检索结果-内蒙古大学图书馆

黑龙江畜牧兽医 2024年第2期 99-104,110页

作者：安而立嵇辛勤阮涌王晗晗罗晓宇龙丹丹陈佳琪杨纯培姚碧琼贵州大学动物科学学院贵阳550025 贵州省动物疫病研究所贵阳550025 贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025 贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵阳550025 三穗县动物疫病预防控制中心贵州三穗556500

为了开展三穗麻鸭鸭坦布苏病毒(Duck Tembusu virus,DTMUV)的净化及探索净化后复方中草药对核心群生产性能及免疫指标的影响,试验采集胎粪、血液、泄殖腔棉拭子、蛋清样本共170573份,应用ELISA、PCR方法进行鸭坦布苏病毒抗原检测。依据... 详细信息

为了开展三穗麻鸭鸭坦布苏病毒(Duck Tembusu virus,DTMUV)的净化及探索净化后复方中草药对核心群生产性能及免疫指标的影响,试验采集胎粪、血液、泄殖腔棉拭子、蛋清样本共170573份,应用ELISA、PCR方法进行鸭坦布苏病毒抗原检测。依据检测结果淘汰阳性鸭,结合禽病的综合防控措施,实施5个世代鸭坦布苏病毒净化方案,建立鸭坦布苏病毒核心净化群,并测定其繁殖性能指标(产蛋率、受精率、孵化率、雏鸭成活率、育成率)。在净化后4世代,从核心群中挑选7日龄三穗麻鸭共120只,分为4组,分别为低、中、高剂量组及对照组,每组3个重复,每个重复10只。低、中、高剂量组在基础日粮中分别添加0.1%、0.2%、0.3%的复方中草药,对照组只饲喂基础日粮,连续饲喂30 d后测定其生产性能指标(平均日增重、平均日采食量、料重比、平均终末体重、平均产蛋量)及免疫指标[免疫球蛋白A(IgA)、免疫球蛋白M(IgM)、免疫球蛋白G(IgG)、白细胞介素-2(IL-2)、白细胞介素-4(IL-4)、白细胞介素-6(IL-6)、γ干扰素(IFN-γ)]。结果表明:经过5个世代净化,三穗麻鸭鸭坦布苏病毒抗原阳性率由0世代的5.11%下降至4世代的0;与0世代相比,产蛋率、受精率、孵化率、雏鸭成活率、育成率分别增加21.53%、11.06%、2.87%、3.95%、5.38%。高剂量组三穗麻鸭平均日增重、平均日采食量、平均终末体重、平均产蛋量均显著高于对照组(P<0.05),低、中、高剂量组IgA、IFN-γ、IL-2、IL-4、IL-6的质量浓度均显著高于对照组(P<0.05);中、高剂量组IgG、IgM的质量浓度均显著高于对照组(P<0.05),低剂量组与对照组差异不显著(P>0.05)。说明该方案净化效果良好,在基础日粮中添加0.3%复方中草药可提高三穗麻鸭生产性能与机体免疫功能。

关键词：鸭坦布苏病毒三穗麻鸭净化复方中草药免疫指标

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F_(3)代香苏杂交猪DKK1基因多态性与生长性状的关联性

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南方农业学报 2022年第4期53卷 969-976页

作者：许家利许厚强阮涌赵佳福倪萌萌孙金魁石鹏飞贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵州贵阳550025

【目的】筛选出F_(3)代香苏杂交猪Dickkopf-1基因(DKKI)的单核苷酸多态性位点(SNPs),并分析基因多态性与生长性状的关联性,为培育香苏杂交猪新品系提供参考依据,同时为深入研究DKK1基因生物学功能打下基础。【方法】通过DNA混池测序的... 详细信息

