检索结果-内蒙古大学图书馆

安徽医科大学学报 2025年第2期60卷 255-265页

作者：丁瑞培刘承忠史灿灿张慧玉代宜萍穆如雪李子龙何茂章李卓君安徽医科大学第一临床医学院合肥230032 安徽医科大学基础医学院微生物学教研室合肥230032 南昌大学抚州医学院基础医学部抚州344000

目的分析由健康人粪便中新分离出的一株动物双歧杆菌B4株的全基因组信息,并探究其益生特性。方法采用体外实验方法对动物双歧杆菌B4的耐药性、溶血性、耐胃酸特性以及生化特性进行评估,并利用二代+三代测序技术对该菌进行全基因组测序... 详细信息

目的分析由健康人粪便中新分离出的一株动物双歧杆菌B4株的全基因组信息,并探究其益生特性。方法采用体外实验方法对动物双歧杆菌B4的耐药性、溶血性、耐胃酸特性以及生化特性进行评估,并利用二代+三代测序技术对该菌进行全基因组测序以及基因功能注释。结果经全基因组测序后显示该动物双歧杆菌B4株基因组大小为1944146 bp,GC含量为60.49%,不含质粒,总基因数为1642个。体外实验分析结果显示,该动物双歧杆菌B4株具有良好的益生特性,包括非溶血性和耐胃酸的特性。同时基因组结果显示,该动物双歧杆菌B4株不具有毒素、致病相关基因,耐药基因少且传播能力不高,具有很高的安全性。通过KEGG、COG、GO等基因注释显示其含有很多生物活性酶,如β-半乳糖苷酶、L-乳酸脱氢酶等益生基因。结论该动物双歧杆菌B4株具有良好的益生特性,在基因层面上展示了优良的安全性,具有益生特性的基因序列。

关键词：动物双歧杆菌分离培养全基因组测序基因组分析益生菌益生基因

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一株人源性高效尿酸降解菌M2a的分离鉴定、全基因组测序及功能分析

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微生物学通报 2025年第3期52卷 1309-1322页

作者：迪力努尔·艾克帕贺怡田婷婷梁美婷陈邬锦陈晓瑜朱语秋杜满茜孙玉萍新疆医科大学基础医学院新疆乌鲁木齐830000 新疆第二医学院基础医学部新疆克拉玛依834000 新疆医科大学第五附属医院检验科新疆乌鲁木齐830000 新疆医科大学基础医学院医学微生物学教研室新疆乌鲁木齐830000 新疆医科大学新疆地方病分子生物学重点实验室新疆乌鲁木齐830000

【背景】高尿酸血症是一种尿酸生成与排泄失衡所导致的嘌呤代谢紊乱疾病,而肠道微生物在嘌呤代谢中发挥重要作用,其中1/3的尿酸通过肠道菌群分解,所以肠道益生菌能够有效降低体内尿酸水平,缓解高尿酸血症。【目的】获得人源性尿酸降解菌... 详细信息

【背景】高尿酸血症是一种尿酸生成与排泄失衡所导致的嘌呤代谢紊乱疾病,而肠道微生物在嘌呤代谢中发挥重要作用,其中1/3的尿酸通过肠道菌群分解,所以肠道益生菌能够有效降低体内尿酸水平,缓解高尿酸血症。【目的】获得人源性尿酸降解菌,并了解其与尿酸降解有关的基因及功能。【方法】通过体外尿酸强化培养和驯化,从正常低尿酸健康人群肠道粪便中获得具备尿酸降解能力的菌株,对其进行一般形态学观察、生化试验、16S rRNA基因序列测定,以及生物信息学分析和鉴定,并进行全基因组测序和功能基因挖掘。【结果】分离出一株具有较高尿酸降解功能的革兰氏阳性杆菌M2a,尿酸降解率达到82.73%,经鉴定为类干酪乳酪杆菌(Lacticaseibacillus paracasei),全基因组测序发现菌株M2a具有9个与尿酸降解相关的基因。【结论】菌株M2a具有高效降解尿酸的能力,为开发和利用微生物制剂进行尿酸治疗提供了科学依据和菌种资源。

关键词：类干酪乳酪杆菌菌株鉴定全基因组测序尿酸降解功能分析

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食管腺样囊性癌67例临床病理特征及预后

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郑州大学学报(医学版) 2025年第1期60卷 24-27页

