检索结果-内蒙古大学图书馆

陆军军医大学学报 2025年第3期47卷 262-274页

作者：叶元兰刘恺文潘一鸣郭风劲重庆医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室重庆

目的基于网络药理学、分子对接技术并结合体外实验探讨佛手柑内酯(Bergapten)治疗骨关节炎(osteoarthritis,OA)的作用与机制。方法检索Super-Pred、Swiss Target Prediction、Drug Bank等相关数据库获取佛手柑内酯的功能靶点和OA疾病相... 详细信息

目的基于网络药理学、分子对接技术并结合体外实验探讨佛手柑内酯(Bergapten)治疗骨关节炎(osteoarthritis,OA)的作用与机制。方法检索Super-Pred、Swiss Target Prediction、Drug Bank等相关数据库获取佛手柑内酯的功能靶点和OA疾病相关作用靶点,将靶点通过Venny 2.1.0进行交集,利用STRING数据库进行蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)分析,利用AutoDock Vina软件进行分子对接。在C28/I2细胞中进行体外验证实验,CCK-8检测佛手柑内酯对C28/I2细胞增殖活性的影响,RT-qPCR和细胞免疫荧光检测增殖凋亡、炎症和衰老相关分泌表型(senescence associated secretory phenotype,SASP)因子的表达情况。使用细胞衰老β-半乳糖苷酶(senescence-associatedβ-galactosidase,SA-β-Gal)染色试剂盒检测SA-β-Gal水平的变化。结果筛选得到145个佛手柑内酯治疗OA的潜在作用靶点。PPI分析发现HSP90AA1、EGFR、HIF1A、PIK3CA 4个潜在核心靶点,且分子对接可形成较稳定的复合物。CCK-8发现,10μmol/L佛手柑内酯处理48 h,C28/I2细胞的存活率最高(P<0.05)。细胞免疫荧光、RT-qPCR和Western Blot实验显示,佛手柑内酯处理后,细胞增殖标志物PCNA、CCND1和CCNE1的表达增加(P<0.05),而凋亡指标Caspase3和BAX的表达降低(P<0.05)。同时,佛手柑内酯处理后,IL-1β诱导的炎性因子IL-6和TNF-α的表达降低,而抗炎因子IL-4和IL-10的表达增加(P<0.05)。SASP因子P16、P21、MMP9和MMP13的表达也显著减少(P<0.05)。Sa-β-Gal染色显示,IL-1β诱导后C28/I2细胞的β-半乳糖苷酶水平显著增加(P<0.05),而佛手柑内酯处理后,β-半乳糖苷酶染色的阳性细胞率显著降低(P<0.05)。结论佛手柑内酯可降低IL-1β刺激的软骨细胞中的SASP因子IL-6、TNF-α、P16、P21、MMP9、MMP13等的表达,从而在延缓OA进展中发挥其抗炎、抗衰老的作用。

关键词：骨关节炎 5-甲氧基补骨脂素网络药理学衰老相关分泌表型

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基于生物信息学分析线粒体转录因子B1在结肠癌中高表达并促进细胞生长

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中国生物化学与分子生物学报 2025年第1期41卷 125-135页

作者：欧志高陈会莹汤婷朱剑军山西医科大学基础医学院医学细胞生物与遗传学教研室太原030001

线粒体转录因子B1(mitochondrial transcription factor B1,TFB1M)主要参与线粒体DNA转录,与肝细胞癌、星状细胞瘤等发生发展有关,然而其在结肠癌中的作用尚不清楚。本研究基于公共数据库和免疫组织化学方法分析TFB1M在结肠癌中的表达... 详细信息

线粒体转录因子B1(mitochondrial transcription factor B1,TFB1M)主要参与线粒体DNA转录,与肝细胞癌、星状细胞瘤等发生发展有关,然而其在结肠癌中的作用尚不清楚。本研究基于公共数据库和免疫组织化学方法分析TFB1M在结肠癌中的表达水平及预后;筛选TFB1M高低表达组差异表达基因,进行功能富集分析,突变分析、免疫细胞浸润和药物敏感性分析等。采用CCK-8、流式细胞术等方法检测过表达TFB1M对结肠癌细胞活力、凋亡及细胞周期分布的影响。结果发现,TFB1M在结肠癌中表达水平显著升高,其表达水平与N分期和TNM分期有关(P<0.05)。TFB1M高表达结肠癌患者预后较差。功能富集结果显示,TFB1M与白细胞介导的免疫、免疫球蛋白产生等信号通路有关。此外,ZFHX4、RYR2、PIK3CA和FAT 4等基因在TFB1M高表达组突变频率显著升高(均P<0.05)。在PIK3CA和FAT 4突变组中TFB1M表达水平显著升高(均P<0.05)。TFB1M高表达组中CD4+记忆活化T细胞占比升高,Treg细胞占比降低。TFB1M高表达组患者可能对陶扎色替(tozasertib)、阿糖胞苷(cytarabine)、长春新碱(vincristine)等更敏感,而TFB1M低表达组患者可能对Dasatinib、JQ1、ERK_2440等更敏感。细胞实验结果表明,过表达TFB1M时,结肠癌细胞活力升高、细胞凋亡减少,S期和G 2/M期细胞占比增多。以上研究结果表明,TFB1M可能通过调控免疫细胞浸润及功能在结肠癌细胞生长过程中发挥关键作用。

