检索结果-内蒙古大学图书馆

基于泛基因组学和消减蛋白质组学技术筛选金黄色葡萄球菌新型抗菌靶点及其药物的分子对接分析

吉林大学学报（医学版） 2024年第4期50卷 970-977页

作者：谭锦莉黄丹廖婧阳朱刘冲刘文彬广东药科大学基础医学院病原生物学教研室广东广州510006 广东省生物活性药物研究重点实验室广东广州510006

目的:应用泛基因组学和消减蛋白质组学技术从金黄色葡萄球菌基因组中筛选新抗菌靶点,为抗金黄色葡萄球菌药物的研发奠定基础。方法:在美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库中以金黄色葡萄球菌为关键词检索全基因组测序数据,收集50个测... 详细信息

目的:应用泛基因组学和消减蛋白质组学技术从金黄色葡萄球菌基因组中筛选新抗菌靶点,为抗金黄色葡萄球菌药物的研发奠定基础。方法:在美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库中以金黄色葡萄球菌为关键词检索全基因组测序数据,收集50个测序级别为Complete的菌株基因组数据。采用BPGA工具对基因组数据进行泛基因组分析获得金黄色葡萄球菌核心基因,采用消减蛋白质组学技术从中筛选获得潜在抗菌靶点,以潜在抗菌靶点为受体,采用LibDock软件从美国食品药品监督管理局(FDA)批准的药物库中筛选潜在的抗金黄色葡萄球菌药物,并采用分子对接技术分析药物和靶点的结合能力。结果:50个金黄色葡萄球菌基因组中共有14379个基因家族,其中1620个为核心基因。消减蛋白质组学分析,酪氨酸自激酶1335为潜在的抗金黄色葡萄球菌靶点。采用LibDock软件筛选出巴龙霉素、替诺福韦二吡呋酯和阿德福韦等9个化合物可能针对该靶点蛋白发挥抗金黄色葡萄球菌作用,分子对接结果显示靶点与化合物结合力良好。结论:酪氨酸自激酶可能是一种抗金黄色葡萄球菌潜在的靶点。

关键词：金黄色葡萄菌泛基因组分子对接消减蛋白质组

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单碱基编辑技术在单基因遗传病治疗中的研究进展

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基因组学与应用生物学 2023年第3期42卷 242-253页

作者：解国涛晏贤春韩骅王逢会梁亮延安大学医学院延安716000 空军军医大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室西安710032

在目前已知的人类致病遗传变异中,点突变约占58%。近年来在成簇规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeat,CRISPR)/Cas系统上发展而来的单碱基编辑技术实现了碱基之间的转换或颠换。虽然到目... 详细信息

在目前已知的人类致病遗传变异中,点突变约占58%。近年来在成簇规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeat,CRISPR)/Cas系统上发展而来的单碱基编辑技术实现了碱基之间的转换或颠换。虽然到目前为止碱基编辑器还存在局限性,然而它为点突变导致的单基因遗传病的治疗带来了新曙光。本文主要阐述近年来单碱基编辑技术的前沿进展及其在单基因遗传病治疗中的研究进展,以期为相关领域的研究及其在未来的临床应用提供参考。

关键词：单基因遗传病基因治疗基因编辑单碱基编辑技术

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嵌合抗原受体巨噬细胞(CAR-M)疗法在炎症相关抑郁症治疗中的应用

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细胞与分子免疫学杂志 2024年第9期40卷 834-838页

作者：徐雨菲王涛空军军医大学基础医学院学员六大队陕西西安710032 空军军医大学基础医学院医学遗传学与发育生物学教研室陕西西安710032

经典的嵌合抗原受体巨噬细胞(CAR-M)发挥促炎作用实现抗肿瘤免疫,但是通过改造CAR的结构设计也可以使其有类似M2的抗炎功能,从而治疗炎症性疾病。目前靶向M1型小胶质细胞的CAR-M疗法能够有效减少神经炎症,用于治疗炎症相关抑郁症。随着... 详细信息

