检索结果-内蒙古大学图书馆

生物工程学报 2021年第2期37卷 418-428页

作者：赵妍喻其林南开大学生命科学学院分子微生物学与技术教育部重点实验室天津300071

内质网作为真核细胞内极为重要的细胞器,在生物大分子合成与加工、物质转运、离子稳态维持、信号转导、细胞器间物质与信号交流等诸多方面发挥关键作用,其功能异常与癌症、自身免疫疾病、病原微生物感染、神经退行性疾病、糖尿病等诸多... 详细信息

内质网作为真核细胞内极为重要的细胞器,在生物大分子合成与加工、物质转运、离子稳态维持、信号转导、细胞器间物质与信号交流等诸多方面发挥关键作用,其功能异常与癌症、自身免疫疾病、病原微生物感染、神经退行性疾病、糖尿病等诸多重大疾病紧密相关。随着纳米技术的不断发展,内质网靶向纳米药物的开发与应用逐渐成为生物工程、纳米医学、材料化学等领域的研究热点。文中结合近年来国内外相关研究进展,对内质网功能紊乱与疾病发生的关系、内质网靶向纳米药物的设计原理、内质网靶向纳米药物的应用进行了综述。内质网靶向纳米药物基于纳米药物载体或生物活性分子自组装原理进行设计。它们以主动或被动方式靶向内质网,通过破坏或维持内质网功能而发挥作用,在癌症靶向治疗、免疫调节、神经系统功能修复等诸多方面具有广泛的应用前景。

关键词：内质网纳米药物分子自组装纳米载体癌症

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生物竞争抑制作用对渤海J油田微生物降解驱油聚合物功能的影响

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微生物学报 2022年第6期62卷 2289-2298页

作者：张世仑王大威尹榆钧靖波海洋石油高效开发国家重点实验室北京100028 中海油研究总院有限责任公司北京100028 南开大学生命科学学院分子微生物学与技术教育部重点实验室天津300071

【目的】揭示可降解驱油用聚合物的油藏内源微生物群落组成,分析生物竞争抑制作用(bio-competitive exclusion,BCX)对微生物聚合物降解功能的影响。【方法】通过室内培养实验,观察BCX对驱油用聚合物黏度的影响,随后借助高通量测序技术... 详细信息

【目的】揭示可降解驱油用聚合物的油藏内源微生物群落组成,分析生物竞争抑制作用(bio-competitive exclusion,BCX)对微生物聚合物降解功能的影响。【方法】通过室内培养实验,观察BCX对驱油用聚合物黏度的影响,随后借助高通量测序技术分析渤海J油田中与聚合物降解相关的微生物菌种,并探寻样本中丰度较高的聚合物降解功能基因─酰胺酶、加氧酶、硫化氢生成酶基因。之后,比对测序结果,采用实时荧光定量法验证上述功能基因在样本之间的含量差异,最后进一步注释携带上述功能基因的微生物群落组成。【结果】BCX可有效地延缓驱油聚合物黏度的损失。油田中与聚合物降解相关的微生物有Acetomicrobium、Tepidiphilus、Thermoanaerobacter、Fervidobacterium、Ralstonia、Halomonas、Roseovarius、Deferribacteraceae和Comamonadaceae等9类菌种。高通量测序分析得到样本中BCX可显著下调丰度的聚合物降解功能基因共计有7种,其中酰胺酶基因ansB、加氧酶基因ssuD在样本之间的含量经定量验证,发现受到了BCX的抑制,这与测序结果相一致。群落组成注释表明,BCX对渤海J油田聚合物高效降解菌─代尔夫特菌(Delftia)存在明显的抑制作用。【结论】揭示了油田中可降解驱油用聚合物的内源微生物群落组成,发现BCX对微生物降解聚合物的抑制效用,证实BCX有助于解决海上油田聚合物驱稳粘问题。

