检索结果-内蒙古大学图书馆

华北农学报 2022年第1期37卷 211-221页

作者：李琪杨昌恒王永林亚秋向华朱江江青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室西南民族大学四川成都610041 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室西南民族大学四川成都610041

旨在获得CIDEB、CIDEC基因的CDS,检测该家族基因在山羊不同组织中的表达量,预测其互作蛋白,为进一步揭示CIDE家族基因在脂代谢中的调控网络提供参考。主要利用RT-PCR克隆获得山羊CIDEB、CIDEC基因序列并利用在线工具分析CIDE家族蛋白的... 详细信息

旨在获得CIDEB、CIDEC基因的CDS,检测该家族基因在山羊不同组织中的表达量,预测其互作蛋白,为进一步揭示CIDE家族基因在脂代谢中的调控网络提供参考。主要利用RT-PCR克隆获得山羊CIDEB、CIDEC基因序列并利用在线工具分析CIDE家族蛋白的生物学特性,并预测其互作蛋白。利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测了CIDE家族基因在山羊不同组织中的表达水平,并检测各互作蛋白在其表达水平最高的组织中的表达量,利用SPSS分析其表达量之间的相关性。克隆获得了CIDEB基因CDS区660 bp,共编码219个氨基酸,CIDEC基因CDS区714 bp,编码237个氨基酸。进化树分析显示,山羊CIDEA、CIDEB、CIDEC均与绵羊亲缘关系最近。RT-qPCR检测发现CIDEA、CIDEB、CIDEC基因分别在山羊瘤胃、肝脏、小肠中表达量最高。CIDEA与DFFB和ELOVL3在瘤胃中的表达量具有极显著相关性(P<0.01),与DIO2、TMEM26、PRDM16、PLIN1具有显著相关性(P<0.05)。CIDEB与DFFA和SDR39U1在肝脏中的表达量具有显著相关性(P<0.05)。CIDEC与PLIN2、GPLD1、ADIPOQ在小肠中的表达量具有显著相关性(P<0.05)。通过分析发现了与CIDE家族表达量具有相关性的基因,可为进一步揭示CIDE基因在脂质代谢中的作用及其调控网络提供理论基础,且CIDE家族蛋白均为脂滴相关蛋白,也可为进一步研究精确的脂滴形成机制提供参考。

关键词：山羊 CIDE家族 RT-qPCR 脂滴基因克隆

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基于转录组测序筛选黄牛低氧适应性相关差异基因

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华北农学报 2020年第2期35卷 217-227页

作者：侯孟典王会钟金城柴志欣益西康珠王吉坤王嘉博青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室西南民族大学四川成都610041 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室西南民族大学四川成都610041

为探明藏黄牛对低氧适应的相关差异表达基因并分析差异表达基因功能和代谢通路,以藏黄牛和三江黄牛心脏组织为研究对象,提取总RNA,建立测序文库后利用Illumina HiSeqTM 4000进行测序,经生物信息学分析筛选出差异表达转录本,并对差异表... 详细信息

为探明藏黄牛对低氧适应的相关差异表达基因并分析差异表达基因功能和代谢通路,以藏黄牛和三江黄牛心脏组织为研究对象,提取总RNA,建立测序文库后利用Illumina HiSeqTM 4000进行测序,经生物信息学分析筛选出差异表达转录本,并对差异表达基因进行GO富集和KEGG通路分析,最后采用荧光定量PCR(RT-qPCR)验证测序数据的准确性。结果表明:藏黄牛相比于三江黄牛得到显著差异表达基因608个,其中上调基因467个,下调基因141个,推测表达量较高的B2M、COX7C、NFATC1、ECE1、CAST基因是与低氧适应性相关的基因;差异转录本GO功能富集分析可知,在分子功能、细胞组分、生物过程分别富集到327,253,2 191个条目,其中富集程度最高的条目分别是细胞发育过程、结合与转录因子活性、细胞前缘。KEGG分析结果表明,差异转录本显著富集在8条通路,筛选低氧适应性候选基因NFATC1是MP-PKG信号通路与T细胞受体信号通路成员,推测其通过cGMP-PKG通路与T细胞受体信号通路参与低氧适应性调控。采用高通量测序技术对藏黄牛和三江黄牛心脏组织进行转录组测序分析,获得大量差异表达基因,为研究动物低氧适应性机制奠定基础。

