检索结果-内蒙古大学图书馆

饲料研究 2023年第22期46卷 156-159页

作者：丁维芹孙永刚韩银仓青海大学畜牧兽医科学院青海西宁810016 青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室青海西宁810016

动物机体脂肪的主要生理功能是储存能源,按照分布位置可分为皮下脂肪(SF)、肌内脂肪(IMF)和内脏脂肪(VF),按照结构、来源和功能可分为白色脂肪(WAT)、棕色脂肪(BAT)和米色脂肪(BeAT)。脂肪代谢分为合成代谢和分解代谢,其影响动物的生产... 详细信息

动物机体脂肪的主要生理功能是储存能源,按照分布位置可分为皮下脂肪(SF)、肌内脂肪(IMF)和内脏脂肪(VF),按照结构、来源和功能可分为白色脂肪(WAT)、棕色脂肪(BAT)和米色脂肪(BeAT)。脂肪代谢分为合成代谢和分解代谢,其影响动物的生产效率、生产成本和肉品质等。牦牛作为地方特色品种,承担着当地畜牧经济的重任,其脂肪代谢调控机制复杂。文章从牦牛脂肪分类、脂肪代谢及其影响因素和相关基因等内容,综述了年龄、品种、性别、饲养管理、营养因素以及多种脂肪代谢相关基因、非编码RNA的调控对牦牛脂肪代谢的影响,以期促进优良品种的选育,为牦牛脂肪代谢提供研究思路,也为提高养殖效益提供参考。

关键词：牦牛脂肪代谢脂肪沉积影响因素

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不同氧浓度下猪睾丸间质细胞转录组分析

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中国畜牧兽医 2023年第6期50卷 2185-2195页

作者：陈楷文赵云娇王磊张剑搏马玉红吴国芳青海大学畜牧兽医科学院(青海省畜牧兽医科学院) 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室西宁810016

【目的】研究不同氧浓度下猪睾丸间质细胞表达谱差异,筛选缺氧导致猪睾丸间质细胞损伤的关键基因。【方法】将猪睾丸间质细胞分为缺氧组(1%氧气,H24组)、正常组(15.75%氧气,N24组),每组3个重复,在相应条件下分别处理24 h,用CCK8法检测... 详细信息

【目的】研究不同氧浓度下猪睾丸间质细胞表达谱差异,筛选缺氧导致猪睾丸间质细胞损伤的关键基因。【方法】将猪睾丸间质细胞分为缺氧组(1%氧气,H24组)、正常组(15.75%氧气,N24组),每组3个重复,在相应条件下分别处理24 h,用CCK8法检测细胞存活率;利用转录组测序技术筛选出缺氧组和正常组睾丸间质细胞中的差异表达基因,利用DESeq 2.0软件进行差异表达基因分析,并对差异表达基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,进一步筛选与氧含量相关的调控基因。【结果】缺氧刺激24 h后,与正常组相比,缺氧组猪睾丸间质细胞存活率极显著降低(P<0.01);转录组测序共获得1654个差异表达基因,其中1242个基因上调,412个基因下调。GO功能富集分析发现,共获得富集条目8条,其中生物过程1条,分子功能7条;KEGG通路富集分析发现,共获得10个显著富集的信号通路,包括HIF-1信号通路、JAK-STAT信号通路和糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路等。通过GO功能和KEGG通路富集分析共获得6个与缺氧应激相关的基因,分别为信号传导及转录激活蛋白5(signal transducer and activator of transcription 5,STAT5)、白细胞介素-8(interleukin-8,IL-8)、CC基元趋化因子配体2(C-C motif chemokine ligand 2,CCL2)、Ⅰ型干扰素受体1(interferon alpha and beta receptor subunit 1,IFNAR1)、细胞因子信号传导抑制因子1(suppressor of cytokine signaling 1,SOCS1)和红细胞生成素(erythropoietin,EPO)。【结论】本研究通过对不同氧浓度下猪睾丸间质细胞进行转录组分析,获得了SOCS 1、IFNAR 1、EPO、STAT 5、IL-8和CCL 26个与猪睾丸间质细胞缺氧损伤和应激修复相关的基因,为解决高原地区公猪生殖能力低下的研究提供参考。

关键词：缺氧猪睾丸间质细胞生殖损伤转录组测序

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益生菌发酵饲料条件优化及营养价值评定

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家畜生态学报 2023年第9期44卷 12-18页

作者：万里吴国芳王磊姚志芳张志鹏张俊峰青海大学畜牧兽医科学院/青海省高原放牧家畜动物营养与饲料科学重点实验室青海西宁810016 青海省高原家畜遗传资源保护及创新利用重点实验室青海西宁810016

