检索结果-内蒙古大学图书馆

病毒学报 2017年第5期33卷 767-773页

作者：贾立平邓洁钱渊首都儿科研究所病毒研究室儿童病毒病病原学北京市重点实验室北京100020

为了解2016年夏季一起发生在某赴内蒙古旅游团游客中的急性胃肠炎暴发流行的病毒病原。分别采集此次胃肠炎暴发流行中两名患病游客腹泻症状发生后第3天、5天和7天的粪便标本,提取核酸后首先用荧光定量PCR扩增诺如病毒核酸进行检测,阳性... 详细信息

为了解2016年夏季一起发生在某赴内蒙古旅游团游客中的急性胃肠炎暴发流行的病毒病原。分别采集此次胃肠炎暴发流行中两名患病游客腹泻症状发生后第3天、5天和7天的粪便标本,提取核酸后首先用荧光定量PCR扩增诺如病毒核酸进行检测,阳性标本分别用RT-PCR扩增病毒VP1基因和RdRp区域基因,通过基因测序和序列比对进行基因分型,构建进化树确定进化同源性。通过荧光定量PCR法检测到两名患者的粪便标本均为诺如病毒阳性,提示此次胃肠炎暴发流行的病原为诺如病毒,进一步的RT-PCR扩增病毒基因分析显示检测到的诺如病毒为GII.P17-GII.G17型;构建系统进化树分析显示本次与2014~2015年度广州、中国香港、中国台湾和日本等地的病毒亲缘关系更为接近;氨基酸序列分析显示该基因型与2014年以来流行的毒株同源性较近,与2014年之前流行的毒株相比变异较大,氨基酸变异主要出现在主要衣壳蛋白的P结构域。提示GII.P17-GII.G17型诺如病毒也是引起内蒙地区急性胃肠炎暴发流行的病毒病原。

关键词：诺如病毒(Norovirus) 急性胃肠炎基因分型 GII.17型

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肠道病毒D68的研究进展

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中华实验和临床病毒学杂志 2019年第4期33卷 440-443页

作者：胡亚芳朱汝南首都儿科研究所病毒研究室儿童病毒病病原学北京市重点实验室北京100020

肠道病毒D68(enterovirus D68,EV-D68)首次于1962年被分离,随后少有报道。近10年,随着其基因多样性迅速增加,EV-D68在世界范围内的检出率开始增高。自2014年EV-D68在美国、加拿大及欧洲暴发流行以来,更多研究报道了其可引起严重的呼吸... 详细信息

肠道病毒D68(enterovirus D68,EV-D68)首次于1962年被分离,随后少有报道。近10年,随着其基因多样性迅速增加,EV-D68在世界范围内的检出率开始增高。自2014年EV-D68在美国、加拿大及欧洲暴发流行以来,更多研究报道了其可引起严重的呼吸道疾病和神经系统并发症,甚至死亡。然而,EV-D68的致病机制仍不明确,目前也没有用于预防和治疗的疫苗以及特效抗病毒药物。因此,持续监测和快速诊断EV-D68感染将更加有利于应对可能发生的暴发流行。本文综合论述了EV-D68的生物学特征、临床表现、流行情况等。

关键词：肠道病毒68型生物学特征临床表现流行病学

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北京婴幼儿腹泻中G1、G3型轮状病毒VP7基因分子进化动态分析

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病毒学报 2019年第3期35卷 377-384页

作者：董慧瑾朱汝南张又赵林清刘立颖贾立平德日钱渊首都儿科研究所病毒研究室儿童病毒病病原学北京市重点实验室北京100020

北京儿童腹泻中G1和G3型轮状病毒(Rotavirus,RV)的流行随时间动态变化。鉴于G1和G3型RV在疫苗研发设计中的重要地位,本研究依据前期对2007～2017北京腹泻就诊患儿中RV流行的监测结果,分别选取G1(15例)和G3(18例)型RV标本,应用DNAStar、M... 详细信息