关键词：群落组成生物竞争抑制黏度高通量测序聚合物驱

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中高温油藏内源微生物好氧激活规律

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南开大学学报（自然科学版） 2022年第4期55卷 43-49页

作者：刘美辰宋永亭韩欢高光军李国强马挺南开大学生命科学学院分子微生物学与技术教育部重点实验室天津300071 胜利油田石油工程技术研究院山东东营257000

针对胜利油田中高温油藏采出液,结合不同营养的激活实验和Miseq高通量测序技术,系统的研究了不同营养激活剂对中高温油藏内源微生物菌群变化的影响.结果表明,不同的营养物质均可激活油藏内源微生物,但在好氧条件下,只有特定的营养配方... 详细信息

针对胜利油田中高温油藏采出液,结合不同营养的激活实验和Miseq高通量测序技术,系统的研究了不同营养激活剂对中高温油藏内源微生物菌群变化的影响.结果表明,不同的营养物质均可激活油藏内源微生物,但在好氧条件下,只有特定的营养配方可以激活烃氧化菌.原油乳化效果的好坏与激活后样品中Bacilli纲内功能性微生物如Bacillus,Paenibacillus,Brevibacillus,Geobacillus是否被大量激活有相关性,以一定比例的糖蜜和玉米浆干粉作为激活剂可以有效激活上述功能微生物.

关键词：中高温油藏石油生物乳化剂内源微生物微生物提高原油采收率

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SLFN12与原型泡沫病毒Tas蛋白相互作用抑制其激活病毒启动子

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中国生物化学与分子生物学报 2020年第10期36卷 1180-1187页

作者：郭鸽胡笑梅解英朋谈娟乔文涛南开大学生命科学学院分子微生物学与技术教育部重点实验室天津300071

Schlafen(SLFN)家族多个成员具有抗病毒活性,但Schlafen家族成员12(Schlafen12,SLFN12)的相关功能尚未见报道。本研究从B细胞cDNA文库中克隆获得SLFN12全长cDNA,亚克隆构建一系列真核表达质粒,分析SLFN12对原型泡沫病毒(prototype foamy... 详细信息

Schlafen(SLFN)家族多个成员具有抗病毒活性,但Schlafen家族成员12(Schlafen12,SLFN12)的相关功能尚未见报道。本研究从B细胞cDNA文库中克隆获得SLFN12全长cDNA,亚克隆构建一系列真核表达质粒,分析SLFN12对原型泡沫病毒(prototype foamy virus,PFV)复制的作用。将SLFN12全长质粒与PFV的感染性克隆(pcPFV)共转染HEK293T细胞。结果显示,当两者的转染质量比为1∶3时,SLFN12过表达使以游离病毒颗粒(cell-free)或细胞共培养(cell-to-cell)方式感染的PFV滴度分别降低了95.21%(P<0.001)以及97.91%(P<0.01),同时病毒蛋白质的表达量也减少,说明SLFN12能够抑制PFV的复制。共转染pcPFV与SLFN12的AAA结构域截短质粒进行同样的实验,PFV滴度分别对应下降了61.88%(P<0.05)以及72.28%(P<0.01),表明AAA结构域参与了SLFN12抑制PFV复制的功能。随后,利用报告质粒系统探究SLFN12对PFV启动子转录活性的影响,观察到SLFN12不影响病毒内部启动子(internal promoter,IP)(P>0.05)及长末端重复序列(long terminal repeat,LTR)(P>0.05)的基础转录活性,但抑制泡沫病毒反式激活因子(trans-activator of spumaviruses,Tas)的表达。当SLFN12和Tas表达质粒的转染质量比为1∶1时,Tas对IP以及LTR的转录激活作用相较对照组,分别减弱了66.27%(P<0.01)以及73.91%(P<0.01)。同时,免疫共沉淀实验观察到,Tas蛋白与SLFN12蛋白之间存在相互作用,表明SLFN12通过与PFV Tas相互作用削弱其表达,从而干扰Tas对IP和LTR的反式激活来抑制PFV复制。本研究发现,SLFN12具有抗病毒活性,拓宽了对SLFN家族抗病毒活性的认识,对于研究泡沫病毒潜伏感染的机制也具有参考价值。