为探究不同发酵条件对益生菌发酵饲料品质的影响,本试验选用毕赤酵母菌JZ10发酵精补料,采用3因素(接种量、水料比、温度)3水平正交设计对发酵条件进行优化,随机分为9个组,测定每组饲料中的氨态氮(NH_(3)-N)、可溶性糖(SS)、淀粉(ST)、pH... 详细信息

为探究不同发酵条件对益生菌发酵饲料品质的影响,本试验选用毕赤酵母菌JZ10发酵精补料,采用3因素(接种量、水料比、温度)3水平正交设计对发酵条件进行优化,随机分为9个组,测定每组饲料中的氨态氮(NH_(3)-N)、可溶性糖(SS)、淀粉(ST)、pH,使用极差分析法找到综合指标最优的组合,测定饲料常规营养成分、霉菌毒素含量,从而确定最佳发酵时间。结果表明:(1)pH最优组为F3(接种量5%、发酵温度30℃、水料比1∶1),ST最优组为F_(1)(接种量5%、发酵温度30℃、水料比0.4∶1),NH_(3)-N最优组为F5(接种量10%、发酵温度25℃、水料比1∶1),SS最优组为F4(接种量10%、发酵温度20℃、水料比0.6∶1)。(2)发酵第5天,粗蛋白(CP)、ST、SS含量显著升高(P<0.05),pH、黄曲霉毒素B_(1)(AFB_(1))、呕吐毒素(DON)含量显著降低(P<0.05)。发酵第7天,中性洗涤纤维(NDF)、酸性洗涤纤维(ADF)、玉米赤霉烯酮(ZEN)含量显著降低(P<0.05),NH 3-N含量显著升高(P<0.05)。精补料的最佳发酵条件为接种量10%,温度25℃,水料比1∶1,发酵时间5~7 d,可提高饲料的营养成分,降低霉菌毒素的含量。

关键词：毕赤酵母菌精补料条件优化营养价值

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低蛋白日粮不同氨基酸平衡模式对藏香猪生产性能、肉品质的影响

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中国饲料 2023年第9期 105-113页

作者：张俊峰王磊吴国芳万里张志鹏青海大学畜牧兽医科学院青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室青海西宁810016

为探究低蛋白质(LP)日粮不同氨基酸(AA)平衡模式对藏香猪生产性能、肉品质的影响,选取4月龄健康藏香猪36头,按照平均体重接近的原则,随机分为3组,每组3个栏,每个栏4头猪,分别饲喂藏香猪肉氨基酸比例日粮(TPM组)、中国NYT 2004地方猪氨... 详细信息

为探究低蛋白质(LP)日粮不同氨基酸(AA)平衡模式对藏香猪生产性能、肉品质的影响,选取4月龄健康藏香猪36头,按照平均体重接近的原则,随机分为3组,每组3个栏,每个栏4头猪,分别饲喂藏香猪肉氨基酸比例日粮(TPM组)、中国NYT 2004地方猪氨基酸比例日粮(NYT组)、美国NRC 2012猪营养氨基酸比例日粮(NRC组)。结果表明:(1)NYT组、NRC组的末体重较TPM组分别提高35.60%、46.92%(P <0.05),平均日增重较TPM组分别提高74.77%、98.45%(P <0.05),平均日采食量较TPM组分别提高8.19%、22.72%(P <0.05),料重比较TPM组分别降低37.64%、38.15%(P <0.05)。(2)NYT组、NRC组的胴体重较TPM组分别提高54.40%、94.97%(P <0.05),眼肌面积较TPM组分别提高78.70%、118.70%(P <0.05),屠宰率较TPM组分别提高13.81%、30.51%(P <0.05)。(3)NRC组熟肉率较TPM组提高7.75%,肉色b降低22.46%(P <0.05)。(4)NRC组肌肉中辛酸、十三酸、花生酸、二十四碳酸、棕榈油酸、十七碳酸、芥酸、神经酸、二十二碳六烯酸含量较TPM组提高66.66%、85.71%、50.00%、50.00%、200.00%、32.54%、37.68%、100.00%、33.33%(P <0.05),而棕榈酸、二十三碳酸、外周血红细胞膜脂肪酸、二十碳三烯酸含量较TPM组降低33.33%、33.33%、51.08%、14.86%(P <0.05),NYT组、NRC组共轭亚麻酸较TPM组提高13.66%、19.43%(P <0.05),γ-亚麻酸较TPM组降低11.80%、10.07%(P <0.05),α-亚麻酸较TPM组降低20.54%、17.07%(P <0.05)。(5)NYT组精氨酸、谷氨酸、甘氨酸、丙氨酸含量含较TPM组降低18.04%、27.94%、19.23%、21.30%(P <0.05),而组氨酸含量较TPM组提高57.83%(P <0.05)。(6)NRC组粗蛋白质、粗脂肪、中性洗涤纤维、钙表观消化率较TPM组提高32.75%、3.09%、20.40%、10.94%(P <0.05)。综上,日粮低蛋白条件下,与TPM组和NYT组日粮氨基酸比例相比,NRC组日粮氨基酸比例能够显著提高藏香猪生产性能和肉品质、营养表观消化率,是最佳氨基酸平衡模式。