关键词：黄牛心脏组织低氧适应性差异表达mRNA 功能富集分析

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藏黄牛与宣汉黄牛心脏miRNA表达谱比较

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中国农业科学 2020年第8期53卷 1677-1687页

作者：陈露露王会王吉坤王嘉博柴志欣陈智华钟金城西南民族大学青藏高原研究院/青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省教育部重点实验室

【目的】miRNA作为一类非编码RNA,广泛参与机体多种生命活动,研究旨在挖掘miRNA在藏黄牛和宣汉黄牛心脏组织中的差异miRNA,为进一步研究藏黄牛低氧适应的分子机制提供基础数据。【方法】随机选取健康的藏黄牛和宣汉黄牛各3头,迅速采集... 详细信息

【目的】miRNA作为一类非编码RNA,广泛参与机体多种生命活动,研究旨在挖掘miRNA在藏黄牛和宣汉黄牛心脏组织中的差异miRNA,为进一步研究藏黄牛低氧适应的分子机制提供基础数据。【方法】随机选取健康的藏黄牛和宣汉黄牛各3头,迅速采集其心脏组织,使用Trizol法提取RNA,琼脂糖凝胶电泳切胶选取18—30nt的片段,连接3’端和5’端,反转录后进行扩增,凝胶电泳切胶纯化后建立藏黄牛和黄牛各3个文库,利用Illumina HiSeq4000测序平台进行高通量测序;将测序得到的序列进行过滤,比对GenBank和Rfam数据库,筛选出藏黄牛和宣汉黄牛的差异miRNA,进行功能注释及信号通路富集分析;随机选择8个miRNAs,利用实时荧光定量PCR检测其在心脏组织的表达量,以验证测序数据的准确性。【结果】藏黄牛和宣汉黄牛心脏组织的高质量读值的序列分别为17 463 446条和13 662 812条,干净读值为16 552 296条和12 055 304条,且在藏黄牛和宣汉黄牛中高质量核酸序列长度富集最多的均是21nt,分别为37.5%和32.1%;且共筛选出219个差异miRNAs,其中48个显著上调,171个显著下调;GO功能注释得到差异miRNA靶基因分子功能中显著富集的条目有22条,如,GO:0005488(结合)、GO:0005515(蛋白质结合)和GO:0043167(离子结合);细胞组分中显著富集的条目有20条,如,GO:0005623(细胞)、GO:0044464(细胞组分)和GO:0005622(细胞内);生物过程中显著富集的条目有13条,如,GO:0035556(细胞内信号转导)、GO:0032774(RNA生物合成过程)和GO:0006351(转录,DNA模板化),KEGG信号通路分析得到差异表达miRNAs靶基因显著富集到胰岛素信号通路(139个靶基因)、mTOR信号通路(38个靶基因)和HIF-1信号通路(92个靶基因)等232个信号通路中,其中有12个靶基因共同作用于这3个信号通路,说明miRNAs可能通过这3个信号通路,共同参与藏黄牛低氧适应性的调控;随机选取8个miRNAs进行荧光定量验证,其表达趋势与测序结果表达趋势基本一致,表明高通量测序数据可信度较高。【结论】得到了miRNA在藏黄牛与宣汉黄牛心脏组织中的表达谱,为揭示藏黄牛低氧适应性的调控机制研究奠定了基础。

关键词：藏黄牛宣汉黄牛 miRNA 心脏高通量测序低氧适应性

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牛诱导多能干细胞的建立及应用研究进展

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生物技术通报 2023年第5期39卷 130-141页

作者：曾虹曾睿琳付伟吉文汇兰道亮西南民族大学畜牧兽医学院成都610041 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室成都610041 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室成都610041

