检索结果-内蒙古大学图书馆

经济林研究 2013年第4期31卷 9-15页

作者：乌云塔娜刘慧敏杜红岩中国林业科学研究院经济林研究开发中心河南郑州450003 国家林业局杜仲工程技术研究中心河南郑州450003 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学林学院湖南长沙410004

为深入了解杜仲MEP途径基因5′端非编码区的功能,在杜仲转录组和全基因组序列的基础上,利用生物信息学方法系统预测了MEP途径系列基因5′端非编码区顺式作用元件的结构和功能。生物信息学分析表明:EuDXS2基因5′端非编码区预测出共有22... 详细信息

为深入了解杜仲MEP途径基因5′端非编码区的功能,在杜仲转录组和全基因组序列的基础上,利用生物信息学方法系统预测了MEP途径系列基因5′端非编码区顺式作用元件的结构和功能。生物信息学分析表明:EuDXS2基因5′端非编码区预测出共有22种共220个顺式作用元件,其中包含启动子顺式元件145个TATA-box和39个CAAT-box的可能位点;EuDXR基因5′端非编码区预测出21种共127个顺式作用元件,68个TATAbox和32个CAAT-box;EuCMK基因5′端非编码区预测出24种共134个顺式作用元件,包含32个CAAT-box和68个TATA-box;EuMDS基因5′端非编码区共预测出30种共104个顺式作用元件,其中43个CAAT-box和23个TATA-box;EuHDS基因5′端非编码区预测出35种共126个顺式作用元件,包括29个CAAT-box和34个TATA-box;EuHDR基因5′端非编码区预测出24种共115个顺式作用元件,包含19个CAAT-box和67个TATA-box。

关键词：杜仲 MEP途径 5’端非编码区顺式作用元件

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分子技术及其在银杏遗传育种中的应用前景

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经济林研究 2002年第3期20卷 8-10页

作者：王义强谭晓风袁文钧中南林学院经济林栽培与育种国家林业局重点实验室湖南株洲412006 湖南省沅陵县林业局湖南沅陵419600

介绍了分子克隆技术的方法和分子标记的类型、特点 ,阐述了分子克隆技术和分子标记技术在银杏新品种培育、良种选择。

关键词：分子技术银杏遗传育种应用分子克隆

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常山胡柚果实的生长发育规律

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经济林研究 2005年第3期23卷 14-17页

作者：仲山民何照斌胡芳名浙江林学院工程学院浙江临安311300 浙江省常山县林业局浙江常山324200 中南林学院经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004

通过设立试验地,采用标准株法,对常山胡柚不同方位的果实进行了生长发育规律研究。结果表明,常山胡柚果实在生长发育过程中,其大小的变化规律是随着生长发育时间的延长而不断增长,其中有两个明显的增长快速期,分别处于7月的中上旬和9月... 详细信息

通过设立试验地,采用标准株法,对常山胡柚不同方位的果实进行了生长发育规律研究。结果表明,常山胡柚果实在生长发育过程中,其大小的变化规律是随着生长发育时间的延长而不断增长,其中有两个明显的增长快速期,分别处于7月的中上旬和9月的中上旬;其单果质量的变化规律也是随着生长发育时间的延长而不断增长,但是,它与果实大小的增长正好相错。果实纵径与横径的变化规律非常一致,只是横径的增长速度明显快于纵径的增长速度,进而引起果形指数总体呈下降趋势。不同方位的果实,在生长发育过程中的变化速度是不同的,经方差分析表明,果实的纵径与横径,在不同的方位之间、在不同的生长发育时期差异极显著;而果形指数、果实质量的变化,在不同方位之间差异不显著,但在不同的生长发育时期差异显著。

关键词：常山胡柚果实生长发育

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杜仲果实和叶片转录组数据组装及基因功能注释

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中南林业科技大学学报 2012年第11期32卷 122-130页

作者：李铁柱杜红岩刘慧敏乌云塔娜王淋叶生晶中南林业科技大学生命科学与技术学院湖南长沙410004 中国林业科学研究院经济林研究开发中心河南郑州450003 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学林学院湖南长沙410004

所构建的杜仲果实和叶片转录组数据库获得了54 471 338条reads数据,包含4 902 420 420nt数据信息,对reads进行拼接,获得了452 421条Contig,总长度为90 705 736 nt;对contig进行拼接后,获得了147 027条Scaffold,总长度为65 877 052 nt;同... 详细信息

所构建的杜仲果实和叶片转录组数据库获得了54 471 338条reads数据,包含4 902 420 420nt数据信息,对reads进行拼接,获得了452 421条Contig,总长度为90 705 736 nt;对contig进行拼接后,获得了147 027条Scaffold,总长度为65 877 052 nt;同理,对Scaffold进一步拼接后,获得了49 610条Unigene,总长度为37616 729 nt;Unigene和COG数据库进行比对表明,杜仲果实和叶片转录组中的Unigene根据功能大致可分为25类;杜仲果实和叶片转录组中的Unigene根据GO功能可分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类42分支;以KEGG数据库为参考,依据代谢通路可以将转录组中的数据分成125类,包括脂类代谢,DNA剪切,植物激素生物合成,苯丙氨酸生物合成,萜类化合物与类固醇类化合物合成等。

