检索结果-内蒙古大学图书馆

FOXA1敲除对苯并[a]芘恶性转化细胞THBEc1miRNA表达谱的影响

中国药理学与毒理学杂志 2025年第3期39卷 169-182页

作者：刘芷毓付于津林毅桐付娟玲姚碧云赵鹏北京大学公共卫生学院毒理学系食品安全毒理学研究与评价北京市重点实验室北京100191

目的研究叉头框蛋白A1(FOXA1)基因敲除对苯并[a]芘(BaP)恶性转化细胞THBEc1微RNA(miRNA)表达谱的影响,建立FOXA1与miRNA及其靶基因之间的调控网络,探讨FOXA1在BaP致癌作用中的可能机制。方法采用二代测序(NGS)技术检测FOXA1敲除细胞TH... 详细信息

目的研究叉头框蛋白A1(FOXA1)基因敲除对苯并[a]芘(BaP)恶性转化细胞THBEc1微RNA(miRNA)表达谱的影响,建立FOXA1与miRNA及其靶基因之间的调控网络,探讨FOXA1在BaP致癌作用中的可能机制。方法采用二代测序(NGS)技术检测FOXA1敲除细胞THBEc1-ΔFOXA1-c34和对照细胞THBEc1-ctrl间的差异表达miRNA,通过RT-qPCR对miRNA测序结果进行验证。利用ENCORI、miRDB、mirDIP、miRWalk和TargetScan 8.0数据库结合THBEc1-ΔFOXA1-c34和THBEc1-ctrl细胞间mRNA的NGS结果,综合预测差异表达miRNA调控的差异表达基因(DEG)。利用DAVID数据库对差异表达miRNA调控的DEG进行GO和KEGG通路富集分析。利用STRING 12.0数据库和Cytoscape 3.10.2软件对差异表达miRNA调控的DEG所编码的蛋白质进行网络分析。结果 miRNA表达谱差异分析检出33个miRNA在THBEc1-ΔFOXA1-c34和THBEc1-ctrl细胞间的表达差异倍数>2或<0.5(错误发现率<0.05),其中13个miRNA在THBEc1-ΔFOXA1-c34细胞中表达低于THBEc1-ctrl,20个miRNA在THBEc1-ΔFOXA1-c34细胞中表达高于THBEc1-ctrl。THBEc1-ΔFOXA1-c34细胞中11个表达下调的miRNA与32个表达上调的mRNA构成调控网络,16个表达上调的miRNA与56个表达下调的mRNA构成调控网络。上述27个差异表达miRNA通过对88个DEG的调控参与多种生物学过程,主要包括细胞生长、增殖、迁移、凋亡、血管生成、上皮-间充质转化和信号转导(TGF-β、Hippo、NF-κB和MAPK等通路)等。结论 FOXA1敲除后BaP恶性转化细胞THBEc1的miRNA表达谱发生改变。敲除FOXA1可能通过改变miRNA的表达水平影响TGF-β和MAPK等通路,从而抑制细胞增殖和迁移。

关键词：苯并[a]芘叉头框蛋白A1 微RNA 苯并[a]芘恶性转化细胞

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体外模拟单室血管外给药染毒模型的构建及其与经典体外染毒模型在硝酸镧诱导HepG2细胞死亡中的比较

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中国药理学与毒理学杂志 2025年第4期39卷 285-295,I0001,I0002页

作者：付大维付于津闫赖赖陈洁刘芷毓付娟玲姚碧云郝卫东赵鹏北京大学公共卫生学院毒理学系食品安全毒理学研究与评价北京市重点实验室北京100191 北京大学公共卫生学院卫生检验学系北京100191

目的以硝酸镧﹝La(NO_(3))_(3)﹞为受试物,构建体外模拟单室血管外给药染毒模型,并探究其与经典体外染毒模型在La(NO_(3))_(3)诱导Hep G2细胞死亡中的差异。方法根据毒动学房室模型理论,自主设计由储液室、混合室、染毒室和废液室组成... 详细信息

