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中国海洋大学学报（自然科学版） 2021年第3期51卷 24-33页

作者：朱慧李嘉文绳秀珍唐小千邢婧战文斌中国海洋大学水产动物病害与免疫学实验室山东青岛266003 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室山东青岛266237

副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)是海水养殖动物弧菌病的主要病原菌之一。为实现对该菌的现场快速检测,本文以制备的兔抗副溶血弧菌多克隆抗体作为金标抗体,提取副溶血弧菌的外膜蛋白、鞭毛蛋白、胞外产物和全菌蛋白,以不同浓度的... 详细信息

副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)是海水养殖动物弧菌病的主要病原菌之一。为实现对该菌的现场快速检测,本文以制备的兔抗副溶血弧菌多克隆抗体作为金标抗体,提取副溶血弧菌的外膜蛋白、鞭毛蛋白、胞外产物和全菌蛋白,以不同浓度的4种抗原蛋白作为4条检测线(T1~T4),特别在T4线设置全菌蛋白,基于竞争免疫层析原理研制出副溶血弧菌胶体金快速检测试纸。使用该试纸检测了副溶血弧菌(***)、鳗弧菌(***)、溶藻弧菌(***)、哈维氏弧菌(***)和鱼肠道弧菌(***),检测结果表明其能够准确鉴别副溶血弧菌感染,排除其他菌的交叉反应干扰。副溶血弧菌快速检测试纸的最低检测限为5×105 cfu·mL^-1,感染副溶血弧菌的牙鲆组织的检测结果与ELISA结果一致。本文研制的试纸具有较高的特异性与准确性且操作简单,为现场快速检测副溶血弧菌提供了有力工具。

关键词：副溶血弧菌胶体金竞争免疫层析法抗原免疫交叉反应快速检测试纸

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温度对多肋藻小孢子体生长及抗氧化生理的影响

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中国水产科学 2022年第9期29卷 1300-1311页

作者：李国梁汪文俊李宝贤梁洲瑞鲁晓萍李晓捷中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室山东青岛266071 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能试验室山东青岛266237 山东东方海洋科技股份有限公司山东省海藻遗传育种与栽培技术重点实验室山东烟台264003

温度是影响藻类生长发育的关键因素之一。本研究探讨了6~22℃下,多肋藻(Costaria costata)小孢子体的生长情况及抗氧化生理特性,以探明其适温机制,为多肋藻海区栽培提供支撑。结果发现,培养初期(5 d内),多肋藻小孢子体在18℃下具有最大... 详细信息

温度是影响藻类生长发育的关键因素之一。本研究探讨了6~22℃下,多肋藻(Costaria costata)小孢子体的生长情况及抗氧化生理特性,以探明其适温机制,为多肋藻海区栽培提供支撑。结果发现,培养初期(5 d内),多肋藻小孢子体在18℃下具有最大的相对生长速率(RGR),22℃下藻体梢部严重穿孔溃烂;随着培养时间延长(10 d),10℃下藻体RGR最高。实验周期内,不同温度组间F_(v)/F_(m)无显著差异,6~14℃下藻体均具有较高的总光合速率(Pt)和最大表观光合速率(P_(nmax)),P_(nmax)随着培养时间的延长在10℃下最高。培养3 d时,6℃下呼吸速率(R_(d))最高;22℃下,藻体R_(d)随着培养时间延长显著上升,表明增强呼吸作用是多肋藻小孢子体对低温和高温胁迫的共同响应。22℃高温胁迫下,胡萝卜素(Car)和岩藻黄素(Fucox)、可溶性蛋白的含量升高;6℃时,SOD酶活高于其他温度组。在6~18℃范围内,灰分、碳水化合物和粗纤维的积累与温度具有一定的正相关性。综上,多肋藻小孢子体可在6~18℃生长,其中以10℃左右为佳。

关键词：多肋藻温度相对生长速率光合作用抗氧化系统生化组成

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DNA条形码技术及其在海洋贝类种质资源保护中的应用

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中国海洋大学学报（自然科学版） 2021年第5期51卷 18-23页

作者：李琪冉轲孔令锋海水养殖教育部重点实验室(中国海洋大学) 山东青岛266003 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室山东青岛266237

