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基于HMMR在肺腺癌组织中表达水平及其对LUAD患者预后影响的生物信息学分析

吉林大学学报（医学版） 2021年第6期47卷 1502-1509页

作者：李书珍曹雅杰耿海营蔡曾晓瑞代春美温有锋李宁锦州医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室辽宁锦州121000 锦州医科大学药学院辽宁锦州121000 锦州医科大学基础医学院人体解剖学教研室辽宁锦州121000 辽宁省人类表型组学重点研究实验室辽宁锦州121000

目的:探讨透明质酸介导的细胞游走受体(HMMR)在肺腺癌(LUAD)组织中的表达及其对LUAD患者预后的影响,阐明HMMR在LUAD发生发展中的作用。方法:通过基因表达汇编(GEO)、肿瘤基因组图谱(TCGA)和人类蛋白图谱(HPA)数据库评估LUAD组织中HMMR m... 详细信息

目的:探讨透明质酸介导的细胞游走受体(HMMR)在肺腺癌(LUAD)组织中的表达及其对LUAD患者预后的影响,阐明HMMR在LUAD发生发展中的作用。方法:通过基因表达汇编(GEO)、肿瘤基因组图谱(TCGA)和人类蛋白图谱(HPA)数据库评估LUAD组织中HMMR mRNA和蛋白表达水平。采用GEPIA2数据库分析HMMR表达对LUAD患者总生存期(OS)和无病生存期(DFS)的影响,采用TCGA数据库分析HMMR mRNA表达与LUAD患者临床病理参数及预后的关系,采用GSEA富集分析探讨HMMR在LUAD组织中显著富集的通路,采用UALCAN数据库探讨HMMR mRNA表达与TP53基因突变的关系,采用STRING数据库预测HMMR与p53信号通路中蛋白的相互作用。结果:LUAD组织中HMMR mRNA和蛋白表达水平明显高于正常组织和癌旁组织(P<0.01)。HMMR mRNA表达水平较高的患者OS和DFS更短(P<0.01)。LUAD组织中,HMMR mRNA表达与患者TNM分期、T分期和N分期有关联(P<0.01)。单因素和多因素Cox分析,HMMR mRNA高表达的患者OS更短。GSEA富集分析,细胞周期、同源重组、p53信号通路、膀胱癌、胰腺癌、小细胞肺癌和泛素化介导的蛋白水解等通路显著富集在HMMR高表达显型。结论:LUAD组织中HMMR表达明显上调,高表达的HMMR mRNA是LUAD患者预后差的独立评价指标。

关键词：肺腺癌透明质酸介导的运动受体数据库预后

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葡萄糖调节蛋白78对肝癌细胞放射敏感性的调控作用及其机制

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吉林大学学报（医学版） 2021年第4期47卷 888-895页

作者：杨洁贺武斌安妮孔雯聪苏荣健王学哲锦州医科大学附属第一医院检验科辽宁锦州121000 锦州医科大学附属第一医院外科学实验室辽宁锦州121000 锦州医科大学基础医学院细胞生物学教研室辽宁锦州121000 锦州医科大学基础医学院病理学教研室辽宁锦州121000

目的:探讨葡萄糖调节蛋白78(GRP78)对肝癌细胞放射敏感性的影响,初步阐明其分子机制。方法:采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法和Western blotting法检测肝癌SMMC-7721、HepG2、PLC、Huh7和QGY-7703细胞中GRP78 mRNA和蛋白表达水平,筛选GR... 详细信息