关键词：结肠癌线粒体转录因子B1 细胞活力细胞凋亡

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中华微生物学和免疫学杂志 2025年第1期45卷 53-63页

作者：汤婷李钰博张昕彤胡艳芬吴昊朱剑军李莉刘铭山西医科大学基础医学院医学细胞生物与遗传学教研室太原030001 济宁医学院附属医院生殖医学科济宁272000

目的在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中构建线粒体相关基因(mitochondria-related genes,Mito-RGs)模型,基于模型预测HCC免疫、预后和治疗特征,为HCC的诊断和治疗提供新思路。方法从癌症基因组图谱数据库中获得肝细胞癌的表... 详细信息

目的在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中构建线粒体相关基因(mitochondria-related genes,Mito-RGs)模型,基于模型预测HCC免疫、预后和治疗特征,为HCC的诊断和治疗提供新思路。方法从癌症基因组图谱数据库中获得肝细胞癌的表达谱和相应的临床信息。采用单变量Cox回归、最小绝对收缩和选择算子回归和多变量Cox回归构建基于Mito-RGs的HCC预后模型并在国际癌症基因组协会的日本乙型肝炎病毒/丙型肝炎病毒患者项目数据集中进行验证。GO和KEGG富集分析研究高低危组差异表达基因富集的信号通路。使用CIBERSORT对免疫浸润进行评估。单细胞数据研究HCC样本高低危组中免疫细胞的比例及与细胞增殖之间的关系。Cellminer评估风险评分模型与药物敏感性之间的关系。结果构建了包含7个Mito-RGs(DTYMK、ACADS、HMGCS2、CYP27A1、TOMM40L、STOM和AKR1B10)的HCC风险预后模型,高危组HCC患者预后更差。高低危组差异表达基因中上调的基因富集在细胞周期和代谢相关通路。单细胞数据显示,高危组中CD8^(+)T细胞、巨噬细胞和单核细胞及增殖细胞占比更高。CIBERSORT分析结果提示Tregs细胞、M0巨噬细胞在高危组中的丰度较高,而CD8^(+)T、CD4^(+)记忆T细胞等丰度较低。药物敏感性预测在高危组对髓系细胞白血病-1蛋白抑制剂、长春新碱、磷脂酰肌醇激酶β亚型抑制剂和极光激酶A抑制剂更敏感,而曲美替尼、司美替尼、细胞外调节蛋白激酶抑制剂和丝裂原活化的细胞外信号调节激酶抑制剂则在低风险组更有效。结论构建的Mito-RGs模型能较好地评估HCC患者预后及免疫细胞浸润程度。

关键词：肝细胞癌线粒体相关基因癌症基因组图谱转录组测序预后

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基于生物信息学分析胃癌双微体中增强子的调控机制

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遗传 2025年

作者：安梦婷郭冠麟吴杰孙文靖贾学渊哈尔滨医科大学基础医学院医学遗传学教研室中国遗传资源保护与疾病防控教育部重点实验室(哈尔滨医科大学)

胃癌(gastric cancer,GC)在全球范围内的发病率和死亡率均居高位。双微体（double minutes,DMs）是一种染色体外的环状染色体，常携带有癌基因或耐药基因，其与肿瘤发生及耐药性密切相关。为深入探索双微体在胃癌发展中的作用及调控机... 详细信息

