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西北农业学报 2024年第7期33卷 1352-1363页

作者：赵霞李元敏李依民胡晓晨高静颜永刚张岗陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心西安712046 陕西中医药大学陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室西安712046 陕西中医药大学第二附属医院西安712046

旨在克隆获得 RpMYB2、 RpMYB3、 RpMYB5、 RpMYB6基因ORF,并对其理化特性、系统进化关系、不同组织表达、激素与非生物胁迫下的表达等展开分析。研究结果表明, RpMYB2、 RpMYB3、 RpMYB5、 RpMYB6依次编码333、275、293、291个氨基酸,... 详细信息

旨在克隆获得 RpMYB2、 RpMYB3、 RpMYB5、 RpMYB6基因ORF,并对其理化特性、系统进化关系、不同组织表达、激素与非生物胁迫下的表达等展开分析。研究结果表明, RpMYB2、 RpMYB3、 RpMYB5、 RpMYB6依次编码333、275、293、291个氨基酸,分子质量分别为34.781、30.525、31.243、33.313 ku, 4个RpMYBs蛋白均为亲水性蛋白并具有较高的热稳定性,除 RpMYB2外其余3个基因结构主要为α-螺旋和无规则卷曲,且均定位于细胞核。由蛋白结构域和保守基序分析发现, RpMYB2、 RpMYB5含有1个HTH-MYB结构域, RpMYB3、 RpMYB6含有2个HTH-MYB结构域,且不同MYB转录因子包含的保守元件数量及种类存在差异,系统进化分析显示 RpMYB2、 RpMYB5属于R1-MYB亚家族, RpMYB3、 RpMYB6属于R2R3-MYB亚家族,与其结构域分类一致。实时荧光定量结果显示,根中 RpMYB2、 RpMYB6转录本丰度最高, RpMYB3、 RpMYB5基因分别在叶片、叶柄中高表达。经200μmol·L^(-1)脱落酸(abscisic acid, ABA)处理, RpMYB5于24 h达峰值;200μmol·L^(-1)茉莉酸甲酯(methyl jasmonate, MeJA)诱导 RpMYB6表达,表达量随时间推移呈逐渐上升趋势且于24 h最高(为0 h的10.30倍),抑制 RpMYB3表达;200μmol·L^(-1)水杨酸(salicylic acid, SA)诱导 RpMYB6表达最为明显,3 h表达量上调至0 h的21.84倍。RpMYBs在非生物胁迫处理下表达也各有差异, RpMYB2受高温胁迫诱导表达, RpMYB3在损伤、高温胁迫下表达下调, RpMYB5在损伤胁迫下表达受抑制, RpMYB6响应高温、盐胁迫。

关键词：掌叶大黄 MYB 表达分析胁迫实时荧光定量PCR

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基于全长转录组测序的掌叶大黄R1-MYB基因家族鉴定分析

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药学学报 2023年第5期58卷 1354-1363页

作者：赵霞李元敏李依民肖光辉张明英程文萍高静彭亮张岗陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西西安712046 陕西中医药大学陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室陕西西安712046 陕西中医药大学第二附属医院陕西西安712046 陕西师范大学生命科学学院陕西西安710119

作为MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)转录因子家族的一大类,R1-MYB(MYBrelated)家族在植物生长发育、环境胁迫及激素信号转导等方面发挥重要的调节作用。本研究基于全长转录组测序分析,系统筛选掌叶大黄R1-MYB... 详细信息