【目的】筛选出F_(3)代香苏杂交猪Dickkopf-1基因(DKKI)的单核苷酸多态性位点(SNPs),并分析基因多态性与生长性状的关联性,为培育香苏杂交猪新品系提供参考依据,同时为深入研究DKK1基因生物学功能打下基础。【方法】通过DNA混池测序的方法对164头F_(3)代香苏杂交猪群体DKK1基因进行SNPs鉴定,采用Excel 2017计算不同基因型的基因频率、基因型频率、遗传纯合度(Ho)、期望杂合度(He)、有效等位基因数(Ne)及多态信息含量(PIC),以卡方(χ;)检验分析基因型是否处于Hardy-Weinberg平衡状态,并在此基础上分析F_(3)代香苏杂交猪SNPs位点与生长性状的关联性。【结果】在F_(3)代香苏杂交猪DKK1基因的Exon-3,4区域发现6个SNPs位点,分别是A2010T、G2012C、C2014T、A2040C、C2042A和G2044C。6个SNPs位点的Ho均高于He,其中,A2010T、G2012C、A2040C、C2042A和G2044C等5个SNPs位点的PIC处于中度多态水平,C2014T位点的PIC则处于低度多态水平。χ;检验结果表明,仅C2042A位点处于Hardy-Weinberg极度不平衡状态(P<0.01),其他5个SNPs位点(A2010T、G2012C、C2014T、A2040C和G2044C)均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。关联分析结果表明,F_(3)代香苏杂交猪DKK1基因A2010T、G2012C、C2014T、A2040C和G2044C位点的不同基因型在体高、胸围、管围、胸深和腿臀围方面表现出差异显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)。【结论】F_(3)代香苏杂交猪DKK1基因A2010T、G2012C、C2014T、A2040C和G2044C位点不同基因型与体高、胸围、管围、胸深和腿臀围呈显著或极显著相关,可作为培育新品系的主效候选基因或与主基因紧密连锁的分子标记。

关键词：香苏杂交猪 DKK1基因单核苷酸多态性位点(SNPs) 生长性状关联性

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鸡(Gallus gallus)中介导ANP32家族蛋白细胞核定位的关键氨基酸位点的鉴定

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基因组学与应用生物学 2023年第10期42卷 1088-1099页

作者：邢静如石海英崔平张前勇段志强贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵阳550025 滨州市畜牧兽医管理服务中心滨州256600

本研究旨在鉴定鸡(Gallus gallus)中介导ANP32家族蛋白核定位信号(nuclear localization signal, NLS)中的关键碱性氨基酸位点。通过生物信息学软件对鸡ANP32家族蛋白二级结构、三级结构、氨基酸同源性、结构域保守性和NLS(KRKR)保守性... 详细信息

本研究旨在鉴定鸡(Gallus gallus)中介导ANP32家族蛋白核定位信号(nuclear localization signal, NLS)中的关键碱性氨基酸位点。通过生物信息学软件对鸡ANP32家族蛋白二级结构、三级结构、氨基酸同源性、结构域保守性和NLS(KRKR)保守性进行分析;同时,构建表达鸡ANP32家族蛋白NLS及其碱性氨基酸位点突变体的重组真核表达载体并转染HEK-293T细胞,通过观察分析其亚细胞定位来鉴定NLS中的关键碱性氨基酸位点。生物信息学分析结果显示,鸡ANP32家族蛋白均以α-螺旋和无规则卷曲为主;其与鸭ANP32家族蛋白的氨基酸同源性最高且达到98.8%;其与鸭ANP32家族蛋白功能结构域保守性最高,LRR和LCAR结构域完全保守;并且鸡ANP32家族蛋白NLS在不同物种间高度保守,NLS均为KRKR。亚细胞定位分析发现,鸡ANP32家族蛋白及其NLS的融合蛋白均主要定位于细胞核,而NLS中的第一个K、第一个R和第二个K突变后导致融合蛋白出现在细胞质,可以推断它们是鸡中介导ANP32家族蛋白细胞核定位的关键氨基酸位点。本研究发现,鸡ANP32家族蛋白NLS具有与全长蛋白相同的细胞核定位特征,且在不同物种间具有高度保守性。鸡ANP32家族蛋白细胞核定位的关键氨基酸位点的鉴定为后续研究其入核转运机制奠定了理论基础。