目的:探讨葡萄糖调节蛋白78(GRP78)对肝癌细胞放射敏感性的影响,初步阐明其分子机制。方法:采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法和Western blotting法检测肝癌SMMC-7721、HepG2、PLC、Huh7和QGY-7703细胞中GRP78 mRNA和蛋白表达水平,筛选GRP78高表达和低表达的肝癌细胞作为研究对象。采用RNA干扰技术在GRP78高表达的人肝癌SMMC-7721细胞中靶向沉默GRP78,命名为siGRP78-SMMC-7721(siGRP78组),以siNC-SMMC-7721为对照组(siNC组);采用基因重组技术在GRP78低表达的人肝癌HepG2细胞中过表达GRP78,命名为Flag-GRP78-HepG2(Flag-GRP78组),以空载体3×Flag-HepG2为对照组(3×Flag组)。各组细胞分别给予0、2、4、6、8和10 Gy剂量X射线照射后,采用MTT法检测肝癌细胞存活率,5-乙炔基-2'脱氧尿嘧啶核苷(EdU)荧光染色法检测肝癌细胞增殖率,Western blotting法检测肝癌细胞中磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路中磷酸化PI3K(p-PI3K)和磷酸化Akt(p-Akt)蛋白表达水平。结果:RT-qPCR法和Western blotting法检测,SMMC-7721细胞中GRP78 mRNA和蛋白表达水平最高,HepG2细胞中GRP78 mRNA和蛋白表达水平最低,选取SMMC-7721和HepG2细胞作为研究对象。MTT法检测,随着放射剂量的增加,肝癌细胞存活率逐渐降低;与siNC组比较,6 Gy以上剂量X射线照射后,siGRP78组细胞存活率明显降低(P<0.01);与3×Flag组比较,4 Gy以上剂量X射线照射后,Flag-GRP78组细胞存活率明显升高(P<0.05或P<0.01)。EdU荧光染色法检测,与siNC组比较,siGRP78组细胞增殖率明显降低(P<0.05);与3×Flag组比较,Flag-GRP78组细胞增殖率明显升高(P<0.05)。Western blotting法检测,与siNC组比较,siGRP78组细胞中p-PI3K和p-Akt蛋白表达水平明显降低(P<0.01);与3×Flag组比较,Flag-GRP78组细胞中p-PI3K和p-Akt蛋白表达水平明显升高(P<0.01)。结论:高表达水平的GRP78可降低肝癌细胞放射敏感性,其作用机制可能与GRP78激活PI3K/Akt信号通路有关。

关键词：葡萄糖调节蛋白78 肝肿瘤放射敏感性细胞凋亡磷脂酰肌醇3激酶蛋白激酶B

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适配体功能化外泌体在肿瘤靶向治疗中的应用

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生物化学与生物物理进展 2023年第9期50卷 2084-2092页

作者：杜梦寒王敬华胜妮石玉生张兴梅南方医科大学基础医学院神经生物学教研室广州510515 暨南大学附属珠海医院珠海市人民医院放疗科珠海519000 暨南大学附属珠海医院珠海市人民医院广东省肿瘤介入诊治研究重点实验室珠海519000

传统的肿瘤治疗方法因缺乏足够的靶向性而会产生严重的毒副作用。外泌体(exosome)是一种天然的纳米囊泡,参与细胞间的信息传递,并且作为药物递送载体具有出色的性能优势,包括低免疫原性、低毒性和能够穿越天然屏障等特点。然而以外泌体... 详细信息

传统的肿瘤治疗方法因缺乏足够的靶向性而会产生严重的毒副作用。外泌体(exosome)是一种天然的纳米囊泡,参与细胞间的信息传递,并且作为药物递送载体具有出色的性能优势,包括低免疫原性、低毒性和能够穿越天然屏障等特点。然而以外泌体为载体的药物递送系统的靶向能力仍有不足。适配体(aptamer)是一类化学合成的单链核酸分子,具有分子质量小、易于修饰和免疫原性低等特点,可作为亲和性配体与靶向分子特异性结合。通过在外泌体表面修饰适配体,药物可以被精确递送到肿瘤细胞发生部位,从而实现对肿瘤的靶向治疗,提高肿瘤治疗效果,减少毒副作用。本篇综述将重点讨论适配体功能化外泌体药物靶向递送系统在各种肿瘤治疗方面的应用,并对其未来的挑战和机遇进行阐述。

关键词：适配体外泌体肿瘤靶向治疗

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RNA m^(6)A甲基化与神经发育

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中国生物化学与分子生物学报 2022年第3期38卷 249-261页

作者：薛李婷赵天叶海虹首都医科大学基础医学院医学遗传学与发育生物学教研室北京100069 首都医科大学神经再生与修复北京市重点实验室北京100069

中枢神经系统控制高级神经活动,例如知觉、运动、语言和认知等。作为人体神经系统最重要的部分,其正常的发育及功能活动在人体发育过程中至关重要。更好地了解调节神经系统发育的基本分子途径以及对大脑的基本生物学理解,可以帮助诊断... 详细信息