DNA条形码技术是一种新兴的分子鉴定方法,是指通过选择一段DNA基因序列片段作为条形码进行物种鉴定、系统发育研究和物种多样性保护等。海洋贝类种类丰富、数量众多,传统的形态分类方法有一定的局限性,对一些非常见及疑难物种不能快速... 详细信息

DNA条形码技术是一种新兴的分子鉴定方法,是指通过选择一段DNA基因序列片段作为条形码进行物种鉴定、系统发育研究和物种多样性保护等。海洋贝类种类丰富、数量众多,传统的形态分类方法有一定的局限性,对一些非常见及疑难物种不能快速、准确地鉴定。作为一种快速、高效的物种诊断技术,DNA条形码技术在海洋贝类种质资源保护与利用方面起到了至关重要的作用。本文就DNA条形码的产生、原理、分析步骤、优势、局限及在海洋贝类种质资源保护中的应用进展进行了综述,并对其未来的发展进行了分析展望。

关键词： DNA条形码海洋贝类种质资源物种诊断

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海水循环水系统中环境因子对大西洋鲑体内土腥味物质含量的影响

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中国海洋大学学报（自然科学版） 2021年第3期51卷 34-44页

作者：魏发奕韩萃李丽董双林高勤峰海水养殖教育部重点实验(中国海洋大学) 山东青岛266003 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室山东青岛266237

为获知不同时期封闭式海水循环水养殖系统中水质因子、浮游植物和细菌群落结构对大西洋鲑(Salmo salar)体内土腥味物质含量变化的影响,于2018—2019年4次采集封闭式海水循环水养殖系统的水样和大西洋鲑。测定水体的氨氮、亚硝氮、硝氮... 详细信息

为获知不同时期封闭式海水循环水养殖系统中水质因子、浮游植物和细菌群落结构对大西洋鲑(Salmo salar)体内土腥味物质含量变化的影响,于2018—2019年4次采集封闭式海水循环水养殖系统的水样和大西洋鲑。测定水体的氨氮、亚硝氮、硝氮、活性磷酸盐等指标,分析水体浮游植物群落结构并通过16S高通量测序测定水体中细菌群落结构,通过微波蒸馏-固相微萃取-气相色谱-质谱联用(MD-SPME-GC-MS)方法,分析大西洋鲑背肌中土臭素(Geosmin,GSM)和二甲基异冰片(2-methylisoborneol,MIB)的含量。研究发现:测定水质指标中温度、溶解氧、盐度、pH、氨氮、亚硝氮、硝氮、活性磷酸盐、总氮、总磷、总悬浮物和溶解性总有机碳在不同时期差异显著。共鉴定出浮游植物7门、13目、26属,蓝藻门(Cyanophyta)、硅藻门(Bacillariophyta)和绿藻门(Chlorophyta)为优势门;不同时期细菌群落中的优势菌门均为变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes),但细菌群落结构存在差异,这主要是由水质差异引起的。在不同时期,鱼体MIB含量均高于GSM含量,MIB为鱼体中主要的土腥味物质,在7和10月MIB含量较高。鱼体土腥味物质含量受浮游植物和细菌群落影响,而水质因子可能通过影响浮游植物和细菌群落的结构,来影响养殖鱼体内土腥味物质的含量。

关键词：大西洋鲑循环水养殖系统土臭素二甲基异冰片细菌群落水质

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基于多目标鱼种资源量指数估计的不同采样设计比较

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水产学报 2021年第5期45卷 700-715页

作者：张国晟王晶张崇良薛莹任一平徐宾铎中国海洋大学水产学院浙江海洋大学水产学院青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室海州湾渔业生态系统教育部野外科学观测研究站

经济高效的渔业资源调查采样有利于保证调查数据的质量,提高调查效率,从而为渔业科学研究提供可靠数据。根据2016—2017年山东近海渔业资源底拖网季度调查数据,以小黄鱼、矛尾虾虎鱼、方氏云鳚和星康吉鳗作为目标鱼种,使用Kriging插值... 详细信息