作者：孙慧宋昕赵若华蒋宁宁朱佳仪丁倩倩赵学科范宗民李爱丽张冬云马磊裘一兵纪爱芳王立东郑州大学第一附属医院河南省食管癌重点开放实验室代谢紊乱与食管癌防治全国重点实验室郑州450052 郑州大学医学科学院郑州450052 林州市肿瘤医院肿瘤科河南林州456550 南阳医学高等专科学校基础医学部病理教研室河南南阳473000 南阳市第一人民医院河南省肿瘤分子生物学医学重点实验室河南南阳473000 郑州大学河南省医药科学研究院郑州450052 长治医学院附属和平医院检验科山西长治046000

目的:探讨食管腺样囊性癌(EACC)的临床病理特征及预后。方法:选择郑州大学第一附属医院河南省食管癌重点开放实验室70万例食管癌患者临床病理和随访(1973至今)大资料库中2001年10月至2023年6月确诊的67例EACC患者,其中男51例,女16例,发... 详细信息

目的:探讨食管腺样囊性癌(EACC)的临床病理特征及预后。方法:选择郑州大学第一附属医院河南省食管癌重点开放实验室70万例食管癌患者临床病理和随访(1973至今)大资料库中2001年10月至2023年6月确诊的67例EACC患者,其中男51例,女16例,发病年龄52~81岁。采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线并行Log-rank检验。采用Cox回归分析EACC预后的影响因素。结果:无淋巴结转移患者的生存状况好于有淋巴结转移者(P<0.05)。有淋巴结转移[HR(95%CI)为3.875(1.607~9.342)]是EACC预后的危险因素。结论:淋巴结转移是EACC预后的影响因素。

关键词：食管腺样囊性癌临床病理特征预后

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Runx2在白藜芦醇诱导的小鼠BMSCs中的表达及生物信息学分析

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中国生物化学与分子生物学报 2019年第9期35卷 1006-1012页

作者：黄燕霍静裴晋红栗学清汪军梅宋丽华长治医学院基础医学部生物化学教研室山西长治046000 长治医学院基础医学部生物教研室山西长治046000 长治医学院药学系山西长治046000

为探讨成骨分化的主要调节因子Runt相关转录因子2(Runt-related transcription factor 2,Runx2)在白藜芦醇(resveratrol,RSVL)诱导小鼠骨髓间充质干细胞(bone marrow mesenchymal stem cell,BMSCs)向成骨细胞分化中的作用,以及以Runx2为研究起点,通过生物信息学分析方法以表明白藜芦醇诱导BMSCs向成骨分化的可能机制。本研究用不同浓度的RSVL(10-9mol/L-10-7mol/L)作用小鼠骨髓间充质干细胞8 d。实时逆转录-聚合酶链反应及Western印记法检测Runx2的mRNA和蛋白质表达水平。生物信息学方法分析及预测鼠Runx2蛋白的性质及特征。结果表明,与对照组相比,10-9mol/L、10-8mol/L、10-7mol/L白藜芦醇诱导Runx2的mRNA表达水平分别增加6%(P> 0. 05)、30%(P<0. 01)、49%(P<0. 01);与对照组相比,10-9mol/L、10-8mol/L、10-7mol/L白藜芦醇诱导Runx2蛋白表达水平分别增加12%(P> 0. 05)、72%(P <0. 01)、94%(P <0. 01)。由此可见,白藜芦醇可显著上调BMSCs中Runx2的mRNA和蛋白质表达水平(P<0. 01),且10-7mol/L的白藜芦醇诱导作用最强。生物信息学预测得知,Runx2属于碱性不稳定蛋白质;二级结构中无规卷曲占主导;存在102个潜在的磷酸化位点、97个潜在O-糖基化位点和8个N-糖基化位点;Runx2具有利于蛋白质间相互作用的结构特点;P1启动子区潜在的转录因子结合位点共28处。疏松的结构特征、丰富的修饰位点及多种转录因子结合位点为探讨白藜芦醇诱导BMSCs的分子机制提供参考。

关键词： Runt相关转录因子2 白藜芦醇骨髓间充质干细胞成骨分化

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食管黏液表皮样癌86例临床病理特征及预后

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郑州大学学报(医学版) 2025年第1期60卷 21-24页