作为MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)转录因子家族的一大类,R1-MYB(MYBrelated)家族在植物生长发育、环境胁迫及激素信号转导等方面发挥重要的调节作用。本研究基于全长转录组测序分析,系统筛选掌叶大黄R1-MYB家族基因,分析其编码蛋白的理化、结构域及分子进化等特性,利用RNA-seq进行基因组织表达分析,并检测RpMYB24响应激素、非生物胁迫的表达模式。结果表明,共鉴定到掌叶大黄49个R1-MYB家族基因,主要编码热稳定的亲水蛋白,大部分定位于细胞核。各蛋白无规卷曲和α螺旋所占比例较大,存在MYB家族标志性的W型保守氨基酸。掌叶大黄R1-MYB家族成员分布于CCA1(circadian clock associated 1)-like、I-box(GATAAG)-like、CPC(CAPRICE)-like、TRF(telomere repeat binding factor)-like和TBP(TATA binding protein)-like 5个亚组,且CCA1-like数量居多。RNA-seq揭示49个R1-MYBs基因在掌叶大黄根、根茎及叶中差异表达,根及根茎中分别有15、23个基因表达量高于叶中。发现RpMYB24基因受脱落酸(abscisic acid,ABA)、水杨酸(salicylic acid,SA)和茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)的诱导,且能显著应答损伤、低温或高温胁迫,但对干旱胁迫响应不显著。本研究系统鉴定了掌叶大黄R1-MYB家族基因及其分子特征,为下一步开展基因功能验证提供基础,进而为大黄药材品质形成的转录调控机制研究提供科学依据。

关键词：掌叶大黄 R1-MYB 转录因子基因表达胁迫

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竹亚科单枝竹属芸香竹花枝和花特征补充描述

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广西植物 2022年第10期42卷 1641-1644页

作者：张雨曲杨新杰程虎印高静彭亮张明英张岗陕西中医药大学药学院陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室西安712046

繁殖器官在竹类植物的分类学研究中具有重要意义,研究组在广西马山县观察到竹亚科单枝竹属芸香竹正在开花,该文根据观察到的开花状况和采集到的标本解剖观察结果,对其花枝和繁殖器官特征做了详细的中文及拉丁文补充描述。经对比芸香竹... 详细信息

繁殖器官在竹类植物的分类学研究中具有重要意义,研究组在广西马山县观察到竹亚科单枝竹属芸香竹正在开花,该文根据观察到的开花状况和采集到的标本解剖观察结果,对其花枝和繁殖器官特征做了详细的中文及拉丁文补充描述。经对比芸香竹与属内已知繁殖器官结构的单枝竹和小花单枝竹的繁殖器官,3个竹种有相同的繁殖器官结构特征,但在小花数目和大小等方面具有差异。繁殖器官比较表明该属竹种的繁殖器官对喀斯特地貌环境有特殊的适应性,也支持依据营养器官差异划分为3个独立竹种。

关键词：竹亚科单枝竹属芸香竹花补充描述

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卵叶远志叶绿体基因组序列特征与系统发育分析

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中草药 2023年第18期54卷 6065-6073页

作者：罗瑶胡本祥张晗史嘉周姬海月净易尧陈晓颖王帮庆颜永刚赵璠李艳茸彭亮陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心/“秦药”研发重点实验室陕西咸阳712046 陕西国际商贸学院陕西咸阳712046 汉中市科技资源统筹中心陕西汉中723000 榆林市第五医院陕西榆林719000

目的解析卵叶远志Polygala sibirica叶绿体因组的序列特征和系统发育关系。方法利用CTAB法提取卵叶远志叶片基因组DNA,通过IlluminaHi Seq平台测序,再用Get Cellelle组装叶绿体基因组,通过MEGA11构建邻接法(neighbor-joining,NJ法)系统... 详细信息

目的解析卵叶远志Polygala sibirica叶绿体因组的序列特征和系统发育关系。方法利用CTAB法提取卵叶远志叶片基因组DNA,通过IlluminaHi Seq平台测序,再用Get Cellelle组装叶绿体基因组,通过MEGA11构建邻接法(neighbor-joining,NJ法)系统发育树。结果卵叶远志的叶绿体基因组全长165192bp,GC含量为36.70%,共编码124个基因,其中包含8个rRNA基因、42个tRNA基因和74个蛋白编码基因;相对同义密码子使用度显示,67.29%的密码子的使用度>1,密码子偏好A、T结尾;共检测到287个简单重复序列(simple sequence repeats,SSR),其中以单核苷酸重复次数最多,占80.61%,单核苷酸主要由A和T组成,这表明在碱基形成过程中A和T被频繁使用;边界分析显示,9种远志属植物叶绿体基因组边界较为稳定,卵叶远志、香港远志***、远志***、瓜子金***和合叶草***基因结构存在相似性;变异分析显示,9种远志属植物叶绿体基因组变异幅度较小;系统发育分析结果显示,卵叶远志、香港远志、瓜子金、远志、合叶草和西南远志***因较高的支持率可聚成一支。结论构建了高质量的卵叶远志全叶绿体基因组,为卵叶远志的遗传结构和遗传多样性研究奠定了基础。