关键词：鸡(Gallus gallus) ANP32 亚细胞定位核定位信号

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鸡干扰素调节因子7的分子特征及其组织表达特性分析

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南方农业学报 2022年第12期53卷 3510-3519页

作者：刘梦岚赵彦频蒋传美赵采芹邢静如张福平段志强贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵州贵阳550025

【目的】明确鸡干扰素调节因子7(chIRF7)的分子特征及chIRF7基因在不同发育阶段各组织中的表达特点,为后续开展IRF7基因调控鸡相关组织发育和抗病毒研究打下基础。【方法】利用RT-PCR扩增chIRF7基因编码区(CDS)并构建其重组真核表达载体... 详细信息

【目的】明确鸡干扰素调节因子7(chIRF7)的分子特征及chIRF7基因在不同发育阶段各组织中的表达特点,为后续开展IRF7基因调控鸡相关组织发育和抗病毒研究打下基础。【方法】利用RT-PCR扩增chIRF7基因编码区(CDS)并构建其重组真核表达载体,通过SOPMA、SWISS-MODEL及BioEdit等在线软件预测分析chIRF7蛋白的二、三级结构及结构域保守性;以重组真核表达载体转染鸡胚成纤维细胞系(DF-1),观察融合蛋白的亚细胞定位情况及分析过表达融合蛋白对新城疫病毒(NDV)复制的影响;采用实时荧光定量PCR检测chIRF7基因在鸡胚发育第14 d(E14d)及鸡出壳第1 d(H1d)、第7 d(H7d)和第14 d(H14d)不同组织中的表达情况。【结果】将从鸡外周血淋巴细胞中扩增获得的chIRF7基因CDS序列插入真核表达载体pEGFP-C1的酶切位点即成功构建获得重组真核表达载体pEGFP-chIRF7。chIRF7蛋白二级结构由无规则卷曲(占51.12%)、α-螺旋(占26.48%)、延伸链(占16.70%)和β-转角(占5.70%)组成;鸡与其他禽类、人类和哺乳动物的IRF7氨基酸序列相似性均较低,且5个功能结构域不保守。经聚肌胞苷酸[Poly(I∶C)]或NDV处理DF-1细胞后,可使融合蛋白EGFP-chIRF7由细胞质定位转变为细胞核定位;而在细胞内过表达融合蛋白EGFP-chIRF7可降低NDV的复制能力和细胞致病性。chIRF7基因在鸡不同发育阶段各组织中均有不同程度的表达,且以肺脏中的相对表达量最高,其次是肝脏和腺胃,在腿肌中的相对表达量较低;从E14d发育到H14d,chIRF7基因在肺脏中的表达呈先下降后趋于稳定的变化趋势,在肝脏、腺胃、心脏和腿肌中呈先下降后上升再下降的变化趋势,在脑组织中呈先稳定再下降的变化趋势,在胸肌和眼球中的表达则趋于稳定。【结论】IRF7在不同物种中的相似性较低且结构域不保守,经外界刺激诱导表达的chIRF7会发生细胞核移位而具有抗病毒感染效果。IRF7基因在鸡不同发育阶段的肺脏、肝脏和腺胃中高表达,说明对这3个组织的发育可能具有调控作用。

关键词：鸡 IRF7基因分子特征亚细胞定位表达特性抗病毒感染

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关岭牛MEF2A和MEF2B基因克隆及其组织表达特征分析

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南方农业学报 2022年第9期53卷 2643-2653页

作者：孙金魁许厚强阮涌宋林锦许家利陈晨石鹏飞贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵州贵阳550025

【目的】探究肌细胞增强因子-2(MEF2A和MEF2B)的生物学信息特征及其在关岭牛不同发育阶段各器官组织中的表达情况,为揭示MEF2A和MEF2B基因在关岭牛生长发育过程中的作用机制及挖掘地方种质资源提供理论参考。【方法】通过RT-PCR克隆MEF2... 详细信息