北京儿童腹泻中G1和G3型轮状病毒(Rotavirus,RV)的流行随时间动态变化。鉴于G1和G3型RV在疫苗研发设计中的重要地位,本研究依据前期对2007～2017北京腹泻就诊患儿中RV流行的监测结果,分别选取G1(15例)和G3(18例)型RV标本,应用DNAStar、MEGA 6.0和BEAST软件包及Datamonkey在线工具,分析和预测11年来其主要中和抗原VP7基因的分子进化动态。结果显示G1和G3型RV同近年世界各地的各自主要流行株之间的进化距离近,相比同一进化树分支内参考株的VP7基因并没有表现出特有的氨基酸变异,提示并未有特别的基因变异直接改变北京G1和G3型RV的流行。本研究中北京G1和G3型RV最近共同祖先株形成时间分别约为2005年和1996年,其VP7基因平均进化速率分别为2.29×10^(-3)和5.11×10^(-4)氨基酸替换·位点^(-1)·年^(-1)。尽管G1型的变异速率大于G3型,但有意思的是它们均无正向选择变异位点。群体流行历史(Bayesian skyline plot,BSP)分析显示人群中G1和G3型RV的感染水平呈现缓慢下降,并均在2010年前后出现了跳跃式下降,随后有所上升并维持在较平稳的感染水平,基本符合北京腹泻儿童中RV流行趋势监测,据此推测群体免疫压力可能是影响G1和G3型RV的流行分布随时间动态变化的原因。分子分析结果还显示本研究中G1和G3型RV和相应型别疫苗株之间的进化距离远,且均在主要抗原区存在变异,这些是否对疫苗应用效果产生影响仍需要对RV的流行进行持续监测。

关键词：腹泻轮状病毒(RV) G1 G3 VP7 分子进化动态

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2013至2014年北京手足口病流行季相关肠道病毒型别变化和分析

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中华儿科杂志 2015年第8期53卷 610-615页

作者：宋秦伟黄辉邓洁赵林清邓莉孙宇王芳钱渊朱汝南首都儿科研究所病毒研究室儿童病毒病病原学北京市重点实验室北京100020 首都儿科研究所附属儿童医院感染科

目的分析北京2013至2014年手足口病流行期间肠道病毒的型别、流行趋势和临床特点，为手足口病的防治提供科学依据。方法2013年4至9月和2014年3至10月，首都儿科研究所附属儿童医院感染门诊就诊患儿的咽拭子标本共977份，其中2013年初步... 详细信息

目的分析北京2013至2014年手足口病流行期间肠道病毒的型别、流行趋势和临床特点，为手足口病的防治提供科学依据。方法2013年4至9月和2014年3至10月，首都儿科研究所附属儿童医院感染门诊就诊患儿的咽拭子标本共977份，其中2013年初步诊断手足口病患儿标本147份；2014年初步诊断手足口病患儿标本343例，不典型手足口病患儿标本201份，疱疹性咽峡炎患儿标本83份，发热伴抽搐患儿标本25份，发热伴出疹患儿标本64份，皮疹待查患儿标本114份。采用实时荧光逆转录聚合酶链反应方法检测肠道病毒（EV）通用型，肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A组16型（CA16）；采用巢式PCR方法对EV通用型阳性而非EV71和CA16的标本核酸进行VP1片段的扩增和测序分析以鉴定型别。分别比较不同年龄组、不同年份间肠道病毒的检出情况，分析其在两个年份的流行趋势。结果977份标本总阳性率为80．1％（783／977），其中CA16为25．6％（250／977），EV71为18．9％（185／977），CA6为20．0％（195／977），CA10为5．0％（49／977），CA4为1．5％（15／977），其他EV为9．1％（89／977），阴性19．9％（194／977）。2013年和2014年检出的各型别地方株同型间均具有较高的同源性，CA6的同源性为94．3％～100％，CA10的同源性为93．8％～99．1％，CA4的同源性为92．7％～99．8％。≤1岁年龄患儿肠道病毒总阳性率为71．1％（106／149），低于其他年龄组（P均〈0．05），但与〉5岁组相近（χ2=1．181，P=0．277）。2013年147例手足口病患儿标本中肠道病毒阳性率为85．7％（126／147），CA6为优势型别占54．8％（69／126），其次是CA16和EV71，分别为20．6％（26／126）和11．9％（15／126）。2014年343例手足口病患儿标本中肠道病毒阳性率为85．4％（293／343），CA16和EV71成为主要型别，分别占42．7％（125／293）和38．2％（112／293），而CA6仅占11．3％（33／293）。2014年不典型手足口病、疱疹性咽峡炎、发热伴抽搐、发热伴出疹和皮疹待查患儿标本的肠道病毒阳性率分别为83．6％（168／201），80．7％（67／83），76．0％（19／25），64．1％（41／64）和60．5％（69／114）。各型肠道病毒的流行高峰主要集中在5至8月份，而每年各型肠道病毒的流行趋势却没有明显的规律。结论北京地区引发儿童手足VI病的肠道病毒，2013年CA6占据第一，2014年CA16和EV71再次成为主要型别；CA6、CA10和CA4等型别肠道病毒引发的临床症状与EV71和CA16引发的临床症状可能存在差异；除EV71和CA16外，也需要重视对CA6、CA10和CA4等其他型别肠道病毒的监测和研究。

