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中国防痨协会2016年全国学术大会

作者：王桂荣姜广路陈素婷于霞王晓波赵立平马异峰董玲玲黄海荣 101149 首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室北京市耐药结核病研究重点实验室

目的确定牛分枝杆菌在中国肺结核患者中的感染状况.方法首先对源于2007-2009年全国耐药基线调查分离到的4069株分枝杆菌,通过对硝基苯甲酸培养基(PNB)和噻吩-2羧酸肼培养基(TCH)进行菌种初步鉴定,然后同时采用Spoligotyping技术和多位... 详细信息

目的确定牛分枝杆菌在中国肺结核患者中的感染状况.方法首先对源于2007-2009年全国耐药基线调查分离到的4069株分枝杆菌,通过对硝基苯甲酸培养基(PNB)和噻吩-2羧酸肼培养基(TCH)进行菌种初步鉴定,然后同时采用Spoligotyping技术和多位点PCR技术进行牛分枝杆菌鉴定.由于牛分枝杆菌在含丙酮酸钠的罗氏培养基上生长更旺盛,对来自北京胸科医院的1828个临床样品同时接种于普通罗氏培养基和含4.5 mg/ml丙酮酸钠的罗氏培养基上,对于在含丙酮酸钠的罗氏培养基上生长更旺盛的菌株通过多位点PCR技术进行牛分枝杆菌鉴定.结果全国耐药基线调查分离到的菌株中仅有1株被鉴定为BCG,该菌株的基因型为SB0120 (ST482);来自北京胸科医院的样品中未分离到牛分枝杆菌.结论牛分枝杆菌在中国肺结核患者中不具有重要公共卫生意义,所以在日常实验室检测和肺结核治疗中不需要特意考虑牛分枝杆菌.

关键词：肺结核牛分枝杆菌感染

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北京家族结核分枝杆菌鉴定方法的研究进展

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中国防痨杂志 2016年第2期38卷 148-153页

作者：郭立娟黄海荣高飞王桂荣内蒙古医科大学研究生学院呼和浩特010059 首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室北京市耐药结核病研究重点实验室内蒙古自治区第四医院

结核病仍是严重威胁人类健康的全球公共卫生问题之一。北京家族结核分枝杆菌是我国大部分地区流行的主要菌株。作者论述了插入序列IS6110-限制性片段长度多态性（IS6110-RFLP）、间隔区寡核苷酸分型（Spoligotyping）、长序列多态性（LS... 详细信息

结核病仍是严重威胁人类健康的全球公共卫生问题之一。北京家族结核分枝杆菌是我国大部分地区流行的主要菌株。作者论述了插入序列IS6110-限制性片段长度多态性（IS6110-RFLP）、间隔区寡核苷酸分型（Spoligotyping）、长序列多态性（LSP）以及单核苷酸多态性（SNP）等多种北京家族结核分枝杆菌分型技术，并讨论了各技术的优缺点，以便对北京家族结核分枝杆菌的鉴定提供可靠依据。

关键词：分枝杆菌,结核基因型

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脓肿分枝杆菌gyrA和gyrB基因突变与左氧氟沙星和莫西沙星耐药的相关性

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中华结核和呼吸杂志 2015年第7期38卷 507-510页

作者：陈素婷聂文娟尚媛媛梁倩付育红马异峰初乃惠黄海荣首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室耐药结核病研究北京市重点实验室 101149

目的分析脓肿分枝杆菌gyrA和gyrB基因的突变形式及其与左氧氟沙星和莫西沙星耐药的相关性.方法纳入菌株为2008至2012年首都医科大学附属北京胸科医院分离的、且经16SrRNA、rpoB基因、hsp65和ITS（Internal Transcribed Spacer）测序... 详细信息

