检索结果-内蒙古大学图书馆

生物工程学报 2025年第4期41卷 1280-1290页

作者：向莎莎黄煜谢建平西南大学生命科学学院现代生物医药研究所

DNA双链断裂(double-strand breaks, DSBs)被认为是生物体内最为严重的一种DNA损伤形式，它不仅会导致基因组失去稳定性，还可能引发细胞死亡。同源重组(homologous recombination, HR)和非同源末端连接(non-homologous end joining, NH... 详细信息

DNA双链断裂(double-strand breaks, DSBs)被认为是生物体内最为严重的一种DNA损伤形式，它不仅会导致基因组失去稳定性，还可能引发细胞死亡。同源重组(homologous recombination, HR)和非同源末端连接(non-homologous end joining, NHEJ)是2种主要的DNA双链断裂修复方法。参与NHEJ途径的核心成分在酵母和人中高度保守，部分细菌如分枝杆菌、铜绿假单胞菌和枯草芽孢杆菌，也具有NHEJ修复能力。NHEJ可能在分枝杆菌潜伏期的双链修复中发挥重要作用。本文对分枝杆菌中NHEJ的修复机制及其关键组分进行了系统综述，并探讨了其在基因编辑领域的应用前景，深入阐述了分枝杆菌NHEJ途径及其最新研究进展，为分枝杆菌NHEJ修复分子机制提供了新见解并为分枝杆菌NHEJ的应用提供了理论基础。

关键词：分枝杆菌非同源末端连接双链断裂基因编辑

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

导读

引用

生物工程学报 2025年第4期41卷 1215-1220页

作者：谢建平西南大学生命科学学院现代生物医药研究所

本期论文主要包括生物材料的递送、基因编辑技术的创新、蛋白质与酶工程的技术突破与应用前景、生物医学技术的前沿突破与转化潜力、多组学技术在生物医药研究中的整合应用等。现对本期论文内容做简要导读。

关键词：

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

UfMylation类泛素修饰在结核分枝杆菌感染免疫中的作用与机理

引用

遗传 2025年第5期47卷 546-557页

作者：廖怡然张其奥李佩波谢建平西南大学生命科学学院现代生物医药研究所重庆400715 重庆市公共卫生救治中心重庆400036

Ubiquitin-fold modifier 1(UfM1)是一种在原核生物和大多数真核生物中广泛存在的I型类泛素蛋白,其介导的UfMylaiton修饰参与调节多种细胞生化过程。近年来UfM1系统在内质网稳态调节中的重要性被逐步发现和重视。结核分枝杆菌感染引发... 详细信息

Ubiquitin-fold modifier 1(UfM1)是一种在原核生物和大多数真核生物中广泛存在的I型类泛素蛋白,其介导的UfMylaiton修饰参与调节多种细胞生化过程。近年来UfM1系统在内质网稳态调节中的重要性被逐步发现和重视。结核分枝杆菌感染引发的内质网应激是结核病发病进程的重要环节,因而UfM1系统有望成为抗结核治疗药物研发的新靶标。本文对UfM1系统和其介导的UfMylation途径进行了介绍,并重点综述了UfM1系统参与内质网稳态调节的最新进展及其在结核病治疗中的潜在价值,以期为开发新型抗结核治疗方法提供新的方向。

关键词： UfMylation UfM1系统结核病

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

血清蛋白质组学和机器学习揭示的青少年结核病新诊断标志物

引用

生物工程学报 2025年第4期41卷 1478-1489页

作者：陈禹许鸿翔田瑶何谦赵晓云张国斌谢建平沈阳市第十人民医院(沈阳市胸科医院)结核病科中国医科大学公共卫生学院西南大学生命科学学院现代生物医药研究所沈阳药科大学生命科学与生物制药学院沈阳市疾病控制中心

青少年(adolescents and young adults, AYA)是结核病的主要患病群体之一。为了研究针对这个群体的独特性诊断标志物，本研究招募了81名AYA受试者，通过定量蛋白质组学的方法，绘制了AYA结核病患者高质量的血清蛋白质图谱。血清蛋白组... 详细信息

青少年(adolescents and young adults, AYA)是结核病的主要患病群体之一。为了研究针对这个群体的独特性诊断标志物，本研究招募了81名AYA受试者，通过定量蛋白质组学的方法，绘制了AYA结核病患者高质量的血清蛋白质图谱。血清蛋白组数据表明，活动性肺结核(active tuberculosis, ATB)患者中血红蛋白和载脂蛋白相对丰度显著降低。通路富集分析表明，ATB组下调蛋白显著富集于抗氧化、细胞脱毒相关通路，表明存在广泛的氧化应激损伤。通过随机森林(random forest, Rf)和极致梯度提升(extreme gradient boosting, XGBoost)联合评估蛋白重要性，获得了一组区分ATB和非ATB的候选蛋白标志物。基于特征递归消除的支持向量机算法，发现载脂蛋白A1(apolipoprotein A-I, APOA1)、血红蛋白亚基α (hemoglobin subunit alpha-1, HBA1)、血红蛋白亚基β(hemoglobin subunit beta, HBB)这3个蛋白的组合在诊断ATB过程中具有最高的准确性和敏感性。临床生化常规检测的血红蛋白(hemoglobin,HGB)和白蛋白(albumin,ALB)含量可以作为评估APOA1、HBB蛋白表达变化的血液生化指标。本研究建立了AYA结核病患者的血清蛋白组全貌，获得了该类群结核病的新诊断标志物。