诱导性多能干细胞(induced pluripotent stem cells,iPSCs)是指通过导入特定的转录因子将终末分化的体细胞重编程为可以无限增殖更新并具有分化为三胚层多种细胞类型的一类干细胞系。目前对人与小鼠的iPSCs研究已经取得了很多重要成果,... 详细信息

诱导性多能干细胞(induced pluripotent stem cells,iPSCs)是指通过导入特定的转录因子将终末分化的体细胞重编程为可以无限增殖更新并具有分化为三胚层多种细胞类型的一类干细胞系。目前对人与小鼠的iPSCs研究已经取得了很多重要成果,但其他动物,如牛等经济型有蹄类家畜iPSCs的研究始终没有突破性的进展。如何将外源转录因子通过重编程载体高效安全地导入体细胞中并持续表达是生产牛诱导多能干细胞(bovine induced pluripotent stem cells,biPSCs)的主要瓶颈。本文就biPSCs建立中重编程系统的选择、诱导因子的选择、小分子化合物的添加等方面进行综述,以期为进一步完善biPSCs及牛胚胎干细胞系的建立提供参考。

关键词：牛诱导多能干细胞体细胞重编程培养体系小分子化合物

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miR-138生物学功能研究进展

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中国生物工程杂志 2022年第4期42卷 68-77页

作者：冉宏标王会钟金城西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省/教育部重点实验室成都610041

microRNAs(miRNAs)是真核生物体内高度保守的非编码小分子RNA,具有多种生物学功能,参与疾病发生和发展、细胞增殖和分化等多种病理及生理过程的调控。miR-138作为一种肿瘤抑制因子已在肿瘤发生与治疗中被广泛研究和应用,同时在心血管及... 详细信息

microRNAs(miRNAs)是真核生物体内高度保守的非编码小分子RNA,具有多种生物学功能,参与疾病发生和发展、细胞增殖和分化等多种病理及生理过程的调控。miR-138作为一种肿瘤抑制因子已在肿瘤发生与治疗中被广泛研究和应用,同时在心血管及神经系统疾病、成骨分化、脂肪生成及卵巢功能维持等生命过程中具有调控作用。在总结分析miR-138相关功能最新研究进展的基础上,对miR-138的潜在研究方向进行了分析、讨论和展望,旨在为进一步深入探明miR-138的生物学功能提供参考和理论依据。

关键词： miR-138 疾病成骨分化脂肪卵巢

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牦牛HDAC8基因特征及其在组织和卵母细胞成熟过程中的表达分析

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华北农学报 2020年第2期35卷 210-216页

作者：秦文昌殷实李泽沛王斌杨柳青周婧雯李键西南民族大学生命科学与技术学院青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室四川成都610041

为探讨组蛋白去乙酰化酶8(Histone deacetylases 8,HDAC8)在牦牛生殖中的作用,以牦牛肝脏cDNA为模板,采用RT-PCR方法克隆牦牛HDAC8基因,并通过生物信息学方法分析牦牛HDAC8序列;利用实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)技术检测该基因在牦牛不同组织及卵母细胞体外成熟过程(GV、MⅠ和MⅡ期)中的表达规律。结果表明,牦牛HDAC8基因序列为1 109 bp(GenBank ***889494),CDS为1 008 bp,编码氨基酸335个;序列比对分析发现,牦牛与其他哺乳动物的相似性在94%以上,表明HDAC8在哺乳类动物进化过程及蛋白结构水平上具有较高的保守性;组织表达分析发现,HDAC8在肝脏组织中的表达水平最高,极显著高于其他组织(P<0.01);HDAC8基因在卵母细胞不同发育阶段中具有不同的表达模式,表达水平随着卵母细胞成熟阶段的递增呈上升趋势,MⅡ期表达水平最高,极显著高于GV和MⅠ期(P<0.01)。综上,HDAC8基因可能在牦牛肝脏代谢及卵母细胞的成熟过程中起一定的调控作用,为进一步探索HDAC8在牦牛生殖中的调控作用提供一定的理论基础。