【目的】探究肌细胞增强因子-2(MEF2A和MEF2B)的生物学信息特征及其在关岭牛不同发育阶段各器官组织中的表达情况,为揭示MEF2A和MEF2B基因在关岭牛生长发育过程中的作用机制及挖掘地方种质资源提供理论参考。【方法】通过RT-PCR克隆MEF2A(NM_001083638.2)和MEF2B(NM_001145793.1)基因编码区(CDS)序列,利用ProtScal、NetPhs 3.1、SOPMA、ProtParam、PSORT II Preadict、SWISS-MODEL等在线软件进行生物信息学分析,同时采用实时荧光定量PCR检测MEF2A和MEF2B基因在关岭牛不同发育阶段(犊牛、青年牛和成年牛)各器官组织中的表达水平。【结果】关岭牛MEF2A和MEF2B基因CDS序列分别编码492和368个氨基酸残基;MEF2A和MEF2B蛋白相对分子量分别为52和39 k D,对应的理论等电点(p I)为9.07和9.35,均属于碱性不稳定蛋白。关岭牛MEF2A和MEF2B蛋白以无规则卷曲和α-螺旋为主,主要定位于细胞核(分别占60.9%和52.2%)。关岭牛MEF2A基因与与挪威鼠和绵羊的MEF2A基因遗传距离较近,关岭牛MEF2B基因则与牦牛和绵羊的MEF2B基因遗传距离较近。实时荧光定量PCR检测结果显示,MEF2A和MEF2B基因在关岭牛不同发育阶段的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、里脊和脂肪等7个组织中均有表达,且受生长发育阶段的影响。其中,MEF2A基因在犊牛各器官组织中的相对表达量极显著高于在青年牛和成年牛(P<0.01,下同),随着年龄的增长,MEF2A基因在关岭牛心脏中的相对表达量极显著高于其他组织;MEF2B基因在青年牛和成年牛的相对表达量极显著高于犊牛,且在关岭牛心脏、肝脏和脾脏中的表达量与年龄呈正相关。【结论】MEF2A基因在关岭牛不同发育阶段心脏中高表达,而MEF2B基因在关岭牛不同发育阶段肺脏和脾脏中高表达,但在里脊中的表达相对较低。可见,MEF2A和MEF2B基因在关岭牛的生长发育过程中发挥重要作用。

关键词：关岭牛 MEF2A基因 MEF2B基因表达特征生长发育

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从江香猪SP1基因组织表达特征及其超表达对间质细胞自噬和凋亡的影响

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南方农业学报 2022年第12期53卷 3498-3509页

作者：刘文娇王涵龚婷贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵州贵阳550025

【目的】分析SP1基因在从江香猪不同组织及不同发育阶段睾丸中的表达情况及其对睾丸间质细胞自噬、凋亡的转录调控作用,为探究SP1基因调控间质细胞自噬的分子机制及提高从江香猪雄性繁殖性能提供理论基础。【方法】选取性早熟的从江香... 详细信息

【目的】分析SP1基因在从江香猪不同组织及不同发育阶段睾丸中的表达情况及其对睾丸间质细胞自噬、凋亡的转录调控作用,为探究SP1基因调控间质细胞自噬的分子机制及提高从江香猪雄性繁殖性能提供理论基础。【方法】选取性早熟的从江香猪作为研究对象,PCR扩增得到其SP1基因编码区(CDS)序列,应用相关在线软件对CDS序列进行生物信息学分析,荧光定量PCR检测性成熟期从江香猪不同组织中SP1表达量,利用实时荧光定量PCR和Western blotting检测不同日龄从江香猪睾丸中的SP1基因表达量。【结果】生物信息学分析结果显示,SP1基因CDS序列全长为2361 bp,编码786个氨基酸残基,蛋白二级及三级结构以无规则卷曲和延伸链为主,无跨膜结构域和信号肽剪切位点,且为不稳定蛋白。SP1氨基酸序列有174个磷酸化位点,通过氨基酸同源性分析发现猪SP1与绵羊和牛的亲缘关系最近。对SP1在各组织的表达量进行检测,结果表明SP1基因相对表达量在脾脏中最高;此外,SP1的蛋白水平在180 d的香猪睾丸中有最高表达量,基因水平在30和180 d的香猪睾丸中有较高表达量。进一步构建SP1基因超表达载体,转染至从江香猪睾丸间质细胞,结果显示pEGFP-C1-SP1组的SP1相对表达量显著高于pEGFP-C1组(P<0.05,下同),而自噬通路相关因子基因mTOR、LC3B、Beclin-1和凋亡相关因子基因Caspase-3、Bcl-2的相对表达量在超表达pEGFP-C1-SP1组显著低于pEGFP-C1组,但自噬凋亡信号因子ERK1/2和凋亡基因Bax的相对表达量无显著变化(P>0.05)。推测SP1基因可通过降低LC3B、Beclin-1、Caspase-3的表达来抑制睾丸间质细胞自噬凋亡的发生,或通过降低mTOR及抗凋亡基因Bcl-2的表达来促进凋亡发生。【结论】SP1基因在从江香猪不同组织及睾丸发育不同阶段均有表达,且通过影响睾丸间质细胞自噬、凋亡相关基因表达,而在从江香猪初情期和性成熟期发挥重要的生理学作用。

