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广西植物 2025年

作者：才让扎西胡夏宇刘玉萍苏旭刘涛毛轩睿徐玉洁杨萍张朋辉郑长远青海师范大学生命科学学院青海师范大学青海省青藏高原生物多样性形成机制与综合利用重点实验室

为明确苦豆子（Sophora alopecuroides）的叶绿体基因组特征及其系统发育位置，该研究利用Illumina平台对苦豆子叶绿体基因组进行测序，并且通过生物信息学方法进行了叶绿体基因组装、注释和特征分析，基于叶绿体基因组和单拷贝直系同... 详细信息

为明确苦豆子（Sophora alopecuroides）的叶绿体基因组特征及其系统发育位置，该研究利用Illumina平台对苦豆子叶绿体基因组进行测序，并且通过生物信息学方法进行了叶绿体基因组装、注释和特征分析，基于叶绿体基因组和单拷贝直系同源基因分别对苦豆子进行系统发育研究以及分歧时间估计。结果表明：（1）苦豆子叶绿体基因组全长154 399 bp，呈典型的四分体结构，GC含量36.6%；编码84个蛋白基因，37个t RNA基因和8个r RNA基因；（2）共检测到94个以单核苷酸A/T重复类型为主的简单重复序列（simple sequence repeats, SSR）位点，主要分布于基因间隔区；（3）亮氨酸（Leu）是苦豆子叶绿体基因组使用频率最高的氨基酸（10.39%），相对同义密码子使用频率（relative synonymous codon usage, RSCU）大于1且ΔRSCU≥0.08的密码子有21个，均以A/U结尾，偏好性受突变与自然选择的综合作用；（4）选择压力分析表明，苦豆子叶绿体基因组中ycf2基因受到正选择作用；（5）基于叶绿体基因组序列和利用转录组/基因组筛选出的单拷贝直系同源基因序列构建的系统发育树拓扑结构并非完全相同，但结果均显示苦豆子与白刺花（Sophora davidii）具有较近的亲缘关系；分歧时间估计表明，以叶绿体基因组为参考估计出的苦豆子分化时间（8.05 Mya）远小于以单拷贝直系同源基因为参考（18.28 Mya）。该研究明晰了苦豆子的叶绿体基因组特征，获得苦豆子较为合理的系统发育位置和分化时间，为后续探讨苦参属系统发育关系、遗传多样性、种质资源筛选与利用等提供了基础数据和参考价值。

关键词：苦豆子叶绿体基因组密码子偏好性系统发育选择压力

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基于优化MaxEnt模型的云雾龙胆潜在适生区预测

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植物研究 2025年

作者：索南吉曾太乙亥陈程浩苗琪孙芳慧陈曦才让拉毛夏京青海师范大学生命科学学院青海省青藏高原生物多样性形成机制与综合利用重点实验室青海省藏医院

云雾龙胆（Gentiana nubigena）是主要分布在青藏高原的中国特有种，是具有药用功能和观赏价值的重要资源植物。预测未来气候变化条件下云雾龙胆适宜生境的空间变化趋势，可为其开发利用和保护提供理论指导。该研究基于优化的MaxEnt模型... 详细信息

云雾龙胆（Gentiana nubigena）是主要分布在青藏高原的中国特有种，是具有药用功能和观赏价值的重要资源植物。预测未来气候变化条件下云雾龙胆适宜生境的空间变化趋势，可为其开发利用和保护提供理论指导。该研究基于优化的MaxEnt模型和ArcGIS空间分析技术，结合云雾龙胆在青藏高原的分布点位信息与生物气候数据，预测了云雾龙胆在当前和未来4个不同时期（2030s、2050s、2070s和2100s）的潜在分布格局，并分析了影响其分布的关键环境因素。结果显示：（1）年降水量（Bio12）、海拔（Elev）、温度季节性变化（Bio4）和最冷月最低温度（Bio6）是影响云雾龙胆地理分布的主要环境因素，累计贡献率达99.1%，年降水量是影响云雾龙胆分布最重要的环境因子。（2）在当前气候背景下，云雾龙胆总适生区面积为148.38×104km2，高适生区面积为32.63×104km2，占总适生区的21.99%，集中分布于青藏高原的东部和东南部地区。（3）与当前分布相比，在SSP126气候情景下未来4个时期（2030s、2050s、2070s和2100s）适生区总体呈现稳定的趋势，2050s和2070s 2个时期适生区有较大程度的退缩。云雾龙胆的地理分布主要受降水和海拔的影响，其适宜性生境在2050s和2070s将面临一定程度的锐减风险。