关键词：牦牛 HDAC8基因组织表达卵母细胞

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牦牛不同年龄段C1QA、C1QB、C1QC基因组织表达分析

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华北农学报 2020年第S01期35卷 385-391页

作者：钟美王吉坤柴志欣武志娟钟金城青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室四川省重点实验室西南民族大学四川成都610041

C1QA、C1QB、C1QC基因分别编码补体C1q蛋白的3个亚基,而C1q在氧化应激、细胞凋亡、维护机体内环境稳定等过程发挥着重要作用,探究其在牦牛不同发育时期各组织中的表达情况将为深入了解牦牛C1q蛋白的功能奠定良好基础。利用TRIzol法提取... 详细信息

C1QA、C1QB、C1QC基因分别编码补体C1q蛋白的3个亚基,而C1q在氧化应激、细胞凋亡、维护机体内环境稳定等过程发挥着重要作用,探究其在牦牛不同发育时期各组织中的表达情况将为深入了解牦牛C1q蛋白的功能奠定良好基础。利用TRIzol法提取麦洼牦牛组织的总RNA,通过实时荧光定量检测C1QA、C1QB、C1QC基因在麦洼牦牛0.5,1.5,2.5岁的心脏、脾脏、肺脏、大脑、小脑组织中的表达特性,使用SPSS 22.0软件分析各组织间的差异显著性。组织表达结果显示,C1QA、C1QB、C1QC基因在牦牛3个年龄中的心脏、脾脏、肺脏、大脑、小脑组织中均有表达,同年龄不同组织的表达趋势基本一致,均为C1QA、C1QB、C1QC基因在牦牛肺脏中的表达量显著高于脾脏、心脏、大脑、小脑(P<0.05);脾脏显著高于心脏、大脑、小脑中的表达量(P<0.05);而心脏中的表达量显著高于大脑、小脑(P<0.05),大脑和小脑间的表达量差异不显著(P>0.05)。C1QA、C1QB、C1QC基因在1.5岁牦牛肺脏中的表达量最高,均极显著高于脾脏、心脏、大脑和小脑(P<0.01)。时序表达结果表明,随着牦牛年龄的增长,C1QA基因在多数组织中的表达量呈显著下降趋势;C1QB则是先显著上升再显著下降;C1QC呈显著上升趋势。综上可知,C1QA、C1QB基因可能通过表达量下调、C1QC基因则可能通过表达量上调来参与牦牛的高原适应性。

关键词：牦牛 C1q 组织表达时序表达高原适应性

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产细菌素屎肠球菌SC-Y112的体外益生性及安全性评价

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食品科学 2021年第11期42卷 154-160页

作者：罗强张明刘巧罗璠西南民族大学畜牧兽医学院青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室四川成都610041

屎肠球菌SC-Y112是一种具有广谱抗菌性质的产细菌素乳酸菌,为更深入了解其菌株性质,本研究通过模拟胃肠液耐受实验、胆盐耐受实验、抗氧化活性测定、溶血活性测定、明胶液化实验、有害代谢物质检测、耐药性评价及肠球菌毒力基因检测对... 详细信息

屎肠球菌SC-Y112是一种具有广谱抗菌性质的产细菌素乳酸菌,为更深入了解其菌株性质,本研究通过模拟胃肠液耐受实验、胆盐耐受实验、抗氧化活性测定、溶血活性测定、明胶液化实验、有害代谢物质检测、耐药性评价及肠球菌毒力基因检测对屎肠球菌SC-Y112的体外益生性质与安全性质进行分析评价。结果表明:屎肠球菌SC-Y112对模拟胃肠液耐受性强,在模拟胃液培养3 h存活率达73.66%,在0.3 g/100 mL的胆盐质量浓度下培养3 h后存活率达56.38%,其发酵24 h上清液总抗氧化能力达35.21 U/mL;此外,屎肠球菌SC-Y112不产生物胺、吲哚以及偶氮还原酶等有害代谢物质,无溶血现象,不溶解明胶,不携带常见肠球菌毒力基因,且对万古霉素敏感。研究结果可为菌株的进一步开发与应用提供科学依据。