关键词：从江香猪 SP1基因分子特征表达模式自噬凋亡

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敲低JAK2基因表达对猪乳腺上皮细胞增殖和凋亡的影响

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农业生物技术学报 2024年第8期32卷 1857-1868页

作者：罗杰杨酸毛同辉杨棋张依裕铜仁职业技术学院贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室铜仁市畜牧技术推广站

Janus激酶2 (Janus kinase, JAK2)是一种激素受体偶联激酶，参与母牛(Bos taurus)乳腺上皮细胞增殖、分化、凋亡等过程，而其调控猪(Sus scrofa)乳腺上皮细胞的增殖或凋亡机制尚不清楚。为探究RNA干扰JAK2基因表达对猪乳腺上皮细胞增殖... 详细信息

Janus激酶2 (Janus kinase, JAK2)是一种激素受体偶联激酶，参与母牛(Bos taurus)乳腺上皮细胞增殖、分化、凋亡等过程，而其调控猪(Sus scrofa)乳腺上皮细胞的增殖或凋亡机制尚不清楚。为探究RNA干扰JAK2基因表达对猪乳腺上皮细胞增殖和凋亡的影响，本研究根据JAK2基因序列设计并合成4对shRNA (short hairpin RNA)干扰序列和1对阴性对照序列，构建shRNA表达载体并将其转染至猪乳腺上皮细胞中，筛选干扰效果最佳的载体，采用串联质谱标记(tandem mass tags, TMT)定量蛋白质组学技术进行蛋白组测序并筛选差异蛋白，分别采用CCK-8细胞增殖检测试剂盒、流式细胞术、q RT-PCR检测细胞增殖、凋亡、周期及相关基因的mRNA表达水平。结果显示，共筛选到差异表达蛋白699个，其中上调蛋白309个，下调蛋白390个。GO富集分析表明，差异蛋白主要富集在多肽生物合成过程和酰胺生物合成过程，以及碳水化合物衍生物结合、核糖体的结构组成等分子功能方面；KEGG富集分析可知，差异蛋白主要富集在核糖体、补体系统和丙型肝炎信号通路。干扰JAK2后，细胞增殖能力相较于对照组在不同时间节点均显著降低(P<0.05)，在72 h时的OD450值极显著降低(P<0.01)，细胞凋亡率(24.0%±3.82%)显著低于对照组(33.2%±2.55%)(P<0.05)，且诱导细胞周期G1/S期阻滞；IFIT1 (interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1)、ISG15 (interferon-stimulated gene 15)、GRB2 (growth factor receptor-bound protein 2)和RACK1 (receptor for activated C kinase 1)基因表达水平在沉默JAK2后极显著低于对照组(P<0.01),RSAD2 (radical S-adenosyl methionine domain containing 2)基因在沉默JAK2后极显著高于对照组(P<0.01)。综上，沉默JAK2可诱导猪乳腺上皮细胞周期G1/S期阻滞，从而抑制细胞增殖，并抑制细胞凋亡，B6E241蛋白(对应基因GRB2)可作为今后研究乳腺上皮细胞增殖相关的关键蛋白。本研究为深入探讨母猪乳腺发育和泌乳调控机制提供了基础资料。