关键词：远志卵叶远志叶绿体基因组序列特征系统发育

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温度和干旱胁迫对3种大黄种子萌发和幼苗生长的影响

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中草药 2022年第8期53卷 2480-2489页

作者：李慧王雪茹李依民徐进刘东高静张明英杜弢颜永刚张岗陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西西安712046 陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室陕西西安712046 镇巴县百花谷现代农牧开发有限公司陕西汉中723600 甘肃中医药大学药学院/甘肃省中药质量与标准研究重点实验室甘肃兰州730099

目的研究不同温度和聚乙二醇(PEG)模拟干旱胁迫对大黄种子萌发的影响,探讨大黄种子萌发的最适温度和对干旱胁迫的耐性。方法用6个温度(10、15、20、25、30、35℃)和6个聚乙二醇(PEG-6000,以下简称PEG)浓度(0、5%、10%、15%、20%、25%)... 详细信息

目的研究不同温度和聚乙二醇(PEG)模拟干旱胁迫对大黄种子萌发的影响,探讨大黄种子萌发的最适温度和对干旱胁迫的耐性。方法用6个温度(10、15、20、25、30、35℃)和6个聚乙二醇(PEG-6000,以下简称PEG)浓度(0、5%、10%、15%、20%、25%)模拟温度胁迫与干旱胁迫对大黄种子进行处理,置人工培养箱培育,借助SPSS 24.0单因素方差分析法对其发芽势、发芽率、胚根、胚轴和子叶等指标统计分析。结果温度与干旱胁迫对3种大黄种子萌发及幼苗生长有显著影响(P<0.05);同一温度下,3种大黄的种子萌发指标随PEG浓度的升高而降低,掌叶大黄和唐古特大黄幼苗各指标亦是随PEG浓度的升高而降低,而药用大黄幼苗各指标随着PEG浓度的升高先增加后减小,在低浓度PEG(5%)达到最大,25%PEG重度干旱时严重抑制掌叶大黄和唐古特大黄萌发(P<0.05),完全抑制药用大黄萌发;20℃或25℃下,各PEG浓度处理的3种大黄种子萌发及幼苗生长指标均达到最大值;在低于20℃或者高于25℃时,各PEG浓度下的指标呈下降趋势,35℃高温下种子萌发和幼苗生长指标随着PEG浓度的升高呈直线下降。结论掌叶大黄和唐古特大黄种子在各处理下所有指标均高于药用大黄,萌发的速度和整齐度较好,种子的活力高,表现出较强的抗旱性,轻度干旱环境有利于药用大黄幼苗生长,为大黄种质资源评价及规范种植研究与应用提供了理论依据。

关键词：大黄干旱温度交互胁迫种子萌发幼苗生长

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外源水杨酸对盐胁迫下大黄种子萌发及幼苗生长的影响

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西北植物学报 2022年第11期42卷 1919-1926页

作者：梁小燕李依民高静徐进颜永刚张岗陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心西安712046 陕西咸阳712083 陕西中医药大学陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室西安712046 镇巴县百花谷现代农牧开发有限公司陕西汉中723600

该研究以掌叶大黄、唐古特大黄和药用大黄种子为材料,采用双层滤纸培养法,设置系列浓度NaCl(0、100、150、200、250 mmol/L)胁迫试验,以及系列浓度水杨酸(SA)溶液(0、50、100、150、200、250 mg/L)拌种和浸种后盐胁迫实验,测定3种大黄... 详细信息

