目的通过表观遗传组学技术,解析胃印戒细胞癌(signet-ring cell carcinoma of the stomach,SRCC)的H3K27me3沉默子的全基因组特征及其对基因转录的调控作用,以阐明SRCC恶性进展的表观调控机制。方法采集2021年1月至2023年12月陆军特色...
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目的通过表观遗传组学技术,解析胃印戒细胞癌(signet-ring cell carcinoma of the stomach,SRCC)的H3K27me3沉默子的全基因组特征及其对基因转录的调控作用,以阐明SRCC恶性进展的表观调控机制。方法采集2021年1月至2023年12月陆军特色医学中心消化内科35例胃镜样本(正常胃窦/胃体15例,SRCC 20例)。采用以下多组学分析:染色质可及性测序(assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing,ATAC-seq)检测染色质开放区域;染色质靶向捕获测序(cleavage under targets and tagmentation,CUT&Tag)捕获H3K27me3沉默子区域;转录组测序(transcriptome sequencing,RNA-seq)分析转录组。测序于Illumina NovaSeq 6000平台完成(符合深度标准)。通过DESeq2筛选H3K27me3相关差异基因(|Log_(2)FC|>1,FDR<0.05),并通过基因本体论(Gene Oncology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析进行功能富集,Homer鉴定转录因子基序,Cytoscape构建调控网络,并使用免疫组化进行验证,探讨其调控机制。结果SRCC沉默子主要分布于基因组远端基因间区(占37.06%)。与正常组织相比,SRCC中H3K27me3沉默子信号显著降低(95%CI:1.34~2.30,P=0.007),共鉴定出6257个丢失位点(FDR<0.01)。CUT&Tag和RNA-seq整合分析显示,380个因沉默子丢失而上调的基因显著富集于免疫相关通路,如T细胞受体信号通路(OR=4.2,95%CI:2.8~6.3,P=0.002)。免疫组化验证表明,转录因子EHF表达显著升高(P<0.05)。结论SRCC中存在H3K27me3沉默子重塑现象,转录因子EHF可能在SRCC恶性进展中发挥关键作用。
2021年10月,疟疾亚单位疫苗RTS,S/AS01获得世界卫生组织(World Health Organization,WHO)的批准,可以接种于疟疾传播风险较高地区的儿童,以期降低非洲5岁以下儿童因疟疾感染而导致的死亡率.因此,RTS,S/AS01成为了获批的首款疟疾疫苗.时...
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2021年10月,疟疾亚单位疫苗RTS,S/AS01获得世界卫生组织(World Health Organization,WHO)的批准,可以接种于疟疾传播风险较高地区的儿童,以期降低非洲5岁以下儿童因疟疾感染而导致的死亡率.因此,RTS,S/AS01成为了获批的首款疟疾疫苗.时隔两年,在RTS,S基础上进行改进的R21/Matrix-M疫苗也获得了WHO的批准,成为了第二款获批的疟疾疫苗.RTS,S/AS01(Mosquirix)和R21/Matrix-M两款疫苗的相继获批,让人们看到了对抗疟疾的新希望,因此被入选“Science 2023年度十大科学突破”之一.
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