经典的嵌合抗原受体巨噬细胞(CAR-M)发挥促炎作用实现抗肿瘤免疫,但是通过改造CAR的结构设计也可以使其有类似M2的抗炎功能,从而治疗炎症性疾病。目前靶向M1型小胶质细胞的CAR-M疗法能够有效减少神经炎症,用于治疗炎症相关抑郁症。随着关于CAR-M抗炎作用的研究不断发展,CAR-M细胞疗法为治疗炎症相关疾病提供了新的思路。

关键词：嵌合抗原受体巨噬细胞(CAR-M) 抑郁症炎症治疗机制综述

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超级增强子在肝细胞癌中致癌机制和治疗靶点的研究进展

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生命科学 2025年

作者：孙璟琦欧斯尔旺姚明辉李梦佳新疆医科大学基础医学院生物学教研室新疆地方病分子生物学重点实验室

肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）是全球癌症相关死亡最普遍和最具破坏性的原因之一，由于其在诊断和治疗方面面临重大挑战，现已对全球健康构成重大威胁。超级增强子（Super-enhancers，SEs）是基因组非编码序列中主动触发... 详细信息

肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）是全球癌症相关死亡最普遍和最具破坏性的原因之一，由于其在诊断和治疗方面面临重大挑战，现已对全球健康构成重大威胁。超级增强子（Super-enhancers，SEs）是基因组非编码序列中主动触发转录的大型增强子簇，它们错综复杂的结构和在决定细胞身份以及促进肿瘤发生和进展方面的关键作用正日益受到关注。在HCC中，SEs已被确定为肿瘤发生和进展的关键参与者。然而，很少有研究系统地讨论SEs在HCC中的关键作用。因此，本文综述了SEs的结构特点、功能及其在HCC进展中的作用，并且分析了SEs靶向治疗的应用前景，以期为癌症治疗提供新的思路。

关键词：超级增强子肝细胞癌非编码RNA 致癌机制靶向抑制剂

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含Src同源2结构域蛋白酪氨酸磷酸酶2抑制剂在肿瘤靶向和免疫治疗中的应用进展

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中国新药杂志 2024年第15期33卷 1557-1563页

作者：石格格王昭维邱玥媛何磊李招招史佳欣赵博晨韩笑杜海琛张英起西北大学生命科学学院空军军医大学药学系生物制药学教研室空军军医大学基础医学院

由PTPN11基因编码的含Src同源2结构域蛋白酪氨酸磷酸酶2(Src homology 2 domain-containing protein tyrosine phosphatase, SHP2)是细胞关键调节因子蛋白酪氨酸磷酸酶(protein tyrosine phosphatase, PTP)家族的一员，在多种恶性肿瘤中高表达。一方面，SHP2通过介导RAS-MAPK,PI3K-AKT和JAK-STAT等信号通路调节肿瘤细胞的生理功能。另一方面，在肿瘤微环境中，SHP2与免疫抑制受体[如程序性死亡受体1(programmed death-1,PD-1)、细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4(cytotoxic T lymphocyte-associated antigen-4,CTLA-4)等]结合，调节免疫细胞的功能，造成免疫微环境的抑制性。因此，SHP2在肿瘤中具有调节肿瘤细胞和免疫微环境的双重功能，提示其为极具价值的肿瘤治疗靶点。近年来，大量具有成药潜力的SHP2抑制剂进入临床试验，为肿瘤靶向治疗提供新的可能。目前SHP2抑制剂的研究已经取得一定成果，但仍存在较多耐药性、非特异性和毒性等问题。因此，需进一步研究SHP2抑制剂的成药性和靶向策略。本文对SHP2参与信号通路的调控机制和其在肿瘤和免疫微环境中的作用进行总结，并对SHP2抑制剂及其临床研究进展进行综述。

关键词：含Src同源2结构域蛋白酪氨酸磷酸酶2 肿瘤信号通路肿瘤免疫微环境含Src同源2结构域蛋白酪氨酸磷酸酶2抑制剂

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环氧化物水解酶2在肝细胞癌中的表达水平与功能作用

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中国生物化学与分子生物学报 2022年第4期38卷 505-514页