关键词：原型泡沫病毒 Schlafen家族成员12 泡沫病毒的反式激活因子

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新疆伊犁野生阿魏菇菌株的分离鉴定与培养特性

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微生物学杂志 2021年第6期41卷 103-110页

作者：木古丽·木哈西吾尔恩·阿合别尔迪刘方南开大学生命科学学院微生物学系分子微生物学与技术教育部重点实验室天津300071 伊犁师范大学微生物资源保护与开发利用重点实验室新疆伊宁835000

对采自新疆伊犁的两种具有不同形态特征的野生阿魏菇(Pleurotus ferulae)子实体分离的菌株进行鉴定和系统发育分析,并探讨优良菌株的培养特性。结合子实体形态和生境特征,利用rDNA-ITS序列,对伊犁野生阿魏菇菌株YL-A1和YL-A2进行分子鉴... 详细信息

对采自新疆伊犁的两种具有不同形态特征的野生阿魏菇(Pleurotus ferulae)子实体分离的菌株进行鉴定和系统发育分析,并探讨优良菌株的培养特性。结合子实体形态和生境特征,利用rDNA-ITS序列,对伊犁野生阿魏菇菌株YL-A1和YL-A2进行分子鉴定及系统发育分析。对阿魏菇菌株YL-A1生长温度、pH、碳源、氮源和无机盐进行单因素试验,分析各因素对菌丝生长的影响,通过L_(9)(3^(4))正交试验,筛选各因子之间的最优组合。结果表明,野生阿魏菇菌株YL-A1(ITS序列GenBank登录号:MN460317)和YL-A2(ITS序列GenBank登录号:MN809132),不仅子实体形态特征有差异,且菌株YL-A1菌丝生长速度和长势优于YL-A2,并相互拮抗。结合生境和形态特征及rDNA ITS序列分析,将二者鉴定为阿魏菇(Pleurotus eryngii ***)。系统发育分析发现,菌株YL-A1和YL-A2单独聚为一组,与其他阿魏菇菌株有一定的遗传距离。经单因素和正交试验,确定了菌株YL-A1在含葡萄糖20 g/L、蛋白胨4 g/L、KH_(2)PO_(4)1 g/L,pH 7.5的培养基中,25℃培养,菌丝生长状态最佳,确定了优良菌株YL-A1菌丝生长最佳培养条件。为进一步保护利用伊犁野生阿魏菇菌种资源提供参考。

关键词：野生阿魏菇菌株培养 ITS鉴定培养特性伊犁河谷

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渤海S油田油藏硫酸盐还原古菌分析

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生物加工过程 2021年第5期19卷 562-568页

作者：张世仑王大威尹榆钧靖波王秀军海洋石油高效开发国家重点实验室北京100028 中海油研究总院有限责任公司北京100028 南开大学生命科学学院分子微生物学与技术教育部重点实验室天津300071

为了证实油藏环境中古菌的酸蚀作用,借助高通量测序的方法对渤海S油田古菌的群落组成和多样性进行分析,发现了具有硫酸盐还原功能的古菌:热球菌(Thermococcales)、古球菌(Archaeoglobales)和脱硫球菌(Desulfurococcales)。通过构建aprA... 详细信息