目的分析脓肿分枝杆菌gyrA和gyrB基因的突变形式及其与左氧氟沙星和莫西沙星耐药的相关性.方法纳入菌株为2008至2012年首都医科大学附属北京胸科医院分离的、且经16SrRNA、rpoB基因、hsp65和ITS（Internal Transcribed Spacer）测序鉴定为脓肿分枝杆菌临床分离株.用微孔板阿尔玛蓝染色方法测定脓肿分枝杆菌临床分离株对左氧氟沙星和莫西沙星的***扩增临床分离株的gyrA和gyrB基因,并对扩增产物进行测序和序列比对分析.结果 70株脓肿分枝杆菌临床分离株,包括45株脓肿亚种和25株马赛亚种,其中68株对左氧氟沙星耐药（10株对莫西沙星耐药）,交叉耐药率为14.3％（10株/68株）.不论是脓肿亚种还是马赛亚种,所有临床分离株gyrA基因的喹诺酮耐药决定区（QRDR）序列第83位为丙氨酸,而gyrB基因QRDR第447位和464位分别是精氨酸和天冬酰胺.马赛亚种临床株的gyrB基因的第541位氨基酸不同于脓肿亚种临床株,存在苏氨酸置换成丝氨酸的亚种间氨基酸多态性,可用于脓肿分枝杆菌亚种鉴定,但未发现与左氧氟沙星和莫西沙星耐药相关的氨基酸突变.结论脓肿分枝杆菌gyrA和gyrB基因的突变形式与左氧氟沙星和莫西沙星耐药没有明确的相关性.

关键词：分枝杆菌属喹诺酮类基因

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四川盆地结核分枝杆菌群体遗传学特征的研究

四川盆地结核分枝杆菌群体遗传学特征的研究

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首届京津冀临床流行病学和循证医学协同发展促进会暨2016北京医学会临床流行病学和循证医学分会第二届学术年会

作者：李卫民李颖付育红原梅董玲玲黄海荣高基民首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室温州医科大学检验医学院生命科学学院浙江省模式生物技术与应用重点实验室

探讨在中国四川盆地流行的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)群体遗传学特征.结果表明北京谱系和欧美谱系MTB在四川盆地以“互相对抗”形式流行;两谱系MTB遗传分化存在差异;欧美谱系MTB的侵入可能与一次历史事件(约720年前... 详细信息

探讨在中国四川盆地流行的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)群体遗传学特征.结果表明北京谱系和欧美谱系MTB在四川盆地以“互相对抗”形式流行;两谱系MTB遗传分化存在差异;欧美谱系MTB的侵入可能与一次历史事件(约720年前的一次战争)有关。

关键词：结核分枝杆菌群体遗传学北京谱系欧美谱系

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CRISPR-Cas9系统在真核细胞领域内的研究进展

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标记免疫分析与临床 2016年第10期23卷 1218-1225页

作者：肖婧张宗德申阿东北京市结核病胸部肿瘤研究所首都医科大学附属北京胸科医院分子生物学实验室耐药结核病研究北京市重点实验室北京101149 首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所儿科学国家重点学科教育部儿科重大疾病研究重点实验室国家呼吸系统疾病临床医学研究中心儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室北京100045

CRISPR-Cas免疫系统在天然状态下保护细菌和古生菌免受外来质粒或噬菌体的入侵。研究者们根据Ⅱ型CRISPRCas系统开发了全新的基因编辑工具——CRISPR-Cas9,它利用与靶序列互补的向导RNA引导Cas9酶定点切割DNA,该技术具有设计简单、操作... 详细信息

CRISPR-Cas免疫系统在天然状态下保护细菌和古生菌免受外来质粒或噬菌体的入侵。研究者们根据Ⅱ型CRISPRCas系统开发了全新的基因编辑工具——CRISPR-Cas9,它利用与靶序列互补的向导RNA引导Cas9酶定点切割DNA,该技术具有设计简单、操作方便、特异性强、效率高等优势,成为新一代基因组编辑技术。本文综述了CRISPR-Cas系统的技术发展史、最新分类和作用原理,重点介绍了近几年来CRISPR-Cas9系统应用于真核细胞领域的研究进展。

关键词： CRISPR-Cas9系统真核细胞基因编辑基因调节

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四川盆地结核分枝杆菌群体遗传学特征的研究

四川盆地结核分枝杆菌群体遗传学特征的研究

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中国防痨协会2016年全国学术大会

作者：李卫民李颖付育红原梅董玲玲黄海荣高基民 101149 首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室温州医科大学检验医学院生命科学学院浙江省模式生物技术与应用重点实验室

目的:探讨在中国四川盆地流行的结核分枝杆菌群体遗传学特征. 方法:对收集自四川盆地(重庆和四川地区)的413株Mtb行长序列多态性(LSP)谱系鉴定;采用x2检验分析不同谱系Mtb在人群中的分布差异.对上述菌株行15位点数目可变串联重复序列... 详细信息