目的以硝酸镧﹝La(NO_(3))_(3)﹞为受试物,构建体外模拟单室血管外给药染毒模型,并探究其与经典体外染毒模型在La(NO_(3))_(3)诱导Hep G2细胞死亡中的差异。方法根据毒动学房室模型理论,自主设计由储液室、混合室、染毒室和废液室组成的染毒装置,采用蠕动泵软管连接各室以单向和定速传输液体,根据预设的吸收半衰期(T_(1/2a))和消除半衰期(T_(1/2))等毒动学参数构建La(NO_(3))_(3)体外模拟单室血管外给药染毒模型。采用电感耦合等离子体质谱仪测定不同时间点染毒室中La(NO_(3))_(3)含量。采用PKsolver和Graph Pad Prism 8.0软件对La(NO_(3))_(3)浓度-时间曲线进行分析。通过比较毒动学参数实测值和根据假定的T_(1/2a)和T_(1/2)计算得到的理论值对染毒模型进行评估。以模拟单室血管外给药染毒模型和经典体外染毒模型对Hep G2细胞给予La(NO_(3))_(3)染毒处理,采用Hoechst 33342/碘化丙啶染色测定细胞死亡率。结果在峰值浓度(Cmax)3.91~1000.00μmol·L^(-1)范围内,体外模拟单室血管外染毒模型实测的La(NO_(3))_(3)浓度-时间曲线几乎与相应理论曲线一致,测量值与理论值呈良好线性相关性(r均>0.9980);包括消除速率常数(Ke)、T1/2、吸收速率常数(Ka)、T_(1/2a)、达峰时间(T_(max))、C_(max)、清除率(CL)和曲线下面积(AUC_(0-∞))在内的各毒动学参数实测值均与相应理论值接近;各实验组浓度-时间曲线拟合系数R2均>0.9900,符合单室血管外给药的房室模型。模拟单室血管外给药染毒模型中,La(NO_(3))_(3)各剂量组均未观察到Hep G2细胞出现明显死亡。经典体外染毒模型中,La(NO_(3))_(3)0.500 mmol·L^(-1)组细胞死亡率显著高于溶剂对照组;0.119和0.243 mmol·L^(-1)组未见明显细胞死亡。Cmax或C染毒为0.500 mmol·L^(-1)时,经典体外染毒诱导Hep G2细胞死亡率显著高于模拟单室血管外给药染毒。AUC相等时,2种染毒模型间La(NO_(3))_(3)诱导Hep G2细胞死亡率差异无统计学意义。结论本研究设计的染毒装置可体外模拟单室血管外给药染毒,使体外毒性测试更接近体内情况,为优化体外毒性测试染毒方法提供了初步实验依据。模拟的单室血管外给药染毒方式和经典体外染毒方式间La(NO_(3))_(3)诱导Hep G2细胞死亡存在差异,提示不同体外染毒模式可能影响毒性测试结果。

关键词：体外模拟单室血管外给药染毒模型经典体外染毒模型毒动学曲线下面积硝酸镧细胞死亡

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妊娠糖尿病对子代大鼠空腹血糖的影响及2'-岩藻糖基乳糖的干预效果研究

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中国生育健康杂志 2025年第3期36卷 201-207页

作者：叶湾韵史涵旭周雅琳文彰彭译乐许雅君北京大学公共卫生学院营养与食品卫生学学系食品安全毒理学研究与评价北京市重点实验室100191

目的研究妊娠糖尿病对大鼠子代空腹血糖的影响,探索2'-岩藻糖基乳糖(2'-FL)改善妊娠糖尿病子代空腹血糖受损的能力及适宜剂量。方法将健康SD大鼠随机分为空白对照组及妊娠糖尿病(GDM)造模组。以高脂饮食配合小剂量链脲佐菌素腹... 详细信息