经济高效的渔业资源调查采样有利于保证调查数据的质量,提高调查效率,从而为渔业科学研究提供可靠数据。根据2016—2017年山东近海渔业资源底拖网季度调查数据,以小黄鱼、矛尾虾虎鱼、方氏云鳚和星康吉鳗作为目标鱼种,使用Kriging插值法模拟了目标鱼种在4个季节的相对资源量分布,设置简单随机抽样（SRS）、常规系统抽样（SYSr）、等距系统抽样（SYSh）、按水深分层随机抽样（StRSdepth）、按区域分层随机抽样（StRSregion）和综合水深和区域分层随机抽样（StRS_total）共6种备选采样设计方案,利用计算机模拟方法对Kriging插值数据进行再抽样,估计各目标鱼种资源量指数,以相对估计误差（relative estimation error, REE）和相对偏差（relative bias, RB）衡量估计结果的精准度,以准确度变化率（accuracy change rate,ACR）小于等于10%的标准确定最优调查站位数,比较不同采样设计在估计多目标鱼种资源量指数方面的表现并进行样本量优化。结果发现,3种抽样方法的估计准度不同,简单随机抽样<分层随机抽样<系统抽样。除系统抽样外,其余采样设计方案均为无偏估计。随调查站位数增加,系统抽样的REE表现出无规律波动趋势。分层随机抽样的REE略低于系统抽样,且随站位数增加而降低。分层随机抽样是最优抽样方法,StRS_total是最优分层方案。不同目标鱼种、季节调查所需站位数不同,StRS_total进行4季度调查的最优站位数可设为80。

关键词：多物种渔业资源调查采样设计资源量指数 Kriging插值计算机模拟山东近海

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三疣梭子蟹Pt-ddit4l基因的克隆及表达分析

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水生生物学报 2021年第2期45卷 334-340页

作者：阎德平吕建建陆璇张文题兴斌宋柳刘萍中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室青岛266071 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室青岛266071

为明确三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)DNA损伤诱导蛋白因子-4(DNA Damage Inducible Transcript like 4,DDIT4L)基因的结构和功能。利用RACE方法克隆获得三疣梭子蟹Pt-ditt4l基因全长。该基因序列全长2727 bp,其中ORF为507 bp,编码了一个168个氨基酸的蛋白,预测分子质量为19.14 kD,且在C端有一个高度保守的RTP801_C结构域。Blast相似性比对和系统进化树分析发现,Pt-ddit4l与凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)ddit4l基因的相似性最高为60%,且与凡纳滨对虾先聚为一支。梭子蟹不同发育阶段表达分析表明,Pt-ddit4l基因在发育早期发挥了一定的作用;组织表达分析显示,Pt-ddit4l基因在肝胰腺中的表达量最高,在血细胞中表达量最低。注射副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)后的感染实验表明,血细胞中Pt-ddit4l的表达量先上升后下降,在24h达到峰值,为对照组的8.85倍(P<0.05);而肝胰腺中则是整体呈下调的趋势,在72h时达到最低值,仅为对照组的1/40(P<0.05)。注射dsddit4l后该基因12—24h表达量显著下调,且注射dsddit4l后再进行弧菌感染的螃蟹的死亡率要显著远高于对照组。研究丰富了三疣梭子蟹DNA损伤诱导蛋白相关研究资料。

关键词：三疣梭子蟹 Pt-ddit4l 发育 RNA干扰副溶血弧菌

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半滑舌鳎雌、雄鱼myostatin基因差异表达的初步研究

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渔业科学进展 2022年第5期43卷 160-167页

作者：张梦倩崔忠凯陈张帆徐文腾陈松林中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室山东省海洋渔业生物技术与遗传育种重点实验室山东青岛266071 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)生长具有明显的性别二态性,性成熟雌鱼体重显著高于雄鱼。鱼体肌肉占体重的40%~60%,肌肉生长是生长性状的核心,而myostatin(mstn)基因是肌肉生长发育的负调控因子,对成肌细胞的增殖具有抑制作用。本研... 详细信息