为了证实油藏环境中古菌的酸蚀作用,借助高通量测序的方法对渤海S油田古菌的群落组成和多样性进行分析,发现了具有硫酸盐还原功能的古菌:热球菌(Thermococcales)、古球菌(Archaeoglobales)和脱硫球菌(Desulfurococcales)。通过构建aprA、dsrA、dsrB等硫酸盐还原功能基因的分子进化树,获得了这些功能基因在古球菌中的丰度,发现古球菌的占比在dsrA、dsrB中呈现优势,意味着古球菌的主要功能是将亚硫酸盐还原为H_(2)S。另一方面,比较了该油田H_(2)S治理井与非治理井的古菌群落组成,发现热球菌在生物竞争抑制(BCX)作用下,其在古菌中的丰度降幅达到23.84%,表明BCX能够抑制古菌的硫酸盐还原功能。本研究明确了引发硫化氢酸蚀的古菌群和相关的功能基因,为有针对性地开发油田次生H_(2)S治理体系提供依据和指导。

关键词：硫酸盐还原菌古菌高通量测序群落组成分子进化树生物竞争抑制

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核糖体谱测序在病毒学研究中的应用

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病毒学报 2019年第6期35卷 984-990页

作者：林永权杨之龙乔文涛分子微生物学与技术教育部重点实验室南开大学生命科学学院天津300071 Division of Biology Kansas State UniversityManhattanKS66506USA

核糖体谱测序结合了RNA深度测序和核酸酶足迹技术,可同时检测细胞内全部基因的转录和翻译。用此方法检测被病毒感染的细胞,不但有可能发现新的病毒蛋白,完善病毒基因组注释,而且还可能发现新的基因翻译现象,为研究翻译机制指明方向。同... 详细信息

核糖体谱测序结合了RNA深度测序和核酸酶足迹技术,可同时检测细胞内全部基因的转录和翻译。用此方法检测被病毒感染的细胞,不但有可能发现新的病毒蛋白,完善病毒基因组注释,而且还可能发现新的基因翻译现象,为研究翻译机制指明方向。同时,该方法能够检测到被病毒感染后宿主翻译水平的动态变化,为研究病毒和宿主之间的相互作用提供线索。目前,学者已经利用核糖体谱测序法分析了6个DNA病毒和4个RNA病毒感染细胞后翻译相关的特征。本文对核糖体谱测序方法在病毒学中的相关研究进行总结和分析,希望为广大病毒学研究者提供新的方法与思路。

关键词：核糖体谱测序组学翻译调控病毒-宿主相互作用

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天津博物馆文物库房部分文物与囊匣中霉菌的分离与鉴定

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文物保护与考古科学 2019年第2期31卷 61-67页

作者：张艳红刘自军刘根亮李彬潘皎马清林天津博物馆天津300201 分子微生物学与技术教育部重点实验室(南开大学) 天津300071 南开大学生命科学学院微生物系天津300071 山东大学文化遗产研究院山东济南250100

馆藏文物中的书画、古籍、档案、纺织品和竹木漆器等有机质文物,常常受到霉菌的破坏。为了解文物库房有机质文物中霉菌病害现状,寻找适合的防治方法,利用显微形态观察和分子生物学方法,对四个库房内文物材料与囊匣上滋生的霉菌进行采样... 详细信息

馆藏文物中的书画、古籍、档案、纺织品和竹木漆器等有机质文物,常常受到霉菌的破坏。为了解文物库房有机质文物中霉菌病害现状,寻找适合的防治方法,利用显微形态观察和分子生物学方法,对四个库房内文物材料与囊匣上滋生的霉菌进行采样、培养、分离和鉴定。实验分离出的14株菌株通过形态观察和分子生物学鉴定为6个属,包括毛壳菌属(Chaetomium)、畸枝霉属(Malbranchea)、曲霉属(Aspergillus)、派伦霉属(Peyronellaea)和枝孢属(Cladosporium)等,其中毛壳菌属数量最多,曲霉属次之,多数为能对文物产生危害的常见菌种,亟待采取有效防治措施。实验结果可为今后霉菌的防治工作提供依据。