该研究以掌叶大黄、唐古特大黄和药用大黄种子为材料,采用双层滤纸培养法,设置系列浓度NaCl(0、100、150、200、250 mmol/L)胁迫试验,以及系列浓度水杨酸(SA)溶液(0、50、100、150、200、250 mg/L)拌种和浸种后盐胁迫实验,测定3种大黄种子萌发及幼苗生长指标,揭示外源水杨酸对盐胁迫下大黄种子萌发及幼苗生长的影响。结果显示:(1)随NaCl浓度增大3种大黄种子的发芽率均呈直线下降趋势,且子叶、胚轴、根和苗等生长均受到强烈抑制。(2)在拌种条件下,200 mmol/L NaCl胁迫下掌叶大黄苗长在200 mg/L SA处理下受到显著促进;200 mmol/L NaCl浓度盐胁迫下唐古特大黄种子发芽率在250 mg/L SA处理下受到显著抑制;100 mmol/L NaCl胁迫下药用大黄种子发芽势在200 mg/L SA处理下受到显著抑制,其发芽率在150 mg/L SA处理下得到显著抑制,其苗长在250 mg/L SA处理下受到显著抑制。(3)在浸种条件下,200 mmol/L NaCl胁迫下掌叶大黄种子发芽率在50 mg/L SA处理下显著提高,其幼苗根长和苗长的生长在250 mg/L SA处理受到显著促进;200 mmol/L NaCl胁迫下唐古特大黄种子的发芽势在200 mg/L SA处理下得到显著促进,其幼苗根和苗的生长在50 mg/L SA处理下得到显著促进;100 mmol/L NaCl胁迫下药用大黄根和苗的生长在100 mg/L SA处理下均得到显著促进。研究表明,3种大黄种子和幼苗对盐胁迫的响应趋势一致,但对不同浓度SA拌种和浸种的响应有较大差异。

关键词：大黄种子盐胁迫水杨酸

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掌叶大黄全长转录组测序分析

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分子植物育种 2022年

作者：王雪茹杜鹃李依民肖光辉唐璟张明英高静颜永刚张岗陕西中医药大学药学院陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西中医药大学陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室陕西师范大学生命科学学院

为深入挖掘掌叶大黄全长基因信息，本研究对掌叶大黄幼苗的根、叶混合样品进行全长转录组测序，并利用生物信息学方法进行基因注释与结构分析。共获得63 514条高质量Isoforms，平均长度为1 497.16 bp，其中共有59 505条基因被Nr、Swissp...

为深入挖掘掌叶大黄全长基因信息，本研究对掌叶大黄幼苗的根、叶混合样品进行全长转录组测序，并利用生物信息学方法进行基因注释与结构分析。共获得63 514条高质量Isoforms，平均长度为1 497.16 bp，其中共有59 505条基因被Nr、Swissprot、KOG及KEGG数据库注释。KOG功能比对共成功注释到25个功能大类，一般功能预测排在首位，为7 392条；KEGG注释分析发现15条参与掌叶大黄次生代谢的通路；共有381条Isoforms编码蒽醌合成通路的28个关键酶；MISA分析发现9 267个SSRs位点，其中三核苷酸数目最多，占比49.13%。同时预测得到63 365个CDS序列、2 213个转录因子以及2 071条LncRNAs。本研究首次使用三代测序技术对掌叶大黄进行全长转录组分析，以期为掌叶大黄生长发育、代谢调控及遗传多样性分析等研究提供基础。

关键词：

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桔梗质量标志物筛选

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中成药 2024年第10期46卷 3393-3399页

作者：井亚江王七龙黄建萍安佳王祥张岗彭亮高静王昌利王育朋张鑫磊颜永刚陕西中医药大学药学院陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心“秦药”研发重点实验室陕西咸阳712046 陕西海天制药有限公司陕西咸阳712000 空军军医大学药学院药物化学与药物分析学教研室陕西西安710032

目的筛选桔梗质量标志物。方法建立HPLC-ELSD指纹图谱,获取化学成分信息。采用网络药理学建立成分-靶点、蛋白互作网络,筛选核心靶点与潜在质量标志物,并进行细胞实验验证。结果19批药材指纹图谱中有12个共有峰,相似度0.933~0.997。共... 详细信息

目的筛选桔梗质量标志物。方法建立HPLC-ELSD指纹图谱,获取化学成分信息。采用网络药理学建立成分-靶点、蛋白互作网络,筛选核心靶点与潜在质量标志物,并进行细胞实验验证。结果19批药材指纹图谱中有12个共有峰,相似度0.933~0.997。共得15种活性成分、5个核心靶点、5个质量标志物。各质量标志物干预后,A549细胞上清IL-17、TNF水平降低(P<0.01),EGFR、JUN、RXRA、STAT3、TNF、PTGS2 mRNA表达升高(P<0.01)。结论桔梗皂苷D 3、桔梗皂苷D 2、桔梗皂苷A、远志皂苷D 2、桔梗酸A可作为桔梗质量标志物,该药材能通过免疫调节、抑制炎症因子分泌、调控细胞分化与增殖等途径达到宣肺、利咽功效。