关键词：低蛋白日粮氨基酸平衡模式生产性能肉品质表观消化率

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基于mtDNA D-loop序列探究门源白牦牛与天祝白牦牛间的遗传差异

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中国畜牧兽医 2021年第5期48卷 1647-1654页

作者：李广祯马志杰陈生梅尕布藏李瑞哲青海大学畜牧兽医科学院青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室西宁810016 青海省门源县苏吉滩乡兽医站西宁810399

为从分子水平上探究青海省门源白牦牛与甘肃省天祝白牦牛间的母系遗传差异,本研究对31头门源白牦牛mtDNA D-loop区部分序列进行测定,结合GenBank中已报道的235条天祝白牦牛相应序列,对共计266条白牦牛D-loop序列进行了综合分析。结果表... 详细信息

为从分子水平上探究青海省门源白牦牛与甘肃省天祝白牦牛间的母系遗传差异,本研究对31头门源白牦牛mtDNA D-loop区部分序列进行测定,结合GenBank中已报道的235条天祝白牦牛相应序列,对共计266条白牦牛D-loop序列进行了综合分析。结果表明,在截取的638 bp白牦牛D-loop区分析序列中,排除64处插入或缺失后共检测到80个多态位点,包括5个单一多态位点和75个简约信息位点。根据序列间核苷酸变异共确定了56种单倍型,其中门源白牦牛拥有特有单倍型7种,天祝白牦牛包含特有单倍型43种,二者共享的单倍型只有2种。门源白牦牛单倍型只分布在A、B和C单倍型组中,而天祝白牦牛单倍型分布在A、B、C、D、E和F单倍型组中,并含有4种普通牛单倍型序列,提示天祝白牦牛中存在普通牛遗传渗入。门源白牦牛单倍型多样度为0.862,核苷酸多样度为0.007,而天祝白牦牛单倍型多样度为0.946,核苷酸多样度为0.014,表明天祝白牦牛的遗传多样性水平高于门源白牦牛。门源白牦牛与天祝白牦牛间的遗传分化指数(Fst)为0.114,表明2个品种(群体)间呈中等分化水平。系统发育分析结果显示,56种单倍型可分为2个明显的分支(即Ⅰ和Ⅱ),表明白牦牛有2个母系起源。综上所述,天祝白牦牛的遗传多样性水平高于门源白牦牛,门源白牦牛母系遗传多样性较低;2个品种(群体)间呈中等遗传分化水平,天祝白牦牛存在一定程度的普通牛基因渗入;2个品种(群体)均由2个母系支系组成,提示白牦牛有2个母系起源。鉴于2个品种(群体)间呈中等遗传分化水平,且都拥有特有的单倍型遗传信息,故建议将其均作为独立的“遗传单元”进行遗传资源保护进而开展保种和选育实践。

关键词：白牦牛 mtDNA D-loop区遗传多样性分化母系起源

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牦牛全基因组关联研究进展

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中国畜牧杂志 2024年第12期60卷 41-47页

作者：徐宇辉吴志鹏盛欣李瑞哲马志杰青海大学畜牧兽医科学院青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室青海西宁810016 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室青海西宁810016

全基因组关联研究(Genome-wide Association Study,GWAS)是利用全基因组范围内高密度的分子标记,以连锁不平衡为基础研究动植物复杂性状遗传机制的一种群体遗传学方法。通过GWAS挖掘影响牦牛重要性状的候选基因,探究表型与基因型间的关... 详细信息