作者：赵若华宋昕赵学科秦富强李爱丽王献增王五洲郭威李吉林马磊徐全晓孙慧蒋宁宁丁倩倩朱佳仪李秀敏鲍启德库建伟张冬云纪爱芳王立东郑州大学第一附属医院河南省食管癌重点开放实验室代谢紊乱与食管癌防治全国重点实验室郑州450052 郑州大学医学科学院郑州450052 林州市肿瘤医院眼科河南林州456550 林州市肿瘤医院肿瘤科河南林州456550 林州市人民医院胸外科河南林州456550 林州市人民医院神经内科河南林州456550 林州市人民医院病理科河南林州456550 南阳市第一人民医院河南省肿瘤分子生物学医学重点实验室河南南阳473000 新乡医学院新乡市肿瘤分子治疗重点实验室河南新乡453003 安阳地区医院肿瘤内科河南安阳455000 南阳医学高等专科学校第一附属医院肿瘤科河南南阳473003 南阳医学高等专科学校基础医学部病理教研室河南南阳473000 长治医学院附属和平医院检验科山西长治046000

目的:探讨食管黏液表皮样癌(EMEC)患者的临床病理特征及预后。方法:选择郑州大学第一附属医院河南省食管癌重点开放实验室70万例食管癌患者临床病理和随访(1973至今)大资料库中2001年1月至2020年12月确诊的86例原发性EMEC患者,男60例,... 详细信息

目的:探讨食管黏液表皮样癌(EMEC)患者的临床病理特征及预后。方法:选择郑州大学第一附属医院河南省食管癌重点开放实验室70万例食管癌患者临床病理和随访(1973至今)大资料库中2001年1月至2020年12月确诊的86例原发性EMEC患者,男60例,女26例,年龄44~78岁。采用Kaplan-Meier法生存曲线并行Log-rank检验;采用Cox回归分析EMEC预后的影响因素。结果:有、无淋巴结转移患者,年龄≥65岁和<65岁患者生存曲线的差异均有统计学意义(P<0.05)。Cox回归结果显示年龄≥65岁[HR(95%CI)为2.357(1.300~4.274)]和有淋巴结转移[HR(95%CI)为2.262(1.275~4.012)]是EMEC患者预后的危险因素。结论:年龄和淋巴结转移是EMEC预后的影响因素。

关键词：食管黏液表皮样癌临床病理特征预后

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长治移民与非移民血浆叶酸及代谢相关基因多态性比较

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中国公共卫生 2018年第9期34卷 1270-1273页

作者：崔国艳杨建洲陈云霞崔宇竹长治医学院基础医学部微生物教研室山西046000 长治医学院公共卫生与预防教研室

目的探讨山西省长治市移民与非移民人群血浆叶酸含量、亚甲基叶酸还原酶MTHFRC677T和甲硫氨酸合成酶MSA2756G位点多态性分布特点,为进一步研究其与疾病的相关性提供依据。方法于2014年5月—2015年6月采用酶联免疫吸附试验(ELISA)对80名... 详细信息

目的探讨山西省长治市移民与非移民人群血浆叶酸含量、亚甲基叶酸还原酶MTHFRC677T和甲硫氨酸合成酶MSA2756G位点多态性分布特点,为进一步研究其与疾病的相关性提供依据。方法于2014年5月—2015年6月采用酶联免疫吸附试验(ELISA)对80名长治林州移民和108名长治本地健康人群测定血浆中叶酸含量。同时采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术(PCR-RFLP)分析长治市人群MTHFR677位点和MS2756位点基因多态性。结果移民组与非移民组人群叶酸含量差异有统计学意义(P=0.006)。移民组内不同性别、年龄和是否饮酒的人群之间叶酸水平差异有统计学意义(P<0.05);非移民组组内不同血型的人群间差异有统计学意义(P<0.05)。2组组间比较结果表明:女性、>60岁、体质指数(BMI)<18.5 kg/m2、不吸烟和不饮酒的人群叶酸水平差异有统计学意义,MTHFR、MS的基因型和等位基因频率比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论在不同特征的长治移民与非移民人群中血浆叶酸含量不同,2组人群MTHFR和MS基因多态性分布存在明显差异。

关键词：移民与非移民叶酸亚甲基四氢叶酸还原酶甲硫氨酸合成酶基因多态性

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食管单纯腺癌和腺鳞癌的临床病理特征及预后

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郑州大学学报(医学版) 2025年第1期60卷 8-12页