目的研究妊娠糖尿病对大鼠子代空腹血糖的影响,探索2'-岩藻糖基乳糖(2'-FL)改善妊娠糖尿病子代空腹血糖受损的能力及适宜剂量。方法将健康SD大鼠随机分为空白对照组及妊娠糖尿病(GDM)造模组。以高脂饮食配合小剂量链脲佐菌素腹腔注射建立GDM模型,GDM造模组产后随机分为对照组(GDM组)、GDM+2'-FL低剂量干预组(GLF组)、GDM+2'-FL中剂量干预组(GMF组)、GDM+2'-FL高剂量干预组(GHF组),每组8只孕鼠。于产后第3~21天对仔鼠进行灌胃,空白对照组与GDM组灌胃蒸馏水,GLF组、GMF组和GHF组分别给予0.2 g/kg、0.6 g/kg和1.8 g/kg的2'-FL灌胃。观察记录母鼠孕期、哺乳期空腹血糖和体重,无菌采集产后第3、11、21天乳汁分析2'-FL含量。记录仔鼠哺乳期体重,于产后第21天检测空腹血糖,产后第7、21天每窝处死雌雄各一只仔鼠,称取主要脏器重量并计算脏器系数。结果GDM组母鼠产后第3、21天乳汁中2'-FL含量显著低于空白对照组(P<0.05),两组乳汁中2'-FL含量在哺乳期均随时间推移降低。GDM组雌、雄仔鼠产后第21天空腹血糖均较空白对照组显著升高(P<0.05),GLF组的雌、雄仔鼠空腹血糖较GDM组显著降低(P<0.05),GMF组和GHF组与GDM组比较,仅雄性仔鼠空腹血糖显著降低(P<0.05)。产后第7天雌、雄仔鼠肝脏系数较空白对照组显著降低(P<0.05),GHF组雌鼠肝脏系数较GDM组显著升高(P<0.05)。产后第21天GDM组雄性仔鼠肝脏系数和雌性仔鼠肾脏系数较空白对照组显著升高(P<0.05),GHF组雌性仔鼠肾脏系数较GDM组显著降低(P<0.05)。结论受妊娠糖尿病影响的仔鼠空腹血糖受损,2'-FL干预可在一定程度上改善仔鼠空腹血糖受损。

关键词：妊娠糖尿病 2′-岩藻糖基乳糖干预作用空腹血糖受损

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北京市某高校青年大学生水摄入现况及与体成分、能量摄入、身体活动的关系

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中国食物与营养 2025年第4期31卷 94-100页

作者：曲畅张建芬张娜北京大学公共卫生学院营养与食品卫生学系北京100191 食品安全毒理学研究与评价北京市重点实验室北京100191

目的:描述北京市某高校青年大学生的水摄入量现状,并进一步探究水摄入量与体成分、能量摄入、身体活动等因素之间的相关性。方法:采用横断面研究设计,在北京某高校招募符合纳排标准的21名青年大学生,发放问卷调查其性别、年龄等基本情况... 详细信息

目的:描述北京市某高校青年大学生的水摄入量现状,并进一步探究水摄入量与体成分、能量摄入、身体活动等因素之间的相关性。方法:采用横断面研究设计,在北京某高校招募符合纳排标准的21名青年大学生,发放问卷调查其性别、年龄等基本情况;采用身高体重计、体成分仪测量其体格和体成分;使用《7天24小时饮水行为调查问卷》调查其饮水行为;采用3天双份饭和称重法相结合的方法调查其食物来源水分及宏量营养素摄入情况;使用三轴加速度计记录其身体活动情况。结果:21名调查对象均完成全部调查,调查对象每日饮水量中位数为1520mL,食物水摄入量中位数为1076mL,总水摄入量中位数为2424mL。单位体重细胞内水分含量小于等于均值的调查对象的饮水量显著高于单位体重细胞内水分含量大于均值组(P<0.05)。每日食物水摄入量与蛋白质、脂肪、碳水化合物供能及总能量摄入呈正相关(P均小于0.05)。结论:大学生水摄入量与体液含量、膳食能量摄入、身体活动等因素有关,需要进一步深入探究。