关键词：结核病血清蛋白组学机器学习诊断标志物载脂蛋白

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

斑马鱼-海分枝杆菌模型研究对结核病致病机理的启示

引用

微生物学报 2010年第1期50卷 15-22页

作者：侯曼美谢建平西南大学生命科学学院现代生物医药研究所重庆400715

全世界约三分之一的人口感染过结核分枝杆菌,其导致的结核病仍然是全球公共卫生的严重威胁。结核菌是典型的胞内致病菌。结核菌的致病性与其成功逃避和利用宿主免疫应答等密切相关。控制结核病需要深入了解致病菌和宿主之间的相互作用... 详细信息

全世界约三分之一的人口感染过结核分枝杆菌,其导致的结核病仍然是全球公共卫生的严重威胁。结核菌是典型的胞内致病菌。结核菌的致病性与其成功逃避和利用宿主免疫应答等密切相关。控制结核病需要深入了解致病菌和宿主之间的相互作用。不同的动物模型是揭示致病菌-宿主相互作用的关键。海分枝杆菌-斑马鱼模型是最近才得以发展并获得了不少新见解的研究系统之一。本文总结了该模型揭示的海分枝杆菌毒力因子Erp、Esx-1、pmiA、Mel1和Mel2、KasB等,以及该模型的优缺点。这些结果为大动物模型研究和深入了解结核分枝杆菌感染人体的致病机理提供了线索。

关键词：斑马鱼海分枝杆菌结核病

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

粟酒裂殖酵母全基因组中含信号肽蛋白质的研究

引用

遗传 2007年第2期29卷 250-256页

作者：刘玉岭柳云帆谢建平西南大学生命科学学院现代生物医药研究所重庆400715

对粟酒裂殖酵母全基因组3条染色体上的4,997个蛋白序列进行了全局性的分析,利用signalP3.0软件分析这些蛋白的N-末端信号肽序列,预测有N-末端分泌信号肽序列的蛋白196个;利用TMpred软件分析跨膜结构,预测跨膜蛋白117个;使用PrositeScan... 详细信息

对粟酒裂殖酵母全基因组3条染色体上的4,997个蛋白序列进行了全局性的分析,利用signalP3.0软件分析这些蛋白的N-末端信号肽序列,预测有N-末端分泌信号肽序列的蛋白196个;利用TMpred软件分析跨膜结构,预测跨膜蛋白117个;使用PrositeScan程序分析膜脂蛋白的脂结合位点,预测有膜脂结合蛋白13个,进而预测分泌性蛋白序列66个。使用TargetP分析66个分泌蛋白的蛋白序列,研究这些蛋白在细胞中的定位。这些分泌蛋白的功能涉及粟酒裂殖酵母的营养、生殖、细胞间以及细胞与环境间的交流等许多方面,对细胞的生存和繁殖有重要意义,在系统生物学的研究中有重要参考价值。粟酒裂殖酵母分泌组的研究也将为粟酒裂殖酵母作为药物筛选模型以及开发为外源蛋白表达的宿主提供基础。

关键词：粟酒裂殖酵母信号肽膜脂蛋白膜整合蛋白分泌蛋白

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

细菌ClpX蛋白酶的结构和功能

引用

微生物学报 2010年第10期50卷 1281-1287页

作者：王琳谢建平西南大学生命科学学院现代生物医药研究所重庆400715

ClpX是热休克蛋白Hsp100蛋白家族的成员之一,在生物体中非常保守。Hsp100/Clp分子伴侣家族功能主要涉及到细胞对环境的压力耐受、胞内蛋白质的周转、DNA复制和基因表达等。结核分枝杆菌所导致的结核病仍然是全球人类健康的主要威胁。致... 详细信息

ClpX是热休克蛋白Hsp100蛋白家族的成员之一,在生物体中非常保守。Hsp100/Clp分子伴侣家族功能主要涉及到细胞对环境的压力耐受、胞内蛋白质的周转、DNA复制和基因表达等。结核分枝杆菌所导致的结核病仍然是全球人类健康的主要威胁。致病菌中的ClpX蛋白酶在基因的表达调控、致病性以及宿主免疫压力耐受中都具有非常重要的功能。本文总结了ClpX蛋白酶的结构、底物以及所调控的基因;分析了结核分枝杆菌ClpX蛋白酶的进化特征,并探讨了结核分枝杆菌ClpX蛋白酶可能的生理功能和在致病性中的重要作用。