关键词：手足口病肠道病毒属基因型儿童

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2010⁃2019年北京地区腹泻患儿中人腺病毒41型Fiber基因分子特征和进化分析

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病毒学报 2021年第5期37卷 1102-1111页

作者：刘立颖钱渊贾立平董慧谨朱汝南首都儿科研究所病毒研究室儿童病毒病病原学北京市重点实验室北京100020

人腺病毒41型(Human adenovirus 41,HAdV-41)是引起儿童腹泻的重要病原之一。为了解北京地区腹泻儿童中HAdV-41 Fiber基因的分子变异和遗传进化特征,选取2010-2019年首都儿科研究所附属儿童医院门诊腹泻患儿HAdV-41阳性的粪便标本,扩增F... 详细信息

人腺病毒41型(Human adenovirus 41,HAdV-41)是引起儿童腹泻的重要病原之一。为了解北京地区腹泻儿童中HAdV-41 Fiber基因的分子变异和遗传进化特征,选取2010-2019年首都儿科研究所附属儿童医院门诊腹泻患儿HAdV-41阳性的粪便标本,扩增Fiber全基因,使用多种生物信息学软件进行系统发生、遗传进化、种群演变和选择压力等分析。结果显示HAdV-41本地毒株存在1644碱基(547氨基酸)和1689碱基(562氨基酸)两种长度的Fiber基因,截短的15个氨基酸位于Fiber蛋白纤维轴区。Mann-Whitney U秩和检验提示检测到感染短Fiber基因的HAdV-41的患儿年龄更小(P=0.036)。同源性分析结果显示Fiber基因的核苷酸和氨基酸序列同源性均大于97%,主要分为四个进化分支(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ),其中Ⅰ和Ⅲ是主要的流行分支,分支Ⅰ主要在国内流行,而分支Ⅲ全球均有流行。HAdV-41共祖起源可追溯到1856年,平均进化速率每年为6.81×10^(-5)碱基替换/位点,10年间理论有效种群一直比较平稳呈缓慢下降趋势。压力选择分析表明,一个正向和三个负向选择位点均位于Fiber蛋白的纤维轴区。上述结果表明2010-2019年间不同进化分支的HAdV-41在北京地区流行,进化速率稳定。Fiber蛋白轴区存在两种不同类型的氨基酸缺失。

关键词：人腺病毒41型(HAdV-41) 纤维蛋白腹泻分子进化

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人腺病毒流行病学研究进展

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病毒学报 2021年第3期37卷 732-739页

作者：杨传宇赵林清首都儿科研究所病毒研究室儿童病毒病原学北京市重点实验室北京100020

人腺病毒(Human adenovirus,HAdV)是引起儿童急性呼吸道感染(ARTIs)的主要原因之一,可引起重症肺炎的暴发流行,迄今为止尚无安全有效的防治手段。HAdV已有52个血清型,被分为7组,即HAdV A-G。有研究提示不同的型别导致的疾病严重程度不同... 详细信息

人腺病毒(Human adenovirus,HAdV)是引起儿童急性呼吸道感染(ARTIs)的主要原因之一,可引起重症肺炎的暴发流行,迄今为止尚无安全有效的防治手段。HAdV已有52个血清型,被分为7组,即HAdV A-G。有研究提示不同的型别导致的疾病严重程度不同,不同时间和地区的优势型别也有所差异。近年来,不断有新的HAdV型别被发现,已报道的共有103个型别。HAdV不断地以重组等方式进化,导致了组织嗜性和中和特性的改变,从而产生高致病性、高传染性的新型毒株,对疾病防控提出了新的挑战。本文以已有研究结果为基础,综合对HAdV的流行病学特征进行综述,为HAdV的疫苗研制和疾病防控提供参考依据。