关键词：水摄入大学生体成分能量摄入身体活动

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一般人群饮水素养核心信息条目的构建及专家一致性评价

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中国食物与营养 2025年第3期31卷 25-29页

作者：朱云霞张娜北京大学公共卫生学院营养与食品卫生学系北京100191 食品安全毒理学研究与评价北京市重点实验室北京100191

目的:通过文献分析初步构建一般人群饮水素养核心信息条目,并进行专家一致性评价。方法:在文献综述的基础上,以当前我国居民的饮水行为现状及存在问题为导向,经文献检索与分析,并参考国际国内饮水相关指南及标准的推荐或建议,以生理学... 详细信息

目的:通过文献分析初步构建一般人群饮水素养核心信息条目,并进行专家一致性评价。方法:在文献综述的基础上,以当前我国居民的饮水行为现状及存在问题为导向,经文献检索与分析,并参考国际国内饮水相关指南及标准的推荐或建议,以生理学及病理生理学等为理论基础,初步构建一般人群饮水素养核心信息(Core Information of Water Intake/Hydration Literacy for General Population)的概念框架以及维度,并进行证据分析,形成初始条目;应用德尔菲专家咨询法对相关领域12名专家进行两轮咨询确定核心条目。结果:基于文献分析初拟一般人群饮水素养核心条目,通过电子邮件形式进行两轮德尔菲法专家咨询,两轮积极系数均为100%,平均权威程度为0.8375;第二轮条目总得分均值(4.75,n=20)较第一轮(4.72,n=20)有所提高,总协调系数为第一轮0.303、第二轮0.203(P均<0.001)。最终确定一般人群饮水素养核心条目20条,涵盖认知和技能2个领域,以及多维度。结论:应用德尔菲法进行专家咨询,对一般人群饮水素养核心信息已基本达成一致。

关键词：德尔菲一致性评价饮水素养一般人群

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母乳低聚糖组合物的免疫效应筛选及其配方牛奶对小鼠的免疫调节作用

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食品科学 2025年第11期46卷 190-197页

作者：孟丽苹杨畅续晓敏王美华史涵旭叶湾韵刘思远钱文涛李洪亮许雅君内蒙古蒙牛乳业(集团)股份有限公司内蒙古呼和浩特011500 蒙牛高科乳制品(北京)有限责任公司北京101100 北京大学公共卫生学院营养与食品卫生学系北京100191 食品安全毒理学研究与评价北京市重点实验室北京100191

目的:研究不同比例的2’-岩藻糖基乳糖(2’-fucosyllactose,2’-FL)、低聚果糖(fructooligosaccharide,FOS)和低聚半乳糖(galactooligosaccharide,GOS)组合物的增强免疫作用,并验证应用该组合物的配方牛奶的免疫功效。方法:采用免疫抑... 详细信息

目的:研究不同比例的2’-岩藻糖基乳糖(2’-fucosyllactose,2’-FL)、低聚果糖(fructooligosaccharide,FOS)和低聚半乳糖(galactooligosaccharide,GOS)组合物的增强免疫作用,并验证应用该组合物的配方牛奶的免疫功效。方法:采用免疫抑制斑马鱼模型,以T细胞数量、巨噬细胞数量、巨噬细胞吞噬能力和杯状细胞数量为依据,筛选2’-FL、GOS、FOS在增强免疫作用上的适宜比例。应用适宜比例的组合物研制儿童配方牛奶。采用环磷酰胺诱导的免疫抑制小鼠模型,评估配方牛奶对实验动物免疫器官组织形态学、外周血和(或)脾脏淋巴细胞、免疫球蛋白及细胞因子的影响。结果:2’-FL、GOS、FOS组合物能够增强免疫抑制斑马鱼的特异性免疫和非特异性免疫功能,在所有实验比例中,以1∶3∶3比例效果最优。采用含有组合物(1∶3∶3)的儿童配方牛奶对免疫抑制小鼠进行干预后,发现受损的脾脏、胸腺结构有所恢复,小鼠外周血白细胞数目升高至正常水平,CD4^(+)/CD8^(+)比值恢复正常,血白细胞介素(interleukin,IL)-4、IL-10、肿瘤坏死因子-α、C-反应蛋白等细胞因子水平有不同程度的升高趋势,其中IL-10质量浓度显著回升(P<0.05)。结论:2’-FL、GOS、FOS组合物具有免疫调节作用,效果受组合物的配比影响;含有适宜比例(1∶3∶3)的2’-FL、GOS、FOS组合物的儿童配方牛奶具有调节免疫作用。