作者：张文桃胡艳芬吴昊刘铭李莉杜根来朱剑军山西医科大学基础医学院医学细胞生物与遗传学教研室太原030001

本研究通过公共数据和实验数据,全面分析环氧化物水解酶2(epoxide hydrolase 2,EPHX2)在肝细胞癌中的表达情况、功能作用以及预后意义。利用GEO和MitoCarta数据集,筛选肝细胞癌中呈差异表达的线粒体相关基因;利用TCGA数据库分析EPHX2及... 详细信息

本研究通过公共数据和实验数据,全面分析环氧化物水解酶2(epoxide hydrolase 2,EPHX2)在肝细胞癌中的表达情况、功能作用以及预后意义。利用GEO和MitoCarta数据集,筛选肝细胞癌中呈差异表达的线粒体相关基因;利用TCGA数据库分析EPHX2及其相关基因在肝细胞癌中的表达水平;运行R包绘制Kaplan-Meier生存曲线和功能富集分析;基于STRING和GSEA构建蛋白质互作网络和基因集富集分析;荧光定量PCR和GEO数据集验证EPHX2在肝细胞癌中的表达水平。本研究共筛选得到15个在肝细胞癌中呈差异表达的线粒体相关基因。EPHX2在肝细胞癌组织中的表达水平显著降低(P<0.01)。EPHX2表达水平与肝癌患者性别、分期和级别有关,而与年龄、T分期等因素无关。与EPHX2低表达组肝癌患者相比,EPHX2高表达组肝癌患者预后较好。功能富集结果显示,EPHX2与补体途径、脂肪酸降解等信号通路有关。蛋白质互作网络结果显示,EPHX2与HAO1、AGXT、ACOX1、GSTκ1、SCP-2、CAT、CYP2C8,CYP2C9,CYP2B6,和CYP2J2等密切相关。GSEA结果显示,EPHX2低表达组与肝癌细胞增殖、肝癌复发等基因集正相关。荧光定量PCR和GEO数据集验证结果显示,EPHX2在肝细胞癌组织和肝癌细胞株中呈显著低表达。EPHX2在肝细胞癌中呈显著低表达,提示其可能在肝细胞癌发生发展过程中发挥抑癌基因作用,但具体作用机制还需进一步验证。

关键词：肝细胞癌环氧化物水解酶2 公共数据库

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小分子化合物在神经元重编程中的应用研究进展

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生理学报 2025年第1期77卷 181-193页

作者：戴子为刘红袁一旻张静宜秦尚尧苏志达海军军医大学基础医学院神经生物学教研室分子神经生物学教育部重点实验室海军军医大学麻醉系疼痛治疗学研究室

神经元重编程是将非神经元成体细胞转分化为神经元的一项创新性技术，能够补充、替代丢失或受损的神经元，为中枢神经系统再生修复提供了一种潜在的有效策略。在细胞内高表达转录因子是诱导神经元重编程一种常用的重要手段，但其重编程... 详细信息

神经元重编程是将非神经元成体细胞转分化为神经元的一项创新性技术，能够补充、替代丢失或受损的神经元，为中枢神经系统再生修复提供了一种潜在的有效策略。在细胞内高表达转录因子是诱导神经元重编程一种常用的重要手段，但其重编程效率比较低，且导入外源基因可能引起宿主基因组不稳定或诱发基因突变，从而限制了它们未来的临床转化应用。相对于转录因子，小分子化合物在神经元重编程领域具有得天独厚的优势，能够克服传统转录因子诱导神经元重编程的诸多局限性，具有更好的应用前景。本文就近年来小分子化合物介导的神经元重编程的相关研究进展及其在中枢神经系统再生修复中的应用进行简要综述。

关键词：小分子化合物神经元重编程中枢神经系统神经再生修复

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二氧化碳安乐死系统在《医学免疫学》实验教学中的应用及其效果评价

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中国免疫学杂志 2025年

作者：高翔刘媛娄静薛殷彤李燕郝洁王丽珺王子元马银超初明王月丹北京大学基础医学院免疫学系国家卫生健康委员会医学免疫学重点实验室(北京大学)北京大学生物医学实验教学中心云南大学医学院免疫教研室