全基因组关联研究(Genome-wide Association Study,GWAS)是利用全基因组范围内高密度的分子标记,以连锁不平衡为基础研究动植物复杂性状遗传机制的一种群体遗传学方法。通过GWAS挖掘影响牦牛重要性状的候选基因,探究表型与基因型间的关系,并将鉴定到的候选基因应用于其分子育种实践中,能够加快牦牛的选育效率,进而提高经济效益。本文介绍了GWAS的基本原理、研究策略及优缺点,综述了GWAS在牦牛生长发育、毛、角等性状研究中取得的研究进展,以期为今后深入解析牦牛经济性状的遗传机理以及开展牦牛分子育种实践提供参考。

关键词： GWAS 性状 QTL 牦牛

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牦牛输卵管壶腹部与峡部的转录组学差异分析

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中国畜牧杂志 2024年第5期60卷 225-232页

作者：李瑞哲徐惊涛马志杰李文浩彭巍陈生梅青海大学畜牧兽医科学院青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室青海省牦牛工程技术研究中心青海西宁810016

输卵管是配子和受精卵的运输通道,在受精和早期胚胎发育中起重要作用。为深入研究牦牛输卵管不同解剖部位功能差异的分子基础,本研究对发情期母牦牛输卵管壶腹部、峡部进行了转录组测序,筛选出1395个差异表达基因,其中500个基因在壶腹... 详细信息

输卵管是配子和受精卵的运输通道,在受精和早期胚胎发育中起重要作用。为深入研究牦牛输卵管不同解剖部位功能差异的分子基础,本研究对发情期母牦牛输卵管壶腹部、峡部进行了转录组测序,筛选出1395个差异表达基因,其中500个基因在壶腹部高表达,895个基因在峡部高表达。基因功能分析及通路富集结果表明,壶腹部上调差异表达基因主要与上皮细胞的完整性、细胞增殖、细胞突起、纤毛、精子运动性、受精过程有关,峡部上调差异表达基因主要与平滑肌收缩、胞外基质、解剖形态和系统发育、精子获能和储存有关。本研究从转录组层面解释了牦牛输卵管壶腹部和峡部形态结构及功能差异的原因,为进一步研究牦牛输卵管不同解剖部位的生理功能提供了基础数据。

关键词：牦牛输卵管腹壶部峡部转录组

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青海欧拉羊(Ovis aries)群体中角发育控制基因RXFP2的选择信号分析

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基因组学与应用生物学 2024年第3期43卷 442-452页

作者：张强龙吴森阎明毅韩翠余忠祥青海大学畜牧兽医科学院西宁810016 青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室西宁810016 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室西宁810016

欧拉羊(Oula sheep)属于藏羊(Tibetan sheep)的一个分支。不同于其他国内外绵羊(Ovis aries)品种,欧拉羊的公母羊皆生有大犄角。这是长期放牧条件下自然选择的结果,但其大犄角不利于现代高效畜牧业生产需求。已有较多研究把绵羊无角性... 详细信息

欧拉羊(Oula sheep)属于藏羊(Tibetan sheep)的一个分支。不同于其他国内外绵羊(Ovis aries)品种,欧拉羊的公母羊皆生有大犄角。这是长期放牧条件下自然选择的结果,但其大犄角不利于现代高效畜牧业生产需求。已有较多研究把绵羊无角性状的主效控制基因定位于绵羊10号染色体上的RXFP2基因,但RXFP2基因在不同绵羊品种中的调控作用仍有差别。为加快青藏高原地区无角绵羊品种培育,本研究对青海有角型、无角型欧拉羊成年母羊各15只进行了10×深度的基因组重测序,采用F_(ST)选择性消除定位角表型主要选择基因,并对欧拉羊RXFP2基因CDS区域及上下50 kbp区域以2000 bp窗口、1000 bp步长进行扫描,对获得的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)进行Tajima′s D、π、FST选择分析。结果发现,欧拉羊RXFP2基因及3′下游区域存在强选择信号。通过对RXFP2基因编码区SNP筛选,挖掘了欧拉羊中4个高质量SNPs,分别是位于RXFP2基因第9、第14外显子的同义突变(g.29458690A>G,g.29446067T>C)和第17外显子的2个非同义突变(g.29439053C>T,g.29439011C>T);突变区域均处于无角、有角欧拉羊RXFP2基因的强选择区域。本研究结果可为无角欧拉羊品种(品系)培育相关分子辅助选择工作提供技术和理论依据,有助于加快无角欧拉羊品种培育的早期选种工作。