中枢神经系统控制高级神经活动,例如知觉、运动、语言和认知等。作为人体神经系统最重要的部分,其正常的发育及功能活动在人体发育过程中至关重要。更好地了解调节神经系统发育的基本分子途径以及对大脑的基本生物学理解,可以帮助诊断和治疗各种神经疾病。RNA分子m^(6)A修饰状态的动态变化及其功能主要由m^(6)A甲基转移酶、m^(6)A去甲基化酶和m^(6)A阅读蛋白等蛋白质复合物共同调控。本文对此进行了详细介绍,并详细概述m^(6)A修饰对神经发育的影响,重点介绍表观转录组学在基因调控中的作用。此外,还强调m^(6)A修饰在神经发育过程中的生物学意义,包括神经发生、神经分化、轴突导向、突触形成及突触可塑性等。根据不同的实验原理和实验技术,本文详细介绍了最近发展的几种检测m^(6)A位点的技术,每种方法都有各自的优点,据此将能够更广泛和更深入地研究这一修饰,并选择合适的方法去研究课题。RNA m^(6)A甲基化是神经科学领域的一个新前沿。近年来,随着m^(6)A检测技术的发展,m^(6)A甲基化在神经系统发育过程中及神经疾病发生中的作用研究逐渐成为热点,具有很大潜力,为神经发育和神经疾病的研究提供了新视角。

关键词：表观转录组学 N^(6)-腺苷酸甲基化神经发育神经发生突触

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耻垢分枝杆菌感染人脐带间充质干细胞模型的建立及其特征

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微生物学通报 2023年第11期50卷 5031-5044页

作者：康亚莉宁唤唤谢燕玲任瑞白鹭路延之康健韦垠张琳娜柏银兰空军军医大学基础医学院微生物与病原生物学教研室陕西西安710032 宁夏医科大学基础医学院生理学和神经生物学系宁夏银川750001 延安大学生命科学学院陕西延安716000

【背景】结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)休眠菌形成被认为是潜伏结核感染(latent tuberculosis infection,LTBI)的主要原因,但目前缺乏体内和体外模型进行机制研究。新近研究表明Mtb可感染间充质干细胞(mesenchymal stem... 详细信息

【背景】结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)休眠菌形成被认为是潜伏结核感染(latent tuberculosis infection,LTBI)的主要原因,但目前缺乏体内和体外模型进行机制研究。新近研究表明Mtb可感染间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSC)并以休眠状态在细胞中长期存活。然而Mtb感染细胞模型存在周期长和生物安全要求高等问题,需要探索可用的MSC感染细胞模型用于Mtb休眠机制的研究。【目的】建立快速生长型耻垢分枝杆菌(Mycobacterium smegmatis,Ms)感染人脐带间充质干细胞(human umbilical cord MSC,hUCMSC)的细胞模型并研究其特征。【方法】取分离好的hUCMSC,流式细胞术鉴定其表面标志性抗原;以Ms菌株感染hUCMSC,DiI标记细胞膜,荧光显微镜下观察细胞吞噬作用;平板法计数Ms胞内存活率;油红O染色观察细胞脂滴形成;鬼笔环肽荧光染色观察细胞骨架变化;实时荧光定量PCR(real time quantitative PCR,RT-qPCR)检测Ms感染的hUCMSC脂质代谢、静息和分化相关基因转录水平。【结果】Ms感染hUCMSC后在胞内以非复制方式存活,其感染率与感染复数呈正相关;Ms感染hUCMSC可诱导脂滴合成相关基因表达,而抑制降解相关基因转录水平,从而促进细胞内脂滴形成。Ms感染促进hUCMSC细胞骨架发生重构,RT-qPCR检测结果显示细胞增殖和分化相关基因表达增加,Ms感染促进hUCMSC向成脂、成骨细胞分化。【结论】本研究建立了可模拟Mtb休眠形成的Ms感染hUCMSC模型,可进一步用于LTBI机制的相关研究。