关键词：人腺病毒(HAdV) 呼吸道感染流行病学血清型基因型

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人呼吸道合胞病毒的流行病学研究进展

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病毒学报 2017年第6期33卷 938-943页

作者：张拓慧赵林清首都儿科研究所病毒研究室儿童病毒病原学北京市重点实验室北京100020

人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,hRSV)是婴幼儿毛细支气管炎和支气管肺炎等严重下呼吸道感染的最主要病原,还与之后哮喘的发生关系密切。hRSV可分为A、B两种抗原亚型,对hRSV的黏附蛋白G进行核苷酸序列分析又可进... 详细信息

人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,hRSV)是婴幼儿毛细支气管炎和支气管肺炎等严重下呼吸道感染的最主要病原,还与之后哮喘的发生关系密切。hRSV可分为A、B两种抗原亚型,对hRSV的黏附蛋白G进行核苷酸序列分析又可进一步将其分为多种基因型,不同时间或地区流行的hRSV亚型和基因型有所差异,不同型别hRSV导致的hRSV疾病严重程度可能也存在差异。迄今为止仍没有安全有效的措施防治hRSV。本文现对hRSV的流行病学研究进展综述,为hRSV疫苗的研制和hRSV疾病的防控提供参考。

关键词：人呼吸道合胞病毒(hRSV) 流行病学亚型基因型

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北京腹泻儿童中G9-Ⅵ轮状病毒再次出现并呈优势流行

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病毒学报 2016年第4期32卷 436-444页

作者：董慧瑾孙宇赵林清邓莉朱汝南陈冬梅贾立平刘立颖张又钱渊首都儿科研究所病毒研究室儿童病毒病病原学北京市重点实验室北京100020 首都儿科研究所附属儿童医院感染科北京100020

1994年从北京腹泻儿童中鉴定的国内首例G9型A组轮状病毒(Group A Rotavirus,RVA)株T203属于G9-Ⅵ(VP7基因进化树支Ⅵ),而之后国内流行的G9型RVAs主要属于全球广泛流行的G9-Ⅲ(VP7基因进化树支Ⅲ)。本研究于2010年通过基因测序从北京腹... 详细信息

1994年从北京腹泻儿童中鉴定的国内首例G9型A组轮状病毒(Group A Rotavirus,RVA)株T203属于G9-Ⅵ(VP7基因进化树支Ⅵ),而之后国内流行的G9型RVAs主要属于全球广泛流行的G9-Ⅲ(VP7基因进化树支Ⅲ)。本研究于2010年通过基因测序从北京腹泻儿童中再次鉴定了一例RVA G9-Ⅵ。为了解北京儿童中G9-Ⅵ再次流行的情况,本研究对国内外人G9型RVAs的VP7基因进行多序列比对分析,在G9-Ⅲ和G9-Ⅵ病毒各自VP7基因序列比较保守、彼此间变异集中的区域设计杂交探针,经PCR合成地高辛标记的cDNA探针,建立区分G9-Ⅲ和G9-Ⅵ的斑点杂交方法;结合本实验室前期建立的RVA常见G和P基因型杂交鉴定方法,对2011-2012年门诊腹泻就诊患儿中RVAs的流行进行调查。结果显示G9型检出率最高(43.5%,57/131),其次是G3(30.5%)、G1(12.2%)和G2(11.5%),未发现G4型。P分型结果显示P[8]为主要基因型(85.2%),其次P[4]型(14.8%),未发现P[6]型。对57例G9型RVAs全部进行G9-Ⅲ和G9-Ⅵ杂交鉴定。结果显示:G9-Ⅵ占96.5%,取代G9-Ⅲ(3.5%)成为优势流行的G9型病毒。从VP7基因进化树图上看到,本研究鉴定的北京人RVA G9-Ⅵ同国内外近期多地出现的人RVA G9-Ⅵ进化关系密切,并且和加拿大的猪RVA株F7P4进化距离近。国内外新近重新出现的人G9-Ⅵ RVAs是否在进化过程中获得了比以往广泛流行的RVA G9-Ⅲ更强的传播能力或致病力,值得进一步研究。