作者：蒋宁宁钟侃宋昕赵学科魏梦霞王苒韩雪娜丁倩倩孙慧赵若华朱佳仪张占阳秦富强李爱丽王献增王五洲郭威李吉林马磊徐全晓罗宏杨声坤谢伟李秀敏鲍启德库建伟张冬云纪爱芳王立东郑州大学第一附属医院河南省食管癌重点开放实验室代谢紊乱与食管癌防治全国重点实验室郑州450052 郑州大学医学科学院郑州450052 林州市肿瘤医院眼科河南林州456550 林州市肿瘤医院肿瘤科河南林州456550 林州市人民医院胸外科河南林州456550 林州市人民医院神经内科河南林州456550 林州市人民医院病理科河南林州456550 南阳市第一人民医院河南省肿瘤分子生物学医学重点实验室河南南阳473000 光山县人民医院普外科河南光山465499 光山县人民医院肿瘤科河南光山465499 光山县人民医院重症医学科河南光山465499 新乡医学院新乡市肿瘤分子治疗重点实验室河南新乡453003 安阳地区医院肿瘤内科河南安阳455000 南阳医学高等专科学校第一附属医院肿瘤科河南南阳473003 南阳医学高等专科学校基础医学部病理教研室河南南阳473000 长治医学院附属和平医院检验科山西长治046000

目的:探讨食管单纯腺癌和食管腺鳞癌的临床病理特征及预后。方法:从郑州大学第一附属医院河南省食管癌重点开放实验室70万例食管癌患者临床病理和随访(1973年至今)大资料库中选取5 282例食管单纯腺癌、1 988例食管腺鳞癌患者的临床病理... 详细信息

目的:探讨食管单纯腺癌和食管腺鳞癌的临床病理特征及预后。方法:从郑州大学第一附属医院河南省食管癌重点开放实验室70万例食管癌患者临床病理和随访(1973年至今)大资料库中选取5 282例食管单纯腺癌、1 988例食管腺鳞癌患者的临床病理资料。Kaplan-Meier法绘制两组的生存曲线并行Log-rank检验。采用Cox回归分析食管单纯腺癌和腺鳞癌预后的影响因素。结果:食管单纯腺癌中男性,年龄≥60岁,常住地为食管癌低发区,无肿瘤家族史,肿瘤中高分化,肿瘤位于胸下段,有淋巴结转移,TNM分期Ⅲ、Ⅳ期的占比高于食管腺鳞癌(P<0.05)。食管单纯腺癌与腺鳞癌生存曲线的差异有统计学意义(P=0.048)。男性,年龄≥60岁,TNM分期Ⅲ、Ⅳ期,手术切缘不净是食管单纯腺癌和腺鳞癌预后的危险因素[HR(95%CI)分别为1.168(1.021~1.336)、1.462(1.297~1.647)、1.605(1.432~1.799)、1.427(1.136~1.793)]和[1.187(1.033~1.364)、1.416(1.241~1.661)、1.333(1.170~1.518)、1.311(1.009~1.703)]。结论:性别、年龄、TNM分期、手术切缘情况是食管单纯腺癌和腺鳞癌预后的影响因素。

关键词：食管单纯腺癌食管腺鳞癌临床病理特征预后

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人DMP1结构及功能的生物信息学分析

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中国骨质疏松杂志 2019年第9期25卷 1263-1268页

作者：黄燕裴晋红李钰娜栗学清武翠玲郑军王博宋丽华长治医学院基础医学部生物化学教研室山西长治046000 长治医学院药学系山西长治046000 不详

目的预测分析人DMP1的结构与功能,为进一步探讨DMP1作用机制提供借鉴。方法生物信息学方法分析DMP1蛋白的理化性质、亚细胞定位、跨膜区和信号肽、二级结构、三级结构,潜在磷酸化及糖基化位点、蛋白相互作用网络、5’非翻译区潜在转录... 详细信息

目的预测分析人DMP1的结构与功能,为进一步探讨DMP1作用机制提供借鉴。方法生物信息学方法分析DMP1蛋白的理化性质、亚细胞定位、跨膜区和信号肽、二级结构、三级结构,潜在磷酸化及糖基化位点、蛋白相互作用网络、5’非翻译区潜在转录因子结合位点和DMP1分子的进化保守性等指标。结果人DMP1蛋白是酸性亲水蛋白;信号肽切割位点位于第16与17位氨基酸之间,无跨膜区;主要二级结构形式为无规卷曲;磷酸化位点123个,O-糖基化位点118个、N-糖基化位点8个;DMP1具有利于蛋白间相互作用的结构特点,5’非翻译区存在多种转录因子潜在结合位点,人体各类组织均有表达,且具有在多种亚细胞结构中定位的特征。结论疏松的结构特征、表达的广泛性、丰富的修饰位点及多种转录因子结合位点均提示DMP1具有更为复杂的生物学功能。