关键词：气候变化生境适宜性青藏高原云雾龙胆最大熵模型

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气候变化背景下青藏高原特有药用植物水母雪兔子的潜在分布区预测

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草地学报 2025年第3期33卷 910-918页

作者：孙成林刘玉萍苏旭李小莉张朋辉曲荣举靳佳瑞杨倩余明君宋昌春青海师范大学生命科学学院青海西宁810008 青海师范大学青海省青藏高原生物多样性形成机制与综合利用重点实验室青海西宁810008 青海师范大学高原科学与可持续发展研究院青海西宁810016

为了明确水母雪兔子(Saussurea medusa)的潜在适宜分布区和适宜生境,本研究利用水母雪兔子的分布记录和气候变量数据,采用MaxEnt模型和ArcGIS软件预测了不同气候变化背景下水母雪兔子的潜在分布区。结果表明,MaxEnt模型对水母雪兔子潜... 详细信息

为了明确水母雪兔子(Saussurea medusa)的潜在适宜分布区和适宜生境,本研究利用水母雪兔子的分布记录和气候变量数据,采用MaxEnt模型和ArcGIS软件预测了不同气候变化背景下水母雪兔子的潜在分布区。结果表明,MaxEnt模型对水母雪兔子潜在分布区预测可信度高,AUC值均高于0.95;海拔、最暖季度降水量、年平均气温、降水量季节性变化是影响其潜在分布区的主要环境因子;末次间冰期、末次盛冰期和全新世中期水母雪兔子高适生区主要分布于青海东部、四川和云南西北部等地;当前和未来(2050年和2070年),高适生区主要分布于四川西北部、甘肃南部、西藏东部、青海东北部等地,分布区面积有所增加,主要向云南南部、西藏东南部等低纬度地区扩张。据此,我们认为青藏高原东南部和云南北部应是水母雪兔子的高适生区,需要建立就地保护以对国家二级珍稀野生保护植物水母雪兔子实施有效保护。

关键词：水母雪兔子气候变化潜在分布区环境变量最大熵模型

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基于PacBio平台的扇穗茅全长转录组测序及热激转录因子家族(HSFs)分析

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草地学报 2025年第2期33卷 370-381页

作者：曲荣举刘玉萍苏旭富贵靳佳瑞杨倩张朋辉余明君孙成林毛轩睿青海师范大学生命科学学院青海西宁810008 青海师范大学青海省青藏高原生物多样性形成机制与综合利用重点实验室青海西宁810008 青海师范大学高原科学与可持续发展研究院青海西宁810016

为了明晰扇穗茅(Littledalea racemosa)的转录组特征和热激转录因子家族(HSFs)的功能与系统位置,本研究基于PacBio平台对扇穗茅全长转录组进行了测序和生物信息学分析。结果表明:测序获得高质量的Unigenes 62016条,平均长度为2752 bp,N5... 详细信息

