检索结果-内蒙古大学图书馆

中草药 2019年第8期50卷 1960-1965页

作者：李欢黑小斌李依民杨琳刘清颜永刚胡本祥张岗陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西西安712046

目的克隆珍稀濒危兰科药用铁皮石斛F-box蛋白基因即S期激酶相关蛋白(S phase kinase-associated protein)基因DoSKP2A,并进行生物信息学和表达特征分析。方法采用RACE技术获基因全长;利用生物信息软件预测基因编码蛋白的理化性质、结构... 详细信息

目的克隆珍稀濒危兰科药用铁皮石斛F-box蛋白基因即S期激酶相关蛋白(S phase kinase-associated protein)基因DoSKP2A,并进行生物信息学和表达特征分析。方法采用RACE技术获基因全长;利用生物信息软件预测基因编码蛋白的理化性质、结构域和亚细胞定位等分子特性;用DNASTAR 7.0和MEGA 7.0分别进行氨基酸多序列比对和进化树构建;借助定量PCR检测基因表达模式。结果克隆到DoSKP2A(GenBank注册号KU160472),c DNA全长1 507 bp,开放阅读框(ORF)长1 101 bp,编码蛋白含366个氨基酸,相对分子质量39 590,等电点7.9。DoSKP2A蛋白不含跨膜域和信号肽,包含F-box核心结构域(26～88)、亮氨酸重复序列LRR(202～226)和多个保守基序;Do SKP2A与植物SKP2As蛋白一致性为64.6%～72.4%,所在分支隶属于SKP2As分子进化的单子叶植物分支,与小兰屿蝴蝶兰SKP2A亲缘关系近;DoSKP2A基因转录本在石斛3种器官中为组成型表达,根中相对表达量较高,为叶中的6.16倍,茎中次之,叶中表达量很低。结论获得一个全新的铁皮石斛F-box蛋白基因DoSKP2A全长、生物信息及其表达特征,为研究其在铁皮石斛生长发育、信号传导和抗逆境胁迫的分子机制提供基础。

关键词：铁皮石斛 SKP2A蛋白基因克隆序列分析实时荧光定量PCR

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不同产地野生远志中5种主要成分的含量测定及质量分析

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中草药 2020年第6期51卷 1609-1616页

作者：张琳杨冰月王晶张岗颜永刚高静杨新杰胡本祥彭亮陕西中医药大学药学院陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西西安712046

目的研究不同产地野生远志Polygala tenuifolia中5种主要成分的含量差异,为远志多成分质量评价体系提供基础。方法采用HPLC法测定20个产地野生远志中远志酮Ⅲ、3,6′-二芥子酰基蔗糖、远志酸、远志皂苷元和细叶远志皂苷的含量,运用SPSS ... 详细信息

目的研究不同产地野生远志Polygala tenuifolia中5种主要成分的含量差异,为远志多成分质量评价体系提供基础。方法采用HPLC法测定20个产地野生远志中远志酮Ⅲ、3,6′-二芥子酰基蔗糖、远志酸、远志皂苷元和细叶远志皂苷的含量,运用SPSS 20.0和SIMCA 11.5进行差异性、聚类、相关性和主成分分析。结果不同产地野生远志中5种主要成分的含量差异显著,聚类分析和主成分分析可将所有样品聚为2类,第Ⅰ类所含3,6′-二芥子酰基蔗糖、远志酮Ⅲ、远志皂苷元和细叶远志皂苷含量较高,来自陕西渭南、陕西咸阳和山西新绛,其余样品则聚为第Ⅱ类。结论陕西渭南、陕西咸阳和山西新绛所产野生远志中主要成分含量较高,与其他产地存在极显著性差异,可为远志质量评价、优良种质及栽培基地选择等提供依据。

关键词：远志质量评价远志酮Ⅲ 3,6′-二芥子酰基蔗糖远志酸远志皂苷元细叶远志皂苷

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北柴胡、紫花阔叶柴胡叶绿体全基因组解析及柴胡属药用植物叶绿体基因组比较与系统发育分析

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药学学报 2021年第2期56卷 618-629页

作者：张明英张雨曲李依民高静沈霞杨新杰颜永刚王昌利张岗陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西西安712046