关键词： 2’-岩藻糖基乳糖低聚果糖低聚半乳糖免疫调节配方牛奶

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线粒体靶向抗氧化剂甲磺酸米托醇与心血管健康

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生理科学进展 2025年第2期56卷 137-145页

作者：唐晓敏王军波北京大学公共卫生学院北京100191 北京市通州区疾病预防控制中心北京101100 食品安全毒理学研究与评价北京市重点实验室北京100191

心血管疾病严重影响人类健康,为亟待解决的公共卫生问题。线粒体代谢产生的活性氧是其发生发展的危险因素,当线粒体功能障碍时将产生过量活性氧,内源抗氧化系统无法清除过量活性氧时,会发生氧化应激损伤,损害心血管健康。通过营养干预... 详细信息

心血管疾病严重影响人类健康,为亟待解决的公共卫生问题。线粒体代谢产生的活性氧是其发生发展的危险因素,当线粒体功能障碍时将产生过量活性氧,内源抗氧化系统无法清除过量活性氧时,会发生氧化应激损伤,损害心血管健康。通过营养干预手段改善线粒体功能,减少活性氧,是防治心血管疾病的重要途径。甲磺酸米托醇(mitoquinol mesylate,MitoQ)作为线粒体靶向抗氧化剂,可靶向积聚在线粒体内膜,淬灭线粒体活性氧。本文综述了MitoQ的分子特性和作用机制及其改善心血管疾病的功效,并对比MitoQ与辅酶Q_(10)的异同,为MitoQ将来在心血管疾病防治方面的应用提供科学依据。

关键词： MitoQ 辅酶Q_(10) 线粒体抗氧化心血管疾病

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蓝光照射对剥夺光照抑郁大鼠大脑缰核中脑源性神经营养因子的影响

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中华预防医学杂志 2021年第6期55卷 767-773页

作者：孟庆贺蒋建军尚兰琴杨晓华魏雪涛肖倩倩郝卫东北京大学公共卫生学院毒理学系食品安全毒理学研究与评价北京市重点实验室100191

目的探讨蓝光照射对剥夺光照抑郁大鼠大脑缰核中脑源性神经营养因子(BDNF)的调节作用。方法采用随机数字表法,将雄性SD大鼠随机分为白光对照组(20只)和抑郁模型组(60只),分别给予白光照射和剥夺光照处理;18 d后将抑郁模型组大鼠随机均... 详细信息

目的探讨蓝光照射对剥夺光照抑郁大鼠大脑缰核中脑源性神经营养因子(BDNF)的调节作用。方法采用随机数字表法,将雄性SD大鼠随机分为白光对照组(20只)和抑郁模型组(60只),分别给予白光照射和剥夺光照处理;18 d后将抑郁模型组大鼠随机均分为抑郁模型组、蓝光处理组和红光处理组,分别给予剥夺光照、补充蓝光照射和补充红光照射处理。白光对照组继续给予白光照射。光照时长均为12 h/d,光照强度均为20 lx,处理持续36 d。期间采用蔗糖偏好试验检测动物的抑郁状态。分别测定各组大鼠大脑缰核、膝状体间叶和外侧膝状体腹侧核c-fos蛋白表达水平;测定缰核内环磷腺苷效应元件结合蛋白(CREB)磷酸化水平及下游蛋白BDNF表达水平。结果补充光照后,蓝光处理组大鼠单位体重蔗糖摄入量基本恢复至白光对照组水平(P>0.05),红光处理组和抑郁模型组大鼠单位体重蔗糖摄入量均低于白光对照组(P值均<0.05)。蓝光处理组大鼠大脑缰核、膝状体间叶和外侧膝状体腹侧核c-fos阳性神经元密度均高于抑郁模型组(P值均<0.05)。蓝光处理组大鼠大脑缰核内BDNF相对表达量和CREB磷酸化水平均高于抑郁模型组(P值均<0.05)。结论蓝光照射可缓解剥夺光照所致的大鼠抑郁样反应,蓝光可通过内在感光性视网膜神经节细胞激活缰核神经元反应,缰核中CREB/BDNF信号通路在蓝光抗抑郁效应中发挥重要作用。