为了明晰扇穗茅(Littledalea racemosa)的转录组特征和热激转录因子家族(HSFs)的功能与系统位置,本研究基于PacBio平台对扇穗茅全长转录组进行了测序和生物信息学分析。结果表明:测序获得高质量的Unigenes 62016条,平均长度为2752 bp,N50长度为2971 bp,蛋白编码区序列(CDS)48127个,简单重复序列(SSR)8858个;扇穗茅Unigenes在5大公共数据库中的注释量分别为27566(NR)、17961(GO)、18300(KOG)、17381(KEGG)和23737(SwissProt),有7663条Unigenes在5个数据库中均得到注释;扇穗茅转录本鉴定到1165个转录因子,隶属于48个转录因子家族,大多与高原极端环境适应有关;其中包含17个热激转录因子(HSF),大部分位于细胞核,为亲水蛋白,cDNA常包含5~10个保守结构域;系统发育研究表明扇穗茅和拟南芥(Arabidopsis thaliana)HSF转录因子聚为9个分支(CladeA-I),扇穗茅的11个HSF与HSFA2聚为一支,彼此具有较近的亲缘关系,可能具有相似的功能。本研究丰富了扇穗茅属物种的遗传信息,为后续关键功能基因的挖掘提供了理论依据。

关键词：扇穗茅全长转录组功能注释转录因子 HSFs

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西宁北川河湿地公园鸟类群落结构

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生态学杂志 2024年第5期43卷 1348-1353页

作者：罗佳鑫鲍敏韩军张强元陈振宁青海师范大学生命科学学院/青藏高原生物多样性形成机制与综合利用重点实验室西宁810008 陕西省铜川市王益-中学铜川727000

为了解西宁北川河湿地公园鸟类分布现状,于2019年1—9月采用样线法、样点法对湿地公园4种生境类型的鸟类组成及多样性进行了调查。共记录到鸟类73种,隶属于16目33科,其中优势种5种,分别为斑嘴鸭(Anas zonorhyncha)、普通秋沙鸭(Mergus m... 详细信息

为了解西宁北川河湿地公园鸟类分布现状,于2019年1—9月采用样线法、样点法对湿地公园4种生境类型的鸟类组成及多样性进行了调查。共记录到鸟类73种,隶属于16目33科,其中优势种5种,分别为斑嘴鸭(Anas zonorhyncha)、普通秋沙鸭(Mergus merganser)、大白鹭(Ardea alba)、渔鸥(Ichthyaetus ichthyaetus)和麻雀(Passer montanus);国家一级重点保护鸟类1种,即黑鹳(Ciconia nigra),国家二级重点保护鸟类4种,分别为大天鹅(Cygnus cygnus)、黑颈䴙䴘(Podiceps nigricollis)、白琵鹭(Platalea leucorodia)和红隼(Falco tinnunculus);旅鸟占鸟类总种数的46.58%,留鸟为27.40%,夏候鸟为15.07%,冬候鸟为10.96%;夏季鸟类群落多样性最高(3.0588),其次为春季(2.8530),秋季最低(1.6032);人工湖生境类型多样性(2.3602)高于其他3个生境,游禽和鸣禽最多(34.25%),其次为涉禽(16.44%)。研究结果可为青海西宁湟水国家湿地公园动物保护和健康评价提供基础资料。

关键词：鸟类多样性湿地青海省

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不同多度等级物种对高寒草甸物种多样性的影响

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草地学报 2025年

作者：马晓丽牛玉丽陈哲关晋宏杜岩功郭小伟王世雄青海师范大学生命科学学院/青海省青藏高原生物多样性形成机制与综合利用重点实验室中国科学院西北高原生物研究所

物种多样性格局的形成依赖于群落构建过程和物种组成。其中，不同多度等级物种对物种多样性的贡献颇具争议。本研究根据多度等级将物种排序，形成稀有-常见种和常见-稀有种两条序列，逐一添加物种并分析物种多样性变化，采用“Levins”... 详细信息

物种多样性格局的形成依赖于群落构建过程和物种组成。其中，不同多度等级物种对物种多样性的贡献颇具争议。本研究根据多度等级将物种排序，形成稀有-常见种和常见-稀有种两条序列，逐一添加物种并分析物种多样性变化，采用“Levins”方法计算生态位宽度和重叠值，旨在分析稀有种和常见种对高寒草甸植物群落物种多样性的贡献。结果表明：（1）物种多度呈对数分布，频度呈“U”型分布。（2）常见种在两条序列中对α多样性贡献率为20.40%～59.20%，稀有种贡献率低于2.80%；稀有种对β多样性贡献率高于40.69%，常见种贡献率为1.06%～5.40%；这种主导效应是物种累积的结果，单个物种贡献差异不大。（3）常见种的生态位宽度和重叠值较稀有种大。研究结果强调在物种多样性保护中，特别是考虑物种多样性的不同水平时，需要综合考虑不同物种的生态角色和贡献，以确保生态保护的完整性和多样性。