目的:探讨在中国四川盆地流行的结核分枝杆菌群体遗传学特征. 方法:对收集自四川盆地(重庆和四川地区)的413株Mtb行长序列多态性(LSP)谱系鉴定;采用x2检验分析不同谱系Mtb在人群中的分布差异.对上述菌株行15位点数目可变串联重复序列(VNTR)基因分型,评价各位点的分辨力.构建N-J树分析其系统进化;构建最小跨度树以模拟群体菌株的遗传结构;采用分子方差分析该地区不同谱系菌株的遗传分化;采用贝叶斯模型计算最近共祖年代. 结果:通过LSP可将413株Mtb菌株分为两大谱系,其中北京谱系占56.2％(232/413);欧美谱系占43.8％(181/413).两谱系Mtb在人群中的分布(性别、年龄、民族及耐药性)差异无统计学意义(P＞0.05).北京谱系Mtb的N-J树呈放射状分布,最小跨度树中有72.4％(168/232)的菌株被划分到同一"克隆复合群".欧美谱系Mtb的N-J树呈枝状分布,最小跨度树中呈现出多个"克隆复合群".北京谱系Mtb在重庆和四川两地区间有显著的遗传分化(FST=0.01891,P＜0.05),而欧美谱系Mtb遗传分化不显著(FST=0.00519,P＞0.05).欧美谱系Mtb中最大克隆复合群(共71株)的最近共祖年代为723年(95％CI:517～946年). 结论:北京谱系和欧美谱系Mtb在四川盆地以"互相对抗"形式流行;两谱系Mtb遗传分化存在差异;欧美谱系Mtb的侵入可能与一次历史事件(约720年前的一次战争)有关.

关键词：结核分枝杆菌长序列多态性群体遗传学地区差异

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四川盆地结核分枝杆菌群体遗传学特征研究

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中华流行病学杂志 2015年第4期36卷 374-378页

作者：李颖付育红原梅董玲玲黄海荣李卫民高基民温州医科大学检验医学院生命科学学院浙江省模式生物技术与应用重点实验室 325035 首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室

目的探讨四川盆地（重庆、四川地区）流行的结核分枝杆菌（MTB）群体遗传学特征。方法对413株源自四川盆地的MTB进行长序列多态性（LSP）谱系鉴定，采用3（2检验分析不同谱系MTB在人群中的分布差异。对菌株进行15位点数目可变串联重复... 详细信息

目的探讨四川盆地（重庆、四川地区）流行的结核分枝杆菌（MTB）群体遗传学特征。方法对413株源自四川盆地的MTB进行长序列多态性（LSP）谱系鉴定，采用3（2检验分析不同谱系MTB在人群中的分布差异。对菌株进行15位点数目可变串联重复序列基因分型，评价各位点的分辨力。构建N—J树分析其系统进化；构建最小跨度树以模拟群体菌株的遗传结构；采用分子方差分析不同谱系MTB的群体问遗传分化；采用贝叶斯模型计算菌株最近共祖年代。结果通过LSP可将413株MTB分为两大谱系，其中北京谱系占56．2％（232／413），欧美谱系占43．8％（181／413）。两谱系MTB在人群中的分布（性别、年龄、民族以及菌株耐药性）差异无统计学意义（P〉0．05）。北京谱系MTB的N—J树呈放射状分布，最小跨度树中有72．4％（168／232）的菌株被划分到同一“克隆复合群”；欧美谱系MTB的N—J树呈枝状分布，最小跨度树中呈现出多个“克隆复合群”。北京谱系MTB在该地区有显著的群体间遗传分化（F ST=0．01891，P〈0．05），而欧美谱系MTB群体间遗传分化不显著（F ST=0．00519，P〉0．05）。欧美谱系MTB中最大菌株复合群的最近共祖年代为723（95％CI：517-946）年。结论北京谱系和欧美谱系MTB在四川盆地以“互相对抗”形式流行；两谱系MTB的群体间遗传分化存在差异；欧美谱系MTB的侵入可能与一次历史事件（约720年前的战争）有关。