关键词：抑郁大鼠大脑蓝光剥夺光照

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姜黄素干预通过促进自噬改善氯化锰所致的大鼠神经行为损伤

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北京大学学报（医学版） 2022年第3期54卷 400-411页

作者：来丽叶窦长松智翠娜陈洁马雪赵鹏姚碧云北京大学公共卫生学院毒理学系食品安全毒理学研究与评价北京市重点实验室北京100191

目的:探讨姜黄素(curcumin,CUR)对锰中毒大鼠神经损伤的干预效应及其机制。方法:成年雄性SD大鼠60只,随机分为5组,每组12只。(1)空白对照组:通过腹腔注射(intraperitoneal injection,ip)给予0.9%(质量分数)生理盐水,并通过灌胃(intragas... 详细信息

目的:探讨姜黄素(curcumin,CUR)对锰中毒大鼠神经损伤的干预效应及其机制。方法:成年雄性SD大鼠60只,随机分为5组,每组12只。(1)空白对照组:通过腹腔注射(intraperitoneal injection,ip)给予0.9%(质量分数)生理盐水,并通过灌胃(intragastric,ig)给予双蒸水(double distilled water,ddH_(2)O);(2)锰中毒模型组:ip给予MnCl_(2)15 mg/kg(Mn^(2+) 6.48 mg/kg),ig给予ddH_(2)O;(3)单独姜黄素组:ip给予0.9%生理盐水,ig给予CUR 300 mg/kg;(4)MnCl_(2)+CUR1组:ip给予MnCl_(2)15 mg/kg,ig给予CUR 100 mg/kg;(5)MnCl_(2)+CUR2组:ip给予MnCl_(2)15 mg/kg,ig给予CUR 300 mg/kg。5组大鼠每周给药5 d,连续给予4周。旷场实验、转棒实验检测动物的探索行为、焦虑抑郁状态、运动及平衡能力,Morris水迷宫(Morris water maze,MWM)实验检测动物的学习、记忆能力。每组6只大鼠进行脑纹状体HE染色和免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)检查,并且其中2只大鼠一侧纹状体进行透射电镜(transmission electron microscope,TEM)观察。每组另外6只大鼠的一侧纹状体利用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)测定锰含量,另一侧纹状体用免疫印迹(Western blotting,WB)检测α-突触核蛋白(α-Synuclein,α-Syn)、细胞质和细胞核转录因子EB(transcription factor EB,TFEB)、雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)、p-mTOR、Beclin1、P62和微管相关蛋白轻链蛋白3(microtubule-associated protein light chain-3,LC3)表达水平,脱氧核糖核苷酸末端转移酶介导的缺口末端标记法(terminal deoxynucleotidyl transterase-mediated dUTP nick end labeling;TUNEL)检测大鼠纹状体多巴胺能神经元凋亡。结果:旷场和转棒实验中,锰中毒模型组水平运动距离、直立次数、中央区运动时间和运动距离、在棒时间、在棒圈数较空白对照组显著降低(P<0.05),而MnCl_(2)+CUR2组的上述指标均较锰中毒模型组显著增加(P<0.05)。MWM定位航行实验第3、4天时,锰中毒模型组逃避潜伏期和游泳距离显著高于空白对照组,而MnCl_(2)+CUR2组则显著高于锰中毒模型组(P<0.05)。MWM探索实验中,锰中毒模型组大鼠穿越平台次数、目标象限游泳时间、目标象限游泳时间百分比、目标象限距离及目标象限距离百分比显著低于对照组(P<0.05),而MnCl_(2)+CUR2组大鼠这些指标均较锰中毒模型组显著增加(P<0.05)。脑纹状体IHC和HE染色发现,锰中毒模型大鼠脑纹状体中酪氨酸羟化酶(tyrosine hydroxylase,TH)阳性多巴胺能神经细胞显著减少,嗜酸性细胞数量显著增加,MnCl_(2)+CUR1和MnCl_(2)+CUR2组TH阳性细胞显著增加,嗜酸性细胞减少,TEM观察发现,锰中毒模型组纹状体神经细胞出现染色质凝结,核固缩;线粒体水肿或空泡,可见溶酶体以及自噬泡。MnCl_(2)+CUR2组染色质凝结,核固缩,线粒体水肿、空泡等均较锰中毒大鼠明显改善,并可见更多的溶酶体以及自噬泡。免疫印迹检测发现,锰中毒模型组α-Syn表达水平较空白对照组显著增加,而MnCl_(2)+CUR2组聚集性α-Syn表达则较锰中毒模型组显著减少(P<0.05)。TFEB及自噬相关蛋白免疫印迹检测发现,与空白对照组比较,单独CUR组、锰中毒模型组、MnCl_(2)+CUR1和MnCl_(2)+CUR2组纹状体胞核TFEB表达均显著增加(P<0.05),与锰中毒模型组比较,MnCl_(2)+CUR1和MnCl_(2)+CUR2组其表达均显著增加(P<0.05);与空白对照组比较,各组mTOR、p-mTOR、P62蛋白表达水平显著降低,Beclin1、LC3Ⅱ/LC3Ⅰ表达水平则显著增加(P<0.05);与锰中毒模型组相比,MnCl_(2)+CUR1和MnCl_(2)+CUR2组大鼠脑纹状体中mTOR、p-mTOR及P62蛋白表达水平显著降低,Beclin1、LC3Ⅱ/LC3Ⅰ表达水平显著增加(P<0.05)。纹状体TUNEL检测结果发现,与空白对照组比较,