实验教学是《医学免疫学》课程的重要组成部分，在实验教学中需要使用实验动物，并且需要医学生处死实验动物。通过应用二氧化碳安乐死系统，能够有效的降低实验动物的痛苦，保证其福利，符合伦理学的要求，还可以在提高《医学免疫学》... 详细信息

实验教学是《医学免疫学》课程的重要组成部分，在实验教学中需要使用实验动物，并且需要医学生处死实验动物。通过应用二氧化碳安乐死系统，能够有效的降低实验动物的痛苦，保证其福利，符合伦理学的要求，还可以在提高《医学免疫学》实验教学效率，减少环境污染的同时，促进医学生树立关注实验动物和尊重生命的科学的价值观和世界观，有利于成为未来的医疗服务人才。在《医学免疫学》实验教学中，恰当应用二氧化碳安乐死系统结合有效的课程思政建设，可以进一步贯彻党的立德树人的教育方针，为培养知识全面、技能高超、素质过硬的医学人才奠定良好的基础。

关键词：医学免疫学实验教学实验动物动物福利二氧化碳安乐死系统

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国产免疫检查点抑制剂与帕博利珠单抗治疗驱动基因阴性晚期非小细胞肺癌的疗效和安全性比较

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中华医学杂志 2024年第4期104卷 282-289页

作者：陈阳倩张聿达言欢秦浩越黄哲张星向思琦胡晓庆吴芳张永昌曾亮杨农南华大学衡阳医学院湖南省肿瘤医院研究生协作培养基地衡阳421001 吉首大学医学院生物化学与免疫学系医学研究中心吉首416000 中南大学湘雅公共卫生学院流行病与卫生统计系长沙410078 中南大学基础医学院病理学教研室肿瘤免疫学实验室长沙410017 湖南省肿瘤医院肺胃肠内科长沙410013

目的探讨国产免疫检查点抑制剂(ICI)与帕博利珠单抗治疗驱动基因阴性晚期非小细胞肺癌的疗效和安全性差异。方法回顾性分析2017年1月1日至2022年10月1日间在湖南省肿瘤医院就诊的1241例驱动基因阴性不可手术的ⅢB~Ⅳ期非小细胞肺癌患者... 详细信息

目的探讨国产免疫检查点抑制剂(ICI)与帕博利珠单抗治疗驱动基因阴性晚期非小细胞肺癌的疗效和安全性差异。方法回顾性分析2017年1月1日至2022年10月1日间在湖南省肿瘤医院就诊的1241例驱动基因阴性不可手术的ⅢB~Ⅳ期非小细胞肺癌患者资料,所有患者均接受免疫单药或免疫联合化疗治疗,1241例患者中,男1066例,女175例;年龄14~84岁,中位年龄62岁。67例患者接受国产ICI单药治疗,695例患者接受国产ICI联合化疗治疗;102例患者接受帕博利珠单药治疗,377例患者接受帕博利珠单抗联合化疗治疗。比较国产ICI和帕博利珠单抗单药或联合化疗的疗效和安全性。结果在ICI单药组中,使用国产ICI和帕博利珠单抗的客观缓解率(ORR)分别为43.3%(29/67)和44.1%(45/102),疾病控制率(DCR)分别为79.1%(53/67)和84.3%(86/102),差异均无统计学意义(均P>0.05)。在免疫联合化疗组中,使用国产ICI和帕博利珠单抗的ORR分别为60.9%(423/695)和62.9%(237/377),DCR分别为92.9%(646/695)和91.0%(343/377),差异均无统计学意义(均P>0.05)。在ICI单药组中,使用国产ICI和帕博利珠单抗的中位无进展生存时间(PFS)分别为9.0(95%CI:3.0~15.0)个月和7.4(95%CI:4.8~9.8)个月,差异无统计学意义(P=0.660);中位总生存时间(OS)分别为27.0(95%CI:25.0~29.0)个月和22.0(95%CI:17.1~26.9)个月,差异无统计学意义(P=0.673)。在免疫联合化疗组中,使用国产ICI和帕博利珠单抗的中位PFS分别为9.0(95%CI:8.2~9.8)和10.5(95%CI:9.0~12.0)个月,差异无统计学意义(P=0.186);中位OS分别为24.0(95%CI:19.1~28.9)和26.0(95%CI:21.3~30.7)个月,差异均无统计学意义(P=0.359)。国产ICI组和帕博利珠单抗组1~2级反应性皮肤毛细血管增生症的发生率分别为14.0%(107/762)和0,≥3级反应性皮肤毛细血管增生症的发生率分别为1.0%(7/762)和0,差异均有统计学意义(均P<0.05);其他不良反应发生率差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论国产ICI与帕博利珠单抗治疗驱动基因阴性晚期非小细胞肺癌的疗效相近;除国产ICI可能会出现特异性的毛细血管增生症外,其他不良反应发生率差异不大。