关键词： α多样性 β多样性物种多度稀有种常见种生态位

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气候变化背景下黑紫披碱草和紫芒披碱草在中国的潜在适生区预测

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草地学报 2025年

作者：雷洁琼刘玉萍苏旭高宣琳吕扬郑莹晖孙成林才让扎西冯旭李佳欢董英雯青海师范大学生命科学学院青海师范大学青海省青藏高原生物多样性形成机制与综合利用重点实验室青海师范大学高原科学与可持续发展研究院

本研究基于MaxEnt模型预测了国家二级保护植物黑紫披碱草（Elymus atratus）和紫芒披碱草（Elymus purpuraristatus）当前（1970—2000年）和未来（2021—2040年、2041—2060年、2061—2080年、2081—2100年）时期的潜在适生区。结果表... 详细信息

本研究基于MaxEnt模型预测了国家二级保护植物黑紫披碱草（Elymus atratus）和紫芒披碱草（Elymus purpuraristatus）当前（1970—2000年）和未来（2021—2040年、2041—2060年、2061—2080年、2081—2100年）时期的潜在适生区。结果表明：⑴影响黑紫披碱草适生区分布的主要环境因子为海拔（2524.94～4118.83 m）、最暖季度平均温度（8.43～14.75℃）和气温季节性变化方差（574.91～890.01℃）；影响紫芒披碱草分布的关键因素是年平均气温（0.31～6.91℃）、最冷季度平均温度（-11.57～-3.16℃）和海拔（1483.81～3759.22 m）。⑵当前黑紫披碱草的适生区面积为288.61 × 104km2，主要位于祁连山脉、横断山脉；紫芒披碱草的适生区面积为343.86 × 104km2，主要在昆仑山脉、阿尔金山脉。⑶未来情景下黑紫披碱草和紫芒披碱草的适生区面积总体呈下降趋势；黑紫披碱草的质心向西南迁移，紫芒披碱草向东北迁移。本研究结果为黑紫披碱草和紫芒披碱草种质资源保护及可持续利用提供了理论依据。

关键词： MaxEnt模型披碱草属潜在分布区空间格局质心转移

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基于MaxEnt模型预测碱韭在中国的潜在适宜区变化

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草地学报 2025年

作者：高宣琳苏旭刘玉萍吕扬雷洁琼郑莹晖才让扎西冯旭李佳欢青海师范大学生命科学学院青海师范大学青海省青藏高原生物多样性形成机制与综合利用重点实验室青海师范大学高原科学与可持续发展研究院

碱韭（Allium polyrhizum）是百合科（Liliaceae）、葱属（Allium）的一种多年生草本植物，具有重要的药用价值、食用价值和经济价值。基于筛选到的89个碱韭分布位点和9个环境因子，本研究利用优化后MaxEnt模型和ArcGIS软件，模拟了当... 详细信息

碱韭（Allium polyrhizum）是百合科（Liliaceae）、葱属（Allium）的一种多年生草本植物，具有重要的药用价值、食用价值和经济价值。基于筛选到的89个碱韭分布位点和9个环境因子，本研究利用优化后MaxEnt模型和ArcGIS软件，模拟了当前和未来气候条件下碱韭在我国的适宜区分布，旨在为碱韭种质资源的可持续利用提供基础数据。结果显示：⑴年平均温度（Bio1）、最干季平均温度（Bio9）、海拔（Elevation）和坡度（Slope）是影响碱韭在我国适宜区分布的主要环境因子；⑵当前气候条件下，碱韭的适宜区总面积为687.99×104km2，高适宜区主要分布于黑龙江、吉林西北部、新疆北部和内蒙古东北部，零星分布于西藏、青海、甘肃等地；⑶未来气候条件下，碱韭的适宜区分布面积大幅缩小，高适宜区主要集中于黑龙江北部和内蒙古东北部；适宜区质心总体向内蒙古东北方向迁移，但始终位于阿拉善右旗境内。