关键词：欧拉羊(Ovis aries) 无角欧拉羊全基因组选择分子辅助育种 RXFP2

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牦牛基因组结构变异研究进展

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中国草食动物科学 2024年第5期44卷 64-70页

作者：刘瑞林徐东辉李瑞哲陈生梅马志杰青海大学畜牧兽医科学院西宁810016 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室西宁810016 青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室西宁810016

基因组结构变异(Structural variation,SV)通常是指基因组内影响DNA序列长度或方向导致其发生变化的变异形式,包括缺失、插入、重复、易位和倒位。SV通过基因剂量效应和位置效应直接或间接影响基因的表达,进而导致物种发生表型变异。近1... 详细信息

基因组结构变异(Structural variation,SV)通常是指基因组内影响DNA序列长度或方向导致其发生变化的变异形式,包括缺失、插入、重复、易位和倒位。SV通过基因剂量效应和位置效应直接或间接影响基因的表达,进而导致物种发生表型变异。近10年来,随着全基因组重测序技术和高密度芯片技术的快速发展,牦牛基因组SV研究也取得了重要进展。本文就基因组SV类型、形成机制和检测方法进行阐释,并将近10年来牦牛基因组SV的研究现状进行了综述,以期为牦牛组学的深入研究、加快牦牛分子育种进程提供参考。

关键词：牦牛基因组结构变异

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5个牛种X染色体单纯型微卫星分布规律及其差异研究

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中国畜牧杂志 2024年第4期60卷 176-183页

作者：徐宇辉徐东辉曹萍孙永刚李瑞哲马志杰青海大学畜牧兽医科学院青海西宁810016 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室青海西宁810016 青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室青海西宁810016

为探究牦牛、普通牛、瘤牛、水牛和印度野牛X染色体基因组序列中单纯型微卫星(Perfect Microsatellites)的分布规律及其差异,本研究利用Krait v 1.4.0软件对以上5个牛种X染色体基因组中的单纯型SSRs序列进行了检测,并对其分布特征进行... 详细信息

为探究牦牛、普通牛、瘤牛、水牛和印度野牛X染色体基因组序列中单纯型微卫星(Perfect Microsatellites)的分布规律及其差异,本研究利用Krait v 1.4.0软件对以上5个牛种X染色体基因组中的单纯型SSRs序列进行了检测,并对其分布特征进行了综合分析。结果表明,在牦牛、普通牛、瘤牛、水牛和印度野牛的X染色体基因组序列中分别筛选到41321、44200、44075、45206个和45701个单纯型SSRs;普通牛X染色体中的单纯型SSRs相对频率最高(317.96 loci/Mb),其次是水牛(315.70 loci/Mb)、印度野牛(312.74 loci/Mb)和牦牛(303.08 loci/Mb),而瘤牛最低(296.16 loci/Mb);水牛X染色体中单纯型SSRs序列总长度占比最高(0.58%),普通牛(0.57%)、牦牛(0.57%)和印度野牛(0.56%)次之,瘤牛最低(0.53%)。5个牛种的X染色体中,单碱基重复类型的SSRs相对频率均最高,其次是两碱基、三碱基、五碱基、四碱基和六碱基重复类型,且单碱基、两碱基、三碱基、四碱基和五碱基重复类型中单纯型SSRs数量最多的重复拷贝类别相同,分别是A、AC、AGC、AAAT和AACTG,普通牛六碱基重复类型中AACCCT重复拷贝类别的SSRs数量最多,牦牛、瘤牛、水牛和印度野牛则是AAAAAC重复拷贝类别的SSRs数量最多。各牛种间相同重复类型的SSRs其重复单元的拷贝数集中的范围基本一致,6种重复类型的SSRs其重复单元的拷贝数分别集中在12~28次(单碱基)、7~24次(两碱基)、5~13次(三碱基)、4~8次(四碱基)、4~7次(五碱基)和4~10次(六碱基)。5个牛种X染色体上单纯型SSRs的分布模式均为非随机分布,部分单纯型SSRs(如重复基序为AT、ATCC、AACCCG的SSRs)倾向于聚集在X染色体的某一个区域,各牛种X染色体中发生聚集的SSRs类别和区域存在差异,显示单纯型SSRs在各牛种X染色体中拥有独特的分布模式。本研究结果为深入了解各牛种X染色体基因组序列中单纯型SSRs的组成和分布特征提供了参考,并为进一步探讨各牛种X染色体基因组中重复序列的进化规律和生物学功能奠定了基础。

关键词：牛种 X染色体微卫星频率密度

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