柴胡属(Bupleurum L.)是伞形科(Apiaceae)中具有重要经济价值的药用类群。本研究利用Illumina HiSeq X Ten平台测序获得北柴胡(*** DC.)和紫花阔叶柴胡(*** ***)的叶绿体全基因组序列,对其进行了组装、注释和特征分析,并与同属已发表的... 详细信息

柴胡属(Bupleurum L.)是伞形科(Apiaceae)中具有重要经济价值的药用类群。本研究利用Illumina HiSeq X Ten平台测序获得北柴胡(*** DC.)和紫花阔叶柴胡(*** ***)的叶绿体全基因组序列,对其进行了组装、注释和特征分析,并与同属已发表的叶绿体全基因组进行了比较和系统发育分析。北柴胡和紫花阔叶柴胡叶绿体全基因组大小分别为155458、155800 bp,均为由一个大单拷贝区(large single copy,LSC;85343、85804 bp)、一个小单拷贝区(small single copy,SSC;17495、17410 bp)和一对反向重复区(inverted repeat,IRa/IRb;26310、26293 bp)构成的环状四分体结构;两者分别注释得到129个基因,包括84个蛋白编码基因、37个tRNA基因和8个rRNA基因;此外,两者重复序列的类型与分布模式相似,但数量有所差异。比较基因组学分析结果表明,柴胡属植物叶绿体全基因组大小、结构、GC含量及基因组成和排列顺序等在种内、种间均高度保守,IRs区未出现明显扩张或收缩;序列的种间变异高于种内,非编码序列(包括基因间区和内含子)变异高于编码基因序列,LSC和SSC区序列变异高于IRs区;此外,筛选到11条核苷酸多样性较高的种间高变异序列,分别位于LSC和SSC区。系统发育分析结果强烈支持柴胡属为单系,其中,北柴胡同种不同个体聚为一支,并与紫花鸭跖柴胡(*** ***)亲缘关系最近,而紫花阔叶柴胡与三岛柴胡(*** L.)亲缘关系更近。本研究将为柴胡属药用植物的分类鉴定、系统发育及资源开发利用等相关研究提供基础。

关键词：柴胡属叶绿体基因组简单重复序列序列变异系统发育

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山茱萸果实发育过程中单宁物质的分布与积累特征

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西北植物学报 2021年第11期41卷 1834-1842页

作者：陈旋勐张岗高静颜永刚魏瑶陈莹陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西咸阳712046

选取不同发育时期的山茱萸果实作为研究对象,采用果实形态观察法、显微及超微技术、组织化学定位法以及紫外分光光度计法对山茱萸果实发育过程中单宁物质分布及积累特征进行观察分析,并以单因素ANOVA检验不同发育时期单宁含量的差异,以... 详细信息

选取不同发育时期的山茱萸果实作为研究对象,采用果实形态观察法、显微及超微技术、组织化学定位法以及紫外分光光度计法对山茱萸果实发育过程中单宁物质分布及积累特征进行观察分析,并以单因素ANOVA检验不同发育时期单宁含量的差异,以揭示单宁物质在山茱萸果实发育中的变化规律,为山茱萸果实涩味调控机制研究提供理论依据。结果表明:(1)山茱萸果实发育过程中果皮颜色和果实体积变化明显,可将其发育过程划分为幼果期、中果期、成熟期3个时期;单宁物质主要分布在山茱萸果实中果皮的单宁细胞中。(2)在山茱萸果实发育过程中单宁细胞数目呈先增后减的变化趋势,幼果期单宁细胞从无到有,随着果实发育单宁细胞数目不断增多,至中果期单宁细胞数目开始减少。(3)单宁含量的变化规律与单宁细胞数目的变化一致,单宁含量在花后120 d时达到最多,随后逐渐减少。(4)单宁物质首先在细胞质的小液泡中积累,中央大液泡形成后则为单宁物质积累的主要场所,其积累形态主要有颗粒状、不规则状和板块状3种;单宁细胞中线粒体数目较多,中果期后期及成熟期在中央大液泡液泡膜附近有电子致密物质积累。研究认为,山茱萸果实中中果皮薄壁细胞为单宁物质积累的专属细胞,即单宁细胞,单宁物质的合成运输与液泡、囊泡以及线粒体的作用密切相关;成熟期山茱萸果实总单宁含量降低,涩味降低,表明单宁物质积累的动态变化与植物对环境的适应性和果实涩味息息相关,可结合代谢组和转录组的方法对山茱萸果实中单宁物质的合成机制进行进一步研究。