关键词：文物库房有机质文物霉菌鉴定分子生物学

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产表面活性剂菌与稠油降解菌复配对原油黏度的影响

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油田化学 2019年第1期36卷 147-151页

作者：王大威张世仑靖波何春百张健马挺海洋石油高效开发国家重点实验室北京100027 中海油研究总院北京100027 分子微生物学与技术教育部重点实验室南开大学生命科学学院天津300071

稠油微生物降解是微生物采油的重要机理之一,但其效率较低,不能明显改变稠油化学组成,降低稠油黏度,从而影响采油效率。针对这一问题,将产表面活性菌与稠油降解菌复配,通过测定菌种作用前后原油的黏度确定产表面活性菌与稠油降解菌的最... 详细信息

稠油微生物降解是微生物采油的重要机理之一,但其效率较低,不能明显改变稠油化学组成,降低稠油黏度,从而影响采油效率。针对这一问题,将产表面活性菌与稠油降解菌复配,通过测定菌种作用前后原油的黏度确定产表面活性菌与稠油降解菌的最佳复配比例;通过原油四组分分析和变性梯度凝胶电泳,研究了生物表面活性剂对稠油生物降解的强化作用。结果表明,产表面活性菌T-1、X-3与稠油降解菌QB26、QB36适宜的复配体积比为2∶2∶1∶1。菌种复配作用后,稠油黏度明显降低,与单独使用降解菌相比降黏率平均提高33.1%,胶质与沥青质平均降解率提高8.0%和4.9%。产表面活性剂菌的加入增加了表面活性剂含量,降低了胶质沥青质等相对重质组分的含量;产表面活性剂菌通过产生表面活性剂,使原油降黏增溶,形成小液滴,易于被稠油降解菌捕获降解,不仅降低稠油黏度,还提高了稠油降解菌的数量。生物表面活性剂对稠油生物降解具有明显的强化作用,在微生物采油技术中具有良好的应用潜力。

关键词：稠油产表面活性菌降解菌强化作用黏度

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硝酸盐注入方式对抑制硫酸盐还原菌活性的影响

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油田化学 2019年第4期36卷 712-716,723页

作者：王大威张世仑靖波杜君景宏马挺海洋石油高效开发国家重点实验室北京100028 中海油研究总院有限责任公司北京100028 中海石油(中国)有限公司天津分公司天津300452 南开大学生命科学学院分子微生物学与技术教育部重点实验室天津300071

生物竞争排斥技术具有价格低廉、处理范围大、操作简单的特点,已经成为硫酸盐还原菌(SRB)油藏治理的重要方法,但现场注入工艺一直是限制该技术使用效果的主要瓶颈。在室内模拟地层条件,通过向地层水中注入硝酸盐类SRB抑制剂(每日注入或... 详细信息

生物竞争排斥技术具有价格低廉、处理范围大、操作简单的特点,已经成为硫酸盐还原菌(SRB)油藏治理的重要方法,但现场注入工艺一直是限制该技术使用效果的主要瓶颈。在室内模拟地层条件,通过向地层水中注入硝酸盐类SRB抑制剂(每日注入或一次性注入等量药剂),促进水中的硝酸盐还原菌(NRB)大量生长扩增,以控制SRB的菌体数量与代谢活性,研究了硝酸盐注入方式对水中SO4^2-、NO^3-、NO^2-、H2S浓度和SRB、NRB菌体数量的影响。结果表明,与一次性加药组相比,每日加药组中SO4^2-浓度下降速度和幅度大,NO^3-和NO^2-浓度较低;两种加药方式均不产生H2S。治理初期一次性注入药剂对NRB的增殖效果明显优于每日注入的效果;治理中后期SRB受到抑制后,持续加入NO^3-的效果要优于一次性加入。在SRB治理过程中,前期投入过量的硝酸盐来刺激NRB的生长进而抑制SRB产生S^2-,后期使用小剂量药剂持续注入的方法来维持抑制效果。

关键词：生物竞争排斥技术硫酸盐还原菌硝酸盐还原菌硝酸盐注入方式

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