关键词：锰中毒姜黄素转录因子EB 自噬

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基于肿瘤基因组图谱数据库探索性筛选潜在泛癌生物标志物

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北京大学学报（医学版） 2021年第3期53卷 602-607页

作者：周川马雪邢云昆李璐迪陈洁姚碧云傅娟玲赵鹏北京大学公共卫生学院毒理学系食品安全毒理学研究与评价北京市重点实验室北京100191

目的:基于肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库筛选潜在泛癌生物标志物,为多种肿瘤的诊断和预后评估提供帮助。方法:利用“GDC Data Transfer Tool”和“GDCRNATools”软件包获取TCGA数据库,完成数据整理,将13种肿瘤纳... 详细信息

目的:基于肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库筛选潜在泛癌生物标志物,为多种肿瘤的诊断和预后评估提供帮助。方法:利用“GDC Data Transfer Tool”和“GDCRNATools”软件包获取TCGA数据库,完成数据整理,将13种肿瘤纳入研究。以错误发现率(false discovery rate,FDR)<0.05且差异倍数(fold change,FC)>1.5作为差异表达标准,筛选在13种肿瘤中均上调或均下调的基因和微小RNA(microRNAs,miRNAs)。利用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC曲线)的曲线下面积(area under the curve,AUC)、最佳截断值及对应的灵敏度和特异度反映诊断价值。利用Kaplan-Meier法计算生存概率后进行对数秩(log-rank)检验并计算风险比(hazard ratio,HR)反映预后评估价值。利用DAVID工具对差异表达基因进行GO(Gene Ontology)、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析。利用STRING和TargetScan工具对差异表达基因和miRNAs进行调控网络分析。结果:共发现48个基因和2个miRNAs在13种肿瘤中均差异表达,其中25个基因均表达上调,23个基因和2个miRNAs均表达下调。多数差异表达基因和miRNAs区分病例和对照的能力较好,AUC、灵敏度和特异度可达0.8~0.9。生存分析结果显示,差异表达基因和miRNAs与多种肿瘤患者的生存显著相关,且多数上调基因是患者生存的危险因素(HR>1),而多数下调基因是患者生存的保护因素(0

关键词：泛癌生物标记,肿瘤基因表达调控基因组,人

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