关键词：山茱萸单宁物质单宁细胞发育

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HPLC指纹图谱和多成分定量结合化学模式识别评价蜜款冬花质量

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中草药 2024年第18期55卷 6344-6354页

作者：龚秀娟彭亮陈晓颖周可心贺喜泉杨冰月陕西中医药大学药学院陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西西安712046 湖南中医药大学药学院湖南长沙410208

目的建立蜜款冬Tussilago farfara花HPLC指纹图谱和多成分含量测定分析方法,结合化学模式识别法综合评价蜜款冬花质量。方法采用HPLC和中药指纹图谱相似度评价系统(2004 A)建立53批蜜款冬花的指纹图谱,同时测定款冬酮等14个有效成分含量... 详细信息

目的建立蜜款冬Tussilago farfara花HPLC指纹图谱和多成分含量测定分析方法,结合化学模式识别法综合评价蜜款冬花质量。方法采用HPLC和中药指纹图谱相似度评价系统(2004 A)建立53批蜜款冬花的指纹图谱,同时测定款冬酮等14个有效成分含量,结合化学模式识别对不同批次蜜款冬花的质量进行评价。结果蜜款冬花指纹图谱共标定了24个共有峰,指认了其中14个成分,相似度为0.763~0.997;聚类分析(cluster analysis,HCA)、主成分分析(principal component analysis,PCA)和正交偏最小二乘法(orthogonal partial least squares-discriminant analysis,OPLS-DA)均将53批样品分为2类,PCA得到6个主成分的累积贡献率为82.457%,OPLS-DA筛选了异绿原酸B、异绿原酸A、异绿原酸C、绿原酸、芦丁、10号峰(未知)6个影响蜜款冬花质量的差异性成分;含量测定结果表明不同批次蜜款冬花中14个有效成分含量存在明显差异,聚类热图将53批样品分为2类,第1类样品中的异绿原酸A、异绿原酸B、异绿原酸C、槲皮素、芦丁、绿原酸、隐绿原酸含量高于第2类,其中异绿原酸A、异绿原酸B、异绿原酸C、芦丁、绿原酸均来OPLS-DA筛选的差异性成分。结论建立的蜜款冬花HPLC指纹图谱和多成分定量方法稳定性好、灵敏度高,结合化学模式识别法可为综合评价蜜款冬花质量提供参考。

关键词：蜜款冬花 HPLC指纹图谱化学模式识别质量评价异绿原酸A 异绿原酸B 异绿原酸C 槲皮素芦丁绿原酸隐绿原酸

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黄芩根中木间木栓的形成与发育特性研究

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西北植物学报 2020年第10期40卷 1672-1678页

作者：王娟颜永刚张岗彭亮陈莹陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西咸阳712046

应用光学显微镜和电子显微镜对3年生黄芩(Scutellaria baicalensis Georgi)根中木间木栓的形成及其发育过程进行了细致观察,以揭示黄芩木间木栓形成的特征以及发育过程中导管及周围薄壁细胞的变化,旨在为中药枯芩的形成提供理论依据和... 详细信息

应用光学显微镜和电子显微镜对3年生黄芩(Scutellaria baicalensis Georgi)根中木间木栓的形成及其发育过程进行了细致观察,以揭示黄芩木间木栓形成的特征以及发育过程中导管及周围薄壁细胞的变化,旨在为中药枯芩的形成提供理论依据和实验证据。结果表明:(1)黄芩根的次生结构由周皮、皮层和次生维管组织组成;木间木栓发生在木质部异常导管的周围,先是导管内出现侵填体或其他物质,接着这些导管邻近的部分薄壁细胞内也出现一些物质,随后导管外围的正常薄壁细胞恢复分生能力,产生木栓形成层,进而形成木间木栓。(2)木间木栓将健康组织与这些异常的导管和薄壁细胞隔离,隔离在内的组织会逐渐成为死亡组织。(3)横切面观,小木间木栓可同时或先后发生在木质部的不同位置,由内向外逐渐扩大,与周围的木间木栓相连,最终形成大的木间木栓。(4)纵切面观,木间木栓以管状形式由根头部向下延伸,部分根中距根头部以下3 cm内有木间木栓存在。

关键词：黄芩结构发育侵填体木间木栓

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基于全长转录组测序的掌叶大黄R1-MYB基因家族鉴定分析