关键词： DMP1 生物信息学结构功能

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肠道菌群、GRP78、TLR4在大鼠肝硬化发生发展中的作用

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中国临床解剖学杂志 2019年第3期37卷 254-260页

作者：陈云霞张慧英杨泽溪来丽娜孟莉李旭炯长治医学院微生物学教研室山西长治046000 长治医学院病理生理学教研室山西长治046000 长治医学院基础医学部山西长治046000 长治医学院药理学教研室山西长治046000 长治医学院生理学教研室山西长治046000

目的探讨肠道菌群、肠组织中内质网应激蛋白GRP78(glucose-regulated protein 78)、模式识别受体TLR4(toll-like receptors 4)表达水平的改变在大鼠肝硬化发生发展中的作用。方法采用复合致病因素法诱导大鼠肝硬化。HE染色观察肝与小肠... 详细信息

目的探讨肠道菌群、肠组织中内质网应激蛋白GRP78(glucose-regulated protein 78)、模式识别受体TLR4(toll-like receptors 4)表达水平的改变在大鼠肝硬化发生发展中的作用。方法采用复合致病因素法诱导大鼠肝硬化。HE染色观察肝与小肠病理学改变,ARISA(automated ribosomal intergenic-spacer analysis)分析回肠内容物肠道菌群组成,培养法检测各组动物细菌易位情况,ELISA(enzyme-linked immunosorbent assay)测定血浆生化指标,quantitative real-time PCR、Western blotting检测肝、肠组织GRP78、TLR4的表达。结果肝硬化模型动物肝、肠组织病理学改变明显。随着肝硬化的进展,模型动物血浆中ALT(alanine aminotransferase)、内毒素和Hcy(homocysteine)的水平逐渐增高。模型组与对照组间肠道菌群的组间相似性明显降低。模型组发生细菌易位的大鼠数量、易位率显著升高。模型组动物肝、肠组织中GRP78的表达水平均随病程进展显著升高;肝组织中TLR4的表达水平在6周之前随病程进展显著升高,8周仍明显高于正常动物,但低于6周时的表达水平;肠组织中TLR4的表达水平在6周之前随病程进展显著升高,8周则明显降低。结论肠道微生物群落结构的生态失调、应激水平升高、免疫功能下降,导致肠道细菌易位,加重肝损伤,促进肝硬化形成。

关键词：肝硬化肠道菌群细菌易位 GRP78 TLR4

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Rheinheimera ***胞外角蛋白酶KerQH2的生物信息学分析

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食品工业科技 2022年第9期43卷 125-130页

作者：栗学清庞鑫高慧芳张廉芸宋英达武翠玲长治医学院基础医学部生物化学与分子生物学教研室山西长治046000 长治医学院精神卫生系山西长治046000 长治医学院临床医学系山西长治046000

目的:预测海洋菌Rheinheimera ***分泌的角蛋白酶KerQH2的结构特征及与底物的互作位点,为深入研究KerQH2对角蛋白底物的降解机理提供理论依据。方法:应用生物信息学技术对KerQH2的结构特征、作用于角蛋白底物的可能位点及关键氨基酸等... 详细信息

目的:预测海洋菌Rheinheimera ***分泌的角蛋白酶KerQH2的结构特征及与底物的互作位点,为深入研究KerQH2对角蛋白底物的降解机理提供理论依据。方法:应用生物信息学技术对KerQH2的结构特征、作用于角蛋白底物的可能位点及关键氨基酸等进行分析。结果:KerQH2为S8家族丝氨酸蛋白酶,其分子表面无规则卷曲占比较高,α-螺旋与β-折叠占比较低且多位于酶分子内部。KerQH2具有保守的催化三联体(Asp8、His41和Ser197),催化三联体区域表面静电势为中性。KerQH2催化结构域中含有大量保守的极性氨基酸及芳香族氨基酸,与底物结合有关的序列富含Gly和Ala。KerQH2主要切割疏水性氨基酸Val(V)/ILe(I)和极性氨基酸Cys(C)/Gln(Q)之间形成的肽键。结论:角蛋白酶KerQH2的特殊结构有助于其降解结构复杂角蛋白分子,这可能是海洋菌对海洋寡营养环境的一种适应性。

关键词：角蛋白酶 KerQH2 海洋菌 Rheinheimera sp. 生物信息学

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