关键词：癌,非小细胞肺免疫检查点抑制剂帕博利珠单抗国产药治疗效果回顾性队列研究

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基于网络药理学及实验验证探讨甘草苷治疗帕金森病的作用机制

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世界科学技术-中医药现代化 2023年第5期25卷 1689-1701页

作者：曲欣妮李文标王利沈隽吉殷宇晴徐缘博何建成许言午上海中医药大学基础医学院生物化学教研室上海中医药大学基础医学院中医诊断教研室上海市健康辨识与评估重点实验室上海201203

目的应用网络药理学方法预测和分析甘草苷治疗帕金森病的作用机制,并选取凋亡信号通路进行细胞水平实验验证。方法从BATMAN-TCM、PharmMapper、SEA、SuperPred、SwissTargetPrediction等数据库获取甘草苷的作用靶点,从OMIM、GeneCards、... 详细信息

目的应用网络药理学方法预测和分析甘草苷治疗帕金森病的作用机制,并选取凋亡信号通路进行细胞水平实验验证。方法从BATMAN-TCM、PharmMapper、SEA、SuperPred、SwissTargetPrediction等数据库获取甘草苷的作用靶点,从OMIM、GeneCards、CTD等数据库获取帕金森病相关基因。将甘草苷的预测靶点和帕金森病相关基因取交集,通过Cytoscape软件利用交集靶点构建“药物-靶点-疾病”网络并进行可视化;运用Cytoscape软件的BisoGenet插件对交集靶点构建PPI网络,通过CytoNCA插件进行拓扑学计算并经度中心性(Degree centrality,DC)和中介中心性(Between centrality,BC)两步筛选获得核心PPI网络;采用R软件运行Bioconductor程序包进行GO和KEGG富集分析;运用Cytoscape软件构建“基因-通路”网络,筛选出网络的关键靶点,并将其与甘草苷进行分子对接;采用Western blot方法验证甘草苷对6-羟基多巴胺(6-hydroxydopamine,6-OHDA)诱导的SH-SY5Y细胞Caspase-3、Bax、Bcl-2、p-PI3K和p-AKT等凋亡通路关键蛋白表达与活化的调控作用。结果共获得甘草苷靶点343个,帕金森病相关基因1328个,二者交集靶点为46个;经拓扑学分析获得核心PPI网络,包含108个节点和2298条边;GO功能分析得到的1543个条目主要与凋亡调控、细胞周期与节律、DNA合成及分解代谢有关;凋亡、PI3K-AKT、NF-κB、TGF-β、HIF-1、FoxO等97条KEGG信号通路被显著富集;“基因-通路”中筛选的关键蛋白及分子对接结果显示TP53、AKT1及RELA可能是甘草苷治疗帕金森病的关键靶点;Western blot结果显示,与6-OHDA组相比,给与甘草苷处理后Bax和Cleaved-Caspase-3的表达水平明显减少(P<0.05),Bcl-2的表达水平显著增加(P<0.01);p-PI3K和p-AKT磷酸化水平明显增多(P<0.01)。结论网络药理学分析提示甘草苷可通过调控多种生物学过程和相关信号途径治疗帕金森病;细胞水平实验证明了甘草苷对6-OHDA损伤神经细胞的保护作用,并初步证实了其对凋亡信号通路的调控作用,为进一步阐明甘草苷治疗帕金森病的分子机制奠定了基础。

关键词：网络药理学甘草苷帕金森病机制凋亡

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