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药学学报 2023年第5期58卷 1354-1363页

作者：赵霞李元敏李依民肖光辉张明英程文萍高静彭亮张岗陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西西安712046 陕西中医药大学陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室陕西西安712046 陕西中医药大学第二附属医院陕西西安712046 陕西师范大学生命科学学院陕西西安710119

作为MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)转录因子家族的一大类,R1-MYB(MYBrelated)家族在植物生长发育、环境胁迫及激素信号转导等方面发挥重要的调节作用。本研究基于全长转录组测序分析,系统筛选掌叶大黄R1-MYB... 详细信息

作为MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)转录因子家族的一大类,R1-MYB(MYBrelated)家族在植物生长发育、环境胁迫及激素信号转导等方面发挥重要的调节作用。本研究基于全长转录组测序分析,系统筛选掌叶大黄R1-MYB家族基因,分析其编码蛋白的理化、结构域及分子进化等特性,利用RNA-seq进行基因组织表达分析,并检测RpMYB24响应激素、非生物胁迫的表达模式。结果表明,共鉴定到掌叶大黄49个R1-MYB家族基因,主要编码热稳定的亲水蛋白,大部分定位于细胞核。各蛋白无规卷曲和α螺旋所占比例较大,存在MYB家族标志性的W型保守氨基酸。掌叶大黄R1-MYB家族成员分布于CCA1(circadian clock associated 1)-like、I-box(GATAAG)-like、CPC(CAPRICE)-like、TRF(telomere repeat binding factor)-like和TBP(TATA binding protein)-like 5个亚组,且CCA1-like数量居多。RNA-seq揭示49个R1-MYBs基因在掌叶大黄根、根茎及叶中差异表达,根及根茎中分别有15、23个基因表达量高于叶中。发现RpMYB24基因受脱落酸(abscisic acid,ABA)、水杨酸(salicylic acid,SA)和茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)的诱导,且能显著应答损伤、低温或高温胁迫,但对干旱胁迫响应不显著。本研究系统鉴定了掌叶大黄R1-MYB家族基因及其分子特征,为下一步开展基因功能验证提供基础,进而为大黄药材品质形成的转录调控机制研究提供科学依据。

关键词：掌叶大黄 R1-MYB 转录因子基因表达胁迫

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铁皮石斛2个P型H^+-ATPase基因的克隆、表达及生物信息学分析

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西北农业学报 2019年第6期28卷 945-952页

作者：黑小斌李欢李依民沈霞高静颜永刚张岗陕西中医药大学药学院陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心

利用RACE进行铁皮石斛质膜PMA(plasmame mbrane H^+-ATPase)基因的全长克隆,采用生物信息学方法、DNASTAR7.0和MEGA7.0对其编码蛋白结构、序列和分子进化等进行分析,并借助实时荧光定量PCR技术检测基因表达模式。结果表明,从铁皮石斛叶... 详细信息

利用RACE进行铁皮石斛质膜PMA(plasmame mbrane H^+-ATPase)基因的全长克隆,采用生物信息学方法、DNASTAR7.0和MEGA7.0对其编码蛋白结构、序列和分子进化等进行分析,并借助实时荧光定量PCR技术检测基因表达模式。结果表明,从铁皮石斛叶片cDNA中分离到2个P型H^+-ATPase基因DoPMA1和DoPMA2(GenBank注册号KU160470和KU160471),各编码1条由973和951个氨基酸组成的肽链;2个基因编码蛋白均含有2个保守的P型ATPase结构域和5个H^+运输ATPase结合位点,不含信号肽,定位在质膜。2个蛋白与植物H^+-ATPases蛋白相似性大于72%,聚在拟南芥、水稻等植物H^+-ATPase分子进化树的Ⅴ和Ⅱ分支。实时荧光定量PCR分析表明,DoPMA1在根和茎中上调,分别为叶中的2.98、1.95倍,DoPMA2在根与叶中表达无显著差异,茎中下调为叶中的0.86倍。研究结果为进一步揭示DoPMA1和DoPMA2分子作用奠定基础。

