚类将岑软3号苗木分为3类,其中Ⅰ级苗5株,Ⅱ级苗29株,Ⅲ级苗38株。

关键词：普通油茶岑软3号苗木分级主成分分析逐步聚类

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赤桉EcWRKY50转录因子基因的电子克隆及生物信息学分析

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农业研究与应用 2014年第4期27卷 9-16页

作者：王鹏良韦翠娥覃柳辉杨利平张照远吴幼媚覃子海蔡玲黄金使高磊甘四明广西林业科学研究院广西优良用材林资源培育重点实验室南宁530002 广西国有三门江林场广西钦州市林业科学研究所钦州市生物工程技术研究中心中国科学院武汉植物园中国林业科学研究院热带林业研究所林木遗传育种国家重点实验室

WRKY转录因子参与植物生长发育、抗病虫、耐逆境等众多过程,并在其中起重要作用。为了研究WRKY在赤桉中的结构和功能,本研究利用电子克隆的方法克隆了赤桉与AtWRKY50高度同源的一个WRKY基因EcWRKY50,并利用生物信息学方法对该基因编码... 详细信息

WRKY转录因子参与植物生长发育、抗病虫、耐逆境等众多过程,并在其中起重要作用。为了研究WRKY在赤桉中的结构和功能,本研究利用电子克隆的方法克隆了赤桉与AtWRKY50高度同源的一个WRKY基因EcWRKY50,并利用生物信息学方法对该基因编码蛋白的氨基酸组成,理化性质,亚细胞定位和高级结构等方面进行预测和分析。结果表明,EcWRKY50基因全长为585 bp,包含一个480 bp的开放阅读框,编码159个氨基酸,该基因蛋白分子量为18.187KD,理论等电点为5.45。该蛋白含有一个WRKYGKK的保守结构域和C2H2结构域,属于GroupⅡc成员,很可能在细胞质中起转录和转录调控的作用;并对该蛋白进行了同源性分析。这些研究为该基因功能的进一步分析奠定了坚实的基础。

关键词：赤桉 EcWRKY50转录因子基因电子克隆生物信息学分析

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赤桉EcWRKY75基因的电子克隆和生物信息学分析

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黑龙江农业科学 2014年第12期 28-32页

作者：王鹏良杨利平李铁英王华宇高磊覃雯霞甘四明广西林业科学研究院广西优良用材林资源培育重点实验室广西南宁530002 广西钦州市林业科学研究所钦州市植物生物工程技术研究中心广西钦州535000 广西国有三门江林场广西柳州545006 中国科学院武汉植物园湖北武汉430074 中国林业科学研究院热带林业研究所广东广州510520 林木遗传育种国家重点实验室北京100091

WRKY75基因在植物的生长发育以及生物和非生物胁迫过程中发挥着重要作用,对其遗传改良进行研究极为必要。以赤桉的EST序列为材料,利用电子克隆技术克隆1个与拟南芥中WRKY75高度同源的WRKY转录因子,命名为EcWRKY75,并对其开展生物信息学... 详细信息

WRKY75基因在植物的生长发育以及生物和非生物胁迫过程中发挥着重要作用,对其遗传改良进行研究极为必要。以赤桉的EST序列为材料,利用电子克隆技术克隆1个与拟南芥中WRKY75高度同源的WRKY转录因子,命名为EcWRKY75,并对其开展生物信息学分析。结果表明:EcWRKY75开放阅读框长为579bp,编码192个氨基酸,分子量为21.395KD,等电点为9.72;该基因编码的蛋白包含1个WRKYGQK保守结构域和1个C2H2的结构域,属GroupⅡ成员;该蛋白很可能在细胞核中起转录、转录调控或信号转导等作用。该基因的电子克隆和生物信息学分析为其实验克隆和功能分析提供可靠的参考依据。

关键词：赤桉 EcWRKY75 电子克隆生物信息学分析

来源：评论

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