胃癌(gastric cancer,GC)在全球范围内的发病率和死亡率均居高位。双微体（double minutes,DMs）是一种染色体外的环状染色体，常携带有癌基因或耐药基因，其与肿瘤发生及耐药性密切相关。为深入探索双微体在胃癌发展中的作用及调控机制，本研究利用生物信息学方法通过分析CCLE细胞系数据库和TCGA实体瘤数据库中的基因组拷贝数变异数据，总结含双微体肿瘤样本的基因组特征，依此特征对胃癌样本进行分类。接着使用FANTOM5数据库、R包“GenomicRanges”、Bedtools工具以及MEME SUITE分析胃癌双微体上增强子及其调控的靶基因的功能。然后利用CIBERSORT包和GDSC药物数据库对TCGA中的含和不含的胃癌样本进行免疫细胞浸润分析和耐药分析。研究显示，胃癌中的双微体基因组特征包括一类拷贝数超过10且长度≥50 kb的基因组片段。双微体增强子的调控作用影响了耐药性和肿瘤免疫，其中增强子-转录因子-靶基因的调控回路扰动也与肿瘤免疫相关。进一步分析发现，双微体增强子调控的靶基因不仅导致了免疫相关基因表达的改变，还使得胃癌样本对常见化疗药物展现出更强的不敏感性，并且耐药相关靶基因在含双微体的胃癌样本中高表达并与不良预后密切相关。综上所述，该项研究为含有双微体的胃癌个体治疗提供了新的见解。

关键词：双微体增强子胃癌肿瘤免疫肿瘤耐药性生物信息学

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鼠尾草酚改善糖尿病小鼠认知功能障碍的机制

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锦州医科大学学报 2025年第1期46卷 10-15页

作者：张强单伟王刚锦州医科大学附属第一医院锦州医科大学基础医学院人体解剖学教研室辽宁锦州121000

目的探讨鼠尾草酚对糖尿病小鼠认知功能的改善情况。方法腹腔注射链脲佐菌素构建小鼠糖尿病模型,干预组小鼠给予100 mg/kg鼠尾草酚灌胃。记录小鼠造模前、造模3 d和12周的体重和血糖;Morris水迷宫评估糖尿病小鼠的认知功能;Nissl染色观... 详细信息

目的探讨鼠尾草酚对糖尿病小鼠认知功能的改善情况。方法腹腔注射链脲佐菌素构建小鼠糖尿病模型,干预组小鼠给予100 mg/kg鼠尾草酚灌胃。记录小鼠造模前、造模3 d和12周的体重和血糖;Morris水迷宫评估糖尿病小鼠的认知功能;Nissl染色观察海马组织神经元形态学及数量的改变;ELISA检测小鼠脑组织中的超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)活力和丙二醛(malondialdehyde,MDA)含量;Western Blot检测海马CX3CL1、CX3CR1蛋白及氧化应激超氧化物歧化酶(superoxide dismutase 2,SOD2)的蛋白表达水平。结果血糖和体重结果显示,与对照组(CON组)相比,在12周时糖尿病相关认知障碍组(DM组)血糖明显升高,体重减轻(P<0.05),而鼠尾草酚(carnosol,CL)干预后改善上述变化(P<0.05)。Morris水迷宫实验结果显示,与DM组相比,CL组小鼠逃避潜伏期明显缩短,穿越平台次数明显增加(P<0.05)。Nissl染色发现CL干预后Nissl体数量有所增加,神经元形态明显改变。与DM组相比,CL治疗组小鼠脑组织中SOD活力增加(P<0.05),MDA含量降低(P<0.05)。CX3CL1、CX3CR1蛋白表达均上调(P<0.05),SOD2明显上调(P<0.05)。结论鼠尾草酚可能通过CX3CL1/CX3CR1通路缓解DM小鼠海马组织的氧化应激,减缓神经元损伤,进而改善DM小鼠认知功能。

关键词：鼠尾草酚糖尿病相关认知功能障碍氧化损伤 CX3CL1/CX3CR1

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纳尔逊海湾病毒感染小鼠巨噬细胞RAW264.7的转录物组分析

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中国医科大学学报 2025年第4期54卷 340-345页

作者：马竹萍陈淼娟孙绿茵付纹瑞田晶李永刚陶晓莉锦州医科大学基础医学院病原生物学教研室辽宁锦州121001 通用技术辽油宝石花医院心内科辽宁盘锦124000 锦州医科大学人畜共患病防控协同创新中心辽宁锦州121001

目的通过分析纳尔逊海湾病毒(NBV)感染小鼠巨噬细胞RAW264.7转录物组测序结果,筛选差异表达基因,探讨固有免疫应答在呼肠孤病毒感染中的作用机制。方法用感染复数为30的NBV-Miyazaki病毒株感染小鼠巨噬细胞RAW264.7,运用高通量转录物组... 详细信息