关键词：桔梗质量标志物 HPLC-ELSD指纹图谱网络药理学细胞实验

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贵州省维管植物新记录7种

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植物资源与环境学报 2023年第4期32卷 98-100页

作者：侯小琪张雨曲张久磊王明川江维克王文银贵阳药用植物园贵州贵阳550002 陕西中医药大学药学院陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室陕西西安712046 贵州中医药大学药学院贵州贵阳550025 贵州威宁彝族回族苗族自治县中水镇卫生院贵州威宁553108

通过野外调查和标本查阅,确定了贵州省维管植物新记录7种,隶属于7科7属,分别为大叶骨碎补(Davallia divaricata Dutch et Tutch.)、木论关木通[Isotrema mulunense(*** et Yan Liu)***,*** et ***]、广西海桐(Pittosporum kwangsiense *** et ***)、薄叶景天(Sedum leptophyllum Fr9d.)、盾翅藤(Aspidopterys glabriuscula ***.)、大叶金牛(Polygala latouchei Franch.)、棒凤仙花(Impatiens clavigera ***.)。骨碎补属(Davallia Sm.)为贵州省新记录属。凭证标本保存在贵阳药用资源博物馆标本室(GYBG)。

关键词：贵州省新记录形态特征喀斯特地貌

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赤霉素对NaCl胁迫下大黄种子萌发和幼苗生长的影响

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中草药 2022年第18期53卷 5834-5841页

作者：李依民梁小燕张晗高静王楠徐进成世强彭亮张岗陕西中医药大学药学院陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西西安712046 陕西中医药大学药学院陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室陕西西安712046 镇巴县百花谷现代农牧开发有限公司陕西汉中723600 镇巴县科技进步促进中心陕西镇巴723600

目的研究NaCl胁迫下掌叶大黄Rheum palmatum、唐古特大黄R. tanguticum和药用大黄R. officinale种子萌发及幼苗生长特性及赤霉素(GA3)引发对盐胁迫下种子萌发及幼苗发育的影响。方法设置0、100、150、200、250 mmol/L NaCl胁迫,200、2... 详细信息

目的研究NaCl胁迫下掌叶大黄Rheum palmatum、唐古特大黄R. tanguticum和药用大黄R. officinale种子萌发及幼苗生长特性及赤霉素(GA3)引发对盐胁迫下种子萌发及幼苗发育的影响。方法设置0、100、150、200、250 mmol/L NaCl胁迫,200、250 mg/L GA3拌种或浸种实验,双层滤纸培养法分析盐胁迫下3种大黄种子萌发及幼苗生长指标。结果 3种大黄种子发芽率随Na Cl浓度增加直线下降、盐相对伤害率直线上升(P<0.05),子叶长、胚轴长、根长和苗长等受到强烈抑制(P<0.05)。200 mmol/L NaCl下GA3拌种或浸种能显著提高掌叶大黄种子发芽率(P<0.05),250 mmol/L Na Cl下仅GA3拌种有作用(P<0.05);200 mmol/L NaCl下2个质量浓度GA3拌种、低质量浓度浸种提高唐古特大黄种子发芽率(P<0.05),250 mmol/L NaCl下GA3无促进作用(P>0.05);GA3拌种和高质量浓度GA3浸种能提高150 mmol/L NaCl下药用大黄种子发芽率(P<0.05),100mmol/LNaCl下GA3无促进作用(P>0.05)。GA3浸种能促进盐胁迫下掌叶大黄、唐古特大黄和药用大黄幼苗根和苗的生长(P<0.05)。结论 NaCl胁迫下3种大黄种子萌发及幼苗生长均受到抑制,3种大黄种子和幼苗耐盐性有差异,药用大黄耐盐性最低,GA3拌种或浸种引发能不同程度缓解高盐胁迫下大黄种子萌发和幼苗发育。

关键词：掌叶大黄唐古特大黄药用大黄种子盐胁迫赤霉素引发

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