关键词：结核分枝杆菌长序列多态性欧美谱系群体遗传学

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中国肺结核患者中牛分枝杆菌的感染状况研究

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结核病与胸部肿瘤 2016年第3期 232-232页

作者：姜广路王桂荣陈素婷于霞王晓波赵立平马异峰董玲玲黄海荣首都医科大学附属北京胸科医院/北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室/北京市耐药结核病研究重点实验室

【摘要】目的是确定牛分枝杆菌在中国肺结核患者中的感染状况。菌株源为2007-2009年全国耐药基线调查分离到的4069株分枝杆菌，首先通过对硝基苯甲酸培养基（PNB）和噻吩-2羧酸肼培养基（TCH）进行菌种初步鉴定，然后同时采用spoligotyp... 详细信息

【摘要】目的是确定牛分枝杆菌在中国肺结核患者中的感染状况。菌株源为2007-2009年全国耐药基线调查分离到的4069株分枝杆菌，首先通过对硝基苯甲酸培养基（PNB）和噻吩-2羧酸肼培养基（TCH）进行菌种初步鉴定，然后同时采用spoligotyping技术和多位点PCR技术进行牛分枝杆菌的鉴定。

关键词：牛分枝杆菌肺结核患者感染状况 spoligotyping 中国 2009年硝基苯甲酸 PCR技术

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抗结核药物间生物学关系的再思考

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临床肺科杂志 2015年第12期20卷 2135-2138页

作者：孙照刚首都医科大学附属北京胸科医院国家结核病临床实验室北京市结核病胸部肿瘤研究所耐药结核病研究北京市重点实验室北京101149

抗结核药物间存在相互作用。世界卫生组织（ WHO）在制定合理的抗结核治疗方案时已经充分考虑到这些因素,并且经过世界各国的广泛实践,其可靠性得到充分认识。当然这些因素也包括抗结核药物与治疗HIV和糖尿病等合并疾病的治疗药物之间... 详细信息

抗结核药物间存在相互作用。世界卫生组织（ WHO）在制定合理的抗结核治疗方案时已经充分考虑到这些因素,并且经过世界各国的广泛实践,其可靠性得到充分认识。当然这些因素也包括抗结核药物与治疗HIV和糖尿病等合并疾病的治疗药物之间的相互作用,这些在WHO抗结核治疗指南中也做了描述[1,2],在此不再赘述。本文重点强调在制定缩短疗程方案和抗结核新药治疗方案等方面时应当考虑组学（ OMICs）技术、遗传学以及分子生物学的科学发现,主要从抗结核药物之间关系的科学发现入手,探讨他们对抗结核药物选择的影响,以供结核病工作者参考。

关键词：抗结核药物生物学关系世界卫生组织治疗方案相互作用分子生物学治疗药物合并疾病

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潜伏感染者实施预防性治疗面临的几个科学问题

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临床肺科杂志 2015年第10期20卷 1747-1749页

作者：孙照刚首都医科大学附属北京胸科医院国家结核病临床实验室北京市结核病胸部肿瘤研究所耐药结核病研究北京市重点实验室北京101149

世界卫生组织在2014年底提出了有关结核潜伏感染管理的指南性文件,其中预防性治疗引人关注,具有重要的现实意义。随着现代生物学技术的快速发展,结核分枝杆菌的潜伏感染得到更深入的认识。最近的研究表明:确定潜伏感染者的检测技术具有... 详细信息

世界卫生组织在2014年底提出了有关结核潜伏感染管理的指南性文件,其中预防性治疗引人关注,具有重要的现实意义。随着现代生物学技术的快速发展,结核分枝杆菌的潜伏感染得到更深入的认识。最近的研究表明:确定潜伏感染者的检测技术具有一定的局限性,而存在于干细胞内的潜伏感染结核分枝杆菌不容易被清除,并且体内潜伏感染结核分枝杆菌与活动性结核分枝杆菌存在相同的突变率,加之我们对抗结核药物之间的关系还缺乏深入了解,一种药物的耐药性可能导致其它药物的最低抑菌浓度(MIC)值升高。上述这些发现提示我们潜伏感染结核分枝杆菌的预防性治疗仍然存在一些基础科学问题有待进一步研究。

关键词：预防性治疗潜伏感染基础科学感染者结核分枝杆菌抗结核药物世界卫生组织最低抑菌浓度

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