半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)生长具有明显的性别二态性,性成熟雌鱼体重显著高于雄鱼。鱼体肌肉占体重的40%~60%,肌肉生长是生长性状的核心,而myostatin(mstn)基因是肌肉生长发育的负调控因子,对成肌细胞的增殖具有抑制作用。本研究旨在探究肌肉生长发育过程中,mstn基因在半滑舌鳎雌、雄鱼的时空表达模式及其与雌、雄鱼生长差异的关系。结果显示,在所检测的1龄鱼的9个组织中,mstn在肌肉中的表达量最高。不同发育时期的肌肉组织定量结果显示,1龄和2龄雄鱼中的表达量显著高于雌鱼(P<0.05),而在选取的其他时期,雌、雄鱼之间的表达量不存在显著差异。原位杂交结果显示,mstn基因的表达位置在肌纤维边缘,即成肌细胞增殖分化的位置。本文系统研究了肌肉生长发育的负调控因子mstn在半滑舌鳎雌、雄鱼中的时空表达模式,为深入研究半滑舌鳎雌、雄鱼生长差异的原因及其机制提供了基础。

关键词：半滑舌鳎 myostatin 肌肉生长发育 qRCR 原位杂交

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海洋浮游植物初级生产力及碳生物量的检测技术研究进展

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海洋科学 2023年第8期47卷 131-140页

作者：王庆轩崔正国曲克明王庆奎魏玉秋孙军天津农学院水产学院天津市水产生态及养殖重点实验室天津300392 中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室山东青岛266071 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室山东青岛266071 中国地质大学广州南沙地大滨海研究院广东广州511462

浮游植物是海洋生态系统中的主要初级生产者,构建海洋食物网、生物泵和元素循环(包括碳循环、氮循环和硅循环等)的基石。因此,海洋生态系统中的元素循环和能量流动均与浮游植物的生长和代谢息息相关。海洋碳循环是全球碳循环的关键环节... 详细信息

浮游植物是海洋生态系统中的主要初级生产者,构建海洋食物网、生物泵和元素循环(包括碳循环、氮循环和硅循环等)的基石。因此,海洋生态系统中的元素循环和能量流动均与浮游植物的生长和代谢息息相关。海洋碳循环是全球碳循环的关键环节,也是全球生态系统中生物地化循环的重要组成部分。尽管浮游植物在海洋碳循环中起着至关重要的作用,但是直接测定浮游植物的初级生产力和碳生物量依旧受到传统技术和方法的限制。本文详细介绍了有关浮游植物初级生产力和碳生物量检测的各种技术和方法,列举了其各自的优缺点。目前,测定海洋浮游植物初级生产力的主要方法有黑白瓶法、遥感估算法、碳同位素测定、快速重复率荧光法;测定海洋浮游植物碳生物量的主要方法有细胞体积转换法、流式细胞术、电子探针X射线显微分析、分位数回归模型估算法。通过对比分析发现碳同位素与快速重复率荧光法相结合可以更高效测定出初级生产力,而最具优势与应用前景的碳生物量检测方法是基于分位数回归模型估算法。其中,基于分位数回归模型估算法具有拟合异常值、测定结果准确等优势,能够实现现场浮游植物群落以及各个功能群碳生物量的估算,并能够与卫星遥感技术手段相结合,可以应用于大尺度和长时间序列的海洋浮游植物碳生物量估算。通过本文的综述,一方面为海洋浮游植物初级生产力和碳含量的研究提供一个基本和系统的认识,另一方面为深入研究浮游植物在海洋碳循环以及全球碳循环中的作用提供参考。

关键词：浮游植物初级生产力碳生物量碳循环检测方法分位数回归模型

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侏儒蛤（Mulinia lateralis）温度感受器TRP通道的鉴定与表达分析

侏儒蛤（Mulinia lateralis）温度感受器TRP通道的鉴定与表达分析

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中国动物学会·中国海洋湖沼学会贝类学分会换届大会暨第二十一次全国贝类学术讨论会

作者：陈晓菲杨祖晶赵昂隋明益钟帅黄晓婷中国海洋大学海洋生命学院海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室

瞬时感受器电位(Transient receptor potential,TRP)家族在介导多种感觉生理功能方面作用显著,能被细胞内外的化合物、信使分子、温度以及机械等刺激激活,参与多种细胞过程,具有复杂的调节方式。近年来,贝类养殖业夏季死亡率高,其如何... 详细信息