关键词：结核分枝杆菌耻垢分枝杆菌间充质干细胞休眠菌结核潜伏感染

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基于“Mini微视频+网络平台”的实验教学设计与应用

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继续医学教育 2023年第9期37卷 33-36页

作者：董颖吴囡孟智超刘凌张轶博锦州医科大学基础医学实验教学中心分子医学实验教学平台辽宁锦州123000 锦州医科大学基础医学院病原生物学教研室辽宁锦州123000

《分子医学实验技术》是集分子生物学基本技能、科研探索和医学应用于一体的基础医学学科,该课程对提高学生基本操作技能、培养学生创新能力至关重要。为加强实验教学实践中的薄弱环节,提高教学质量,笔者结合既往实验教学经验,制作了实... 详细信息

《分子医学实验技术》是集分子生物学基本技能、科研探索和医学应用于一体的基础医学学科,该课程对提高学生基本操作技能、培养学生创新能力至关重要。为加强实验教学实践中的薄弱环节,提高教学质量,笔者结合既往实验教学经验,制作了实验室规则类、实验前后工作类、操作与原理关联理解类、基本操作技能类、关键实验步骤及特殊现象类等五类Mini微视频。Mini微视频是时长在10 s~2 min的针对教学薄弱环节进行总结的知识碎片内容,不等于微课,将其与网络平台有机融合运用于实验教学中,充分发挥其辅助教学功能,有利于提高实验教学效率和教学质量,进一步满足学生的自主化、个性化学习要求,同时也能极大促进教学相长。

关键词：分子医学实验技术 Mini微视频网络平台教学自主化学习个性化学习

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前包钦格复合体的星形胶质细胞参与调控呼吸模式

前包钦格复合体的星形胶质细胞参与调控呼吸模式

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中国睡眠研究会第16届全国学术年会暨湖北科学技术学术年会

作者：赵雪尉红肖王升河北医科大学基础医学院神经生物学教研室

目的:前包钦格复合体位于延髓腹外侧,是呼吸中枢模式发生器的重要结构。前包钦格复合体主要包括吸气节律神经元和模式调控神经元。近年来的研究表明,星形胶质细胞和神经元之间的交互作用对于维持稳态发挥重要作用,然而前包钦格复合体的... 详细信息

目的:前包钦格复合体位于延髓腹外侧,是呼吸中枢模式发生器的重要结构。前包钦格复合体主要包括吸气节律神经元和模式调控神经元。近年来的研究表明,星形胶质细胞和神经元之间的交互作用对于维持稳态发挥重要作用,然而前包钦格复合体的星形胶质细胞在呼吸调控中的作用还尚未完全阐明,本研究旨在明确此类神经细胞是否参与调控通气反应和呼吸模式。方法:利用化学遗传学方法选择性激活或抑制小鼠的前包钦格复合体区的星形胶质细胞;利用全身无创体积描记系统测定自由活动小鼠的呼吸参数。结果:化学遗传学方法激活前包钦格复合体的星形胶质细胞,小鼠呼吸频率减慢,潮气量增加,然而每分通气量不变,同时叹息样呼吸次数增加,但对自发性呼吸暂停的频率无影响。化学遗传学方法抑制preB?tC的星形胶质细胞对呼吸参数无显著性影响。结论:激活前包钦格复合体的星形胶质细胞引起深慢呼吸,但不影响通气量,同时伴有特殊呼吸模式的变化。

关键词：呼吸中枢呼吸模式星形胶质细胞肺通气

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小鼠心肌肥厚枢纽基因的筛选与鉴定

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解剖学报 2021年第3期52卷 391-397页

作者：史卓李家慧高静董艳莉任甫文普帅锦州医科大学基础医学院解剖学教研室辽宁锦州121000 锦州医科大学辽宁省人类表型组重点研究实验室辽宁锦州121000 锦州市卫生学校护理教研室辽宁锦州121000 锦州医科大学第三临床医学院辽宁锦州121000 锦州医科大学附属第一医院超声科辽宁锦州121000 朝阳市卫生学校实验中心护理组辽宁朝阳122000 锦州医科大学基础医学院病理生理学教研室辽宁锦州121000

目的通过生物信息学分析结合生物学实验,筛选和鉴定与心肌肥厚密切相关的枢纽基因。方法从基因表达数据库(GEO)下载小鼠心肌肥厚相关芯片数据,利用GEO2R在线工具筛选差异表达基因;利用DAVID6.7、String 11.0和Cytoscape 3.7. 0软件对差... 详细信息