关键词：铁皮石斛质膜ATPase 克隆表达模式生物信息学分析

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温度和干旱胁迫对3种大黄种子萌发和幼苗生长的影响

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中草药 2022年第8期53卷 2480-2489页

作者：李慧王雪茹李依民徐进刘东高静张明英杜弢颜永刚张岗陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西西安712046 陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室陕西西安712046 镇巴县百花谷现代农牧开发有限公司陕西汉中723600 甘肃中医药大学药学院/甘肃省中药质量与标准研究重点实验室甘肃兰州730099

目的研究不同温度和聚乙二醇(PEG)模拟干旱胁迫对大黄种子萌发的影响,探讨大黄种子萌发的最适温度和对干旱胁迫的耐性。方法用6个温度(10、15、20、25、30、35℃)和6个聚乙二醇(PEG-6000,以下简称PEG)浓度(0、5%、10%、15%、20%、25%)... 详细信息

目的研究不同温度和聚乙二醇(PEG)模拟干旱胁迫对大黄种子萌发的影响,探讨大黄种子萌发的最适温度和对干旱胁迫的耐性。方法用6个温度(10、15、20、25、30、35℃)和6个聚乙二醇(PEG-6000,以下简称PEG)浓度(0、5%、10%、15%、20%、25%)模拟温度胁迫与干旱胁迫对大黄种子进行处理,置人工培养箱培育,借助SPSS 24.0单因素方差分析法对其发芽势、发芽率、胚根、胚轴和子叶等指标统计分析。结果温度与干旱胁迫对3种大黄种子萌发及幼苗生长有显著影响(P<0.05);同一温度下,3种大黄的种子萌发指标随PEG浓度的升高而降低,掌叶大黄和唐古特大黄幼苗各指标亦是随PEG浓度的升高而降低,而药用大黄幼苗各指标随着PEG浓度的升高先增加后减小,在低浓度PEG(5%)达到最大,25%PEG重度干旱时严重抑制掌叶大黄和唐古特大黄萌发(P<0.05),完全抑制药用大黄萌发;20℃或25℃下,各PEG浓度处理的3种大黄种子萌发及幼苗生长指标均达到最大值;在低于20℃或者高于25℃时,各PEG浓度下的指标呈下降趋势,35℃高温下种子萌发和幼苗生长指标随着PEG浓度的升高呈直线下降。结论掌叶大黄和唐古特大黄种子在各处理下所有指标均高于药用大黄,萌发的速度和整齐度较好,种子的活力高,表现出较强的抗旱性,轻度干旱环境有利于药用大黄幼苗生长,为大黄种质资源评价及规范种植研究与应用提供了理论依据。

关键词：大黄干旱温度交互胁迫种子萌发幼苗生长

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基于网络药理学研究南五味子对肝损伤的保护作用机制分析

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天然产物研究与开发 2020年第5期32卷 759-768页

作者：姜海慧唐凯张化为姜祎宋小妹黄文丽邓翀陕西中医药大学陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西省中药基础与新药研究重点实验室咸阳712046

通过网络药理学和分子对接的方式探究南五味子治疗肝损伤的作用机制。通过多个数据库检索并筛选出南五味子的活性成分和其治疗肝损伤的相关靶点。采用Cytoscape3.2.1软件构建活性成分-潜在靶点的网络图;运用String数据库做蛋白相互作用... 详细信息

通过网络药理学和分子对接的方式探究南五味子治疗肝损伤的作用机制。通过多个数据库检索并筛选出南五味子的活性成分和其治疗肝损伤的相关靶点。采用Cytoscape3.2.1软件构建活性成分-潜在靶点的网络图;运用String数据库做蛋白相互作用分析。使用R project对南五味子治疗肝损伤的关键靶点进行GO和KEGG的富集分析和网络构建,最后通过分子对接验证。最终筛选出南五味子有效化学成分31个,与肝损伤相关的靶点358个,KEGG富集分析主要在168条相关信号通路,分析表明南五味子可能通过PIK3CA、MAPK1、MAPK3、STAT3等核心靶点发挥作用,这些靶点主要富集Neuroactive ligand-receptor interaction、Proteoglycans in cancer、Prostate cancer、EGFR tyrosine kinase inhibitor resistance、Hepatitis B、ErbB signaling pathway等多条通路上,分子对接结果也显示良好的结合效果。本研究揭示了南五味子中的多成分作用于多靶点、多信号通路治疗肝损伤的作用机制,为生物实验提供理论基础。

关键词：网络药理学肝损伤南五味子作用机制分子对接

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