关键词：杜仲果实叶片转录组基因功能

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杜仲幼果和成熟果实转录组数据组装及基因功能注释

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中南林业科技大学学报 2012年第10期32卷 9-17页

对杜仲幼果和成熟果实进行测序后,共获得了53 080 588个reads片段,包含了4 777 252 920个核苷酸序列信息,对reads进行拼接,共获得了921 902个Contig片段,序列信息达到了129 461 462 nt;在Contig数据的基础上,进一步采用over-lap的方法... 详细信息

对杜仲幼果和成熟果实进行测序后,共获得了53 080 588个reads片段,包含了4 777 252 920个核苷酸序列信息,对reads进行拼接,共获得了921 902个Contig片段,序列信息达到了129 461 462 nt;在Contig数据的基础上,进一步采用over-lap的方法进行拼接,共获得了190 518个Scaffold片段,序列信息达到了67 868 367 nt;在Scaffold数据的基础上,进一步拼接,数据共获得了64 474个Unigene片段,序列信息达到了39 120 703 nt;Unigene和COG数据库进行比对表明,杜仲幼果和成熟果实转录组中的Unigene根据功能大致可分为25类;Unigene根据GO功能大致可分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类44分支;利用KEGG数据库作为参考,依据代谢通路可以将转录组中的数据分成119类,包括生化代谢通路、植物—真菌互作、DNA剪切、植物激素生物合成、苯丙氨酸生物合成、萜类化合物与类固醇类化合物合成、脂类代谢、RNA降解等。

关键词：杜仲幼果成熟果实转录组基因功能

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7个杏李品种花粉SFB基因的克隆鉴定

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中南林业科技大学学报 2010年第12期30卷 1-5页

作者：李芳东乌云塔娜杜红岩李洪果杨绍彬北京林业大学北京100083 中国林业科学研究院经济林研究开发中心河南郑州450009 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学林学院湖南长沙410004

以美国杏李品种为试验材料,利用Prunus的SFB基因特异性引物,对7个杏李品种进行PCR扩增,并进行克隆、测序。采用生物信息学分析方法分离鉴定了‘恐龙蛋’等7个杏李品种的花粉SFB基因。PCR结果显示,‘风味皇后’、‘味帝’、‘味王’、‘... 详细信息

以美国杏李品种为试验材料,利用Prunus的SFB基因特异性引物,对7个杏李品种进行PCR扩增,并进行克隆、测序。采用生物信息学分析方法分离鉴定了‘恐龙蛋’等7个杏李品种的花粉SFB基因。PCR结果显示,‘风味皇后’、‘味帝’、‘味王’、‘风味玫瑰’、‘味厚’、‘味馨’、‘恐龙蛋’等7个品种均扩增出一条460 bp左右的片段;对PCR产物回收克隆后测序,并通过BLAST比对和生物信息学分析表明,‘风味皇后’、‘味王’、‘风味玫瑰’、‘味厚’、‘味帝’、‘恐龙蛋’等6个品种中克隆到了一个SFBh基因;‘风味皇后’、‘味王’、‘风味玫瑰’、‘味厚’、‘味馨’等5个品种中克隆到了一个SFBe基因;‘味帝’和‘恐龙蛋’中分离克隆了SFBb基因;‘味馨’中分离克隆了一个SFB2基因;故7个杏李品种的花粉SFB基因型鉴定为:‘风味皇后’、‘味王’、‘风味玫瑰’和‘味厚’等4个品种的花粉SFB基因型相同,为SFBeSFBh;‘味帝’和‘恐龙蛋’的花粉SFB基因型相同,为SFBbSFBh;味馨’的花粉SFB基因型为SFBeSFB2。

关键词：杏李自交不亲和性 F-Box SFB基因

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中国梨醇-酰基转移酶(AAT)基因的克隆及遗传多态性

中国梨醇-酰基转移酶(AAT)基因的克隆及遗传多态性

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第六届全国梨科研、生产与产业化论坛会

作者：乌云塔娜康秀马腾中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室中南林业科技大学林学院

以10个中国梨品种为试验材料,对基因组DNA进行AT基因的特异性PCR扩增、克隆、DNA序列测定,利用生物信息学分析方法研究了中国梨AAT基因的遗传多态性。结果表明,浓香、微香、无香梨品种中均存在AAT基因,不同梨品种中克隆到约2100bp大小的... 详细信息