目的通过生物信息学分析结合生物学实验,筛选和鉴定与心肌肥厚密切相关的枢纽基因。方法从基因表达数据库(GEO)下载小鼠心肌肥厚相关芯片数据,利用GEO2R在线工具筛选差异表达基因;利用DAVID6.7、String 11.0和Cytoscape 3.7. 0软件对差异基因进行分析;昆明小鼠随机分为生理盐水组(n=6)和血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)组(n=6),建立心肌肥厚模型,通过Real-time PCR方法检测枢纽基因在AngⅡ诱导的昆明小鼠心肌肥厚模型中的表达。结果筛选出共有差异表达基因202个,枢纽基因12个;Real-time PCR结果显示核心蛋白聚糖(Dcn)、HADHA和热休克蛋白(HSP) 90αA1在AngⅡ组中表达明显下调。结论筛选出的枢纽基因可以通过细胞外基质和转化生长因子β(TGF-β)影响昆明小鼠心肌肥厚的发生发展。

关键词：心肌肥厚生物信息学差异表达基因实时定量聚合酶链反应昆明小鼠

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肌梭形态研究进展

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生理学报 2022年第6期74卷 1039-1047页

作者：连文玺饶家声郝柳芳王子珏段红梅杨朝阳李晓光北京航空航天大学生物与医学工程学院北京市生物材料与神经再生重点实验室首都医科大学基础医学院神经生物学教研室

肌梭是分布于骨骼肌中的重要本体感受器，参与调节躯体运动、维持姿势、控制运动速度变化等生理活动，是许多运动及代谢疾病的重要评估指标和治疗靶点。本文对肌梭在骨骼肌中的分布、机械力信号传递机制进行概述，并对肌梭形态和结构特... 详细信息

肌梭是分布于骨骼肌中的重要本体感受器，参与调节躯体运动、维持姿势、控制运动速度变化等生理活动，是许多运动及代谢疾病的重要评估指标和治疗靶点。本文对肌梭在骨骼肌中的分布、机械力信号传递机制进行概述，并对肌梭形态和结构特点的研究进展进行综述。

关键词：肌梭形态卫星细胞施万细胞成纤维/脂肪前体细胞

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利用生物电阻抗法研究进藏工作的汉族人群骨骼肌含量

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解剖学报 2021年第4期52卷 643-646页

作者：赵秋月张海龙席焕久任甫阎文柱钟铧白马多吉锦州医科大学基础医学院人体解剖学教研室辽宁锦州121001 西藏大学医学院人体解剖学教研室拉萨850000

目的探讨进藏工作汉族成年人群和辽宁汉族成年人群骨骼肌含量分布的特点及差异。方法随机抽取进藏工作的辽宁本地汉族、辽宁汉族健康成人作为研究对象,共选取进藏辽宁本地汉族成人223名(男95,女128);辽宁汉族成人302名(男126,女176),应... 详细信息

目的探讨进藏工作汉族成年人群和辽宁汉族成年人群骨骼肌含量分布的特点及差异。方法随机抽取进藏工作的辽宁本地汉族、辽宁汉族健康成人作为研究对象,共选取进藏辽宁本地汉族成人223名(男95,女128);辽宁汉族成人302名(男126,女176),应用体成分分析仪对受试者的体重、全身肌肉量、躯干肌肉量、左上肢肌肉量、右上肢肌肉量、左下肢肌肉量、右下肢肌肉量进行测量。并将所有结果输入SPSS 22.0统计学软件分析,应用独立样本t检验等相关统计学方法处理。结果进藏汉族成年人群的体重、躯干肌肉量、左上肢肌肉量、右上肢肌肉量、左下肢肌肉量及右下肌肉量均小于辽宁本地汉族人群,差异有显著性(P<0.01或P<0.05);进藏汉族和辽宁汉族人群的男性肌肉量大于女性人群,差异有显著性(P<0.01或P<0.05)。结论辽宁汉族人群进入西藏高原地区后,身体各部分肌肉量数值均明显下降。人体成分的改变可受性别、高原缺氧环境等多种因素影响。

关键词：汉族藏族骨骼肌生物电阻抗法成人

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