关键词：碱韭最大熵模型环境因子潜在适宜区质心迁移

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苦马豆(Sphaerophysa salsula)6个不同居群的染色体核型分析

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草地学报 2024年第8期32卷 2469-2477页

作者：曲荣举刘玉萍陈金元苏旭张朋辉靳佳瑞余明君杨倩青海师范大学生命科学学院青海西宁810008 青海师范大学青海省青藏高原生物多样性形成机制与综合利用重点实验室青海西宁810008 青海师范大学高原科学与可持续发展研究院青海西宁810016

本研究采用染色体常规压片技术和核型分析方法,对苦马豆(Sphaerophysa salsula)6个自然居群(P81,P89,P96,P102,P137,P142)的染色体核型特征进行了分析,探讨了不同居群间的进化趋势和亲缘关系。结果表明:苦马豆6个参试居群的染色体数目... 详细信息

本研究采用染色体常规压片技术和核型分析方法,对苦马豆(Sphaerophysa salsula)6个自然居群(P81,P89,P96,P102,P137,P142)的染色体核型特征进行了分析,探讨了不同居群间的进化趋势和亲缘关系。结果表明:苦马豆6个参试居群的染色体数目和基数恒定,均为2n=2X=16;主要有中部着丝粒(m)和亚中部着丝粒(sm)染色体两种类型,中部着丝粒染色体数量多于亚中部着丝粒染色体;绝大多数居群的核型公式为2n=2X=16 m,仅居群P137的核型公式为2n=2X=14 m+2 sm;染色体长度介于1.05~2.63之间,属于小型染色体;核型类型包括1A,2A,3A和2B,平均臂比处于1.18~1.43之间,长度比居于1.44~2.05之间,核不对称系数介于54.02~58.98之间;居群P89的核型类型为1A,核不对称系数最小,进化程度最低;当遗传距离为4时,苦马豆6个居群形成三大类,居群P137和P142的亲缘关系较近。本研究首次分析了苦马豆的染色体核型特征,探讨了不同居群间的进化趋势和亲缘关系,为苦马豆属物种系统发育和基因组学研究提供了细胞学的佐证。

关键词：苦马豆染色体核型分析进化趋势亲缘关系聚类分析

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水蓼生物修复重金属污染研究进展

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生态科学 2024年第3期43卷 275-280页

作者：胡樱杨敏婷费翔林贾慧萍王慧春青海师范大学生命科学学院西宁810001 青海省青藏高原药用动植物资源重点实验室西宁810001 青海省青藏高原生物多样性形成机制与综合利用重点实验室西宁810008

生物修复重金属污染技术具安全无二次污染、成本低、适用范围广等特点,可对水体、土壤进行有效修复,其推广与应用价值巨大。蓼科蓼属植物水蓼(Polygonum hydropiper L.)是锰超富集植物,对镉、锶、铅等重金属均具富集作用。文章综述近年... 详细信息

生物修复重金属污染技术具安全无二次污染、成本低、适用范围广等特点,可对水体、土壤进行有效修复,其推广与应用价值巨大。蓼科蓼属植物水蓼(Polygonum hydropiper L.)是锰超富集植物,对镉、锶、铅等重金属均具富集作用。文章综述近年来水蓼重金属富集能力、生理响应等研究,并提出未来该方向重点研究内容:(1)加大水蓼重金属胁迫筛选,掌握有效富集重金属种类。(2)深入水蓼分子解毒机制研究,为改良水蓼及其生物富集重金属应用提供思路。(3)挖掘水蓼遗传学调控特点,选育具期望的水蓼生物材料。(4)探索水蓼重金属回收技术,解决投入应用的后顾之忧。

关键词：水蓼重金属生物材料植物修复

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