关键词： Janus激酶(JAK2) 猪乳腺上皮细胞细胞增殖细胞凋亡

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全基因组eQTL揭示猪11号染色体肉质性状新候选位点

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农业生物技术学报 2024年第4期32卷 807-819页

作者：郑韵頔冉雪琴牛熙黄世会李升王嘉福贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室

全基因组关联分析（genome-wide association study, GWAS）挖掘了大量猪肉肉质性状关联的遗传变异，但是多数变异的调控机制未知。遗传变异主要通过调控基因表达水平影响复杂性状，通过定位表达数量性状位点（expression quantitative ... 详细信息

全基因组关联分析（genome-wide association study, GWAS）挖掘了大量猪肉肉质性状关联的遗传变异，但是多数变异的调控机制未知。遗传变异主要通过调控基因表达水平影响复杂性状，通过定位表达数量性状位点（expression quantitative trait locus, eQTL）鉴定基因表达水平相关的遗传变异，有助于阐释变异位点与性状之间的关联。为筛选肉质性状候选基因与位点，本研究以F2代的19个杂交香猪（Sus scrofa）(大白猪♂×从江香猪♀)个体为试验材料，使用全基因组测序（whole genome sequencing, WGS）和背最长肌组织的RNA-seq数据进行全基因组eQTL分析，在11号染色体上共检测到1 332个cis-eQTLs(PFDR<0.01)和18 078个trans-eQTLs(PFDR<1E-12)。对cis-eQTL关联中的eSNP（eQTL-associated SNP）位点进行注释筛选，使用PCR-限制性片段长度多态性（restriction fragment length polymorphism, RFLP）和Sanger测序鉴定了1个位于肉质性状候选eGene（eQTL-associated gene）—线粒体中间肽酶基因（mitochondrial intermediate peptidase, MIPEP） 5'UTR的eSNP位点rs319855910 c.-46C>G，与MIPEP基因表达水平显著相关(PFDR=8.81E-03)。RNA-seq统计分析发现，rs319855910不同基因型显著影响MIPEP基因表达（P<0.05）。当rs319855910基因型由野生型（CC）突变为纯合突变型（GG）时，MIPEP基因的表达水平显著下调（P<0.05）。进一步分析发现，rs319855910位于转录因子结合序列区域，导致MIPEP基因5'UTR序列结合的转录因子种类和数量发生改变。上述结果表明，rs319855910是一个新的猪肉肉质性状候选位点，能够通过转录因子的结合而调节MIPEP基因表达，从而影响猪的肉质性状。本研究为猪种选育和遗传改良提供基础资料。

关键词：猪全基因组测序(WGS) 转录组测序表达数量性状位点(eQTL) SNP 肉质性状

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鸡ANP32家族蛋白亚细胞定位及其在免疫器官中的表达特征分析

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南方农业学报 2022年第11期53卷 3249-3256页

作者：邢静如石海英王燕碧赵采芹唐宏段志强贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵州贵阳550025

【目的】明确鸡ANP32家族蛋白的亚细胞定位及在不同月龄鸡免疫器官中的表达特征,为后续研究鸡ANP32家族蛋白与新城疫病毒(NDV)复制及其致病性的关系打下基础。【方法】分别构建鸡ANP32家族基因重组真核表达载体,转染HEK-293T细胞后进行... 详细信息