目的通过分析纳尔逊海湾病毒(NBV)感染小鼠巨噬细胞RAW264.7转录物组测序结果,筛选差异表达基因,探讨固有免疫应答在呼肠孤病毒感染中的作用机制。方法用感染复数为30的NBV-Miyazaki病毒株感染小鼠巨噬细胞RAW264.7,运用高通量转录物组测序技术,以q<0.05且|log2FC|≥1为条件,筛选感染组和对照组的差异表达基因,利用基因本体论(GO)和京都基因和基因组数据库(KEGG)对差异表达基因进行富集分析。结果与对照组相比,感染组差异表达的基因共442个,其中显著上调的基因381个,显著下调的基因61个。差异表达基因在GO富集中主要与固有免疫反应、对病毒的防御反应、细胞因子的产生以及细胞对细胞因子刺激的反应等功能相关,在KEGG中主要富集到Toll样受体信号通路、维甲酸诱导基因Ⅰ样受体信号通路、PI3K/Akt等信号通路。结论RAW264.7细胞被NBV-Miyazaki病毒感染后,可以通过激活模式识别受体,促进细胞因子、趋化因子和其他免疫相关因子释放,增强抗体依赖细胞介导的细胞毒作用,以发挥免疫效应,为探究固有免疫在NBV-Miyazaki病毒感染过程中的作用机制提供了理论依据。

关键词：纳尔逊海湾病毒巨噬细胞转录物组

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红景天苷通过CCL2/CCR2通路对糖尿病小鼠肾病炎症反应的抑制作用

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锦州医科大学学报 2025年第2期 27-34+42页

作者：安娜单伟王刚锦州医科大学附属第一医院锦州医科大学基础医学院人体解剖学教研室

目的观察红景天苷对糖尿病肾脏病的影响，并探讨红景天苷治疗糖尿病肾脏病的具体机制。方法腹腔注射链脲佐菌素建立糖尿病小鼠模型并分别给予50、100、150μmol/L红景天苷(salidroside, Sal)。各组小鼠分别于第4周、8周、12周分别检... 详细信息

目的观察红景天苷对糖尿病肾脏病的影响，并探讨红景天苷治疗糖尿病肾脏病的具体机制。方法腹腔注射链脲佐菌素建立糖尿病小鼠模型并分别给予50、100、150μmol/L红景天苷(salidroside, Sal)。各组小鼠分别于第4周、8周、12周分别检测小鼠血糖；生化法检测24 h尿蛋白及血清肌酐(creatinine, Cr)、血尿素氮(blood urea nitrogen, BUN)含量及肾脏系数；酶联免疫吸附测定法(enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA)检测尿液中β2-微球蛋白(beta-2 microglobulin, β2-MG)、中性粒细胞明胶酶相关脂质运载蛋白(neutrophil gelatinase-associated lipocalin, NGAL)、肾损伤分子-1(kidney injury molecule-1,KIM-1)水平和肾组织中白细胞介素-10(interleukin-10,IL-10)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-alpha, TNF-α)和白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)炎症因子含量；实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time quantitative polymerase chain reaction, RT-qPCR)检测趋化因子2(chemokine C-C motif ligand 2,CCL2)、趋化因子2信使核糖核酸(chemokine C-C motif receptor 2 messenger ribonucleic acid, CCR2 mRNA)水平；Western Blot检测IL-10、IL-6、CCL2和CCR2相关蛋白的表达。结果与CON组相比，DM组小鼠血糖浓度升高(P<0.01);24 h尿蛋白增加(P<0.01);肾功能及肾脏系数增加(P<0.01);β2-MG、NGAL、KIM-1水平增加(P<0.01);IL-10因子含量和蛋白水平降低(P<0.01);TNF-α和IL-6因子含量和蛋白水平增加(P<0.01);CCL2和CCR2 mRNA和蛋白水平增加(P<0.01)。但给予中、高剂量组的红景天苷后明显改善上述变化，低剂量组无明显变化。在中剂量组干预的基础上尾静脉注射CCL2/CCR2的激活剂GW0742逆转红景天苷对糖尿病小鼠肾脏的保护作用。结论红景天苷可能通过CCL2/CCR2通路抑制糖尿病小鼠肾脏的炎症反应，减轻高血糖环境对肾脏的损伤，参与及改善糖尿病肾脏病的发生与发展。