关键词：屎肠球菌益生性质安全性质毒力基因

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致病性小肠结肠炎耶尔森氏菌分离鉴定及三重PCR检测方法的建立

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食品工业科技 2021年第7期42卷 95-101页

作者：张楠驰苟小兰王利西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用国家教育部重点实验室动物科学国家民委重点实验室四川成都610041

为鉴定导致患病鲫鱼肛门红肿、腹部有出血点症状的病原菌,并建立一种快速检测该病原菌的方法。本研究从患病鲫鱼中分离了病原菌,采用形态学、理化特性分析及16S rDNA序列分析方法鉴定菌株。采用PCR扩增法检测该菌毒力基因,琼脂纸片扩散... 详细信息

为鉴定导致患病鲫鱼肛门红肿、腹部有出血点症状的病原菌,并建立一种快速检测该病原菌的方法。本研究从患病鲫鱼中分离了病原菌,采用形态学、理化特性分析及16S rDNA序列分析方法鉴定菌株。采用PCR扩增法检测该菌毒力基因,琼脂纸片扩散法检测该菌株的耐药性,致病性能验证试验检测其致病性。针对该菌ail基因、inv基因和intB基因设计了3条特异性引物,通过对反应体系和条件的优化,建立了一种检测该菌的三重PCR方法并初步应用于患病鲫鱼样品的检测中。结果显示,从患病鲫鱼心脏组织中分离了一株小肠结肠炎耶尔森氏菌(Yersinia enterocolitica),命名为fsznc-10。检测到该菌携带ail、ystB、virF、intB毒力基因,该菌对诺氟沙星、庆大霉素等5种抗生素敏感,对鲫鱼具有一定的致病性。三重PCR方法可准确扩增出小肠结肠炎耶尔森氏菌ail、inv和intB三个目的基因,而其他菌株均未扩增出目的基因。该方法检测该菌DNA最低检出量为1.704×10-6 ng/μL,检测患病鱼心脏样品的阳性率约为86.67%,与16S rDNA序列分析方法的检测符合率为100%。本试验建立的三重PCR检测法具有特异性强、敏感性高、操作简单、成本低的优点。这为临床中小肠结肠炎耶尔森氏菌的防控和检测提供参考依据。

关键词：小肠结肠炎耶尔森氏菌毒力基因快速检测多重PCR

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产细菌素屎肠球菌的筛选鉴定及其抑菌特性

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食品科学 2021年第6期42卷 171-177页

作者：张明罗强魏婕刘巧罗璠西南民族大学生命科学与技术学院青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室四川成都610041

从采自四川红原的传统发酵酸乳中分离得到308株疑似乳酸菌,通过96孔板法初筛和平板打孔法复筛,筛选出1株具有明显抑菌作用的菌株SC-Y112。通过形态学观察、16S rDNA序列同源性分析和ropA管家基因序列同源性分析结合生理生化实验,鉴定该... 详细信息

从采自四川红原的传统发酵酸乳中分离得到308株疑似乳酸菌,通过96孔板法初筛和平板打孔法复筛,筛选出1株具有明显抑菌作用的菌株SC-Y112。通过形态学观察、16S rDNA序列同源性分析和ropA管家基因序列同源性分析结合生理生化实验,鉴定该菌株为屎肠球菌(Enterococcus faecium)。通过排酸及排除H2O2影响后,该菌株的发酵上清液仍具有明显抑菌活性,经蛋白酶处理后,抑菌效果明显消失或下降,说明发酵上清液中的抑菌成分具有蛋白质性质。进一步探究该菌株所产细菌素的生物学特性、遗传稳定性及抑菌特性表明,该细菌素在菌株接种后6 h产生,12 h达到最高;菌株在连续传代86代内,产细菌素能力较为稳定;细菌素在pH 3.0~7.0的条件下稳定,在100℃处理30 min后仍具有抑菌活性;SC-Y112所产细菌素具有广谱抗菌性,对单核细胞性李斯特菌有明显的抑菌活性。

关键词：发酵酸乳屎肠球菌细菌素抑菌

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