关键词： ClpX蛋白酶表达调控致病性结核分枝杆菌

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

细菌毒素-抗毒素系统在噬菌体流产感染中的作用

引用

生物工程学报 2022年第9期38卷 3291-3300页

作者：海洋王小雨谢建平西南大学生命科学学院现代生物医药研究所重庆400715

细菌常受到数量众多的噬菌体感染,宿主细菌在和噬菌体竞赛中进化出多样化的分子策略,流产感染(abortive infection,Abi)是其中之一。毒素-抗毒素系统(toxin-antitoxin system,TA)会在细菌受到压力胁迫时表达并介导细菌的低代谢甚至休眠... 详细信息

细菌常受到数量众多的噬菌体感染,宿主细菌在和噬菌体竞赛中进化出多样化的分子策略,流产感染(abortive infection,Abi)是其中之一。毒素-抗毒素系统(toxin-antitoxin system,TA)会在细菌受到压力胁迫时表达并介导细菌的低代谢甚至休眠,还能直接减少子代噬菌体形成。此外,部分毒素序列和结构与Cas蛋白高度同源,噬菌体甚至会编码抗毒素类似物来阻遏对应毒素的活性。这表明流产感染中细菌死亡过程导致的噬菌体感染失败与TA功能高度重合,TA可能是噬菌体侵染宿主的主要阻力和防御力量之一。文中基于TA系统的分类和功能,对参与噬菌体流产感染的TA系统进行了综述,并预测具有流产功能的TA系统和其在抗生素开发和疾病治疗中的应用前景。这有助于认识细菌-噬菌体相互作用,并指导噬菌体治疗和合成生物学。

关键词：毒素-抗毒素系统流产感染噬菌体代谢重塑 CRISPR-Cas

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

分枝杆菌非典型错配修复及其在抗生素耐药中的研究进展

引用

遗传 2023年第11期45卷 1018-1027页

作者：向莎莎谢建平西南大学生命科学学院现代生物医药研究所重庆400715

错配修复(mismatch repair,MMR)是生物体DNA复制后的一种常见修复系统,对于维持基因组稳定性至关重要,其关键步骤由MutS和MutL蛋白家族的成员执行,尽管这种修复途径十分重要,但在许多古菌和放线菌基因组中并不存在MutS或MutL的同源蛋白... 详细信息

错配修复(mismatch repair,MMR)是生物体DNA复制后的一种常见修复系统,对于维持基因组稳定性至关重要,其关键步骤由MutS和MutL蛋白家族的成员执行,尽管这种修复途径十分重要,但在许多古菌和放线菌基因组中并不存在MutS或MutL的同源蛋白。这类细菌(例如分枝杆菌等)采用另一种非典型的MMR途径,由核酸内切酶EndoMS/NucS发挥关键作用,与典型MMR蛋白(MutS/MutL)相比没有结构同源性。EndoMS/NucS介导的非典型错配修复在分枝杆菌DNA修复、突变和同源重组以及抗生素耐药等方面发挥重要作用。本文通过对比典型MMR途径和非典型MMR途径,深入阐述了分枝杆菌EndoMS/NucS介导的非典型MMR途径及其最新进展,以期为分枝杆菌错配修复分子机制带来新见解以及对分枝杆菌抗生素治疗提供研究线索。

关键词：分枝杆菌错配修复 EndoMS/NucS 抗生素耐药

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

分枝杆菌T7SS(ESX)分泌系统功能研究进展

引用

遗传 2023年第12期45卷 1100-1113页

作者：蒋智勇谢建平西南大学生命科学学院现代生物医药研究所重庆400715

分枝杆菌感染宿主后能够通过分泌至胞外的效应蛋白去影响宿主的免疫功能,其中ESX(或Ⅶ型)系统在效应蛋白分泌方面发挥了重要作用。ESX分泌系统是分枝杆菌和许多放线菌中的蛋白质输出系统,但目前ESX系统如何将底物运输穿过外膜的分子机... 详细信息

分枝杆菌感染宿主后能够通过分泌至胞外的效应蛋白去影响宿主的免疫功能,其中ESX(或Ⅶ型)系统在效应蛋白分泌方面发挥了重要作用。ESX分泌系统是分枝杆菌和许多放线菌中的蛋白质输出系统,但目前ESX系统如何将底物运输穿过外膜的分子机制以及调控机制尚不清楚。本文对ESX系统的组成、功能、分类以及将底物运输至周质空间的相关研究进展展开了综述,并探讨了ESX系统在抗生素耐药、持留及与宿主-噬菌体相互作用中的功能,以及作为新药物靶标的潜力,以期为结核病新药物和疫苗抗原的发现提供新的见解。

关键词： ESX系统分枝杆菌膜复合体抗生素毒力因子

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：