关键词：糖尿病肾脏病红景天苷 CCL2/CCR2 炎症反应

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OBE理念背景下开展细胞生物学课堂教学互动的探索实践

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基础医学教育 2025年第2期27卷 129-133页

作者：卢玉飞广西医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室南宁530021

教师优化课堂教学设计,通过课中发布围绕重难点知识精心设计的互动话题并适时开展随堂练习,积极开展细胞生物学课堂教学互动探索实践。调查结果表明,这种教学互动模式不仅能引导学生主动思考,提高了学生的课堂参与度,更重要的是促进他... 详细信息

教师优化课堂教学设计,通过课中发布围绕重难点知识精心设计的互动话题并适时开展随堂练习,积极开展细胞生物学课堂教学互动探索实践。调查结果表明,这种教学互动模式不仅能引导学生主动思考,提高了学生的课堂参与度,更重要的是促进他们对重难点知识的理解、掌握和运用能力,同时也能让教师在互动中了解学生对所学内容的理解掌握程度。这种教学互动模式为该课程的教学改革提供了参考。

关键词：细胞生物学教学改革课堂教学成果导向教育教学互动

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皮肤创伤愈合过程中机械力信号介导成纤维细胞迁移的机制研究进展

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解剖科学进展 2025年第1期31卷 129-131,135页

作者：张庆峰王阳邹宇翟效月中国医科大学基础医学院组织学与胚胎学教研室辽宁沈阳110122 锦州医科大学附属第三医院整形外科辽宁锦州121001 中国医科大学附属第一医院整形外科辽宁沈阳110001

在皮肤创伤愈合过程中,成纤维细胞通过增殖、迁移和分泌细胞外基质(extracellular matrix, ECM)参与修复。细胞外基质的物理特性能够被成纤维细胞感知并在细胞内引起系列级联反应,促进其迁移。本文介绍了成纤维细胞在发生发育和创面愈... 详细信息

在皮肤创伤愈合过程中,成纤维细胞通过增殖、迁移和分泌细胞外基质(extracellular matrix, ECM)参与修复。细胞外基质的物理特性能够被成纤维细胞感知并在细胞内引起系列级联反应,促进其迁移。本文介绍了成纤维细胞在发生发育和创面愈合过程中的异质性,以及其受机械力信号驱动迁移的可能机制,旨在为探索慢性伤口愈合机制和过度瘢痕形成机制提供理论基础。

关键词：成纤维细胞迁移皮肤创伤愈合机械力信号

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基于生物信息学分析胃癌双微体中增强子的调控机制

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遗传 2025年第05期 558-572页

作者：安梦婷郭冠麟吴杰孙文靖贾学渊哈尔滨医科大学基础医学院医学遗传学教研室中国遗传资源保护与疾病防控教育部重点实验室(哈尔滨医科大学)

胃癌(gastric cancer,GC)在全球范围内的发病率和死亡率均居高位。双微体(double minutes,DMs)是一种染色体外的环状染色体，常携带有癌基因或耐药基因，其与肿瘤发生及耐药性密切相关。为深入探索双微体在胃癌发展中的作用及调控机制... 详细信息

胃癌(gastric cancer,GC)在全球范围内的发病率和死亡率均居高位。双微体(double minutes,DMs)是一种染色体外的环状染色体，常携带有癌基因或耐药基因，其与肿瘤发生及耐药性密切相关。为深入探索双微体在胃癌发展中的作用及调控机制，本研究利用生物信息学方法通过分析CCLE细胞系数据库和TCGA实体瘤数据库中的基因组拷贝数变异数据，总结含双微体肿瘤样本的基因组特征，依此特征对胃癌样本进行分类。接着使用FANTOM5数据库、R包“GenomicRanges”、Bedtools工具以及MEME SUITE分析胃癌双微体上增强子及其调控的靶基因的功能。然后利用CIBERSORT包和GDSC药物数据库对TCGA中含和不含的胃癌样本进行免疫细胞浸润分析和耐药分析。研究显示，胃癌中的双微体基因组特征包括一类拷贝数超过10且长度≥50 kb的基因组片段。双微体增强子的调控作用影响了耐药性和肿瘤免疫，其中增强子-转录因子-靶基因的调控回路扰动也与肿瘤免疫相关。进一步分析发现，双微体增强子调控的靶基因不仅导致了免疫相关基因表达的改变，还使得胃癌样本对常见化疗药物展现出更强的不敏感性，并且耐药相关靶基因在含双微体的胃癌样本中高表达并与不良预后密切相关。综上所述，该项研究为含有双微体的胃癌个体治疗提供了新的见解。

关键词：双微体增强子胃癌肿瘤免疫肿瘤耐药性生物信息学

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