瞬时感受器电位(Transient receptor potential,TRP)家族在介导多种感觉生理功能方面作用显著,能被细胞内外的化合物、信使分子、温度以及机械等刺激激活,参与多种细胞过程,具有复杂的调节方式。近年来,贝类养殖业夏季死亡率高,其如何根据环境和生理状态感知和响应高温以求生存仍然存在很大的未知,仅有少量贝类的TRP家族基因获得了鉴定。因此,本研究以世代周期短、能够在实验室大规模养殖的潜在模式贝侏儒蛤(Mulinia lateralis)为研究对象,系统鉴定了侏儒蛤基因组中的15个TRP通道(分属于4个TRP亚家族)。所有侏儒蛤TRP家族基因中均包含由六个跨膜区组成的离子通道结构,其TRP的序列和结构特征与其他物种的TRP通道高度保守。时空表达谱分析表明,一些TRP基因参与了侏儒蛤早期胚胎发育的的细胞分裂和成体组织感觉过程。Ml TRPM2和Ml TRPM2b自受精卵至壳顶幼虫时期均呈现出高表达,暗示这两个TRP通道在侏儒蛤胚胎发育早期的细胞分裂中发挥重要作用。Ml TRPC-gamma自囊胚期开始表达,推测这些基因参与胚层的形成,并随着不同组织器官的发育而表达。在成体各组织中,Ml TRPA1和Ml TRPV-Nan2在外套膜、鳃或闭壳肌中表达量较高;Ml TRPA1-homolog3和Ml TRPM2在足中表达量较高,暗示其是参与侏儒蛤机械刺激感觉的重要感受器。在高温胁迫下,部分TRPA1亚家族成员表达明显上调,暗示TRPA1为侏儒蛤的温度感受器,这也与先前无脊椎动物中关于TRPA亚家族基因响应热刺激的研究结果一致。本研究首次对侏儒蛤的TRP通道进行了系统的研究,对进一步解析贝类感知外界温度变化的分子机制和热适应性研究提供了宝贵的资源。

关键词：侏儒蛤瞬时感受器电位通道家族时空表达高温胁迫

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Tc1/Mariner转座子超家族在褶皱臂尾轮虫中的进化和表达分析

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中国海洋大学学报（自然科学版） 2022年第4期52卷 62-74页

作者：范正杰王玉珏张全启中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室山东青岛266003 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室山东青岛266237 中国海洋大学三亚海洋研究院海南省热带水产种质重点实验室海南三亚572000

为了探究Tc1/Mariner转座子超家族对褶皱臂尾轮虫(Brachionus plicatilis)基因组结构和基因表达调控的影响,本研究基于褶皱臂尾轮虫的基因组和转录组数据,对褶皱臂尾轮虫的重复序列进行了注释,并对褶皱臂尾轮虫的转座子的表达和其临近... 详细信息

为了探究Tc1/Mariner转座子超家族对褶皱臂尾轮虫(Brachionus plicatilis)基因组结构和基因表达调控的影响,本研究基于褶皱臂尾轮虫的基因组和转录组数据,对褶皱臂尾轮虫的重复序列进行了注释,并对褶皱臂尾轮虫的转座子的表达和其临近基因的表达进行了统计和富集,在基因上下游及内部区域富集到了10个转座子家族(其中3个家族属于Tc1/Mariner超家族)。在针对褶皱臂尾轮虫的Tc1/Mariner超家族分析中,共发现其7个亚家族:Tc1(DD34E)、Tc2(DD35D)、Mariner(DD34D)、Pogo(DDxD)、Sagan(DD30D)、Tigger(DD32/36D)和Fot1(DD30D),并主要分布在基因间区,对转座酶催化区域的结构和系统发育分析显示拥有完整转座酶的3个亚家族(Tc1、Tc2和Pogo)保守性强且聚类情况良好。基于转录组数据发现各个家族的表达模式较为相似,在雄性阶段表达较高。Tc1/Mariner超家族临近基因的功能大量涉及到环境信息处理和生物发育调节,反映了褶皱臂尾轮虫基因组对环境的适应。本研究通过对褶皱臂尾轮虫Tc1/Mariner转座子超家族在基因组中的进化和表达进行系统分析,为从功能角度认知Tc1/Mariner转座子并理解Tc1/Mariner对基因组进化的作用提供了新的线索。

关键词：褶皱臂尾轮虫 Tc1/Mariner 转座子系统发育表达分析

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