以10个中国梨品种为试验材料,对基因组DNA进行AT基因的特异性PCR扩增、克隆、DNA序列测定,利用生物信息学分析方法研究了中国梨AAT基因的遗传多态性。结果表明,浓香、微香、无香梨品种中均存在AAT基因,不同梨品种中克隆到约2100bp大小的1～5条AT基因。其中外显子部分存在1个HXXXD活性区和1个高变区,内含子中至少存在8处长度缺失和突变。基因结构分析表明,这些AAT基因同属于家族clo3601的转移酶基因家族pfamn02548,而且基因家族中不同基因的活性及表达程度可能不同,直接导致梨的香气程度的不同。

关键词：梨 AAT基因多态性

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中国梨S-RNase基因启动子的TAIL-PCR克隆及功能预测

中国梨S-RNase基因启动子的TAIL-PCR克隆及功能预测

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第六届全国梨科研、生产与产业化论坛会

作者：乌云塔娜刘学英中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室中南林业科技大学林学院

根据梨S-RNase基因的5′端保守序列设计3个反向特异引物,以中国砂梨（Pyrus pyrifolia）品种金花、懋功及白梨（Pyrus Brestchneideri）品种鸭梨基因组DNA为模板,TAIL-PCR分别扩增出长度为854bp、1448bp和1137bp的S13-RNase、S12-RNase、S21-RNase基因启动子序列;利用PLACE和PlantCARE软件对其进行顺式调控元件预测发现,该启动子具有典型的TATAbox和CAAT box,并位于转录起始位点的上游-33～-27bp及-78～-75bp处;此外,在核心启动子上游还存在光应答调控元件（Box4,I-box,G-box）、脱落酸应答元件ABRE、真菌诱导子应答元件Box-W1、赤霉素应答元件P-box、水杨酸应答元件TCA-element以及参与胚乳表达元件GCN4otif等,由此可知该启动子可能受光照、脱落酸、真菌、赤霉素、水杨酸等多种条件的共同调节。Clustal X对S13-RNase、S12-RNase、S21-RNase基因启动子序列与日本梨S2-RNase、S3-RNase、S4-RNase、S5-RNase基因进行序列比对,发现S-RNase启动子TATA盒上游存在-约200bp的同源区域,且这一区域内可能存在雌蕊特异表达顺式作用元件。MEG4.0构建系统发育树表明梨属和苹果属S-RNase等位基因多态性可能在亚科的分化之前就已形成。

关键词： TAIL-PCR 梨S-RNase基因启动子功能

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油桐种子EST文库构建及主要表达基因的分析

油桐种子EST文库构建及主要表达基因的分析

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第二届中国林业学术大会——S9 木本粮油产业化

作者：谭晓风谢禄山张琳中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室中南林业科技大学林学院

油桐是中国的高品质工业油料树种,种子含油率52%-64%,桐油是一种优良的干性植物油,其主要成分是一种共轭三烯酸即桐酸(9,11,13-十八碳三烯酸),桐酸遇空气氧化成膜。为了研究与桐油合成相关的基因表达和分离基因,我们以发育中的对年桐种... 详细信息

油桐是中国的高品质工业油料树种,种子含油率52%-64%,桐油是一种优良的干性植物油,其主要成分是一种共轭三烯酸即桐酸(9,11,13-十八碳三烯酸),桐酸遇空气氧化成膜。为了研究与桐油合成相关的基因表达和分离基因,我们以发育中的对年桐种子为材料构建了cDNA文库,并随机挑取3107个克隆进行5'-端测序构建表达序列标签EST文库,并进一步应用生物信息学方法在NCBI数据库中与其他植物核酸非冗余数据进行同源性比对,结果表明有2205个cDNA与其他植物种的基因有高度同源性,有482种基因得到初步鉴定,另有342个克隆可能为目前功能尚未知的基因。EST文库的功能分类研究发现与油脂合成相关的基因有油酸脱饱和酶基因,ω-3脂肪酸脱饱和酶基因,3-酮脂酰辅酶A硫解酶基因,β-酮脂酰ACP合成酶Ⅰ基因,脂烯酰ACP还原酶基因,酯酶/脂肪酶/硫酯酶家族蛋白基因,多不饱和脂肪酸合成酶亚基B基因,烯酰CoA水合酶/异构酶家族蛋白基因等;此外有种子贮藏蛋白基因,钙油体蛋白基因,油体蛋白基因,豆球蛋白基因,清蛋白基因等;还有大量的核糖体RNA基因,花粉过敏源基因;许多EST序列与转移蛋白、基因表达、发育调控、抗性、生长物质及发育有关。有338个单一表达的序列涉及普通物质的生化代谢。基因种类的表达数量与趋势与油桐种子进入发育后期相一致。建立油桐种子EST文库并对桐油合成相关基因进行研究对发展工业用油具有重大意义。

关键词：油桐桐酸 cDNA文库 EST文库表达基因

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油桐种子EST文库构建及主要表达基因的分析

油桐种子EST文库构建及主要表达基因的分析

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第二届中国林业学术大会-S9 木本粮油产业化

作者：谭晓风谢禄山张琳中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室中南林业科技大学林学院

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