【目的】明确鸡ANP32家族蛋白的亚细胞定位及在不同月龄鸡免疫器官中的表达特征,为后续研究鸡ANP32家族蛋白与新城疫病毒(NDV)复制及其致病性的关系打下基础。【方法】分别构建鸡ANP32家族基因重组真核表达载体,转染HEK-293T细胞后进行诱导表达,利用Western blotting检测融合蛋白表达情况,并通过荧光观察分析融合蛋白亚细胞定位;同时采用实时荧光定量PCR检测ANP32家族基因在1~6月龄鸡免疫器官(脾脏、胸腺和法氏囊)中的表达水平。【结果】成功构建了鸡ANP32家族基因重组真核表达载体pEGFP-C1-ANP32A、pEGFP-C1-ANP32B和pEGFP-C1-ANP32E,转染HEK-293T细胞后得到正确表达,获得携带EGFP标签的融合蛋白EGFP-ANP32A、EGFPANP32B和EGFP-ANP32E,其分子量分别为60.0、57.9和56.9 k D。亚细胞定位分析结果表明,融合蛋白EGFP-ANP32A、EGFP-ANP32B和EGFP-ANP32E的荧光与细胞核荧光完全重合,即主要定位在细胞核。实时荧光定量PCR检测结果表明,ANP32家族基因在1~6月龄鸡免疫器官(脾脏、胸腺和法氏囊)中均有表达,且在不同免疫器官中的表达水平存在差异;ANP32A和ANP32E基因在1~6月龄鸡免疫器官中呈先上升后下降的表达趋势,且在2月龄免疫器官中的相对表达量达峰值;ANP32B基因的表达则呈下降趋势,以1月龄鸡免疫器官中的相对表达量最高。【结论】鸡ANP32家族蛋白主要定位于细胞核,且ANP32家族基因在不同月龄鸡免疫器官中均有表达,但这3个基因具有独特的表达特征,其表达差异与免疫器官发育及免疫功能间的关系有待进一步探究。

关键词：鸡 ANP32家族蛋白亚细胞定位免疫器官组织表达特征

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基于比较基因组分析猪特有基因家族及其进化

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基因组学与应用生物学 2023年第7期42卷 726-735页

作者：袁巍毕欢张雨丹张依裕顾晓龙陈伟高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025 贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵阳550025 贵州大学动物科学学院贵阳550025 贵州省贵阳德康农牧有限公司贵阳550025

基因家族的数量及结构变异是物种适应自然变化的重要机制。深入研究猪(Sus scrofa)的基因家族进化,可以了解其基因扩张和收缩事件,从而揭示猪在进化过程中为适应环境而发生改变的特殊机制。本研究采用比较基因组学方法,对猪、牛(Bos tau... 详细信息

基因家族的数量及结构变异是物种适应自然变化的重要机制。深入研究猪(Sus scrofa)的基因家族进化,可以了解其基因扩张和收缩事件,从而揭示猪在进化过程中为适应环境而发生改变的特殊机制。本研究采用比较基因组学方法,对猪、牛(Bos taurus)、绵羊(Ovis aries)、羊驼(Vicugna pacos)、鸡(Gallus gallus)和小鼠(Mus musculus)的参考基因组进行比较,以鉴定猪基因家族。利用PAML软件计算物种分化时间,并通过CAFE软件分析猪基因家族中的扩张和收缩基因。将鉴定到的显著收缩和扩张基因注释到KEGG、 GO、 KOG数据库中进行通路分析。结果表明,猪共有16 749个基因家族,包含20 660个基因。同其他5个物种相比,猪具有55个特有的基因家族,包含470个基因。基因家族收缩与扩张分析结果表明,猪基因组中共有334个基因家族发生收缩,214个基因家族发生扩张。其中,有110个基因家族的扩张显著,包含473个基因;152个基因家族的收缩显著,包含102个基因。富集结果表明,显著扩张家族基因主要富集在生殖过程、胆汁分泌和化学致癌作用DNA加合物等方面;显著收缩家族基因主要富集在系统性红斑狼疮、酒精中毒、坏死性肺炎以及冠状病毒病等方面;猪特有基因家族的基因主要富集在脂肪转运代谢、嗅觉受体活性、气味剂结合以及脂肪酸的降解等方面。本研究鉴定和分析了猪显著收缩与扩张及其特有的基因家族,并发现其在多个生物过程中具有重要的功能。这些结果有助于更深入了解猪的适应性进化,并为其作为生物模型研究人类疾病提供了新的线索。

关键词：比较基因组猪基因家族收缩与扩张特有基因

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