关键词：轮状病毒地高辛斑点杂交 G9

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正确分析儿童急性呼吸道感染病毒病原检测结果

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中华实用儿科临床杂志 2021年第24期36卷 1856-1860页

作者：孙宇赵林清首都儿科研究所病毒学研究室儿童病毒病病原学北京市重点实验室北京100020

急性呼吸道病毒感染给世界各地的儿童造成了巨大的疾病负担,早期、快速、准确的病毒病原诊断对于选择适当的治疗、拯救生命、阻止暴发流行及避免不必要的抗生素使用具有重要意义。面对日益增多且多样化的实验室诊断方法,需要正确分析儿... 详细信息

急性呼吸道病毒感染给世界各地的儿童造成了巨大的疾病负担,早期、快速、准确的病毒病原诊断对于选择适当的治疗、拯救生命、阻止暴发流行及避免不必要的抗生素使用具有重要意义。面对日益增多且多样化的实验室诊断方法,需要正确分析儿童急性呼吸道感染病毒病原检测结果。现对目前在用或即将应用于临床的诊断方法进行概述,并对临床报告的正确解读加以详细阐述,以便为临床医师更好地分析呼吸道病毒病原结果提供帮助。

关键词：病毒病原急性呼吸道感染诊断方法儿童

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人呼吸道合胞病毒快速抗原检测方法的床旁检测适用性探讨

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中华儿科杂志 2017年第2期55卷 139-143页

作者：丁雅馨田润钱渊孙宇邓洁王芳朱汝南赵林清首都儿科研究所病毒研究室儿童病毒病病原学北京市重点实验室北京 100020

目的探讨呼吸道合胞病毒（RSV）快速抗原检测方法的临床实用性，为临床选择床旁检测方法提供依据。方法收集2015年1月5日至2月7日首都儿科研究所附属儿童医院临床疑为病毒感染的急性呼吸道感染（ARI）住院患儿呼吸道标本209份，其中包... 详细信息

目的探讨呼吸道合胞病毒（RSV）快速抗原检测方法的临床实用性，为临床选择床旁检测方法提供依据。方法收集2015年1月5日至2月7日首都儿科研究所附属儿童医院临床疑为病毒感染的急性呼吸道感染（ARI）住院患儿呼吸道标本209份，其中包括咽拭子标本78份、鼻咽分泌物标本131份。应用免疫层析方法，对上述标本进行RSV快速抗原检测，应用转录（1iT）-巢式PCR进行RSV核酸检测。对其中的鼻咽分泌物标本，同时应用直接免疫荧光进行RSV抗原检测。统计学分析快速抗原检测方法的灵敏度、特异度及与对照方法间的一致性。结果RSV快速抗原检测方法与直接免疫荧光相比较，在鼻咽分泌物检测中特异度为97．3％，灵敏度为83．9％，两种方法的一致性检验Kappa=0．86；X^2=73．9561，P〈0．01；与RT-巢式PCR相比较，特异度在鼻咽分泌物中为100．0％，咽拭子中为92．0％，灵敏度在鼻咽分泌物中为74．2％，咽拭子中为77．8％，两种方法的一致性检验在鼻咽分泌物中Kappa=0．74，X^2=73．9561，P〈0．01，在咽拭子中Kappa=0．62，X^2=25．2478，P〈0．01。采用RSV快速抗原和RT-巢式PCR检测，咽拭子标本的RSV阳性检出率（21．7％、7．3％）均明显低于鼻咽分泌物标本（78．3％、78．0％）。RSV快速抗原检测方法可床旁、手工操作，整体操作所需时间约为10min。结论RSV快速抗原检测方法与直接免疫荧光及RT-巢式PCR方法相比较，有很好的灵敏度与特异度，RSV快速抗原检测为RSV阳性的标本可确定为阳性，但阴性结果需要进一步经直接免疫荧光及RT-巢式PCR方法确证；对临床诊断为急性呼吸道感染的儿童进行RSV检测时更适合用鼻咽分泌物标本；RSV快速抗原检测方法具有快速、高效、操作方便等特点，适合于床旁检测。

关键词：呼吸道合胞病毒床旁检测抗原检测

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